Fish Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of fish only.

See also: hub accessassembly statistics


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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base gaps assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
cpg
islands
1 Acadian redfish (alternate hap 2024)
GCA_043250585.1
n/a 15,565
(2.22 %)
55,970
(6.07 %)
n/a 40.87
(100.00 %)
n/a 11,377
(100.00 %)
2,245,785
(44.92 %)
421,772
(6.42 %)
4,908,102
(36.20 %)
39,685
(1.95 %)
2 Acadian redfish (fSebFas1 primary hap 2024 refseq)
GCF_043250625.1
59,397
(10.47 %)
15,453
(2.37 %)
50,184
(6.16 %)
n/a 40.90
(99.99 %)
472
(0.01 %)
204
(100.00 %)
529,455
(3.89 %)
444,047
(7.93 %)
4,765,018
(37.01 %)
39,918
(2.01 %)
3 alewife (anadromous, Long Island Sound Yale_2024_CS 2024)
GCF_046254945.1
51,219
(7.63 %)
15,894
(1.91 %)
68,940
(6.15 %)
n/a 43.01
(99.98 %)
1,061
(0.02 %)
329
(100.00 %)
3,296,957
(52.37 %)
1,419,758
(14.07 %)
4,202,787
(42.59 %)
48,047
(2.20 %)
4 alligator pipefish (LvHL_M 2021)
GCF_019802595.1
54,226
(11.15 %)
13,427
(2.67 %)
46,903
(5.94 %)
n/a 42.94
(100.00 %)
144
(0.00 %)
143
(100.00 %)
1,200,994
(30.62 %)
143,062
(2.20 %)
3,921,676
(38.03 %)
67,978
(8.92 %)
5 allis shad
GCF_017589495.1
48,520
(8.47 %)
15,371
(2.28 %)
58,686
(5.84 %)
n/a 42.99
(99.91 %)
1,541
(0.09 %)
1,095
(100.00 %)
1,190,406
(9.30 %)
1,205,679
(11.28 %)
3,960,328
(38.81 %)
36,494
(1.83 %)
6 Amazon molly
GCF_000485575.1
56,958
(11.69 %)
15,117
(2.64 %)
30,114
(6.60 %)
n/a 39.16
(95.38 %)
36,429
(4.64 %)
31,058
(95.36 %)
346,461
(2.03 %)
188,557
(1.44 %)
5,139,633
(26.01 %)
35,229
(1.82 %)
7 amberjack S.aureovittata (China HTS-2021-v1 2021)
GCF_021018895.1
47,198
(13.10 %)
15,500
(3.14 %)
41,230
(6.67 %)
n/a 40.79
(99.99 %)
150
(0.01 %)
31
(100.00 %)
1,230,524
(26.57 %)
398,694
(5.41 %)
4,106,609
(25.60 %)
15,656
(0.99 %)
8 American shad (fAloSap1 alternate hap 2021)
GCA_018492705.1
n/a 15,901
(2.25 %)
61,133
(6.37 %)
n/a 43.14
(100.00 %)
1
(0.00 %)
5,411
(100.00 %)
2,043,181
(23.64 %)
1,141,539
(11.35 %)
3,668,314
(38.60 %)
40,218
(2.14 %)
9 American shad (primary hap 2021)
GCA_018492685.1
n/a 15,709
(2.23 %)
60,087
(6.26 %)
n/a 43.18
(99.45 %)
1,639
(0.55 %)
73
(100.00 %)
2,785,521
(47.82 %)
1,245,219
(12.59 %)
3,856,612
(39.43 %)
42,700
(2.25 %)
10 American shad (primary hap 2021)
GCF_018492685.1
70,400
(9.39 %)
16,145
(2.29 %)
60,087
(6.26 %)
76,974
(8.55 %)
43.18
(99.45 %)
1,639
(0.55 %)
74
(100.00 %)
1,297,174
(9.39 %)
1,245,221
(12.59 %)
3,857,267
(39.43 %)
42,699
(2.23 %)
11 Andian cavefish (hap1 2023 genbank)
GCA_030014385.1
n/a 15,802
(1.97 %)
47,186
(4.62 %)
n/a 40.27
(100.00 %)
198
(0.00 %)
349
(100.00 %)
2,616,870
(40.73 %)
658,784
(9.71 %)
5,197,126
(48.95 %)
48,344
(2.62 %)
12 Andian cavefish (hap1 2023 refseq)
GCF_030014385.1
42,881
(5.97 %)
15,802
(1.97 %)
47,186
(4.62 %)
n/a 40.27
(100.00 %)
198
(0.00 %)
349
(100.00 %)
2,616,870
(40.73 %)
658,784
(9.71 %)
5,197,126
(48.95 %)
48,344
(2.62 %)
13 annual killifish
GCF_001266775.1
38,517
(8.87 %)
14,027
(2.45 %)
27,798
(5.86 %)
n/a 39.29
(80.23 %)
1,025,519
(19.94 %)
168,368
(80.17 %)
349,927
(2.63 %)
296,826
(3.18 %)
5,039,517
(28.69 %)
26,364
(1.18 %)
14 Antarctic jonasfish (primary hap 2024)
GCA_963971535.1
n/a 16,678
(0.56 %)
151,361
(4.03 %)
n/a 44.57
(99.91 %)
15,113
(0.09 %)
5,983
(100.00 %)
12,251,532
(51.73 %)
3,521,157
(17.69 %)
10,051,020
(68.37 %)
494,595
(10.52 %)
15 Antarctic lanternfish (alternate hap 2023)
GCA_951214905.1
n/a 17,318
(1.49 %)
80,097
(5.79 %)
n/a 43.49
(100.00 %)
n/a 11,436
(100.00 %)
5,482,467
(36.71 %)
1,454,729
(18.84 %)
6,756,226
(47.56 %)
92,057
(3.50 %)
16 Antarctic lanternfish (primary hap 2023)
GCA_951216825.1
n/a 17,342
(1.44 %)
78,914
(5.48 %)
n/a 43.57
(99.96 %)
3,179
(0.04 %)
1,901
(100.00 %)
5,980,457
(37.18 %)
1,633,782
(21.76 %)
6,279,725
(52.83 %)
104,688
(3.57 %)
17 Antarctic spiny plunderfish (primary hap 2020)
GCA_902827135.1
n/a 14,859
(1.97 %)
60,431
(5.73 %)
n/a 41.82
(99.99 %)
1,039
(0.01 %)
1,541
(100.00 %)
461,253
(3.08 %)
434,124
(6.81 %)
3,499,945
(42.99 %)
60,941
(3.20 %)
18 Arctic char (2024)
GCF_045679555.1
101,825
(6.80 %)
26,394
(1.53 %)
107,089
(4.26 %)
n/a 43.53
(99.98 %)
3,854
(0.02 %)
939
(100.00 %)
1,090,104
(4.07 %)
1,787,017
(23.51 %)
9,220,961
(56.45 %)
78,798
(2.30 %)
19 Arctic char (CBP00131 primary hap 2024)
GCA_036784965.1
n/a 22,376
(1.44 %)
97,559
(4.71 %)
n/a 43.37
(99.97 %)
3,235
(0.03 %)
4,404
(99.97 %)
999,920
(4.22 %)
1,630,911
(26.08 %)
7,875,105
(58.08 %)
70,947
(2.59 %)
20 Arctic char (IW2-2015 2018)
GCF_002910315.2
72,597
(5.72 %)
23,967
(1.55 %)
45,775
(3.69 %)
n/a 43.16
(93.25 %)
1,718,015
(6.84 %)
16,700
(99.99 %)
1,011,348
(4.06 %)
1,666,148
(10.50 %)
10,597,529
(44.77 %)
76,282
(1.94 %)
21 Aristotle's catfish (alternate hap 2022)
GCA_946807865.1
n/a 14,032
(2.44 %)
39,770
(4.92 %)
n/a 38.85
(100.00 %)
n/a 7,617
(100.00 %)
1,808,149
(37.98 %)
583,449
(10.56 %)
4,203,368
(40.67 %)
24,867
(2.06 %)
22 Aristotle's catfish (primary hap 2022)
GCA_946808225.1
n/a 15,455
(2.53 %)
40,077
(4.90 %)
86,346
(8.45 %)
38.90
(99.98 %)
795
(0.02 %)
241
(100.00 %)
2,045,691
(38.70 %)
669,975
(11.72 %)
4,638,765
(42.07 %)
28,277
(1.93 %)
23 Arkansas darter
GCF_013103735.1
51,282
(9.79 %)
14,588
(2.90 %)
42,306
(6.27 %)
n/a 40.52
(99.50 %)
35,052
(0.52 %)
4,664
(100.00 %)
418,294
(3.29 %)
331,380
(3.74 %)
4,153,309
(26.60 %)
15,489
(0.95 %)
24 arroyo chub (AC-1 alternate hap 2022)
GCA_026230005.1
n/a 17,862
(2.29 %)
70,667
(5.50 %)
n/a 40.01
(100.00 %)
327
(0.00 %)
179
(100.00 %)
2,876,989
(50.39 %)
700,511
(9.88 %)
5,977,913
(44.08 %)
104,320
(8.02 %)
25 arroyo chub (AC-1 primary hap 2022)
GCA_026230025.1
n/a 18,025
(2.28 %)
71,255
(5.50 %)
n/a 40.03
(100.00 %)
318
(0.00 %)
341
(100.00 %)
2,884,301
(50.42 %)
702,464
(9.98 %)
5,989,299
(44.18 %)
105,945
(8.03 %)
26 Asian bonytongue (2019)
GCF_900964775.1
50,328
(9.13 %)
16,526
(2.73 %)
38,780
(6.64 %)
72,662
(8.52 %)
44.16
(99.99 %)
145
(0.01 %)
72
(100.00 %)
504,673
(3.06 %)
216,136
(1.69 %)
4,323,242
(26.50 %)
88,517
(10.73 %)
27 Asian bonytongue (alternate hap)
GCA_900964985.2
n/a 16,053
(2.73 %)
74,777
(7.26 %)
n/a 44.15
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,006
(100.00 %)
482,351
(3.03 %)
207,018
(1.68 %)
4,139,370
(26.26 %)
85,546
(10.82 %)
28 Asian redtail catfish (EC202008001 2021)
GCF_019097595.1
51,030
(10.40 %)
15,549
(2.60 %)
42,858
(5.39 %)
n/a 39.70
(100.00 %)
107
(0.00 %)
73
(100.00 %)
1,718,992
(31.80 %)
749,009
(14.09 %)
4,206,758
(37.30 %)
19,230
(1.16 %)
29 Atlantic bluefin tuna (primary hap 2024 genbank)
GCA_963924715.1
n/a 15,722
(2.57 %)
43,026
(5.68 %)
n/a 39.77
(99.99 %)
468
(0.01 %)
120
(100.00 %)
1,608,686
(33.02 %)
253,749
(4.14 %)
5,181,115
(27.80 %)
14,488
(0.90 %)
30 Atlantic bluefin tuna (primary hap 2024 refseq)
GCF_963924715.1
54,426
(12.09 %)
15,720
(2.57 %)
43,026
(5.68 %)
n/a 39.77
(99.99 %)
468
(0.01 %)
119
(100.00 %)
1,608,682
(33.02 %)
253,749
(4.14 %)
5,181,078
(27.80 %)
14,488
(0.90 %)
31 Atlantic cod (2019)
GCF_902167405.1
51,642
(11.92 %)
14,055
(2.62 %)
36,761
(8.42 %)
68,438
(9.50 %)
45.64
(96.48 %)
1,216
(3.52 %)
227
(100.00 %)
790,946
(10.54 %)
855,327
(13.06 %)
2,851,161
(33.38 %)
97,133
(7.82 %)
32 Atlantic cod (alternate hap)
GCA_902167395.1
n/a 13,366
(2.68 %)
66,599
(9.29 %)
n/a 45.55
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3,592
(100.00 %)
696,727
(10.13 %)
749,876
(13.00 %)
2,554,769
(33.77 %)
87,167
(8.03 %)
33 Atlantic halibut (2019 refseq)
GCF_009819705.1
52,130
(11.46 %)
14,961
(3.19 %)
45,365
(7.48 %)
69,662
(10.94 %)
42.21
(99.43 %)
290
(0.57 %)
57
(100.00 %)
428,321
(4.16 %)
256,153
(3.73 %)
3,725,981
(24.13 %)
31,325
(2.25 %)
34 Atlantic halibut (alternate hap 2019)
GCA_009819745.1
n/a 16,554
(3.01 %)
54,832
(7.45 %)
n/a 42.29
(100.00 %)
62
(0.00 %)
4,053
(100.00 %)
494,008
(4.23 %)
299,066
(3.87 %)
4,272,649
(24.46 %)
36,868
(2.33 %)
35 Atlantic herring (v2)
GCF_900700415.2
50,946
(10.35 %)
16,394
(2.60 %)
61,637
(7.20 %)
n/a 44.16
(99.89 %)
1,990
(0.11 %)
3,687
(99.89 %)
1,269,688
(11.71 %)
1,318,661
(13.43 %)
3,732,801
(32.49 %)
35,959
(1.97 %)
36 Atlantic horse mackerel (alternate hap 2021)
GCA_905171655.2
n/a 15,331
(2.42 %)
52,370
(6.91 %)
n/a 41.96
(100.00 %)
74
(0.00 %)
1,049
(100.00 %)
1,454,631
(18.29 %)
383,946
(4.34 %)
4,363,016
(32.69 %)
56,416
(3.08 %)
37 Atlantic horse mackerel (primary hap 2021)
GCA_905171665.2
n/a 15,262
(2.42 %)
51,857
(6.86 %)
n/a 41.94
(100.00 %)
222
(0.00 %)
153
(100.00 %)
1,454,219
(18.25 %)
384,609
(4.72 %)
4,338,083
(32.80 %)
56,553
(3.08 %)
38 Atlantic mackerel (primary hap 2023 genbank)
GCA_963691925.1
n/a 15,291
(2.56 %)
43,206
(5.92 %)
n/a 39.78
(99.96 %)
1,489
(0.04 %)
666
(100.00 %)
1,496,244
(26.83 %)
395,543
(8.92 %)
4,523,761
(29.92 %)
13,309
(0.75 %)
39 Atlantic mackerel (primary hap 2023 refseq)
GCF_963691925.1
34,357
(8.10 %)
15,289
(2.56 %)
43,205
(5.92 %)
n/a 39.78
(99.96 %)
1,489
(0.04 %)
665
(100.00 %)
1,496,240
(26.83 %)
395,543
(8.92 %)
4,523,726
(29.93 %)
13,308
(0.75 %)
40 Atlantic salmon (refseq 2021)
GCF_905237065.1
112,904
(5.61 %)
28,077
(1.40 %)
115,207
(3.75 %)
183,727
(7.26 %)
43.42
(100.00 %)
211
(0.00 %)
4,222
(100.00 %)
1,300,611
(4.84 %)
2,247,891
(25.01 %)
10,731,814
(59.31 %)
77,089
(1.86 %)
41 Atlantic salmon (Sally 2015)
GCF_000233375.1
109,781
(5.45 %)
26,968
(1.35 %)
202,772
(19.11 %)
n/a 43.10
(88.27 %)
138,207
(11.73 %)
241,570
(99.97 %)
1,628,119
(9.46 %)
2,496,917
(19.18 %)
10,390,780
(51.80 %)
79,791
(1.60 %)
42 Atlantic silverside (fMenMen1 hap1 2025)
GCA_048628825.1
n/a 14,247
(3.16 %)
47,091
(7.94 %)
n/a 42.17
(99.99 %)
867
(0.02 %)
478
(100.00 %)
352,705
(4.33 %)
432,013
(10.15 %)
2,954,922
(28.67 %)
41,876
(4.47 %)
43 Atlantic silverside (fMenMen1 hap2 2025)
GCA_048544195.1
n/a 14,127
(3.23 %)
45,606
(7.98 %)
n/a 42.03
(99.99 %)
804
(0.01 %)
567
(100.00 %)
333,253
(4.04 %)
384,132
(9.16 %)
2,977,533
(27.98 %)
40,432
(4.35 %)
44 Atlantic turbot (AOZZmale01 2020)
GCF_013347765.1
60,214
(14.44 %)
14,860
(3.40 %)
50,921
(8.07 %)
76,242
(9.93 %)
43.38
(100.00 %)
51
(0.00 %)
127
(100.00 %)
449,865
(5.00 %)
299,255
(7.03 %)
3,274,219
(25.77 %)
67,338
(7.00 %)
45 Australian ruff (RE-2024a hap1 2024)
GCA_042242115.1
n/a 15,457
(2.72 %)
38,472
(5.59 %)
n/a 39.70
(100.00 %)
91
(0.00 %)
625
(100.00 %)
476,492
(3.25 %)
242,097
(6.02 %)
4,286,693
(33.41 %)
9,322
(0.80 %)
46 Australian ruff (RE-2024a hap2 2024)
GCA_042242135.1
n/a 15,534
(2.50 %)
39,464
(5.26 %)
n/a 39.77
(100.00 %)
98
(0.00 %)
552
(100.00 %)
498,493
(3.22 %)
271,314
(7.61 %)
4,161,752
(38.16 %)
9,637
(0.93 %)
47 ballan wrasse (2016)
GCF_900080235.1
42,362
(9.30 %)
16,129
(2.44 %)
33,854
(5.87 %)
n/a 40.89
(99.98 %)
257
(0.02 %)
13,466
(100.00 %)
503,078
(3.93 %)
321,407
(5.60 %)
4,329,412
(30.36 %)
21,221
(1.07 %)
48 ballan wrasse (primary hap 2024 genbank)
GCA_963930695.1
n/a 15,142
(2.66 %)
43,601
(6.21 %)
n/a 40.59
(99.98 %)
815
(0.02 %)
133
(100.00 %)
1,221,802
(30.10 %)
290,738
(7.79 %)
4,164,845
(30.34 %)
17,126
(0.94 %)
49 ballan wrasse (primary hap 2024 refseq)
GCF_963930695.1
48,592
(12.09 %)
15,140
(2.66 %)
43,304
(6.14 %)
n/a 40.59
(99.98 %)
815
(0.02 %)
946
(99.98 %)
1,221,797
(30.10 %)
290,736
(7.79 %)
4,164,799
(30.34 %)
17,126
(0.94 %)
50 banded archerfish (alternate hap 2021)
GCA_017976295.1
n/a 15,211
(3.23 %)
41,620
(7.14 %)
n/a 41.08
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2,393
(100.00 %)
785,178
(17.57 %)
249,148
(8.36 %)
3,391,653
(26.49 %)
13,787
(0.93 %)
51 banded archerfish (primary hap 2021 refseq)
GCF_017976425.1
42,399
(11.11 %)
15,310
(3.17 %)
41,147
(7.01 %)
62,990
(9.37 %)
41.11
(99.82 %)
98
(0.18 %)
96
(100.00 %)
463,524
(3.35 %)
271,913
(9.55 %)
3,355,326
(28.08 %)
15,089
(0.96 %)
52 banded electric knifefish (BG-103 2025)
GCF_052324685.1
68,886
(11.99 %)
16,359
(2.68 %)
75,905
(8.35 %)
n/a 43.73
(99.95 %)
810
(0.05 %)
840
(100.00 %)
1,095,288
(18.40 %)
868,255
(17.95 %)
2,693,555
(36.32 %)
81,652
(5.89 %)
53 banded killifish (hap1 2024)
GCA_037039145.1
n/a 15,122
(1.44 %)
65,809
(4.50 %)
n/a 41.23
(99.74 %)
293
(0.26 %)
331
(100.00 %)
2,545,429
(50.53 %)
451,939
(5.50 %)
5,807,705
(42.18 %)
94,695
(3.92 %)
54 banded killifish (hap2 2024)
GCA_037038625.1
n/a 15,024
(1.45 %)
65,141
(4.53 %)
n/a 41.23
(99.52 %)
373
(0.48 %)
196
(100.00 %)
2,509,508
(50.53 %)
441,892
(5.11 %)
6,245,443
(38.22 %)
93,198
(3.82 %)
55 barbel (alternate hap 2022)
GCA_936446605.1
n/a 26,794
(3.15 %)
76,434
(5.64 %)
n/a 37.81
(100.00 %)
1
(0.00 %)
8,035
(100.00 %)
4,084,361
(52.18 %)
538,411
(4.25 %)
7,659,980
(38.94 %)
58,008
(2.90 %)
56 barbel (primary hap 2022)
GCA_936440315.1
n/a 31,876
(3.30 %)
85,063
(5.65 %)
n/a 37.89
(100.00 %)
108
(0.00 %)
92
(100.00 %)
4,839,533
(52.47 %)
646,636
(4.57 %)
8,240,279
(42.13 %)
71,384
(3.04 %)
57 barramundi perch (ASB-BC8 2022)
GCF_001640805.2
53,657
(13.68 %)
16,073
(3.06 %)
44,214
(6.63 %)
n/a 40.76
(98.88 %)
674
(1.12 %)
2,997
(100.00 %)
986,469
(19.78 %)
237,272
(4.32 %)
3,983,840
(23.58 %)
16,237
(1.03 %)
58 beardfish (hap1 2025)
GCA_047511565.1
n/a 15,938
(3.00 %)
52,921
(7.52 %)
n/a 43.38
(99.98 %)
752
(0.02 %)
327
(100.00 %)
993,554
(11.81 %)
755,389
(11.75 %)
3,469,352
(30.25 %)
68,008
(5.51 %)
59 beardfish (hap2 2025)
GCA_047511595.1
n/a 15,940
(3.02 %)
51,682
(7.42 %)
n/a 43.31
(99.98 %)
756
(0.02 %)
200
(100.00 %)
986,717
(11.69 %)
754,642
(11.91 %)
3,459,958
(30.32 %)
67,732
(5.27 %)
60 Bermuda beardfish (OG660 hap1 2025)
GCA_048537225.1
n/a 15,950
(2.82 %)
53,175
(7.04 %)
n/a 42.97
(99.99 %)
481
(0.01 %)
846
(100.00 %)
1,017,817
(12.34 %)
764,426
(15.65 %)
3,524,564
(32.87 %)
60,800
(4.43 %)
61 Bermuda beardfish (OG660 hap2 2025)
GCA_048537235.1
n/a 15,811
(2.85 %)
52,254
(7.09 %)
n/a 43.06
(99.99 %)
508
(0.01 %)
461
(100.00 %)
1,002,378
(12.22 %)
753,750
(14.96 %)
3,479,721
(32.11 %)
60,513
(4.18 %)
62 bicolor damselfish
GCF_000690725.1
32,951
(8.67 %)
15,181
(2.55 %)
31,420
(5.94 %)
n/a 41.66
(93.68 %)
44,409
(6.34 %)
42,059
(93.66 %)
351,453
(2.61 %)
180,113
(1.20 %)
5,016,154
(23.41 %)
46,423
(2.30 %)
63 bight redfish (2022)
GCF_026898505.1
34,914
(7.61 %)
16,015
(2.73 %)
54,287
(6.76 %)
n/a 42.40
(100.00 %)
n/a 8,310
(100.00 %)
996,609
(9.55 %)
631,344
(6.03 %)
4,456,094
(29.17 %)
37,522
(2.03 %)
64 bight redfish (hap1 2025)
GCA_048128805.1
n/a 16,025
(2.63 %)
53,351
(6.76 %)
n/a 42.47
(99.98 %)
699
(0.02 %)
322
(100.00 %)
995,401
(9.22 %)
626,617
(9.80 %)
4,302,378
(31.80 %)
38,231
(2.50 %)
65 bight redfish (hap2 2025)
GCA_048129085.1
n/a 15,902
(2.63 %)
52,639
(6.71 %)
n/a 42.44
(99.98 %)
680
(0.02 %)
204
(100.00 %)
989,039
(9.11 %)
628,091
(9.80 %)
4,315,800
(31.97 %)
37,729
(2.33 %)
66 black goby (alternate hap 2023)
GCA_951799965.1
n/a 14,534
(2.11 %)
56,906
(6.41 %)
n/a 42.10
(100.00 %)
n/a 3,523
(100.00 %)
2,445,373
(45.07 %)
452,878
(9.46 %)
4,195,077
(39.49 %)
77,592
(4.86 %)
67 black goby (primary hap 2023)
GCA_951799975.1
n/a 14,455
(2.06 %)
56,488
(6.31 %)
n/a 42.10
(99.99 %)
636
(0.01 %)
298
(100.00 %)
3,230,397
(55.09 %)
494,440
(10.43 %)
4,359,169
(40.46 %)
81,684
(4.81 %)
68 black perch (LCO1_2020_lvr alternate hap 2022)
GCA_022578405.1
n/a 31,847
(2.01 %)
153,565
(6.53 %)
n/a 41.78
(99.99 %)
639
(0.00 %)
63,422
(100.00 %)
2,786,840
(18.28 %)
1,016,389
(7.50 %)
8,844,631
(26.90 %)
130,556
(4.42 %)
69 black perch (LCO1_2020_lvr primary hap 2022 refseq)
GCF_022577435.1
42,351
(12.09 %)
14,988
(3.02 %)
47,106
(6.98 %)
n/a 41.61
(100.00 %)
234
(0.00 %)
463
(100.00 %)
1,017,142
(18.99 %)
360,899
(8.75 %)
3,761,447
(28.91 %)
48,360
(4.43 %)
70 black porgy (SG-2024 2024)
GCA_041753875.1
n/a 15,257
(2.73 %)
47,477
(6.62 %)
n/a 42.03
(100.00 %)
n/a 24
(100.00 %)
488,582
(3.19 %)
254,655
(4.13 %)
4,385,401
(24.08 %)
32,461
(1.90 %)
71 black rockcod
GCF_000735185.1
34,978
(8.49 %)
12,601
(2.15 %)
42,589
(6.13 %)
n/a 40.62
(97.93 %)
59,164
(2.09 %)
72,571
(97.92 %)
268,591
(2.71 %)
238,334
(3.18 %)
3,425,479
(29.48 %)
31,009
(2.11 %)
72 black seabass (Rhode Island RG_2023a 2023)
GCF_030273125.1
43,392
(8.45 %)
15,522
(2.13 %)
48,255
(5.50 %)
n/a 38.69
(100.00 %)
341
(0.00 %)
92
(100.00 %)
1,651,919
(22.26 %)
782,601
(7.55 %)
5,398,047
(38.87 %)
24,508
(1.19 %)
73 blackbelly eelpout (fLycPai1 haplotype 1 2023)
GCA_028021495.1
n/a 15,274
(2.92 %)
51,453
(7.45 %)
n/a 43.07
(99.99 %)
373
(0.01 %)
461
(100.00 %)
1,239,364
(29.69 %)
354,703
(9.63 %)
3,006,556
(30.35 %)
53,503
(4.48 %)
74 blackbelly eelpout (fLycPai1 haplotype 2 2023)
GCA_028022725.1
n/a 15,043
(2.96 %)
50,860
(7.54 %)
n/a 42.98
(99.99 %)
366
(0.01 %)
109
(100.00 %)
1,210,142
(29.44 %)
340,820
(9.19 %)
2,986,750
(29.89 %)
52,010
(4.20 %)
75 blackspot tuskfish (SL-2024 2025)
GCA_047301625.1
n/a 15,085
(2.21 %)
48,479
(5.71 %)
n/a 41.56
(100.00 %)
11
(0.00 %)
43
(100.00 %)
499,447
(3.15 %)
285,392
(5.12 %)
5,443,017
(30.00 %)
23,550
(1.23 %)
76 blackstripe livebearer (line A6 2022)
GCF_027474105.1
44,847
(11.30 %)
15,364
(2.86 %)
51,122
(6.88 %)
n/a 39.48
(99.99 %)
89
(0.01 %)
415
(100.00 %)
1,160,519
(28.33 %)
183,082
(4.75 %)
4,354,804
(27.83 %)
40,207
(2.97 %)
77 blacktail shiner (hap1 2024)
GCA_038021265.1
n/a 17,403
(2.99 %)
45,903
(5.38 %)
n/a 38.64
(99.99 %)
709
(0.01 %)
673
(100.00 %)
2,141,901
(35.77 %)
482,931
(17.18 %)
4,297,133
(46.82 %)
41,889
(2.32 %)
78 blacktail shiner (hap2 2024)
GCA_038024135.1
n/a 17,486
(2.97 %)
46,833
(5.41 %)
n/a 38.79
(99.99 %)
720
(0.01 %)
413
(100.00 %)
2,165,269
(36.18 %)
490,692
(17.84 %)
4,251,333
(47.54 %)
42,744
(2.37 %)
79 blue catfish (D&B 2022)
GCF_023375685.1
48,929
(10.27 %)
15,574
(2.62 %)
44,035
(5.21 %)
n/a 39.80
(98.04 %)
171
(1.96 %)
43
(100.00 %)
2,180,806
(45.14 %)
625,260
(6.63 %)
5,137,199
(35.52 %)
31,164
(1.89 %)
80 blue tilapia (BGI-SZ)
GCF_005870065.1
36,881
(7.40 %)
15,408
(2.38 %)
27,235
(5.59 %)
n/a 40.42
(89.87 %)
53,539
(10.15 %)
12,952
(100.00 %)
867,639
(16.39 %)
195,137
(1.62 %)
5,293,484
(23.10 %)
21,238
(1.02 %)
81 blue tilapia (Guangdong)
GCF_013358895.1
57,860
(9.04 %)
15,494
(1.98 %)
57,878
(5.63 %)
56,939
(8.11 %)
40.66
(99.97 %)
723
(0.03 %)
304
(100.00 %)
1,055,724
(20.14 %)
324,841
(3.27 %)
5,000,753
(32.08 %)
32,357
(1.59 %)
82 blue whiting (primary hap 2024)
GCA_964030765.1
n/a 13,097
(2.93 %)
55,097
(8.76 %)
n/a 45.82
(99.88 %)
3,055
(0.12 %)
3,832
(100.00 %)
1,337,604
(32.27 %)
749,185
(17.27 %)
2,363,606
(35.06 %)
78,815
(8.25 %)
83 bluehead (hap1 2025)
GCA_054084025.1
n/a 15,162
(2.51 %)
41,482
(5.72 %)
n/a 39.79
(100.00 %)
111
(0.00 %)
52
(100.00 %)
1,371,177
(35.68 %)
288,485
(9.14 %)
4,713,876
(32.53 %)
15,696
(0.93 %)
84 bluehead (hap2 2025)
GCA_054084055.1
n/a 15,168
(2.55 %)
41,458
(5.80 %)
n/a 39.80
(100.00 %)
85
(0.00 %)
60
(100.00 %)
1,362,285
(34.85 %)
283,087
(8.25 %)
4,688,916
(31.80 %)
15,611
(0.95 %)
85 bluestreak cleaner wrasse (JK-2023 2023)
GCA_030710495.1
n/a 14,996
(2.68 %)
44,244
(6.44 %)
n/a 40.81
(100.00 %)
211
(0.00 %)
59
(100.00 %)
1,619,681
(30.07 %)
337,749
(4.31 %)
4,541,709
(29.20 %)
14,576
(0.85 %)
86 bluestripe pipefish (RoL2022-K1 2023)
GCF_030265055.1
63,345
(14.83 %)
14,387
(3.54 %)
43,563
(7.96 %)
n/a 41.68
(100.00 %)
12
(0.00 %)
57
(100.00 %)
842,739
(18.67 %)
356,558
(12.86 %)
2,720,911
(41.08 %)
40,187
(4.66 %)
87 blunt-snouted clingfish (alternate hap)
GCA_900650505.1
n/a 12,494
(1.93 %)
44,967
(5.14 %)
n/a 38.20
(100.00 %)
1
(0.00 %)
7,675
(100.00 %)
608,174
(4.23 %)
390,755
(4.71 %)
4,977,071
(42.41 %)
23,532
(1.46 %)
88 blunt-snouted clingfish (v2 2020 genbank)
GCA_900634775.2
n/a 14,499
(1.97 %)
51,213
(5.47 %)
n/a 38.27
(98.47 %)
1,160
(1.53 %)
442
(100.00 %)
731,731
(4.21 %)
471,623
(4.92 %)
5,974,055
(42.88 %)
29,052
(1.48 %)
89 Boeseman's rainbowfish (fMelBoe1 alternate hap 2021)
GCA_017639755.1
n/a 13,882
(2.27 %)
45,919
(5.98 %)
n/a 39.50
(99.99 %)
45
(0.01 %)
3,194
(100.00 %)
803,073
(13.60 %)
258,404
(4.19 %)
4,674,614
(28.36 %)
15,524
(1.02 %)
90 Boeseman's rainbowfish (primary hap 2021)
GCA_017639745.1
n/a 15,285
(2.29 %)
51,552
(6.21 %)
n/a 39.65
(99.63 %)
440
(0.37 %)
93
(100.00 %)
1,668,580
(40.04 %)
303,669
(4.77 %)
5,189,490
(29.11 %)
18,525
(1.10 %)
91 Boeseman's rainbowfish (primary hap 2021)
GCF_017639745.1
51,238
(8.77 %)
15,174
(2.24 %)
51,552
(6.21 %)
n/a 39.65
(99.63 %)
440
(0.37 %)
93
(100.00 %)
542,278
(3.15 %)
303,669
(4.77 %)
5,189,645
(29.11 %)
18,525
(1.10 %)
92 Bolin's lanternfish (primary hap 2024)
GCA_963924005.1
n/a 16,964
(1.77 %)
67,673
(5.93 %)
n/a 42.61
(99.97 %)
1,785
(0.03 %)
979
(100.00 %)
4,285,965
(30.73 %)
1,222,431
(20.69 %)
6,105,881
(46.99 %)
73,543
(3.28 %)
93 bonti-bonti (fTelBon1 alternate hap 2022)
GCA_933228925.1
n/a 12,424
(1.95 %)
46,550
(6.00 %)
n/a 41.63
(100.00 %)
n/a 4,619
(100.00 %)
789,207
(14.61 %)
348,482
(20.98 %)
3,447,241
(38.72 %)
27,035
(4.16 %)
94 bonti-bonti (primary hap 2022)
GCA_933228915.1
n/a 14,929
(1.93 %)
55,343
(5.90 %)
n/a 41.66
(99.97 %)
1,329
(0.03 %)
146
(100.00 %)
998,246
(14.90 %)
443,155
(22.40 %)
4,319,947
(40.01 %)
34,018
(4.16 %)
95 bony fish B.hirsutus (HB-005 2024)
GCF_040956055.1
24,050
(11.30 %)
14,596
(4.48 %)
52,760
(11.00 %)
n/a 44.75
(99.96 %)
1,486
(0.04 %)
1,370
(100.00 %)
471,281
(10.94 %)
181,798
(7.38 %)
2,008,576
(24.90 %)
46,438
(14.87 %)
96 bony fish G.rarus (2020-XYJJ_v1 2022)
GCA_023029165.1
n/a 17,903
(2.56 %)
61,083
(4.83 %)
n/a 39.20
(99.98 %)
410
(0.02 %)
46
(100.00 %)
3,191,854
(60.59 %)
577,156
(9.69 %)
6,405,936
(42.87 %)
47,551
(3.22 %)
97 bony fish P.dabryanus (BB 2023)
GCF_030506205.1
86,420
(8.25 %)
22,100
(2.28 %)
59,296
(4.66 %)
n/a 38.32
(100.00 %)
1
(0.00 %)
610
(100.00 %)
3,555,303
(40.49 %)
538,181
(9.64 %)
6,137,303
(50.16 %)
71,533
(4.06 %)
98 bony fish R.nasutus (DBWJ_T2T 2025)
GCA_048301585.1
n/a 17,715
(2.98 %)
44,183
(4.64 %)
n/a 38.96
(100.00 %)
2
(0.00 %)
70
(100.00 %)
613,768
(4.88 %)
440,668
(11.76 %)
5,264,302
(45.25 %)
39,351
(3.96 %)
99 bony fish S.pulcher (SPU_LCO1_2020_fin primary hap 2022)
GCF_022749685.1
37,003
(8.79 %)
15,275
(2.46 %)
46,371
(5.95 %)
n/a 41.58
(100.00 %)
8
(0.00 %)
186
(100.00 %)
1,369,180
(24.73 %)
232,889
(8.56 %)
4,426,024
(31.90 %)
27,133
(1.64 %)
100 bony fish T.vachellii (PV-2020 2023)
GCF_030014155.1
43,278
(10.19 %)
15,613
(2.96 %)
39,340
(5.77 %)
n/a 39.31
(99.98 %)
291
(0.02 %)
78
(100.00 %)
1,563,305
(33.23 %)
689,312
(9.96 %)
3,954,578
(35.31 %)
20,152
(1.50 %)
101 Borax Lake chub (OS27281-9 2025)
GCF_051911475.1
81,778
(6.98 %)
17,407
(2.27 %)
73,376
(5.83 %)
n/a 40.13
(100.00 %)
n/a 532
(100.00 %)
3,842,976
(66.66 %)
684,484
(9.77 %)
6,131,520
(42.41 %)
106,613
(7.33 %)
102 bowfin (hap1 2024 refseq)
GCF_036373705.1
55,474
(7.85 %)
13,848
(1.83 %)
27,055
(4.43 %)
n/a 40.75
(100.00 %)
97
(0.00 %)
389
(100.00 %)
953,492
(13.69 %)
387,699
(7.91 %)
4,552,359
(37.72 %)
46,301
(2.99 %)
103 bowfin (hap2 2024)
GCA_036365475.1
n/a 13,813
(1.89 %)
27,088
(4.55 %)
n/a 40.60
(100.00 %)
80
(0.00 %)
297
(100.00 %)
886,999
(13.24 %)
358,077
(7.37 %)
4,625,277
(36.22 %)
43,764
(2.79 %)
104 Brauer's lanternfish (alternate hap 2023)
GCA_963281105.1
n/a 17,999
(1.60 %)
76,655
(5.58 %)
n/a 42.04
(100.00 %)
5
(0.00 %)
10,799
(100.00 %)
5,994,257
(39.29 %)
1,126,685
(10.35 %)
6,996,991
(46.02 %)
71,016
(3.36 %)
105 Brauer's lanternfish (primary hap 2023)
GCA_963280865.1
n/a 17,865
(1.56 %)
76,506
(5.59 %)
n/a 42.15
(99.96 %)
2,704
(0.04 %)
676
(100.00 %)
6,391,921
(39.62 %)
1,227,487
(11.70 %)
6,669,558
(49.73 %)
76,828
(3.96 %)
106 broad-nosed pipefish (SK-2024d hap1 2025)
GCA_048301445.1
n/a 13,406
(4.62 %)
41,458
(10.33 %)
n/a 43.23
(100.00 %)
78
(0.00 %)
155
(100.00 %)
205,224
(2.93 %)
217,943
(13.58 %)
1,368,592
(36.56 %)
48,018
(12.44 %)
107 broad-nosed pipefish (SK-2024d hap2 2025)
GCA_048301605.1
n/a 13,414
(4.78 %)
41,481
(10.68 %)
n/a 43.24
(100.00 %)
90
(0.00 %)
126
(100.00 %)
203,521
(2.96 %)
200,308
(11.44 %)
1,413,994
(34.72 %)
47,578
(12.59 %)
108 broad-nosed pipefish (Sweden RoL2023-S1 2023)
GCF_033458585.1
49,639
(15.87 %)
13,630
(3.98 %)
43,263
(9.12 %)
n/a 43.65
(100.00 %)
40
(0.00 %)
495
(100.00 %)
727,223
(20.88 %)
290,624
(20.53 %)
1,369,709
(43.82 %)
51,671
(14.43 %)
109 brook trout (EN_2023a 2023)
GCF_029448725.1
92,568
(6.87 %)
26,875
(1.47 %)
114,101
(4.26 %)
n/a 43.70
(99.83 %)
4,299
(0.17 %)
2,721
(100.00 %)
5,005,012
(52.10 %)
2,055,293
(26.66 %)
9,701,968
(57.04 %)
89,897
(2.49 %)
110 brown-marbled grouper (2020)
GCF_011397635.1
49,218
(8.52 %)
15,634
(1.92 %)
53,710
(4.99 %)
n/a 41.33
(100.00 %)
205
(0.00 %)
26
(100.00 %)
632,147
(3.01 %)
371,482
(3.01 %)
6,438,110
(31.32 %)
26,136
(0.96 %)
111 Burton's mouthbrooder (Broad 2011)
GCF_000239415.1
47,805
(10.97 %)
14,997
(2.72 %)
25,504
(5.86 %)
n/a 40.51
(84.10 %)
61,073
(15.93 %)
69,067
(84.07 %)
311,174
(3.20 %)
125,534
(0.72 %)
4,461,288
(20.25 %)
17,722
(0.91 %)
112 Burton's mouthbrooder (NCSU 2021)
GCF_018398535.1
52,584
(12.38 %)
15,229
(2.54 %)
47,264
(5.92 %)
n/a 40.68
(89.05 %)
32,418
(10.97 %)
7,421
(100.00 %)
812,382
(17.52 %)
158,486
(1.12 %)
4,571,794
(23.61 %)
22,763
(1.21 %)
113 butterfish (fScaArg1 alternate hap 2021)
GCA_020382915.1
n/a 15,228
(3.42 %)
41,322
(7.36 %)
n/a 41.47
(100.00 %)
4
(0.00 %)
1,592
(100.00 %)
972,098
(18.43 %)
155,031
(1.41 %)
3,452,400
(21.36 %)
15,255
(1.12 %)
114 butterfish (primary hap 2021)
GCF_020382885.2
52,841
(14.10 %)
15,261
(3.43 %)
40,580
(7.38 %)
n/a 41.49
(99.70 %)
77
(0.30 %)
48
(100.00 %)
413,775
(3.11 %)
160,299
(1.55 %)
3,420,994
(21.24 %)
15,574
(1.13 %)
115 butterfly blenny (alternate hap 2023)
GCA_963422475.1
n/a 13,798
(2.47 %)
59,889
(7.42 %)
n/a 42.92
(100.00 %)
n/a 5,820
(100.00 %)
1,489,327
(27.87 %)
440,022
(10.93 %)
3,608,241
(30.24 %)
73,310
(6.61 %)
116 butterfly blenny (primary hap 2023)
GCA_963422515.1
n/a 14,403
(2.47 %)
61,860
(7.37 %)
n/a 43.15
(99.96 %)
1,625
(0.04 %)
525
(100.00 %)
959,651
(12.16 %)
517,137
(13.14 %)
3,775,081
(32.47 %)
81,881
(6.68 %)
117 California grunion (hap1 2024)
GCF_036924035.1
48,842
(7.86 %)
15,030
(2.11 %)
47,569
(5.39 %)
n/a 41.54
(100.00 %)
223
(0.00 %)
296
(100.00 %)
362,601
(2.31 %)
342,827
(15.91 %)
3,359,060
(39.76 %)
28,098
(1.96 %)
118 California sheephead (SPU_LCO1_2020_fin alternate hap 2022)
GCA_022749735.1
n/a 19,842
(2.16 %)
72,007
(6.04 %)
n/a 41.70
(99.97 %)
2,679
(0.02 %)
15,877
(99.98 %)
1,911,945
(24.70 %)
364,933
(8.56 %)
6,201,042
(32.00 %)
39,114
(1.56 %)
119 California sheephead (SPU_LCO1_2020_fin primary hap 2022)
GCA_022749685.1
n/a 15,277
(2.46 %)
46,371
(5.95 %)
n/a 41.58
(100.00 %)
8
(0.00 %)
179
(100.00 %)
1,369,186
(24.73 %)
232,889
(8.56 %)
4,426,065
(31.90 %)
27,134
(1.64 %)
120 channel bull blenny (2019 refseq)
GCF_900634415.1
40,788
(11.04 %)
14,472
(3.02 %)
24,012
(6.59 %)
60,720
(10.43 %)
40.96
(99.58 %)
445
(0.42 %)
322
(100.00 %)
420,697
(5.49 %)
320,518
(6.91 %)
3,394,846
(28.67 %)
20,453
(1.39 %)
121 channel bull blenny (alternate hap 2019)
GCA_900634435.1
n/a 15,980
(2.79 %)
53,680
(6.62 %)
n/a 40.96
(100.00 %)
10
(0.00 %)
11,565
(100.00 %)
451,656
(4.76 %)
321,158
(5.51 %)
3,800,099
(26.83 %)
20,338
(1.21 %)
122 channel catfish (USDA103 2022)
GCA_001660625.3
n/a 15,782
(2.56 %)
45,562
(5.15 %)
n/a 39.82
(99.35 %)
100
(0.65 %)
136
(100.00 %)
2,357,987
(46.85 %)
671,925
(8.67 %)
5,043,595
(36.53 %)
34,284
(2.16 %)
123 channel catfish (USDA103 v2.0 2022)
GCF_001660625.3
59,187
(10.70 %)
15,782
(2.57 %)
45,562
(5.15 %)
n/a 39.82
(99.35 %)
100
(0.65 %)
137
(100.00 %)
2,257,240
(46.82 %)
671,926
(8.67 %)
5,043,664
(36.53 %)
34,284
(2.16 %)
124 cherry salmon (Uvic2021 2024)
GCF_036934945.1
80,307
(5.31 %)
27,171
(1.38 %)
123,048
(4.00 %)
n/a 44.12
(99.94 %)
4,047
(0.06 %)
18,306
(100.00 %)
1,207,353
(5.23 %)
2,779,869
(27.93 %)
11,429,057
(55.56 %)
83,137
(1.99 %)
125 chevron butterflyfish (hap1 2024 refseq)
GCF_039877785.1
38,623
(10.62 %)
15,604
(3.07 %)
48,037
(7.05 %)
n/a 42.79
(100.00 %)
49
(0.00 %)
36
(100.00 %)
1,224,649
(24.57 %)
254,015
(3.62 %)
3,657,926
(23.28 %)
30,971
(2.02 %)
126 chevron butterflyfish (hap2 2024)
GCA_039877575.1
n/a 15,116
(2.91 %)
47,839
(7.01 %)
n/a 42.73
(100.00 %)
43
(0.00 %)
71
(100.00 %)
463,848
(3.80 %)
254,561
(4.23 %)
3,654,295
(24.08 %)
30,593
(1.99 %)
127 chichlid (S. diagramma)
GCF_900408965.1
61,496
(12.33 %)
15,296
(2.30 %)
50,818
(6.10 %)
n/a 40.92
(100.00 %)
942
(0.00 %)
823
(100.00 %)
920,881
(19.96 %)
193,629
(1.36 %)
4,724,179
(28.98 %)
28,565
(1.65 %)
128 Chinaman-leatherjacket (Tasmania G7.1 2024)
GCF_046127955.1
46,411
(11.83 %)
14,102
(3.02 %)
52,239
(7.87 %)
n/a 45.59
(100.00 %)
n/a 396
(100.00 %)
809,090
(6.75 %)
459,997
(7.66 %)
2,973,747
(37.71 %)
124,869
(12.74 %)
129 chinamanfish (OG11 2025)
GCA_048128715.1
n/a 15,611
(1.87 %)
46,283
(4.42 %)
n/a 39.32
(100.00 %)
72
(0.00 %)
61
(100.00 %)
663,907
(2.82 %)
372,676
(3.23 %)
7,551,541
(33.03 %)
17,757
(0.80 %)
130 chinamanfish (OG11 2025)
GCA_048128725.1
n/a 15,739
(1.88 %)
46,290
(4.42 %)
n/a 39.31
(100.00 %)
70
(0.00 %)
89
(100.00 %)
663,559
(2.79 %)
371,107
(3.14 %)
7,519,173
(32.84 %)
17,824
(0.70 %)
131 Chinese cavefish (2022)
GCF_024868665.1
48,071
(11.91 %)
16,738
(3.72 %)
46,295
(6.80 %)
n/a 39.61
(98.56 %)
9,510
(1.45 %)
1,039
(100.00 %)
1,469,931
(44.44 %)
188,838
(2.34 %)
3,624,116
(35.94 %)
44,615
(5.01 %)
132 Chinese large-mouth catfish (SWU-2019-XX 2020)
GCF_014805685.1
49,690
(9.64 %)
15,266
(2.70 %)
40,151
(5.21 %)
n/a 38.75
(99.82 %)
597
(0.18 %)
286
(100.00 %)
772,209
(6.45 %)
630,039
(7.45 %)
4,729,261
(37.48 %)
24,310
(1.76 %)
133 Chinese sucker (Aquarium Trade MX2 2022)
GCF_019703515.2
89,018
(6.31 %)
26,613
(1.64 %)
77,184
(3.14 %)
n/a 39.08
(100.00 %)
224
(0.00 %)
353
(100.00 %)
9,298,177
(59.91 %)
977,119
(3.49 %)
13,499,422
(52.38 %)
100,309
(2.90 %)
134 Chinook salmon (v1 2018 female)
GCF_002872995.1
81,327
(5.14 %)
27,462
(1.53 %)
54,538
(3.80 %)
n/a 43.55
(97.26 %)
272,151
(2.76 %)
15,944
(99.99 %)
1,207,194
(4.55 %)
2,524,408
(13.75 %)
12,127,831
(47.56 %)
87,959
(2.02 %)
135 Chinook salmon (v2 Ot180627B 2021 male rfseq)
GCF_018296145.1
92,370
(5.73 %)
26,372
(1.57 %)
107,059
(4.12 %)
157,582
(6.65 %)
43.55
(99.99 %)
2,334
(0.01 %)
9,978
(99.99 %)
1,483,168
(7.79 %)
2,306,695
(23.48 %)
10,038,888
(54.54 %)
62,726
(1.40 %)
136 chub mackerel (fScoJap1 alternate hap 2022)
GCA_027409835.1
n/a 15,165
(2.44 %)
46,105
(6.16 %)
n/a 39.93
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,163
(100.00 %)
1,546,066
(27.08 %)
537,737
(9.87 %)
4,485,153
(30.70 %)
14,774
(0.81 %)
137 chub mackerel (primary hap 2022 refseq)
GCF_027409825.1
34,390
(6.95 %)
15,348
(2.35 %)
46,858
(6.07 %)
n/a 40.01
(99.92 %)
1,572
(0.08 %)
360
(100.00 %)
1,669,322
(28.44 %)
638,340
(11.55 %)
4,613,373
(32.38 %)
16,290
(0.85 %)
138 chum salmon (Oke142-1_Chum_Gynogen 2020)
GCF_012931545.1
76,338
(6.27 %)
23,186
(1.70 %)
90,881
(4.14 %)
n/a 43.06
(95.36 %)
242,238
(4.66 %)
28,109
(99.98 %)
1,143,292
(6.07 %)
1,487,818
(12.14 %)
8,992,314
(46.24 %)
51,797
(1.25 %)
139 chum salmon (PuntledgeMale-10-30-2019 2022)
GCF_023373465.1
205,598
(6.68 %)
26,582
(1.42 %)
119,437
(4.14 %)
120,379
(5.87 %)
43.89
(99.99 %)
3,433
(0.01 %)
17,480
(99.99 %)
1,160,500
(5.63 %)
2,584,312
(31.72 %)
10,621,107
(55.67 %)
68,538
(1.53 %)
140 climbing perch (alternate hap 2019)
GCA_900650485.1
n/a 14,940
(3.51 %)
39,688
(7.41 %)
n/a 40.40
(99.61 %)
36
(0.39 %)
2,641
(100.00 %)
307,993
(2.63 %)
121,935
(1.79 %)
3,190,928
(20.98 %)
10,131
(0.86 %)
141 climbing perch (v1.3 2021)
GCA_900324465.3
n/a 15,241
(3.53 %)
39,067
(7.54 %)
67,055
(11.68 %)
40.40
(99.35 %)
266
(0.65 %)
51
(100.00 %)
633,883
(15.28 %)
130,249
(1.89 %)
3,325,008
(21.31 %)
10,500
(0.87 %)
142 clown anemonefish (DU_AmpOce 2017)
GCF_002776465.1
53,580
(9.24 %)
15,685
(2.23 %)
33,477
(5.63 %)
n/a 39.47
(99.94 %)
1,406
(0.06 %)
6,405
(100.00 %)
431,950
(2.92 %)
381,394
(4.84 %)
4,952,343
(31.95 %)
23,543
(1.15 %)
143 clown anemonefish (Okinawa individual 3 2022)
GCF_022539595.1
53,925
(11.11 %)
15,702
(2.37 %)
47,805
(5.50 %)
n/a 39.59
(99.98 %)
1,454
(0.02 %)
354
(100.00 %)
1,346,903
(35.25 %)
401,782
(5.36 %)
4,891,035
(31.59 %)
23,489
(1.28 %)
144 coho salmon (150728-3 2019)
GCF_002021735.2
100,863
(6.58 %)
27,072
(1.56 %)
50,811
(3.95 %)
125,873
(5.26 %)
43.55
(99.98 %)
5,631
(0.02 %)
4,482
(100.00 %)
1,491,966
(6.88 %)
2,135,217
(25.52 %)
10,152,659
(54.74 %)
65,662
(1.36 %)
145 common bream (primary hap 2024)
GCA_963993115.1
n/a 18,114
(2.63 %)
66,549
(6.11 %)
n/a 38.62
(99.99 %)
685
(0.01 %)
215
(100.00 %)
2,639,968
(48.46 %)
659,243
(7.55 %)
5,950,358
(40.47 %)
62,337
(3.61 %)
146 common carp (R8XR3 2021)
GCA_905221575.1
n/a 30,973
(3.47 %)
83,657
(5.95 %)
n/a 37.06
(100.00 %)
372
(0.00 %)
674
(100.00 %)
3,324,121
(41.45 %)
707,134
(4.72 %)
8,110,561
(39.08 %)
44,388
(1.60 %)
147 common carp (SPL01 2021)
GCF_018340385.1
91,197
(7.89 %)
31,041
(2.89 %)
89,244
(5.01 %)
n/a 37.11
(99.53 %)
26,351
(0.48 %)
6,701
(100.00 %)
1,634,612
(6.00 %)
919,239
(3.97 %)
10,192,037
(38.56 %)
52,638
(1.62 %)
148 common dab (primary hap 2023)
GCF_963576545.1
36,211
(8.34 %)
14,995
(2.62 %)
50,844
(6.89 %)
n/a 42.67
(99.99 %)
275
(0.01 %)
338
(100.00 %)
1,186,799
(32.17 %)
307,864
(16.34 %)
3,562,802
(35.00 %)
41,657
(2.72 %)
149 common dace (hap1.1 2025)
GCA_965113295.1
n/a 18,484
(2.43 %)
69,931
(5.95 %)
n/a 39.03
(99.98 %)
1,202
(0.02 %)
876
(100.00 %)
938,148
(4.74 %)
828,944
(9.34 %)
5,833,273
(42.65 %)
78,182
(4.87 %)
150 common dace (hap2.1 2025)
GCA_965113325.1
n/a 17,904
(2.46 %)
68,908
(5.96 %)
n/a 38.98
(99.98 %)
1,147
(0.02 %)
530
(100.00 %)
3,428,827
(55.24 %)
796,220
(8.80 %)
5,775,180
(41.93 %)
77,105
(4.67 %)
151 common seabream (hap1.1 2025)
GCA_965226575.1
n/a 15,435
(2.40 %)
54,036
(6.66 %)
n/a 41.73
(99.99 %)
536
(0.01 %)
576
(100.00 %)
495,544
(2.96 %)
454,601
(9.69 %)
4,614,163
(29.34 %)
29,859
(1.71 %)
152 common seabream (hap2.1 2025)
GCA_965225695.1
n/a 15,519
(2.52 %)
53,533
(6.93 %)
n/a 41.68
(99.99 %)
535
(0.01 %)
784
(99.99 %)
472,383
(2.92 %)
337,781
(6.08 %)
4,705,623
(26.82 %)
29,198
(1.68 %)
153 common seadragon (TA_2022b 2022)
GCF_024500385.1
60,947
(12.28 %)
13,706
(2.67 %)
42,956
(5.71 %)
n/a 42.24
(100.00 %)
196
(0.00 %)
1,259
(100.00 %)
1,417,848
(37.47 %)
173,323
(3.85 %)
3,968,694
(40.23 %)
70,253
(6.29 %)
154 common sole (alternate hap 2023)
GCA_958295035.1
n/a 14,904
(2.99 %)
43,194
(7.09 %)
n/a 40.77
(100.00 %)
n/a 1,318
(100.00 %)
1,128,080
(18.77 %)
328,975
(8.35 %)
3,952,898
(31.64 %)
26,979
(2.08 %)
155 common sole (primary hap 2023 refseq)
GCF_958295425.1
55,359
(12.02 %)
14,844
(2.94 %)
42,832
(6.93 %)
n/a 40.87
(99.99 %)
373
(0.01 %)
242
(100.00 %)
1,149,243
(19.12 %)
342,238
(9.71 %)
3,906,753
(32.84 %)
27,772
(2.71 %)
156 common whitefish (fCorLav1.hap1.1 2024)
GCA_964263955.1
n/a 29,103
(1.36 %)
124,287
(3.94 %)
n/a 43.87
(99.96 %)
5,995
(0.04 %)
11,150
(100.00 %)
1,655,140
(4.68 %)
1,843,550
(17.63 %)
9,367,555
(61.56 %)
112,654
(3.84 %)
157 common whitefish (fCorLav1.hap2.1 2024)
GCA_964263835.1
n/a 25,968
(1.48 %)
104,922
(4.18 %)
n/a 43.67
(99.96 %)
4,689
(0.04 %)
8,669
(99.96 %)
1,320,339
(4.08 %)
1,364,334
(15.61 %)
7,674,742
(61.10 %)
94,019
(3.82 %)
158 convict blenny (fPhoLeu1 alternate hap 2021)
GCA_020510965.1
n/a 5,231
(0.27 %)
47,644
(1.48 %)
n/a 44.62
(99.99 %)
144
(0.01 %)
21,561
(99.99 %)
2,803,873
(49.20 %)
655,416
(2.69 %)
7,558,550
(67.05 %)
181,626
(10.52 %)
159 convict blenny (primary hap 2021)
GCA_020510985.1
n/a n/a 134,417
(1.50 %)
n/a 44.52
(99.13 %)
2,580
(0.87 %)
512
(100.00 %)
9,062,541
(49.33 %)
2,097,650
(2.66 %)
20,502,207
(74.78 %)
568,042
(10.14 %)
160 copperband butterflyfish (fCheRos1 alternate hap 2021)
GCA_017976315.1
n/a 13,622
(2.81 %)
43,285
(6.93 %)
n/a 42.59
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,125
(100.00 %)
1,741,373
(32.89 %)
182,926
(2.01 %)
3,659,106
(21.68 %)
27,693
(1.89 %)
161 copperband butterflyfish (primary hap 2021)
GCA_017976325.1
n/a 15,372
(3.13 %)
44,916
(6.99 %)
n/a 42.57
(100.00 %)
60
(0.00 %)
29
(100.00 %)
1,198,445
(25.93 %)
199,450
(2.10 %)
3,861,717
(21.57 %)
29,106
(1.85 %)
162 copperband butterflyfish (primary hap 2021)
GCF_017976325.1
35,291
(10.46 %)
15,210
(3.03 %)
44,916
(6.99 %)
61,755
(8.99 %)
42.57
(100.00 %)
60
(0.00 %)
29
(100.00 %)
406,118
(2.95 %)
199,450
(2.10 %)
3,861,745
(21.57 %)
29,106
(1.85 %)
163 corkwing wrasse (primary hap 2022)
GCA_947650265.1
n/a 14,740
(2.91 %)
45,483
(7.26 %)
n/a 41.82
(99.96 %)
1,379
(0.04 %)
395
(100.00 %)
936,676
(24.41 %)
306,192
(9.29 %)
3,495,456
(28.75 %)
29,142
(2.35 %)
164 Corydoras catfish unclassified (C115 2021)
GCA_019802505.1
n/a 14,695
(2.68 %)
51,799
(6.37 %)
n/a 42.12
(100.00 %)
n/a 2,080
(100.00 %)
1,969,654
(37.02 %)
663,295
(11.19 %)
3,764,275
(45.19 %)
67,226
(8.43 %)
165 crested bigscale (hap1.1 2025)
GCA_964638095.1
n/a 17,935
(1.34 %)
104,307
(6.12 %)
n/a 44.53
(99.96 %)
2,975
(0.04 %)
2,930
(100.00 %)
5,608,839
(57.44 %)
1,825,932
(20.35 %)
6,375,759
(51.18 %)
149,374
(4.78 %)
166 crested bigscale (hap2.1 2025)
GCA_964638665.1
n/a 17,775
(1.43 %)
100,017
(6.38 %)
n/a 44.59
(99.96 %)
2,894
(0.04 %)
4,301
(99.96 %)
5,332,080
(56.26 %)
1,737,704
(18.88 %)
6,064,583
(49.72 %)
141,258
(4.70 %)
167 crested weedfish (hap1 OG76 2025)
GCA_049082185.1
n/a 14,740
(2.96 %)
58,554
(8.04 %)
n/a 44.56
(99.96 %)
1,180
(0.04 %)
793
(100.00 %)
711,944
(7.44 %)
537,707
(8.17 %)
3,418,045
(29.92 %)
95,750
(8.49 %)
168 crested weedfish (hap2 OG76 2025)
GCA_049082045.1
n/a 13,849
(3.08 %)
53,198
(8.16 %)
n/a 44.70
(99.96 %)
1,089
(0.04 %)
513
(100.00 %)
649,032
(7.21 %)
483,451
(7.55 %)
3,155,766
(28.97 %)
88,490
(8.53 %)
169 crucian carp (alternate hap 2023)
GCA_963082795.1
n/a 4,509
(3.03 %)
16,936
(7.22 %)
n/a 38.67
(100.00 %)
n/a 3,713
(100.00 %)
430,197
(46.38 %)
101,926
(7.54 %)
1,077,239
(32.21 %)
10,612
(4.11 %)
170 crucian carp (primary hap 2023 refseq)
GCF_963082965.1
90,094
(6.75 %)
29,386
(2.81 %)
88,291
(5.37 %)
n/a 38.31
(99.99 %)
832
(0.01 %)
277
(100.00 %)
3,481,382
(45.81 %)
802,773
(6.54 %)
8,190,783
(44.41 %)
83,696
(3.82 %)
171 cuckoo wrasse (primary hap 2023)
GCF_963584025.1
51,190
(10.37 %)
15,144
(2.59 %)
43,207
(5.98 %)
n/a 40.77
(99.98 %)
570
(0.02 %)
324
(100.00 %)
1,435,625
(29.39 %)
330,276
(12.54 %)
4,196,830
(33.83 %)
19,310
(1.01 %)
172 cunner (fTauAds1 alternate hap 2021)
GCA_020745675.1
n/a 14,861
(2.74 %)
42,996
(6.34 %)
n/a 41.31
(99.99 %)
31
(0.01 %)
1,476
(100.00 %)
1,373,727
(30.17 %)
220,572
(4.38 %)
4,176,936
(27.32 %)
17,129
(1.04 %)
173 cunner (primary hap 2021)
GCA_020745685.1
n/a 15,192
(2.74 %)
43,564
(6.38 %)
n/a 41.31
(99.41 %)
283
(0.59 %)
64
(100.00 %)
1,419,667
(30.50 %)
243,024
(4.81 %)
4,334,690
(27.65 %)
17,974
(1.06 %)
174 Dalai köbertrulling (WHDGS20190420 2020)
GCF_015846415.1
49,121
(12.72 %)
16,501
(4.06 %)
40,671
(7.11 %)
n/a 38.77
(100.00 %)
116
(0.00 %)
167
(100.00 %)
1,213,719
(40.21 %)
134,299
(3.43 %)
3,676,403
(30.98 %)
29,879
(3.18 %)
175 Danionella translucida (Bolton 2019)
GCA_007224835.1
n/a 16,341
(3.18 %)
41,545
(5.47 %)
n/a 38.57
(98.69 %)
8,366
(1.31 %)
36,005
(98.69 %)
300,659
(2.50 %)
212,357
(6.15 %)
4,267,143
(35.05 %)
23,311
(2.18 %)
176 Danionella translucida (fDanTra1 2020)
GCA_903798025.1
n/a 15,965
(3.73 %)
37,421
(5.87 %)
n/a 38.52
(94.12 %)
18,487
(5.88 %)
29,831
(94.12 %)
251,333
(2.28 %)
132,120
(1.41 %)
4,061,554
(28.83 %)
16,871
(1.57 %)
177 dark-edged splitfin (DD_20200921_A 2022 refseq)
GCF_021462225.1
56,220
(7.59 %)
15,422
(1.71 %)
50,084
(4.18 %)
n/a 40.18
(99.46 %)
409
(0.54 %)
72
(100.00 %)
369,606
(1.86 %)
176,954
(1.87 %)
6,142,638
(38.35 %)
32,973
(1.28 %)
178 delta smelt
GCF_021917145.1
41,807
(14.97 %)
14,549
(4.09 %)
44,849
(9.74 %)
n/a 44.99
(99.92 %)
1,474
(0.08 %)
376
(100.00 %)
387,882
(5.57 %)
383,522
(9.22 %)
1,814,696
(32.48 %)
28,299
(3.33 %)
179 denticle herring (alternate hap 2019)
GCA_900700345.2
n/a 14,119
(3.95 %)
47,988
(8.57 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
4
(0.00 %)
1,972
(100.00 %)
312,660
(2.77 %)
160,575
(2.83 %)
2,525,528
(27.70 %)
50,830
(8.72 %)
180 denticle herring (v2 2020)
GCA_900700375.2
n/a 16,559
(3.78 %)
58,823
(8.66 %)
74,128
(10.47 %)
43.69
(99.18 %)
464
(0.82 %)
461
(100.00 %)
403,512
(3.23 %)
224,284
(4.61 %)
2,948,738
(28.79 %)
64,661
(9.49 %)
181 doctor fish G.rufa (2025)
GCF_049309525.1
56,413
(6.01 %)
18,728
(2.09 %)
57,498
(4.48 %)
n/a 37.04
(99.47 %)
14,924
(0.54 %)
1,000
(100.00 %)
928,901
(3.56 %)
923,200
(13.04 %)
6,338,918
(52.94 %)
64,694
(3.55 %)
182 dorado (hap1 2023)
GCA_030448965.1
n/a 16,788
(2.12 %)
50,338
(4.68 %)
n/a 41.27
(98.12 %)
641
(1.88 %)
182
(100.00 %)
2,709,759
(34.74 %)
798,364
(14.84 %)
5,418,190
(36.02 %)
30,055
(1.31 %)
183 dorado (hap2 2023 refseq)
GCF_030463535.1
45,512
(7.65 %)
16,797
(2.11 %)
50,411
(4.67 %)
n/a 41.29
(99.15 %)
726
(0.85 %)
103
(100.00 %)
871,278
(4.83 %)
805,806
(14.65 %)
5,615,217
(36.69 %)
30,083
(1.31 %)
184 double-spotted pufferfish T.bimaculatus (TB-2018 2019)
GCA_004026145.2
n/a 14,760
(4.56 %)
56,353
(11.37 %)
n/a 45.56
(99.97 %)
1,033
(0.03 %)
1,158
(100.00 %)
292,029
(9.69 %)
192,568
(5.53 %)
1,623,924
(22.71 %)
51,743
(9.31 %)
185 dwarf seahorse (Florida 2022)
GCF_025434085.1
51,366
(12.50 %)
13,736
(3.19 %)
50,537
(7.64 %)
n/a 44.73
(100.00 %)
79
(0.00 %)
213
(100.00 %)
986,789
(36.30 %)
235,862
(13.25 %)
2,323,084
(41.85 %)
68,121
(17.75 %)
186 eastern happy (primary hap 2024)
GCA_964374335.1
n/a 15,554
(2.13 %)
55,328
(6.30 %)
n/a 41.16
(100.00 %)
40
(0.00 %)
31
(100.00 %)
933,060
(24.43 %)
252,509
(4.84 %)
4,460,314
(32.70 %)
34,184
(2.09 %)
187 eastern happy (v3 2021)
GCA_900246225.5
n/a 15,552
(2.29 %)
52,465
(6.26 %)
86,437
(9.40 %)
41.07
(99.87 %)
490
(0.13 %)
364
(100.00 %)
1,309,350
(35.93 %)
217,916
(1.89 %)
4,547,434
(30.78 %)
33,005
(1.88 %)
188 electric eel (alternate hap 2020)
GCA_013347915.1
n/a 12,020
(3.63 %)
38,881
(7.31 %)
n/a 42.77
(100.00 %)
n/a 2,629
(100.00 %)
429,509
(7.66 %)
432,260
(11.41 %)
2,049,609
(24.32 %)
35,597
(4.37 %)
189 electric eel (MRS-EE1 2018 U Wisconsin)
GCF_003665695.1
40,618
(11.48 %)
15,837
(3.85 %)
23,074
(6.63 %)
n/a 42.56
(96.95 %)
119,361
(3.09 %)
8,786
(100.00 %)
519,014
(5.41 %)
516,718
(6.65 %)
3,020,801
(21.49 %)
41,947
(3.71 %)
190 electric eel (primary hap 2020 refseq)
GCF_013358815.1
48,958
(12.10 %)
15,950
(3.66 %)
48,976
(7.25 %)
54,541
(8.42 %)
42.49
(98.20 %)
227
(1.80 %)
89
(100.00 %)
567,625
(7.41 %)
564,286
(10.86 %)
2,935,360
(24.79 %)
44,501
(3.93 %)
191 electric eel (QZ-2024a 2024)
GCA_041902795.1
n/a 16,358
(2.62 %)
62,068
(6.39 %)
n/a 41.74
(99.75 %)
49
(0.25 %)
460
(100.00 %)
701,679
(6.15 %)
756,011
(21.53 %)
2,660,355
(42.28 %)
50,381
(3.85 %)
192 elephant fish B.brachyistius (T26 2022)
GCF_023856365.1
82,153
(9.98 %)
16,513
(2.13 %)
79,047
(6.37 %)
n/a 44.15
(99.99 %)
234
(0.01 %)
1,425
(100.00 %)
923,543
(11.79 %)
425,650
(9.45 %)
3,525,237
(34.97 %)
91,552
(5.39 %)
193 emerald rockcod
GCF_902827165.1
44,179
(8.48 %)
15,275
(2.20 %)
57,830
(6.43 %)
63,731
(6.65 %)
40.94
(99.99 %)
932
(0.01 %)
864
(100.00 %)
460,185
(3.64 %)
399,729
(6.87 %)
3,533,188
(40.09 %)
52,191
(2.51 %)
194 Eurasian minnow (alternate hap 2023)
GCA_949152275.1
n/a 17,920
(3.03 %)
59,697
(6.61 %)
n/a 39.13
(100.00 %)
8
(0.00 %)
4,949
(100.00 %)
2,285,870
(44.17 %)
480,649
(10.13 %)
4,833,803
(39.56 %)
57,737
(4.15 %)
195 Eurasian minnow (primary hap 2023)
GCA_949152265.1
n/a 17,661
(3.01 %)
58,218
(6.54 %)
n/a 39.21
(99.98 %)
881
(0.02 %)
125
(100.00 %)
2,346,939
(44.27 %)
502,415
(11.23 %)
4,890,830
(40.45 %)
60,482
(4.22 %)
196 European anchovy (BLACKSEA-1 2023)
GCF_034702125.1
48,154
(5.87 %)
15,415
(1.33 %)
77,712
(5.08 %)
n/a 44.45
(99.99 %)
9,202
(0.02 %)
1,922
(100.00 %)
4,406,534
(31.73 %)
2,331,293
(15.35 %)
6,863,540
(50.47 %)
80,927
(2.32 %)
197 European chub (alternate hap 2023)
GCA_949319155.1
n/a 17,416
(2.74 %)
60,936
(6.02 %)
n/a 38.65
(100.00 %)
12
(0.00 %)
7,437
(100.00 %)
2,377,147
(47.98 %)
578,235
(8.27 %)
5,267,308
(40.22 %)
50,909
(3.45 %)
198 European chub (primary hap 2023)
GCA_949319135.1
n/a 18,028
(2.64 %)
64,206
(6.04 %)
n/a 38.73
(99.99 %)
588
(0.01 %)
106
(100.00 %)
2,649,943
(48.88 %)
666,129
(9.08 %)
5,751,610
(41.56 %)
58,471
(3.64 %)
199 European conger (primary hap 2023 refseq)
GCF_963514075.1
54,631
(7.46 %)
17,072
(1.89 %)
34,801
(5.07 %)
n/a 43.89
(99.98 %)
1,009
(0.02 %)
380
(100.00 %)
761,522
(5.99 %)
913,306
(13.25 %)
5,767,879
(35.48 %)
120,990
(6.12 %)
200 European flounder (alternate hap 2023)
GCA_949316195.1
n/a 14,690
(3.17 %)
48,422
(7.90 %)
n/a 42.61
(100.00 %)
n/a 1,915
(100.00 %)
1,138,190
(26.31 %)
249,865
(4.72 %)
3,352,038
(25.55 %)
36,828
(3.13 %)
201 European flounder (primary hap 2023 genbank)
GCA_949316205.1
n/a 14,753
(3.17 %)
47,618
(7.81 %)
n/a 42.59
(99.98 %)
482
(0.02 %)
109
(100.00 %)
1,160,784
(27.06 %)
251,985
(5.23 %)
3,353,121
(26.00 %)
37,130
(2.79 %)
202 European flounder (primary hap 2023 refseq)
GCF_949316205.1
48,969
(12.45 %)
14,751
(3.17 %)
47,618
(7.81 %)
n/a 42.59
(99.98 %)
482
(0.02 %)
108
(100.00 %)
1,160,781
(27.06 %)
251,983
(5.23 %)
3,353,086
(26.00 %)
37,129
(2.79 %)
203 European perch
GCF_010015445.1
55,605
(8.20 %)
15,430
(2.07 %)
55,499
(5.43 %)
n/a 40.90
(99.97 %)
801
(0.03 %)
303
(100.00 %)
684,094
(5.16 %)
634,788
(7.48 %)
5,182,241
(37.07 %)
44,049
(1.94 %)
204 European plaice (alternate hap 2022)
GCA_947347695.1
n/a 14,619
(2.94 %)
50,389
(7.92 %)
n/a 42.58
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3,222
(100.00 %)
430,112
(3.88 %)
299,581
(6.89 %)
3,182,258
(27.97 %)
40,094
(3.66 %)
205 European plaice (primary hap 2022 refseq)
GCF_947347685.1
46,467
(10.51 %)
14,818
(2.71 %)
51,453
(7.41 %)
n/a 42.51
(99.97 %)
1,072
(0.03 %)
355
(100.00 %)
476,314
(3.63 %)
520,729
(13.27 %)
3,283,360
(33.55 %)
47,050
(4.45 %)
206 European seabass (2021)
GCF_905237075.1
62,470
(13.08 %)
15,582
(2.89 %)
44,472
(6.56 %)
69,435
(12.92 %)
40.38
(99.85 %)
272
(0.15 %)
303
(100.00 %)
1,210,970
(24.30 %)
278,140
(4.02 %)
4,343,442
(26.18 %)
15,975
(0.93 %)
207 European smelt (primary hap 2023 genbank)
GCA_963692335.1
n/a 15,640
(3.79 %)
50,248
(9.36 %)
n/a 45.42
(99.90 %)
2,462
(0.10 %)
1,038
(100.00 %)
1,648,435
(31.35 %)
508,368
(13.05 %)
1,992,832
(35.86 %)
33,284
(4.05 %)
208 European smelt (primary hap 2023 refseq)
GCF_963692335.1
46,762
(14.07 %)
15,639
(3.79 %)
50,238
(9.36 %)
n/a 45.42
(99.90 %)
2,462
(0.10 %)
1,007
(100.00 %)
1,648,428
(31.34 %)
508,368
(13.05 %)
1,992,793
(35.86 %)
33,284
(4.05 %)
209 European sprat (primary hap 2023)
GCA_963457725.1
n/a 16,181
(2.44 %)
63,544
(7.17 %)
n/a 43.83
(99.96 %)
1,501
(0.04 %)
387
(100.00 %)
2,109,362
(31.42 %)
1,300,159
(14.91 %)
3,634,744
(35.44 %)
35,552
(1.87 %)
210 fathead minnow
GCF_016745375.1
57,312
(8.34 %)
18,039
(3.02 %)
52,431
(6.01 %)
n/a 38.45
(86.78 %)
5,594
(13.23 %)
911
(100.00 %)
657,027
(4.09 %)
444,571
(6.23 %)
4,902,960
(35.69 %)
49,361
(2.78 %)
211 flathead mullet
GCF_022458985.1
48,689
(12.71 %)
14,908
(3.00 %)
45,084
(6.96 %)
75,582
(11.23 %)
41.90
(99.97 %)
445
(0.04 %)
24
(100.00 %)
469,841
(3.23 %)
207,738
(2.31 %)
3,955,233
(24.74 %)
45,885
(3.03 %)
212 flavescent peacock cichlid (primary hap 2025)
GCA_965226115.1
n/a 15,528
(2.10 %)
55,124
(6.16 %)
n/a 41.15
(100.00 %)
31
(0.00 %)
23
(100.00 %)
946,588
(24.66 %)
252,409
(5.14 %)
4,403,110
(33.26 %)
35,478
(2.07 %)
213 flier cichlid (alternate hap MPI-CPG 2019)
GCA_007364235.1
n/a 17,494
(2.06 %)
62,257
(5.73 %)
n/a 41.17
(99.98 %)
13
(0.02 %)
9,305
(99.98 %)
1,140,986
(16.60 %)
316,083
(2.17 %)
6,036,560
(30.48 %)
26,445
(1.22 %)
214 flier cichlid (MPI-CPG 2019 refseq)
GCF_007364275.1
43,842
(8.12 %)
15,434
(2.15 %)
26,448
(5.90 %)
64,657
(6.60 %)
41.23
(98.19 %)
744
(1.81 %)
188
(100.00 %)
1,014,141
(16.95 %)
287,035
(2.21 %)
5,305,890
(30.67 %)
24,130
(1.26 %)
215 freshwater garfish (fXenCan1 alternate hap 2020)
GCA_014839645.1
n/a 13,745
(2.58 %)
50,416
(6.72 %)
n/a 41.33
(100.00 %)
2
(0.00 %)
5,171
(100.00 %)
442,646
(4.09 %)
276,927
(5.42 %)
3,741,267
(26.25 %)
28,827
(2.28 %)
216 freshwater garfish (primary hap 2020)
GCA_014839995.1
n/a 14,625
(2.57 %)
52,879
(6.72 %)
n/a 41.41
(98.98 %)
1,373
(1.02 %)
410
(100.00 %)
492,828
(4.29 %)
318,631
(5.94 %)
3,977,536
(27.41 %)
32,390
(2.33 %)
217 giant grouper (andai-2023 2024)
GCA_041903045.1
n/a 15,652
(1.85 %)
56,048
(5.08 %)
n/a 41.35
(100.00 %)
7
(0.00 %)
176
(100.00 %)
640,534
(2.88 %)
384,479
(4.59 %)
6,438,939
(33.27 %)
28,221
(1.10 %)
218 giant grouper (andai-2023 2024)
GCF_041903045.1
54,335
(8.28 %)
15,897
(1.90 %)
54,413
(4.93 %)
n/a 41.35
(100.00 %)
7
(0.00 %)
177
(100.00 %)
2,360,178
(45.89 %)
384,480
(4.59 %)
6,438,969
(33.27 %)
28,221
(1.10 %)
219 giant grouper (Andai001 2019)
GCF_005281545.1
45,328
(7.65 %)
15,661
(1.91 %)
53,910
(4.91 %)
n/a 41.26
(96.40 %)
23,415
(3.61 %)
4,201
(100.00 %)
604,763
(2.71 %)
357,944
(2.52 %)
6,501,327
(30.28 %)
26,431
(0.91 %)
220 giant-fin mudskipper (primary hap 2023)
GCA_009829125.3
n/a 14,604
(2.46 %)
44,145
(5.80 %)
n/a 40.22
(99.05 %)
701
(0.95 %)
123
(100.00 %)
1,778,565
(42.94 %)
551,482
(7.22 %)
4,886,874
(38.97 %)
37,287
(2.58 %)
221 gilthead seabream (alternate hap 2019)
GCA_900880695.1
n/a 13,090
(2.37 %)
48,927
(6.41 %)
n/a 41.97
(100.00 %)
2
(0.00 %)
7,241
(100.00 %)
422,758
(2.89 %)
231,452
(2.54 %)
3,818,141
(24.36 %)
38,368
(2.40 %)
222 gilthead seabream (v2 2021)
GCA_900880675.2
n/a 15,752
(2.45 %)
56,395
(6.58 %)
n/a 41.94
(99.96 %)
1,050
(0.04 %)
176
(100.00 %)
1,474,134
(29.50 %)
305,809
(3.03 %)
4,701,691
(25.69 %)
47,327
(2.41 %)
223 girdled pipefish (MCC-2025b 2025)
GCF_051991245.1
57,866
(11.07 %)
13,805
(2.52 %)
44,742
(5.92 %)
n/a 39.76
(100.00 %)
101
(0.00 %)
463
(100.00 %)
1,734,878
(32.37 %)
521,477
(15.39 %)
3,082,588
(49.42 %)
75,991
(6.60 %)
224 glassy sweeper (hap1 2025)
GCA_054100275.1
n/a 14,892
(2.55 %)
47,390
(5.79 %)
n/a 42.54
(99.99 %)
322
(0.01 %)
539
(100.00 %)
1,216,278
(15.23 %)
823,638
(18.14 %)
2,994,017
(41.43 %)
33,021
(2.41 %)
225 glassy sweeper (hap2 2025)
GCA_054100245.1
n/a 14,871
(2.60 %)
45,895
(5.82 %)
n/a 42.50
(99.99 %)
275
(0.01 %)
485
(100.00 %)
1,163,167
(14.63 %)
743,930
(17.84 %)
2,984,076
(40.46 %)
32,923
(2.23 %)
226 golden-line barbel
GCF_001515645.1
74,257
(6.73 %)
29,486
(2.77 %)
55,545
(5.32 %)
n/a 37.54
(89.58 %)
136,894
(10.45 %)
168,074
(89.55 %)
1,118,646
(5.04 %)
718,426
(6.54 %)
9,092,306
(37.16 %)
70,606
(1.91 %)
227 goldfish
GCF_003368295.1
116,745
(8.75 %)
35,097
(2.94 %)
68,251
(6.12 %)
n/a 37.48
(99.99 %)
2,247
(0.01 %)
8,463
(99.99 %)
1,693,800
(5.39 %)
916,195
(5.01 %)
9,731,118
(40.19 %)
66,585
(2.06 %)
228 grass carp (HZGC_01 2021)
GCF_019924925.1
67,821
(11.16 %)
18,195
(3.27 %)
48,459
(5.67 %)
n/a 37.48
(99.98 %)
150
(0.02 %)
31
(100.00 %)
654,416
(3.33 %)
429,734
(3.77 %)
5,501,085
(40.21 %)
26,282
(1.58 %)
229 great blue-spotted mudskipper (Guang Dong 2022)
GCF_026225935.1
36,357
(7.09 %)
14,512
(1.92 %)
45,809
(4.61 %)
n/a 39.76
(99.63 %)
3,407
(0.37 %)
600
(100.00 %)
2,662,894
(54.47 %)
803,911
(10.32 %)
5,763,692
(48.31 %)
53,808
(2.65 %)
230 great blue-spotted mudskipper (pooled male+femail 2014 BGI)
GCF_000788275.1
25,835
(5.19 %)
14,212
(1.97 %)
27,894
(4.68 %)
n/a 39.49
(93.15 %)
92,327
(6.89 %)
108,947
(93.11 %)
552,368
(5.00 %)
742,395
(8.07 %)
5,901,720
(42.46 %)
44,972
(1.97 %)
231 greater amberjack
GCF_002260705.1
33,769
(9.11 %)
15,336
(2.93 %)
22,220
(6.07 %)
n/a 40.86
(99.17 %)
9,742
(0.82 %)
34,656
(100.00 %)
573,770
(4.04 %)
368,800
(3.72 %)
4,449,534
(24.71 %)
15,850
(0.98 %)
232 greater argentine (alternate hap 2023)
GCA_951799415.1
n/a 15,483
(3.45 %)
47,484
(7.95 %)
n/a 44.71
(100.00 %)
n/a 4,805
(100.00 %)
1,400,150
(23.78 %)
738,163
(17.35 %)
2,460,977
(35.90 %)
20,794
(2.09 %)
233 greater argentine (primary hap 2023)
GCA_951799395.1
n/a 16,553
(3.15 %)
51,766
(7.37 %)
n/a 44.75
(99.95 %)
1,752
(0.05 %)
1,085
(100.00 %)
1,674,762
(26.07 %)
900,455
(18.62 %)
2,849,256
(39.22 %)
26,022
(2.30 %)
234 greater pipefish (primary hap 2020)
GCA_901709675.2
n/a 13,469
(5.26 %)
42,380
(12.01 %)
n/a 43.46
(100.00 %)
43
(0.00 %)
88
(100.00 %)
193,442
(3.05 %)
125,716
(4.25 %)
1,676,030
(25.93 %)
46,340
(13.40 %)
235 greater pipefish (v1 alternate hap 2019)
GCA_901709685.1
n/a 10,795
(5.59 %)
33,380
(12.07 %)
n/a 43.29
(100.00 %)
2
(0.00 %)
1,848
(100.00 %)
140,376
(2.96 %)
81,000
(3.32 %)
1,318,564
(23.30 %)
34,104
(12.82 %)
236 greater pipefish (v1.2 2020 refseq)
GCF_901709675.1
47,335
(18.32 %)
13,477
(5.26 %)
42,380
(12.01 %)
37,563
(15.76 %)
43.46
(100.00 %)
43
(0.00 %)
87
(100.00 %)
193,407
(3.05 %)
125,716
(4.25 %)
1,676,004
(25.93 %)
46,327
(10.97 %)
237 greater pipefish (v2 2023 genbank)
GCA_948146105.1
n/a 13,412
(4.76 %)
45,946
(11.50 %)
n/a 44.34
(99.99 %)
95
(0.01 %)
251
(100.00 %)
494,547
(20.10 %)
204,804
(10.66 %)
1,444,044
(34.08 %)
47,904
(17.47 %)
238 greater pipefish (v2 alternate haplotype 2023)
GCA_948146095.1
n/a 13,681
(4.93 %)
45,034
(11.64 %)
n/a 43.88
(100.00 %)
n/a 4,533
(100.00 %)
460,038
(18.47 %)
163,838
(7.90 %)
1,681,190
(29.08 %)
47,523
(15.60 %)
239 greater sand-eel (alternate hap 2023)
GCA_949358355.1
n/a 13,432
(2.10 %)
50,930
(6.39 %)
n/a 41.05
(100.00 %)
n/a 4,952
(100.00 %)
2,495,763
(38.80 %)
473,105
(6.27 %)
3,444,123
(38.56 %)
35,298
(1.94 %)
240 greater sand-eel (primary hap 2023)
GCA_949357725.1
n/a 15,028
(2.35 %)
50,436
(6.30 %)
n/a 41.10
(99.97 %)
1,188
(0.03 %)
1,568
(100.00 %)
2,688,222
(39.74 %)
549,362
(7.60 %)
3,564,661
(40.05 %)
37,043
(1.94 %)
241 green swordtail
GCF_003331165.1
52,602
(11.81 %)
14,955
(2.58 %)
47,115
(6.33 %)
n/a 39.09
(99.71 %)
661
(0.29 %)
272
(100.00 %)
328,469
(2.10 %)
162,178
(2.35 %)
4,801,050
(28.86 %)
37,217
(2.39 %)
242 grey gurnard (primary hap 2023)
GCA_963514095.1
n/a 14,752
(2.74 %)
58,725
(8.49 %)
n/a 43.13
(99.98 %)
553
(0.02 %)
322
(100.00 %)
1,860,845
(35.64 %)
378,045
(9.39 %)
3,208,482
(30.12 %)
66,857
(4.99 %)
243 gudgeon (alternate hap 2023)
GCA_949357705.1
n/a 16,645
(1.92 %)
62,533
(4.55 %)
n/a 39.69
(100.00 %)
8
(0.00 %)
7,253
(100.00 %)
5,166,731
(67.78 %)
750,850
(11.35 %)
5,903,440
(54.20 %)
90,235
(5.58 %)
244 gudgeon (primary hap 2023)
GCA_949357685.1
n/a 17,136
(1.90 %)
63,611
(4.50 %)
n/a 39.74
(99.99 %)
1,046
(0.01 %)
233
(100.00 %)
5,662,029
(68.75 %)
825,757
(11.99 %)
6,236,024
(55.15 %)
99,559
(5.68 %)
245 Gulf pipefish (Florida 2022)
GCF_024217435.2
53,176
(17.83 %)
13,439
(4.00 %)
41,519
(8.87 %)
n/a 44.92
(100.00 %)
11
(0.00 %)
495
(100.00 %)
644,597
(20.82 %)
180,309
(16.78 %)
1,339,434
(43.63 %)
51,080
(18.49 %)
246 Gulf pipefish (RoL_Ssco_1.1 Florida 2022 refseq)
GCF_024217435.1
58,583
(18.27 %)
13,442
(4.00 %)
41,565
(8.87 %)
n/a 44.92
(100.00 %)
11
(0.00 %)
496
(100.00 %)
253,033
(3.86 %)
180,311
(16.78 %)
1,339,521
(43.63 %)
51,080
(18.49 %)
247 Gulf pipefish (RoL_Ssco_1.2 Florida 2022 genbank)
GCA_024217435.4
n/a 13,441
(4.00 %)
41,519
(8.87 %)
n/a 44.92
(100.00 %)
11
(0.00 %)
496
(100.00 %)
644,601
(20.82 %)
180,310
(16.78 %)
1,339,461
(43.63 %)
51,080
(18.49 %)
248 guppy
GCF_000633615.1
48,303
(11.25 %)
14,436
(2.72 %)
44,759
(6.24 %)
n/a 39.33
(90.86 %)
458,354
(9.22 %)
40,143
(90.84 %)
340,480
(2.43 %)
167,943
(1.50 %)
4,695,380
(25.63 %)
35,188
(1.91 %)
249 honeycomb rockfish (fSebUmb1 alternate hap 2020)
GCA_015220095.1
n/a 15,058
(2.50 %)
46,340
(5.85 %)
n/a 40.71
(100.00 %)
21
(0.00 %)
2,131
(100.00 %)
1,642,351
(37.42 %)
389,169
(5.43 %)
4,687,710
(35.55 %)
34,408
(1.75 %)
250 honeycomb rockfish (primary hap 2020)
GCA_015220745.1
n/a 15,189
(2.47 %)
47,034
(5.98 %)
n/a 40.77
(99.83 %)
215
(0.17 %)
139
(100.00 %)
2,065,833
(43.50 %)
422,266
(6.20 %)
4,827,130
(36.22 %)
37,878
(1.84 %)
251 honeycomb rockfish (primary hap 2020)
GCF_015220745.1
57,752
(9.94 %)
15,244
(2.44 %)
47,034
(5.98 %)
63,546
(8.88 %)
40.77
(99.83 %)
215
(0.17 %)
138
(100.00 %)
524,161
(3.79 %)
422,265
(6.20 %)
4,827,148
(36.22 %)
37,878
(1.84 %)
252 horned golden-line barbel
GCF_001515625.1
74,598
(6.94 %)
30,802
(3.11 %)
57,655
(5.63 %)
n/a 37.18
(91.91 %)
150,790
(8.11 %)
314,962
(91.89 %)
1,147,234
(4.93 %)
708,513
(4.77 %)
9,080,512
(35.95 %)
63,217
(1.71 %)
253 humpback grouper (ca_2020 2021)
GCA_019925165.1
n/a 15,747
(1.90 %)
53,724
(4.85 %)
n/a 41.28
(100.00 %)
518
(0.00 %)
306
(100.00 %)
2,548,626
(45.61 %)
366,695
(6.82 %)
6,355,082
(33.14 %)
22,330
(0.83 %)
254 humphead wrasse
GCF_018320785.1
42,229
(6.60 %)
15,287
(1.66 %)
47,025
(4.13 %)
n/a 39.53
(100.00 %)
284
(0.00 %)
46
(100.00 %)
447,458
(2.27 %)
310,170
(4.65 %)
8,002,463
(32.97 %)
12,252
(0.38 %)
255 Indian glassy fish (alternate hap 2019)
GCA_900651595.1
n/a 14,412
(3.70 %)
41,944
(8.58 %)
n/a 42.27
(99.58 %)
230
(0.42 %)
2,242
(100.00 %)
304,774
(2.86 %)
140,555
(2.80 %)
2,689,154
(24.08 %)
15,419
(1.38 %)
256 Indian glassy fish (v2 2020)
GCA_900634625.2
n/a 15,339
(3.60 %)
44,099
(8.47 %)
57,867
(10.10 %)
42.38
(98.08 %)
1,523
(1.92 %)
157
(100.00 %)
346,399
(3.02 %)
163,524
(3.00 %)
2,755,274
(25.07 %)
17,931
(1.47 %)
257 Indian medaka
GCF_002922805.2
49,295
(10.27 %)
14,591
(2.49 %)
52,982
(6.37 %)
n/a 39.04
(94.83 %)
51,550
(5.20 %)
8,493
(100.00 %)
319,151
(2.20 %)
208,690
(2.67 %)
5,412,546
(33.29 %)
40,721
(2.36 %)
258 Indo-Pacific tarpon (2020)
GCF_013368585.1
41,570
(6.90 %)
18,302
(2.47 %)
29,762
(5.45 %)
74,968
(7.01 %)
43.02
(99.97 %)
63
(0.03 %)
207
(100.00 %)
603,558
(3.71 %)
433,446
(4.32 %)
5,341,985
(22.07 %)
78,561
(3.69 %)
259 Japanese flounder
GCF_001970005.1
37,838
(12.25 %)
14,521
(3.39 %)
30,773
(7.34 %)
n/a 41.64
(81.04 %)
40,314
(18.97 %)
9,525
(100.00 %)
332,322
(2.84 %)
164,916
(1.16 %)
3,476,344
(17.36 %)
21,768
(1.42 %)
260 Japanese flounder (ysfri-2021 2022)
GCF_024713975.1
60,200
(14.08 %)
14,987
(3.26 %)
42,919
(7.40 %)
n/a 41.54
(100.00 %)
21
(0.00 %)
25
(100.00 %)
850,797
(19.88 %)
308,390
(6.45 %)
3,329,304
(26.55 %)
23,373
(1.76 %)
261 Japanese medaka
GCF_002234675.1
50,526
(10.32 %)
14,325
(2.50 %)
27,912
(6.71 %)
91,652
(11.67 %)
40.84
(99.93 %)
491
(0.07 %)
25
(100.00 %)
384,317
(4.42 %)
163,041
(3.07 %)
4,631,750
(34.91 %)
41,215
(2.89 %)
262 jewelled blenny (primary hap 2019 refseq)
GCF_902148845.1
42,877
(8.61 %)
15,188
(2.40 %)
41,262
(7.86 %)
58,418
(6.97 %)
44.34
(98.69 %)
602
(1.31 %)
203
(100.00 %)
667,122
(4.21 %)
442,004
(5.09 %)
4,388,570
(26.54 %)
121,464
(9.36 %)
263 jewelled blenny (primary hap 2019 genbank)
GCA_902148845.1
n/a 15,186
(2.40 %)
86,752
(9.03 %)
n/a 44.34
(98.69 %)
602
(1.31 %)
202
(100.00 %)
667,122
(4.21 %)
442,004
(5.09 %)
4,388,312
(26.54 %)
121,464
(9.36 %)
264 jewelled blenny (alternate hap 2019)
GCA_902148835.1
n/a 15,945
(2.17 %)
101,825
(8.93 %)
n/a 44.49
(99.63 %)
9
(0.37 %)
4,516
(100.00 %)
744,228
(4.25 %)
519,896
(5.73 %)
4,677,160
(28.52 %)
138,484
(9.55 %)
265 John dory (alternate hap 2023)
GCA_960530785.1
n/a 14,960
(2.23 %)
74,436
(6.65 %)
n/a 43.94
(100.00 %)
n/a 5,370
(100.00 %)
1,620,688
(23.00 %)
902,057
(13.66 %)
4,547,953
(39.90 %)
129,990
(12.07 %)
266 John dory (primary hap 2023)
GCA_960531495.1
n/a 14,906
(2.33 %)
72,029
(6.72 %)
n/a 43.92
(99.98 %)
887
(0.02 %)
191
(100.00 %)
1,609,654
(22.82 %)
897,264
(13.58 %)
4,548,467
(39.80 %)
129,147
(11.75 %)
267 kelp grouper (mb 2019)
GCF_006386435.1
45,790
(8.57 %)
15,561
(1.99 %)
53,188
(5.12 %)
n/a 41.32
(97.02 %)
48,394
(2.99 %)
4,563
(100.00 %)
574,889
(2.73 %)
367,135
(2.64 %)
6,420,280
(29.10 %)
28,979
(1.07 %)
268 kelp perch (BFR_SWC_R1_liver_20210118 2023)
GCF_029030835.1
40,680
(11.49 %)
14,847
(3.17 %)
46,307
(7.10 %)
n/a 41.87
(100.00 %)
n/a 1,003
(100.00 %)
967,639
(17.54 %)
319,567
(5.43 %)
3,743,006
(26.82 %)
47,481
(4.63 %)
269 Korean giant-fin mudskipper (v1 alternate hap 2020 genbank)
GCA_009829135.1
n/a 13,470
(2.34 %)
42,799
(5.73 %)
n/a 40.16
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,799
(100.00 %)
394,414
(4.41 %)
509,973
(7.17 %)
4,581,968
(38.91 %)
34,522
(2.54 %)
270 Korean giant-fin mudskipper (v1.2 primary hap 2023)
GCF_009829125.3
33,236
(8.44 %)
14,601
(2.46 %)
44,145
(5.80 %)
n/a 40.22
(99.05 %)
701
(0.95 %)
122
(100.00 %)
1,755,227
(42.93 %)
551,482
(7.22 %)
4,887,087
(38.97 %)
37,287
(2.58 %)
271 lake trout
GCF_016432855.1
65,012
(4.57 %)
26,528
(1.53 %)
112,119
(4.47 %)
76,885
(3.80 %)
43.50
(99.99 %)
3,264
(0.01 %)
4,121
(100.00 %)
1,387,896
(5.81 %)
1,797,785
(19.28 %)
9,643,314
(54.44 %)
85,419
(2.52 %)
272 lake whitefish (EN20210322 male 2021 Laval U)
GCF_018398675.1
78,867
(4.31 %)
27,579
(1.38 %)
113,850
(3.63 %)
n/a 44.18
(100.00 %)
1,716
(0.00 %)
6,355
(100.00 %)
1,729,029
(6.03 %)
1,781,307
(15.24 %)
9,311,548
(61.16 %)
126,142
(4.04 %)
273 lake whitefish (EN_2021a female 2021 Laval U)
GCF_020615455.1
87,259
(4.53 %)
28,366
(1.38 %)
117,266
(3.71 %)
n/a 44.12
(100.00 %)
1,159
(0.00 %)
7,334
(100.00 %)
1,768,537
(6.02 %)
1,793,716
(15.51 %)
9,525,312
(61.13 %)
126,485
(3.95 %)
274 lantern fish (primary hap 2024)
GCA_963921795.1
n/a 17,851
(1.28 %)
83,249
(5.18 %)
n/a 42.69
(99.97 %)
2,397
(0.03 %)
709
(100.00 %)
7,797,173
(37.37 %)
1,593,818
(10.64 %)
7,610,300
(54.05 %)
127,942
(3.84 %)
275 large yellow croaker
GCF_000972845.2
49,927
(11.76 %)
15,365
(3.00 %)
26,101
(6.66 %)
n/a 41.34
(99.67 %)
7,424
(0.33 %)
9,998
(100.00 %)
478,685
(3.50 %)
306,063
(3.37 %)
4,199,578
(24.80 %)
28,138
(2.09 %)
276 large-eye snaggletooth (alternate hap 2023)
GCA_949987545.1
n/a 15,841
(2.36 %)
79,276
(8.51 %)
n/a 46.35
(100.00 %)
n/a 5,761
(100.00 %)
2,935,570
(42.17 %)
1,208,602
(21.28 %)
3,157,730
(42.63 %)
88,759
(6.30 %)
277 large-eye snaggletooth (primary hap 2023)
GCA_949987555.1
n/a 16,376
(2.19 %)
82,947
(7.99 %)
n/a 46.31
(99.94 %)
2,631
(0.06 %)
1,522
(100.00 %)
3,333,323
(43.58 %)
1,553,932
(25.91 %)
3,393,507
(46.78 %)
99,668
(6.39 %)
278 largemouth bass (2-A1 2021)
GCA_019677235.1
n/a 15,790
(2.31 %)
50,332
(5.65 %)
n/a 40.87
(99.96 %)
672
(0.04 %)
202
(100.00 %)
464,845
(2.71 %)
255,513
(3.69 %)
5,124,388
(29.65 %)
25,920
(1.67 %)
279 largemouth bass (LMB-PRFRI aquatic 2020)
GCF_014851395.1
55,170
(9.49 %)
16,635
(2.18 %)
56,707
(5.52 %)
n/a 40.86
(99.85 %)
2,909
(0.15 %)
4,753
(100.00 %)
497,281
(2.60 %)
269,495
(3.70 %)
5,496,732
(29.60 %)
28,733
(1.66 %)
280 largescale foureyes (fAnaAna1 alternate hap 2020)
GCA_014839705.1
n/a 8,132
(2.11 %)
25,878
(4.67 %)
n/a 38.55
(100.00 %)
n/a 5,088
(100.00 %)
260,789
(2.73 %)
158,564
(2.12 %)
3,023,128
(27.39 %)
9,678
(1.02 %)
281 largescale foureyes (primary hap 2020)
GCA_014839685.1
n/a 14,774
(2.18 %)
42,858
(4.83 %)
58,247
(6.94 %)
38.54
(99.96 %)
107
(0.04 %)
33
(100.00 %)
506,950
(2.73 %)
305,170
(2.13 %)
6,194,879
(29.85 %)
17,881
(0.94 %)
282 leafy seadragon (BA_2022a 2022)
GCF_024500275.1
46,242
(10.23 %)
13,712
(2.62 %)
43,369
(5.56 %)
n/a 42.40
(100.00 %)
76
(0.00 %)
1,537
(100.00 %)
1,406,779
(35.37 %)
202,983
(7.44 %)
3,933,128
(41.19 %)
70,560
(7.78 %)
283 lemon sole (primary hap 2024)
GCA_964266715.1
n/a 14,961
(2.55 %)
52,234
(6.83 %)
n/a 41.57
(99.99 %)
409
(0.01 %)
1,601
(100.00 %)
1,233,052
(39.33 %)
366,741
(18.98 %)
3,296,338
(36.77 %)
44,712
(2.85 %)
284 leopard coralgrouper
GCF_008729295.1
38,671
(7.52 %)
15,538
(2.18 %)
57,480
(5.26 %)
n/a 39.54
(98.22 %)
3,611
(1.77 %)
94,260
(100.00 %)
629,451
(3.42 %)
385,539
(3.83 %)
6,343,655
(29.35 %)
27,018
(1.26 %)
285 leopard coralgrouper (2020)
GCA_011397275.1
n/a 14,279
(2.33 %)
42,076
(5.46 %)
n/a 39.56
(99.93 %)
1,076
(0.07 %)
110
(100.00 %)
549,895
(3.48 %)
327,803
(5.10 %)
5,415,686
(29.83 %)
22,432
(1.37 %)
286 leopard coralgrouper (mb 2020)
GCA_008729295.2
n/a 15,538
(2.19 %)
57,440
(5.26 %)
n/a 39.54
(98.22 %)
3,611
(1.77 %)
94,259
(100.00 %)
627,843
(3.43 %)
385,539
(3.83 %)
6,342,852
(29.35 %)
27,018
(1.26 %)
287 lesser salmon catfish (fNeoGra1 alternate hap 2023)
GCA_027579805.1
n/a 15,487
(0.88 %)
85,135
(3.39 %)
n/a 42.43
(100.00 %)
3
(0.00 %)
6,593
(100.00 %)
5,572,163
(49.59 %)
1,052,072
(6.02 %)
7,246,646
(62.69 %)
157,768
(4.38 %)
288 lesser salmon catfish (primary hap 2023 refseq)
GCF_027579695.1
53,323
(3.35 %)
15,955
(0.92 %)
85,700
(3.30 %)
n/a 42.44
(99.43 %)
334
(0.57 %)
38
(100.00 %)
6,041,262
(71.88 %)
1,126,468
(6.51 %)
7,609,180
(62.74 %)
166,630
(4.38 %)
289 lesser sand-eel (alternate hap 2023)
GCA_950004245.1
n/a 13,792
(2.19 %)
51,353
(6.60 %)
n/a 41.16
(100.00 %)
1
(0.00 %)
3,620
(100.00 %)
2,536,362
(38.05 %)
513,115
(7.50 %)
3,542,854
(37.60 %)
31,814
(1.79 %)
290 lesser sand-eel (primary hap 2023)
GCA_949987685.1
n/a 13,908
(2.19 %)
50,634
(6.50 %)
n/a 41.22
(99.97 %)
1,017
(0.03 %)
701
(100.00 %)
2,698,640
(39.19 %)
577,328
(8.51 %)
3,615,231
(39.17 %)
33,251
(1.82 %)
291 lesser weever (primary hap 2023)
GCA_963691815.1
n/a 15,269
(2.44 %)
52,449
(6.28 %)
n/a 41.81
(99.99 %)
606
(0.02 %)
133
(100.00 %)
1,879,201
(31.40 %)
449,901
(9.89 %)
4,248,556
(33.21 %)
43,864
(3.01 %)
292 limp eelpout (alternate hap 2023)
GCA_949748265.1
n/a 15,033
(2.98 %)
51,296
(7.68 %)
n/a 43.01
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2,700
(100.00 %)
1,099,919
(28.68 %)
314,919
(9.57 %)
2,620,601
(30.23 %)
49,248
(4.19 %)
293 limp eelpout (primary hap 2023)
GCA_949748355.1
n/a 15,060
(2.89 %)
50,064
(7.31 %)
n/a 41.88
(99.98 %)
589
(0.02 %)
534
(100.00 %)
1,116,427
(28.18 %)
315,489
(13.14 %)
2,598,812
(33.21 %)
50,192
(3.82 %)
294 live sharksucker (alternate hap 2019)
GCA_900963505.1
n/a 14,632
(3.51 %)
40,441
(7.51 %)
n/a 41.42
(99.96 %)
19
(0.04 %)
1,405
(100.00 %)
435,742
(3.57 %)
139,003
(1.51 %)
3,161,165
(22.06 %)
16,302
(1.34 %)
295 live sharksucker (v2 2021)
GCA_900963305.2
n/a 14,975
(3.53 %)
40,908
(7.56 %)
n/a 41.43
(99.89 %)
140
(0.11 %)
38
(100.00 %)
772,309
(14.49 %)
146,353
(1.65 %)
3,204,473
(21.79 %)
16,807
(1.33 %)
296 longspined bullhead (.1 primary hap 2021)
GCA_910589615.1
n/a 15,027
(3.10 %)
51,137
(7.71 %)
n/a 42.22
(99.99 %)
242
(0.01 %)
27
(100.00 %)
452,844
(4.81 %)
417,308
(9.63 %)
3,262,282
(28.51 %)
55,527
(4.38 %)
297 longspined bullhead (fTauBub2.1 alternate hap 2021)
GCA_910589325.1
n/a 15,137
(3.09 %)
52,499
(7.75 %)
n/a 42.22
(100.00 %)
n/a 1,778
(100.00 %)
448,166
(4.67 %)
416,181
(8.95 %)
3,288,388
(27.99 %)
55,747
(4.41 %)
298 lumpfish (alternate hap 2019)
GCA_009769515.1
n/a 12,848
(3.32 %)
43,711
(8.09 %)
n/a 42.84
(100.00 %)
n/a 1,866
(100.00 %)
407,698
(6.03 %)
360,501
(11.29 %)
2,456,041
(28.07 %)
45,916
(5.21 %)
299 lumpfish (primary hap v2.1 2023 genbank)
GCA_963457625.1
n/a 14,944
(3.23 %)
50,328
(8.09 %)
n/a 42.82
(99.97 %)
954
(0.03 %)
232
(100.00 %)
1,034,598
(25.93 %)
434,819
(13.21 %)
2,907,371
(30.18 %)
55,066
(5.20 %)
300 lumpfish (v1 primary hap 2019 refseq)
GCF_009769545.1
41,612
(11.11 %)
14,752
(3.31 %)
49,223
(8.10 %)
52,721
(8.34 %)
42.83
(98.22 %)
347
(1.78 %)
48
(100.00 %)
478,386
(6.02 %)
421,632
(11.07 %)
2,928,619
(27.99 %)
53,321
(5.09 %)
301 lyretail cichlid
GCF_000239395.1
38,273
(10.03 %)
14,804
(2.69 %)
23,751
(5.79 %)
n/a 40.44
(80.94 %)
109,100
(19.10 %)
118,181
(80.90 %)
695,696
(14.49 %)
119,381
(1.10 %)
4,539,429
(19.49 %)
18,098
(0.91 %)
302 Macquarie perch (MP_SCH12 2025)
GCA_005408345.2
n/a 15,741
(3.05 %)
44,413
(6.63 %)
n/a 40.96
(99.81 %)
2,749
(0.19 %)
4,720
(99.81 %)
1,194,402
(27.04 %)
207,054
(2.14 %)
4,244,275
(25.87 %)
17,670
(1.38 %)
303 Malawi cichlid R.sp.'chilingali' (2024)
GCA_963969265.1
n/a 15,501
(2.18 %)
54,090
(6.20 %)
n/a 41.17
(99.99 %)
422
(0.01 %)
82
(100.00 %)
1,727,328
(38.16 %)
259,351
(4.71 %)
4,381,278
(33.25 %)
35,281
(1.93 %)
304 mandarin fish (A2ci 2020)
GCA_011952085.1
n/a 15,626
(2.66 %)
47,764
(6.15 %)
n/a 40.50
(99.86 %)
308
(0.14 %)
1,155
(100.00 %)
464,800
(3.45 %)
224,516
(3.03 %)
4,595,551
(27.23 %)
18,300
(1.44 %)
305 mandarin fish (FFG_IHB_CAS 2021)
GCF_020085105.1
64,831
(12.89 %)
15,283
(2.75 %)
43,349
(6.02 %)
n/a 40.35
(100.00 %)
93
(0.00 %)
65
(100.00 %)
441,324
(3.38 %)
206,420
(2.54 %)
4,582,841
(27.41 %)
15,999
(1.17 %)
306 mandarin fish (RoL2022-P1 2023)
GCF_027744825.2
49,029
(12.41 %)
14,186
(3.08 %)
55,502
(8.05 %)
n/a 43.27
(100.00 %)
19
(0.00 %)
97
(100.00 %)
321,832
(4.91 %)
114,318
(16.04 %)
2,300,636
(32.10 %)
46,312
(5.05 %)
307 mangrove rivulus
GCF_001649575.2
46,187
(11.82 %)
14,522
(2.87 %)
46,641
(6.86 %)
n/a 40.03
(94.31 %)
32,278
(5.70 %)
300
(100.00 %)
345,678
(2.32 %)
146,263
(1.33 %)
4,718,292
(27.30 %)
39,541
(2.69 %)
308 marbled rockcod (alternate hap 2023)
GCA_949606865.1
n/a 14,564
(1.72 %)
71,604
(6.41 %)
n/a 41.49
(100.00 %)
n/a 8,737
(100.00 %)
1,662,251
(42.29 %)
439,119
(12.96 %)
3,776,125
(45.00 %)
56,507
(2.83 %)
309 marbled rockcod (primary hap 2023)
GCA_949606895.1
n/a 15,070
(1.79 %)
71,367
(6.50 %)
n/a 41.46
(99.92 %)
4,157
(0.08 %)
943
(100.00 %)
1,717,591
(42.63 %)
474,348
(12.30 %)
4,011,319
(44.93 %)
59,531
(2.83 %)
310 Mariana snailfish (Mariana Trench HS2019 2023)
GCF_029220125.1
44,376
(10.91 %)
14,032
(2.80 %)
60,400
(8.09 %)
n/a 43.84
(99.86 %)
974
(0.14 %)
200
(100.00 %)
1,157,953
(36.57 %)
569,832
(12.19 %)
2,864,996
(37.65 %)
98,423
(9.53 %)
311 Mexican tetra (2017 WashU)
GCF_000372685.2
47,018
(6.00 %)
16,516
(1.68 %)
33,920
(4.24 %)
n/a 38.00
(96.73 %)
621
(3.27 %)
2,415
(100.00 %)
1,125,511
(6.89 %)
1,113,607
(11.76 %)
8,546,053
(42.44 %)
44,933
(1.77 %)
312 Mexican tetra (ESR-SI-001 2022)
GCA_023375975.1
n/a 17,080
(1.67 %)
52,903
(4.12 %)
n/a 38.24
(100.00 %)
14
(0.00 %)
109
(100.00 %)
3,667,987
(52.26 %)
1,363,316
(12.23 %)
7,667,719
(47.23 %)
48,358
(1.88 %)
313 Mexican tetra (ESR-SI-001 2022)
GCF_023375975.1
71,254
(7.50 %)
16,674
(1.63 %)
52,903
(4.12 %)
101,896
(6.64 %)
38.24
(100.00 %)
14
(0.00 %)
109
(100.00 %)
1,155,823
(4.90 %)
1,363,316
(12.23 %)
7,667,721
(47.23 %)
48,358
(1.88 %)
314 Mexican tetra (Pach_M1 Pachon cave 2021)
GCA_019721115.1
n/a 16,698
(1.62 %)
62,818
(5.14 %)
74,339
(6.58 %)
38.41
(99.99 %)
334
(0.01 %)
195
(100.00 %)
1,194,830
(5.04 %)
1,460,981
(11.81 %)
7,590,179
(47.66 %)
50,533
(2.46 %)
315 Midas cichlid (2014)
GCA_000751415.1
n/a 15,067
(2.44 %)
45,263
(5.54 %)
n/a 40.74
(92.95 %)
617,558
(7.14 %)
624,195
(92.86 %)
867,309
(14.82 %)
199,669
(1.16 %)
5,215,762
(25.14 %)
13,920
(0.64 %)
316 milkfish (2019)
GCF_902362185.1
30,812
(7.61 %)
16,869
(3.41 %)
21,377
(6.58 %)
n/a 41.53
(99.36 %)
112
(0.64 %)
31
(100.00 %)
958,774
(8.18 %)
731,733
(9.10 %)
3,702,024
(26.31 %)
22,089
(1.27 %)
317 milkfish (alternate hap 2019)
GCA_902362175.1
n/a 16,565
(3.38 %)
42,094
(6.75 %)
n/a 41.51
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1,937
(100.00 %)
930,392
(8.11 %)
708,375
(9.04 %)
3,612,575
(26.46 %)
21,531
(1.27 %)
318 milkfish (primary hap 2019)
GCA_902362185.1
n/a 16,866
(3.41 %)
42,121
(6.75 %)
n/a 41.53
(99.36 %)
111
(0.64 %)
30
(100.00 %)
958,774
(8.18 %)
731,732
(9.10 %)
3,701,956
(26.31 %)
22,089
(1.27 %)
319 minispotted lanternfish (primary hap 2023)
GCA_963454915.1
n/a 17,701
(1.62 %)
73,433
(5.69 %)
n/a 42.20
(99.98 %)
1,398
(0.02 %)
388
(100.00 %)
6,438,444
(40.32 %)
1,202,669
(11.51 %)
7,055,665
(47.04 %)
74,954
(3.44 %)
320 monkeyface prickleback (CVI_PGR_0920_01 alternate hap 2022)
GCA_023349535.1
n/a 15,176
(3.17 %)
47,458
(7.48 %)
n/a 42.05
(99.99 %)
927
(0.02 %)
486
(100.00 %)
1,167,409
(26.98 %)
438,114
(8.08 %)
3,351,987
(27.25 %)
45,298
(3.39 %)
321 monkeyface prickleback (CVI_PGR_0920_01 primary hap 2022)
GCA_023349555.1
n/a 14,480
(3.19 %)
44,951
(7.47 %)
n/a 42.05
(99.98 %)
936
(0.02 %)
725
(100.00 %)
1,101,582
(26.86 %)
415,846
(8.16 %)
3,162,480
(27.08 %)
42,657
(3.44 %)
322 monkeyface prickleback (CVI_PGR_0920_01 primary hap 2022)
GCF_023349555.1
40,276
(12.25 %)
14,478
(3.19 %)
44,951
(7.47 %)
n/a 42.05
(99.98 %)
936
(0.02 %)
1,660
(99.98 %)
1,101,578
(26.86 %)
415,846
(8.16 %)
3,162,428
(27.08 %)
42,657
(3.44 %)
323 Monterrey platyfish
GCF_001444195.1
53,100
(12.11 %)
14,672
(2.71 %)
27,552
(6.74 %)
n/a 39.02
(99.85 %)
229
(0.15 %)
68
(100.00 %)
305,761
(2.11 %)
134,157
(2.14 %)
4,687,726
(28.26 %)
33,082
(2.28 %)
324 mormyrid electric fish (MSU_618 2025)
GCF_048594095.1
77,155
(10.70 %)
16,413
(2.24 %)
85,893
(7.33 %)
n/a 43.96
(100.00 %)
249
(0.00 %)
407
(100.00 %)
447,893
(2.43 %)
464,565
(9.46 %)
3,801,201
(29.32 %)
93,225
(5.54 %)
325 mother-of-pearl pipefish (UIUO_Vmar 2025)
GCF_051991255.1
52,779
(11.71 %)
13,809
(2.79 %)
42,073
(6.01 %)
n/a 39.99
(100.00 %)
67
(0.00 %)
213
(100.00 %)
1,377,634
(26.81 %)
393,358
(16.01 %)
3,239,092
(44.24 %)
67,936
(6.78 %)
326 mummichog (Maine)
GCF_000826765.1
41,183
(7.38 %)
14,602
(1.92 %)
57,194
(5.03 %)
35,597
(6.40 %)
40.58
(91.29 %)
123,625
(8.75 %)
120,723
(91.25 %)
447,158
(2.19 %)
235,336
(1.39 %)
6,518,990
(26.03 %)
54,589
(2.39 %)
327 mummichog (U. Missouri)
GCF_011125445.2
56,612
(6.89 %)
15,361
(1.60 %)
69,801
(5.20 %)
n/a 40.76
(99.88 %)
2,820
(0.12 %)
1,031
(100.00 %)
636,480
(2.75 %)
392,130
(3.32 %)
7,023,777
(32.98 %)
81,101
(3.45 %)
328 New Zealand spotty (alternate hap 2019 genbank)
GCA_009762545.1
n/a 13,566
(2.17 %)
40,774
(5.21 %)
n/a 40.81
(100.00 %)
n/a 3,286
(100.00 %)
472,659
(4.46 %)
348,429
(5.17 %)
4,169,213
(33.57 %)
16,368
(0.83 %)
329 New Zealand spotty (primary hap 2019 genbank)
GCA_009762535.1
n/a 14,609
(2.22 %)
43,262
(5.33 %)
60,241
(8.02 %)
40.86
(98.32 %)
1,135
(1.69 %)
468
(100.00 %)
519,324
(4.65 %)
393,329
(5.54 %)
4,522,265
(33.34 %)
18,302
(0.85 %)
330 New Zealand spotty (primary hap refseq)
GCF_009762535.1
45,555
(9.06 %)
14,609
(2.22 %)
43,259
(5.33 %)
60,241
(8.02 %)
40.86
(98.32 %)
1,135
(1.69 %)
467
(100.00 %)
517,755
(4.63 %)
393,328
(5.54 %)
4,522,224
(33.34 %)
18,299
(0.85 %)
331 Nile tilapia
GCF_001858045.2
77,397
(10.87 %)
15,599
(1.99 %)
32,839
(6.04 %)
n/a 40.73
(99.99 %)
551
(0.01 %)
2,460
(100.00 %)
600,869
(5.40 %)
291,105
(3.17 %)
4,958,128
(31.15 %)
32,038
(1.81 %)
332 ninespine stickleback (alternate hap 2023)
GCA_949316245.1
n/a 13,050
(3.93 %)
44,650
(10.12 %)
n/a 44.10
(100.00 %)
n/a 1,934
(100.00 %)
512,583
(14.83 %)
156,305
(8.46 %)
2,005,803
(27.09 %)
59,674
(9.19 %)
333 ninespine stickleback (NSP_V7 2020)
GCF_902500615.1
51,166
(15.31 %)
14,765
(3.99 %)
49,191
(9.80 %)
n/a 44.37
(99.99 %)
341
(0.01 %)
1,667
(100.00 %)
380,357
(3.60 %)
188,301
(6.29 %)
2,422,266
(25.70 %)
72,584
(9.69 %)
334 ninespine stickleback (primary hap 2023 genbank)
GCA_949316345.1
n/a 14,600
(3.83 %)
49,927
(9.98 %)
n/a 44.12
(99.97 %)
738
(0.03 %)
175
(100.00 %)
599,088
(14.68 %)
186,747
(10.27 %)
2,273,942
(28.36 %)
70,136
(9.39 %)
335 ninespine stickleback (primary hap 2023 refseq)
GCF_949316345.1
57,816
(15.11 %)
14,598
(3.83 %)
49,473
(9.87 %)
n/a 44.12
(99.97 %)
738
(0.03 %)
174
(100.00 %)
599,085
(14.68 %)
186,746
(10.27 %)
2,273,889
(28.36 %)
70,136
(9.39 %)
336 North African catfish (Netherlands MV-2021 2022)
GCF_024256425.1
51,085
(7.42 %)
15,809
(2.17 %)
43,728
(4.54 %)
n/a 39.00
(100.00 %)
n/a 48
(100.00 %)
2,472,286
(44.73 %)
560,123
(5.68 %)
6,203,876
(38.64 %)
42,187
(2.72 %)
337 North African catfish (Netherlands MV-2021 alternate hap 2022)
GCA_024256465.1
n/a 15,704
(2.16 %)
43,094
(4.57 %)
n/a 38.93
(99.99 %)
115
(0.01 %)
104
(100.00 %)
1,034,605
(5.50 %)
566,093
(5.52 %)
6,229,176
(38.50 %)
41,022
(2.53 %)
338 North African catfish (Netherlands MV-2021 primary hap 2022)
GCA_024256435.1
n/a 15,762
(2.12 %)
43,732
(4.51 %)
n/a 38.98
(100.00 %)
180
(0.00 %)
278
(100.00 %)
1,071,044
(5.64 %)
581,680
(6.16 %)
6,228,783
(39.01 %)
42,159
(2.70 %)
339 northern cavefish (hap1 2024)
GCA_046255685.1
n/a 14,295
(2.22 %)
50,623
(6.07 %)
n/a 42.09
(99.99 %)
466
(0.01 %)
892
(100.00 %)
1,941,831
(49.35 %)
650,256
(17.85 %)
3,210,410
(44.77 %)
55,251
(4.79 %)
340 northern cavefish (hap2 2024)
GCA_046255725.1
n/a 14,542
(2.12 %)
51,650
(5.81 %)
n/a 41.56
(99.99 %)
484
(0.01 %)
667
(100.00 %)
2,014,967
(51.82 %)
755,698
(19.90 %)
3,290,098
(47.08 %)
57,881
(4.66 %)
341 northern pike
GCF_004634155.1
66,376
(9.11 %)
16,778
(2.37 %)
27,040
(5.41 %)
n/a 42.29
(99.99 %)
584
(0.01 %)
908
(100.00 %)
1,065,458
(31.14 %)
531,451
(7.80 %)
4,677,366
(33.26 %)
44,793
(2.82 %)
342 northern pike (alternate hap 2020)
GCA_011004835.1
n/a 11,782
(2.41 %)
40,748
(5.68 %)
n/a 42.32
(99.93 %)
11
(0.07 %)
3,813
(100.00 %)
700,818
(30.15 %)
372,729
(7.71 %)
3,058,655
(31.76 %)
29,687
(2.57 %)
343 northern pike (primary hap 2020 refseq)
GCF_011004845.1
63,720
(9.28 %)
16,618
(2.41 %)
55,784
(5.64 %)
82,941
(8.82 %)
42.22
(99.89 %)
112
(0.11 %)
53
(100.00 %)
984,415
(29.15 %)
524,708
(7.32 %)
4,691,096
(32.91 %)
42,910
(2.52 %)
344 northern snakehead (prfri 2023)
GCF_033026475.1
61,639
(13.32 %)
15,131
(2.87 %)
35,444
(5.74 %)
n/a 39.76
(100.00 %)
52
(0.00 %)
291
(100.00 %)
830,033
(26.45 %)
152,304
(8.77 %)
3,778,846
(29.39 %)
8,436
(0.70 %)
345 ocellated dragonet (captive hap1 2024)
GCA_044231665.1
n/a 13,787
(3.68 %)
60,819
(10.07 %)
n/a 45.42
(100.00 %)
99
(0.00 %)
108
(100.00 %)
259,874
(3.38 %)
94,885
(3.76 %)
2,302,967
(21.04 %)
58,433
(13.25 %)
346 ocellated dragonet (captive hap2 2024)
GCA_044231645.1
n/a 13,709
(3.65 %)
60,517
(9.98 %)
n/a 45.43
(100.00 %)
111
(0.00 %)
129
(100.00 %)
272,479
(3.57 %)
101,623
(4.29 %)
2,384,412
(21.91 %)
58,256
(13.22 %)
347 Old Calabar mormyrid (PKING1 2018)
GCF_002872115.1
61,915
(11.48 %)
15,987
(2.73 %)
33,963
(6.66 %)
n/a 43.93
(92.03 %)
49,579
(7.99 %)
4,666
(100.00 %)
348,463
(2.27 %)
314,129
(2.95 %)
4,259,711
(20.83 %)
76,846
(4.18 %)
348 old wife (hap1 2024)
GCA_043641665.1
n/a 15,390
(3.48 %)
41,015
(7.24 %)
n/a 42.00
(100.00 %)
114
(0.00 %)
135
(100.00 %)
1,334,569
(24.51 %)
219,801
(2.87 %)
3,652,047
(23.09 %)
19,721
(1.34 %)
349 old wife E.armatus (hap1 2024)
GCF_043641665.1
32,231
(8.81 %)
15,382
(3.41 %)
41,015
(7.24 %)
n/a 42.00
(100.00 %)
114
(0.00 %)
136
(100.00 %)
1,143,877
(18.90 %)
219,801
(2.87 %)
3,652,133
(23.09 %)
19,721
(1.34 %)
350 old wife E.armatus (hap2 2024)
GCA_043640875.1
n/a 15,360
(3.42 %)
41,012
(7.26 %)
n/a 41.99
(100.00 %)
100
(0.00 %)
94
(100.00 %)
438,416
(3.46 %)
219,275
(2.83 %)
3,623,998
(22.85 %)
19,710
(1.32 %)
351 orangethroat darter
GCF_008692095.1
55,448
(8.29 %)
15,000
(2.25 %)
49,918
(5.41 %)
n/a 40.91
(99.57 %)
101,221
(0.47 %)
3,119
(100.00 %)
566,915
(3.75 %)
509,018
(6.60 %)
5,142,090
(31.18 %)
26,702
(1.46 %)
352 orbiculate cardinalfish (primary hap 2019 refseq)
GCF_902148855.1
46,571
(5.47 %)
15,761
(1.50 %)
31,563
(4.00 %)
59,905
(3.98 %)
37.90
(99.73 %)
1,844
(0.27 %)
340
(100.00 %)
1,257,250
(5.57 %)
979,214
(8.64 %)
6,386,731
(48.59 %)
29,320
(0.87 %)
353 orbiculate cardinalfish (primary hap 2019 genbank)
GCA_902148855.1
n/a 15,761
(1.50 %)
52,078
(3.82 %)
n/a 37.90
(99.73 %)
1,844
(0.27 %)
340
(100.00 %)
1,257,250
(5.57 %)
979,214
(8.64 %)
6,386,126
(48.59 %)
29,320
(0.87 %)
354 orbiculate cardinalfish (alternate hap 2019)
GCA_902148825.1
n/a 14,018
(1.51 %)
45,251
(3.61 %)
n/a 37.73
(99.94 %)
142
(0.06 %)
7,038
(99.94 %)
1,041,393
(5.09 %)
744,623
(6.94 %)
6,250,631
(45.53 %)
22,522
(0.77 %)
355 oriental weatherfish (2024)
GCF_027580225.2
72,545
(8.62 %)
17,655
(2.31 %)
50,007
(4.93 %)
n/a 38.17
(100.00 %)
110
(0.00 %)
61
(100.00 %)
446,769
(2.37 %)
424,953
(7.13 %)
6,268,308
(45.46 %)
53,150
(3.31 %)
356 oriental weatherfish (BS_2022a 2023)
GCF_027580225.1
68,792
(8.54 %)
17,223
(2.28 %)
49,697
(5.11 %)
n/a 38.10
(99.99 %)
614
(0.01 %)
358
(100.00 %)
2,925,549
(40.35 %)
402,676
(5.35 %)
5,933,365
(45.71 %)
56,843
(3.18 %)
357 Osbeck's grenadier anchovy (Shantou hap1 2025)
GCA_048544215.1
n/a 14,679
(2.30 %)
51,447
(6.15 %)
n/a 44.09
(99.99 %)
1,177
(0.01 %)
180
(100.00 %)
1,452,983
(14.50 %)
1,649,878
(17.81 %)
4,184,643
(38.57 %)
36,016
(2.07 %)
358 Osbeck's grenadier anchovy (Shantou hap2 2025)
GCA_048544225.1
n/a 15,600
(2.30 %)
54,714
(6.21 %)
n/a 43.99
(99.99 %)
1,132
(0.01 %)
184
(100.00 %)
1,505,689
(14.07 %)
1,691,834
(17.30 %)
4,407,291
(38.23 %)
38,205
(2.14 %)
359 oyster pompano (Australia AG129_WGS33_773 2025)
GCF_046630095.1
60,285
(14.61 %)
15,290
(2.96 %)
42,088
(6.53 %)
n/a 41.26
(100.00 %)
n/a 150
(100.00 %)
534,470
(3.96 %)
267,099
(3.88 %)
4,094,899
(24.75 %)
14,784
(1.60 %)
360 P.nyererei 1_Seehausen
GCF_000239375.1
40,001
(9.36 %)
14,904
(2.72 %)
24,732
(5.87 %)
n/a 40.60
(84.20 %)
60,817
(15.83 %)
68,050
(84.17 %)
306,171
(3.27 %)
124,292
(0.75 %)
4,414,831
(20.66 %)
18,455
(0.96 %)
361 Pacific bluefin tuna (20180606_amami#17_male 2023)
GCA_021601225.2
n/a 15,791
(2.58 %)
43,533
(5.61 %)
n/a 39.67
(100.00 %)
269
(0.00 %)
849
(100.00 %)
1,627,265
(32.11 %)
249,744
(3.17 %)
5,205,419
(26.82 %)
13,305
(0.67 %)
362 Pacific cod (2023)
GCF_031168955.1
49,430
(13.67 %)
13,542
(2.89 %)
64,214
(9.77 %)
n/a 45.55
(99.92 %)
4,826
(0.09 %)
24
(100.00 %)
1,117,561
(38.30 %)
685,851
(13.38 %)
2,330,116
(34.15 %)
87,761
(8.68 %)
363 Pacific halibut (PH-IPHC-18 2020)
GCF_013339905.1
48,776
(12.61 %)
14,747
(3.15 %)
45,075
(7.30 %)
n/a 42.24
(100.00 %)
219
(0.00 %)
120
(100.00 %)
410,917
(4.22 %)
246,500
(4.66 %)
3,680,698
(25.23 %)
31,508
(2.30 %)
364 Pacific halibut (QCI-W04-F060 2022)
GCF_022539355.2
46,697
(12.50 %)
14,862
(3.15 %)
45,824
(7.30 %)
n/a 42.17
(99.95 %)
1,131
(0.05 %)
53
(100.00 %)
407,699
(3.94 %)
247,330
(3.84 %)
3,838,896
(24.75 %)
31,782
(2.27 %)
365 Pacific saury (AMF1-May2022 2023)
GCF_033807715.1
54,344
(6.52 %)
15,214
(1.67 %)
74,345
(6.13 %)
n/a 41.49
(99.96 %)
900
(0.04 %)
759
(100.00 %)
805,776
(5.16 %)
849,901
(11.48 %)
4,645,552
(43.92 %)
106,026
(5.14 %)
366 panther danio (primary hap 2020)
GCF_903798145.1
40,657
(5.52 %)
17,858
(2.46 %)
42,119
(3.16 %)
n/a 36.32
(98.82 %)
1,821
(1.18 %)
342
(100.00 %)
3,973,354
(56.67 %)
940,639
(7.81 %)
8,701,639
(50.54 %)
29,684
(1.18 %)
367 parallel lanternfish (alternate hap 2024)
GCA_964188415.1
n/a 15,421
(1.80 %)
62,324
(6.15 %)
n/a 42.79
(99.90 %)
4,955
(0.10 %)
4,978
(99.90 %)
4,032,523
(34.18 %)
982,411
(16.51 %)
5,189,655
(46.47 %)
64,543
(3.14 %)
368 parallel lanternfish (primary hap 2024)
GCA_964188405.1
n/a 16,917
(1.64 %)
72,190
(5.85 %)
n/a 42.91
(99.96 %)
2,729
(0.04 %)
24
(100.00 %)
4,976,327
(35.08 %)
1,258,755
(18.52 %)
6,268,804
(48.21 %)
81,193
(3.23 %)
369 Patagonian blennie (Puerto Natales JMC-PN-2008 2024)
GCF_036324505.1
42,701
(12.59 %)
14,986
(3.15 %)
46,289
(7.75 %)
n/a 40.99
(99.97 %)
380
(0.03 %)
27
(100.00 %)
1,031,762
(25.30 %)
219,393
(4.63 %)
3,436,780
(25.57 %)
16,570
(1.12 %)
370 pejerrey (fOdoBon6 haplotype 2 2023)
GCA_027942885.1
n/a 15,317
(2.02 %)
61,647
(6.35 %)
n/a 41.37
(99.99 %)
135
(0.01 %)
469
(99.99 %)
981,519
(15.40 %)
319,637
(12.45 %)
3,706,473
(36.77 %)
50,353
(2.98 %)
371 pejerrey (hap1 2023 genbank)
GCA_027942865.1
n/a 15,242
(2.07 %)
60,994
(6.53 %)
n/a 41.51
(99.99 %)
282
(0.01 %)
189
(100.00 %)
975,354
(15.76 %)
315,625
(10.49 %)
3,601,904
(35.09 %)
49,121
(3.07 %)
372 pejerrey (hap1 2023 refseq)
GCF_027942865.1
47,443
(8.28 %)
15,242
(2.07 %)
60,994
(6.53 %)
n/a 41.51
(99.99 %)
282
(0.01 %)
189
(100.00 %)
440,063
(2.87 %)
315,625
(10.49 %)
3,601,808
(35.09 %)
49,121
(3.07 %)
373 peladilla (fAplTae1 alternate hap 2021)
GCA_017639685.1
n/a 16,729
(3.56 %)
56,451
(8.61 %)
n/a 45.00
(100.00 %)
11
(0.00 %)
5,701
(100.00 %)
1,153,359
(18.94 %)
829,887
(14.54 %)
2,793,018
(28.79 %)
49,469
(4.32 %)
374 peladilla (primary hap 2021)
GCA_017639675.1
n/a 13,829
(3.83 %)
41,932
(8.64 %)
n/a 45.01
(98.24 %)
1,158
(1.77 %)
41
(100.00 %)
930,246
(18.49 %)
660,569
(13.71 %)
2,316,198
(27.66 %)
41,023
(4.40 %)
375 pencil smelt N.antarctica (primary hap 2024)
GCA_963989245.1
n/a 17,996
(2.00 %)
89,591
(7.93 %)
n/a 45.22
(99.94 %)
3,299
(0.06 %)
1,177
(100.00 %)
2,828,457
(30.93 %)
1,676,413
(19.87 %)
4,137,400
(48.69 %)
78,669
(4.37 %)
376 picturesque dragonet (SynPic1 hap1 2024)
GCA_044231685.1
n/a 13,827
(3.46 %)
53,000
(8.90 %)
n/a 43.38
(100.00 %)
122
(0.00 %)
364
(100.00 %)
222,800
(3.83 %)
105,428
(7.84 %)
2,500,710
(25.24 %)
41,125
(5.45 %)
377 picturesque dragonet (SynPic1 hap2 2024)
GCA_044231675.1
n/a 13,816
(3.52 %)
52,689
(9.01 %)
n/a 43.48
(100.00 %)
100
(0.00 %)
300
(100.00 %)
223,762
(3.25 %)
105,291
(6.28 %)
2,579,336
(24.55 %)
41,114
(5.50 %)
378 pike-perch
GCF_008315115.2
65,418
(8.54 %)
15,731
(2.23 %)
52,240
(5.69 %)
n/a 40.87
(99.98 %)
711
(0.02 %)
337
(100.00 %)
629,999
(5.16 %)
567,578
(7.41 %)
4,697,709
(36.49 %)
39,666
(1.93 %)
379 pinecone soldierfish (primary hap 2019 refseq)
GCF_902150065.1
40,770
(8.72 %)
15,738
(2.42 %)
26,691
(5.69 %)
57,069
(6.14 %)
41.83
(99.78 %)
253
(0.22 %)
87
(100.00 %)
1,063,888
(5.90 %)
646,820
(4.30 %)
4,938,857
(28.11 %)
41,636
(2.04 %)
380 pinecone soldierfish (primary hap 2019 genbank)
GCA_902150065.1
n/a 15,738
(2.42 %)
53,616
(6.20 %)
n/a 41.83
(99.78 %)
253
(0.22 %)
87
(100.00 %)
1,063,888
(5.90 %)
646,820
(4.30 %)
4,938,772
(28.11 %)
41,636
(2.04 %)
381 pinecone soldierfish (alternate hap 2019)
GCA_902148815.1
n/a 15,563
(2.38 %)
54,264
(6.19 %)
n/a 41.81
(100.00 %)
6
(0.00 %)
2,193
(100.00 %)
1,040,418
(5.81 %)
623,499
(4.08 %)
4,888,400
(27.89 %)
40,331
(2.02 %)
382 pink cusk-eel (Tasmania CSIRO-AG114 2024)
GCF_046128005.1
40,370
(14.18 %)
14,305
(3.83 %)
42,250
(9.00 %)
n/a 44.35
(100.00 %)
n/a 598
(100.00 %)
544,423
(6.21 %)
349,202
(8.94 %)
2,573,015
(26.48 %)
39,781
(3.80 %)
383 pink salmon
GCF_021184085.1
91,140
(4.89 %)
27,187
(1.37 %)
124,120
(3.88 %)
n/a 44.28
(99.96 %)
5,213
(0.04 %)
22,556
(99.99 %)
1,343,135
(0.00 %)
2,906,520
(28.95 %)
10,882,087
(57.26 %)
97,805
(3.04 %)
384 ploughfish
GCF_902827175.1
50,551
(7.66 %)
14,699
(1.83 %)
66,348
(6.06 %)
62,492
(5.74 %)
41.52
(99.98 %)
1,569
(0.02 %)
2,618
(100.00 %)
467,937
(3.05 %)
412,361
(6.64 %)
3,498,382
(45.08 %)
73,879
(3.55 %)
385 pollack (alternate hap 2023)
GCA_949987605.1
n/a 14,050
(2.77 %)
63,249
(8.86 %)
n/a 45.41
(100.00 %)
n/a 4,970
(100.00 %)
708,455
(9.71 %)
797,241
(15.67 %)
2,785,159
(33.18 %)
78,151
(7.95 %)
386 pollack (primary hap 2023)
GCA_949987615.1
n/a 14,126
(2.81 %)
61,907
(8.75 %)
n/a 45.67
(99.94 %)
1,810
(0.06 %)
616
(100.00 %)
753,034
(10.17 %)
850,189
(15.72 %)
2,888,555
(33.70 %)
80,883
(8.43 %)
387 pond loach (2024)
GCF_030506205.2
63,171
(8.66 %)
17,091
(2.42 %)
45,877
(5.02 %)
n/a 38.27
(99.98 %)
1,120
(0.02 %)
220
(100.00 %)
409,390
(2.50 %)
390,110
(8.52 %)
5,401,936
(44.65 %)
52,115
(4.00 %)
388 predatory carp (Z2021 2022)
GCF_024489055.1
56,688
(7.63 %)
17,670
(2.67 %)
54,522
(5.25 %)
n/a 37.95
(100.00 %)
181
(0.00 %)
51
(100.00 %)
3,087,358
(61.37 %)
553,846
(7.14 %)
6,036,124
(43.52 %)
47,942
(3.56 %)
389 prehistoric monster fish (2019 refseq)
GCF_902500255.1
45,404
(2.55 %)
14,664
(0.76 %)
72,609
(2.41 %)
57,391
(2.04 %)
41.99
(99.49 %)
2,554
(0.51 %)
464
(100.00 %)
1,310,663
(2.79 %)
786,401
(3.65 %)
9,901,286
(59.90 %)
172,199
(5.45 %)
390 prehistoric monster fish (alternate hap 2019)
GCA_902500245.1
n/a 10,944
(0.64 %)
59,123
(2.21 %)
n/a 41.96
(100.00 %)
8
(0.00 %)
19,587
(100.00 %)
947,336
(2.69 %)
554,284
(3.27 %)
7,314,941
(58.56 %)
125,285
(5.42 %)
391 rainbow smelt (alternate hap 2024)
GCA_038355625.1
n/a 14,263
(3.89 %)
47,883
(9.83 %)
n/a 44.87
(100.00 %)
n/a 7,757
(100.00 %)
752,623
(32.18 %)
356,559
(11.00 %)
1,559,609
(33.41 %)
24,556
(3.64 %)
392 rainbow smelt (fOsmMor3 primary hap 2024)
GCA_038355195.1
n/a 15,639
(3.89 %)
49,368
(9.40 %)
n/a 45.55
(99.93 %)
1,907
(0.07 %)
365
(100.00 %)
1,655,350
(30.53 %)
511,512
(12.09 %)
2,015,264
(35.19 %)
32,410
(4.33 %)
393 rainbow smelt (fOsmMor3 primary hap 2024)
GCF_038355195.1
39,606
(12.43 %)
15,641
(3.89 %)
49,368
(9.40 %)
n/a 45.55
(99.93 %)
1,907
(0.07 %)
366
(100.00 %)
1,655,356
(30.53 %)
511,513
(12.09 %)
2,015,303
(35.19 %)
32,410
(4.33 %)
394 rainbow trout (Arlee)
GCF_013265735.2
119,271
(6.51 %)
27,513
(1.62 %)
109,524
(4.38 %)
138,073
(5.21 %)
43.45
(99.74 %)
486
(0.26 %)
939
(100.00 %)
1,537,455
(7.32 %)
2,083,211
(23.10 %)
10,092,840
(53.71 %)
73,586
(2.16 %)
395 rainbow trout (Swanson)
GCF_002163495.1
79,286
(6.41 %)
25,179
(1.70 %)
98,339
(4.18 %)
115,853
(5.33 %)
42.67
(88.52 %)
427,894
(11.54 %)
139,800
(99.96 %)
1,332,141
(5.52 %)
1,604,760
(8.18 %)
9,451,984
(44.00 %)
56,604
(1.05 %)
396 Rankin cod (hap1 2025)
GCA_048129235.1
n/a 15,661
(1.94 %)
54,906
(5.30 %)
n/a 41.36
(100.00 %)
21
(0.00 %)
386
(100.00 %)
591,994
(2.64 %)
396,424
(6.16 %)
6,144,028
(31.24 %)
24,792
(1.05 %)
397 Rankin cod (hap2 2025)
GCA_048129065.1
n/a 15,830
(2.03 %)
54,183
(5.34 %)
n/a 41.30
(100.00 %)
33
(0.00 %)
199
(100.00 %)
2,922,062
(42.12 %)
374,226
(5.08 %)
6,124,255
(30.17 %)
24,493
(0.98 %)
398 razorback sucker (HMW12.3.18 2022)
GCF_025860055.1
72,004
(5.94 %)
27,195
(1.88 %)
81,269
(3.63 %)
n/a 39.59
(99.96 %)
1,873
(0.04 %)
1,746
(100.00 %)
7,035,382
(51.89 %)
1,021,269
(5.98 %)
12,768,853
(46.85 %)
109,185
(4.70 %)
399 red drum (XU1910 2020)
GCA_014183145.1
n/a 15,655
(3.01 %)
47,717
(6.87 %)
n/a 40.98
(95.57 %)
11,577
(4.42 %)
34,462
(100.00 %)
470,579
(3.16 %)
231,051
(1.91 %)
4,345,700
(23.24 %)
20,149
(1.25 %)
400 red seabream (2024)
GCA_040436345.1
n/a 15,424
(2.55 %)
50,764
(6.70 %)
n/a 41.21
(100.00 %)
278
(0.00 %)
302
(100.00 %)
1,851,763
(34.79 %)
322,891
(6.05 %)
4,847,079
(26.99 %)
23,370
(1.27 %)
401 red seabream (2024)
GCF_040436345.1
36,326
(8.73 %)
15,416
(2.51 %)
50,764
(6.70 %)
n/a 41.21
(100.00 %)
278
(0.00 %)
25
(100.00 %)
474,006
(3.07 %)
322,892
(6.05 %)
4,847,143
(26.99 %)
23,370
(1.27 %)
402 red-bellied piranha (fPygNat1 alternate hap 2020)
GCA_015220065.1
n/a 4,539
(2.01 %)
14,061
(4.35 %)
n/a 40.48
(100.00 %)
n/a 1,751
(100.00 %)
759,605
(49.59 %)
161,693
(7.99 %)
1,684,737
(29.93 %)
7,525
(1.31 %)
403 red-bellied piranha (Pna-1 2016)
GCF_001682695.1
47,129
(6.06 %)
17,089
(1.80 %)
33,378
(4.02 %)
n/a 40.45
(97.38 %)
62,964
(2.59 %)
325,620
(97.41 %)
898,445
(4.81 %)
863,000
(6.48 %)
7,757,382
(34.74 %)
34,329
(1.24 %)
404 red-bellied piranha (primary hap 2020)
GCA_015220715.1
n/a 16,837
(1.87 %)
52,672
(4.24 %)
n/a 40.58
(99.17 %)
303
(0.83 %)
56
(100.00 %)
817,566
(5.40 %)
689,236
(8.30 %)
7,296,379
(35.73 %)
33,087
(1.38 %)
405 red-bellied piranha (primary hap 2020)
GCF_015220715.1
54,818
(7.05 %)
16,817
(1.87 %)
52,672
(4.24 %)
76,011
(5.65 %)
40.58
(99.17 %)
303
(0.83 %)
55
(100.00 %)
817,566
(5.40 %)
689,236
(8.30 %)
7,296,459
(35.73 %)
33,087
(1.38 %)
406 redfish (Tasmania AG114_WGS23_722 - 3 2025)
GCF_046629955.1
37,802
(8.56 %)
16,430
(2.60 %)
56,127
(6.62 %)
n/a 42.14
(100.00 %)
n/a 6,232
(100.00 %)
1,061,195
(9.52 %)
653,833
(5.90 %)
4,595,588
(30.15 %)
38,922
(2.20 %)
407 reedfish (2021)
GCF_900747795.2
44,478
(2.01 %)
13,108
(0.46 %)
23,157
(1.29 %)
n/a 39.37
(99.18 %)
1,431
(0.82 %)
169
(100.00 %)
8,636,520
(39.34 %)
1,069,643
(2.91 %)
19,980,572
(47.52 %)
89,023
(1.13 %)
408 reedfish (v1 alternate hap 2019)
GCA_900700845.2
n/a 9,950
(0.37 %)
31,611
(1.22 %)
n/a 39.44
(100.00 %)
5
(0.00 %)
38,598
(100.00 %)
1,300,565
(2.57 %)
685,834
(2.21 %)
14,691,576
(45.66 %)
63,365
(1.11 %)
409 ringed pipefish (RoL2022-P2 2023)
GCF_027744805.1
56,261
(13.18 %)
14,197
(2.71 %)
45,193
(6.30 %)
n/a 41.67
(100.00 %)
14
(0.00 %)
157
(100.00 %)
941,095
(17.66 %)
238,999
(5.27 %)
4,283,692
(41.06 %)
43,014
(4.07 %)
410 Rio pearlfish (Nwh7 v2 2021)
GCF_014905685.2
25,353
(3.88 %)
14,334
(1.56 %)
137,348
(9.74 %)
n/a 41.06
(92.01 %)
100,521
(8.02 %)
18,998
(100.00 %)
635,526
(3.14 %)
444,158
(3.06 %)
6,203,124
(42.81 %)
52,308
(2.11 %)
411 river trout (v2 2021)
GCA_901001165.2
n/a 27,928
(1.66 %)
110,791
(4.44 %)
n/a 43.36
(96.90 %)
3,941
(3.10 %)
1,441
(100.00 %)
4,690,842
(57.30 %)
1,789,507
(15.87 %)
9,819,763
(52.37 %)
70,821
(1.77 %)
412 roach minnow (alternate hap 2023)
GCA_951802655.1
n/a 18,165
(2.73 %)
62,580
(6.00 %)
n/a 38.74
(100.00 %)
6
(0.00 %)
4,612
(100.00 %)
2,483,904
(48.29 %)
584,363
(7.55 %)
5,582,076
(40.38 %)
60,229
(3.53 %)
413 roach minnow (primary hap 2023)
GCA_951802725.1
n/a 18,132
(2.65 %)
63,523
(6.01 %)
n/a 38.80
(99.99 %)
471
(0.01 %)
86
(100.00 %)
2,613,900
(48.90 %)
625,102
(8.21 %)
5,738,444
(41.24 %)
65,328
(3.68 %)
414 rock gunnel (alternate hap 2021)
GCA_910591705.2
n/a 15,291
(3.29 %)
45,865
(7.56 %)
n/a 42.26
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,165
(100.00 %)
1,131,154
(25.69 %)
269,583
(5.08 %)
3,371,712
(24.64 %)
36,810
(2.68 %)
415 rock gunnel (primary hap 2021)
GCA_910591455.2
n/a 15,181
(3.34 %)
44,153
(7.53 %)
51,135
(7.40 %)
42.31
(99.98 %)
418
(0.02 %)
101
(100.00 %)
1,121,704
(25.48 %)
269,467
(4.88 %)
3,358,709
(24.69 %)
36,987
(3.02 %)
416 rohu (BAU-BD-2019 2022)
GCF_022985175.1
52,514
(8.81 %)
17,664
(3.05 %)
48,403
(5.24 %)
n/a 36.06
(83.93 %)
5,144
(16.07 %)
2,870
(100.00 %)
2,600,095
(49.94 %)
683,499
(4.34 %)
6,000,462
(35.96 %)
33,741
(1.62 %)
417 Rosablanca catfish (hap2 2023)
GCA_030015355.1
n/a 15,434
(2.01 %)
44,991
(4.63 %)
n/a 40.24
(100.00 %)
192
(0.00 %)
302
(100.00 %)
2,506,810
(40.54 %)
613,867
(8.67 %)
5,070,851
(48.32 %)
46,071
(2.57 %)
418 rouch bullseye (RE-2024b hap1 2024 refseq)
GCF_042242105.1
32,256
(9.05 %)
15,283
(3.03 %)
44,299
(6.93 %)
n/a 41.85
(100.00 %)
87
(0.00 %)
441
(100.00 %)
1,115,191
(21.73 %)
271,391
(5.93 %)
3,651,073
(24.53 %)
19,771
(1.39 %)
419 rough bullseye (RE-2024b hap2 2024)
GCA_042242125.1
n/a 14,475
(2.89 %)
44,413
(7.11 %)
n/a 42.15
(100.00 %)
93
(0.00 %)
84
(100.00 %)
1,762,151
(30.90 %)
262,291
(5.80 %)
3,580,461
(24.37 %)
19,851
(1.40 %)
420 rudd (Europe DD20220513a primary hap 2022)
GCA_024453875.1
n/a 17,895
(2.55 %)
64,448
(5.84 %)
n/a 38.93
(99.99 %)
418
(0.01 %)
110
(100.00 %)
2,661,155
(49.83 %)
673,071
(10.59 %)
5,755,954
(42.48 %)
66,952
(4.46 %)
421 rudd (fScaEry2.hap1.1 2024)
GCA_964197995.1
n/a 18,254
(2.38 %)
68,852
(5.71 %)
n/a 39.02
(99.99 %)
836
(0.01 %)
759
(100.00 %)
2,854,977
(51.13 %)
754,287
(11.81 %)
5,942,764
(44.17 %)
72,686
(4.52 %)
422 sablefish (Golden Eagle Sablefish UVic2021 2023)
GCF_027596085.1
34,548
(9.49 %)
15,280
(3.00 %)
46,259
(6.95 %)
n/a 40.45
(99.99 %)
723
(0.01 %)
8,212
(99.99 %)
1,335,152
(28.19 %)
415,384
(6.53 %)
3,948,379
(27.81 %)
22,854
(1.61 %)
423 sailfin molly
GCF_001443285.1
53,986
(11.41 %)
15,048
(2.71 %)
33,482
(6.71 %)
n/a 39.18
(83.41 %)
41,735
(16.61 %)
54,623
(83.39 %)
357,919
(2.18 %)
189,502
(1.23 %)
4,873,063
(22.51 %)
34,138
(1.62 %)
424 salamanderfish (hap1 2025)
GCA_049190665.1
n/a 15,661
(2.59 %)
68,929
(8.14 %)
n/a 45.02
(99.96 %)
1,365
(0.04 %)
2,987
(100.00 %)
2,234,544
(43.47 %)
1,192,255
(16.84 %)
3,383,827
(41.37 %)
108,808
(9.86 %)
425 salamanderfish (hap2 2025)
GCA_049190655.1
n/a 15,427
(2.54 %)
67,522
(7.97 %)
n/a 44.96
(99.96 %)
1,366
(0.04 %)
1,559
(100.00 %)
2,195,227
(44.71 %)
1,219,658
(17.45 %)
3,319,218
(42.93 %)
108,314
(9.71 %)
426 sansaifugu (HTHZ2018 2019)
GCF_003711565.1
56,023
(20.10 %)
13,998
(4.84 %)
48,737
(11.56 %)
n/a 45.63
(99.99 %)
250
(0.01 %)
868
(100.00 %)
304,980
(15.98 %)
171,631
(4.98 %)
1,616,965
(21.60 %)
48,338
(9.79 %)
427 sardine (primary hap 2023 genbank)
GCA_963854185.1
n/a 16,071
(2.33 %)
64,180
(7.08 %)
n/a 44.44
(99.96 %)
1,654
(0.04 %)
241
(100.00 %)
1,503,111
(11.74 %)
1,507,024
(15.48 %)
4,027,638
(37.52 %)
68,874
(3.56 %)
428 sardine (primary hap 2023 refseq)
GCF_963854185.1
48,146
(9.15 %)
16,069
(2.33 %)
64,178
(7.08 %)
n/a 44.44
(99.96 %)
1,654
(0.04 %)
240
(100.00 %)
1,503,108
(11.74 %)
1,507,022
(15.48 %)
4,027,614
(37.52 %)
68,873
(3.56 %)
429 scribbled pipefish (RoL2023-P3 2023)
GCF_030265065.1
51,267
(7.00 %)
13,854
(1.32 %)
48,980
(3.46 %)
n/a 39.44
(100.00 %)
9
(0.00 %)
109
(100.00 %)
1,805,346
(21.21 %)
512,153
(12.76 %)
6,260,589
(63.96 %)
96,908
(3.65 %)
430 sea stickleback (SK-2024b hap1 2025)
GCA_048126635.1
n/a 14,310
(4.44 %)
47,336
(10.19 %)
n/a 44.83
(99.99 %)
241
(0.01 %)
38
(100.00 %)
446,827
(13.86 %)
192,599
(8.52 %)
2,033,160
(22.85 %)
61,012
(13.03 %)
431 sea stickleback (SK-2024b hap2 2025)
GCA_048127205.1
n/a 14,237
(4.44 %)
46,701
(10.13 %)
n/a 44.75
(99.99 %)
276
(0.01 %)
52
(100.00 %)
413,494
(14.42 %)
189,429
(8.99 %)
1,996,715
(23.13 %)
60,252
(12.60 %)
432 Senegalese sole
GCF_019176455.1
46,446
(12.02 %)
15,155
(3.15 %)
43,828
(7.31 %)
n/a 40.92
(99.99 %)
662
(0.01 %)
1,937
(100.00 %)
522,618
(4.22 %)
317,280
(4.23 %)
4,040,245
(28.25 %)
26,946
(1.79 %)
433 shanny (alternate hap 2023)
GCA_963383635.1
n/a 14,728
(2.46 %)
62,094
(7.09 %)
n/a 42.32
(100.00 %)
1
(0.00 %)
3,847
(100.00 %)
939,151
(11.90 %)
472,983
(7.68 %)
4,326,183
(28.40 %)
64,290
(4.16 %)
434 shanny (primary hap 2023)
GCA_963383615.1
n/a 15,032
(2.44 %)
62,625
(6.97 %)
n/a 42.07
(99.98 %)
598
(0.02 %)
847
(100.00 %)
967,197
(11.85 %)
498,286
(8.15 %)
4,397,828
(28.96 %)
65,744
(4.06 %)
435 sharptooth jobfish (hap1 2024)
GCA_045363895.1
n/a 15,800
(1.77 %)
51,791
(4.52 %)
n/a 39.82
(100.00 %)
84
(0.00 %)
283
(100.00 %)
777,839
(3.19 %)
459,791
(3.90 %)
7,958,604
(35.17 %)
21,711
(0.94 %)
436 sharptooth jobfish (hap2 2024)
GCA_045363885.1
n/a 15,879
(1.78 %)
51,774
(4.52 %)
n/a 39.81
(100.00 %)
76
(0.00 %)
172
(100.00 %)
778,842
(3.19 %)
462,247
(3.82 %)
7,956,116
(35.13 %)
21,587
(0.91 %)
437 sheepshead minnow
GCF_000732505.1
37,892
(7.02 %)
14,749
(2.02 %)
25,480
(4.66 %)
n/a 38.19
(86.93 %)
113,210
(13.10 %)
110,959
(86.90 %)
363,397
(1.88 %)
195,191
(1.43 %)
6,444,762
(27.47 %)
18,269
(0.66 %)
438 shortfin molly
GCF_001443325.1
54,473
(11.42 %)
15,104
(2.72 %)
33,717
(6.74 %)
n/a 39.23
(84.81 %)
37,507
(15.20 %)
50,598
(84.80 %)
328,347
(2.03 %)
172,112
(1.18 %)
4,876,942
(22.80 %)
34,271
(1.66 %)
439 Siamese fighting fish (primary hap 2023)
GCA_900634795.4
n/a 14,592
(4.32 %)
55,265
(10.96 %)
n/a 45.31
(99.99 %)
321
(0.01 %)
35
(100.00 %)
391,485
(19.39 %)
175,896
(4.39 %)
1,946,407
(23.16 %)
70,331
(13.13 %)
440 Siamese fighting fish (v1 alternate hap 2019)
GCA_900651605.1
n/a 14,510
(4.12 %)
60,058
(10.77 %)
n/a 45.51
(100.00 %)
2
(0.00 %)
3,705
(100.00 %)
249,671
(3.68 %)
182,366
(4.87 %)
1,939,533
(22.55 %)
72,474
(13.55 %)
441 Siamese fighting fish (v4 primary hap 2023)
GCF_900634795.4
59,291
(19.85 %)
14,594
(4.32 %)
55,265
(10.96 %)
n/a 45.31
(99.99 %)
321
(0.01 %)
36
(100.00 %)
384,203
(19.38 %)
175,898
(4.39 %)
1,946,630
(23.16 %)
70,331
(13.13 %)
442 Siamese fighting fish (v5.4 alternate hap 2023)
GCA_900651605.2
n/a 14,737
(4.05 %)
61,568
(10.70 %)
n/a 45.50
(100.00 %)
108
(0.00 %)
3,872
(100.00 %)
392,585
(19.23 %)
190,741
(5.09 %)
1,994,824
(23.20 %)
74,259
(13.49 %)
443 silver carp (IHB0807247 2022)
GCA_022817975.1
n/a 17,684
(3.64 %)
46,034
(5.41 %)
n/a 37.14
(95.48 %)
65,388
(4.54 %)
47,685
(100.00 %)
2,382,486
(47.36 %)
302,138
(3.05 %)
5,269,318
(35.19 %)
18,811
(0.87 %)
444 silver crucian carp (wild population from Czech Republic Cgi1373 2022)
GCF_023724105.1
131,179
(9.80 %)
29,612
(2.99 %)
81,338
(5.43 %)
n/a 37.63
(99.92 %)
2,597
(0.08 %)
51
(100.00 %)
3,277,259
(45.05 %)
801,192
(7.96 %)
7,910,205
(42.51 %)
60,236
(2.18 %)
445 silver spinyfin (hap1 2025)
GCA_048569125.1
n/a 16,906
(1.39 %)
115,931
(7.77 %)
n/a 44.10
(99.96 %)
3,365
(0.04 %)
5,504
(100.00 %)
4,606,608
(53.63 %)
1,428,326
(25.54 %)
4,395,832
(51.22 %)
166,807
(7.52 %)
446 silver spinyfin (hap2 2025)
GCA_048569135.1
n/a 17,409
(1.14 %)
146,413
(8.24 %)
n/a 44.20
(99.96 %)
3,473
(0.04 %)
8,068
(99.96 %)
2,051,529
(14.72 %)
1,808,246
(28.36 %)
4,967,915
(54.93 %)
208,486
(7.83 %)
447 smalleye Pacific opah (hap1 2023)
GCA_029633845.1
n/a 13,661
(1.11 %)
75,418
(4.21 %)
n/a 45.01
(99.96 %)
3,120
(0.04 %)
1,059
(100.00 %)
4,634,757
(53.53 %)
1,006,319
(17.13 %)
5,273,732
(51.16 %)
145,115
(7.59 %)
448 smalleye Pacific opah (hap2 2023 refseq)
GCF_029633865.1
34,018
(4.17 %)
13,617
(1.10 %)
74,639
(4.12 %)
n/a 44.94
(99.96 %)
3,115
(0.04 %)
544
(100.00 %)
4,603,649
(53.23 %)
1,009,241
(18.00 %)
5,236,063
(51.65 %)
143,632
(7.43 %)
449 smallmouth bass
GCF_021292245.1
55,932
(9.40 %)
15,509
(2.37 %)
49,387
(5.61 %)
n/a 40.72
(99.65 %)
34,581
(0.36 %)
15,020
(100.00 %)
445,979
(2.50 %)
249,630
(2.49 %)
5,071,015
(28.28 %)
23,875
(1.36 %)
450 snake pipefish (RoL-2023_Sb 2023)
GCF_033978785.1
57,883
(4.39 %)
15,654
(1.03 %)
72,123
(3.58 %)
n/a 38.64
(100.00 %)
2,564
(0.00 %)
424
(100.00 %)
3,149,025
(23.73 %)
1,621,410
(19.58 %)
7,534,195
(67.22 %)
122,765
(3.07 %)
451 snook (hap1 2025)
GCA_050436885.1
n/a 15,215
(3.21 %)
45,947
(7.33 %)
n/a 42.77
(100.00 %)
132
(0.00 %)
128
(100.00 %)
1,347,990
(22.56 %)
273,258
(3.73 %)
3,827,912
(24.01 %)
41,023
(3.89 %)
452 snook (hap2 2025)
GCA_050436865.1
n/a 15,253
(3.20 %)
45,461
(7.26 %)
n/a 42.75
(100.00 %)
147
(0.00 %)
76
(100.00 %)
1,355,297
(22.50 %)
273,269
(4.03 %)
3,827,438
(24.25 %)
41,203
(3.77 %)
453 sockeye salmon (On170113-E2 v2 2019)
GCF_006149115.2
75,641
(6.10 %)
24,075
(1.71 %)
98,364
(4.30 %)
n/a 43.37
(96.15 %)
25,658
(3.85 %)
36,660
(99.99 %)
949,725
(3.53 %)
1,465,583
(10.82 %)
8,853,884
(48.52 %)
62,850
(1.45 %)
454 sockeye salmon (Pitt River 2024)
GCF_034236695.1
80,798
(5.59 %)
26,218
(1.35 %)
116,746
(3.87 %)
n/a 44.03
(99.93 %)
4,351
(0.07 %)
12,436
(100.00 %)
6,356,046
(54.95 %)
2,840,516
(31.41 %)
10,575,179
(57.52 %)
77,648
(1.61 %)
455 South Georgia icefish (v2 primary hap 2022)
GCF_902827115.2
42,862
(7.09 %)
14,776
(1.80 %)
68,955
(6.18 %)
n/a 42.07
(99.90 %)
2,603
(0.11 %)
1,563
(100.00 %)
512,600
(3.45 %)
473,958
(7.19 %)
3,590,436
(45.74 %)
88,970
(4.31 %)
456 southern bluefin tuna (alternate hap 2021)
GCA_910596085.1
n/a 15,727
(2.61 %)
43,177
(5.74 %)
n/a 39.72
(100.00 %)
n/a 895
(100.00 %)
1,590,386
(33.53 %)
246,800
(2.86 %)
5,173,834
(26.85 %)
14,473
(0.87 %)
457 southern bluefin tuna (primary hap 2021 refseq)
GCF_910596095.1
58,429
(11.06 %)
15,626
(2.56 %)
42,730
(5.74 %)
n/a 39.73
(100.00 %)
184
(0.00 %)
58
(100.00 %)
554,276
(3.42 %)
247,764
(2.94 %)
5,176,851
(26.85 %)
14,097
(0.88 %)
458 southern platyfish
GCF_002775205.1
46,380
(11.15 %)
14,674
(2.66 %)
28,368
(6.82 %)
n/a 38.97
(99.53 %)
156
(0.47 %)
102
(100.00 %)
323,402
(2.76 %)
146,477
(2.33 %)
4,741,552
(28.27 %)
34,667
(2.13 %)
459 Southwestern China cavefish
GCF_001515605.1
74,330
(6.97 %)
30,906
(3.19 %)
55,474
(5.66 %)
n/a 37.28
(92.69 %)
168,741
(7.34 %)
254,423
(92.66 %)
1,129,104
(5.02 %)
730,197
(4.59 %)
8,910,005
(36.97 %)
64,238
(1.79 %)
460 spangled emperor (hap1 2024)
GCA_045362495.1
n/a 15,554
(1.75 %)
58,641
(5.19 %)
n/a 40.59
(100.00 %)
196
(0.00 %)
226
(100.00 %)
682,449
(3.01 %)
409,809
(4.43 %)
7,114,584
(28.98 %)
37,214
(1.53 %)
461 spangled emperor (hap2 2024)
GCA_045362485.1
n/a 15,490
(1.77 %)
57,993
(5.20 %)
n/a 40.57
(100.00 %)
244
(0.00 %)
151
(100.00 %)
677,985
(3.03 %)
408,391
(4.33 %)
7,184,861
(29.15 %)
36,602
(1.46 %)
462 spiny chromis (Palm Island Apoly-LR-REF 2022)
GCF_021347895.1
57,656
(10.03 %)
15,810
(2.14 %)
58,218
(5.77 %)
n/a 40.33
(99.99 %)
871
(0.01 %)
81
(100.00 %)
1,505,948
(35.31 %)
346,542
(4.71 %)
5,210,329
(31.65 %)
36,529
(1.65 %)
463 spiny chromis (Palm Islands 2017)
GCF_002109545.1
38,931
(8.84 %)
15,624
(2.29 %)
35,942
(5.59 %)
n/a 40.01
(85.05 %)
209,115
(15.01 %)
30,414
(100.00 %)
372,901
(2.33 %)
278,854
(1.99 %)
5,622,334
(22.61 %)
25,079
(0.95 %)
464 spotted green pufferfish (2004)
GCA_000180735.1
n/a 13,641
(5.13 %)
57,982
(13.46 %)
n/a 46.43
(91.24 %)
18,974
(8.76 %)
44,686
(91.24 %)
252,877
(4.38 %)
159,939
(3.51 %)
1,689,462
(18.66 %)
51,580
(13.42 %)
465 spotted pipefish (UIUO_Sarg 2025)
GCF_051989625.1
49,965
(14.01 %)
13,213
(3.59 %)
38,524
(7.41 %)
n/a 40.60
(100.00 %)
57
(0.00 %)
233
(100.00 %)
635,384
(17.18 %)
202,319
(16.03 %)
2,105,734
(43.72 %)
46,516
(8.10 %)
466 spotted scat (primary hap 2021)
GCA_020382885.1
n/a 15,262
(3.44 %)
40,580
(7.38 %)
n/a 41.49
(99.70 %)
77
(0.30 %)
48
(100.00 %)
847,675
(17.29 %)
160,299
(1.55 %)
3,420,966
(21.24 %)
15,574
(1.13 %)
467 spotted sea bass (ZS-2023 2023)
GCA_031216445.1
n/a 15,425
(3.14 %)
43,414
(6.98 %)
n/a 41.07
(100.00 %)
n/a 109
(100.00 %)
447,804
(3.49 %)
241,876
(3.25 %)
3,757,088
(26.25 %)
23,346
(2.49 %)
468 spotted tilapia (v1 MD_Pm_ZW 2024)
GCF_036321145.1
46,818
(8.35 %)
14,938
(2.04 %)
55,475
(6.12 %)
n/a 40.81
(100.00 %)
23
(0.00 %)
792
(100.00 %)
505,488
(2.57 %)
269,742
(4.14 %)
4,697,020
(30.74 %)
30,399
(1.90 %)
469 spotted tilapia (v2 MD_Pm_ZW 2024)
GCF_036321145.2
48,380
(8.37 %)
15,470
(2.04 %)
57,237
(6.11 %)
n/a 40.81
(100.00 %)
24
(0.00 %)
791
(100.00 %)
523,070
(2.57 %)
277,554
(4.08 %)
4,872,723
(30.67 %)
31,383
(1.89 %)
470 spotted wolffish (MPS153535 2025)
GCF_050575085.1
49,857
(11.48 %)
15,196
(3.01 %)
47,823
(7.37 %)
n/a 41.99
(100.00 %)
5
(0.00 %)
328
(100.00 %)
430,253
(4.48 %)
288,471
(10.10 %)
3,247,212
(28.89 %)
36,945
(3.24 %)
471 sterlet (maternal hap 2022 refseq)
GCF_902713425.1
110,167
(7.62 %)
25,364
(1.76 %)
40,715
(4.06 %)
n/a 40.11
(100.00 %)
433
(0.00 %)
1,731
(100.00 %)
4,055,215
(43.14 %)
1,124,096
(10.13 %)
9,426,172
(41.81 %)
64,522
(2.85 %)
472 sterlet (v2 paternal hap 2022)
GCA_902713435.2
n/a 24,717
(1.73 %)
40,151
(4.13 %)
74,807
(5.54 %)
40.09
(99.99 %)
475
(0.01 %)
1,517
(100.00 %)
1,844,596
(9.77 %)
1,119,340
(9.88 %)
9,372,934
(41.58 %)
65,007
(2.74 %)
473 stone loach (alternate hap 2022)
GCA_947034905.1
n/a 16,177
(4.18 %)
40,160
(7.35 %)
n/a 39.58
(100.00 %)
n/a 2,237
(100.00 %)
1,208,781
(38.02 %)
121,854
(7.96 %)
2,956,942
(32.61 %)
27,787
(3.58 %)
474 stone loach (primary hap 2022)
GCA_947034865.1
n/a 16,419
(3.98 %)
40,677
(7.21 %)
n/a 39.69
(99.97 %)
825
(0.03 %)
100
(100.00 %)
1,324,513
(39.84 %)
143,170
(9.30 %)
3,000,881
(34.30 %)
30,130
(3.71 %)
475 stone moroko (DD20220531a primary hap 2022)
GCF_024679245.1
59,497
(6.82 %)
17,172
(2.25 %)
57,383
(4.85 %)
n/a 39.18
(99.99 %)
497
(0.01 %)
81
(100.00 %)
4,750,810
(63.58 %)
649,426
(10.14 %)
6,511,384
(46.74 %)
74,723
(4.45 %)
476 straightnose pipefish (RoL-2023_Sa 2023)
GCF_033978795.1
56,498
(4.86 %)
14,602
(1.00 %)
64,279
(2.96 %)
n/a 39.74
(100.00 %)
1,172
(0.00 %)
473
(100.00 %)
2,984,285
(27.54 %)
1,402,691
(20.35 %)
7,915,062
(67.02 %)
140,374
(3.90 %)
477 striated frogfish (MH-2024 2024)
GCF_040054535.1
45,220
(12.66 %)
14,509
(3.35 %)
46,221
(7.95 %)
n/a 42.02
(100.00 %)
18
(0.00 %)
42
(100.00 %)
791,570
(25.79 %)
305,491
(6.68 %)
3,000,938
(29.61 %)
36,818
(4.17 %)
478 striped catfish (fPanHyp1 alternate hap 2022)
GCA_027382375.1
n/a 15,871
(2.85 %)
42,287
(5.51 %)
n/a 38.96
(100.00 %)
1
(0.00 %)
3,274
(100.00 %)
1,826,752
(37.53 %)
592,022
(6.69 %)
4,899,884
(32.33 %)
17,357
(1.25 %)
479 striped catfish (primary hap 2022 refseq)
GCF_027358585.1
53,859
(11.99 %)
16,033
(2.86 %)
41,619
(5.48 %)
n/a 38.99
(99.49 %)
236
(0.51 %)
58
(100.00 %)
1,870,234
(37.80 %)
605,570
(6.82 %)
5,059,429
(32.43 %)
17,919
(1.29 %)
480 striped catfish Indonesia
GCF_009078355.1
50,044
(9.61 %)
15,665
(2.76 %)
41,398
(5.35 %)
n/a 38.86
(99.98 %)
463
(0.02 %)
150
(100.00 %)
777,186
(5.69 %)
603,962
(6.24 %)
5,141,987
(32.41 %)
17,264
(1.20 %)
481 striped catfish Vietnam
GCF_003671635.1
40,992
(9.44 %)
15,295
(2.91 %)
20,865
(5.31 %)
n/a 38.71
(97.32 %)
23,755
(2.69 %)
567
(100.00 %)
693,498
(4.75 %)
489,286
(3.69 %)
4,849,313
(30.04 %)
15,076
(0.95 %)
482 striped sea-bass
GCF_004916995.1
32,103
(10.78 %)
14,422
(3.07 %)
38,188
(6.41 %)
n/a 40.19
(99.19 %)
73,335
(0.86 %)
630
(100.00 %)
365,581
(2.59 %)
142,967
(0.99 %)
4,151,813
(22.73 %)
13,730
(0.95 %)
483 Sumatra barb
GCF_018831695.1
54,947
(11.16 %)
18,745
(3.98 %)
49,520
(6.36 %)
n/a 38.24
(99.95 %)
5,075
(0.05 %)
1,122
(100.00 %)
638,783
(6.33 %)
357,159
(7.71 %)
4,520,846
(32.46 %)
46,339
(3.96 %)
484 swamp eel
GCF_001952655.1
43,831
(10.64 %)
14,741
(2.98 %)
20,099
(5.80 %)
n/a 40.90
(92.01 %)
51,257
(8.01 %)
71,879
(91.99 %)
266,195
(1.84 %)
95,726
(1.16 %)
3,596,747
(21.95 %)
7,065
(0.42 %)
485 swordfish
GCF_016859285.1
47,986
(9.92 %)
15,208
(2.84 %)
42,556
(5.91 %)
n/a 40.69
(99.97 %)
449
(0.03 %)
1,482
(100.00 %)
484,543
(3.59 %)
230,762
(3.41 %)
4,496,150
(23.94 %)
27,129
(2.10 %)
486 tambaqui
GCF_904425465.1
46,601
(6.55 %)
17,150
(1.88 %)
50,327
(4.03 %)
n/a 39.33
(100.00 %)
420
(0.00 %)
1,269
(100.00 %)
753,112
(4.00 %)
676,948
(5.71 %)
8,317,676
(35.32 %)
25,784
(0.92 %)
487 thickback sole (primary hap 2023)
GCA_963457635.1
n/a 14,720
(2.58 %)
45,918
(6.44 %)
n/a 40.37
(99.99 %)
454
(0.01 %)
188
(100.00 %)
1,242,704
(17.37 %)
518,293
(15.23 %)
3,986,694
(40.18 %)
51,441
(3.53 %)
488 thicklip grey mullet (primary hap 2023)
GCA_963514085.1
n/a 15,347
(2.73 %)
50,294
(7.25 %)
n/a 42.30
(99.98 %)
610
(0.02 %)
393
(100.00 %)
1,157,324
(26.70 %)
229,196
(4.33 %)
3,694,790
(27.54 %)
38,929
(2.20 %)
489 threadfin butterflyfish (fChaAug3hap1 2025)
GCF_051107435.1
44,089
(11.63 %)
15,141
(2.93 %)
45,805
(6.86 %)
n/a 42.61
(100.00 %)
19
(0.00 %)
187
(100.00 %)
1,201,894
(23.61 %)
240,001
(6.49 %)
3,662,205
(24.22 %)
26,438
(2.03 %)
490 threadfin butterflyfish (hap1 2025)
GCA_051107435.1
n/a 15,144
(2.93 %)
45,932
(6.87 %)
n/a 42.61
(100.00 %)
19
(0.00 %)
188
(100.00 %)
1,201,899
(23.61 %)
240,002
(6.49 %)
3,662,246
(24.22 %)
26,438
(2.03 %)
491 threadfin butterflyfish (hap2 2025)
GCA_051107495.1
n/a 15,399
(3.12 %)
45,594
(7.06 %)
n/a 42.67
(100.00 %)
23
(0.00 %)
81
(100.00 %)
1,189,225
(23.13 %)
232,268
(4.38 %)
3,702,255
(22.38 %)
26,358
(1.90 %)
492 three-spined stickleback
GCF_016920845.1
50,181
(16.09 %)
14,935
(3.99 %)
53,773
(9.96 %)
n/a 44.66
(99.24 %)
3,125
(0.76 %)
2,937
(100.00 %)
368,987
(9.09 %)
160,564
(2.89 %)
2,308,841
(21.91 %)
80,336
(11.49 %)
493 three-spined stickleback (fGasAcu3.hap1.1 2024)
GCF_964276395.1
78,725
(16.72 %)
14,937
(3.72 %)
54,336
(9.75 %)
n/a 44.71
(99.99 %)
331
(0.01 %)
460
(99.99 %)
580,327
(20.54 %)
206,696
(9.01 %)
2,334,830
(27.29 %)
84,009
(12.41 %)
494 three-spined stickleback (hap1 2024)
GCA_964276395.1
n/a 14,939
(3.72 %)
56,284
(10.07 %)
n/a 44.71
(99.99 %)
331
(0.01 %)
133
(100.00 %)
573,569
(20.53 %)
206,699
(9.01 %)
2,335,009
(27.29 %)
84,009
(12.41 %)
495 three-spined stickleback (hap2 2024)
GCA_964276385.1
n/a 13,591
(3.79 %)
50,693
(10.19 %)
n/a 44.72
(99.99 %)
309
(0.01 %)
479
(99.99 %)
505,547
(19.86 %)
181,092
(8.75 %)
2,117,454
(27.02 %)
75,434
(12.33 %)
496 threespot wrasse (MK-OKI-2021-1 2023)
GCF_033239565.1
40,418
(8.77 %)
15,124
(2.26 %)
46,507
(5.67 %)
n/a 40.89
(99.99 %)
117
(0.01 %)
228
(100.00 %)
539,144
(3.57 %)
361,249
(6.62 %)
5,059,734
(33.65 %)
22,689
(1.57 %)
497 tidewater goby (DKJ021-1_F 2022)
GCA_026437355.1
n/a 13,912
(1.87 %)
62,727
(6.28 %)
n/a 42.90
(99.99 %)
894
(0.01 %)
755
(100.00 %)
1,981,480
(37.86 %)
652,950
(27.50 %)
3,680,829
(47.75 %)
96,414
(8.01 %)
498 tidewater goby (DKJ021-1_Fhap1 2022 refseq)
GCF_026437365.1
43,108
(6.07 %)
14,279
(1.78 %)
65,726
(6.14 %)
n/a 42.96
(99.99 %)
794
(0.01 %)
821
(100.00 %)
411,442
(6.11 %)
708,255
(30.28 %)
3,809,301
(49.66 %)
101,682
(8.04 %)
499 tiger tail seahorse (QL1 v2 2016)
GCF_001891065.2
47,037
(13.33 %)
13,806
(3.76 %)
52,367
(8.81 %)
n/a 43.30
(93.08 %)
22,977
(6.92 %)
55,891
(93.08 %)
356,857
(3.66 %)
155,338
(3.36 %)
2,806,278
(24.56 %)
61,010
(7.71 %)
500 tongue sole
GCF_000523025.1
45,186
(16.40 %)
14,186
(3.98 %)
20,816
(8.22 %)
n/a 40.82
(94.88 %)
33,269
(5.14 %)
62,912
(94.86 %)
423,833
(4.34 %)
235,739
(3.33 %)
3,085,031
(24.78 %)
17,094
(1.42 %)
501 topmouth culter (CATC2023 2024)
GCA_040182925.1
n/a 17,927
(2.80 %)
55,175
(5.53 %)
n/a 37.59
(100.00 %)
31
(0.00 %)
37
(100.00 %)
3,036,659
(56.67 %)
587,658
(6.36 %)
5,970,645
(42.75 %)
39,224
(2.23 %)
502 torafugu (alternate hap 2019)
GCA_901000745.3
n/a 13,635
(4.82 %)
48,723
(11.83 %)
n/a 45.60
(99.82 %)
38
(0.18 %)
2,012
(100.00 %)
249,793
(9.32 %)
151,193
(4.49 %)
1,577,144
(20.25 %)
46,936
(9.72 %)
503 torafugu (fTakRub1.2 2019 refseq)
GCF_901000725.2
53,489
(18.32 %)
14,527
(4.79 %)
28,597
(10.65 %)
55,587
(14.38 %)
45.67
(99.04 %)
402
(0.96 %)
128
(100.00 %)
281,011
(10.36 %)
178,921
(5.32 %)
1,642,756
(20.86 %)
49,975
(9.63 %)
504 torafugu (fTakRub1.3 2021 genbank)
GCA_901000725.3
n/a 14,527
(4.79 %)
51,181
(11.72 %)
n/a 45.67
(99.04 %)
402
(0.96 %)
128
(100.00 %)
325,077
(14.03 %)
178,921
(5.32 %)
1,642,754
(20.86 %)
49,975
(9.63 %)
505 trahira (v1 hap1 2024 refseq)
GCF_029633855.1
55,764
(7.71 %)
17,259
(2.05 %)
47,792
(4.36 %)
n/a 40.99
(94.51 %)
989
(5.49 %)
598
(100.00 %)
2,407,637
(30.93 %)
742,073
(14.33 %)
5,715,475
(37.52 %)
29,012
(2.12 %)
506 trahira (v2 hap1 2024 genbank)
GCA_029633855.2
n/a 17,256
(2.05 %)
47,792
(4.36 %)
n/a 40.99
(94.51 %)
989
(5.49 %)
597
(100.00 %)
2,407,631
(30.93 %)
742,073
(14.33 %)
5,715,418
(37.52 %)
29,012
(2.12 %)
507 trahira (v2 hap2 2024)
GCA_029633875.2
n/a 15,041
(2.01 %)
42,180
(4.38 %)
n/a 41.03
(96.21 %)
792
(3.79 %)
594
(98.65 %)
1,069,159
(7.06 %)
653,554
(15.46 %)
4,921,631
(38.75 %)
26,440
(2.18 %)
508 trumpetfish (SK-2024c 2025)
GCA_048301465.1
n/a 14,730
(2.84 %)
50,956
(7.07 %)
n/a 43.20
(100.00 %)
179
(0.00 %)
161
(100.00 %)
548,208
(5.35 %)
356,364
(7.30 %)
3,448,877
(26.01 %)
26,685
(1.80 %)
509 trumpetfish (SK-2024c 2025)
GCA_048301475.1
n/a 14,680
(2.80 %)
50,753
(6.99 %)
n/a 43.14
(100.00 %)
187
(0.00 %)
248
(100.00 %)
559,722
(5.35 %)
382,817
(8.57 %)
3,423,208
(26.76 %)
26,739
(1.77 %)
510 turbot (primary hap 2023)
GCA_963854745.1
n/a 14,816
(3.44 %)
49,680
(8.16 %)
n/a 43.40
(99.97 %)
805
(0.03 %)
108
(100.00 %)
808,348
(19.20 %)
301,230
(7.15 %)
3,267,772
(25.91 %)
66,132
(6.90 %)
511 turbot (ysfricsl-2021 2022)
GCF_022379125.1
57,298
(14.93 %)
14,887
(3.52 %)
49,403
(8.32 %)
87,351
(14.65 %)
43.54
(100.00 %)
n/a 28
(100.00 %)
455,017
(0.00 %)
297,185
(5.03 %)
3,312,612
(24.33 %)
65,633
(7.08 %)
512 turquoise killifish (GRZ 2015)
GCF_001465895.1
40,386
(7.85 %)
14,339
(2.08 %)
84,906
(20.47 %)
57,218
(6.01 %)
42.51
(68.98 %)
85,562
(31.04 %)
68,911
(68.97 %)
392,114
(2.78 %)
307,607
(2.09 %)
4,777,941
(27.62 %)
61,105
(2.15 %)
513 turquoise killifish (GRZ-AD 2024)
GCF_043380555.1
56,976
(5.74 %)
14,604
(1.25 %)
72,207
(4.35 %)
n/a 44.51
(100.00 %)
369
(0.00 %)
304
(100.00 %)
2,858,575
(46.12 %)
660,603
(29.65 %)
4,283,242
(61.88 %)
118,966
(11.71 %)
514 turquoise killifish (MZM-0403 2023)
GCF_027789165.1
54,501
(6.75 %)
14,227
(1.27 %)
69,161
(4.33 %)
n/a 44.33
(93.22 %)
3,093
(6.78 %)
2,681
(100.00 %)
2,760,581
(47.64 %)
635,213
(25.56 %)
4,136,925
(56.55 %)
110,696
(10.50 %)
515 walking catfish (CIFAMagur01 2020)
GCA_013621035.1
n/a 15,895
(2.18 %)
46,934
(4.73 %)
n/a 39.83
(99.95 %)
605
(0.05 %)
3,484
(100.00 %)
1,061,538
(6.25 %)
611,618
(5.19 %)
5,978,835
(37.11 %)
54,666
(3.50 %)
516 walleye pollock (NIFS_2021 2022)
GCF_026213295.1
49,084
(12.15 %)
14,241
(2.71 %)
70,653
(9.29 %)
n/a 45.59
(99.96 %)
2,816
(0.04 %)
168
(100.00 %)
1,274,742
(38.63 %)
797,757
(14.11 %)
2,725,416
(34.38 %)
95,149
(8.09 %)
517 warty frogfish (fAntMac1 alternate hap 2020)
GCA_013347815.1
n/a 14,197
(3.33 %)
44,782
(7.70 %)
n/a 41.82
(100.00 %)
n/a 2,294
(100.00 %)
396,279
(4.74 %)
275,154
(5.76 %)
2,933,132
(29.41 %)
35,104
(4.08 %)
518 warty frogfish (primary hap 2020)
GCA_013358685.1
n/a 14,494
(3.34 %)
45,310
(7.77 %)
n/a 41.86
(99.87 %)
219
(0.13 %)
155
(100.00 %)
413,753
(4.95 %)
290,313
(6.11 %)
3,010,996
(29.71 %)
36,840
(4.18 %)
519 western mosquitofish
GCF_019740435.1
54,016
(12.31 %)
14,667
(2.80 %)
44,358
(6.62 %)
n/a 38.94
(97.42 %)
181
(2.58 %)
37
(100.00 %)
348,476
(2.56 %)
158,728
(2.21 %)
4,604,959
(26.85 %)
30,624
(1.94 %)
520 western speckled dace (OS25496 2023)
GCF_029890125.1
46,203
(5.36 %)
16,945
(2.57 %)
65,343
(6.35 %)
n/a 39.74
(100.00 %)
n/a 930
(100.00 %)
2,528,154
(48.24 %)
549,447
(8.24 %)
5,157,802
(41.42 %)
84,874
(6.05 %)
521 westslope cutthroat trout (Uvic-CL-2024 2024)
GCF_045791955.1
85,126
(5.62 %)
27,822
(1.58 %)
113,187
(4.31 %)
n/a 43.47
(99.99 %)
1,381
(0.01 %)
4,647
(99.99 %)
1,200,605
(4.82 %)
2,237,797
(24.56 %)
10,339,252
(54.27 %)
70,550
(1.65 %)
522 White Sands pupfish
GCF_016077235.1
46,084
(6.27 %)
14,817
(1.71 %)
52,055
(4.88 %)
n/a 39.01
(100.00 %)
n/a 2,003
(100.00 %)
489,894
(2.67 %)
304,277
(3.91 %)
6,371,712
(38.05 %)
41,820
(1.75 %)
523 wide-bodied pipefish (UIUO_SnigA 2025)
GCF_051989575.1
42,217
(16.06 %)
13,404
(4.52 %)
34,943
(9.06 %)
n/a 40.12
(100.00 %)
105
(0.00 %)
156
(100.00 %)
449,493
(16.34 %)
165,719
(11.05 %)
1,950,180
(36.18 %)
32,458
(8.36 %)
524 wolf-eel
GCF_004355925.1
43,638
(14.00 %)
14,930
(3.24 %)
31,372
(7.30 %)
n/a 42.10
(92.86 %)
23,891
(7.15 %)
33,400
(92.85 %)
379,343
(3.26 %)
244,853
(2.39 %)
3,432,622
(22.07 %)
30,581
(2.04 %)
525 woolly sculpin (alternate hap CAN_PGR_092001 2022)
GCA_023055415.1
n/a 14,753
(3.49 %)
49,516
(8.47 %)
n/a 43.00
(100.00 %)
222
(0.00 %)
171
(100.00 %)
458,382
(5.18 %)
420,718
(8.01 %)
3,146,054
(25.71 %)
69,817
(7.20 %)
526 woolly sculpin (CAN_PGR_092001 2022)
GCA_023055335.1
n/a 14,847
(3.48 %)
50,136
(8.43 %)
n/a 42.99
(100.00 %)
219
(0.00 %)
443
(100.00 %)
461,903
(5.20 %)
422,251
(8.03 %)
3,180,804
(25.81 %)
70,183
(7.15 %)
527 woolly sculpin (CAN_PGR_092001 primary hap 2022)
GCF_023055335.1
42,410
(12.47 %)
14,845
(3.48 %)
50,132
(8.43 %)
n/a 42.99
(100.00 %)
219
(0.00 %)
661
(100.00 %)
461,895
(5.20 %)
422,249
(8.03 %)
3,180,722
(25.81 %)
70,181
(7.15 %)
528 worm pipefish (v2.1 RoL_2023-P12025)
GCF_033978685.3
47,694
(3.96 %)
14,177
(1.01 %)
59,392
(2.97 %)
n/a 39.43
(100.00 %)
40
(0.00 %)
230
(100.00 %)
1,246,897
(5.46 %)
1,548,619
(19.15 %)
6,596,258
(69.80 %)
148,788
(5.04 %)
529 Wuchang bream
GCF_018812025.1
68,781
(8.86 %)
18,247
(2.62 %)
57,323
(5.24 %)
n/a 37.64
(99.83 %)
1,281
(0.17 %)
243
(100.00 %)
801,110
(0.00 %)
559,399
(5.04 %)
6,340,567
(43.09 %)
45,067
(2.52 %)
530 X-ray tetra P.maxillaris (Tingi 2024)
GCA_045781885.1
n/a 16,642
(2.04 %)
47,150
(4.32 %)
n/a 38.74
(100.00 %)
n/a 157
(100.00 %)
3,230,699
(43.68 %)
893,937
(8.12 %)
7,684,185
(38.36 %)
29,533
(1.14 %)
531 Yangtze koukloug (SWU-2019 2020)
GCF_012432095.1
63,938
(10.50 %)
17,502
(3.25 %)
52,519
(5.86 %)
n/a 37.23
(99.62 %)
617
(0.38 %)
353
(100.00 %)
2,297,102
(50.34 %)
368,423
(3.28 %)
5,171,389
(38.98 %)
32,824
(2.00 %)
532 yellow and blueback fusilier (OG672 2025)
GCA_048129025.1
n/a 15,641
(1.95 %)
52,141
(5.13 %)
n/a 40.61
(100.00 %)
17
(0.00 %)
250
(100.00 %)
607,010
(2.66 %)
288,837
(3.91 %)
6,785,488
(31.37 %)
39,560
(1.65 %)
533 yellow and blueback fusilier (OG672 2025)
GCA_048129055.1
n/a 15,666
(1.88 %)
53,049
(5.01 %)
n/a 40.71
(100.00 %)
29
(0.00 %)
324
(100.00 %)
620,903
(2.64 %)
305,809
(5.18 %)
6,707,330
(33.41 %)
45,863
(1.88 %)
534 yellow catfish (hzauxx_2018 2022)
GCF_022655615.1
64,819
(11.15 %)
15,680
(2.87 %)
41,108
(5.68 %)
n/a 39.49
(99.94 %)
817
(0.06 %)
517
(100.00 %)
839,496
(9.42 %)
756,396
(11.12 %)
4,051,149
(35.45 %)
24,342
(1.72 %)
535 yellow catfish (Tf-2017 2018)
GCF_003724035.1
54,374
(10.66 %)
15,584
(2.85 %)
22,598
(5.58 %)
n/a 39.55
(99.11 %)
1,760
(0.89 %)
663
(100.00 %)
883,218
(10.65 %)
797,020
(11.09 %)
4,092,065
(35.46 %)
24,238
(1.72 %)
536 yellow perch (YP-PL-M2 2019)
GCF_004354835.1
47,121
(7.78 %)
15,458
(2.26 %)
28,572
(5.62 %)
n/a 40.84
(99.95 %)
831
(0.05 %)
268
(100.00 %)
620,402
(4.92 %)
540,302
(7.26 %)
4,770,842
(35.92 %)
35,251
(1.63 %)
537 yellowfin seabream (v.2019 alternate hap 2020)
GCA_904848175.1
n/a 814
(1.87 %)
3,814
(6.84 %)
n/a 42.36
(99.98 %)
80
(0.02 %)
349
(100.00 %)
38,000
(5.03 %)
29,516
(7.35 %)
232,988
(20.37 %)
2,289
(2.07 %)
538 yellowfin seabream (v.2019 primary hap 2020)
GCA_904848185.1
n/a 15,178
(2.83 %)
46,332
(6.73 %)
n/a 42.09
(100.00 %)
149
(0.00 %)
65
(100.00 %)
499,904
(3.43 %)
254,360
(2.64 %)
4,420,091
(22.81 %)
31,005
(1.79 %)
539 yellowfin seabream (v.2019 primary hap 2020)
GCF_904848185.1
63,974
(13.26 %)
15,178
(2.82 %)
46,332
(6.73 %)
84,160
(11.62 %)
42.09
(100.00 %)
149
(0.00 %)
66
(100.00 %)
499,939
(3.43 %)
254,361
(2.64 %)
4,420,217
(22.81 %)
31,005
(1.79 %)
540 yellowfin tuna (alternate hap 2021)
GCA_914744365.1
n/a 15,959
(2.63 %)
43,025
(5.73 %)
n/a 39.71
(100.00 %)
n/a 640
(100.00 %)
1,427,221
(28.44 %)
257,108
(3.15 %)
5,197,531
(26.91 %)
13,909
(0.83 %)
541 yellowfin tuna (primary hap 2021)
GCF_914725855.1
57,835
(11.36 %)
15,616
(2.53 %)
42,750
(5.72 %)
n/a 39.73
(100.00 %)
70
(0.00 %)
68
(100.00 %)
569,665
(3.53 %)
259,656
(3.34 %)
5,175,692
(27.05 %)
14,420
(0.88 %)
542 yellowtail amberjack (v2 SW California HSWRI2012SDOR001 2017)
GCF_002814215.2
40,948
(9.95 %)
15,673
(2.75 %)
53,235
(6.33 %)
n/a 40.72
(97.79 %)
33,661
(2.21 %)
98,345
(100.00 %)
1,337,427
(24.48 %)
522,121
(4.83 %)
4,649,096
(25.00 %)
16,819
(0.86 %)
543 zebra mbuna (Mazinzi reef 2018)
GCF_000238955.4
51,025
(8.37 %)
15,901
(2.10 %)
32,136
(6.12 %)
n/a 41.16
(99.99 %)
641
(0.01 %)
1,690
(100.00 %)
565,771
(6.22 %)
253,037
(2.53 %)
4,679,743
(31.57 %)
36,689
(2.00 %)
544 zebra mbuna (NMK-2024a 2024)
GCF_041146795.1
64,053
(10.53 %)
15,646
(2.13 %)
55,412
(6.16 %)
n/a 41.21
(98.83 %)
155
(1.17 %)
63
(100.00 %)
1,445,623
(39.84 %)
261,983
(5.12 %)
4,357,683
(32.79 %)
35,968
(2.14 %)
545 zebrafish (fDanRer4 alternate hap 2022)
GCA_944039255.1
n/a 6,365
(2.41 %)
16,467
(3.26 %)
n/a 36.72
(100.00 %)
n/a 4,719
(100.00 %)
1,317,027
(59.43 %)
323,062
(10.58 %)
3,014,570
(45.46 %)
14,563
(1.98 %)
546 zebrafish (GRCz12tu Tuebingen 2025)
GCF_049306965.1
122,338
(8.09 %)
18,033
(2.41 %)
44,966
(3.23 %)
n/a 37.14
(100.00 %)
13,351
(0.00 %)
26
(100.00 %)
3,807,410
(60.58 %)
965,679
(12.22 %)
8,736,108
(52.67 %)
45,856
(2.03 %)
547 zebrafish (T5D 2021)
GCA_018400075.1
n/a 17,774
(2.54 %)
44,221
(3.24 %)
n/a 36.52
(99.87 %)
20,876
(0.14 %)
20,901
(99.86 %)
4,138,008
(61.22 %)
894,145
(6.79 %)
9,494,379
(47.68 %)
42,482
(2.03 %)
548 zebrafish (WGS:CAHPTA01 2020)
GCA_903684865.1
n/a 17,535
(2.50 %)
44,169
(3.34 %)
n/a 36.57
(99.99 %)
712
(0.01 %)
1,252
(100.00 %)
3,891,854
(61.07 %)
927,173
(7.78 %)
8,621,517
(50.27 %)
44,554
(2.12 %)
549 zebrafish (WGS:CAHPTB02 2020)
GCA_903684855.2
n/a 17,692
(2.51 %)
43,578
(3.27 %)
n/a 36.56
(99.99 %)
1,352
(0.01 %)
755
(100.00 %)
3,937,397
(60.86 %)
936,258
(7.76 %)
8,732,369
(50.44 %)
44,812
(2.09 %)
550 zebrafish (WGS:CALUEM01 primary hap 2022)
GCA_944039275.1
n/a 18,065
(2.46 %)
44,526
(3.30 %)
n/a 37.08
(99.99 %)
381
(0.01 %)
73
(100.00 %)
4,804,769
(44.04 %)
954,645
(10.72 %)
8,694,743
(51.88 %)
44,936
(2.02 %)
551 zebrafish GRCz11
GCF_000002035.6
72,965
(6.43 %)
22,246
(2.54 %)
51,134
(7.13 %)
n/a 36.60
(99.72 %)
20,258
(0.28 %)
34,617
(99.73 %)
4,595,932
(57.92 %)
1,077,677
(6.47 %)
10,772,232
(49.45 %)
53,471
(2.06 %)
552 zig-zag eel (alternate hap)
GCA_900700395.1
n/a 1,204
(2.88 %)
4,065
(7.13 %)
n/a 41.24
(99.99 %)
n/a 1,437
(100.00 %)
26,319
(3.19 %)
14,209
(3.21 %)
211,357
(18.05 %)
1,253
(1.49 %)
553 zig-zag eel (v1.2 2019 refseq)
GCF_900324485.2
45,001
(12.01 %)
15,037
(3.35 %)
40,235
(7.28 %)
60,496
(9.39 %)
40.66
(97.76 %)
238
(2.24 %)
123
(100.00 %)
348,230
(2.87 %)
157,728
(2.01 %)
3,180,025
(23.44 %)
12,807
(1.08 %)
554 zig-zag eel (v1.3 2021 genbank)
GCA_900324485.3
n/a 15,036
(3.35 %)
40,234
(7.28 %)
n/a 40.66
(97.76 %)
238
(2.24 %)
123
(100.00 %)
671,614
(20.98 %)
157,728
(2.01 %)
3,180,040
(23.44 %)
12,807
(1.08 %)
TOTALS:total assembly count 554

Additional hubs with collections of assemblies
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Primates 607 assemblies assembly stats track stats
Mammals 731 assemblies assembly stats track stats
Birds 541 assemblies assembly stats track stats
Fishes 554 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 353 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 1929 assemblies assembly stats track stats
Plants 440 assemblies assembly stats track stats
Fungi 4120 assemblies assembly stats track stats
Viruses 15059 assemblies assembly stats track stats
Archaea 2702 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 22332 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 688 assemblies assembly stats track stats
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VGP - Vertebrate Genome Project 1303 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 464 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 5519 assemblies assembly stats track stats