Mammals Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of mammals only.

See also: hub accessassembly statistics


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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base gaps assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
cpg
islands
1 aardvark (SDZICR_OR568_19922 2012 Broad)
GCF_000298275.1
25,594
(1.08 %)
18,351
(1.06 %)
20,358
(0.98 %)
n/a 40.07
(76.89 %)
411,144
(23.15 %)
433,653
(76.85 %)
n/a 536,700
(0.74 %)
18,176,790
(39.08 %)
26,235
(0.40 %)
2 African grass rat (maternal 2020)
GCA_011750645.1
n/a 20,916
(2.01 %)
19,513
(1.43 %)
n/a 41.37
(98.89 %)
1,526
(1.11 %)
1,610
(100.00 %)
4,928,847
(37.45 %)
1,652,295
(5.20 %)
13,507,965
(32.27 %)
17,712
(0.51 %)
3 African grass rat (paternal 2020)
GCA_011762545.1
n/a 20,796
(2.00 %)
19,611
(1.43 %)
n/a 41.42
(97.70 %)
1,563
(2.30 %)
1,740
(100.00 %)
4,904,243
(37.25 %)
1,672,608
(5.37 %)
13,465,246
(32.19 %)
17,677
(0.50 %)
4 African grass rat (v1 paternal X 2020 refseq)
GCF_011762505.1
45,963
(2.46 %)
20,878
(1.99 %)
19,613
(1.43 %)
37,929
(2.32 %)
41.39
(99.19 %)
1,624
(0.81 %)
1,595
(100.00 %)
4,939,557
(37.33 %)
1,674,970
(5.40 %)
13,613,429
(32.71 %)
17,767
(0.51 %)
5 African grass rat (v2 paternal X 2024 genbank)
GCA_011762505.2
n/a 19,637
(1.95 %)
19,610
(1.43 %)
n/a 41.39
(99.19 %)
1,624
(0.81 %)
1,596
(100.00 %)
5,399,465
(42.90 %)
1,674,970
(5.40 %)
13,613,540
(32.71 %)
17,767
(0.51 %)
6 African grass rat (v2 paternal X 2025 refseq)
GCF_011762505.2
70,837
(3.51 %)
19,640
(1.95 %)
19,607
(1.43 %)
n/a 41.39
(99.19 %)
1,624
(0.81 %)
1,595
(100.00 %)
5,625,390
(42.96 %)
1,674,970
(5.40 %)
13,612,806
(32.71 %)
17,767
(0.51 %)
7 African grass rat (v3 paternal hap 2024)
GCA_011762505.3
n/a 20,986
(2.01 %)
19,611
(1.43 %)
n/a 41.39
(99.19 %)
1,624
(0.81 %)
1,596
(100.00 %)
4,532,782
(33.95 %)
1,674,970
(5.40 %)
13,612,916
(32.71 %)
17,767
(0.51 %)
8 African hunting dog
GCA_001887905.1
n/a 18,956
(1.75 %)
17,562
(1.41 %)
n/a 40.98
(92.89 %)
1,415,298
(7.28 %)
803
(100.00 %)
4,458,183
(39.99 %)
658,637
(1.13 %)
13,671,493
(28.24 %)
47,644
(1.64 %)
9 African hunting dog (LycPic1hap1 2024)
GCA_040955645.1
n/a 18,688
(1.61 %)
19,670
(1.44 %)
n/a 41.35
(100.00 %)
82
(0.00 %)
86
(100.00 %)
4,281,139
(31.62 %)
959,378
(2.78 %)
12,859,760
(32.95 %)
49,122
(2.32 %)
10 African hunting dog (LycPic1hap2 2024)
GCA_040955705.1
n/a 19,463
(1.58 %)
20,378
(1.42 %)
n/a 41.30
(100.00 %)
91
(0.00 %)
77
(100.00 %)
4,513,580
(32.16 %)
1,008,611
(2.91 %)
13,570,452
(33.71 %)
50,954
(2.21 %)
11 African savanna elephant (2009 refseq)
GCF_000001905.1
46,043
(2.30 %)
19,169
(1.26 %)
19,664
(1.10 %)
n/a 40.76
(97.57 %)
93,514
(2.45 %)
95,866
(97.55 %)
6,363,315
(57.54 %)
365,797
(0.88 %)
16,073,053
(44.89 %)
33,513
(0.68 %)
12 African savanna elephant (hap1 mLoxAfr1 2023)
GCA_030020305.1
n/a 18,845
(1.07 %)
22,426
(1.10 %)
n/a 41.34
(99.85 %)
169
(0.15 %)
1,253
(99.85 %)
4,406,744
(29.55 %)
925,868
(4.71 %)
15,966,881
(50.49 %)
68,531
(1.61 %)
13 African savanna elephant (hap2 2023 genbank)
GCA_030014295.1
n/a 18,981
(1.10 %)
22,759
(1.12 %)
n/a 41.25
(99.90 %)
231
(0.10 %)
880
(100.00 %)
4,426,756
(29.95 %)
832,908
(4.08 %)
16,118,910
(49.47 %)
62,315
(1.49 %)
14 African savanna elephant (hap2 2023 refseq)
GCF_030014295.1
64,034
(3.35 %)
18,980
(1.10 %)
21,593
(1.06 %)
n/a 41.25
(99.90 %)
231
(0.10 %)
879
(100.00 %)
4,426,749
(29.95 %)
832,904
(4.08 %)
16,118,888
(49.47 %)
62,314
(1.49 %)
15 African soft-furred rat (Lowveld savanna grassland N552 2022)
GCA_021653895.1
n/a 20,232
(2.08 %)
18,517
(1.32 %)
n/a 41.15
(100.00 %)
n/a 7,311
(100.00 %)
5,083,017
(39.13 %)
1,337,200
(3.02 %)
13,402,561
(30.35 %)
17,841
(0.51 %)
16 African soft-furred rat (MVZ Mamm 221054 2021)
GCA_019843795.1
n/a 26,123
(1.59 %)
49,154
(1.23 %)
n/a 41.38
(99.06 %)
92,030
(0.93 %)
412,491
(99.07 %)
5,251,146
(37.28 %)
1,541,020
(3.13 %)
13,613,713
(32.35 %)
21,054
(0.58 %)
17 agile gracile mouse opossum
GCF_016433145.1
30,697
(1.32 %)
17,361
(0.78 %)
17,596
(0.81 %)
n/a 37.86
(91.75 %)
85,142
(8.25 %)
60,714
(100.00 %)
7,917,577
(49.04 %)
1,054,566
(1.57 %)
22,701,659
(37.69 %)
27,301
(0.49 %)
18 Allen's wood mouse (MVZ Mamm 196246 2021)
GCA_019843855.1
n/a 22,687
(1.16 %)
46,299
(0.94 %)
n/a 41.37
(99.72 %)
75,967
(0.24 %)
659,537
(99.76 %)
6,139,432
(45.57 %)
1,339,550
(3.13 %)
12,293,115
(32.34 %)
16,575
(0.44 %)
19 alpaca (2025)
GCF_048564905.1
80,233
(3.11 %)
18,667
(1.53 %)
23,043
(1.52 %)
n/a 41.92
(99.91 %)
681
(0.09 %)
519
(100.00 %)
3,387,094
(33.34 %)
395,581
(10.22 %)
11,510,740
(36.96 %)
72,497
(1.98 %)
20 alpaca (v3.2 Carlotta AHFN-0088 2019 Deakin U)
GCF_000164845.4
54,987
(3.56 %)
18,439
(1.93 %)
18,426
(1.63 %)
n/a 41.40
(95.85 %)
166,272
(4.17 %)
77,389
(100.00 %)
3,004,413
(33.17 %)
315,092
(1.36 %)
12,458,272
(24.89 %)
54,502
(1.38 %)
21 Alpine marmot (2019)
GCF_001458135.2
69,587
(3.43 %)
19,047
(1.54 %)
17,768
(1.39 %)
n/a 39.80
(96.13 %)
88,858
(3.88 %)
14,031
(100.00 %)
3,726,252
(26.48 %)
746,953
(1.83 %)
14,066,368
(30.30 %)
30,191
(0.63 %)
22 Alvarez's mastiff bat (A012 2023)
GCA_031001765.1
n/a 19,086
(1.55 %)
22,040
(1.52 %)
n/a 42.18
(99.99 %)
1,182
(0.01 %)
1,369
(99.99 %)
3,846,728
(31.78 %)
639,852
(2.90 %)
11,937,936
(38.98 %)
75,377
(2.21 %)
23 Alvarez's mastiff bat (hap1 2024)
GCA_037157525.1
n/a 18,980
(1.50 %)
22,394
(1.50 %)
n/a 42.30
(100.00 %)
80
(0.00 %)
326
(100.00 %)
3,896,863
(31.56 %)
659,711
(4.74 %)
11,945,162
(40.81 %)
76,769
(2.57 %)
24 Alvarez's mastiff bat (hap2 2024)
GCA_037176705.1
n/a 19,066
(1.48 %)
22,356
(1.48 %)
n/a 42.25
(100.00 %)
75
(0.00 %)
287
(100.00 %)
3,908,607
(31.48 %)
664,931
(5.23 %)
11,892,191
(41.08 %)
76,453
(2.43 %)
25 Amazon manatee (hap1 2025)
GCA_046562985.1
n/a 17,917
(1.26 %)
20,499
(1.11 %)
n/a 40.77
(100.00 %)
377
(0.00 %)
550
(100.00 %)
5,812,915
(56.93 %)
431,488
(2.57 %)
14,336,638
(47.98 %)
33,775
(0.84 %)
26 Amazon manatee (hap2 2025)
GCA_046562895.1
n/a 18,949
(1.23 %)
21,655
(1.08 %)
n/a 40.80
(100.00 %)
294
(0.00 %)
401
(100.00 %)
6,218,266
(57.31 %)
470,437
(3.04 %)
15,241,157
(48.91 %)
37,124
(0.86 %)
27 American beaver (hap1 2025)
GCA_047511655.1
n/a 19,828
(1.45 %)
20,376
(1.31 %)
n/a 39.72
(100.00 %)
181
(0.00 %)
503
(100.00 %)
4,030,880
(35.35 %)
566,770
(2.63 %)
14,198,970
(35.24 %)
24,454
(0.96 %)
28 American beaver (hap1v2 2025)
GCA_047511655.2
n/a 19,759
(1.46 %)
19,656
(1.23 %)
n/a 39.67
(100.00 %)
181
(0.00 %)
182
(100.00 %)
4,077,829
(35.51 %)
563,159
(2.55 %)
14,502,350
(35.45 %)
23,983
(0.89 %)
29 American beaver (hap2 2025)
GCA_047511605.1
n/a 19,144
(1.44 %)
18,959
(1.23 %)
n/a 39.54
(100.00 %)
194
(0.00 %)
229
(100.00 %)
3,981,637
(35.85 %)
561,691
(2.26 %)
14,374,940
(35.03 %)
23,386
(0.80 %)
30 American beaver (hap2v2 2025)
GCA_047511605.2
n/a 19,115
(1.44 %)
18,756
(1.21 %)
n/a 39.53
(100.00 %)
194
(0.00 %)
154
(100.00 %)
4,032,632
(35.91 %)
560,508
(2.24 %)
14,349,713
(35.01 %)
23,225
(0.77 %)
31 American beaver (mCasCan1.hap1v2 2025)
GCF_047511655.1
79,343
(3.55 %)
19,759
(1.46 %)
19,920
(1.23 %)
n/a 39.67
(100.00 %)
181
(0.00 %)
181
(100.00 %)
4,023,733
(35.50 %)
563,158
(2.55 %)
14,502,226
(35.45 %)
23,983
(0.89 %)
32 American beaver (Ward 2017 refseq)
GCF_001984765.1
40,013
(2.15 %)
20,867
(1.53 %)
24,201
(1.33 %)
n/a 39.72
(99.99 %)
3,321
(0.01 %)
21,157
(100.00 %)
4,526,430
(33.75 %)
486,353
(1.30 %)
14,347,145
(31.96 %)
23,046
(0.72 %)
33 American bison (2014 refseq)
GCF_000754665.1
38,699
(2.34 %)
19,782
(1.47 %)
20,444
(1.25 %)
n/a 41.82
(93.12 %)
341,984
(6.92 %)
470,415
(93.08 %)
n/a 419,596
(0.95 %)
13,519,877
(37.66 %)
60,388
(1.03 %)
34 American black bear (L20-20 2025)
GCA_024610735.2
n/a 18,082
(1.59 %)
20,977
(1.43 %)
n/a 42.93
(100.00 %)
41
(0.00 %)
298
(100.00 %)
4,773,058
(45.96 %)
641,956
(5.91 %)
13,210,521
(35.54 %)
68,976
(3.00 %)
35 American black bear (L20-20 alternate hap 2022)
GCA_024610745.1
n/a 22,502
(1.17 %)
43,431
(1.28 %)
n/a 43.14
(99.99 %)
n/a 77,311
(100.00 %)
4,587,986
(32.30 %)
773,829
(6.39 %)
14,594,034
(35.67 %)
78,849
(3.32 %)
36 American black bear (L20-20 primary hap 2022)
GCA_024610735.1
n/a 18,458
(1.52 %)
21,049
(1.43 %)
n/a 42.93
(100.00 %)
22
(0.00 %)
317
(100.00 %)
4,000,508
(32.69 %)
641,903
(5.91 %)
13,210,530
(35.54 %)
68,981
(3.00 %)
37 American black bear (UA15103 2021)
GCF_020975775.1
53,916
(3.11 %)
18,840
(1.73 %)
20,969
(1.50 %)
n/a 42.09
(100.00 %)
n/a 2,213
(100.00 %)
3,936,528
(34.53 %)
594,864
(2.90 %)
13,725,005
(32.35 %)
62,580
(1.91 %)
38 American mink (2018)
GCA_900108605.1
n/a 18,686
(1.70 %)
20,016
(1.50 %)
36,997
(1.74 %)
41.60
(92.95 %)
154,172
(7.07 %)
161,347
(92.93 %)
4,350,343
(38.70 %)
606,128
(1.17 %)
13,605,797
(28.74 %)
54,199
(1.98 %)
39 American mink (hap1 2024)
GCA_964106545.1
n/a 19,203
(1.43 %)
22,174
(1.33 %)
n/a 42.39
(99.98 %)
2,957
(0.02 %)
435
(100.00 %)
4,188,829
(30.04 %)
802,295
(5.81 %)
14,041,290
(37.98 %)
65,430
(2.64 %)
40 American mink (hap2 2024)
GCA_964106205.1
n/a 18,890
(1.43 %)
21,684
(1.33 %)
n/a 42.35
(99.98 %)
2,849
(0.02 %)
3,200
(99.98 %)
4,158,563
(30.22 %)
786,430
(5.25 %)
13,845,377
(37.58 %)
64,307
(2.75 %)
41 American mink (M4711 2021 Dalhousie U)
GCF_020171115.1
50,253
(2.26 %)
18,949
(1.49 %)
20,914
(1.29 %)
n/a 42.26
(100.00 %)
n/a 183
(100.00 %)
4,705,680
(39.15 %)
795,684
(5.50 %)
14,085,357
(37.99 %)
63,307
(2.38 %)
42 American pika (hap1 2023)
GCF_030435755.1
45,008
(1.93 %)
17,997
(1.35 %)
23,185
(1.49 %)
n/a 44.16
(100.00 %)
432
(0.00 %)
5,864
(100.00 %)
4,126,248
(43.60 %)
628,344
(15.71 %)
11,100,962
(42.69 %)
60,350
(1.67 %)
43 American pika (hap2 2023)
GCA_030435715.1
n/a 16,911
(1.23 %)
21,107
(1.43 %)
n/a 44.43
(100.00 %)
375
(0.00 %)
6,123
(100.00 %)
1,808,768
(10.42 %)
561,106
(21.05 %)
10,283,513
(45.97 %)
54,919
(1.33 %)
44 American pika 3.0 (2012 Broad refseq)
GCF_000292845.1
26,240
(1.93 %)
17,576
(1.61 %)
20,076
(1.70 %)
n/a 43.35
(87.20 %)
122,542
(12.82 %)
132,962
(87.18 %)
2,761,257
(29.47 %)
414,896
(1.07 %)
10,968,698
(26.71 %)
44,652
(1.14 %)
45 American pika 4.0 (UAM:Mamm:113957 2020)
GCF_014633375.1
31,887
(1.92 %)
17,532
(1.60 %)
19,609
(1.65 %)
n/a 43.35
(87.14 %)
124,941
(12.88 %)
9,351
(100.00 %)
2,827,662
(29.77 %)
414,980
(1.07 %)
10,969,165
(26.69 %)
44,743
(1.13 %)
46 American wolverine (FN33715 2022)
GCA_024509225.1
n/a 18,360
(1.57 %)
20,615
(1.47 %)
n/a 41.70
(100.00 %)
53
(0.00 %)
758
(100.00 %)
4,038,995
(32.25 %)
664,825
(1.25 %)
13,625,080
(33.05 %)
56,595
(2.13 %)
47 Amur tiger (TaeGuk 2013 refseq)
GCF_000464555.1
33,681
(2.23 %)
17,929
(1.49 %)
15,090
(1.29 %)
n/a 41.40
(97.59 %)
155,553
(2.44 %)
157,032
(97.56 %)
n/a 831,136
(1.67 %)
13,654,437
(31.78 %)
65,229
(1.60 %)
48 Angolan free-tailed bat (Cote d'Ivoire 20210831_DDa 2024)
GCA_043748645.1
n/a 18,528
(1.65 %)
22,359
(1.64 %)
n/a 42.89
(100.00 %)
88
(0.00 %)
44
(100.00 %)
3,531,044
(35.70 %)
555,304
(2.07 %)
11,439,853
(36.03 %)
102,112
(3.75 %)
49 Angolan free-tailed bat (Cote d'Ivoire 20210831_DDa alternate hap 2024)
GCA_043748605.1
n/a 17,996
(1.77 %)
23,084
(1.76 %)
n/a 43.12
(100.00 %)
n/a 1,670
(100.00 %)
4,087,571
(42.52 %)
525,056
(2.00 %)
10,779,134
(34.81 %)
100,610
(3.93 %)
50 Angus cow (Angus x Brahman F1 Angus haplotype 2018)
GCA_003369685.2
n/a 19,096
(1.59 %)
20,674
(1.34 %)
n/a 41.99
(99.75 %)
277
(0.25 %)
1,435
(100.00 %)
5,290,422
(47.51 %)
478,946
(1.94 %)
12,568,313
(41.15 %)
45,850
(1.37 %)
51 Antarctic minke whale
GCA_000978805.1
n/a 23,312
(1.49 %)
45,535
(1.26 %)
n/a 40.73
(99.37 %)
299,456
(0.64 %)
720,900
(99.36 %)
4,011,313
(41.13 %)
504,837
(1.04 %)
13,553,641
(30.96 %)
56,223
(1.31 %)
52 Antillean ghost-faced bat
GCA_004026545.1
n/a 20,088
(1.74 %)
31,558
(1.63 %)
n/a 41.74
(99.97 %)
1,835
(0.01 %)
207,094
(99.99 %)
3,025,044
(30.67 %)
332,606
(0.70 %)
12,504,556
(28.79 %)
65,503
(2.30 %)
53 aoudad
GCA_002201775.1
n/a 19,905
(1.62 %)
27,488
(1.60 %)
n/a 42.01
(95.96 %)
186,672
(4.05 %)
263,992
(95.95 %)
5,418,013
(45.05 %)
471,426
(1.19 %)
13,396,252
(36.94 %)
48,844
(1.32 %)
54 Arabian camel (Drom800 2019 refseq)
GCF_000803125.2
64,532
(3.85 %)
18,483
(1.89 %)
20,554
(1.62 %)
n/a 41.51
(99.22 %)
47,342
(0.79 %)
21,070
(100.00 %)
3,233,022
(34.07 %)
345,049
(1.55 %)
13,383,050
(26.19 %)
58,872
(1.79 %)
55 Arabian camel (hap2 2024)
GCA_036321565.1
n/a 17,085
(1.73 %)
19,317
(1.59 %)
n/a 41.75
(100.00 %)
210
(0.00 %)
173
(100.00 %)
2,818,446
(29.44 %)
316,646
(8.90 %)
11,192,133
(31.47 %)
52,135
(1.67 %)
56 Arabian camel (paternal hap 2024 genbank)
GCA_036321535.1
n/a 18,080
(1.66 %)
20,345
(1.52 %)
n/a 41.64
(100.00 %)
195
(0.00 %)
172
(100.00 %)
3,040,473
(29.22 %)
343,482
(10.93 %)
11,797,012
(33.50 %)
55,428
(1.61 %)
57 Arabian camel (paternal hap 2024 refseq)
GCF_036321535.1
62,940
(3.46 %)
18,078
(1.66 %)
21,071
(1.56 %)
n/a 41.64
(100.00 %)
195
(0.00 %)
171
(100.00 %)
3,040,467
(29.22 %)
343,480
(10.93 %)
11,796,955
(33.50 %)
55,427
(1.61 %)
58 Arctic fox (Blue_001 2021 refseq)
GCF_018345385.1
60,759
(3.11 %)
19,942
(1.72 %)
19,529
(1.38 %)
n/a 41.27
(100.00 %)
529
(0.00 %)
929
(100.00 %)
4,821,229
(41.22 %)
1,006,124
(2.31 %)
13,556,149
(32.92 %)
49,997
(2.23 %)
59 Arctic ground squirrel (AGS 11-09-20 2018)
GCF_003426925.1
39,569
(2.25 %)
18,954
(1.74 %)
19,372
(1.45 %)
n/a 39.95
(89.51 %)
2,429,461
(10.59 %)
15,883
(100.00 %)
4,400,304
(32.67 %)
672,831
(1.50 %)
13,913,477
(26.41 %)
27,575
(0.72 %)
60 Arctic ground squirrel (hap1 2024)
GCA_045843805.1
n/a 20,255
(1.35 %)
21,401
(1.44 %)
n/a 40.08
(100.00 %)
694
(0.00 %)
2,530
(100.00 %)
4,287,108
(25.85 %)
895,123
(5.96 %)
15,722,314
(36.45 %)
34,781
(0.82 %)
61 Arctic ground squirrel (hap2 2024)
GCA_045843765.1
n/a 18,385
(1.31 %)
19,099
(1.34 %)
n/a 39.97
(100.00 %)
590
(0.00 %)
2,307
(100.00 %)
4,314,945
(35.63 %)
820,736
(6.65 %)
14,490,422
(35.95 %)
31,201
(0.78 %)
62 Arctic ground squirrel (mUroPar1hap1 2024)
GCF_045843805.1
45,939
(2.00 %)
19,773
(1.41 %)
20,880
(1.28 %)
n/a 40.08
(100.00 %)
694
(0.00 %)
2,529
(100.00 %)
5,291,989
(39.61 %)
895,123
(5.96 %)
15,722,212
(36.45 %)
34,781
(0.82 %)
63 Asian palm civet
GCA_004024585.1
n/a 22,124
(1.43 %)
43,710
(1.39 %)
n/a 42.52
(99.95 %)
4,533
(0.02 %)
442,658
(99.98 %)
4,877,367
(40.32 %)
754,440
(1.35 %)
14,557,779
(32.29 %)
148,246
(5.67 %)
64 Asiatic brush-tailed porcupine (POm2014 2021)
GCA_016801275.1
n/a 18,688
(1.73 %)
22,642
(1.64 %)
n/a 41.26
(97.24 %)
152,126
(2.77 %)
303,244
(97.23 %)
3,431,580
(28.56 %)
667,375
(2.21 %)
13,572,972
(26.90 %)
42,853
(1.30 %)
65 Asiatic elephant (hap1 2025)
GCA_051911825.1
n/a 18,110
(1.16 %)
21,254
(1.07 %)
n/a 41.12
(100.00 %)
83
(0.00 %)
106
(100.00 %)
8,688,198
(60.75 %)
617,944
(3.48 %)
16,342,943
(48.24 %)
54,726
(1.19 %)
66 Asiatic elephant (hap2 2025)
GCA_051911805.1
n/a 17,315
(1.21 %)
20,345
(1.11 %)
n/a 41.03
(99.98 %)
51
(0.02 %)
88
(100.00 %)
8,066,849
(59.94 %)
495,013
(2.47 %)
15,276,267
(46.85 %)
44,484
(1.08 %)
67 Asiatic elephant (mEleMax1 alternate hap 2022)
GCA_024166345.1
n/a 17,906
(1.18 %)
21,966
(1.14 %)
n/a 41.14
(100.00 %)
n/a 6,361
(100.00 %)
3,818,524
(29.72 %)
533,426
(3.22 %)
14,381,781
(47.30 %)
50,264
(1.15 %)
68 Asiatic elephant (mEleMax1 primary hap 2022)
GCF_024166365.1
61,202
(2.60 %)
18,887
(1.13 %)
21,194
(1.06 %)
n/a 41.14
(99.90 %)
126
(0.10 %)
64
(100.00 %)
4,358,470
(31.27 %)
663,094
(4.56 %)
16,261,778
(48.66 %)
69,120
(1.32 %)
69 Asiatic mouflon (Amuf_v1 2020)
GCA_014523465.1
n/a 19,569
(1.59 %)
21,293
(1.35 %)
n/a 41.97
(99.68 %)
257
(0.32 %)
128
(100.00 %)
5,390,761
(47.15 %)
451,837
(1.15 %)
13,157,608
(40.67 %)
44,158
(1.19 %)
70 Asiatic tapir (hap1 2023)
GCA_031878655.1
n/a 18,969
(1.75 %)
20,207
(1.36 %)
n/a 41.25
(100.00 %)
79
(0.00 %)
262
(100.00 %)
3,650,963
(38.06 %)
355,322
(2.63 %)
14,837,952
(31.37 %)
37,174
(1.87 %)
71 Asiatic tapir (hap2 2023)
GCA_031878705.1
n/a 18,931
(1.76 %)
19,988
(1.37 %)
n/a 41.16
(100.00 %)
92
(0.00 %)
193
(100.00 %)
3,632,286
(38.21 %)
350,074
(2.22 %)
14,785,531
(30.90 %)
36,699
(1.70 %)
72 ass (Dezhou 2021)
GCF_016077325.2
84,046
(4.01 %)
18,838
(1.75 %)
20,239
(1.42 %)
69,689
(3.29 %)
41.42
(99.86 %)
1,922
(0.15 %)
50
(100.00 %)
3,840,509
(41.57 %)
319,943
(0.81 %)
14,889,114
(29.46 %)
41,082
(1.37 %)
73 ass (Donkey D_3611 2024)
GCF_041296235.1
92,510
(3.84 %)
18,566
(1.54 %)
21,504
(1.32 %)
n/a 42.37
(99.94 %)
7
(0.06 %)
849
(100.00 %)
3,555,052
(38.38 %)
658,645
(5.79 %)
14,242,715
(36.79 %)
43,875
(3.45 %)
74 ass (Maral har 2015 refseq)
GCF_001305755.1
48,976
(3.12 %)
18,838
(1.78 %)
19,295
(1.44 %)
n/a 41.28
(98.63 %)
69,593
(1.38 %)
2,167
(100.00 %)
3,731,432
(40.84 %)
289,737
(0.96 %)
14,695,308
(28.58 %)
40,025
(1.06 %)
75 Atlantic white-sided dolphin (mLagAcu1.hap1.1 2024)
GCA_964270905.1
n/a 18,773
(1.50 %)
21,069
(1.29 %)
n/a 42.18
(99.99 %)
1,034
(0.01 %)
900
(100.00 %)
3,975,427
(35.64 %)
1,054,000
(10.27 %)
12,281,095
(41.92 %)
79,762
(4.08 %)
76 Atlantic white-sided dolphin (mLagAcu1.hap2.1 2024)
GCA_964270935.1
n/a 17,961
(1.59 %)
20,087
(1.36 %)
n/a 42.05
(99.99 %)
917
(0.01 %)
1,796
(99.99 %)
3,626,392
(35.51 %)
824,778
(7.32 %)
11,499,904
(39.18 %)
74,348
(3.46 %)
77 Australian echidna (mTacAcu1 alternate hap 2020)
GCA_015852515.1
n/a 13,505
(1.03 %)
18,978
(1.47 %)
n/a 45.32
(99.98 %)
26
(0.02 %)
3,482
(100.00 %)
6,880,857
(41.88 %)
1,099,932
(7.47 %)
8,156,735
(56.68 %)
70,515
(2.88 %)
78 Australian echidna (mTacAcu1 primary hap 2020)
GCF_015852505.1
42,938
(2.28 %)
14,891
(1.01 %)
19,714
(1.45 %)
n/a 45.30
(98.61 %)
524
(1.39 %)
310
(100.00 %)
7,814,876
(42.89 %)
1,219,764
(6.93 %)
9,488,325
(55.68 %)
78,364
(2.73 %)
79 Australian echidna (primary hap 2020)
GCA_015852505.1
n/a 14,558
(1.03 %)
19,716
(1.45 %)
n/a 45.30
(98.61 %)
524
(1.39 %)
311
(100.00 %)
11,576,251
(65.36 %)
1,219,765
(6.93 %)
9,488,197
(55.68 %)
78,365
(2.74 %)
80 Bactrian camel (Alxa 2014 refseq)
GCF_000767855.1
52,191
(3.64 %)
18,303
(1.98 %)
17,097
(1.64 %)
n/a 41.32
(99.32 %)
31,980
(0.69 %)
67,435
(99.31 %)
2,966,704
(34.06 %)
306,997
(0.95 %)
12,209,949
(25.43 %)
49,790
(1.25 %)
81 Bactrian camel YW-2024 2025
GCF_048773025.1
76,927
(4.47 %)
18,239
(1.57 %)
22,111
(1.51 %)
n/a 41.95
(100.00 %)
127
(0.00 %)
158
(100.00 %)
3,258,307
(30.21 %)
377,352
(13.70 %)
11,533,205
(36.22 %)
65,887
(1.95 %)
82 banded mongoose
GCA_004023785.1
n/a 21,568
(1.57 %)
30,427
(1.43 %)
n/a 42.00
(99.96 %)
4,510
(0.02 %)
316,874
(99.98 %)
4,768,524
(40.51 %)
684,187
(1.30 %)
13,713,756
(33.42 %)
78,648
(2.80 %)
83 bank vole
GCF_902806735.1
56,423
(2.99 %)
18,977
(1.71 %)
18,408
(1.50 %)
n/a 41.86
(98.62 %)
53,506
(1.39 %)
54,142
(98.61 %)
3,222,366
(21.59 %)
933,697
(2.20 %)
12,831,232
(31.50 %)
18,784
(0.42 %)
84 banner-tailed kangaroo rat
GCF_019054845.1
43,753
(1.82 %)
18,397
(1.18 %)
24,180
(1.39 %)
n/a 40.83
(100.00 %)
n/a 2,026
(100.00 %)
5,587,719
(30.97 %)
1,363,513
(3.95 %)
12,128,920
(48.74 %)
36,371
(1.27 %)
85 banteng 2023
GCF_032452875.1
71,974
(3.56 %)
19,305
(1.36 %)
21,174
(1.20 %)
n/a 42.79
(100.00 %)
84
(0.00 %)
1,518
(100.00 %)
3,344,481
(20.63 %)
1,039,571
(11.74 %)
13,031,356
(47.36 %)
73,031
(1.72 %)
86 bat A.intermedius (hap2 2024)
GCA_038363225.1
n/a 17,124
(1.63 %)
18,342
(1.54 %)
n/a 42.25
(100.00 %)
56
(0.00 %)
187
(100.00 %)
2,597,378
(26.81 %)
332,733
(4.43 %)
10,957,327
(33.52 %)
63,688
(2.22 %)
87 bat C.sowelli (hap1 2025)
GCA_051307085.1
n/a 18,014
(1.42 %)
20,809
(1.93 %)
n/a 42.09
(100.00 %)
68
(0.00 %)
509
(100.00 %)
3,004,656
(32.84 %)
845,572
(16.12 %)
11,658,155
(41.10 %)
66,315
(3.59 %)
88 bat C.sowelli (hap2 2025)
GCA_051307135.1
n/a 17,963
(1.56 %)
20,587
(1.76 %)
n/a 42.16
(100.00 %)
58
(0.00 %)
272
(100.00 %)
2,925,013
(29.51 %)
669,006
(8.09 %)
11,656,071
(35.51 %)
66,056
(3.20 %)
89 bat G.keenani (hap1 2025)
GCA_050655435.1
n/a 17,710
(1.68 %)
20,322
(1.57 %)
n/a 42.06
(100.00 %)
103
(0.00 %)
188
(100.00 %)
3,982,570
(44.25 %)
413,159
(3.00 %)
12,157,326
(33.66 %)
69,493
(3.54 %)
90 bat G.keenani (hap2 2025)
GCA_050655445.1
n/a 17,129
(1.75 %)
19,351
(1.61 %)
n/a 42.25
(100.00 %)
57
(0.00 %)
83
(100.00 %)
3,507,996
(42.55 %)
382,739
(1.78 %)
11,541,032
(32.12 %)
67,214
(3.68 %)
91 bat H.larvatus (alternate hap 2023)
GCA_031878685.1
n/a 19,431
(1.77 %)
23,767
(1.57 %)
n/a 41.38
(100.00 %)
4
(0.00 %)
7,531
(100.00 %)
4,390,631
(44.16 %)
678,913
(4.61 %)
11,883,673
(33.41 %)
41,004
(1.20 %)
92 bat H.larvatus (China 20210929_DDb primary hap 2024)
GCA_043727955.1
n/a 19,354
(1.74 %)
21,367
(1.51 %)
n/a 41.48
(100.00 %)
190
(0.00 %)
265
(100.00 %)
3,860,506
(38.95 %)
722,335
(7.13 %)
11,994,816
(35.77 %)
44,562
(1.21 %)
93 bat M.microtis (hap1 2025)
GCA_051107205.1
n/a 18,403
(1.68 %)
20,606
(1.62 %)
n/a 42.65
(100.00 %)
68
(0.00 %)
190
(100.00 %)
3,101,865
(28.94 %)
356,434
(1.13 %)
11,717,214
(32.98 %)
78,560
(2.78 %)
94 bat M.microtis (hap2 2025)
GCA_051107335.1
n/a 17,634
(1.72 %)
19,795
(1.66 %)
n/a 42.77
(100.00 %)
64
(0.00 %)
158
(100.00 %)
2,904,392
(28.42 %)
330,754
(1.09 %)
11,070,209
(31.88 %)
74,480
(2.76 %)
95 beluga whale (Cook Inlet, Alaska, USA DL-CIB17-05 2020)
GCA_009917745.1
n/a 19,239
(1.79 %)
22,513
(1.43 %)
35,878
(1.82 %)
41.25
(97.57 %)
27,070
(2.43 %)
52,780
(97.57 %)
4,021,599
(43.53 %)
544,323
(1.08 %)
12,738,162
(33.47 %)
59,710
(1.51 %)
96 beluga whale (GAN/ISIS: 26980492/103006 v3 2019)
GCF_002288925.2
59,413
(3.09 %)
18,667
(1.79 %)
20,314
(1.43 %)
n/a 41.24
(98.49 %)
24,414
(1.52 %)
29,444
(98.48 %)
4,001,248
(43.73 %)
543,276
(1.11 %)
12,802,735
(34.18 %)
59,307
(1.53 %)
97 big brown bat (BU_THK_EF1 2012)
GCF_000308155.1
59,162
(3.17 %)
18,334
(1.94 %)
20,121
(1.78 %)
n/a 42.93
(89.41 %)
160,269
(10.62 %)
167,057
(89.38 %)
2,842,065
(25.82 %)
614,712
(1.89 %)
10,407,733
(28.90 %)
66,720
(2.99 %)
98 big brown bat (TK198812 2023)
GCA_027574615.1
n/a 18,420
(1.89 %)
21,275
(1.72 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
75
(0.00 %)
49
(100.00 %)
4,895,568
(45.28 %)
904,082
(3.80 %)
10,530,742
(37.05 %)
77,606
(3.68 %)
99 big brown bat (TK198812 2023)
GCF_027574615.1
46,266
(2.61 %)
18,620
(1.80 %)
21,271
(1.72 %)
n/a 43.51
(100.00 %)
75
(0.00 %)
48
(100.00 %)
3,041,145
(25.08 %)
904,075
(3.80 %)
10,530,666
(37.05 %)
77,605
(3.68 %)
100 bighorn sheep (Bighorn MfBH-ARS-UI-01 2024)
GCA_042477335.2
n/a 19,021
(1.39 %)
21,154
(1.33 %)
n/a 43.91
(100.00 %)
3
(0.00 %)
41
(100.00 %)
5,490,141
(54.04 %)
826,352
(11.67 %)
12,918,667
(46.86 %)
52,254
(10.67 %)
101 bighorn sheep (BS48 2019)
GCA_004026945.1
n/a 23,059
(1.34 %)
36,486
(1.19 %)
n/a 43.20
(99.90 %)
9,412
(0.03 %)
1,057,548
(99.97 %)
6,321,577
(50.75 %)
716,846
(1.66 %)
13,904,326
(44.98 %)
95,564
(1.72 %)
102 bighorn sheep (v2 Bighorn MfBH-ARS-UI-01 2024)
GCF_042477335.2
78,636
(2.63 %)
19,459
(1.36 %)
21,150
(1.33 %)
n/a 43.91
(100.00 %)
3
(0.00 %)
42
(100.00 %)
3,963,383
(22.89 %)
826,353
(11.67 %)
12,918,743
(46.86 %)
52,254
(10.67 %)
103 bilby (mMagLag1 2024)
GCA_037893015.1
n/a 18,686
(0.72 %)
17,238
(0.81 %)
n/a 37.35
(99.66 %)
4,431
(0.34 %)
609
(100.00 %)
6,263,094
(27.34 %)
2,223,995
(5.89 %)
23,994,844
(43.69 %)
51,039
(3.47 %)
104 bilby (mMagLag1 2024)
GCF_037893015.1
60,460
(3.10 %)
18,687
(0.72 %)
17,229
(0.81 %)
n/a 37.35
(99.66 %)
4,431
(0.34 %)
608
(100.00 %)
6,299,949
(27.49 %)
2,223,987
(5.89 %)
23,992,536
(43.69 %)
51,039
(3.47 %)
105 black and rufous elephant shrew (mRhyPet1hap1 2024)
GCA_043290085.1
n/a 20,713
(0.64 %)
21,469
(0.64 %)
n/a 41.74
(100.00 %)
770
(0.00 %)
470
(100.00 %)
3,860,121
(14.52 %)
1,230,113
(2.81 %)
21,600,460
(65.53 %)
49,878
(0.73 %)
106 black and rufous elephant shrew (mRhyPet1hap2 2024)
GCA_043290065.1
n/a 19,814
(0.63 %)
20,140
(0.63 %)
n/a 41.82
(100.00 %)
723
(0.00 %)
315
(100.00 %)
3,657,357
(14.24 %)
1,158,716
(2.84 %)
22,924,986
(64.53 %)
46,774
(0.90 %)
107 black flying fox
GCF_000325575.1
46,991
(3.15 %)
18,089
(2.00 %)
20,668
(1.75 %)
n/a 39.74
(97.93 %)
104,566
(2.08 %)
170,164
(97.92 %)
2,975,186
(34.05 %)
481,859
(1.45 %)
12,582,349
(26.52 %)
62,483
(3.88 %)
108 black rat
GCF_011064425.1
39,601
(2.37 %)
20,793
(1.98 %)
17,944
(1.37 %)
n/a 42.14
(99.98 %)
6,158
(0.02 %)
2,173
(100.00 %)
4,715,157
(41.57 %)
1,432,294
(3.45 %)
13,275,550
(32.36 %)
18,055
(0.48 %)
109 black rhinoceros (alternate hap 2021)
GCA_020826835.1
n/a 19,000
(1.37 %)
22,547
(1.26 %)
n/a 41.56
(99.97 %)
178
(0.03 %)
1,199
(100.00 %)
4,340,245
(37.22 %)
564,468
(8.07 %)
14,384,523
(40.40 %)
44,971
(1.16 %)
110 black rhinoceros (BS38 2019 Broad)
GCA_004027315.1
n/a 21,713
(1.32 %)
32,731
(1.18 %)
n/a 41.22
(99.85 %)
7,256
(0.02 %)
2,029,914
(99.98 %)
4,618,655
(36.76 %)
618,834
(2.21 %)
16,248,532
(40.32 %)
44,113
(0.97 %)
111 black rhinoceros (primary hap 2021 refseq)
GCF_020826845.1
56,268
(2.28 %)
18,774
(1.38 %)
22,348
(1.26 %)
n/a 41.59
(99.95 %)
215
(0.05 %)
1,076
(100.00 %)
4,200,390
(36.22 %)
548,030
(8.34 %)
14,347,693
(40.14 %)
43,525
(1.14 %)
112 black-footed cat
GCA_004023925.1
n/a 22,895
(1.14 %)
51,789
(1.13 %)
n/a 41.92
(99.90 %)
13,476
(0.06 %)
603,600
(99.94 %)
5,261,265
(44.11 %)
943,514
(1.77 %)
13,681,435
(34.77 %)
86,892
(2.23 %)
113 black-footed ferret (SB6536 2022)
GCF_022355385.1
56,415
(2.78 %)
18,681
(1.55 %)
20,685
(1.40 %)
n/a 41.55
(96.71 %)
33,042
(3.30 %)
20,575
(100.00 %)
4,087,717
(30.94 %)
695,805
(1.18 %)
13,880,116
(32.08 %)
54,060
(2.11 %)
114 black-lipped pika
GCF_017591425.1
46,297
(2.64 %)
18,529
(1.63 %)
23,458
(1.83 %)
n/a 43.71
(100.00 %)
54
(0.00 %)
2,214
(100.00 %)
1,843,705
(12.62 %)
471,798
(2.76 %)
11,394,992
(31.27 %)
63,124
(1.85 %)
115 Blainville's beaked whale (alternate hap 2022)
GCA_025094165.1
n/a 17,838
(1.54 %)
21,389
(1.35 %)
n/a 41.71
(100.00 %)
1
(0.00 %)
5,198
(100.00 %)
3,542,727
(35.35 %)
650,369
(8.86 %)
10,971,320
(41.15 %)
62,389
(1.68 %)
116 Blainville's beaked whale (primary hap 2022 refseq)
GCF_025265405.1
47,553
(2.07 %)
19,041
(1.52 %)
20,766
(1.27 %)
n/a 41.70
(99.97 %)
97
(0.03 %)
74
(100.00 %)
3,964,038
(35.29 %)
765,957
(8.74 %)
12,128,229
(41.78 %)
70,851
(1.80 %)
117 blue whale (alternate hap JJ_BM4_2016_0621 2019)
GCA_008658375.1
n/a 17,285
(1.80 %)
21,295
(1.43 %)
n/a 41.22
(100.00 %)
n/a 12,574
(100.00 %)
3,196,354
(43.47 %)
467,194
(1.26 %)
10,176,588
(33.66 %)
56,916
(1.85 %)
118 blue whale (JJ_BM4_2016_0621 primary hap 2020)
GCA_009873245.3
n/a 19,151
(1.81 %)
20,574
(1.41 %)
n/a 40.88
(98.91 %)
886
(1.09 %)
106
(100.00 %)
3,986,871
(44.21 %)
579,629
(1.22 %)
12,858,081
(34.60 %)
67,032
(1.73 %)
119 Blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v2 alternate hap 2020)
GCA_008658375.2
n/a 16,997
(1.82 %)
20,609
(1.44 %)
n/a 41.20
(100.00 %)
3
(0.00 %)
10,999
(100.00 %)
3,126,800
(43.49 %)
454,452
(1.23 %)
9,916,868
(33.63 %)
55,436
(1.85 %)
120 blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v3 primary hap 2020)
GCF_009873245.2
58,737
(2.71 %)
19,162
(1.80 %)
20,576
(1.41 %)
36,291
(1.99 %)
40.88
(98.91 %)
886
(1.09 %)
106
(100.00 %)
3,986,870
(44.21 %)
579,629
(1.22 %)
12,858,384
(34.60 %)
67,032
(1.73 %)
121 bobcat (Redwood Valley CCGP_SWC_20201006 alternate hap 2022)
GCA_022079275.1
n/a 24,877
(1.23 %)
48,382
(1.39 %)
n/a 42.05
(99.98 %)
4,716
(0.01 %)
72,827
(99.99 %)
6,403,412
(33.31 %)
1,269,531
(1.94 %)
17,771,689
(33.82 %)
100,915
(3.00 %)
122 bobcat (Redwood Valley CCGP_SWC_20201006 primary hap 2022)
GCF_022079265.1
45,417
(2.39 %)
18,576
(1.65 %)
20,510
(1.41 %)
n/a 41.80
(100.00 %)
24
(0.00 %)
75
(100.00 %)
4,970,082
(43.28 %)
894,002
(1.80 %)
13,648,384
(34.21 %)
69,211
(2.68 %)
123 boreal woodland reindeer (boreal CA-31 2023)
GCA_019903745.2
n/a 20,135
(1.60 %)
22,598
(1.47 %)
n/a 41.46
(96.98 %)
34,682
(3.03 %)
12,266
(100.00 %)
3,134,107
(24.41 %)
394,920
(0.92 %)
13,154,929
(36.43 %)
48,826
(1.07 %)
124 Botta's pocket gopher (bottae MVZ:Mamm:240275 alternate hap 2022)
GCA_024803775.1
n/a 18,647
(0.96 %)
23,998
(1.13 %)
n/a 41.67
(100.00 %)
124
(0.00 %)
3,340
(100.00 %)
3,775,862
(22.40 %)
1,257,803
(21.71 %)
9,347,543
(61.85 %)
33,757
(1.35 %)
125 Botta's pocket gopher (bottae MVZ:Mamm:240275 primary hap 2022)
GCA_024803745.1
n/a 17,791
(1.12 %)
22,667
(1.29 %)
n/a 41.66
(100.00 %)
106
(0.00 %)
2,898
(100.00 %)
6,293,452
(41.30 %)
1,076,688
(17.94 %)
8,553,272
(57.13 %)
31,102
(1.31 %)
126 Botta's pocket gopher (hap1 2023)
GCA_031878675.1
n/a 18,247
(1.61 %)
22,673
(1.83 %)
n/a 41.12
(99.99 %)
775
(0.01 %)
835
(100.00 %)
2,918,285
(18.64 %)
868,090
(5.77 %)
9,427,604
(40.78 %)
27,049
(1.25 %)
127 Botta's pocket gopher (hap2 2023)
GCA_031878665.1
n/a 17,612
(1.68 %)
22,099
(1.91 %)
n/a 41.23
(99.99 %)
541
(0.01 %)
365
(100.00 %)
2,748,918
(17.16 %)
827,542
(4.51 %)
8,832,809
(39.20 %)
26,416
(1.35 %)
128 boutu (hap1 2024)
GCA_036417435.1
n/a 18,667
(1.46 %)
20,817
(1.26 %)
n/a 42.07
(100.00 %)
284
(0.00 %)
903
(100.00 %)
4,004,895
(35.23 %)
925,158
(12.15 %)
11,999,784
(42.65 %)
63,428
(1.55 %)
129 boutu (hap2 2024)
GCA_036417475.1
n/a 17,954
(1.51 %)
19,994
(1.30 %)
n/a 42.02
(100.00 %)
240
(0.00 %)
800
(100.00 %)
3,723,164
(34.96 %)
809,880
(11.02 %)
11,359,211
(41.42 %)
60,067
(1.55 %)
130 Brahman cow (Angus x Brahman F1 Brahman haplotype 2018)
GCF_003369695.1
63,234
(2.88 %)
19,601
(1.57 %)
21,699
(1.34 %)
n/a 41.83
(99.94 %)
302
(0.06 %)
1,250
(100.00 %)
5,524,454
(47.57 %)
459,928
(1.40 %)
13,208,799
(41.21 %)
41,359
(1.10 %)
131 Brandt's bat
GCF_000412655.1
46,912
(2.84 %)
19,267
(1.75 %)
18,495
(1.62 %)
n/a 42.59
(94.06 %)
155,664
(5.95 %)
325,414
(94.05 %)
2,897,662
(25.08 %)
634,208
(3.20 %)
11,323,618
(31.06 %)
66,749
(1.59 %)
132 Brazilian free-tailed bat (alternate hap 2023)
GCA_030848815.1
n/a 18,921
(1.72 %)
22,946
(1.65 %)
n/a 42.50
(100.00 %)
n/a 3,728
(100.00 %)
4,021,020
(40.28 %)
637,136
(3.60 %)
11,382,826
(36.28 %)
70,547
(2.64 %)
133 Brazilian free-tailed bat (primary hap 2023)
GCA_030848825.1
n/a 19,039
(1.66 %)
21,660
(1.59 %)
n/a 42.29
(100.00 %)
20
(0.00 %)
148
(100.00 %)
3,805,818
(31.80 %)
640,446
(2.50 %)
11,793,353
(36.15 %)
68,896
(2.40 %)
134 Brazilian guinea pig
GCA_000688575.1
n/a 16,531
(1.49 %)
11,177
(1.44 %)
n/a 39.81
(64.76 %)
2,565,595
(35.61 %)
3,131
(100.00 %)
2,529,479
(25.87 %)
342,907
(0.66 %)
10,719,517
(21.05 %)
19,508
(0.31 %)
135 Brazilian tapir
GCA_004025025.1
n/a 21,581
(1.61 %)
30,818
(1.32 %)
n/a 41.12
(99.93 %)
2,273
(0.01 %)
805,779
(99.99 %)
3,877,938
(38.36 %)
344,032
(0.79 %)
15,601,710
(32.81 %)
43,382
(1.17 %)
136 brown bear (GAN/ISIS:MIG12 v2 2018)
GCF_003584765.2
50,229
(2.92 %)
18,811
(1.77 %)
21,073
(1.52 %)
n/a 41.84
(99.31 %)
17,380
(0.70 %)
21,813
(99.30 %)
4,201,043
(40.86 %)
567,586
(1.23 %)
13,807,211
(30.86 %)
62,125
(1.80 %)
137 brown bear (v2.0 North America Adak 2023)
GCF_023065955.2
66,371
(4.20 %)
18,615
(1.68 %)
21,434
(1.53 %)
n/a 42.29
(100.00 %)
250
(0.00 %)
362
(100.00 %)
4,030,019
(33.22 %)
630,008
(4.17 %)
13,240,060
(32.92 %)
64,814
(2.05 %)
138 brown big-eared bat (alternate hap 2023)
GCA_963455325.1
n/a 18,932
(1.77 %)
23,324
(1.64 %)
n/a 43.04
(100.00 %)
n/a 5,570
(100.00 %)
4,970,484
(48.00 %)
928,854
(4.06 %)
10,332,383
(39.35 %)
59,133
(2.45 %)
139 brown big-eared bat (primary hap 2023)
GCA_963455305.1
n/a 19,138
(1.72 %)
20,370
(1.54 %)
n/a 43.08
(99.99 %)
1,237
(0.01 %)
65
(100.00 %)
3,201,470
(26.24 %)
957,903
(4.27 %)
10,687,995
(39.65 %)
60,671
(2.39 %)
140 brown-throated sloth
GCA_004027775.1
n/a 17,043
(1.21 %)
37,090
(1.36 %)
n/a 42.76
(99.76 %)
462
(0.00 %)
1,772,267
(100.00 %)
2,487,215
(36.18 %)
316,812
(1.60 %)
7,948,666
(37.96 %)
62,325
(2.36 %)
141 bush duiker (CMD-5126 2019)
GCA_006408735.1
n/a 21,234
(1.49 %)
24,405
(1.37 %)
n/a 42.55
(81.82 %)
787,889
(18.24 %)
810,213
(81.76 %)
5,743,783
(45.60 %)
588,471
(5.37 %)
13,114,146
(31.74 %)
52,826
(1.05 %)
142 cactus mouse (2023)
GCF_949786415.1
47,537
(2.02 %)
18,894
(1.46 %)
20,159
(1.22 %)
n/a 42.40
(99.98 %)
2,603
(0.02 %)
4,297
(100.00 %)
7,181,232
(52.75 %)
1,247,378
(18.35 %)
13,329,318
(43.03 %)
19,540
(0.49 %)
143 California mouse (IS 2022)
GCF_007827085.1
62,273
(3.80 %)
18,959
(1.75 %)
19,378
(1.41 %)
n/a 42.21
(100.00 %)
547
(0.00 %)
237
(100.00 %)
5,970,582
(45.08 %)
1,165,743
(3.67 %)
13,734,349
(33.67 %)
19,529
(0.58 %)
144 California sea lion (alternate hap 2019)
GCA_009762295.1
n/a 18,348
(1.81 %)
18,692
(1.47 %)
n/a 41.58
(100.00 %)
n/a 3,093
(100.00 %)
3,722,619
(42.89 %)
488,086
(1.26 %)
10,893,132
(33.14 %)
44,449
(1.57 %)
145 California sea lion (LMU 2018 refseq)
GCF_900631625.1
69,240
(2.99 %)
20,741
(1.78 %)
20,298
(1.40 %)
n/a 41.38
(99.81 %)
47,716
(0.20 %)
10,423
(100.00 %)
4,530,259
(43.28 %)
573,086
(1.12 %)
13,442,336
(33.58 %)
50,583
(1.46 %)
146 California sea lion (mZalCal1 alternate hap 2020)
GCA_009762295.2
n/a 18,319
(1.81 %)
18,772
(1.48 %)
n/a 41.58
(100.00 %)
n/a 3,096
(100.00 %)
3,724,021
(42.91 %)
488,356
(1.26 %)
10,891,276
(33.15 %)
44,467
(1.57 %)
147 California sea lion (primary hap 2020)
GCA_009762305.2
n/a 20,939
(1.78 %)
20,184
(1.40 %)
n/a 41.40
(99.23 %)
185
(0.77 %)
47
(100.00 %)
4,530,531
(43.69 %)
590,246
(1.24 %)
13,263,573
(33.76 %)
51,899
(1.50 %)
148 California sea lion (v2 primary hap 2020)
GCF_009762305.2
70,801
(3.05 %)
20,915
(1.77 %)
20,179
(1.40 %)
44,926
(2.10 %)
41.40
(99.23 %)
185
(0.77 %)
47
(100.00 %)
4,525,652
(43.65 %)
590,246
(1.24 %)
13,263,648
(33.76 %)
51,899
(1.50 %)
149 California vole (kernensis MVZ Mamm 240107 alternate hap 2023)
GCA_028537755.1
n/a 19,409
(1.86 %)
20,578
(1.69 %)
n/a 42.43
(100.00 %)
43
(0.00 %)
310
(100.00 %)
3,161,054
(22.60 %)
891,453
(5.62 %)
11,087,206
(33.12 %)
19,104
(0.65 %)
150 California vole (kernensis MVZ Mamm 240107 primary hap 2023)
GCA_028537955.1
n/a 19,681
(1.86 %)
21,257
(1.62 %)
n/a 42.24
(100.00 %)
51
(0.00 %)
350
(100.00 %)
4,957,057
(42.33 %)
943,226
(5.63 %)
11,695,871
(33.83 %)
20,062
(0.64 %)
151 Canada lynx (alternate hap LIC74 2019)
GCA_007474575.1
n/a 12,029
(1.42 %)
15,171
(1.16 %)
n/a 41.46
(100.00 %)
3
(0.00 %)
15,036
(100.00 %)
2,937,491
(43.50 %)
544,410
(1.76 %)
7,641,565
(32.72 %)
39,082
(2.44 %)
152 Canada lynx (LIC74 primary hap 2020)
GCA_007474595.2
n/a 18,286
(1.66 %)
19,266
(1.35 %)
n/a 41.70
(99.88 %)
842
(0.12 %)
55
(100.00 %)
5,014,416
(43.75 %)
904,528
(1.75 %)
13,467,329
(34.19 %)
66,805
(2.53 %)
153 Canada lynx (LIC74 v2 alternate hap 2020)
GCA_007474575.2
n/a 12,041
(1.42 %)
15,226
(1.16 %)
n/a 41.46
(100.00 %)
5
(0.00 %)
15,046
(100.00 %)
2,939,291
(43.50 %)
544,849
(1.76 %)
7,650,345
(32.74 %)
39,099
(2.44 %)
154 Canada lynx (LIC74 v2 primary hap 2020)
GCF_007474595.2
50,142
(2.69 %)
18,273
(1.65 %)
19,264
(1.35 %)
n/a 41.70
(99.88 %)
842
(0.12 %)
54
(100.00 %)
5,011,165
(43.72 %)
904,525
(1.75 %)
13,467,551
(34.19 %)
66,799
(2.48 %)
155 Cantor's roundleaf bat
GCA_004027415.1
n/a 23,788
(1.42 %)
45,328
(1.68 %)
38,254
(1.57 %)
41.36
(99.91 %)
6,366
(0.03 %)
846,566
(99.97 %)
3,997,370
(31.48 %)
775,742
(1.42 %)
12,770,948
(33.45 %)
41,527
(1.41 %)
156 Cape elephant shrew
GCF_000299155.1
25,406
(1.08 %)
23,258
(1.07 %)
24,266
(1.16 %)
n/a 40.30
(86.29 %)
279,394
(13.74 %)
288,162
(86.26 %)
3,765,232
(16.90 %)
604,351
(0.89 %)
20,072,078
(42.36 %)
25,977
(0.42 %)
157 Cape golden mole (2012 Broad)
GCF_000296735.1
25,323
(1.07 %)
20,961
(1.07 %)
21,723
(1.04 %)
n/a 40.01
(79.93 %)
370,844
(20.11 %)
391,344
(79.89 %)
4,924,640
(21.03 %)
500,830
(1.95 %)
18,946,663
(41.18 %)
21,186
(0.33 %)
158 Cape rock hyrax (Dallas Zoo Isis #01D731 2014)
GCA_000152225.2
n/a 18,455
(1.10 %)
22,103
(1.12 %)
n/a 41.00
(88.89 %)
259,879
(11.14 %)
325,568
(88.86 %)
6,210,235
(51.92 %)
381,915
(1.06 %)
20,080,212
(36.28 %)
29,690
(0.50 %)
159 Cape rock hyrax (US060 2019 Broad)
GCA_004026925.1
n/a 21,401
(0.85 %)
45,353
(1.14 %)
n/a 41.08
(99.93 %)
4,203
(0.01 %)
1,048,940
(99.99 %)
7,222,494
(54.48 %)
430,286
(0.85 %)
21,775,991
(44.61 %)
37,158
(0.70 %)
160 capybara
GCA_004027455.1
n/a 20,152
(1.22 %)
28,931
(1.29 %)
n/a 39.76
(99.93 %)
5,747
(0.02 %)
661,089
(99.98 %)
4,220,878
(29.16 %)
777,357
(2.04 %)
15,214,944
(35.16 %)
34,558
(0.85 %)
161 carabao (swamp buffalo K-KA32 2023)
GCF_029407905.1
77,279
(2.89 %)
19,433
(1.40 %)
21,166
(1.23 %)
n/a 42.77
(100.00 %)
21
(0.00 %)
115
(100.00 %)
3,479,445
(21.92 %)
547,054
(6.39 %)
12,840,677
(45.22 %)
99,752
(3.73 %)
162 cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v2.0 2023 USDA)
GCF_002263795.3
77,808
(4.11 %)
19,428
(1.48 %)
22,236
(1.33 %)
n/a 42.01
(100.00 %)
386
(0.00 %)
1,958
(100.00 %)
3,449,588
(22.63 %)
596,092
(3.13 %)
12,785,607
(42.11 %)
46,864
(1.37 %)
163 cattle (Hereford UMD_3.1.1 2014)
GCF_000003055.6
57,977
(2.74 %)
19,583
(1.56 %)
20,581
(1.31 %)
n/a 41.82
(99.23 %)
74,464
(0.78 %)
75,598
(99.22 %)
5,607,556
(49.02 %)
440,521
(1.25 %)
13,167,657
(40.78 %)
42,869
(1.24 %)
164 Chacoan peccary (BS20 v2 2019 Broad)
GCA_004024745.2
n/a 18,603
(1.52 %)
22,330
(1.36 %)
n/a 42.35
(98.12 %)
57,013
(1.80 %)
1,240,743
(98.20 %)
5,255,211
(43.27 %)
2,502,373
(4.37 %)
12,968,788
(40.96 %)
172,178
(3.66 %)
165 cheetah (Ajub_Pintada_27869175 2022)
GCF_027475565.1
80,997
(4.53 %)
18,420
(1.70 %)
19,561
(1.40 %)
n/a 41.59
(100.00 %)
22
(0.00 %)
195
(100.00 %)
4,611,842
(35.10 %)
837,685
(1.68 %)
13,649,125
(33.06 %)
60,367
(2.22 %)
166 cheetah (Rico 2018)
GCF_003709585.1
72,154
(3.33 %)
18,472
(1.70 %)
20,443
(1.42 %)
n/a 41.55
(99.55 %)
24,173
(0.45 %)
3,220
(100.00 %)
4,853,945
(42.85 %)
831,106
(1.53 %)
13,663,571
(32.84 %)
60,744
(2.17 %)
167 Chinese forest musk deer (Sichuan 2022)
GCF_022376915.1
51,625
(2.80 %)
19,565
(1.43 %)
22,280
(1.29 %)
n/a 42.30
(99.97 %)
1,781
(0.03 %)
2,446
(100.00 %)
3,257,347
(21.65 %)
399,120
(3.81 %)
12,906,274
(43.79 %)
46,689
(1.12 %)
168 Chinese hamster (17A/GY CHO 2020)
GCF_003668045.3
55,440
(2.79 %)
20,030
(1.84 %)
18,721
(1.41 %)
67,900
(3.41 %)
41.51
(99.90 %)
4,164
(0.10 %)
647
(100.00 %)
8,121,057
(33.74 %)
1,095,058
(2.91 %)
12,923,274
(32.25 %)
19,341
(0.58 %)
169 Chinese hamster (CHO v1 2011 BGI)
GCF_000223135.1
46,006
(2.59 %)
20,602
(1.78 %)
17,467
(1.35 %)
n/a 41.37
(96.61 %)
156,635
(3.40 %)
265,787
(96.60 %)
4,541,936
(33.03 %)
1,072,129
(2.66 %)
13,150,189
(30.04 %)
12,522
(0.25 %)
170 Chinese hamster (CHO v2 2017 Eagle Genomics Ltd)
GCA_900186095.1
n/a 19,874
(1.85 %)
19,298
(1.44 %)
n/a 41.45
(98.56 %)
63,334
(1.45 %)
71,598
(98.55 %)
4,521,726
(33.66 %)
1,060,619
(2.55 %)
12,867,288
(31.26 %)
17,960
(0.54 %)
171 Chinese hamster (CHO-K1 CHOZN v2.4 2022)
GCA_026545065.1
n/a 20,293
(1.81 %)
18,881
(1.42 %)
n/a 41.62
(71.16 %)
924,541
(28.93 %)
1,236,122
(71.07 %)
4,330,728
(30.92 %)
987,319
(3.70 %)
13,374,062
(21.92 %)
18,838
(0.40 %)
172 Chinese pangolin (2020 Yunnan U)
GCF_014570555.1
69,694
(3.21 %)
18,206
(1.70 %)
20,508
(1.48 %)
n/a 40.79
(95.54 %)
34,903
(4.47 %)
4,694
(100.00 %)
2,927,176
(35.60 %)
269,964
(0.67 %)
12,610,535
(29.10 %)
35,278
(1.05 %)
173 Chinese pangolin (hap1 2023)
GCA_030020395.1
n/a 18,675
(1.41 %)
21,838
(1.29 %)
n/a 41.07
(99.77 %)
383
(0.23 %)
662
(100.00 %)
3,516,380
(43.45 %)
618,194
(3.68 %)
12,009,657
(39.02 %)
47,708
(1.22 %)
174 Chinese pangolin (hap1 2023)
GCF_030020395.1
71,445
(2.98 %)
18,379
(1.34 %)
21,837
(1.29 %)
n/a 41.07
(99.77 %)
383
(0.23 %)
661
(100.00 %)
3,318,871
(34.65 %)
618,193
(3.68 %)
12,009,669
(39.02 %)
47,708
(1.22 %)
175 Chinese pangolin (hap2 mManPen7 2023)
GCA_030020945.1
n/a 18,538
(1.34 %)
21,724
(1.27 %)
n/a 41.09
(99.48 %)
190
(0.52 %)
700
(100.00 %)
3,362,899
(34.48 %)
678,384
(4.11 %)
12,024,241
(39.52 %)
48,960
(1.19 %)
176 Chinese pangolin (MPE899 2014 WashU)
GCA_000738955.1
n/a 18,749
(1.63 %)
22,506
(1.40 %)
n/a 40.93
(90.69 %)
257,424
(9.33 %)
230,927
(90.67 %)
2,691,116
(34.48 %)
316,518
(1.96 %)
11,538,086
(25.40 %)
30,693
(0.58 %)
177 Chinese rufous horseshoe bat
GCA_001888835.1
n/a 26,871
(2.34 %)
25,467
(1.89 %)
n/a 40.52
(97.22 %)
212,601
(2.80 %)
63,439
(100.00 %)
3,219,611
(33.86 %)
495,126
(1.20 %)
12,476,551
(27.16 %)
32,993
(0.98 %)
178 Chinese rufous horseshoe bat (RSC01 2024)
GCA_036562045.1
n/a 17,893
(1.95 %)
19,249
(1.60 %)
n/a 40.47
(100.00 %)
286
(0.00 %)
454
(100.00 %)
3,055,304
(33.11 %)
531,106
(1.34 %)
11,858,144
(29.52 %)
30,884
(1.08 %)
179 Chinese rufous horseshoe bat (RSC01 2024)
GCF_036562045.2
67,162
(3.87 %)
17,890
(1.94 %)
19,248
(1.60 %)
n/a 40.47
(100.00 %)
286
(0.00 %)
454
(100.00 %)
3,325,750
(39.02 %)
531,106
(1.34 %)
11,858,028
(29.52 %)
30,884
(1.08 %)
180 Chinese tree shrew (2013 BGI)
GCF_000334495.1
47,005
(2.07 %)
21,375
(1.39 %)
19,231
(1.28 %)
n/a 41.73
(95.10 %)
191,695
(4.92 %)
242,445
(95.08 %)
5,060,321
(23.05 %)
1,046,388
(4.15 %)
14,978,259
(38.04 %)
88,806
(1.44 %)
181 Chinese tree shrew (KIZ-2021 2023)
GCA_033439345.1
n/a 22,218
(1.55 %)
22,364
(1.36 %)
n/a 41.78
(99.99 %)
1,697
(0.01 %)
1,645
(100.00 %)
6,126,341
(42.08 %)
1,035,957
(2.47 %)
14,328,193
(41.14 %)
90,914
(1.82 %)
182 Chiriquinan serotine (hap1 2025)
GCA_054100705.1
n/a 17,992
(1.72 %)
21,541
(1.60 %)
n/a 43.57
(100.00 %)
319
(0.00 %)
133
(100.00 %)
5,339,985
(49.93 %)
956,399
(6.53 %)
10,659,420
(39.61 %)
80,046
(3.68 %)
183 chiru
GCA_000400835.1
n/a 20,320
(1.60 %)
42,654
(2.51 %)
n/a 42.01
(93.04 %)
283,069
(7.00 %)
298,127
(93.00 %)
5,342,241
(43.54 %)
425,329
(1.25 %)
13,714,420
(34.66 %)
43,135
(1.89 %)
184 clouded leopard (mNeoNeb1 alternate hap 2023)
GCA_028018655.1
n/a 16,430
(1.52 %)
21,057
(1.44 %)
n/a 41.79
(100.00 %)
n/a 10,377
(100.00 %)
3,845,437
(33.39 %)
794,587
(2.14 %)
10,765,695
(33.40 %)
56,375
(2.45 %)
185 clouded leopard (mNeoNeb1 primary hap 2023 refseq)
GCF_028018385.1
81,219
(3.62 %)
18,300
(1.65 %)
20,361
(1.39 %)
n/a 41.79
(99.94 %)
181
(0.06 %)
33
(100.00 %)
4,224,269
(34.84 %)
992,668
(2.08 %)
13,618,866
(34.42 %)
67,830
(2.45 %)
186 common bottlenose dolphin (maternal 2020)
GCA_011762535.1
n/a 18,837
(1.77 %)
20,857
(1.43 %)
n/a 41.43
(99.73 %)
649
(0.27 %)
985
(100.00 %)
4,073,893
(46.15 %)
630,039
(2.15 %)
12,628,219
(35.41 %)
65,379
(1.89 %)
187 common bottlenose dolphin (maternal hap 2024)
GCA_011762595.2
n/a 18,777
(1.77 %)
20,526
(1.42 %)
n/a 41.44
(99.74 %)
674
(0.26 %)
362
(100.00 %)
4,064,487
(44.85 %)
628,982
(2.12 %)
12,490,633
(35.29 %)
65,551
(1.90 %)
188 common bottlenose dolphin (maternal Y refseq 2020)
GCF_011762595.1
67,220
(3.31 %)
18,766
(1.77 %)
20,528
(1.42 %)
35,852
(1.58 %)
41.44
(99.74 %)
674
(0.26 %)
362
(100.00 %)
4,069,115
(46.17 %)
628,982
(2.12 %)
12,490,891
(35.29 %)
65,551
(1.90 %)
189 common bottlenose dolphin (MMES2002162SC 2016 refseq)
GCF_001922835.1
45,975
(2.99 %)
17,255
(1.69 %)
17,058
(1.34 %)
n/a 40.85
(99.45 %)
114,003
(0.57 %)
2,648
(100.00 %)
3,845,938
(43.89 %)
514,631
(1.06 %)
12,317,098
(32.18 %)
48,030
(1.35 %)
190 common bottlenose dolphin (mTurTru1 2024)
GCF_011762595.2
80,385
(4.33 %)
18,770
(1.77 %)
20,525
(1.42 %)
n/a 41.44
(99.74 %)
674
(0.26 %)
361
(100.00 %)
3,981,744
(44.78 %)
628,982
(2.12 %)
12,490,558
(35.29 %)
65,551
(1.90 %)
191 common bottlenose dolphin (paternal 2020)
GCA_011762515.1
n/a 18,537
(1.77 %)
20,619
(1.44 %)
n/a 41.42
(98.08 %)
868
(1.92 %)
1,166
(100.00 %)
3,997,801
(45.93 %)
609,838
(1.85 %)
12,400,272
(34.53 %)
64,630
(1.84 %)
192 common brushtail (alternate hap 2020)
GCA_011100645.1
n/a 14,863
(0.75 %)
15,426
(0.89 %)
n/a 39.41
(100.00 %)
313
(0.00 %)
12,446
(100.00 %)
5,846,769
(38.56 %)
987,917
(1.99 %)
16,764,356
(40.14 %)
13,303
(0.35 %)
193 common brushtail (refseq 2020)
GCF_011100635.1
37,661
(1.80 %)
18,653
(0.80 %)
15,375
(0.86 %)
n/a 39.48
(99.44 %)
1,796
(0.56 %)
212
(100.00 %)
7,598,116
(38.90 %)
1,259,434
(1.97 %)
22,071,306
(40.56 %)
17,762
(0.38 %)
194 common pipistrelle (2020)
GCA_903992545.1
n/a 17,216
(1.82 %)
19,202
(1.79 %)
n/a 42.55
(99.97 %)
1,546
(0.03 %)
323
(100.00 %)
2,953,532
(23.94 %)
805,142
(2.83 %)
9,964,846
(34.69 %)
57,295
(2.83 %)
195 common pipistrelle (alternate hap 2020)
GCA_903992515.1
n/a 15,974
(1.72 %)
20,563
(1.66 %)
n/a 42.41
(100.00 %)
12
(0.00 %)
10,459
(100.00 %)
2,634,333
(23.76 %)
703,674
(2.65 %)
8,909,525
(33.95 %)
50,430
(2.54 %)
196 common pipistrelle (Broad 2019)
GCA_004026625.1
n/a 21,938
(1.35 %)
53,915
(1.60 %)
n/a 42.88
(99.88 %)
10,870
(0.05 %)
736,974
(99.95 %)
3,499,501
(22.91 %)
1,046,301
(2.96 %)
11,759,516
(37.96 %)
92,062
(3.23 %)
197 common pipistrelle (hap1.1 2025)
GCA_965203405.1
n/a 18,233
(1.77 %)
21,445
(1.80 %)
n/a 42.93
(99.98 %)
1,650
(0.02 %)
575
(100.00 %)
3,324,262
(26.83 %)
869,167
(7.44 %)
10,218,519
(37.91 %)
76,006
(3.29 %)
198 common pipistrelle (hap1.2 2025)
GCA_965203405.2
n/a 18,176
(1.76 %)
21,285
(1.78 %)
n/a 42.95
(100.00 %)
370
(0.00 %)
254
(100.00 %)
3,357,975
(26.71 %)
873,676
(8.26 %)
10,088,614
(38.25 %)
78,890
(3.25 %)
199 common pipistrelle (hap2.1 2025)
GCA_965204225.1
n/a 18,115
(1.81 %)
21,233
(1.83 %)
n/a 42.89
(99.98 %)
1,602
(0.02 %)
1,971
(99.98 %)
3,303,323
(27.28 %)
852,756
(5.65 %)
10,047,424
(36.41 %)
69,105
(3.25 %)
200 common pipistrelle (hap2.2 2025)
GCA_965204225.2
n/a 18,092
(1.83 %)
21,286
(1.85 %)
n/a 42.90
(100.00 %)
358
(0.00 %)
656
(100.00 %)
3,325,603
(27.55 %)
851,200
(4.82 %)
10,152,156
(36.08 %)
66,359
(3.22 %)
201 common thicket rat (MVZ Mamm 221001 2021)
GCA_019843835.1
n/a 25,148
(1.36 %)
49,594
(1.08 %)
n/a 41.11
(99.52 %)
63,300
(0.44 %)
572,372
(99.56 %)
3,806,717
(32.04 %)
1,181,694
(2.86 %)
12,272,340
(28.58 %)
16,373
(0.48 %)
202 common vampire bat (v2 HL8 alternate hap 2022 genbank)
GCA_022682395.2
n/a 17,485
(1.76 %)
18,907
(1.66 %)
n/a 42.87
(99.99 %)
576
(0.01 %)
429
(100.00 %)
2,592,246
(28.20 %)
352,985
(2.87 %)
10,737,944
(31.11 %)
61,125
(2.28 %)
203 common vampire bat (v2 HL8 primary hap 2022 refseq)
GCF_022682495.2
58,786
(3.38 %)
18,507
(1.82 %)
19,451
(1.59 %)
n/a 42.99
(99.99 %)
615
(0.01 %)
574
(100.00 %)
2,960,602
(36.90 %)
431,577
(3.90 %)
11,286,753
(32.62 %)
71,507
(2.50 %)
204 common vampire bat (v3 DRU21DN04 2018)
GCF_002940915.2
51,044
(3.24 %)
18,503
(1.88 %)
18,071
(1.68 %)
n/a 42.15
(97.78 %)
54,246
(2.23 %)
83,364
(97.77 %)
2,799,509
(29.62 %)
275,242
(1.03 %)
11,796,826
(28.19 %)
51,634
(1.37 %)
205 common warthog (WHEZ1 2021)
GCF_016906955.1
55,156
(2.64 %)
18,264
(1.56 %)
19,251
(1.34 %)
54,816
(2.83 %)
41.95
(99.61 %)
523
(0.39 %)
194
(100.00 %)
3,898,243
(30.33 %)
588,742
(1.17 %)
12,955,929
(36.44 %)
75,592
(1.86 %)
206 common wombat
GCF_900497805.2
46,365
(1.78 %)
19,437
(0.86 %)
18,947
(0.96 %)
n/a 38.86
(99.68 %)
67,461
(0.33 %)
14,183
(100.00 %)
8,645,969
(41.99 %)
1,203,246
(1.61 %)
23,878,215
(39.11 %)
18,752
(0.37 %)
207 Corsac fox (zsh2022 2023)
GCA_030463245.1
n/a 19,527
(1.61 %)
18,923
(1.35 %)
n/a 41.24
(100.00 %)
107
(0.00 %)
202
(100.00 %)
4,435,406
(32.05 %)
981,019
(1.98 %)
13,673,245
(32.65 %)
49,252
(2.20 %)
208 coyote (coyote_06102 2023)
GCA_034620425.1
n/a 19,251
(1.60 %)
19,585
(1.40 %)
n/a 41.18
(100.00 %)
93
(0.00 %)
120
(100.00 %)
4,493,000
(32.28 %)
982,814
(2.01 %)
13,803,318
(33.09 %)
50,777
(2.23 %)
209 creeping vole
GCF_018167655.1
54,941
(2.31 %)
23,033
(1.55 %)
25,427
(1.53 %)
n/a 44.23
(100.00 %)
n/a 2,147
(100.00 %)
4,549,519
(25.66 %)
1,153,429
(13.60 %)
13,568,297
(40.65 %)
23,141
(0.54 %)
210 crested porcupine
GCA_004026905.1
n/a 21,005
(1.32 %)
35,975
(1.39 %)
n/a 41.51
(99.89 %)
4,351
(0.02 %)
1,140,949
(99.98 %)
4,303,147
(30.69 %)
600,488
(1.19 %)
14,049,490
(33.80 %)
57,196
(1.33 %)
211 crested rat (2021)
GCA_907164525.1
n/a 18,829
(1.57 %)
20,084
(1.23 %)
n/a 40.89
(92.16 %)
116,236
(7.85 %)
153,441
(92.15 %)
6,937,911
(48.56 %)
1,051,397
(2.16 %)
13,178,644
(37.15 %)
22,912
(0.47 %)
212 Crete spiny mouse (2024)
GCA_964271855.1
n/a 19,467
(1.76 %)
18,734
(1.43 %)
n/a 42.87
(100.00 %)
184
(0.00 %)
113
(100.00 %)
4,718,848
(32.83 %)
1,327,449
(6.80 %)
12,893,458
(34.03 %)
21,236
(0.61 %)
213 Crete spiny mouse (2025)
GCA_964271855.5
n/a 19,050
(1.82 %)
18,719
(1.43 %)
n/a 42.87
(100.00 %)
184
(0.00 %)
112
(100.00 %)
5,710,100
(41.99 %)
1,327,449
(6.80 %)
12,893,310
(34.03 %)
21,236
(0.61 %)
214 Cuvier's beaked whale
GCA_004364475.1
n/a 23,700
(0.90 %)
51,715
(0.86 %)
n/a 42.01
(99.76 %)
3,229
(0.01 %)
3,761,505
(99.99 %)
6,544,424
(43.61 %)
1,417,186
(3.11 %)
16,127,873
(42.25 %)
68,668
(1.15 %)
215 cyclops roundleaf bat (Cote d'Ivoire 20210929_DDa alternate hap 2024)
GCA_043880225.1
n/a 18,335
(1.64 %)
20,207
(1.46 %)
n/a 41.56
(100.00 %)
n/a 1,440
(100.00 %)
4,675,929
(43.51 %)
742,038
(2.58 %)
11,746,853
(36.11 %)
47,949
(1.04 %)
216 cyclops roundleaf bat (Cote d'Ivoire 20210929_DDa primary hap 2024)
GCA_043880285.1
n/a 18,610
(1.67 %)
19,098
(1.39 %)
n/a 41.56
(99.99 %)
334
(0.01 %)
73
(100.00 %)
4,077,286
(41.85 %)
754,689
(2.64 %)
11,873,386
(36.16 %)
48,137
(1.04 %)
217 Damara mole-rat DMR 1.0 (2014 BGI)
GCF_000743615.1
52,373
(2.57 %)
17,983
(1.45 %)
17,063
(1.43 %)
n/a 40.34
(97.96 %)
87,815
(2.05 %)
162,545
(97.95 %)
4,053,433
(30.86 %)
545,281
(1.74 %)
13,406,483
(30.65 %)
37,008
(0.74 %)
218 Damara mole-rat DMR 1.0 HiC (2020 DNA Zoo)
GCF_012274545.1
58,091
(2.74 %)
17,780
(1.44 %)
16,515
(1.42 %)
n/a 40.34
(97.94 %)
88,899
(2.07 %)
73,970
(100.00 %)
4,035,140
(30.95 %)
544,772
(1.73 %)
13,390,872
(30.61 %)
37,008
(0.74 %)
219 dassie-rat
GCA_004026965.1
n/a 20,479
(1.16 %)
42,937
(1.41 %)
n/a 41.86
(99.89 %)
9,645
(0.04 %)
920,324
(99.96 %)
4,563,054
(28.83 %)
660,623
(1.92 %)
12,899,807
(34.48 %)
46,569
(1.25 %)
220 Daubenton's bat (alternate hap 2023)
GCA_963242275.1
n/a 18,895
(1.78 %)
24,235
(1.81 %)
n/a 43.39
(100.00 %)
n/a 4,930
(100.00 %)
2,813,870
(23.75 %)
718,406
(5.18 %)
9,977,320
(37.24 %)
62,910
(2.66 %)
221 Daubenton's bat (hap1.2 2025)
GCA_963259705.2
n/a 19,016
(1.77 %)
22,392
(1.66 %)
n/a 43.17
(100.00 %)
219
(0.00 %)
176
(100.00 %)
5,102,002
(45.10 %)
815,584
(6.94 %)
10,416,086
(39.34 %)
66,271
(2.56 %)
222 Daubenton's bat (hap2.2 2025)
GCA_963242275.2
n/a 18,127
(1.87 %)
21,346
(1.75 %)
n/a 43.37
(100.00 %)
136
(0.00 %)
208
(100.00 %)
4,712,850
(43.86 %)
726,883
(5.33 %)
9,942,977
(37.29 %)
62,442
(2.66 %)
223 Daubenton's bat (primary hap 2023 refseq)
GCF_963259705.1
64,558
(3.32 %)
19,141
(1.72 %)
22,133
(1.66 %)
n/a 43.18
(99.99 %)
1,099
(0.01 %)
121
(100.00 %)
3,040,232
(24.03 %)
796,911
(6.38 %)
10,478,180
(38.84 %)
64,920
(2.51 %)
224 Daurian ground squirrel
GCA_002406435.1
n/a 20,990
(1.31 %)
17,575
(1.17 %)
n/a 39.77
(96.15 %)
141,850
(3.84 %)
502,654
(96.16 %)
5,783,538
(34.36 %)
924,038
(3.73 %)
17,533,301
(30.85 %)
27,955
(0.39 %)
225 David's myotis bat
GCF_000327345.1
37,645
(2.70 %)
18,744
(1.78 %)
17,565
(1.62 %)
n/a 42.69
(91.23 %)
223,511
(8.80 %)
325,280
(91.20 %)
2,680,166
(23.79 %)
532,273
(1.90 %)
11,016,028
(29.55 %)
59,615
(1.59 %)
226 Davis's round-eared bat (hap1 2025)
GCA_051307075.1
n/a 17,736
(1.53 %)
21,703
(1.45 %)
n/a 42.03
(100.00 %)
153
(0.00 %)
311
(100.00 %)
4,450,174
(45.25 %)
390,322
(7.86 %)
12,108,244
(37.90 %)
76,695
(4.57 %)
227 Davis's round-eared bat (hap2 2025)
GCA_051307065.1
n/a 16,878
(1.65 %)
20,512
(1.56 %)
n/a 42.17
(100.00 %)
113
(0.00 %)
148
(100.00 %)
3,720,522
(43.45 %)
352,035
(4.96 %)
11,326,247
(34.44 %)
72,242
(4.65 %)
228 degu (3935 2012 refseq)
GCF_000260255.1
48,165
(2.13 %)
22,242
(1.41 %)
22,101
(1.46 %)
n/a 41.38
(84.36 %)
252,772
(15.68 %)
259,904
(84.32 %)
4,901,673
(27.74 %)
898,945
(1.50 %)
14,282,003
(29.30 %)
40,135
(0.82 %)
229 desert hamster (2022)
GCF_943737965.1
37,291
(2.11 %)
19,744
(1.74 %)
20,215
(1.50 %)
n/a 41.31
(100.00 %)
n/a 2,079
(100.00 %)
4,038,079
(31.01 %)
1,132,871
(2.71 %)
11,946,112
(32.62 %)
17,053
(0.51 %)
230 Desmarest's hutia
GCA_004027915.1
n/a 23,535
(0.78 %)
50,796
(0.95 %)
n/a 42.03
(99.83 %)
3,492
(0.01 %)
2,355,850
(99.99 %)
5,790,506
(26.72 %)
1,062,134
(1.71 %)
16,977,224
(35.29 %)
54,479
(1.01 %)
231 dingo (2020 Alpine COOINDA U.NSW)
GCF_012295265.1
102,060
(4.04 %)
19,777
(1.69 %)
20,341
(1.41 %)
n/a 41.29
(99.69 %)
325
(0.31 %)
477
(100.00 %)
4,950,808
(42.83 %)
1,033,921
(2.36 %)
13,745,703
(33.32 %)
51,835
(2.25 %)
232 dingo (Sandy 2020 James Cook U)
GCF_003254725.2
104,332
(4.50 %)
19,710
(1.72 %)
19,857
(1.42 %)
n/a 41.24
(100.00 %)
69
(0.00 %)
159
(100.00 %)
4,547,906
(33.32 %)
993,474
(2.19 %)
13,701,060
(33.18 %)
51,216
(2.28 %)
233 dog (Basenji MU ID 185726 2019)
GCA_004886185.2
n/a 19,889
(1.67 %)
20,501
(1.39 %)
n/a 41.36
(99.99 %)
1,388
(0.01 %)
3,630
(99.99 %)
4,950,227
(43.32 %)
1,059,639
(2.97 %)
13,694,849
(33.70 %)
51,443
(2.16 %)
234 dog (Basenji UNSW-BAS-2019 2021)
GCA_013276365.2
n/a 19,310
(1.60 %)
19,947
(1.42 %)
n/a 41.21
(100.00 %)
149
(0.00 %)
631
(100.00 %)
4,452,916
(32.14 %)
960,590
(2.23 %)
13,685,353
(33.01 %)
50,715
(2.22 %)
235 dog (Bernese Mountain Dog BD 2023)
GCA_031010765.1
n/a 19,211
(1.60 %)
20,327
(1.44 %)
n/a 41.20
(100.00 %)
641
(0.00 %)
175
(100.00 %)
4,471,016
(32.18 %)
984,776
(2.03 %)
13,719,474
(32.88 %)
51,050
(2.25 %)
236 dog (Bernese Mountain Dog OD 2023)
GCA_031010635.1
n/a 19,279
(1.60 %)
20,348
(1.44 %)
n/a 41.21
(100.00 %)
1,015
(0.00 %)
159
(100.00 %)
4,491,081
(32.21 %)
996,142
(2.01 %)
13,761,195
(32.97 %)
51,490
(2.25 %)
237 dog (boxer Tasha 2011)
GCF_000002285.3
82,536
(3.63 %)
19,772
(1.66 %)
19,565
(1.39 %)
n/a 41.31
(99.25 %)
23,876
(0.76 %)
27,106
(99.24 %)
4,918,098
(43.29 %)
991,835
(2.81 %)
13,644,959
(33.60 %)
53,269
(2.07 %)
238 dog (boxer Tasha 2020)
GCF_000002285.5
93,761
(3.84 %)
19,392
(1.71 %)
19,572
(1.42 %)
52,141
(3.27 %)
41.26
(100.00 %)
1,028
(0.00 %)
147
(100.00 %)
23,927,903
(42.42 %)
972,851
(2.05 %)
13,611,845
(33.11 %)
50,679
(2.26 %)
239 dog (Cairn Terrier CA611 2023)
GCA_031010295.1
n/a 19,255
(1.61 %)
20,479
(1.45 %)
n/a 41.19
(100.00 %)
262
(0.00 %)
141
(100.00 %)
4,490,019
(32.25 %)
989,383
(1.99 %)
13,710,808
(32.97 %)
50,883
(2.22 %)
240 dog (German shepard Mischka 2020)
GCF_011100685.1
96,734
(3.71 %)
20,135
(1.64 %)
20,871
(1.38 %)
56,772
(3.19 %)
41.50
(100.00 %)
585
(0.00 %)
2,782
(100.00 %)
20,264,827
(43.87 %)
1,152,879
(3.22 %)
13,784,690
(34.30 %)
53,518
(2.23 %)
241 dog (German Shepherd Nala 2020)
GCA_008641055.3
n/a 19,757
(1.69 %)
20,201
(1.41 %)
n/a 41.32
(99.74 %)
458
(0.26 %)
410
(100.00 %)
4,974,233
(43.03 %)
1,048,366
(2.46 %)
13,881,889
(33.61 %)
51,900
(2.21 %)
242 dog (Labrador retriever 2023)
GCA_031165255.1
n/a 19,256
(1.61 %)
20,247
(1.44 %)
n/a 41.18
(100.00 %)
516
(0.00 %)
675
(100.00 %)
4,456,220
(32.19 %)
960,584
(1.96 %)
13,688,006
(32.82 %)
50,670
(2.21 %)
243 dog (labrador SID07034 2020)
GCF_014441545.1
99,420
(3.87 %)
19,870
(1.70 %)
20,252
(1.41 %)
54,322
(3.23 %)
41.19
(99.47 %)
575
(0.53 %)
376
(100.00 %)
4,981,985
(42.28 %)
1,019,772
(1.97 %)
13,959,750
(32.77 %)
52,469
(2.25 %)
244 dog (poodle 2003)
GCA_000181415.1
n/a 12,852
(0.53 %)
24,666
(0.57 %)
n/a 41.09
(99.86 %)
n/a 1,089,636
(100.00 %)
3,212,912
(39.08 %)
549,098
(1.63 %)
8,833,799
(29.80 %)
41,068
(1.31 %)
245 domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2017 WashU)
GCF_000181335.3
72,076
(3.30 %)
18,662
(1.64 %)
20,897
(1.37 %)
n/a 41.73
(98.20 %)
436
(1.80 %)
5,079
(98.20 %)
5,086,462
(43.51 %)
964,126
(2.68 %)
13,947,871
(33.33 %)
69,701
(2.41 %)
246 domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2021 WashU)
GCA_000181335.5
n/a 18,378
(1.53 %)
21,242
(1.40 %)
n/a 41.73
(98.21 %)
422
(1.79 %)
5,010
(98.31 %)
4,683,703
(33.33 %)
964,129
(2.68 %)
13,948,305
(33.33 %)
69,725
(2.42 %)
247 domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2021)
GCA_000181335.6
n/a 18,357
(1.55 %)
20,085
(1.38 %)
n/a 41.76
(98.18 %)
422
(1.82 %)
1,254
(98.28 %)
4,661,997
(33.78 %)
947,221
(2.58 %)
13,867,949
(33.67 %)
68,011
(2.41 %)
248 domestic cat (Fca126 2021 Texas A&M U)
GCF_018350175.1
99,222
(4.40 %)
18,456
(1.66 %)
19,833
(1.39 %)
94,133
(5.63 %)
41.81
(100.00 %)
39
(0.00 %)
102
(100.00 %)
4,965,571
(43.65 %)
932,424
(1.95 %)
13,596,808
(33.85 %)
67,329
(2.48 %)
249 domestic cattle (Tuli MAZUNGA 2024)
GCA_040285425.1
n/a 19,454
(1.36 %)
22,081
(1.21 %)
n/a 44.04
(99.98 %)
31
(0.02 %)
878
(100.00 %)
6,506,177
(50.93 %)
1,038,848
(13.71 %)
11,547,434
(49.22 %)
84,199
(8.81 %)
250 domestic cattle (Wagyu 3DWFS0412 2024)
GCA_040286185.1
n/a 19,252
(1.32 %)
22,269
(1.20 %)
n/a 43.83
(99.96 %)
17
(0.04 %)
407
(99.99 %)
6,783,665
(51.29 %)
1,072,289
(13.17 %)
12,697,022
(49.18 %)
89,666
(8.32 %)
251 domestic ferret (JIRA1106 JCVI 2020)
GCF_011764305.1
68,868
(3.09 %)
19,019
(1.55 %)
21,812
(1.42 %)
n/a 41.90
(100.00 %)
n/a 1,224
(100.00 %)
4,650,028
(39.49 %)
745,115
(2.02 %)
13,758,447
(36.14 %)
58,684
(2.16 %)
252 domestic ferret (Sable 2011 Broad)
GCA_000239315.1
n/a 18,778
(1.67 %)
19,571
(1.47 %)
n/a 41.48
(96.89 %)
72,670
(3.12 %)
76,914
(96.88 %)
4,491,876
(40.13 %)
618,556
(1.07 %)
13,721,938
(31.04 %)
54,600
(1.94 %)
253 domestic guinea pig (051 PalLab524CR 2023)
GCF_034190915.1
79,333
(3.55 %)
17,999
(1.09 %)
21,509
(1.20 %)
n/a 40.64
(100.00 %)
84
(0.00 %)
672
(100.00 %)
5,037,431
(41.68 %)
886,785
(13.97 %)
14,620,284
(42.71 %)
39,682
(0.89 %)
254 domestic guinea pig (2N 2008 refseq)
GCF_000151735.1
44,762
(2.31 %)
18,301
(1.33 %)
20,111
(1.34 %)
n/a 39.95
(97.81 %)
58,460
(2.20 %)
61,604
(97.80 %)
4,257,852
(38.85 %)
658,533
(1.25 %)
14,547,726
(34.19 %)
37,093
(0.85 %)
255 domestic yak (maiwa yakHY00 2019)
GCA_005887515.3
n/a 18,672
(1.39 %)
19,408
(1.24 %)
n/a 41.97
(100.00 %)
646
(0.00 %)
343
(100.00 %)
3,570,978
(23.00 %)
583,762
(8.57 %)
14,055,227
(40.52 %)
43,883
(1.17 %)
256 dugong (hap1 mDugDug1 2023)
GCA_030035585.1
n/a 18,354
(1.22 %)
20,434
(1.08 %)
n/a 40.65
(100.00 %)
96
(0.00 %)
198
(100.00 %)
4,458,084
(33.00 %)
444,499
(1.79 %)
15,031,940
(47.42 %)
29,863
(0.83 %)
257 dugong (hap2 mDugDug1 2023)
GCA_030020955.1
n/a 18,538
(1.23 %)
20,775
(1.09 %)
n/a 40.64
(100.00 %)
89
(0.00 %)
167
(100.00 %)
4,455,227
(33.01 %)
444,021
(1.73 %)
14,946,847
(47.37 %)
29,828
(0.79 %)
258 dwarf fruit-eating bat (hap1 2025)
GCA_051107565.1
n/a 17,834
(1.67 %)
19,738
(1.55 %)
n/a 42.25
(100.00 %)
77
(0.00 %)
106
(100.00 %)
3,731,962
(43.43 %)
377,985
(3.87 %)
11,915,741
(34.43 %)
72,159
(2.56 %)
259 dwarf fruit-eating bat (hap2 2025)
GCA_051107595.1
n/a 16,790
(1.71 %)
18,246
(1.55 %)
n/a 42.24
(100.00 %)
43
(0.00 %)
102
(100.00 %)
3,412,455
(42.90 %)
339,875
(3.98 %)
10,947,746
(33.73 %)
65,083
(2.56 %)
260 dwarf mongoose
GCA_004023845.1
n/a 21,478
(1.57 %)
32,174
(1.43 %)
n/a 41.83
(99.94 %)
10,815
(0.05 %)
200,185
(99.95 %)
4,574,991
(40.34 %)
595,520
(1.11 %)
13,720,585
(32.94 %)
70,689
(2.42 %)
261 eastern cottontail (primary hap 2023)
GCA_949820135.1
n/a 18,522
(1.26 %)
22,314
(1.28 %)
n/a 43.69
(100.00 %)
316
(0.00 %)
99
(100.00 %)
3,699,683
(20.55 %)
935,350
(11.22 %)
13,112,318
(44.07 %)
99,224
(2.27 %)
262 eastern European house mouse (PWK_PhJ v2 2022)
GCA_921998335.2
n/a 21,903
(2.13 %)
19,801
(1.40 %)
108,675
(4.42 %)
41.79
(99.89 %)
207
(0.11 %)
211
(100.00 %)
4,630,645
(40.56 %)
1,531,506
(3.70 %)
13,011,312
(35.48 %)
22,270
(0.54 %)
263 eastern mole
GCA_004024925.1
n/a 19,631
(1.57 %)
32,414
(1.63 %)
n/a 42.02
(99.91 %)
7,239
(0.03 %)
647,535
(99.97 %)
3,145,725
(29.42 %)
554,620
(1.75 %)
10,663,504
(32.88 %)
55,063
(3.69 %)
264 eastern quoll
GCA_020854095.1
n/a 15,715
(0.80 %)
16,750
(0.93 %)
n/a 36.19
(100.00 %)
431
(0.00 %)
76
(100.00 %)
5,256,999
(24.81 %)
1,280,160
(3.39 %)
21,362,866
(41.74 %)
24,508
(0.70 %)
265 eastern spiny mouse (2021)
GCA_907164435.1
n/a 20,397
(1.93 %)
20,515
(1.44 %)
n/a 42.68
(98.12 %)
109,220
(1.90 %)
19,837
(99.90 %)
4,701,702
(33.98 %)
1,304,933
(2.91 %)
13,145,044
(31.05 %)
19,636
(0.56 %)
266 eastern woodrat (hap1 2025)
GCA_050000055.1
n/a 19,460
(1.37 %)
22,249
(1.25 %)
n/a 40.82
(100.00 %)
154
(0.00 %)
1,382
(100.00 %)
7,741,791
(54.00 %)
2,194,305
(10.09 %)
13,803,906
(42.49 %)
22,114
(0.48 %)
267 eastern woodrat (hap2 2025)
GCA_050000045.1
n/a 18,460
(1.50 %)
21,237
(1.36 %)
n/a 41.08
(100.00 %)
154
(0.00 %)
942
(100.00 %)
6,975,151
(51.59 %)
1,843,248
(8.41 %)
12,873,831
(39.03 %)
20,366
(0.52 %)
268 Egyptian rousette (1219 2016 Boston U)
GCF_001466805.2
54,791
(4.93 %)
18,221
(2.05 %)
24,192
(1.88 %)
46,601
(2.22 %)
40.02
(99.97 %)
638
(0.03 %)
2,490
(100.00 %)
2,815,693
(32.23 %)
440,119
(1.01 %)
12,346,041
(26.86 %)
56,244
(6.54 %)
269 Egyptian rousette (primary hap 2025)
GCA_014176215.2
n/a 17,319
(2.06 %)
22,433
(1.85 %)
n/a 40.05
(98.63 %)
250
(1.37 %)
27
(100.00 %)
3,010,528
(35.56 %)
434,429
(1.02 %)
12,031,135
(26.53 %)
53,517
(6.74 %)
270 Egyptian rousette (v1 2020 refseq)
GCF_014176215.1
65,163
(4.76 %)
17,642
(2.07 %)
22,317
(1.84 %)
n/a 40.05
(98.59 %)
242
(1.41 %)
29
(100.00 %)
2,821,248
(33.05 %)
434,414
(1.02 %)
12,031,597
(26.52 %)
53,573
(4.84 %)
271 Egyptian spiny mouse (US019 2019)
GCA_004027535.1
n/a 23,498
(1.69 %)
36,970
(1.40 %)
30,076
(1.58 %)
42.71
(99.88 %)
20,469
(0.09 %)
391,811
(99.91 %)
4,983,574
(35.17 %)
1,342,514
(3.45 %)
13,029,270
(32.79 %)
19,944
(0.55 %)
272 elk (wapiti)
GCF_019320065.1
66,846
(3.00 %)
20,090
(1.67 %)
21,999
(1.44 %)
n/a 41.62
(99.93 %)
6,643
(0.08 %)
185
(100.00 %)
4,884,711
(43.14 %)
429,925
(1.65 %)
13,135,255
(37.85 %)
47,099
(1.31 %)
273 ermine (2020)
GCF_009829155.1
74,345
(3.19 %)
18,855
(1.65 %)
20,667
(1.43 %)
44,584
(2.07 %)
41.56
(99.12 %)
199
(0.88 %)
94
(100.00 %)
4,647,934
(41.44 %)
714,174
(1.30 %)
13,845,904
(33.42 %)
56,065
(2.25 %)
274 ermine (alternate hap 2020)
GCA_009829165.1
n/a 13,583
(1.65 %)
15,403
(1.46 %)
n/a 41.72
(100.00 %)
n/a 3,327
(100.00 %)
3,139,035
(40.57 %)
480,111
(1.29 %)
9,106,061
(31.93 %)
39,139
(2.25 %)
275 ermine (hap1.1 2025)
GCA_965636865.1
n/a 18,538
(1.35 %)
23,646
(1.36 %)
n/a 42.25
(100.00 %)
212
(0.00 %)
1,036
(100.00 %)
6,455,322
(46.66 %)
881,285
(5.47 %)
13,096,768
(42.14 %)
93,973
(3.17 %)
276 ermine (hap2.1 2025)
GCA_965636855.1
n/a 17,654
(1.42 %)
22,483
(1.40 %)
n/a 42.07
(100.00 %)
139
(0.00 %)
1,083
(100.00 %)
5,945,296
(44.94 %)
800,358
(4.39 %)
12,526,091
(40.11 %)
85,220
(2.90 %)
277 ermine (primary hap 2020)
GCA_009829155.1
n/a 18,855
(1.65 %)
20,668
(1.43 %)
n/a 41.56
(99.12 %)
199
(0.88 %)
94
(100.00 %)
4,647,997
(41.44 %)
714,178
(1.30 %)
13,845,820
(33.42 %)
56,065
(2.25 %)
278 Eurasian badger (2021)
GCA_922990625.1
n/a 19,332
(1.42 %)
22,424
(1.40 %)
n/a 42.47
(100.00 %)
27
(0.00 %)
726
(100.00 %)
4,362,536
(31.74 %)
801,232
(4.02 %)
13,893,672
(37.73 %)
65,806
(4.13 %)
279 Eurasian badger (v3.2 2022)
GCA_922984935.2
n/a 19,268
(1.40 %)
22,121
(1.36 %)
41,043
(1.93 %)
42.48
(100.00 %)
101
(0.00 %)
538
(100.00 %)
4,417,203
(31.72 %)
821,664
(4.02 %)
13,814,720
(38.08 %)
66,524
(3.95 %)
280 Eurasian beaver (alternate hap 2025)
GCA_977035955.1
n/a 14,184
(1.28 %)
14,518
(1.21 %)
n/a 40.16
(99.94 %)
12,413
(0.06 %)
17,640
(99.94 %)
2,894,516
(33.23 %)
469,512
(3.63 %)
8,909,825
(39.95 %)
18,772
(1.65 %)
281 Eurasian beaver (primary hap 2025)
GCA_977036005.1
n/a 20,316
(1.47 %)
20,429
(1.25 %)
n/a 39.69
(100.00 %)
237
(0.00 %)
228
(100.00 %)
4,115,552
(36.09 %)
562,383
(2.69 %)
14,321,638
(36.02 %)
24,219
(0.75 %)
282 Eurasian field mouse (2024)
GCA_964023405.1
n/a 20,487
(1.88 %)
19,707
(1.34 %)
n/a 42.15
(100.00 %)
182
(0.00 %)
61
(100.00 %)
5,115,510
(39.18 %)
1,868,284
(4.29 %)
13,503,826
(37.29 %)
26,414
(0.61 %)
283 Eurasian red squirrel (alternate hap 2019)
GCA_902685485.1
n/a 12,437
(1.51 %)
12,702
(1.22 %)
n/a 40.06
(100.00 %)
2
(0.00 %)
10,657
(100.00 %)
2,303,176
(35.38 %)
353,996
(1.49 %)
7,218,556
(31.67 %)
24,268
(1.07 %)
284 Eurasian red squirrel (v1.2 2020)
GCA_902686455.2
n/a 21,309
(1.58 %)
21,026
(1.36 %)
33,465
(1.53 %)
40.08
(94.33 %)
1,177
(5.67 %)
639
(100.00 %)
4,677,412
(35.73 %)
704,218
(1.42 %)
14,992,063
(31.49 %)
48,159
(1.04 %)
285 Eurasian river otter (2020)
GCF_902655055.1
67,269
(2.96 %)
18,842
(1.54 %)
20,178
(1.40 %)
n/a 41.59
(100.00 %)
185
(0.00 %)
44
(100.00 %)
4,259,294
(33.39 %)
713,721
(1.36 %)
13,626,048
(34.37 %)
57,073
(1.82 %)
286 Eurasian river otter (alternate hap 2019)
GCA_902653095.1
n/a 9,910
(1.59 %)
11,315
(1.31 %)
n/a 41.85
(100.00 %)
n/a 8,506
(100.00 %)
2,052,338
(42.25 %)
316,084
(1.64 %)
6,222,460
(33.12 %)
27,057
(1.96 %)
287 Eurasian river otter (primary hap 2020)
GCA_902655055.2
n/a 19,133
(1.66 %)
20,177
(1.40 %)
n/a 41.59
(100.00 %)
185
(0.00 %)
44
(100.00 %)
4,736,483
(42.28 %)
713,721
(1.36 %)
13,625,976
(34.37 %)
57,073
(1.82 %)
288 Eurasian water vole (alternate hap 2020)
GCA_903992525.1
n/a 16,761
(1.66 %)
19,715
(1.37 %)
n/a 42.13
(100.00 %)
105
(0.00 %)
16,473
(100.00 %)
3,118,266
(26.44 %)
829,463
(2.82 %)
9,700,482
(31.37 %)
14,146
(0.57 %)
289 Eurasian water vole (primary hap 2021)
GCA_903992535.2
n/a 19,126
(1.84 %)
19,054
(1.47 %)
n/a 42.15
(99.74 %)
873
(0.26 %)
215
(100.00 %)
5,439,454
(42.21 %)
1,088,163
(2.91 %)
12,853,486
(32.42 %)
19,000
(0.58 %)
290 Eurasian water vole (v2 2021)
GCF_903992535.2
45,544
(2.51 %)
19,733
(1.78 %)
19,053
(1.47 %)
36,935
(2.27 %)
42.15
(99.74 %)
873
(0.26 %)
215
(100.00 %)
3,993,912
(25.74 %)
1,088,163
(2.91 %)
12,853,770
(32.42 %)
19,000
(0.58 %)
291 European free-tailed bat (hap1.1 2025)
GCA_976988885.1
n/a 19,367
(1.49 %)
21,955
(1.44 %)
n/a 42.35
(100.00 %)
174
(0.00 %)
641
(100.00 %)
4,439,364
(40.01 %)
680,470
(8.16 %)
11,487,613
(43.09 %)
73,991
(1.99 %)
292 European free-tailed bat (hap2.1 2025)
GCA_976988855.1
n/a 19,630
(1.68 %)
21,945
(1.52 %)
n/a 42.25
(100.00 %)
121
(0.00 %)
370
(100.00 %)
4,242,872
(41.74 %)
637,498
(4.18 %)
11,360,772
(39.15 %)
69,324
(2.22 %)
293 European ground squirrel (alternate hap 2024)
GCA_964194095.1
n/a 15,410
(1.11 %)
21,126
(1.11 %)
n/a 39.96
(100.00 %)
n/a 28,045
(100.00 %)
3,186,054
(30.28 %)
656,568
(16.12 %)
9,975,571
(43.35 %)
28,808
(1.24 %)
294 European hare (LE1 primary hap 2023)
GCF_033115175.1
46,528
(2.09 %)
19,392
(1.25 %)
23,070
(1.29 %)
n/a 44.03
(100.00 %)
418
(0.00 %)
651
(100.00 %)
4,011,592
(19.81 %)
1,000,204
(8.44 %)
13,414,251
(44.25 %)
98,831
(2.33 %)
295 European harvest mouse (alternate hap 2024)
GCA_963924645.1
n/a 3,404
(1.16 %)
2,956
(0.83 %)
n/a 39.56
(100.00 %)
n/a 5,020
(100.00 %)
741,789
(44.38 %)
265,801
(43.28 %)
1,048,943
(61.65 %)
3,244
(3.57 %)
296 European harvest mouse (primary hap 2024)
GCA_963924665.1
n/a 20,236
(1.71 %)
19,368
(1.32 %)
n/a 40.05
(99.99 %)
2,020
(0.02 %)
894
(100.00 %)
4,892,811
(36.49 %)
1,223,387
(18.26 %)
11,907,631
(42.51 %)
17,423
(0.62 %)
297 European mink (alternate hap 2023)
GCA_030435785.1
n/a 15,419
(1.50 %)
21,175
(1.51 %)
n/a 42.09
(100.00 %)
n/a 12,043
(100.00 %)
2,952,218
(30.62 %)
538,508
(2.18 %)
9,303,303
(34.20 %)
47,810
(2.50 %)
298 European mink (primary hap 2023 refseq)
GCF_030435805.1
69,556
(3.13 %)
18,706
(1.46 %)
21,193
(1.37 %)
n/a 41.85
(100.00 %)
39
(0.00 %)
25
(100.00 %)
4,237,791
(30.90 %)
792,897
(2.69 %)
13,417,195
(36.59 %)
67,132
(2.54 %)
299 European mole (hap1 2024)
GCA_964194135.1
n/a 18,085
(1.69 %)
19,509
(1.58 %)
n/a 42.08
(99.99 %)
1,056
(0.01 %)
464
(100.00 %)
2,569,380
(23.32 %)
565,465
(2.18 %)
10,506,666
(33.68 %)
46,367
(3.09 %)
300 European mole (hap2 2024)
GCA_964194205.1
n/a 18,064
(1.69 %)
19,764
(1.59 %)
n/a 42.07
(99.99 %)
1,040
(0.01 %)
1,396
(99.99 %)
2,567,492
(23.34 %)
570,250
(2.16 %)
10,485,959
(33.56 %)
46,213
(3.27 %)
301 European pine marten (primary hap 2023)
GCA_963455335.1
n/a 18,336
(1.50 %)
20,807
(1.41 %)
n/a 42.38
(99.98 %)
2,250
(0.02 %)
477
(100.00 %)
4,096,160
(31.55 %)
707,337
(3.28 %)
13,715,382
(34.73 %)
61,481
(4.29 %)
302 European shrew (alternate hap 2023)
GCA_027595995.1
n/a 17,506
(1.26 %)
25,527
(1.52 %)
n/a 43.20
(100.00 %)
n/a 5,699
(100.00 %)
2,400,784
(15.19 %)
1,062,793
(3.20 %)
13,284,496
(41.93 %)
77,009
(2.86 %)
303 European shrew (GB8-d 2012)
GCF_000181275.1
23,525
(1.54 %)
17,290
(1.33 %)
22,005
(1.50 %)
n/a 42.90
(90.49 %)
188,953
(9.54 %)
201,798
(90.46 %)
4,400,127
(33.22 %)
946,629
(2.03 %)
13,377,581
(35.30 %)
77,851
(2.58 %)
304 European shrew (primary hap 2023)
GCF_027595985.1
44,643
(2.60 %)
17,479
(1.26 %)
21,293
(1.37 %)
n/a 43.24
(99.46 %)
1,427
(0.54 %)
65
(100.00 %)
2,474,584
(15.18 %)
1,107,884
(3.28 %)
13,638,467
(41.72 %)
79,785
(2.86 %)
305 European snow vole (alternate hap 2023)
GCA_950005115.1
n/a 18,364
(1.79 %)
20,379
(1.63 %)
n/a 42.19
(100.00 %)
1
(0.00 %)
4,256
(100.00 %)
3,049,618
(22.22 %)
852,708
(4.50 %)
10,501,392
(33.34 %)
17,629
(0.60 %)
306 European snow vole (primary hap 2023 refseq)
GCF_950005125.1
47,025
(2.69 %)
19,592
(1.78 %)
21,173
(1.56 %)
n/a 41.98
(100.00 %)
197
(0.00 %)
160
(100.00 %)
5,048,186
(44.12 %)
998,537
(5.14 %)
12,204,053
(34.97 %)
20,725
(0.63 %)
307 European suslik (primary hap 2024)
GCA_964194105.1
n/a 20,075
(1.28 %)
20,274
(1.19 %)
n/a 39.90
(99.99 %)
1,436
(0.01 %)
502
(100.00 %)
4,357,247
(31.78 %)
882,536
(12.27 %)
14,882,486
(41.66 %)
39,275
(0.88 %)
308 European woodmouse (2022 refseq)
GCF_947179515.1
54,113
(2.24 %)
19,959
(1.65 %)
19,953
(1.25 %)
n/a 41.23
(99.99 %)
1,129
(0.01 %)
497
(100.00 %)
4,863,650
(37.41 %)
1,795,997
(8.95 %)
13,681,732
(40.58 %)
23,961
(0.53 %)
309 European woodmouse (alternate hap 2022)
GCA_947179525.1
n/a 18,692
(1.72 %)
22,021
(1.36 %)
n/a 41.56
(100.00 %)
2
(0.00 %)
10,863
(100.00 %)
4,055,957
(36.08 %)
1,513,576
(9.53 %)
11,306,811
(39.67 %)
20,865
(0.55 %)
310 fallow deer (Ldn47 2023)
GCF_033118175.1
57,013
(2.35 %)
20,187
(1.33 %)
23,290
(1.33 %)
n/a 42.38
(100.00 %)
44
(0.00 %)
284
(100.00 %)
3,308,241
(20.72 %)
513,748
(18.20 %)
12,996,819
(48.19 %)
214,480
(2.98 %)
311 fallow deer (maternal hap SK-2024 2025)
GCA_048126745.1
n/a 20,072
(1.51 %)
22,668
(1.37 %)
n/a 41.80
(100.00 %)
147
(0.00 %)
1,369
(100.00 %)
4,623,335
(34.75 %)
475,143
(7.51 %)
13,000,703
(41.56 %)
112,581
(2.00 %)
312 fallow deer (paternal hap SK-2024 2025)
GCA_048127045.1
n/a 18,238
(1.57 %)
20,307
(1.42 %)
n/a 41.46
(100.00 %)
242
(0.00 %)
388
(100.00 %)
4,244,450
(35.89 %)
405,446
(2.83 %)
12,211,643
(38.55 %)
52,418
(1.36 %)
313 false killer whale (hap1 2024 genbank)
GCA_039906515.1
n/a 18,718
(1.50 %)
20,929
(1.32 %)
n/a 42.08
(99.90 %)
123
(0.10 %)
439
(100.00 %)
3,958,932
(35.76 %)
1,002,329
(11.61 %)
12,193,131
(41.85 %)
79,158
(3.74 %)
314 false killer whale (hap1 2024 refseq)
GCF_039906515.1
75,958
(3.31 %)
18,718
(1.50 %)
20,982
(1.32 %)
n/a 42.08
(99.90 %)
123
(0.10 %)
438
(100.00 %)
3,958,926
(35.76 %)
1,002,329
(11.61 %)
12,193,061
(41.85 %)
79,158
(3.74 %)
315 false killer whale (hap2 2024)
GCA_039906525.1
n/a 17,866
(1.45 %)
21,079
(1.46 %)
n/a 42.37
(99.08 %)
133
(0.92 %)
416
(100.00 %)
3,852,502
(34.98 %)
1,112,185
(16.42 %)
11,435,533
(44.17 %)
75,215
(4.36 %)
316 fat dormouse (US078 2019)
GCA_004027185.1
n/a 23,122
(1.24 %)
48,677
(1.27 %)
n/a 42.33
(99.92 %)
10,685
(0.04 %)
444,115
(99.96 %)
6,783,404
(37.03 %)
1,642,515
(3.72 %)
12,706,289
(39.97 %)
65,521
(1.47 %)
317 fat sand rat (mPsaObe1 2021)
GCF_907164565.1
43,224
(2.50 %)
18,543
(1.78 %)
20,094
(1.42 %)
n/a 41.95
(99.11 %)
50,482
(0.90 %)
11,389
(100.00 %)
4,686,377
(43.10 %)
920,563
(1.85 %)
12,813,848
(35.08 %)
22,480
(0.71 %)
318 fat sand rat (Psa_ob012049795 2017)
GCA_002215935.1
n/a 21,644
(1.71 %)
31,665
(1.41 %)
n/a 41.99
(99.99 %)
n/a 96,427
(100.00 %)
4,646,110
(38.87 %)
946,664
(2.24 %)
13,134,526
(33.94 %)
26,411
(0.73 %)
319 fat-tailed dunnart (SCR6 2025)
GCF_048593235.1
60,212
(2.43 %)
15,763
(0.77 %)
16,031
(0.89 %)
n/a 36.12
(99.99 %)
1,908
(0.01 %)
8
(100.00 %)
5,302,378
(24.47 %)
1,450,227
(3.79 %)
20,870,714
(44.26 %)
24,586
(0.65 %)
320 fat-tailed dunnart (SCR6 hap1 2025)
GCA_048593235.1
n/a 15,762
(0.77 %)
16,035
(0.89 %)
n/a 36.12
(99.99 %)
1,908
(0.01 %)
1,915
(99.99 %)
5,302,372
(24.47 %)
1,450,220
(3.79 %)
20,870,654
(44.26 %)
24,585
(0.65 %)
321 fat-tailed dunnart (SCR6 hap2 2025)
GCA_048593295.1
n/a 16,012
(0.77 %)
16,430
(0.90 %)
n/a 36.18
(99.99 %)
1,730
(0.01 %)
1,737
(99.99 %)
5,361,847
(24.48 %)
1,474,744
(3.79 %)
21,021,671
(44.20 %)
25,669
(0.69 %)
322 fin whale (hap1.1 2025)
GCA_965194825.1
n/a 19,491
(1.21 %)
22,538
(1.06 %)
n/a 42.19
(99.99 %)
1,516
(0.01 %)
2,612
(100.00 %)
4,598,236
(35.34 %)
1,716,315
(24.14 %)
12,260,919
(52.40 %)
82,683
(1.47 %)
323 fin whale (hap2.1 2025)
GCA_965194765.1
n/a 18,684
(1.40 %)
21,322
(1.20 %)
n/a 41.87
(99.99 %)
1,258
(0.01 %)
3,706
(99.99 %)
4,103,716
(36.69 %)
1,030,821
(16.12 %)
11,633,934
(45.82 %)
74,782
(1.60 %)
324 fishing cat (Anna 2022 U Missouri)
GCF_022837055.1
68,085
(2.86 %)
18,432
(1.63 %)
19,912
(1.37 %)
n/a 41.91
(100.00 %)
63
(0.00 %)
192
(100.00 %)
4,777,906
(34.85 %)
937,432
(2.30 %)
13,438,032
(34.55 %)
70,402
(2.61 %)
325 Florida manatee (CSIC 2023)
GCA_030013775.1
n/a 19,432
(1.24 %)
24,035
(1.14 %)
n/a 40.66
(100.00 %)
33
(0.00 %)
15,641
(100.00 %)
4,400,331
(33.07 %)
439,615
(1.04 %)
14,884,753
(46.98 %)
32,563
(0.80 %)
326 Florida manatee (Lorelei 2012 refseq)
GCF_000243295.1
39,664
(2.08 %)
18,308
(1.37 %)
20,588
(1.23 %)
32,868
(1.38 %)
40.73
(89.24 %)
160,167
(10.78 %)
166,490
(89.22 %)
n/a 389,315
(0.74 %)
14,633,038
(38.46 %)
27,462
(0.64 %)
327 fossa
GCA_004023885.1
n/a 21,156
(1.56 %)
29,809
(1.38 %)
n/a 41.51
(99.94 %)
6,335
(0.03 %)
470,371
(99.97 %)
4,962,168
(42.36 %)
814,639
(1.52 %)
13,708,904
(34.14 %)
78,033
(2.52 %)
328 Gambian giant pouched rat
GCA_004027575.1
n/a 21,189
(1.59 %)
32,806
(1.43 %)
n/a 42.11
(99.88 %)
7,473
(0.03 %)
1,110,425
(99.97 %)
4,137,605
(24.57 %)
1,071,627
(2.76 %)
12,905,250
(32.78 %)
32,359
(0.80 %)
329 gaur (Gaur_Henry_Doorly_Zoo_5443 2020)
GCA_014182915.2
n/a 19,130
(1.53 %)
21,239
(1.30 %)
n/a 41.83
(99.99 %)
2,194
(0.01 %)
635
(100.00 %)
6,520,228
(50.46 %)
466,916
(1.41 %)
13,425,286
(41.25 %)
41,833
(1.15 %)
330 gayal (CVASU_BF_001 2021)
GCA_017311355.1
n/a 24,549
(1.09 %)
55,194
(1.15 %)
n/a 42.05
(99.91 %)
n/a 1,262,134
(100.00 %)
3,691,398
(22.78 %)
677,397
(2.00 %)
14,380,670
(42.36 %)
75,114
(1.33 %)
331 gayal (Nagaland 2019)
GCA_007844835.1
n/a 22,715
(1.55 %)
23,635
(1.33 %)
n/a 41.67
(96.51 %)
301,761
(3.52 %)
306,776
(96.48 %)
6,243,468
(45.69 %)
518,664
(1.99 %)
15,147,647
(37.64 %)
45,586
(0.89 %)
332 Geoffroy's bat (hap1.1 2025)
GCA_965115925.1
n/a 19,320
(1.74 %)
21,940
(1.65 %)
n/a 42.55
(99.99 %)
1,540
(0.01 %)
404
(100.00 %)
3,707,500
(37.60 %)
733,107
(7.78 %)
10,515,474
(39.35 %)
60,200
(2.41 %)
333 Geoffroy's bat (hap1.2 2025)
GCA_965115925.2
n/a 18,831
(1.81 %)
22,032
(1.67 %)
n/a 42.55
(100.00 %)
226
(0.00 %)
306
(100.00 %)
4,958,159
(48.46 %)
733,004
(7.77 %)
10,528,813
(39.34 %)
59,971
(2.41 %)
334 Geoffroy's bat (hap2.1 2025)
GCA_965115945.1
n/a 18,718
(1.71 %)
20,961
(1.62 %)
n/a 42.29
(99.98 %)
1,597
(0.02 %)
2,101
(99.98 %)
3,662,405
(37.72 %)
717,069
(7.80 %)
10,298,372
(39.22 %)
56,300
(2.26 %)
335 Geoffroy's bat (hap2.2 2025)
GCA_965115945.2
n/a 18,471
(1.79 %)
21,274
(1.64 %)
n/a 42.31
(100.00 %)
264
(0.00 %)
418
(100.00 %)
4,911,358
(48.79 %)
719,004
(7.65 %)
10,340,272
(39.15 %)
56,616
(2.24 %)
336 Geoffroy's cat
GCF_018350155.1
85,344
(3.53 %)
18,469
(1.66 %)
19,516
(1.36 %)
93,795
(4.83 %)
41.75
(100.00 %)
45
(0.00 %)
82
(100.00 %)
5,021,854
(43.23 %)
930,175
(1.84 %)
13,757,469
(34.29 %)
65,918
(2.36 %)
337 giant anteater
GCA_004026745.1
n/a 24,383
(0.91 %)
44,315
(0.93 %)
n/a 39.53
(99.88 %)
8,283
(0.02 %)
1,629,691
(99.98 %)
5,333,757
(35.57 %)
575,140
(0.91 %)
21,181,213
(39.97 %)
57,558
(0.94 %)
338 giant otter
GCA_004024605.1
n/a 21,199
(1.46 %)
30,565
(1.34 %)
n/a 41.71
(99.93 %)
7,431
(0.03 %)
652,159
(99.97 %)
5,113,769
(41.55 %)
788,677
(1.46 %)
14,385,279
(35.77 %)
82,376
(2.05 %)
339 giant panda (Jingjing v3 2020)
GCF_002007445.2
65,481
(3.27 %)
19,077
(1.67 %)
20,176
(1.39 %)
n/a 41.68
(98.09 %)
189,277
(1.92 %)
73,514
(100.00 %)
4,012,144
(34.40 %)
617,803
(1.99 %)
14,216,587
(30.41 %)
59,449
(1.50 %)
340 goat (v2 San Clemente 2016 USDA)
GCF_001704415.2
47,172
(2.31 %)
19,342
(1.38 %)
22,346
(1.24 %)
n/a 43.16
(100.00 %)
790
(0.00 %)
29,886
(100.00 %)
3,502,527
(22.45 %)
760,831
(7.07 %)
13,024,178
(44.85 %)
125,662
(4.00 %)
341 Gobi jerboa
GCA_004027895.1
n/a 22,410
(0.91 %)
45,268
(1.02 %)
n/a 41.94
(99.88 %)
10,987
(0.04 %)
1,295,369
(99.96 %)
8,828,417
(40.19 %)
1,979,806
(6.43 %)
14,759,732
(47.73 %)
24,314
(0.52 %)
342 golden hamster (Baylor 2021)
GCF_017639785.1
67,831
(3.37 %)
19,354
(1.71 %)
19,863
(1.47 %)
69,903
(4.39 %)
42.04
(96.99 %)
711
(3.01 %)
7,058
(96.99 %)
3,981,818
(27.65 %)
976,456
(3.46 %)
12,580,903
(32.87 %)
21,268
(0.61 %)
343 golden hamster (Broad 2013 refseq)
GCF_000349665.1
42,636
(2.91 %)
18,976
(1.82 %)
19,149
(1.51 %)
29,936
(1.96 %)
42.01
(82.92 %)
216,216
(17.12 %)
237,700
(82.88 %)
3,599,795
(26.09 %)
790,256
(1.69 %)
12,003,956
(24.29 %)
18,591
(0.51 %)
344 golden jackal (CA01 2025)
GCF_053574225.1
115,457
(4.37 %)
19,332
(1.58 %)
21,009
(1.39 %)
n/a 41.58
(100.00 %)
59
(0.00 %)
306
(100.00 %)
6,089,485
(46.31 %)
1,184,044
(5.44 %)
13,574,928
(35.96 %)
54,314
(2.19 %)
345 golden spiny mouse (2020)
GCA_903995435.1
n/a 20,001
(1.90 %)
19,127
(1.50 %)
n/a 42.51
(99.65 %)
880
(0.35 %)
623
(100.00 %)
4,976,496
(36.34 %)
1,305,613
(3.34 %)
12,957,738
(32.33 %)
20,760
(0.59 %)
346 golden spiny mouse (2020)
GCF_903995435.1
36,997
(1.96 %)
20,006
(1.91 %)
19,132
(1.50 %)
n/a 42.51
(99.65 %)
880
(0.35 %)
623
(100.00 %)
4,785,907
(32.61 %)
1,305,613
(3.34 %)
12,958,061
(32.33 %)
20,760
(0.59 %)
347 golden-mantled ground squirrel (hap1 2025 genbank)
GCA_048772815.1
n/a 20,967
(0.89 %)
24,137
(0.94 %)
n/a 39.52
(99.99 %)
1,448
(0.01 %)
8,087
(100.00 %)
5,547,018
(29.30 %)
1,312,047
(10.07 %)
15,174,898
(52.73 %)
40,182
(0.59 %)
348 golden-mantled ground squirrel (hap1 2025 refseq)
GCF_048772815.1
49,173
(1.30 %)
19,845
(0.90 %)
24,244
(0.94 %)
n/a 39.52
(99.99 %)
1,448
(0.01 %)
8,088
(100.00 %)
8,197,827
(62.01 %)
1,312,047
(10.07 %)
15,174,958
(52.73 %)
40,182
(0.59 %)
349 golden-mantled ground squirrel (hap2 2025 genbank)
GCA_048772825.1
n/a 19,719
(1.16 %)
22,611
(1.21 %)
n/a 39.48
(100.00 %)
643
(0.00 %)
2,820
(100.00 %)
4,725,546
(31.70 %)
997,950
(3.53 %)
14,753,550
(39.53 %)
33,465
(0.69 %)
350 golden-mantled ground squirrel (hap2 2025 refseq)
GCF_048772825.1
46,395
(1.71 %)
18,853
(1.19 %)
22,613
(1.21 %)
n/a 39.48
(100.00 %)
643
(0.00 %)
2,821
(100.00 %)
6,984,115
(50.68 %)
997,950
(3.53 %)
14,753,604
(39.53 %)
33,465
(0.69 %)
351 gracile shrew mole
GCA_004024945.1
n/a 19,165
(1.25 %)
43,816
(1.48 %)
n/a 41.08
(99.89 %)
8,248
(0.04 %)
732,083
(99.96 %)
2,957,465
(23.76 %)
783,289
(2.60 %)
11,503,344
(31.38 %)
92,729
(3.60 %)
352 gray fox (Vermont ataVT051 2023)
GCA_032313775.1
n/a 19,352
(1.42 %)
20,724
(1.33 %)
n/a 42.10
(100.00 %)
26
(0.00 %)
898
(100.00 %)
4,418,039
(36.90 %)
1,050,244
(11.63 %)
13,240,305
(39.50 %)
89,246
(2.69 %)
353 gray seal (241Hg 2020)
GCF_012393455.1
79,009
(3.73 %)
19,882
(1.73 %)
22,416
(1.46 %)
n/a 41.44
(100.00 %)
117
(0.00 %)
6,880
(100.00 %)
4,448,588
(43.28 %)
557,710
(1.32 %)
13,340,576
(33.41 %)
55,637
(1.78 %)
354 gray seal (hap1.1 2025)
GCA_964656455.1
n/a 19,291
(1.73 %)
20,301
(1.41 %)
n/a 41.56
(99.99 %)
1,130
(0.01 %)
171
(100.00 %)
4,245,582
(34.81 %)
600,624
(2.16 %)
13,240,803
(34.28 %)
56,932
(1.78 %)
355 gray seal (hap2.1 2025)
GCA_964656465.1
n/a 19,222
(1.73 %)
20,205
(1.41 %)
n/a 41.54
(99.99 %)
1,110
(0.01 %)
1,233
(99.99 %)
4,236,942
(34.95 %)
601,409
(1.99 %)
13,226,667
(34.03 %)
57,067
(1.82 %)
356 gray seal (mHalGry1.hap1.1 2025)
GCF_964656455.1
70,736
(3.27 %)
18,889
(1.71 %)
20,343
(1.40 %)
n/a 41.56
(99.99 %)
1,130
(0.01 %)
1,300
(99.99 %)
5,332,627
(44.68 %)
600,622
(2.16 %)
13,240,769
(34.28 %)
56,931
(1.78 %)
357 gray short-tailed opossum (mMonDom1 alternate hap 2023)
GCA_027917375.1
n/a 12,662
(0.70 %)
15,124
(0.89 %)
n/a 37.74
(100.00 %)
24
(0.00 %)
8,086
(100.00 %)
4,098,004
(25.33 %)
806,470
(2.98 %)
16,244,072
(43.39 %)
24,879
(0.67 %)
358 gray short-tailed opossum (mMonDom1 primary hap 2023 refseq)
GCF_027887165.1
73,383
(3.04 %)
16,637
(0.72 %)
16,036
(0.85 %)
n/a 37.92
(99.11 %)
2,255
(0.89 %)
13
(100.00 %)
5,562,359
(25.40 %)
1,096,620
(2.60 %)
22,322,748
(43.37 %)
28,894
(0.57 %)
359 gray short-tailed opossum (MonDom5 2007)
GCF_000002295.2
68,388
(2.34 %)
16,663
(0.75 %)
16,162
(0.84 %)
n/a 37.82
(97.26 %)
67,660
(2.75 %)
72,674
(97.25 %)
7,753,175
(55.85 %)
1,051,473
(2.34 %)
22,274,001
(42.23 %)
30,883
(0.53 %)
360 gray squirrel (2020)
GCF_902686445.1
59,073
(2.48 %)
20,752
(1.49 %)
21,107
(1.31 %)
32,732
(1.45 %)
40.06
(99.98 %)
1,824
(0.02 %)
752
(100.00 %)
4,605,578
(34.50 %)
728,192
(1.65 %)
15,467,412
(33.91 %)
51,878
(1.11 %)
361 gray squirrel (alternate hap 2019)
GCA_902685475.1
n/a 17,156
(1.53 %)
18,190
(1.33 %)
n/a 40.25
(100.00 %)
2
(0.00 %)
9,510
(100.00 %)
3,455,580
(34.94 %)
530,053
(1.56 %)
10,927,458
(32.64 %)
38,976
(1.13 %)
362 gray squirrel (primary hap 2020)
GCA_902686445.2
n/a 20,739
(1.50 %)
21,110
(1.31 %)
n/a 40.06
(99.98 %)
1,824
(0.02 %)
753
(100.00 %)
4,732,857
(35.28 %)
728,193
(1.65 %)
15,466,750
(33.91 %)
51,878
(1.11 %)
363 gray wolf (2021)
GCA_905319855.2
n/a 19,474
(1.55 %)
20,394
(1.40 %)
72,806
(4.12 %)
41.49
(100.00 %)
166
(0.00 %)
82
(100.00 %)
4,550,524
(31.76 %)
1,063,944
(3.96 %)
13,588,117
(34.74 %)
51,996
(2.15 %)
364 gray wolf (alternate hap 2021)
GCA_905319845.1
n/a 12,760
(1.57 %)
14,423
(1.42 %)
n/a 41.35
(100.00 %)
1
(0.00 %)
5,537
(100.00 %)
2,725,227
(31.66 %)
616,862
(3.40 %)
8,041,744
(32.68 %)
32,293
(2.35 %)
365 intermediate fruit-eating bat (hap1 2024)
GCA_038363145.1
n/a 18,022
(1.56 %)
19,824
(1.51 %)
n/a 42.28
(100.00 %)
81
(0.00 %)
419
(100.00 %)
2,827,417
(26.82 %)
371,479
(4.97 %)
11,603,093
(34.64 %)
71,574
(2.28 %)
366 great fruit-eating bat (hap1 2025)
GCA_038363095.4
n/a 18,198
(1.65 %)
19,926
(1.51 %)
n/a 42.45
(100.00 %)
44
(0.00 %)
487
(100.00 %)
3,105,608
(36.84 %)
379,427
(5.52 %)
11,651,533
(35.11 %)
72,337
(2.76 %)
367 great fruit-eating bat (mArtLit1hap2 2024)
GCA_038363175.2
n/a 16,978
(1.61 %)
18,544
(1.54 %)
n/a 42.42
(100.00 %)
54
(0.00 %)
312
(100.00 %)
2,601,985
(26.67 %)
331,187
(4.87 %)
10,884,729
(33.93 %)
63,610
(2.71 %)
368 great fruit-eating bat (v2 hap1 2024)
GCA_038363095.2
n/a 18,051
(1.56 %)
19,955
(1.51 %)
n/a 42.45
(100.00 %)
45
(0.00 %)
487
(100.00 %)
2,841,143
(26.67 %)
379,430
(5.52 %)
11,651,542
(35.11 %)
72,337
(2.76 %)
369 great roundleaf bat (v2 ML-2016 2016)
GCF_001890085.2
50,908
(3.26 %)
18,993
(2.01 %)
19,633
(1.65 %)
41,769
(2.41 %)
41.11
(87.42 %)
172,750
(12.60 %)
7,387
(100.00 %)
2,946,981
(30.72 %)
495,272
(1.05 %)
11,587,728
(25.43 %)
32,949
(0.96 %)
370 greater bulldog bat
GCA_004026585.1
n/a 20,774
(1.62 %)
28,140
(1.63 %)
n/a 40.92
(99.94 %)
6,171
(0.03 %)
304,393
(99.97 %)
3,288,598
(29.60 %)
478,424
(1.16 %)
11,427,553
(35.29 %)
44,124
(1.99 %)
371 Greater cane rat
GCA_004025085.1
n/a 20,383
(0.98 %)
47,456
(1.25 %)
n/a 42.85
(99.83 %)
8,825
(0.03 %)
1,898,466
(99.97 %)
5,569,185
(30.19 %)
946,696
(3.12 %)
13,144,109
(41.83 %)
97,686
(2.61 %)
372 greater horseshoe bat (MPI-CBG alternate hap 2019)
GCA_004115295.1
n/a 14,896
(1.85 %)
18,939
(1.59 %)
n/a 40.69
(100.00 %)
2
(0.00 %)
13,426
(100.00 %)
2,426,330
(34.43 %)
418,341
(1.36 %)
8,763,234
(27.86 %)
24,370
(1.08 %)
373 greater horseshoe bat (MPI-CBG mRhiFer1 2019)
GCA_004115265.3
n/a 18,510
(1.96 %)
20,357
(1.68 %)
n/a 40.54
(99.64 %)
158
(0.36 %)
135
(100.00 %)
3,547,476
(40.33 %)
564,790
(1.35 %)
12,217,002
(29.39 %)
32,445
(1.06 %)
374 greater horseshoe bat (v2 MPI-CBG 2019)
GCF_004115265.2
53,353
(3.13 %)
18,641
(1.97 %)
20,359
(1.68 %)
n/a 40.54
(99.64 %)
158
(0.36 %)
134
(100.00 %)
3,218,744
(34.52 %)
564,789
(1.35 %)
12,217,020
(29.39 %)
32,445
(1.06 %)
375 greater mouse-eared bat (2020 Bat1K)
GCF_014108235.1
70,930
(3.43 %)
19,052
(1.84 %)
21,498
(1.73 %)
n/a 43.11
(98.55 %)
538
(1.45 %)
93
(100.00 %)
3,088,083
(26.27 %)
753,124
(2.84 %)
10,383,466
(35.84 %)
61,023
(2.69 %)
376 Greater mouse-tailed bat (20210906_DDa alternate hap 2024)
GCA_043880455.1
n/a 16,611
(1.60 %)
22,294
(1.43 %)
n/a 42.59
(100.00 %)
n/a 8,359
(100.00 %)
4,914,747
(44.93 %)
593,619
(4.20 %)
10,708,461
(39.52 %)
222,795
(3.47 %)
377 greater mouse-tailed bat (20210906_DDa primary hap 2024)
GCA_043880545.1
n/a 18,582
(1.55 %)
20,954
(1.35 %)
n/a 42.46
(100.00 %)
152
(0.00 %)
106
(100.00 %)
4,158,629
(40.30 %)
696,150
(4.67 %)
12,702,667
(41.11 %)
257,446
(3.38 %)
378 greater sac-winged bat (alternate hap 2024)
GCA_036850925.1
n/a 17,838
(1.44 %)
21,425
(1.45 %)
n/a 41.86
(100.00 %)
n/a 2,167
(100.00 %)
6,139,040
(42.07 %)
974,353
(2.52 %)
11,694,399
(43.03 %)
96,465
(2.06 %)
379 greater sac-winged bat (primary hap 2024 refseq)
GCF_036850765.1
55,259
(2.53 %)
18,321
(1.40 %)
21,048
(1.35 %)
n/a 41.71
(98.73 %)
468
(1.27 %)
256
(100.00 %)
4,247,145
(29.53 %)
1,031,385
(2.50 %)
12,465,157
(43.30 %)
101,620
(2.01 %)
380 greater spear-nosed bat (2021 Texas Tech U)
GCF_019186645.2
50,563
(2.96 %)
18,224
(1.70 %)
20,689
(1.67 %)
n/a 42.27
(100.00 %)
55
(0.00 %)
534
(100.00 %)
2,961,591
(0.00 %)
387,908
(0.97 %)
12,179,612
(30.91 %)
62,189
(5.35 %)
381 grey whale
GCA_004363415.1
n/a 21,827
(1.52 %)
32,191
(1.24 %)
n/a 41.22
(99.88 %)
10,622
(0.04 %)
1,046,770
(99.96 %)
4,841,166
(45.56 %)
780,015
(1.83 %)
13,559,563
(39.86 %)
72,343
(1.59 %)
382 grey whale (mEscRob2 alternate hap 2023)
GCA_028021475.1
n/a 19,129
(1.37 %)
24,628
(1.24 %)
n/a 41.83
(100.00 %)
n/a 14,442
(100.00 %)
3,892,130
(35.74 %)
874,864
(15.70 %)
11,484,916
(45.69 %)
73,507
(1.72 %)
383 grey whale (primary hap 2023 genbank)
GCA_028021215.1
n/a 19,288
(1.38 %)
21,791
(1.21 %)
n/a 41.74
(100.00 %)
279
(0.00 %)
704
(100.00 %)
4,116,900
(35.85 %)
966,065
(16.74 %)
12,154,173
(46.39 %)
77,011
(1.59 %)
384 grey whale (primary hap 2023 refseq)
GCF_028021215.1
49,276
(1.90 %)
19,295
(1.38 %)
21,790
(1.21 %)
n/a 41.74
(100.00 %)
279
(0.00 %)
703
(100.00 %)
4,116,894
(35.85 %)
966,064
(16.74 %)
12,154,101
(46.39 %)
77,011
(1.59 %)
385 hairy big-eared bat (US037 2019 Broad)
GCA_004026765.1
n/a 21,360
(1.44 %)
37,376
(1.52 %)
n/a 42.38
(99.94 %)
3,218
(0.01 %)
553,308
(99.99 %)
3,519,246
(30.77 %)
393,318
(0.85 %)
12,525,258
(34.42 %)
84,875
(2.37 %)
386 Hanaki's dwarf bat (2024)
GCA_964339955.1
n/a 17,856
(1.76 %)
20,604
(1.75 %)
n/a 42.55
(100.00 %)
306
(0.00 %)
141
(100.00 %)
3,697,250
(33.21 %)
842,827
(8.27 %)
10,094,062
(38.40 %)
61,715
(2.96 %)
387 Hanaki's dwarf bat (2025)
GCA_964339955.5
n/a 17,654
(1.85 %)
20,599
(1.75 %)
n/a 42.55
(100.00 %)
306
(0.00 %)
141
(100.00 %)
4,660,276
(45.88 %)
842,822
(8.27 %)
10,093,872
(38.40 %)
61,715
(2.96 %)
388 harbor porpoise (alternate hap 2024)
GCA_963924725.1
n/a 19,112
(1.54 %)
22,516
(1.29 %)
n/a 42.02
(100.00 %)
n/a 7,636
(100.00 %)
4,295,938
(43.35 %)
1,111,088
(11.90 %)
12,254,452
(42.18 %)
77,325
(3.31 %)
389 harbor porpoise (primary hap 2024 genbank)
GCA_963924675.1
n/a 18,529
(1.58 %)
20,583
(1.34 %)
n/a 41.72
(99.99 %)
966
(0.01 %)
442
(100.00 %)
3,760,716
(36.18 %)
888,368
(7.18 %)
12,379,240
(39.04 %)
71,530
(2.69 %)
390 harbor porpoise (primary hap 2024 refseq)
GCF_963924675.1
33,578
(1.54 %)
18,528
(1.58 %)
20,582
(1.34 %)
n/a 41.72
(99.99 %)
966
(0.01 %)
1,405
(99.99 %)
3,760,713
(36.18 %)
888,368
(7.18 %)
12,379,181
(39.04 %)
71,530
(2.69 %)
391 harbor seal
GCF_004348235.1
50,657
(2.98 %)
19,484
(1.76 %)
20,771
(1.44 %)
33,296
(1.58 %)
41.38
(99.09 %)
16,480
(0.91 %)
21,161
(99.09 %)
4,526,182
(43.28 %)
576,921
(1.11 %)
13,421,780
(33.06 %)
54,592
(1.70 %)
392 Hawaiian monk seal (2021 Johns Hopkins U)
GCF_002201575.2
37,605
(1.99 %)
19,483
(1.73 %)
19,767
(1.35 %)
n/a 41.41
(98.23 %)
25,763
(1.77 %)
7,487
(100.00 %)
4,575,217
(43.59 %)
583,394
(1.11 %)
13,374,131
(33.69 %)
52,067
(1.50 %)
393 hazel dormouse
GCA_004027005.1
n/a 21,556
(1.24 %)
40,971
(1.33 %)
n/a 41.60
(99.91 %)
15,076
(0.06 %)
481,881
(99.94 %)
6,679,641
(33.98 %)
1,653,419
(3.72 %)
12,685,676
(43.98 %)
71,478
(1.57 %)
394 hazel dormouse (alternate hap 2023)
GCA_963383665.1
n/a 11,130
(1.23 %)
22,071
(1.36 %)
n/a 42.15
(99.99 %)
n/a 31,856
(100.00 %)
2,958,239
(41.25 %)
788,242
(4.52 %)
6,056,268
(41.88 %)
36,143
(1.96 %)
395 hazel dormouse (primary hap 2023)
GCA_963383645.1
n/a 18,620
(1.42 %)
22,403
(1.38 %)
n/a 41.73
(99.99 %)
1,805
(0.01 %)
214
(100.00 %)
6,063,911
(41.66 %)
1,593,657
(4.46 %)
12,229,281
(43.98 %)
71,058
(1.88 %)
396 hippopotamus (BS01 2019 Broad)
GCA_004027065.1
n/a 24,267
(1.55 %)
34,820
(1.30 %)
n/a 41.43
(99.91 %)
4,730
(0.02 %)
972,599
(99.98 %)
4,579,311
(41.26 %)
606,731
(1.02 %)
14,514,493
(36.58 %)
54,753
(1.59 %)
397 hippopotamus (HIP001 2018)
GCA_002995585.1
n/a 22,343
(1.70 %)
31,687
(1.45 %)
n/a 40.96
(94.63 %)
153,125
(5.38 %)
281,897
(94.62 %)
3,952,905
(38.55 %)
476,243
(1.97 %)
14,216,817
(27.43 %)
48,380
(1.43 %)
398 hippopotamus (mHipAmp2 hap1 2023)
GCA_030028035.1
n/a 20,391
(1.63 %)
20,668
(1.37 %)
n/a 41.62
(100.00 %)
83
(0.00 %)
545
(100.00 %)
3,778,764
(35.17 %)
563,345
(3.63 %)
13,524,869
(35.56 %)
48,164
(1.90 %)
399 hippopotamus (v2 hap2 2023 refseq)
GCF_030028045.1
64,153
(2.73 %)
20,331
(1.62 %)
20,633
(1.37 %)
n/a 41.60
(100.00 %)
226
(0.00 %)
357
(100.00 %)
3,783,440
(35.17 %)
567,797
(3.38 %)
13,462,531
(35.48 %)
48,365
(1.91 %)
400 hirola (BS46 2019 Broad)
GCA_004027495.1
n/a 22,264
(1.40 %)
36,984
(1.26 %)
n/a 42.31
(99.93 %)
9,287
(0.03 %)
545,176
(99.97 %)
5,809,405
(48.62 %)
465,001
(1.08 %)
13,326,245
(42.35 %)
48,312
(1.15 %)
401 Hispaniolan solenodon
GCA_004363575.1
n/a 18,805
(1.55 %)
27,454
(1.64 %)
n/a 39.98
(99.96 %)
5,186
(0.02 %)
181,804
(99.98 %)
2,669,787
(26.78 %)
431,610
(1.04 %)
13,429,711
(27.35 %)
53,444
(2.30 %)
402 hispid cotton rat
GCA_004025045.1
n/a 25,324
(1.49 %)
31,681
(1.31 %)
39,953
(1.43 %)
39.77
(99.89 %)
13,744
(0.05 %)
897,290
(99.95 %)
4,384,099
(28.17 %)
1,132,313
(3.34 %)
14,729,737
(38.08 %)
17,558
(0.40 %)
403 Hoffmann's two-fingered sloth
GCA_000164785.2
n/a 24,546
(1.30 %)
30,273
(1.15 %)
n/a 39.80
(98.09 %)
101,085
(1.91 %)
370,035
(98.09 %)
5,145,551
(52.20 %)
614,819
(1.62 %)
17,932,269
(39.26 %)
55,943
(1.04 %)
404 hog-nosed bat
GCA_004027555.1
n/a 20,591
(1.30 %)
39,589
(1.39 %)
n/a 40.99
(99.88 %)
6,224
(0.03 %)
1,230,480
(99.97 %)
4,081,924
(31.12 %)
1,008,077
(2.20 %)
12,068,828
(39.98 %)
55,567
(2.02 %)
405 Honduran yellow-shouldered bat (v2.1 Veracruz 20B 2020)
GCF_014824575.3
49,071
(2.78 %)
17,588
(1.64 %)
19,357
(1.60 %)
n/a 42.32
(99.79 %)
38,648
(0.21 %)
25,848
(100.00 %)
2,708,400
(27.89 %)
366,870
(1.48 %)
11,795,308
(31.27 %)
59,066
(1.72 %)
406 horse (maternal 2024)
GCA_036418255.1
n/a 16,789
(1.65 %)
18,017
(1.36 %)
n/a 42.07
(100.00 %)
210
(0.00 %)
821
(100.00 %)
3,146,381
(34.68 %)
430,664
(5.91 %)
13,246,059
(32.62 %)
37,293
(2.80 %)
407 horse (paternal hap 2024)
GCA_036426135.1
n/a 19,073
(1.67 %)
20,636
(1.38 %)
n/a 42.08
(100.00 %)
114
(0.00 %)
602
(100.00 %)
3,521,953
(35.39 %)
461,571
(5.26 %)
14,833,688
(32.77 %)
43,527
(2.54 %)
408 horse (thoroughbred H_3958 2024)
GCF_041296265.1
124,629
(3.91 %)
18,742
(1.47 %)
21,901
(1.39 %)
n/a 42.90
(99.96 %)
5
(0.04 %)
625
(100.00 %)
3,600,073
(33.96 %)
709,759
(8.89 %)
14,396,691
(35.72 %)
48,802
(5.67 %)
409 horse (Twilight 2018)
GCF_002863925.1
76,388
(4.03 %)
18,997
(1.73 %)
20,914
(1.42 %)
113,346
(6.08 %)
41.50
(99.62 %)
6,294
(0.38 %)
4,701
(100.00 %)
4,080,319
(44.85 %)
395,037
(1.44 %)
15,169,517
(29.93 %)
44,825
(1.77 %)
410 house mouse (129S1_SvImJv1 2016)
GCA_001624185.1
n/a 21,289
(2.22 %)
18,626
(1.42 %)
102,148
(4.16 %)
41.77
(85.00 %)
366,945
(15.05 %)
62,882
(95.15 %)
5,075,137
(40.38 %)
1,400,072
(2.80 %)
13,497,076
(26.20 %)
16,957
(0.40 %)
411 house mouse (129S1_SvImJ_v3 2022)
GCA_921998555.2
n/a 21,780
(2.13 %)
19,436
(1.37 %)
110,376
(4.47 %)
41.79
(99.60 %)
1,557
(0.40 %)
188
(100.00 %)
4,653,663
(40.74 %)
1,550,342
(3.54 %)
12,930,784
(35.48 %)
23,211
(0.57 %)
412 house mouse (AKR_J v3 2022)
GCA_922000895.2
n/a 21,721
(2.13 %)
19,324
(1.37 %)
110,654
(4.48 %)
41.80
(99.85 %)
2,714
(0.15 %)
201
(100.00 %)
4,645,513
(40.70 %)
1,547,237
(3.56 %)
13,016,932
(35.69 %)
23,309
(0.57 %)
413 house mouse (alternate hap 2023)
GCA_949316305.1
n/a 661
(0.88 %)
720
(0.54 %)
n/a 38.59
(100.00 %)
n/a 1,806
(100.00 %)
97,279
(72.21 %)
40,071
(55.89 %)
208,928
(64.94 %)
506
(0.31 %)
414 house mouse (A_J v3 2022)
GCA_921998355.2
n/a 21,869
(2.13 %)
19,400
(1.37 %)
110,389
(4.48 %)
41.80
(99.39 %)
608
(0.61 %)
163
(100.00 %)
4,668,553
(40.80 %)
1,556,835
(3.58 %)
12,995,938
(35.53 %)
23,203
(0.56 %)
415 house mouse (BALB_cJ v3 2022)
GCA_921997145.2
n/a 21,891
(2.13 %)
19,499
(1.37 %)
110,461
(4.47 %)
41.79
(99.80 %)
274
(0.20 %)
217
(100.00 %)
4,673,990
(40.79 %)
1,560,327
(3.63 %)
13,018,071
(35.70 %)
23,196
(0.56 %)
416 house mouse (C3H_HeJ v3 2022)
GCA_921997125.2
n/a 21,793
(2.13 %)
19,516
(1.38 %)
110,049
(4.46 %)
41.79
(99.05 %)
844
(0.95 %)
174
(100.00 %)
4,657,005
(40.76 %)
1,551,107
(3.53 %)
12,949,100
(35.32 %)
23,262
(0.56 %)
417 house mouse (C57BL/6J 2012)
GCA_000185105.2
n/a 21,313
(2.28 %)
19,336
(1.53 %)
n/a 41.71
(91.01 %)
189,267
(9.02 %)
191,581
(90.98 %)
4,937,032
(40.05 %)
1,409,489
(2.64 %)
13,090,524
(27.69 %)
16,523
(0.40 %)
418 house mouse (C57BL_6J T2T 2024)
GCA_964188535.1
n/a 21,496
(1.92 %)
19,278
(1.25 %)
n/a 41.31
(99.85 %)
108
(0.15 %)
345
(99.85 %)
4,519,975
(46.81 %)
1,564,206
(14.33 %)
12,267,542
(42.16 %)
23,119
(0.55 %)
419 house mouse (CBA_J v3 2022)
GCA_921998905.2
n/a 21,829
(2.13 %)
19,841
(1.39 %)
110,858
(4.48 %)
41.79
(99.52 %)
658
(0.48 %)
145
(100.00 %)
4,658,032
(40.77 %)
1,552,298
(3.59 %)
12,948,038
(35.52 %)
23,232
(0.56 %)
420 house mouse (DBA_2J v3 2022)
GCA_921998315.2
n/a 22,302
(2.08 %)
19,749
(1.35 %)
113,269
(4.42 %)
41.72
(100.00 %)
153
(0.00 %)
361
(100.00 %)
4,785,676
(41.69 %)
1,597,598
(4.56 %)
13,190,158
(36.58 %)
24,140
(0.59 %)
421 house mouse (FVB_NJ v3 2022)
GCA_921998635.2
n/a 21,633
(2.15 %)
19,565
(1.40 %)
110,246
(4.50 %)
41.82
(98.35 %)
6,244
(1.65 %)
384
(100.00 %)
4,621,601
(40.42 %)
1,537,622
(3.48 %)
12,818,729
(34.77 %)
22,696
(0.55 %)
422 house mouse (LP_J v3 2022)
GCA_947599735.1
n/a 22,452
(1.91 %)
19,841
(1.23 %)
110,073
(3.98 %)
41.29
(99.99 %)
386
(0.01 %)
515
(100.00 %)
4,839,574
(46.33 %)
1,645,163
(11.88 %)
12,936,515
(41.49 %)
24,374
(0.54 %)
423 house mouse (NOD_ShiLtJ v3 2022)
GCA_921998325.2
n/a 21,797
(2.13 %)
19,521
(1.38 %)
109,890
(4.48 %)
41.80
(99.50 %)
1,462
(0.50 %)
170
(100.00 %)
4,650,016
(40.74 %)
1,547,220
(3.54 %)
12,918,125
(35.45 %)
23,253
(0.56 %)
424 house mouse (NZO_HlLtJ v3 2022)
GCA_947593165.1
n/a 22,481
(1.93 %)
19,932
(1.26 %)
109,670
(4.03 %)
41.34
(100.00 %)
234
(0.00 %)
441
(100.00 %)
4,822,230
(45.92 %)
1,637,027
(11.19 %)
13,082,730
(41.04 %)
24,187
(0.54 %)
425 house mouse (primary hap 2023)
GCA_949316315.1
n/a 22,351
(1.96 %)
19,629
(1.26 %)
n/a 41.38
(100.00 %)
101
(0.00 %)
179
(100.00 %)
4,774,018
(45.31 %)
1,620,102
(10.50 %)
13,181,250
(40.47 %)
23,955
(0.54 %)
426 house mouse C57BL/6J 2020 GRC
GCF_000001635.27
136,224
(4.84 %)
22,409
(2.02 %)
19,480
(1.31 %)
140,725
(4.83 %)
41.67
(97.30 %)
334
(2.70 %)
22,273
(97.30 %)
5,361,085
(45.51 %)
1,641,063
(3.41 %)
12,722,791
(36.04 %)
23,794
(0.53 %)
427 house mouse C57BL_6NJ (2016)
GCA_001632555.1
n/a 21,177
(2.23 %)
18,495
(1.42 %)
103,002
(4.20 %)
41.76
(82.53 %)
410,660
(17.53 %)
49,821
(96.37 %)
5,081,049
(40.22 %)
1,392,942
(2.58 %)
13,476,268
(25.21 %)
16,877
(0.39 %)
428 house mouse C57BL_6NJ (2022)
GCA_921999865.2
n/a 21,817
(2.13 %)
19,349
(1.37 %)
n/a 41.79
(99.76 %)
1,127
(0.24 %)
214
(100.00 %)
4,661,104
(40.76 %)
1,552,079
(3.56 %)
12,953,662
(35.57 %)
23,204
(0.56 %)
429 humpback whale (KW2013002 2024)
GCA_041834305.1
n/a 19,463
(1.32 %)
22,424
(1.19 %)
n/a 42.05
(100.00 %)
88
(0.00 %)
1,355
(100.00 %)
4,164,459
(34.02 %)
1,281,751
(18.33 %)
12,412,281
(48.28 %)
82,412
(1.67 %)
430 Iberian mole (v2.1 TD23 2020)
GCF_014898055.3
56,986
(3.41 %)
18,431
(1.69 %)
20,317
(1.59 %)
n/a 41.89
(99.89 %)
3,575
(0.11 %)
3,202
(100.00 %)
2,635,974
(23.38 %)
496,514
(1.29 %)
10,969,546
(32.61 %)
47,466
(2.89 %)
431 Indian false vampire
GCA_004026885.1
n/a 20,067
(1.37 %)
36,544
(1.53 %)
32,548
(1.37 %)
40.84
(99.83 %)
6,266
(0.02 %)
1,909,067
(99.98 %)
4,096,409
(31.50 %)
699,311
(1.81 %)
12,307,198
(39.96 %)
92,830
(3.12 %)
432 Indian flying fox
GCF_902729225.1
64,763
(3.85 %)
18,222
(2.01 %)
23,187
(1.82 %)
45,389
(2.18 %)
39.83
(99.10 %)
17,500
(0.90 %)
16,113
(100.00 %)
2,972,300
(34.11 %)
487,157
(1.49 %)
12,486,528
(27.37 %)
57,869
(3.73 %)
433 Indian short-nosed fruit bat (CYSPWHU 2023)
GCA_030015415.1
n/a 17,560
(2.04 %)
21,687
(1.83 %)
n/a 39.77
(100.00 %)
26
(0.00 %)
181
(100.00 %)
2,598,385
(30.48 %)
486,921
(1.41 %)
11,828,726
(27.28 %)
37,476
(5.58 %)
434 Indochinese shrew (US011 2019 Broad)
GCA_004027635.1
n/a 18,870
(0.51 %)
55,636
(0.81 %)
n/a 39.81
(99.83 %)
5,267
(0.02 %)
2,420,679
(99.98 %)
4,130,068
(16.60 %)
1,663,335
(3.30 %)
18,728,711
(46.19 %)
31,453
(0.55 %)
435 Indus River dolphin
GCA_004363435.1
n/a 24,321
(1.30 %)
47,065
(1.14 %)
n/a 41.72
(99.88 %)
11,702
(0.04 %)
1,110,492
(99.96 %)
5,093,308
(45.60 %)
845,860
(1.72 %)
13,162,111
(41.37 %)
68,257
(1.40 %)
436 Inner Mongolia cashmere goat (2024)
GCA_041735815.1
n/a 19,123
(1.40 %)
21,508
(1.26 %)
n/a 43.19
(100.00 %)
n/a 31
(100.00 %)
3,982,368
(23.76 %)
650,129
(7.44 %)
12,858,872
(44.33 %)
99,144
(2.87 %)
437 intermediate horseshoe bat (China 20211001_DDa alternate hap 2024)
GCA_043727925.1
n/a 17,564
(1.87 %)
20,064
(1.66 %)
n/a 41.05
(100.00 %)
n/a 2,194
(100.00 %)
3,406,902
(41.38 %)
537,189
(4.88 %)
11,454,141
(30.99 %)
32,338
(1.09 %)
438 intermediate horseshoe bat (China 20211001_DDa primary hap 2024)
GCA_043728065.1
n/a 18,239
(1.76 %)
20,378
(1.53 %)
n/a 41.40
(100.00 %)
37
(0.00 %)
2,195
(100.00 %)
3,438,644
(42.82 %)
584,006
(9.54 %)
12,207,998
(35.49 %)
34,491
(1.02 %)
439 intermediate roundleaf bat (primary hap 2023)
GCA_031876335.1
n/a 19,064
(1.67 %)
20,800
(1.49 %)
n/a 41.55
(100.00 %)
119
(0.00 %)
69
(100.00 %)
3,393,548
(30.92 %)
723,545
(6.58 %)
12,073,117
(35.40 %)
43,736
(1.20 %)
440 jaguar (BS21 2019)
GCA_004023805.1
n/a 21,431
(1.51 %)
32,835
(1.35 %)
n/a 41.70
(99.89 %)
21,329
(0.09 %)
460,121
(99.91 %)
5,420,861
(43.75 %)
1,049,353
(1.93 %)
13,848,545
(34.90 %)
71,066
(2.37 %)
441 jaguar (hap1 2025)
GCA_046562885.1
n/a 17,882
(1.68 %)
19,103
(1.41 %)
n/a 41.66
(100.00 %)
140
(0.00 %)
115
(100.00 %)
4,622,385
(41.25 %)
893,297
(1.89 %)
12,851,116
(33.53 %)
61,319
(2.55 %)
442 jaguar (hap1 2025)
GCA_046562885.2
n/a 17,884
(1.68 %)
19,104
(1.41 %)
n/a 41.66
(100.00 %)
140
(0.00 %)
115
(100.00 %)
4,733,274
(41.33 %)
893,297
(1.89 %)
12,851,116
(33.53 %)
61,319
(2.55 %)
443 jaguar (hap2 2025)
GCA_046562875.1
n/a 18,867
(1.64 %)
20,784
(1.40 %)
n/a 41.76
(100.00 %)
200
(0.00 %)
85
(100.00 %)
4,977,843
(41.75 %)
982,064
(2.10 %)
13,365,332
(34.16 %)
66,000
(2.75 %)
444 jaguar (hap2 2025)
GCA_046562875.2
n/a 18,869
(1.64 %)
20,781
(1.40 %)
n/a 41.76
(100.00 %)
200
(0.00 %)
85
(100.00 %)
5,097,971
(41.83 %)
982,064
(2.10 %)
13,365,332
(34.16 %)
66,000
(2.75 %)
445 jaguar (Sample0147 2023)
GCF_028533385.1
71,578
(4.12 %)
19,122
(1.67 %)
21,950
(1.36 %)
n/a 41.58
(99.31 %)
56,371
(0.70 %)
36,243
(100.00 %)
4,552,854
(33.37 %)
897,371
(1.63 %)
13,732,912
(32.89 %)
63,777
(2.41 %)
446 jaguarundi
GCF_014898765.1
72,564
(3.15 %)
18,602
(1.64 %)
20,510
(1.39 %)
n/a 41.75
(97.85 %)
42,499
(2.16 %)
10,948
(100.00 %)
5,035,745
(43.29 %)
907,329
(1.61 %)
13,590,905
(33.57 %)
69,090
(2.29 %)
447 Jamaican fruit-eating bat (1a 2020 Wuhan U)
GCF_014825515.1
48,692
(2.72 %)
19,921
(1.66 %)
23,614
(1.68 %)
39,384
(2.12 %)
41.95
(98.87 %)
110,840
(1.13 %)
56,740
(100.00 %)
2,972,388
(28.79 %)
405,474
(2.15 %)
12,458,880
(30.65 %)
61,973
(1.87 %)
448 Jamaican fruit-eating bat (2021)
GCF_021234435.1
55,114
(3.18 %)
17,875
(1.68 %)
19,958
(1.66 %)
n/a 42.00
(100.00 %)
3
(0.00 %)
868
(100.00 %)
2,697,287
(28.17 %)
318,700
(0.84 %)
11,750,329
(31.61 %)
61,951
(1.93 %)
449 Japanese wild mouse (2022)
GCA_921999095.2
n/a 23,292
(2.05 %)
20,114
(1.31 %)
n/a 41.71
(100.00 %)
397
(0.00 %)
1,449
(100.00 %)
4,952,306
(42.53 %)
1,635,456
(4.60 %)
12,838,321
(38.56 %)
24,168
(0.56 %)
450 Java mouse-deer (US108 2019 Broad)
GCA_004024965.1
n/a 23,081
(1.38 %)
38,181
(1.41 %)
n/a 42.73
(99.91 %)
2,829
(0.01 %)
1,159,819
(99.99 %)
4,791,310
(34.97 %)
448,498
(1.92 %)
13,175,375
(39.89 %)
68,778
(2.92 %)
451 killer whale (2022)
GCF_937001465.1
78,479
(3.76 %)
18,710
(1.51 %)
21,101
(1.30 %)
34,448
(1.49 %)
41.91
(100.00 %)
123
(0.00 %)
448
(100.00 %)
3,955,401
(36.81 %)
844,672
(9.94 %)
12,233,568
(41.63 %)
77,307
(3.08 %)
452 killer whale (alternate hap 2022)
GCA_937001455.1
n/a 14,982
(1.50 %)
19,185
(1.30 %)
n/a 42.13
(100.00 %)
n/a 12,410
(100.00 %)
2,752,892
(35.61 %)
589,217
(10.15 %)
8,371,032
(41.11 %)
57,347
(3.41 %)
453 killer whale (Morgan 2013)
GCF_000331955.2
70,972
(3.55 %)
18,736
(1.86 %)
20,365
(1.48 %)
n/a 41.35
(94.82 %)
78,441
(5.20 %)
80,100
(94.80 %)
3,978,339
(43.98 %)
555,737
(1.13 %)
12,773,973
(31.51 %)
61,145
(1.59 %)
454 killer whale (primary hap 2022)
GCA_937001465.1
n/a 18,847
(1.59 %)
21,099
(1.30 %)
n/a 41.91
(100.00 %)
123
(0.00 %)
448
(100.00 %)
4,361,647
(43.69 %)
844,672
(9.94 %)
12,233,548
(41.63 %)
77,307
(3.08 %)
455 klipspringer (KSP-560 2019)
GCA_006410675.1
n/a 22,317
(1.37 %)
27,606
(1.31 %)
n/a 42.04
(89.74 %)
371,212
(10.28 %)
396,104
(89.72 %)
6,379,883
(45.04 %)
726,514
(5.64 %)
15,472,957
(34.77 %)
50,579
(1.00 %)
456 koala (Bilbo 61053 2022)
GCA_003287225.2
n/a 17,087
(0.81 %)
14,711
(0.86 %)
n/a 39.05
(100.00 %)
669
(0.00 %)
1,246
(100.00 %)
6,280,029
(29.77 %)
1,123,294
(2.02 %)
21,796,316
(39.24 %)
15,957
(0.35 %)
457 koala (Bilbo 61053 2022)
GCF_003287225.1
50,393
(2.58 %)
17,125
(0.85 %)
14,711
(0.86 %)
n/a 39.05
(100.00 %)
669
(0.00 %)
1,246
(100.00 %)
10,370,789
(60.23 %)
1,123,294
(2.02 %)
21,796,035
(39.24 %)
15,957
(0.35 %)
458 koala (Bilbo 61053 2025)
GCA_003287225.3
n/a 17,123
(0.85 %)
14,700
(0.86 %)
n/a 39.06
(100.00 %)
664
(0.00 %)
1,239
(100.00 %)
10,358,875
(60.22 %)
1,121,543
(2.02 %)
21,754,367
(39.21 %)
15,940
(0.35 %)
459 Kuhl's pipistrelle (2020)
GCF_014108245.1
65,654
(3.37 %)
17,918
(1.89 %)
20,819
(1.86 %)
n/a 42.57
(99.31 %)
394
(0.69 %)
202
(100.00 %)
2,897,422
(23.58 %)
797,420
(2.76 %)
10,057,100
(34.56 %)
55,965
(2.99 %)
460 Kuhl's pipistrelle (primary hap 2025)
GCA_014108245.2
n/a 17,770
(2.01 %)
20,646
(1.86 %)
n/a 42.57
(99.31 %)
522
(0.69 %)
82
(100.00 %)
4,542,064
(41.94 %)
797,434
(2.76 %)
10,057,037
(34.56 %)
55,766
(2.87 %)
461 large flying fox
GCF_000151845.1
52,243
(3.10 %)
18,454
(1.91 %)
23,631
(1.73 %)
n/a 39.82
(91.80 %)
189,340
(8.24 %)
225,433
(91.76 %)
3,117,045
(36.49 %)
504,277
(3.03 %)
13,025,556
(25.00 %)
78,404
(3.24 %)
462 large Japanese field mouse (IB14-021 2017)
GCA_002335545.1
n/a 22,630
(1.74 %)
33,810
(1.26 %)
n/a 42.04
(57.78 %)
4,289,924
(42.35 %)
4,626,044
(57.65 %)
3,638,537
(31.76 %)
1,048,253
(1.87 %)
12,039,926
(16.61 %)
19,817
(0.34 %)
463 large tree shrew (BS70 2022)
GCA_026018925.1
n/a 21,678
(1.34 %)
22,317
(1.25 %)
n/a 42.17
(100.00 %)
1,188
(0.00 %)
1,198
(100.00 %)
5,530,547
(22.20 %)
1,357,640
(10.13 %)
14,334,312
(46.09 %)
123,453
(2.17 %)
464 large tree shrew (BS70 2025)
GCA_026018925.2
n/a 21,760
(1.34 %)
22,479
(1.26 %)
n/a 42.17
(100.00 %)
1,263
(0.00 %)
1,209
(100.00 %)
6,876,878
(36.82 %)
1,357,671
(10.13 %)
14,333,971
(46.09 %)
123,449
(2.17 %)
465 least weasel (hap1.1 2025)
GCA_964662115.1
n/a 19,085
(1.11 %)
23,074
(1.09 %)
n/a 43.54
(99.98 %)
2,938
(0.02 %)
3,189
(100.00 %)
4,687,333
(25.05 %)
908,610
(10.98 %)
12,922,050
(49.64 %)
68,749
(2.22 %)
466 least weasel (hap2.1 2025)
GCA_964662095.1
n/a 18,255
(1.29 %)
22,201
(1.27 %)
n/a 42.68
(99.98 %)
2,709
(0.02 %)
4,948
(99.98 %)
4,268,233
(27.47 %)
787,850
(6.40 %)
12,592,088
(42.54 %)
62,416
(2.34 %)
467 leopard (Hobbes primary hap 2022)
GCF_024362965.1
70,501
(3.29 %)
18,472
(1.56 %)
20,388
(1.41 %)
n/a 41.75
(99.99 %)
335
(0.01 %)
382
(100.00 %)
4,634,038
(33.80 %)
932,991
(2.25 %)
13,686,652
(34.03 %)
65,793
(2.64 %)
468 leopard (Maewha 2016 refseq)
GCF_001857705.1
73,279
(3.20 %)
18,881
(1.63 %)
21,010
(1.44 %)
n/a 41.71
(96.17 %)
214,953
(3.85 %)
265,330
(96.15 %)
5,247,029
(42.87 %)
1,059,446
(5.13 %)
14,265,573
(32.20 %)
77,001
(2.45 %)
469 leopard cat
GCF_016509475.1
59,965
(3.05 %)
18,472
(1.65 %)
19,934
(1.38 %)
n/a 41.80
(100.00 %)
56
(0.00 %)
123
(100.00 %)
4,978,115
(43.28 %)
901,754
(1.84 %)
13,596,535
(34.23 %)
67,390
(2.50 %)
470 Leschenault's rousette (2020)
GCA_015472975.1
n/a 17,815
(2.05 %)
23,917
(1.90 %)
n/a 40.13
(99.14 %)
100,669
(0.88 %)
108,810
(99.12 %)
2,688,705
(31.20 %)
428,968
(1.19 %)
12,245,385
(26.51 %)
58,118
(6.81 %)
471 lesser Egyptian jerboa (2021)
GCF_020740685.1
51,730
(1.99 %)
20,129
(1.24 %)
22,089
(1.24 %)
40,414
(1.76 %)
42.00
(99.52 %)
561
(0.48 %)
160
(100.00 %)
7,346,291
(41.25 %)
1,187,587
(2.92 %)
14,222,177
(44.13 %)
34,688
(0.86 %)
472 lesser Egyptian jerboa (alternate hap 2021)
GCA_020740715.1
n/a 17,777
(1.27 %)
19,232
(1.28 %)
n/a 42.13
(92.75 %)
2,875
(7.25 %)
508
(100.00 %)
6,476,967
(33.93 %)
999,133
(2.78 %)
11,809,834
(40.52 %)
29,872
(0.82 %)
473 lesser Egyptian jerboa (JJ0015 2012 refseq)
GCF_000280705.1
25,978
(1.44 %)
19,408
(1.38 %)
20,312
(1.35 %)
n/a 41.87
(87.17 %)
326,464
(12.87 %)
337,360
(87.13 %)
6,125,934
(38.31 %)
832,825
(1.53 %)
13,661,612
(33.98 %)
26,669
(0.59 %)
474 lesser Egyptian jerboa (primary hap 2021)
GCA_020740685.1
n/a 20,129
(1.24 %)
22,086
(1.24 %)
n/a 42.00
(99.52 %)
561
(0.48 %)
159
(100.00 %)
6,288,871
(38.51 %)
1,187,585
(2.92 %)
14,221,962
(44.13 %)
34,688
(0.86 %)
475 lesser false vampire bat (Vietnam 20211001_DDb alternate hap 2024)
GCA_043880535.1
n/a 1,572
(0.57 %)
3,175
(1.45 %)
n/a 41.82
(100.00 %)
n/a 2,678
(100.00 %)
286,260
(35.16 %)
107,917
(13.71 %)
1,232,326
(51.86 %)
5,144
(2.91 %)
476 lesser false vampire bat (Vietnam 20211001_DDb primary hap 2024)
GCA_043880595.1
n/a 18,484
(1.87 %)
24,356
(1.84 %)
n/a 41.88
(97.91 %)
866
(2.09 %)
617
(99.68 %)
3,419,622
(36.65 %)
663,182
(2.53 %)
11,508,574
(30.58 %)
84,174
(4.85 %)
477 lesser horseshoe bat (hap1 2024)
GCA_964194185.1
n/a 19,031
(1.88 %)
21,003
(1.63 %)
n/a 40.81
(99.99 %)
1,627
(0.01 %)
723
(100.00 %)
3,133,745
(33.46 %)
660,064
(3.79 %)
11,720,176
(32.32 %)
35,414
(1.75 %)
478 lesser horseshoe bat (hap2 2024)
GCA_964194215.1
n/a 18,875
(1.72 %)
21,166
(1.58 %)
n/a 41.18
(99.99 %)
1,648
(0.01 %)
2,727
(99.99 %)
3,160,659
(34.00 %)
696,130
(6.23 %)
11,662,645
(34.26 %)
36,176
(1.80 %)
479 lesser horseshoe bat (hap2.2 2025)
GCA_964194215.2
n/a 18,974
(1.81 %)
21,191
(1.58 %)
n/a 41.18
(100.00 %)
56
(0.00 %)
1,036
(100.00 %)
3,652,081
(41.23 %)
696,117
(6.18 %)
11,690,617
(34.28 %)
36,376
(1.84 %)
480 lesser noctule (v2 hap1 2025)
GCA_964264875.2
n/a 18,342
(1.54 %)
22,974
(1.62 %)
n/a 43.04
(100.00 %)
302
(0.00 %)
588
(100.00 %)
4,258,096
(37.31 %)
1,289,911
(11.51 %)
9,694,758
(42.52 %)
65,974
(2.80 %)
481 lesser noctule (v2 hap2 2025)
GCA_964264895.2
n/a 17,492
(1.62 %)
22,188
(1.72 %)
n/a 43.10
(100.00 %)
247
(0.00 %)
920
(100.00 %)
3,886,341
(36.52 %)
1,139,308
(10.89 %)
9,356,457
(40.65 %)
62,254
(3.00 %)
482 lesser panda (RP43 2017)
GCA_002007465.1
n/a 19,120
(1.69 %)
20,591
(1.50 %)
n/a 41.60
(98.56 %)
137,333
(1.45 %)
148,922
(98.55 %)
4,513,888
(40.87 %)
692,778
(1.62 %)
13,691,859
(31.36 %)
64,369
(2.52 %)
483 lesser sac-winged bat (alternate hap 2024)
GCA_036851165.1
n/a 18,593
(1.42 %)
23,334
(1.46 %)
n/a 41.84
(100.00 %)
n/a 4,715
(100.00 %)
6,471,175
(42.04 %)
1,030,472
(2.62 %)
12,509,696
(42.43 %)
96,414
(2.05 %)
484 lesser sac-winged bat (primary hap 2024 refseq)
GCF_036850995.1
53,210
(2.49 %)
18,323
(1.42 %)
21,350
(1.39 %)
n/a 41.84
(99.24 %)
573
(0.76 %)
168
(100.00 %)
4,224,344
(28.69 %)
1,030,576
(2.60 %)
12,591,989
(42.30 %)
98,189
(2.06 %)
485 lion
GCF_018350215.1
67,745
(2.86 %)
17,956
(1.69 %)
19,033
(1.40 %)
61,242
(3.04 %)
41.71
(100.00 %)
55
(0.00 %)
99
(100.00 %)
4,666,951
(42.23 %)
889,987
(1.87 %)
13,151,686
(33.40 %)
62,675
(2.56 %)
486 little brown bat
GCF_000147115.1
50,660
(2.76 %)
19,314
(1.86 %)
22,683
(1.70 %)
n/a 42.50
(96.66 %)
61,131
(3.35 %)
72,785
(96.65 %)
3,682,263
(37.05 %)
634,854
(2.15 %)
10,841,759
(33.45 %)
57,630
(1.79 %)
487 little pocket mouse (longimembris alternate hap 2022)
GCA_024363435.1
n/a 19,150
(1.52 %)
23,435
(1.64 %)
n/a 42.08
(100.00 %)
229
(0.00 %)
718
(100.00 %)
n/a 1,051,300
(12.43 %)
9,858,628
(43.20 %)
48,101
(2.62 %)
488 little pocket mouse (longimembris primary hap 2022)
GCA_024363575.1
n/a 19,760
(1.50 %)
24,317
(1.63 %)
n/a 42.09
(100.00 %)
215
(0.00 %)
1,135
(100.00 %)
3,913,744
(28.43 %)
1,095,577
(12.70 %)
10,273,833
(43.74 %)
49,636
(2.61 %)
489 little tube-nosed bat
GCA_004026665.1
n/a 22,009
(1.26 %)
45,725
(1.35 %)
n/a 43.80
(99.90 %)
6,795
(0.03 %)
886,972
(99.97 %)
3,372,804
(23.57 %)
1,014,476
(3.00 %)
11,948,592
(41.18 %)
71,530
(2.05 %)
490 long-finned pilot whale (alternate hap 2024)
GCA_963455345.2
n/a 17,552
(1.56 %)
25,954
(1.35 %)
n/a 42.12
(100.00 %)
n/a 28,097
(100.00 %)
3,815,058
(48.74 %)
789,873
(8.23 %)
9,845,230
(38.66 %)
58,137
(3.47 %)
491 long-finned pilot whale (v2 primary hap 2024 refseq)
GCF_963455315.2
61,447
(2.80 %)
18,725
(1.51 %)
20,946
(1.39 %)
n/a 42.38
(99.99 %)
1,084
(0.01 %)
2,076
(99.99 %)
4,125,452
(35.62 %)
1,577,896
(12.03 %)
12,347,170
(42.01 %)
71,822
(5.51 %)
492 long-finned pilot whale (X-22926-18 2019)
GCF_006547405.1
66,117
(3.28 %)
18,772
(1.80 %)
21,031
(1.46 %)
33,672
(1.78 %)
41.29
(99.58 %)
14,859
(0.42 %)
20,999
(99.58 %)
3,962,125
(45.58 %)
557,247
(1.11 %)
12,616,535
(34.70 %)
62,905
(1.69 %)
493 long-footed potoroo (2021)
GCA_904812075.1
n/a 278
(19.06 %)
223
(16.20 %)
n/a 51.14
(99.50 %)
n/a 1,479
(100.00 %)
194
(1.83 %)
54
(0.32 %)
2,088
(5.90 %)
51
(2.47 %)
494 long-tailed chinchilla
GCF_000276665.1
54,854
(2.98 %)
18,096
(1.59 %)
19,514
(1.52 %)
n/a 41.06
(95.56 %)
78,817
(4.46 %)
81,656
(95.54 %)
4,018,866
(30.94 %)
607,082
(1.15 %)
13,528,234
(28.15 %)
46,931
(1.25 %)
495 long-tongued fruit bat (US102 2019 Broad)
GCA_004027375.1
n/a 19,208
(1.99 %)
31,180
(1.92 %)
n/a 39.56
(99.97 %)
2,056
(0.01 %)
174,041
(99.99 %)
2,893,453
(32.61 %)
597,516
(1.76 %)
12,093,608
(28.14 %)
63,015
(4.70 %)
496 Lowland paca
GCA_004365215.1
n/a 21,953
(0.62 %)
56,356
(0.80 %)
n/a 40.83
(99.78 %)
3,060
(0.01 %)
3,771,510
(99.99 %)
5,892,507
(29.20 %)
802,811
(1.38 %)
18,630,883
(38.61 %)
61,715
(0.94 %)
497 Malayan pangolin (MJ-LG 2024)
GCF_040802235.1
87,404
(4.24 %)
18,382
(1.54 %)
19,802
(1.30 %)
n/a 41.03
(100.00 %)
90
(0.00 %)
63
(100.00 %)
3,146,889
(38.39 %)
384,539
(2.15 %)
12,642,995
(34.68 %)
48,454
(1.30 %)
498 Malayan pangolin (MP_PG03-UM 2016 refseq)
GCF_001685135.1
48,591
(2.76 %)
19,458
(1.57 %)
24,783
(1.38 %)
41,272
(1.95 %)
40.78
(92.27 %)
984,658
(7.81 %)
80,670
(100.00 %)
3,064,599
(35.21 %)
866,309
(3.08 %)
13,310,859
(28.76 %)
35,558
(0.84 %)
499 Malayan pangolin YNU ManJav 2.0
GCF_014570535.1
68,043
(3.50 %)
18,167
(1.72 %)
20,453
(1.54 %)
n/a 40.83
(91.78 %)
57,746
(8.23 %)
17,969
(100.00 %)
2,864,567
(34.23 %)
277,996
(1.69 %)
12,659,207
(25.72 %)
33,486
(1.00 %)
500 marsupial mole (Waite Creek area ABTC07570 2025)
GCA_048126345.1
n/a 25,281
(0.80 %)
18,740
(0.87 %)
n/a 37.80
(99.99 %)
196
(0.01 %)
889
(99.99 %)
6,538,990
(26.08 %)
1,450,668
(2.40 %)
21,374,371
(47.19 %)
17,923
(0.30 %)
501 Masai giraffe (MA1 2016 Penn St)
GCA_001651235.1
n/a 20,950
(1.52 %)
28,854
(1.33 %)
n/a 41.39
(96.50 %)
257,672
(3.48 %)
770,838
(96.52 %)
5,502,479
(43.94 %)
531,418
(2.64 %)
13,936,018
(36.18 %)
40,504
(1.02 %)
502 meadow jumping mouse
GCA_004024765.1
n/a 22,236
(1.08 %)
44,719
(1.21 %)
n/a 42.31
(99.88 %)
7,610
(0.03 %)
1,165,710
(99.97 %)
6,135,446
(33.31 %)
1,525,146
(3.34 %)
13,854,475
(39.91 %)
26,633
(0.68 %)
503 meadow vole (hap1 2024 genbank)
GCA_037038515.1
n/a 19,134
(1.78 %)
20,672
(1.55 %)
n/a 42.38
(100.00 %)
60
(0.00 %)
181
(100.00 %)
4,818,689
(41.90 %)
962,362
(4.16 %)
12,161,222
(34.42 %)
23,781
(0.74 %)
504 meadow vole (hap1 2024 refseq)
GCF_037038515.1
56,969
(2.88 %)
19,974
(1.74 %)
20,672
(1.55 %)
n/a 42.38
(100.00 %)
60
(0.00 %)
180
(100.00 %)
4,116,239
(33.62 %)
962,362
(4.16 %)
12,161,153
(34.42 %)
23,781
(0.74 %)
505 meadow vole (hap2 2024)
GCA_037039175.1
n/a 19,001
(1.82 %)
20,271
(1.68 %)
n/a 42.58
(100.00 %)
53
(0.00 %)
143
(100.00 %)
3,141,368
(21.37 %)
898,900
(4.24 %)
11,475,531
(32.14 %)
22,186
(0.75 %)
506 meerkat (VVHF042 2019 DNA Zoo refseq)
GCF_006229205.1
58,806
(2.67 %)
19,009
(1.64 %)
19,088
(1.36 %)
n/a 41.68
(99.72 %)
65,245
(0.28 %)
63,791
(100.00 %)
4,564,931
(40.13 %)
634,179
(1.21 %)
13,631,635
(32.17 %)
64,858
(2.22 %)
507 melon-headed whale (hap1 2025)
GCA_051427945.1
n/a 18,643
(1.64 %)
20,840
(1.43 %)
n/a 42.07
(100.00 %)
84
(0.00 %)
204
(100.00 %)
5,100,394
(52.00 %)
1,312,199
(7.54 %)
12,322,262
(38.99 %)
69,873
(4.58 %)
508 melon-headed whale (hap2 2025)
GCA_051427955.1
n/a 17,790
(1.73 %)
19,805
(1.50 %)
n/a 41.92
(100.00 %)
65
(0.00 %)
167
(100.00 %)
4,595,309
(50.05 %)
975,539
(5.44 %)
11,730,402
(37.10 %)
65,883
(3.79 %)
509 Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 alternate hap 2022)
GCA_024711525.1
n/a 18,555
(1.22 %)
24,508
(1.35 %)
n/a 42.04
(100.00 %)
181
(0.00 %)
3,482
(100.00 %)
6,419,007
(53.84 %)
1,384,128
(15.63 %)
11,486,822
(50.51 %)
38,521
(1.60 %)
510 Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 primary hap 2022)
GCA_024711535.1
n/a 21,281
(1.16 %)
28,592
(1.34 %)
n/a 42.27
(100.00 %)
182
(0.00 %)
4,354
(100.00 %)
4,378,955
(29.66 %)
1,568,842
(17.75 %)
12,889,786
(51.96 %)
46,167
(1.71 %)
511 Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 primary hap 2022)
GCF_024711535.1
68,331
(2.37 %)
21,280
(1.16 %)
28,582
(1.34 %)
n/a 42.27
(100.00 %)
182
(0.00 %)
4,535
(100.00 %)
4,378,949
(29.66 %)
1,568,842
(17.75 %)
12,889,725
(51.96 %)
46,167
(1.71 %)
512 Merriam's long-tongued bat (hap1 2024)
GCA_039655065.1
n/a 18,172
(1.67 %)
20,736
(1.60 %)
n/a 42.19
(100.00 %)
47
(0.00 %)
82
(100.00 %)
2,998,913
(29.48 %)
418,833
(1.07 %)
11,783,716
(32.96 %)
65,956
(4.38 %)
513 Merriam's long-tongued bat (hap2 2024)
GCA_039656995.1
n/a 18,105
(1.68 %)
20,751
(1.60 %)
n/a 42.18
(100.00 %)
45
(0.00 %)
71
(100.00 %)
2,994,788
(29.48 %)
415,375
(1.07 %)
11,752,432
(32.88 %)
65,597
(4.38 %)
514 mesic four-striped grass rat (FMNH 192475 2021)
GCA_019844195.1
n/a 18,926
(2.00 %)
20,713
(1.46 %)
n/a 41.06
(99.08 %)
121,340
(0.94 %)
152,293
(99.06 %)
6,081,188
(43.08 %)
1,497,646
(3.55 %)
13,086,584
(30.02 %)
15,700
(0.46 %)
515 Mexican gray wolf (hap1 2025 refseq)
GCF_048164855.1
112,768
(4.40 %)
19,582
(1.52 %)
20,911
(1.39 %)
n/a 41.56
(100.00 %)
167
(0.00 %)
249
(100.00 %)
4,598,813
(31.70 %)
1,102,136
(4.40 %)
13,591,364
(35.18 %)
53,470
(2.24 %)
516 Mexican gray wolf (hap2 2025)
GCA_048164845.1
n/a 18,738
(1.56 %)
19,759
(1.41 %)
n/a 41.58
(100.00 %)
124
(0.00 %)
155
(100.00 %)
4,265,479
(32.40 %)
1,030,876
(4.11 %)
12,818,772
(34.22 %)
50,269
(2.22 %)
517 minke whale (2013 refseq)
GCF_000493695.1
42,553
(2.38 %)
19,159
(1.73 %)
18,656
(1.42 %)
n/a 40.94
(94.06 %)
173,296
(5.96 %)
184,072
(94.04 %)
n/a 573,951
(1.48 %)
13,504,347
(30.96 %)
65,448
(1.38 %)
518 minke whale (alternate hap 2023)
GCA_950005055.1
n/a 20,412
(1.46 %)
27,421
(1.34 %)
n/a 41.50
(100.00 %)
1
(0.00 %)
21,272
(100.00 %)
3,811,435
(36.24 %)
959,712
(10.27 %)
12,159,896
(41.30 %)
69,852
(1.62 %)
519 minke whale (primary hap 2023 refseq)
GCF_949987535.1
61,711
(2.51 %)
19,550
(1.49 %)
21,499
(1.26 %)
n/a 41.55
(99.99 %)
1,177
(0.01 %)
1,374
(100.00 %)
4,006,927
(35.92 %)
1,058,105
(12.08 %)
12,708,103
(42.66 %)
72,756
(1.59 %)
520 Mongolian gerbil (243 2017 Lucigen Corp.)
GCF_002204375.1
40,359
(2.29 %)
21,215
(1.83 %)
24,305
(1.47 %)
n/a 42.09
(95.23 %)
91,601
(4.78 %)
68,793
(100.00 %)
4,821,343
(37.74 %)
940,776
(1.82 %)
13,848,274
(31.31 %)
24,154
(0.74 %)
521 Mongolian gerbil (EAM2014 2019 BGI)
GCA_008131255.1
n/a 19,952
(1.59 %)
23,462
(1.36 %)
n/a 41.98
(99.01 %)
103,843
(0.97 %)
412,933
(99.03 %)
5,009,454
(0.00 %)
1,042,929
(2.52 %)
14,121,194
(34.63 %)
26,044
(0.71 %)
522 Mongolian gerbil (TT.TT164.6M 2023)
GCF_030254825.1
65,502
(2.97 %)
19,045
(1.53 %)
20,203
(1.29 %)
n/a 41.87
(100.00 %)
53
(0.00 %)
193
(100.00 %)
4,477,607
(37.21 %)
1,124,432
(5.22 %)
13,244,320
(39.20 %)
25,300
(0.76 %)
523 monito del monte (mDroGli1 alternate hap 2021)
GCA_019395325.1
n/a 16,419
(0.77 %)
17,219
(0.89 %)
n/a 39.03
(100.00 %)
33
(0.00 %)
9,959
(100.00 %)
6,332,360
(29.69 %)
1,065,454
(2.09 %)
17,908,986
(42.25 %)
13,856
(0.35 %)
524 monito del monte (primary hap 2021 refseq)
GCF_019393635.1
47,034
(2.02 %)
18,399
(0.80 %)
15,519
(0.85 %)
n/a 39.11
(99.91 %)
260
(0.09 %)
17
(100.00 %)
9,107,968
(41.08 %)
1,249,635
(2.12 %)
21,135,324
(42.80 %)
16,598
(0.36 %)
525 Montane guinea pig
GCA_004027695.1
n/a 20,064
(1.06 %)
31,321
(1.18 %)
39,905
(1.42 %)
40.09
(99.88 %)
11,321
(0.04 %)
1,379,500
(99.96 %)
4,730,634
(30.02 %)
1,583,664
(6.57 %)
15,806,339
(40.40 %)
37,371
(0.76 %)
526 moose/elk (2024)
GCA_964270355.1
n/a 19,816
(1.60 %)
22,341
(1.44 %)
n/a 41.70
(100.00 %)
3
(0.00 %)
1,737
(100.00 %)
3,099,775
(24.20 %)
406,796
(2.52 %)
13,117,056
(38.34 %)
50,644
(1.33 %)
527 moose/elk (AALL_1980 2023)
GCA_015832495.2
n/a 19,116
(1.66 %)
21,184
(1.45 %)
n/a 41.55
(95.50 %)
71,769
(4.51 %)
77,708
(95.49 %)
3,026,678
(23.77 %)
373,266
(0.91 %)
13,167,376
(34.08 %)
44,302
(1.21 %)
528 moose/elk (MIG12-28694850 2019)
GCA_007570765.1
n/a 21,375
(1.65 %)
26,769
(1.42 %)
n/a 41.64
(92.66 %)
83,831
(7.35 %)
131,373
(92.65 %)
5,022,053
(43.27 %)
384,658
(1.22 %)
13,422,381
(34.52 %)
49,216
(1.18 %)
529 Mount Data shrew rat (FMNH 198792 2021)
GCA_019843965.1
n/a 18,266
(2.07 %)
18,451
(1.45 %)
n/a 41.51
(99.45 %)
47,796
(0.55 %)
61,989
(99.45 %)
5,656,524
(42.94 %)
1,120,762
(2.44 %)
12,212,163
(29.98 %)
15,204
(0.46 %)
530 mountain beaver
GCA_004027875.1
n/a 22,428
(1.10 %)
38,670
(1.12 %)
n/a 40.58
(99.89 %)
7,253
(0.02 %)
1,286,779
(99.98 %)
5,859,004
(32.29 %)
914,052
(2.37 %)
16,249,666
(38.21 %)
39,133
(0.76 %)
531 muskrat
GCA_004026605.1
n/a 22,540
(1.52 %)
32,136
(1.35 %)
n/a 41.59
(99.93 %)
6,243
(0.02 %)
571,599
(99.98 %)
4,437,736
(28.49 %)
922,826
(2.38 %)
13,945,732
(35.23 %)
19,876
(0.50 %)
532 naked mole-rat (2022)
GCA_944319725.1
n/a 20,755
(1.51 %)
20,024
(1.35 %)
n/a 39.98
(99.96 %)
2,332
(0.04 %)
264
(100.00 %)
3,593,261
(30.76 %)
529,045
(1.14 %)
13,294,831
(36.07 %)
32,235
(0.93 %)
533 naked mole-rat (maternal 2024)
GCA_964261345.1
n/a 19,980
(1.56 %)
19,365
(1.33 %)
n/a 39.96
(99.93 %)
2,238
(0.07 %)
263
(100.00 %)
5,099,610
(44.65 %)
523,459
(1.13 %)
13,036,461
(35.91 %)
31,614
(0.92 %)
534 naked mole-rat (MEF-2018 2020)
GCA_014060925.1
n/a 22,011
(1.30 %)
21,392
(1.22 %)
n/a 40.13
(95.11 %)
139,535
(4.91 %)
148,797
(95.09 %)
4,885,102
(35.91 %)
654,418
(1.90 %)
16,401,315
(34.21 %)
40,717
(0.98 %)
535 naked mole-rat (NMR 29 2012 refseq)
GCF_000247695.1
74,587
(3.56 %)
21,332
(1.74 %)
20,861
(1.51 %)
n/a 40.21
(88.43 %)
110,424
(11.59 %)
114,653
(88.41 %)
4,179,991
(32.69 %)
484,933
(0.92 %)
13,672,561
(27.63 %)
31,950
(0.88 %)
536 naked mole-rat (pHap 2024)
GCA_964261355.1
n/a 19,953
(1.57 %)
19,579
(1.35 %)
n/a 39.98
(99.91 %)
2,381
(0.09 %)
264
(100.00 %)
5,097,978
(44.61 %)
523,861
(1.13 %)
13,168,788
(36.09 %)
31,789
(0.93 %)
537 narwhal (Baffin Bay 2019)
GCF_005190385.1
51,639
(2.71 %)
18,741
(1.78 %)
20,365
(1.40 %)
33,148
(1.79 %)
41.22
(99.52 %)
18,323
(0.49 %)
6,972
(100.00 %)
4,011,742
(43.97 %)
565,367
(1.22 %)
12,720,018
(34.85 %)
60,492
(1.58 %)
538 narwhal (Baffin Bay Population NGI 2022)
GCA_005190385.3
n/a 18,681
(1.79 %)
19,816
(1.40 %)
n/a 41.26
(100.00 %)
313
(0.00 %)
101
(100.00 %)
3,618,235
(37.24 %)
612,229
(1.52 %)
12,641,632
(35.02 %)
60,518
(1.78 %)
539 Natal long-fingered bat
GCF_001595765.1
32,050
(3.03 %)
18,015
(2.17 %)
18,293
(1.87 %)
n/a 42.07
(96.24 %)
204,616
(3.79 %)
1,269
(100.00 %)
2,565,457
(28.95 %)
376,532
(1.91 %)
10,427,823
(26.35 %)
63,261
(2.07 %)
540 Nathusius's pipistrelle (hap1.1 2025)
GCA_964656225.1
n/a 18,001
(1.75 %)
21,219
(1.77 %)
n/a 42.26
(99.98 %)
1,836
(0.02 %)
1,062
(100.00 %)
3,664,854
(32.90 %)
906,692
(8.55 %)
10,164,440
(37.98 %)
56,705
(2.75 %)
541 Nathusius's pipistrelle (hap1.2 2025)
GCA_964656225.2
n/a 17,671
(1.80 %)
21,057
(1.71 %)
n/a 42.19
(100.00 %)
307
(0.00 %)
410
(100.00 %)
4,579,266
(45.39 %)
943,644
(11.48 %)
9,925,875
(39.77 %)
56,485
(2.63 %)
542 Nathusius's pipistrelle (hap2.1 2025)
GCA_964656075.1
n/a 17,899
(1.71 %)
20,808
(1.69 %)
n/a 42.15
(99.98 %)
1,832
(0.02 %)
2,485
(99.98 %)
3,637,576
(31.92 %)
930,013
(11.25 %)
9,967,930
(39.61 %)
56,237
(2.62 %)
543 Nathusius's pipistrelle (hap2.2 2025)
GCA_964656075.2
n/a 17,650
(1.86 %)
21,005
(1.78 %)
n/a 42.30
(100.00 %)
306
(0.00 %)
759
(100.00 %)
4,580,609
(44.28 %)
888,097
(8.14 %)
10,070,978
(37.75 %)
56,514
(2.79 %)
544 Nathusius's pipistrelle (primary hap 2024)
GCA_963693515.1
n/a 17,944
(1.86 %)
20,545
(1.83 %)
n/a 42.45
(100.00 %)
263
(0.00 %)
154
(100.00 %)
3,628,328
(34.57 %)
838,723
(4.04 %)
10,155,601
(35.22 %)
56,332
(2.92 %)
545 Natterer's bat (hap1.2 2025)
GCA_964212035.2
n/a 19,475
(1.82 %)
22,424
(1.68 %)
n/a 43.15
(100.00 %)
225
(0.00 %)
212
(100.00 %)
3,841,654
(38.99 %)
801,041
(5.78 %)
10,278,311
(38.66 %)
64,639
(2.57 %)
546 Natterer's bat (hap2.2 2025)
GCA_964212025.2
n/a 18,368
(1.91 %)
21,701
(1.80 %)
n/a 43.27
(100.00 %)
136
(0.00 %)
309
(100.00 %)
3,509,151
(38.16 %)
704,537
(5.21 %)
9,806,703
(36.74 %)
61,004
(2.65 %)
547 neotropical fruit bat
GCF_014824575.2
49,109
(2.78 %)
17,703
(1.63 %)
19,389
(1.60 %)
n/a 42.32
(99.79 %)
38,675
(0.21 %)
26,068
(100.00 %)
2,862,405
(29.31 %)
366,960
(1.48 %)
11,796,203
(31.27 %)
59,091
(1.70 %)
548 Nilgiri tahr
GCA_004026825.1
n/a 22,735
(1.44 %)
34,961
(1.27 %)
n/a 42.37
(99.93 %)
10,387
(0.04 %)
479,550
(99.96 %)
5,793,761
(48.50 %)
535,297
(1.34 %)
13,378,352
(42.46 %)
57,653
(1.29 %)
549 nine-banded armadillo (hap2 2023)
GCA_030445035.2
n/a 21,049
(1.11 %)
24,419
(1.07 %)
n/a 41.00
(99.67 %)
793
(0.33 %)
546
(100.00 %)
5,507,356
(53.38 %)
738,321
(2.02 %)
19,755,425
(43.69 %)
142,597
(2.85 %)
550 nine-banded armadillo (v2 hap1 2023)
GCA_030445055.2
n/a 19,350
(1.07 %)
22,207
(1.07 %)
n/a 40.97
(99.27 %)
823
(0.73 %)
588
(100.00 %)
4,330,716
(32.85 %)
661,966
(1.52 %)
18,302,021
(42.22 %)
130,245
(2.79 %)
551 nine-banded armadillo (v2 hap2 2023)
GCF_030445035.2
72,174
(2.47 %)
21,051
(1.11 %)
24,418
(1.07 %)
n/a 41.00
(99.67 %)
793
(0.33 %)
546
(100.00 %)
5,412,063
(53.31 %)
738,320
(2.02 %)
19,755,423
(43.69 %)
142,597
(2.85 %)
552 nine-banded armadillo (v3.2 3-136 2012 Baylor)
GCF_000208655.3
46,110
(1.87 %)
20,820
(1.08 %)
25,226
(1.08 %)
n/a 40.77
(90.89 %)
268,437
(9.13 %)
314,788
(90.87 %)
4,552,770
(34.01 %)
651,225
(1.26 %)
19,266,969
(38.27 %)
139,490
(2.47 %)
553 North American deer mouse (MVZ:Mamm:240117 alternate hap 2022)
GCA_026167925.1
n/a 19,342
(1.57 %)
20,947
(1.48 %)
n/a 42.40
(100.00 %)
229
(0.00 %)
1,006
(100.00 %)
4,161,568
(23.13 %)
1,278,205
(8.22 %)
13,148,019
(37.60 %)
23,523
(0.71 %)
554 North American deer mouse (MVZ:Mamm:240117 primary hap 2022)
GCA_026229955.1
n/a 19,700
(1.54 %)
22,354
(1.46 %)
n/a 42.19
(100.00 %)
244
(0.00 %)
2,082
(100.00 %)
6,089,884
(47.99 %)
1,358,786
(9.39 %)
13,799,349
(39.08 %)
24,733
(0.70 %)
555 North American porcupine (mEreDor1 alternate hap 2023)
GCA_028500835.1
n/a 15,210
(1.55 %)
18,316
(1.43 %)
n/a 41.06
(100.00 %)
1
(0.00 %)
5,051
(100.00 %)
3,911,633
(40.55 %)
565,546
(1.54 %)
10,853,726
(32.61 %)
40,925
(1.35 %)
556 North American porcupine (mEreDor1 primary hap 2023)
GCA_028451465.1
n/a 18,102
(1.58 %)
20,073
(1.40 %)
n/a 41.03
(100.00 %)
277
(0.00 %)
116
(100.00 %)
4,958,089
(41.64 %)
719,163
(1.59 %)
13,867,662
(33.89 %)
51,299
(1.36 %)
557 North Atlantic right whale (hap1 2023)
GCA_028571275.1
n/a 18,699
(1.61 %)
20,354
(1.28 %)
n/a 41.64
(99.84 %)
385
(0.16 %)
947
(100.00 %)
3,815,900
(43.46 %)
718,935
(11.38 %)
11,928,210
(42.25 %)
85,881
(1.90 %)
558 North Atlantic right whale (hap2 + XY 2023 refseq)
GCF_028564815.1
49,646
(1.86 %)
19,562
(1.46 %)
21,631
(1.25 %)
n/a 41.69
(99.83 %)
367
(0.17 %)
789
(100.00 %)
1,368,536
(2.24 %)
841,303
(13.08 %)
12,527,582
(43.92 %)
94,259
(1.92 %)
559 North Atlantic right whale (hap2._XY 2023)
GCA_028564815.2
n/a 19,476
(1.53 %)
21,630
(1.25 %)
n/a 41.69
(99.83 %)
367
(0.17 %)
788
(100.00 %)
4,812,242
(53.57 %)
841,302
(13.08 %)
12,527,493
(43.92 %)
94,259
(1.92 %)
560 North Pacific right whale
GCA_004363455.1
n/a 23,145
(1.43 %)
38,161
(1.21 %)
n/a 41.15
(99.88 %)
7,094
(0.03 %)
1,361,057
(99.97 %)
5,039,622
(45.69 %)
694,986
(1.31 %)
14,063,101
(40.51 %)
74,800
(1.52 %)
561 northern American river otter
GCF_010015895.1
53,945
(2.18 %)
18,974
(1.68 %)
21,247
(1.45 %)
n/a 41.41
(99.58 %)
7,620
(0.42 %)
13,541
(99.58 %)
4,538,847
(41.18 %)
685,281
(1.20 %)
13,840,953
(32.61 %)
53,559
(1.88 %)
562 northern bat (alternate hap 2023)
GCA_951640545.1
n/a 18,343
(1.80 %)
23,253
(1.77 %)
n/a 43.55
(100.00 %)
3
(0.00 %)
4,899
(100.00 %)
1,174,241
(2.96 %)
825,170
(5.11 %)
9,889,579
(36.12 %)
76,164
(3.52 %)
563 northern bat (primary hap 2023)
GCA_951640355.1
n/a 18,636
(1.75 %)
21,446
(1.68 %)
n/a 43.32
(99.99 %)
1,423
(0.01 %)
207
(100.00 %)
1,259,729
(2.95 %)
905,676
(6.25 %)
10,554,535
(38.21 %)
77,656
(3.27 %)
564 northern black mastiff bat (mMolNig1 2022)
GCA_026936385.1
n/a 18,924
(1.53 %)
22,934
(1.58 %)
n/a 42.38
(100.00 %)
199
(0.00 %)
146
(100.00 %)
3,850,624
(31.21 %)
648,359
(3.76 %)
11,788,702
(39.25 %)
85,908
(2.60 %)
565 northern black mastiff bat (mMolNig1hap1 2024)
GCA_039880945.1
n/a 18,933
(1.44 %)
23,629
(1.50 %)
n/a 42.60
(100.00 %)
113
(0.00 %)
366
(100.00 %)
4,027,155
(30.73 %)
712,278
(5.22 %)
12,003,034
(41.58 %)
96,116
(3.02 %)
566 northern black mastiff bat (mMolNig1hap2 2024)
GCA_039880925.1
n/a 18,305
(1.49 %)
22,534
(1.56 %)
n/a 42.75
(100.00 %)
80
(0.00 %)
282
(100.00 %)
3,783,543
(30.10 %)
656,592
(4.68 %)
11,353,707
(40.26 %)
92,041
(3.01 %)
567 northern bottlenose whale (alternate hap 2023)
GCA_949752845.1
n/a 19,537
(1.44 %)
27,826
(1.30 %)
n/a 41.67
(100.00 %)
n/a 23,401
(100.00 %)
3,634,923
(35.56 %)
672,860
(11.00 %)
11,175,398
(41.72 %)
62,007
(1.94 %)
568 northern bottlenose whale (primary hap 2023)
GCA_949752795.1
n/a 19,073
(1.44 %)
20,821
(1.21 %)
n/a 41.81
(99.99 %)
1,098
(0.01 %)
757
(100.00 %)
3,997,911
(34.76 %)
769,275
(14.94 %)
12,133,820
(44.83 %)
67,258
(2.00 %)
569 northern elephant seal (BS05 2019 Broad)
GCA_004023865.1
n/a 22,834
(1.54 %)
36,083
(1.32 %)
n/a 41.52
(99.94 %)
9,483
(0.04 %)
330,739
(99.96 %)
4,849,944
(43.83 %)
600,306
(1.16 %)
13,420,049
(34.43 %)
57,236
(1.62 %)
570 northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap1 2023 genbank)
GCA_029215605.1
n/a 19,278
(1.60 %)
19,908
(1.39 %)
n/a 41.84
(100.00 %)
98
(0.00 %)
596
(100.00 %)
4,348,333
(34.40 %)
621,985
(2.21 %)
13,251,768
(35.32 %)
69,898
(2.38 %)
571 Northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap1 2023 refseq)
GCF_029215605.1
74,106
(3.88 %)
19,277
(1.60 %)
20,000
(1.36 %)
n/a 41.84
(100.00 %)
98
(0.00 %)
595
(100.00 %)
4,348,327
(34.40 %)
621,980
(2.21 %)
13,251,706
(35.32 %)
69,897
(2.38 %)
572 northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap2 2023)
GCA_029215635.1
n/a 19,340
(1.59 %)
19,732
(1.37 %)
n/a 41.91
(100.00 %)
60
(0.00 %)
482
(100.00 %)
4,365,070
(34.26 %)
627,639
(2.43 %)
13,174,494
(35.47 %)
74,314
(2.49 %)
573 northern elephant seal (v3 JK_09032017 2022)
GCF_021288785.2
53,819
(3.32 %)
20,099
(1.75 %)
20,957
(1.35 %)
n/a 41.51
(99.35 %)
39,936
(0.65 %)
142,455
(100.00 %)
4,368,400
(33.93 %)
588,877
(1.19 %)
13,745,426
(32.96 %)
52,064
(1.59 %)
574 northern fur seal
GCF_003265705.1
54,953
(2.43 %)
23,408
(1.78 %)
23,666
(1.43 %)
52,089
(2.17 %)
41.48
(98.01 %)
38,666
(1.99 %)
52,469
(98.01 %)
5,047,032
(43.38 %)
638,130
(1.06 %)
14,922,442
(33.12 %)
57,281
(1.44 %)
575 northern fur seal (GAN/ISIS: 27379988/994484 2025)
GCF_003265705.2
71,169
(3.14 %)
21,276
(1.78 %)
21,276
(1.42 %)
n/a 41.44
(98.05 %)
30,369
(1.95 %)
43,734
(98.05 %)
4,118,994
(34.95 %)
578,801
(1.07 %)
13,530,999
(33.27 %)
51,258
(1.43 %)
576 northern gundi (hap1 2025)
GCA_048771875.1
n/a 16,996
(1.51 %)
21,787
(1.66 %)
n/a 42.28
(100.00 %)
117
(0.00 %)
535
(100.00 %)
3,293,772
(27.51 %)
602,403
(3.02 %)
11,827,700
(30.64 %)
44,220
(1.55 %)
577 northern gundi (hap2 2025)
GCA_048771865.1
n/a 17,037
(1.43 %)
21,690
(1.55 %)
n/a 42.88
(100.00 %)
115
(0.00 %)
1,031
(100.00 %)
3,527,940
(26.81 %)
646,620
(6.32 %)
11,343,462
(34.09 %)
47,125
(1.51 %)
578 northern gundi (US049 2019)
GCA_004027205.1
n/a 18,035
(1.39 %)
27,379
(1.57 %)
n/a 42.68
(99.91 %)
5,037
(0.02 %)
865,110
(99.98 %)
4,149,883
(27.83 %)
654,063
(1.64 %)
12,342,565
(33.72 %)
47,533
(1.43 %)
579 northern mole vole
GCA_001685095.1
n/a 23,252
(1.39 %)
44,209
(1.25 %)
n/a 41.68
(99.04 %)
371,627
(0.98 %)
722,087
(99.02 %)
3,923,814
(25.79 %)
898,453
(2.47 %)
13,708,986
(29.04 %)
16,583
(0.36 %)
580 northern three-toed jerboa (halli NM19106 2024)
GCA_036346955.1
n/a 19,574
(1.25 %)
21,306
(1.23 %)
n/a 42.16
(99.93 %)
954
(0.07 %)
487
(100.00 %)
6,447,286
(38.11 %)
1,321,523
(3.44 %)
13,986,035
(43.83 %)
30,337
(0.84 %)
581 northern white rhinoceros
GCA_004027795.1
n/a 25,328
(1.34 %)
61,003
(1.95 %)
n/a 41.32
(99.90 %)
7,054
(0.03 %)
949,480
(99.97 %)
4,330,882
(38.89 %)
484,754
(1.12 %)
15,544,248
(33.11 %)
43,689
(2.08 %)
582 northern woolly horseshoe bat (20210929_DDc alternate hap 2024)
GCA_043748905.1
n/a 17,474
(1.85 %)
19,891
(1.65 %)
n/a 40.73
(100.00 %)
n/a 1,329
(100.00 %)
3,473,169
(40.23 %)
618,364
(2.01 %)
11,013,083
(30.75 %)
32,427
(1.26 %)
583 northern woolly horseshoe bat (20210929_DDc primary hap 2024)
GCA_043748575.1
n/a 18,475
(1.82 %)
19,990
(1.56 %)
n/a 40.72
(100.00 %)
63
(0.00 %)
68
(100.00 %)
3,507,612
(39.92 %)
711,081
(2.15 %)
11,788,205
(32.17 %)
35,670
(1.25 %)
584 Norway rat (BN/NHsdMcwi 2024 genbank)
GCA_036323735.1
114,725
(42.69 %)
21,917
(1.75 %)
19,476
(1.26 %)
n/a 41.82
(99.86 %)
220
(0.14 %)
77
(100.00 %)
4,700,726
(39.99 %)
1,603,005
(5.45 %)
13,451,813
(38.68 %)
20,118
(0.44 %)
585 Norway rat (BN/NHsdMcwi 2024 refseq)
GCF_036323735.1
114,725
(5.38 %)
21,870
(1.74 %)
19,989
(1.27 %)
n/a 41.82
(99.86 %)
220
(0.14 %)
76
(100.00 %)
5,294,185
(42.75 %)
1,603,005
(5.45 %)
13,451,760
(38.68 %)
20,118
(0.44 %)
586 Norway rat (F344/Stm 2024)
GCA_041222355.1
n/a 21,764
(1.78 %)
20,141
(1.30 %)
n/a 41.87
(99.96 %)
234
(0.04 %)
120
(100.00 %)
4,636,987
(39.98 %)
1,579,595
(5.22 %)
13,544,768
(38.06 %)
20,127
(0.46 %)
587 Norway rat BN7 haplotype
GCA_015244455.1
n/a 3,096
(1.64 %)
2,450
(1.02 %)
n/a 41.23
(100.00 %)
6
(0.00 %)
3,156
(100.00 %)
517,347
(50.76 %)
157,701
(3.90 %)
1,502,752
(34.14 %)
1,806
(0.40 %)
588 Norway rat BN7.2
GCF_015227675.2
97,432
(4.08 %)
21,526
(1.86 %)
19,266
(1.33 %)
54,530
(2.79 %)
41.99
(99.19 %)
581
(0.81 %)
757
(99.19 %)
5,029,005
(45.44 %)
1,514,974
(3.57 %)
13,450,428
(35.83 %)
19,244
(0.46 %)
589 Norway rat celera
GCF_000002265.2
39,745
(2.91 %)
21,492
(1.95 %)
19,112
(1.38 %)
n/a 41.98
(95.28 %)
111,391
(4.74 %)
118,423
(95.26 %)
9,721,869
(43.57 %)
1,387,703
(3.05 %)
13,224,921
(32.45 %)
18,944
(0.42 %)
590 Norway rat Rnor6.0
GCF_000001895.5
69,456
(3.34 %)
22,369
(1.83 %)
20,269
(1.32 %)
n/a 41.93
(95.13 %)
145,731
(4.89 %)
76,195
(95.16 %)
5,329,187
(44.14 %)
1,620,304
(3.72 %)
14,520,050
(33.09 %)
22,600
(0.47 %)
591 Norway rat SHR/Utx RGD_8142385 2022
GCA_023515785.1
n/a 21,116
(1.68 %)
20,103
(1.27 %)
57,027
(2.45 %)
41.85
(99.82 %)
1,256
(0.18 %)
2,151
(100.00 %)
4,704,388
(38.22 %)
1,611,144
(5.76 %)
13,524,575
(38.35 %)
20,720
(0.48 %)
592 Norway rat SHRSP/BppUtx 2022
GCA_021556685.1
n/a 22,366
(1.71 %)
20,531
(1.26 %)
57,580
(2.44 %)
41.86
(99.94 %)
1,610
(0.06 %)
2,734
(100.00 %)
5,238,574
(46.36 %)
1,638,412
(5.87 %)
13,769,141
(38.49 %)
21,006
(0.49 %)
593 Norway rat WKY/Bbb 2022
GCA_023515805.1
n/a 21,607
(1.68 %)
21,244
(1.28 %)
58,136
(2.47 %)
41.92
(99.80 %)
1,456
(0.20 %)
3,553
(100.00 %)
4,811,412
(38.21 %)
1,650,950
(5.41 %)
13,740,644
(38.24 %)
21,449
(0.51 %)
594 nutria
GCA_004027025.1
n/a 24,707
(1.00 %)
47,533
(1.18 %)
n/a 41.70
(99.84 %)
15,249
(0.05 %)
1,684,916
(99.95 %)
6,961,690
(30.09 %)
1,698,977
(3.31 %)
15,207,563
(42.57 %)
59,854
(1.00 %)
595 okapi
GCA_001660835.1
n/a 21,483
(1.43 %)
31,061
(1.26 %)
n/a 41.48
(95.11 %)
376,008
(4.86 %)
1,213,177
(95.14 %)
5,808,036
(42.90 %)
619,044
(4.22 %)
14,940,153
(35.17 %)
47,417
(1.12 %)
596 Okinawa island spiny rat (P-3 2024)
GCA_047150545.1
n/a 20,516
(1.33 %)
20,222
(0.99 %)
n/a 40.89
(100.00 %)
19
(0.00 %)
53
(100.00 %)
9,452,355
(48.57 %)
2,252,101
(4.71 %)
12,808,891
(51.48 %)
20,770
(0.36 %)
597 Okinawa island spiny rat (P-3 primary hap 2023)
GCA_036184385.1
n/a 18,829
(1.78 %)
19,061
(1.29 %)
n/a 41.18
(100.00 %)
250
(0.00 %)
1,778
(100.00 %)
6,918,941
(46.48 %)
1,550,409
(4.06 %)
12,787,294
(38.04 %)
19,458
(0.47 %)
598 Ord's kangaroo rat
GCF_000151885.1
30,625
(2.21 %)
17,959
(1.54 %)
19,318
(1.54 %)
n/a 42.06
(92.36 %)
83,035
(7.65 %)
148,226
(92.35 %)
4,337,455
(33.76 %)
1,140,316
(7.60 %)
10,422,685
(36.59 %)
61,921
(3.56 %)
599 pacarana
GCA_004027595.1
n/a 20,748
(1.20 %)
33,195
(1.31 %)
n/a 41.81
(99.90 %)
6,392
(0.02 %)
1,164,830
(99.98 %)
4,374,443
(30.16 %)
660,811
(1.38 %)
14,062,133
(35.99 %)
59,382
(1.23 %)
600 Pacific pocket mouse (BS65 2019 Broad)
GCA_004363475.1
n/a 21,575
(1.07 %)
47,478
(1.31 %)
n/a 41.87
(99.76 %)
18,801
(0.07 %)
2,428,619
(99.93 %)
4,881,232
(20.80 %)
1,352,971
(4.11 %)
12,583,960
(48.42 %)
74,961
(2.33 %)
601 Pacific pocket mouse (PPM17 2022 San Diego Zoo)
GCF_023159225.1
46,202
(2.48 %)
18,752
(1.50 %)
22,526
(1.60 %)
n/a 41.98
(99.96 %)
1,807
(0.04 %)
6,180
(100.00 %)
3,313,319
(16.79 %)
1,066,382
(10.88 %)
9,981,468
(42.63 %)
49,134
(2.83 %)
602 Pacific walrus
GCF_000321225.1
27,163
(1.89 %)
20,293
(1.71 %)
20,982
(1.48 %)
n/a 41.36
(95.85 %)
66,766
(4.16 %)
70,656
(95.84 %)
4,372,578
(41.12 %)
511,500
(1.05 %)
13,507,582
(30.43 %)
45,142
(1.29 %)
603 Pacific white-sided dolphin
GCF_003676395.1
65,970
(3.26 %)
18,743
(1.79 %)
20,862
(1.45 %)
31,917
(1.69 %)
41.28
(99.56 %)
16,699
(0.44 %)
21,350
(99.56 %)
3,971,820
(45.64 %)
574,056
(1.14 %)
12,602,965
(34.83 %)
62,275
(1.67 %)
604 pale spear-nosed bat (alternate hap MPI-MPIP 2019)
GCA_004115245.1
n/a 18,118
(1.63 %)
23,536
(1.65 %)
n/a 42.48
(100.00 %)
38
(0.00 %)
10,873
(100.00 %)
3,001,130
(29.46 %)
375,042
(0.79 %)
11,813,971
(29.64 %)
67,712
(4.23 %)
605 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP mPhyDis1 primary hap 2020)
GCA_004126475.3
n/a 18,167
(1.70 %)
20,017
(1.62 %)
n/a 42.38
(99.28 %)
884
(0.72 %)
78
(100.00 %)
3,071,886
(30.03 %)
385,665
(0.81 %)
12,049,923
(30.57 %)
63,918
(4.33 %)
606 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 alternate hap 2020)
GCA_004115245.2
n/a 18,116
(1.63 %)
23,608
(1.65 %)
n/a 42.48
(100.00 %)
38
(0.00 %)
10,895
(100.00 %)
3,002,448
(29.46 %)
375,226
(0.79 %)
11,824,034
(29.65 %)
67,718
(4.23 %)
607 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 primary hap 2020)
GCF_004126475.2
54,932
(3.31 %)
18,171
(1.69 %)
20,025
(1.62 %)
42,786
(3.39 %)
42.38
(99.28 %)
884
(0.72 %)
77
(100.00 %)
3,069,141
(30.00 %)
385,664
(0.81 %)
12,050,232
(30.57 %)
63,905
(3.75 %)
608 Pallas's mastiff bat
GCF_014108415.1
48,421
(2.20 %)
18,667
(1.61 %)
21,915
(1.59 %)
n/a 42.35
(97.95 %)
349
(2.05 %)
60
(100.00 %)
3,863,217
(32.76 %)
624,933
(1.88 %)
11,572,319
(37.09 %)
79,984
(2.45 %)
609 pallid bat (TK200870 alternate hap 2023)
GCA_027595915.1
n/a 19,085
(1.74 %)
22,770
(1.68 %)
n/a 43.01
(100.00 %)
n/a 1,839
(100.00 %)
5,323,924
(49.33 %)
928,982
(3.65 %)
11,123,530
(39.36 %)
70,095
(2.89 %)
610 pallid bat (TK200870 primary hap 2023)
GCA_027563665.1
n/a 19,688
(1.69 %)
21,998
(1.64 %)
n/a 43.04
(99.72 %)
234
(0.28 %)
112
(99.99 %)
2,794,986
(22.60 %)
938,016
(3.72 %)
11,241,518
(39.41 %)
70,272
(2.89 %)
611 Parnell's mustached bat (2013)
GCA_000465405.1
n/a 21,436
(1.40 %)
57,232
(2.18 %)
n/a 40.82
(99.34 %)
265,720
(0.70 %)
443,121
(99.30 %)
2,780,805
(29.26 %)
290,520
(0.63 %)
12,354,814
(27.13 %)
69,806
(1.89 %)
612 Parnell's mustached bat (Mesoamerican 2021)
GCF_021234165.1
37,033
(2.48 %)
18,339
(1.76 %)
21,630
(1.69 %)
n/a 41.32
(100.00 %)
12
(0.00 %)
333
(100.00 %)
2,828,339
(30.56 %)
333,670
(0.75 %)
12,444,271
(30.90 %)
53,180
(4.61 %)
613 particolored bat (hap1.2 2025)
GCA_963924515.2
n/a 17,612
(1.78 %)
20,793
(1.69 %)
n/a 43.57
(100.00 %)
189
(0.00 %)
273
(100.00 %)
5,418,781
(46.24 %)
903,727
(5.36 %)
10,321,898
(38.41 %)
78,516
(4.52 %)
614 particolored bat (hap2.2 2025)
GCA_963924695.2
n/a 16,887
(1.81 %)
20,042
(1.72 %)
n/a 43.67
(100.00 %)
128
(0.00 %)
395
(100.00 %)
5,048,325
(44.60 %)
836,727
(4.41 %)
9,638,999
(37.87 %)
76,656
(4.63 %)
615 particolored bat (primary hap 2024)
GCA_963924515.1
n/a 17,913
(1.72 %)
20,720
(1.72 %)
n/a 43.54
(99.99 %)
980
(0.01 %)
185
(100.00 %)
2,932,869
(21.94 %)
874,665
(4.83 %)
10,263,103
(37.46 %)
77,397
(4.55 %)
616 Patagonian cavy
GCA_004027295.1
n/a 21,143
(0.94 %)
40,887
(1.10 %)
n/a 39.86
(99.87 %)
6,223
(0.02 %)
1,911,987
(99.98 %)
5,194,890
(30.95 %)
892,551
(2.11 %)
17,052,577
(40.22 %)
45,730
(0.84 %)
617 Pere David's deer
GCA_002443075.1
n/a 20,723
(1.65 %)
23,551
(1.43 %)
n/a 41.58
(97.49 %)
144,642
(2.51 %)
339,454
(97.49 %)
5,171,293
(43.30 %)
427,987
(1.20 %)
13,665,133
(35.97 %)
48,374
(1.14 %)
618 Philippine flying lemur (mCynVol1 alternate hap 2022)
GCA_027409165.1
n/a 18,794
(1.72 %)
21,421
(1.40 %)
n/a 40.18
(100.00 %)
n/a 1,750
(100.00 %)
4,001,442
(39.37 %)
547,894
(2.75 %)
13,870,563
(34.33 %)
40,162
(1.31 %)
619 Philippine flying lemur (primary hap 2022 genbank)
GCA_027409185.1
n/a 20,384
(1.64 %)
22,124
(1.29 %)
n/a 40.24
(100.00 %)
116
(0.00 %)
131
(100.00 %)
4,492,423
(39.31 %)
627,842
(4.79 %)
15,561,515
(36.57 %)
45,336
(1.27 %)
620 Philippine flying lemur (primary hap 2022 refseq)
GCF_027409185.1
44,950
(1.91 %)
20,385
(1.64 %)
22,123
(1.29 %)
n/a 40.24
(100.00 %)
116
(0.00 %)
130
(100.00 %)
4,492,417
(39.31 %)
627,841
(4.79 %)
15,561,458
(36.57 %)
45,336
(1.27 %)
621 pig (Bamei 2023)
GCA_030704935.1
n/a 18,472
(1.44 %)
19,911
(1.28 %)
n/a 42.63
(99.98 %)
878
(0.02 %)
379
(100.00 %)
3,996,827
(27.97 %)
2,094,728
(7.23 %)
12,677,118
(40.57 %)
81,791
(2.82 %)
622 pig (Bamei 2025)
GCA_030704935.2
n/a 17,940
(1.49 %)
20,133
(1.29 %)
n/a 42.64
(100.00 %)
n/a 21
(100.00 %)
6,650,808
(50.63 %)
1,731,111
(5.80 %)
12,817,015
(40.05 %)
81,487
(2.80 %)
623 pig (Duroc 2017)
GCF_000003025.6
77,695
(4.05 %)
18,980
(1.64 %)
19,453
(1.32 %)
59,876
(4.84 %)
41.87
(98.81 %)
544
(1.19 %)
1,313
(98.81 %)
5,021,184
(45.67 %)
710,994
(1.32 %)
13,243,289
(36.33 %)
79,132
(1.82 %)
624 pig (Norwegian landrace 2024)
GCA_963921485.1
n/a 18,500
(1.46 %)
19,718
(1.29 %)
n/a 42.45
(100.00 %)
n/a 54
(100.00 %)
4,068,783
(28.54 %)
1,511,605
(5.52 %)
12,867,101
(39.59 %)
82,002
(2.44 %)
625 pig (USMARCv1 2017)
GCA_002844635.1
n/a 19,458
(1.54 %)
21,487
(1.27 %)
58,655
(2.58 %)
42.49
(95.20 %)
661
(4.80 %)
14,157
(100.00 %)
5,159,244
(47.53 %)
902,079
(3.63 %)
13,145,120
(36.86 %)
82,442
(2.62 %)
626 pig (Wuzhishan WZS1 2025)
GCA_048338725.1
n/a 18,525
(1.46 %)
19,792
(1.29 %)
n/a 42.55
(100.00 %)
n/a 20
(100.00 %)
4,084,482
(28.40 %)
1,424,314
(5.35 %)
12,927,595
(39.56 %)
81,967
(2.96 %)
627 plains viscacha rat (AO245 2017)
GCA_002564285.1
n/a 23,367
(0.78 %)
50,706
(0.93 %)
n/a 41.26
(99.73 %)
124,165
(0.16 %)
1,682,965
(99.84 %)
5,295,703
(27.32 %)
1,024,529
(1.81 %)
16,181,193
(35.22 %)
46,628
(0.97 %)
628 plains zebra (Etosha38 2022 UCLA)
GCF_021613505.1
55,794
(2.87 %)
19,529
(1.76 %)
21,214
(1.39 %)
n/a 41.38
(99.04 %)
14,595
(0.96 %)
11,098
(100.00 %)
3,683,862
(38.74 %)
314,723
(0.68 %)
15,217,328
(29.38 %)
41,391
(1.27 %)
629 platypus (alternate hap Pmale09 2020)
GCA_004115175.2
n/a 13,244
(1.26 %)
19,241
(1.68 %)
n/a 46.27
(100.00 %)
25
(0.00 %)
5,868
(100.00 %)
4,420,884
(51.59 %)
513,006
(3.13 %)
7,749,797
(49.18 %)
81,538
(8.24 %)
630 platypus (Pmale09 primary hap 2020)
GCA_004115215.4
n/a 14,555
(1.24 %)
18,891
(1.63 %)
n/a 46.14
(99.18 %)
515
(0.82 %)
322
(100.00 %)
7,731,079
(57.03 %)
578,617
(2.89 %)
9,113,668
(48.93 %)
87,861
(7.92 %)
631 platypus (Pmale09 v4 2020)
GCF_004115215.2
51,379
(3.07 %)
14,778
(1.26 %)
18,888
(1.63 %)
n/a 46.14
(99.18 %)
515
(0.82 %)
322
(100.00 %)
5,071,089
(51.34 %)
578,614
(2.89 %)
9,113,848
(48.93 %)
87,796
(6.47 %)
632 polar bear (Baiyulong BGI 2014 refseq)
GCF_000687225.1
35,751
(2.39 %)
18,466
(1.69 %)
15,384
(1.38 %)
n/a 41.65
(98.35 %)
110,343
(1.67 %)
134,162
(98.33 %)
4,123,540
(40.16 %)
553,196
(1.29 %)
13,765,581
(29.91 %)
54,907
(1.17 %)
633 polar bear (UCSC 2021)
GCF_017311325.1
52,175
(2.92 %)
18,588
(1.75 %)
20,731
(1.54 %)
n/a 41.88
(99.60 %)
45,532
(0.41 %)
3,900
(100.00 %)
4,204,162
(40.75 %)
572,129
(1.75 %)
13,926,894
(30.79 %)
63,315
(1.93 %)
634 prairie deer mouse (Baylor 2013)
GCF_000500345.1
50,187
(2.51 %)
20,427
(1.69 %)
20,874
(1.45 %)
n/a 42.34
(94.06 %)
182,263
(5.97 %)
212,962
(94.03 %)
n/a 1,229,123
(2.83 %)
14,447,916
(30.09 %)
23,246
(0.56 %)
635 prairie deer mouse (BWxNUB_F1_BW_parent 2025)
GCF_049852395.1
84,704
(3.63 %)
19,312
(1.68 %)
20,354
(1.41 %)
n/a 42.31
(100.00 %)
106
(0.00 %)
25
(100.00 %)
6,577,724
(45.25 %)
1,288,198
(5.24 %)
13,978,540
(35.31 %)
23,724
(0.69 %)
636 prairie deer mouse (Harvard 2020)
GCF_003704035.1
69,779
(3.28 %)
19,755
(1.73 %)
19,194
(1.43 %)
n/a 42.28
(95.07 %)
147,442
(4.96 %)
155,966
(95.04 %)
4,751,621
(29.04 %)
1,172,212
(2.66 %)
13,934,672
(29.87 %)
22,444
(0.57 %)
637 prairie vole
GCF_000317375.1
40,484
(2.72 %)
19,648
(1.91 %)
19,489
(1.62 %)
n/a 42.25
(92.03 %)
180,677
(8.00 %)
187,012
(92.00 %)
3,779,126
(25.51 %)
879,192
(2.11 %)
12,360,347
(27.34 %)
18,233
(0.52 %)
638 proboscis bat (hap1 2024)
GCA_037038545.1
n/a 17,919
(1.46 %)
19,330
(1.31 %)
n/a 40.78
(100.00 %)
68
(0.00 %)
41
(100.00 %)
3,707,234
(28.28 %)
643,817
(2.22 %)
12,106,384
(41.48 %)
54,438
(1.38 %)
639 proboscis bat (hap2 2024)
GCA_037038555.1
n/a 17,253
(1.51 %)
18,507
(1.35 %)
n/a 40.91
(100.00 %)
39
(0.00 %)
38
(100.00 %)
3,466,835
(27.96 %)
585,261
(1.91 %)
11,364,898
(40.65 %)
50,527
(1.37 %)
640 pronghorn (PH2016 2021)
GCA_021018645.1
n/a 21,848
(1.58 %)
27,614
(1.56 %)
n/a 41.70
(96.83 %)
74,027
(3.17 %)
140,480
(96.83 %)
3,335,744
(24.40 %)
405,435
(4.11 %)
13,855,606
(34.67 %)
48,670
(1.19 %)
641 Przewalski's gazelle (PLG-pushi 2019)
GCA_006410515.1
n/a 19,722
(1.52 %)
21,663
(1.29 %)
n/a 42.49
(95.93 %)
557,686
(4.13 %)
831,816
(95.87 %)
5,438,181
(47.21 %)
408,156
(1.63 %)
13,068,837
(39.30 %)
67,544
(1.31 %)
642 Przewalski's horse (Burgud 2014 refseq)
GCF_000696695.1
45,089
(2.76 %)
19,546
(1.69 %)
22,107
(1.36 %)
n/a 41.27
(99.13 %)
80,963
(0.88 %)
134,060
(99.12 %)
3,787,533
(40.54 %)
435,607
(1.73 %)
14,738,418
(28.36 %)
40,752
(0.94 %)
643 Przewalski's horse (Varuska primary hap 2024)
GCF_037783145.1
117,131
(4.09 %)
18,569
(1.70 %)
20,018
(1.38 %)
n/a 42.23
(100.00 %)
310
(0.00 %)
2,146
(100.00 %)
3,768,149
(39.86 %)
632,308
(5.35 %)
14,449,518
(32.71 %)
42,166
(4.46 %)
644 puma (L17-30 alternate hap 2023)
GCA_028749965.1
n/a 18,380
(1.53 %)
20,701
(1.40 %)
n/a 41.91
(100.00 %)
96
(0.00 %)
304
(100.00 %)
4,881,674
(33.96 %)
978,817
(2.17 %)
13,422,986
(35.08 %)
69,437
(2.62 %)
645 puma (L17-30 primary hap 2023)
GCA_028749985.1
n/a 17,553
(1.53 %)
19,299
(1.39 %)
n/a 41.89
(100.00 %)
134
(0.00 %)
390
(100.00 %)
4,629,539
(33.53 %)
919,008
(2.02 %)
12,766,157
(34.70 %)
65,437
(2.53 %)
646 puma (SC36_Marlon 2018 refseq)
GCF_003327715.1
25,588
(1.44 %)
17,664
(1.57 %)
16,565
(1.29 %)
n/a 41.36
(95.34 %)
178,992
(4.69 %)
2,175
(100.00 %)
4,885,335
(42.70 %)
833,138
(1.76 %)
13,705,778
(31.28 %)
58,912
(1.65 %)
647 punctate agouti
GCA_004363535.1
n/a 22,612
(1.05 %)
45,433
(1.19 %)
n/a 40.79
(99.92 %)
6,459
(0.02 %)
993,123
(99.98 %)
5,671,738
(32.53 %)
945,722
(1.69 %)
17,003,309
(36.58 %)
85,696
(1.65 %)
648 Punta de Vaca leaf-eared mouse (GD2095 2023)
GCA_033318265.1
n/a 18,332
(1.50 %)
18,296
(1.29 %)
n/a 40.01
(100.00 %)
133
(0.00 %)
437
(100.00 %)
3,825,722
(28.38 %)
915,865
(11.98 %)
13,456,122
(37.89 %)
18,577
(0.50 %)
649 pygmy sperm whale
GCA_004363705.1
n/a 22,661
(1.30 %)
42,546
(1.15 %)
n/a 41.89
(99.89 %)
6,053
(0.02 %)
1,258,125
(99.98 %)
5,185,912
(43.65 %)
836,752
(1.88 %)
14,150,125
(39.88 %)
95,344
(2.15 %)
650 pygmy sperm whale (haplotype 1 2022 refseq)
GCF_026419965.1
73,518
(2.67 %)
18,496
(1.55 %)
20,718
(1.32 %)
n/a 42.05
(99.81 %)
143
(0.19 %)
581
(100.00 %)
3,817,659
(34.51 %)
758,297
(7.42 %)
12,196,998
(39.96 %)
101,353
(2.90 %)
651 pygmy sperm whale (mKogBre1 haplotype 2 2022)
GCA_026419985.1
n/a 18,550
(1.51 %)
20,491
(1.29 %)
n/a 42.18
(99.99 %)
138
(0.01 %)
391
(100.00 %)
3,860,112
(33.83 %)
820,375
(9.58 %)
12,159,196
(41.59 %)
106,168
(2.78 %)
652 Pyrenean desman (IBE-C5619 2021)
GCA_019455555.1
n/a 17,527
(1.87 %)
20,474
(1.83 %)
n/a 41.67
(98.52 %)
63,679
(1.49 %)
75,985
(98.51 %)
2,147,379
(23.41 %)
327,740
(0.98 %)
10,539,226
(28.05 %)
44,487
(4.39 %)
653 rabbit (A946 2020)
GCA_013371645.1
n/a 19,881
(1.40 %)
22,566
(1.32 %)
n/a 44.09
(99.92 %)
4,254
(0.08 %)
5,157
(99.93 %)
5,202,709
(44.78 %)
1,059,544
(2.39 %)
13,897,372
(40.69 %)
119,691
(2.74 %)
654 rabbit (alternate hap 2024)
GCA_964237575.1
n/a 12,274
(1.39 %)
16,482
(1.38 %)
n/a 44.19
(100.00 %)
n/a 10,111
(100.00 %)
3,613,446
(49.48 %)
579,915
(3.18 %)
7,084,192
(39.81 %)
65,573
(2.79 %)
655 rabbit (New Zealand White DNA-2018 2021 refseq)
GCF_009806435.1
83,033
(4.16 %)
19,486
(1.31 %)
23,267
(1.31 %)
n/a 43.83
(97.68 %)
18,178
(2.32 %)
3,160
(100.00 %)
4,072,524
(21.41 %)
976,273
(2.33 %)
13,766,413
(39.76 %)
113,371
(2.46 %)
656 rabbit (primary hap 2024 refseq)
GCF_964237555.1
95,289
(4.22 %)
19,385
(1.31 %)
22,631
(1.31 %)
n/a 44.02
(99.98 %)
2,276
(0.02 %)
221
(100.00 %)
4,099,586
(21.20 %)
1,062,900
(3.78 %)
13,416,814
(41.72 %)
116,523
(2.66 %)
657 rabbit (Thorbecke 2009 Broad refseq)
GCF_000003625.3
43,642
(2.34 %)
18,665
(1.39 %)
20,095
(1.24 %)
n/a 43.75
(95.14 %)
80,789
(4.88 %)
84,024
(95.12 %)
4,890,480
(44.71 %)
883,939
(1.73 %)
13,254,520
(38.27 %)
110,337
(2.33 %)
658 raccoon dog (2021)
GCF_905146905.1
52,577
(2.89 %)
19,628
(1.60 %)
20,274
(1.43 %)
n/a 41.28
(99.98 %)
70
(0.02 %)
811
(100.00 %)
4,499,368
(31.98 %)
1,005,212
(2.04 %)
13,884,201
(32.95 %)
52,450
(2.27 %)
659 Rambouillet sheep (Baylor 2017)
GCF_002742125.1
50,083
(2.48 %)
19,992
(1.47 %)
22,506
(1.31 %)
41,290
(1.46 %)
41.91
(99.99 %)
4,847
(0.01 %)
7,486
(99.99 %)
5,764,757
(47.38 %)
507,629
(1.55 %)
14,138,601
(41.27 %)
51,748
(1.29 %)
660 Rambouillet sheep (U.Idaho 2021)
GCF_016772045.1
70,461
(3.21 %)
19,413
(1.59 %)
21,222
(1.35 %)
n/a 41.99
(100.00 %)
84
(0.00 %)
142
(100.00 %)
5,300,958
(46.83 %)
455,553
(1.24 %)
13,023,443
(40.62 %)
43,959
(1.30 %)
661 ratel
GCA_004024625.1
n/a 22,196
(1.21 %)
35,937
(1.18 %)
n/a 42.00
(99.85 %)
6,511
(0.02 %)
2,074,823
(99.98 %)
6,171,383
(41.93 %)
877,669
(1.49 %)
15,269,908
(41.22 %)
95,094
(1.91 %)
662 red bat
GCA_004026805.1
n/a 27,510
(1.22 %)
65,467
(1.48 %)
n/a 42.69
(99.94 %)
6,380
(0.02 %)
525,280
(99.98 %)
4,644,227
(28.24 %)
1,170,868
(2.68 %)
15,628,238
(39.97 %)
125,564
(3.55 %)
663 red deer (2021)
GCF_910594005.1
68,992
(2.68 %)
20,470
(1.48 %)
22,563
(1.32 %)
n/a 42.98
(100.00 %)
40
(0.00 %)
144
(100.00 %)
5,501,063
(44.60 %)
503,301
(12.23 %)
13,102,622
(44.55 %)
88,756
(1.66 %)
664 red deer (alternate hap 2021)
GCA_910593805.1
n/a 18,817
(1.29 %)
21,916
(1.20 %)
n/a 44.23
(100.00 %)
22
(0.00 %)
4,021
(100.00 %)
3,279,005
(20.48 %)
472,706
(21.87 %)
11,466,609
(50.26 %)
128,858
(2.07 %)
665 red fox (BD-2025 2025)
GCF_048418805.1
84,632
(3.45 %)
19,565
(1.57 %)
19,909
(1.38 %)
n/a 41.31
(100.00 %)
104
(0.00 %)
289
(100.00 %)
4,480,315
(31.76 %)
1,010,887
(2.70 %)
13,766,344
(33.12 %)
50,763
(2.22 %)
666 red fox (hap1 2024)
GCA_964106825.2
n/a 19,622
(1.57 %)
20,371
(1.38 %)
n/a 41.34
(99.98 %)
1,845
(0.02 %)
461
(100.00 %)
4,519,485
(31.91 %)
1,018,114
(2.59 %)
13,810,284
(32.99 %)
52,053
(2.31 %)
667 red fox (hap2 2024)
GCA_964106925.2
n/a 19,517
(1.57 %)
20,105
(1.37 %)
n/a 41.31
(99.99 %)
1,819
(0.02 %)
350
(100.00 %)
4,487,839
(31.79 %)
1,010,106
(2.64 %)
13,838,711
(33.07 %)
51,373
(2.26 %)
668 red fox (tameXaggressive cross 2018)
GCF_003160815.1
43,508
(2.67 %)
19,826
(1.69 %)
18,893
(1.40 %)
n/a 41.08
(97.06 %)
246,167
(2.96 %)
82,424
(100.00 %)
4,919,102
(40.79 %)
954,461
(2.46 %)
14,190,625
(30.86 %)
53,204
(1.88 %)
669 reed vole (MF-2015 2020)
GCF_014885135.2
55,722
(3.60 %)
19,808
(1.93 %)
20,787
(1.69 %)
n/a 42.36
(95.60 %)
67,118
(4.40 %)
10,460
(100.00 %)
3,130,955
(20.09 %)
831,969
(2.09 %)
11,985,657
(28.48 %)
18,764
(0.58 %)
670 Reeves' muntjac (alternate hap 2024)
GCA_963930665.1
n/a 18,947
(1.29 %)
24,114
(1.28 %)
n/a 42.75
(100.00 %)
n/a 8,892
(100.00 %)
3,375,476
(23.21 %)
654,539
(6.64 %)
11,132,469
(48.29 %)
79,357
(2.66 %)
671 Reeves' muntjac (primary hap 2024)
GCF_963930625.1
52,442
(2.57 %)
19,577
(1.52 %)
22,283
(1.38 %)
n/a 41.89
(99.99 %)
682
(0.01 %)
267
(100.00 %)
3,294,672
(23.89 %)
527,436
(2.98 %)
13,137,581
(39.89 %)
57,436
(1.81 %)
672 reindeer (2023)
GCA_963422255.1
n/a 21,329
(1.58 %)
25,201
(1.59 %)
n/a 41.46
(98.35 %)
131,886
(1.65 %)
259,765
(98.35 %)
3,254,173
(23.49 %)
440,431
(2.00 %)
14,258,607
(36.17 %)
48,931
(1.20 %)
673 reindeer (US061 2019)
GCA_004026565.1
n/a 24,150
(1.39 %)
39,911
(1.41 %)
n/a 42.08
(99.89 %)
4,769
(0.02 %)
1,365,508
(99.98 %)
6,083,178
(46.10 %)
546,470
(1.23 %)
14,434,855
(43.16 %)
55,319
(1.23 %)
674 Rice's whale (hap1 2023)
GCA_028017805.1
n/a 19,396
(1.48 %)
21,693
(1.26 %)
n/a 41.62
(97.80 %)
131
(2.20 %)
1,039
(100.00 %)
3,973,936
(35.55 %)
987,571
(11.66 %)
12,473,459
(42.11 %)
74,971
(1.64 %)
675 Rice's whale (hap2 2023 refseq)
GCF_028023285.1
59,888
(2.34 %)
19,291
(1.53 %)
21,195
(1.30 %)
n/a 41.44
(99.90 %)
334
(0.10 %)
774
(100.00 %)
3,917,923
(36.26 %)
828,521
(9.28 %)
12,518,796
(41.08 %)
73,126
(1.69 %)
676 Rickett's big-footed myotis (AB-2021 2024)
GCA_036010255.1
n/a 18,982
(1.81 %)
22,002
(1.76 %)
n/a 43.12
(100.00 %)
n/a 105
(100.00 %)
2,909,847
(24.53 %)
757,964
(3.03 %)
10,561,925
(36.25 %)
57,318
(2.32 %)
677 Risso's dolphin (hap1.1 2024)
GCA_964374135.1
n/a 18,825
(1.58 %)
20,986
(1.29 %)
n/a 42.25
(99.99 %)
1,138
(0.01 %)
1,150
(100.00 %)
4,405,513
(43.51 %)
1,342,544
(11.28 %)
12,274,096
(41.76 %)
76,936
(4.65 %)
678 Risso's dolphin (hap2.1 2024)
GCA_964374185.1
n/a 18,061
(1.68 %)
20,080
(1.36 %)
n/a 41.97
(99.99 %)
1,073
(0.01 %)
2,135
(99.99 %)
3,948,427
(43.52 %)
848,222
(8.00 %)
11,527,950
(38.76 %)
70,117
(3.31 %)
679 root vole (2023)
GCA_963919705.1
n/a 19,293
(1.92 %)
20,635
(1.67 %)
n/a 42.30
(100.00 %)
3
(0.00 %)
268
(100.00 %)
4,396,130
(38.90 %)
891,534
(2.66 %)
12,119,692
(31.39 %)
19,542
(0.63 %)
680 Ryukyu mouse (v2 2017)
GCF_900094665.2
53,792
(2.85 %)
21,351
(2.29 %)
18,073
(1.39 %)
n/a 41.70
(89.05 %)
306,599
(10.98 %)
30,835
(92.70 %)
4,479,912
(35.83 %)
1,351,677
(2.59 %)
12,964,608
(27.49 %)
15,963
(0.43 %)
681 Saanen dairy goat
GCA_015443085.1
n/a 19,257
(1.54 %)
21,221
(1.32 %)
n/a 42.30
(100.00 %)
170
(0.00 %)
1,362
(100.00 %)
5,336,862
(47.58 %)
515,161
(2.87 %)
13,144,895
(41.67 %)
58,623
(2.22 %)
682 saddleback dolphin (alternate hap 2023)
GCA_949987525.1
n/a 18,509
(1.54 %)
22,514
(1.36 %)
n/a 41.95
(100.00 %)
1
(0.00 %)
7,427
(100.00 %)
3,675,922
(35.75 %)
950,374
(10.49 %)
11,670,399
(40.31 %)
63,587
(3.15 %)
683 saddleback dolphin (alternate hap 2024)
GCA_949987525.2
n/a 18,426
(1.62 %)
22,420
(1.35 %)
n/a 41.95
(100.00 %)
1
(0.00 %)
7,427
(100.00 %)
4,448,346
(50.40 %)
950,374
(10.49 %)
11,670,399
(40.31 %)
63,587
(3.15 %)
684 saddleback dolphin (primary hap 2024)
GCA_949987515.2
n/a 18,542
(1.57 %)
20,620
(1.32 %)
n/a 42.06
(99.99 %)
968
(0.01 %)
631
(100.00 %)
4,890,277
(52.33 %)
1,258,165
(13.09 %)
12,359,469
(42.64 %)
66,188
(3.91 %)
685 saddleback dolphin (v1 primary hap 2023 refseq)
GCF_949987515.1
46,746
(2.39 %)
18,624
(1.49 %)
20,662
(1.31 %)
n/a 42.06
(99.99 %)
968
(0.01 %)
630
(100.00 %)
4,020,676
(35.99 %)
1,259,549
(13.09 %)
12,359,748
(42.64 %)
66,179
(3.91 %)
686 saddleback dolphin (v2 primary hap 2024 refseq)
GCF_949987515.2
46,014
(2.36 %)
18,616
(1.49 %)
20,618
(1.32 %)
n/a 42.06
(99.99 %)
968
(0.01 %)
1,598
(99.99 %)
4,020,525
(35.99 %)
1,258,165
(13.09 %)
12,359,758
(42.64 %)
66,188
(3.91 %)
687 saiga antelope
GCA_004024985.1
n/a 23,736
(0.84 %)
55,133
(0.88 %)
n/a 42.52
(99.87 %)
2,867
(0.01 %)
1,775,066
(99.99 %)
6,485,113
(49.43 %)
447,097
(0.88 %)
13,972,753
(44.46 %)
46,883
(0.82 %)
688 Schreibers' long-fingered bat (US075 2019)
GCA_004026525.1
n/a 20,147
(2.06 %)
31,271
(1.82 %)
n/a 42.27
(99.94 %)
6,918
(0.04 %)
184,538
(99.96 %)
2,772,932
(29.66 %)
366,782
(1.13 %)
10,477,531
(28.60 %)
62,520
(2.73 %)
689 Schreibers' long-fingered bat (v2 hap1 2025)
GCA_964146895.2
n/a 18,109
(2.10 %)
21,263
(1.89 %)
n/a 42.51
(100.00 %)
140
(0.00 %)
186
(100.00 %)
2,812,261
(34.39 %)
457,565
(5.58 %)
10,220,083
(31.02 %)
59,522
(2.81 %)
690 Schreibers' long-fingered bat (v2 hap2 2025)
GCA_964145185.2
n/a 17,286
(2.19 %)
20,474
(1.95 %)
n/a 42.64
(100.00 %)
86
(0.00 %)
254
(100.00 %)
2,610,773
(33.65 %)
389,844
(4.42 %)
9,728,138
(29.49 %)
56,508
(2.97 %)
691 scimitar-horned oryx
GCF_014754425.2
51,527
(2.72 %)
19,713
(1.57 %)
21,928
(1.32 %)
n/a 41.74
(99.30 %)
16,241
(0.70 %)
9,089
(100.00 %)
5,435,109
(46.76 %)
414,279
(0.98 %)
13,490,956
(40.45 %)
42,961
(1.10 %)
692 Screaming hairy armadillo
GCA_004027955.1
n/a 24,532
(0.39 %)
56,725
(0.46 %)
n/a 39.68
(99.70 %)
2,747
(0.01 %)
7,680,080
(99.99 %)
8,978,735
(36.02 %)
1,516,551
(1.58 %)
32,918,217
(47.67 %)
234,762
(1.56 %)
693 sea otter (GAN:26980312 2017 refseq)
GCF_002288905.1
38,140
(2.17 %)
18,578
(1.64 %)
20,913
(1.44 %)
34,179
(1.77 %)
41.56
(98.79 %)
23,134
(1.21 %)
29,589
(98.79 %)
4,703,044
(41.42 %)
721,750
(1.39 %)
14,065,653
(32.89 %)
55,388
(1.87 %)
694 Seba's short-tailed bat
GCA_004027735.1
n/a 21,878
(0.94 %)
55,858
(1.10 %)
n/a 42.70
(99.84 %)
3,864
(0.01 %)
1,929,203
(99.99 %)
3,802,235
(28.35 %)
606,320
(1.03 %)
15,171,250
(31.99 %)
118,227
(2.28 %)
695 sei whale (hap1.1 2025)
GCA_965194805.1
n/a 19,292
(1.27 %)
21,865
(1.14 %)
n/a 41.99
(99.99 %)
1,179
(0.01 %)
2,572
(100.00 %)
4,525,289
(42.25 %)
1,097,216
(21.14 %)
12,203,884
(50.47 %)
80,128
(1.58 %)
696 sei whale (hap2.1 2025)
GCA_965194725.1
n/a 19,313
(1.37 %)
21,662
(1.17 %)
n/a 41.68
(99.99 %)
1,066
(0.01 %)
2,917
(99.99 %)
4,418,625
(42.98 %)
875,114
(15.81 %)
12,360,254
(46.52 %)
78,537
(1.66 %)
697 sheep (hu hu3095 2024)
GCA_040805955.1
n/a 19,388
(1.42 %)
21,612
(1.28 %)
n/a 43.17
(100.00 %)
n/a 28
(100.00 %)
5,311,536
(44.06 %)
653,238
(7.29 %)
12,937,231
(44.10 %)
63,230
(6.03 %)
698 sheep (OAR_USU_Benz2616 2023)
GCF_016772045.2
89,680
(5.44 %)
19,308
(1.52 %)
21,506
(1.35 %)
n/a 42.01
(100.00 %)
84
(0.00 %)
143
(100.00 %)
3,275,767
(22.85 %)
464,346
(1.26 %)
12,987,607
(40.61 %)
44,477
(1.28 %)
699 sheep (Texel 2015)
GCA_000298735.2
n/a 19,179
(1.56 %)
19,001
(1.26 %)
48,105
(1.85 %)
41.90
(98.94 %)
44,566
(1.07 %)
48,481
(98.93 %)
5,429,824
(46.13 %)
540,267
(1.64 %)
13,509,668
(38.83 %)
43,911
(1.13 %)
700 shrew mouse
GCF_900095145.1
46,279
(2.64 %)
20,549
(2.23 %)
18,979
(1.49 %)
94,079
(3.98 %)
41.89
(90.53 %)
269,643
(9.50 %)
17,879
(93.73 %)
4,788,498
(38.32 %)
1,499,714
(3.03 %)
13,021,757
(27.83 %)
16,787
(0.47 %)
701 Siberian hamster (SSSS 2022)
GCA_023856395.1
n/a 18,375
(1.83 %)
17,066
(1.44 %)
n/a 41.27
(99.64 %)
88,601
(0.37 %)
7,756
(100.00 %)
3,152,242
(21.63 %)
1,087,009
(2.64 %)
12,055,167
(29.20 %)
15,455
(0.48 %)
702 Siberian musk deer (BS20 2019 Broad)
GCA_004024705.1
n/a 23,440
(1.32 %)
37,497
(1.19 %)
n/a 42.32
(99.86 %)
19,764
(0.07 %)
1,195,467
(99.93 %)
6,726,950
(49.79 %)
437,480
(1.57 %)
14,155,240
(46.22 %)
49,177
(1.05 %)
703 sika deer (Changchun, China MLH-2022 2023)
GCA_034195675.1
n/a 20,087
(1.59 %)
23,556
(1.46 %)
n/a 41.66
(99.97 %)
1,724
(0.03 %)
1,889
(100.00 %)
3,925,148
(27.17 %)
419,490
(1.24 %)
13,364,988
(37.79 %)
47,630
(1.31 %)
704 small Madagascar hedgehog
GCF_000313985.2
37,090
(1.93 %)
18,969
(1.19 %)
19,298
(1.31 %)
n/a 43.01
(88.43 %)
270,406
(11.60 %)
7,490
(100.00 %)
3,789,337
(28.89 %)
429,226
(0.87 %)
16,951,112
(32.23 %)
39,993
(0.70 %)
705 smoky shrew (2023)
GCF_029834395.1
37,165
(1.66 %)
17,572
(1.06 %)
24,146
(1.29 %)
n/a 43.43
(100.00 %)
n/a 497
(100.00 %)
2,593,080
(14.11 %)
1,194,567
(7.25 %)
14,051,522
(48.20 %)
107,473
(2.80 %)
706 snow leopard (11264 2022)
GCF_023721935.1
53,569
(3.37 %)
18,780
(1.67 %)
21,038
(1.40 %)
n/a 41.60
(99.30 %)
23,786
(0.70 %)
2,636
(100.00 %)
4,714,429
(34.93 %)
919,518
(1.59 %)
13,711,504
(33.24 %)
64,690
(2.41 %)
707 snowshoe hare
GCA_004026855.1
n/a 23,263
(0.88 %)
55,811
(1.01 %)
n/a 44.12
(99.87 %)
10,153
(0.03 %)
1,602,982
(99.97 %)
4,767,120
(21.29 %)
1,040,992
(2.22 %)
15,680,144
(43.23 %)
126,152
(2.28 %)
708 social tuco-tuco
GCA_004027165.1
n/a 25,166
(1.12 %)
41,316
(1.26 %)
n/a 40.71
(99.89 %)
16,191
(0.06 %)
823,762
(99.94 %)
5,390,906
(28.28 %)
1,027,922
(2.15 %)
15,241,308
(38.39 %)
31,883
(0.72 %)
709 Soft-furred tree mouse (WYS1704033 2022)
GCA_023101885.1
n/a 20,505
(1.36 %)
25,606
(1.53 %)
n/a 42.21
(99.64 %)
3,794
(0.36 %)
1,243
(100.00 %)
5,973,279
(45.08 %)
1,551,851
(4.63 %)
13,570,249
(38.60 %)
73,762
(1.53 %)
710 soprano pipistrelle (alternate hap 2023)
GCA_949987765.1
n/a 17,590
(1.81 %)
21,597
(1.85 %)
n/a 42.88
(100.00 %)
1
(0.00 %)
2,717
(100.00 %)
2,734,555
(21.46 %)
795,752
(6.56 %)
9,601,735
(36.35 %)
62,524
(3.25 %)
711 soprano pipistrelle (hap1.2 2025)
GCA_949987585.2
n/a 17,999
(1.88 %)
21,396
(1.80 %)
n/a 42.74
(100.00 %)
122
(0.00 %)
330
(100.00 %)
4,426,108
(44.40 %)
866,819
(7.44 %)
10,132,985
(37.65 %)
64,680
(3.15 %)
712 soprano pipistrelle (hap2.2 2025)
GCA_949987765.2
n/a 17,269
(1.90 %)
20,534
(1.83 %)
n/a 42.89
(100.00 %)
87
(0.00 %)
369
(100.00 %)
4,151,522
(43.86 %)
809,312
(8.01 %)
9,615,104
(37.56 %)
63,890
(3.24 %)
713 soprano pipistrelle (primary hap 2023)
GCA_949987585.1
n/a 18,056
(1.78 %)
21,158
(1.79 %)
n/a 42.67
(100.00 %)
161
(0.00 %)
249
(100.00 %)
2,899,535
(21.64 %)
853,717
(7.80 %)
10,162,216
(37.72 %)
63,256
(3.06 %)
714 South African ground squirrel
GCA_004024805.1
n/a 22,802
(1.44 %)
33,892
(1.27 %)
n/a 39.97
(99.92 %)
9,745
(0.04 %)
587,115
(99.96 %)
5,256,998
(34.93 %)
594,122
(1.27 %)
14,462,947
(33.96 %)
34,141
(0.80 %)
715 Southeastern Asian house mouse (2016)
GCA_001624445.1
n/a 21,103
(2.24 %)
18,682
(1.45 %)
102,099
(4.16 %)
41.83
(86.23 %)
424,005
(13.83 %)
52,352
(97.85 %)
4,990,851
(39.88 %)
1,356,202
(2.67 %)
13,469,640
(26.15 %)
16,724
(0.41 %)
716 Southeastern Asian house mouse (2022)
GCA_921999005.2
n/a 21,799
(2.13 %)
19,729
(1.40 %)
110,356
(4.43 %)
41.78
(99.19 %)
278
(0.81 %)
151
(100.00 %)
4,663,228
(40.41 %)
1,549,985
(3.70 %)
13,012,600
(34.99 %)
21,349
(0.52 %)
717 Southeastern Asian house mouse (T2T 2024)
GCA_964188545.1
n/a 22,529
(1.85 %)
20,409
(1.22 %)
n/a 41.10
(99.90 %)
78
(0.10 %)
416
(99.90 %)
4,880,101
(47.77 %)
1,689,287
(15.13 %)
12,822,147
(42.92 %)
22,642
(0.54 %)
718 Southern African pygmy mouse (2020)
GCA_902729485.2
n/a 21,253
(2.02 %)
24,053
(1.41 %)
n/a 41.62
(85.36 %)
63,317
(14.65 %)
92,356
(85.35 %)
5,677,434
(41.24 %)
1,683,338
(3.20 %)
13,320,768
(28.29 %)
21,132
(0.44 %)
719 southern elephant seal
GCF_011800145.1
53,210
(2.86 %)
19,520
(1.73 %)
20,727
(1.41 %)
39,634
(1.86 %)
41.45
(99.36 %)
22,850
(0.64 %)
1,115
(100.00 %)
4,728,105
(43.75 %)
585,443
(1.13 %)
13,463,979
(33.65 %)
53,182
(1.62 %)
720 southern grasshopper mouse (2020)
GCA_903995425.1
n/a 19,395
(1.68 %)
18,821
(1.36 %)
n/a 41.81
(98.94 %)
2,143
(1.06 %)
2,949
(100.00 %)
4,850,480
(28.64 %)
1,195,836
(2.72 %)
13,539,823
(32.73 %)
18,046
(0.54 %)
721 southern grasshopper mouse (2020)
GCF_903995425.1
47,152
(2.39 %)
19,356
(1.68 %)
18,821
(1.36 %)
n/a 41.81
(98.94 %)
2,143
(1.06 %)
2,949
(100.00 %)
4,850,460
(28.64 %)
1,195,836
(2.72 %)
13,540,762
(32.73 %)
18,046
(0.54 %)
722 southern multimammate mouse
GCF_008632895.1
69,058
(3.04 %)
20,313
(2.11 %)
17,745
(1.38 %)
n/a 41.39
(91.90 %)
146,713
(8.12 %)
28
(100.00 %)
4,875,400
(38.43 %)
1,454,350
(2.93 %)
13,104,717
(28.82 %)
16,715
(0.45 %)
723 southern tamandua (mTamTet1 alternate hap 2022)
GCA_023853755.1
n/a 20,179
(1.21 %)
24,249
(1.19 %)
n/a 39.54
(100.00 %)
4
(0.00 %)
7,866
(100.00 %)
3,953,031
(35.88 %)
531,111
(1.14 %)
16,354,874
(39.96 %)
59,907
(1.35 %)
724 southern tamandua (mTamTet1 primary hap 2022)
GCA_023851605.1
n/a 20,058
(1.26 %)
22,196
(1.13 %)
n/a 39.48
(99.44 %)
961
(0.56 %)
201
(100.00 %)
4,037,291
(46.02 %)
593,019
(1.17 %)
18,033,833
(40.56 %)
65,039
(1.33 %)
725 southern tamandua (mTamTet1 primary hap 2022)
GCF_023851605.1
84,279
(3.04 %)
20,960
(1.28 %)
22,188
(1.13 %)
n/a 39.48
(99.44 %)
961
(0.56 %)
200
(100.00 %)
4,793,649
(47.24 %)
593,018
(1.17 %)
18,033,318
(40.56 %)
65,039
(1.33 %)
726 southern three-banded armadillo
GCA_004025125.1
n/a 29,138
(0.73 %)
56,522
(0.75 %)
n/a 39.20
(99.82 %)
15,801
(0.04 %)
2,941,308
(99.96 %)
6,990,740
(38.88 %)
839,452
(1.23 %)
24,805,397
(43.95 %)
71,951
(0.98 %)
727 southern two-toed sloth (mChoDid1 alternate hap 2020)
GCA_015220265.1
n/a 22,897
(1.23 %)
27,007
(1.18 %)
n/a 39.87
(100.00 %)
70
(0.00 %)
12,050
(100.00 %)
4,502,020
(38.27 %)
576,759
(1.02 %)
17,143,050
(40.65 %)
51,339
(1.15 %)
728 southern two-toed sloth (mChoDid1 primary hap 2020)
GCF_015220235.1
63,054
(2.39 %)
21,998
(1.29 %)
23,177
(1.18 %)
45,345
(1.69 %)
39.89
(97.48 %)
1,243
(2.52 %)
146
(100.00 %)
4,559,690
(39.66 %)
577,607
(1.02 %)
16,594,630
(40.50 %)
51,430
(1.14 %)
729 southern two-toed sloth (primary hap 2020)
GCA_015220235.1
n/a 22,250
(1.38 %)
23,180
(1.18 %)
n/a 39.89
(97.48 %)
1,240
(2.52 %)
146
(100.00 %)
4,830,544
(50.68 %)
577,607
(1.02 %)
16,594,148
(40.49 %)
51,430
(1.14 %)
730 southern white rhinoceros (SDZICR_KB13650 2012 refseq)
GCF_000283155.1
37,037
(2.11 %)
18,398
(1.71 %)
19,753
(1.44 %)
n/a 40.90
(96.05 %)
54,737
(3.96 %)
57,824
(96.04 %)
3,685,898
(38.31 %)
421,694
(0.97 %)
14,765,529
(28.93 %)
36,281
(1.02 %)
731 Sowerby's beaked whale (hap1 2024)
GCA_964165515.1
n/a 19,471
(1.39 %)
22,951
(1.24 %)
n/a 42.04
(99.99 %)
1,095
(0.01 %)
1,604
(100.00 %)
4,307,839
(34.31 %)
825,475
(10.97 %)
11,375,945
(45.31 %)
76,527
(3.10 %)
732 Sowerby's beaked whale (hap2 2024)
GCA_964148845.1
n/a 18,591
(1.46 %)
21,588
(1.27 %)
n/a 42.00
(99.99 %)
974
(0.01 %)
2,126
(99.99 %)
3,961,403
(34.20 %)
742,897
(9.73 %)
10,832,739
(43.68 %)
70,803
(2.85 %)
733 Sowerby's beaked whale (US080 2019)
GCA_004027085.1
n/a 22,800
(1.32 %)
38,247
(1.17 %)
n/a 41.68
(99.84 %)
8,597
(0.03 %)
1,810,317
(99.97 %)
5,520,986
(45.05 %)
1,081,962
(2.69 %)
13,480,261
(43.01 %)
69,001
(1.39 %)
734 sperm whale (SW-GA 2023)
GCF_002837175.3
62,616
(2.83 %)
19,485
(1.75 %)
22,707
(1.41 %)
n/a 41.33
(95.82 %)
121,387
(4.20 %)
133,555
(95.80 %)
3,906,439
(36.43 %)
691,647
(2.39 %)
13,489,368
(32.95 %)
86,751
(2.23 %)
735 spotted-tailed quoll (Chaos hap1 2025)
GCA_048593285.1
n/a 15,188
(0.80 %)
15,406
(0.90 %)
n/a 36.07
(99.97 %)
151
(0.03 %)
157
(99.97 %)
4,933,924
(23.65 %)
1,239,006
(2.76 %)
20,612,787
(41.98 %)
21,700
(0.64 %)
736 spotted-tailed quoll (Chaos hap2 2025)
GCA_048593245.1
n/a 15,441
(0.80 %)
15,791
(0.92 %)
n/a 36.12
(99.99 %)
118
(0.01 %)
124
(99.99 %)
4,962,547
(23.62 %)
1,257,253
(2.87 %)
20,652,321
(42.01 %)
22,718
(0.69 %)
737 star-nosed mole
GCF_000260355.1
30,444
(2.86 %)
16,116
(1.82 %)
17,403
(1.78 %)
n/a 41.55
(95.10 %)
82,557
(4.92 %)
84,595
(95.08 %)
1,855,039
(18.90 %)
308,473
(0.86 %)
9,571,561
(26.02 %)
48,079
(2.76 %)
738 Steller sea lion
GCF_004028035.1
46,044
(2.38 %)
21,171
(1.78 %)
21,626
(1.43 %)
36,701
(1.75 %)
41.38
(99.41 %)
18,994
(0.59 %)
24,485
(99.41 %)
4,556,415
(43.53 %)
577,797
(1.09 %)
13,545,012
(33.71 %)
51,355
(1.45 %)
739 Stephens's kangaroo rat
GCA_004024685.1
n/a 20,638
(1.19 %)
43,541
(1.37 %)
n/a 41.90
(99.85 %)
8,882
(0.04 %)
1,278,525
(99.96 %)
4,886,095
(30.36 %)
1,229,832
(5.30 %)
11,334,494
(44.33 %)
38,450
(1.17 %)
740 steppe mouse (ZRU 2018)
GCA_003336285.1
n/a 22,032
(2.17 %)
20,891
(1.41 %)
n/a 41.70
(95.78 %)
123,681
(4.24 %)
161,217
(95.76 %)
4,964,415
(42.35 %)
1,414,584
(2.75 %)
12,989,925
(31.80 %)
17,544
(0.44 %)
741 Stoliczka's trident bat (China 2021113_DDA alternate hap 2024)
GCA_043727795.1
n/a 18,498
(1.82 %)
20,345
(1.58 %)
n/a 41.33
(100.00 %)
2
(0.00 %)
2,228
(100.00 %)
4,403,018
(41.05 %)
809,880
(2.56 %)
11,206,839
(32.61 %)
38,354
(1.36 %)
742 Stoliczka's trident bat (China 2021113_DDA primary hap 2024)
GCA_043727835.1
n/a 19,605
(1.80 %)
20,075
(1.48 %)
n/a 41.32
(100.00 %)
87
(0.00 %)
80
(100.00 %)
4,110,913
(40.46 %)
838,212
(2.48 %)
11,938,168
(33.52 %)
40,424
(1.32 %)
743 straw-colored fruit bat
GCA_000465285.1
n/a 20,161
(1.66 %)
40,283
(1.50 %)
n/a 39.24
(99.62 %)
154,908
(0.40 %)
288,446
(99.60 %)
2,814,732
(32.92 %)
372,539
(1.01 %)
12,351,823
(25.93 %)
67,245
(2.34 %)
744 stripe-headed round-eared bat
GCA_004024845.1
n/a 20,248
(1.62 %)
29,173
(1.61 %)
n/a 42.04
(99.96 %)
2,860
(0.01 %)
252,670
(99.99 %)
3,018,746
(29.48 %)
333,243
(0.74 %)
12,128,116
(30.51 %)
59,513
(1.87 %)
745 striped dolphin (alternate hap 2023)
GCA_951394445.1
n/a 18,204
(1.54 %)
21,036
(1.34 %)
n/a 42.07
(100.00 %)
n/a 3,464
(100.00 %)
3,767,720
(35.65 %)
1,102,723
(10.92 %)
11,794,617
(40.96 %)
67,537
(3.57 %)
746 striped dolphin (primary hap 2023)
GCA_951394435.1
n/a 18,595
(1.48 %)
20,637
(1.29 %)
n/a 42.18
(99.99 %)
993
(0.01 %)
639
(100.00 %)
4,097,623
(35.88 %)
1,442,973
(13.60 %)
12,327,244
(43.08 %)
68,498
(4.29 %)
747 striped hyena (BS54 2019 Broad)
GCA_004023945.1
n/a 22,373
(1.45 %)
39,382
(1.45 %)
n/a 41.66
(99.93 %)
11,849
(0.05 %)
362,072
(99.95 %)
5,048,667
(42.42 %)
712,073
(1.24 %)
13,879,012
(34.58 %)
69,835
(2.20 %)
748 striped hyena (Hyena2069 2018 Potsdam U)
GCF_003009895.1
48,870
(2.41 %)
18,793
(1.67 %)
20,950
(1.44 %)
n/a 41.56
(99.29 %)
23,058
(0.71 %)
5,761
(100.00 %)
4,782,500
(41.88 %)
701,157
(1.32 %)
13,436,624
(33.05 %)
58,977
(2.20 %)
749 sugar glider (PSGF00001 2023)
GCA_028583685.1
n/a 19,326
(0.81 %)
17,560
(0.95 %)
n/a 38.95
(98.12 %)
85,933
(1.89 %)
1,895
(100.00 %)
6,382,198
(27.07 %)
1,058,207
(1.74 %)
22,508,040
(39.84 %)
16,224
(0.33 %)
750 sugar glider (PSGF00001 2023)
GCF_028583685.1
55,990
(2.41 %)
19,328
(0.81 %)
17,559
(0.95 %)
n/a 38.95
(98.12 %)
85,933
(1.89 %)
1,896
(100.00 %)
6,382,203
(27.07 %)
1,058,208
(1.74 %)
22,508,106
(39.84 %)
16,224
(0.33 %)
751 Sumatran rhinoceros (Ipuh 2017)
GCA_002844835.1
n/a 20,368
(1.53 %)
24,204
(1.23 %)
n/a 41.05
(95.54 %)
50,876
(4.40 %)
1,112,463
(95.60 %)
4,516,240
(39.90 %)
561,540
(1.56 %)
15,821,451
(34.68 %)
45,201
(1.03 %)
752 Sumatran serow (serow.1 2024)
GCF_032405125.1
36,400
(1.65 %)
19,192
(1.42 %)
22,014
(1.41 %)
n/a 43.08
(100.00 %)
6
(0.00 %)
159
(100.00 %)
3,242,768
(21.18 %)
612,565
(8.05 %)
12,812,990
(44.37 %)
75,177
(5.86 %)
753 Sunda flying lemur (2014 WashU)
GCF_000696425.1
34,734
(1.83 %)
21,356
(1.55 %)
25,832
(1.21 %)
n/a 40.21
(87.96 %)
412,608
(12.07 %)
511,878
(87.93 %)
4,961,153
(38.35 %)
854,441
(3.33 %)
17,562,576
(28.82 %)
82,988
(1.05 %)
754 Sunda flying lemur (US047 2019 Broad)
GCA_004027255.1
n/a 24,882
(1.29 %)
43,546
(1.12 %)
n/a 40.46
(99.88 %)
5,895
(0.02 %)
1,655,642
(99.98 %)
5,807,241
(38.62 %)
953,765
(2.48 %)
18,836,777
(37.68 %)
114,955
(1.43 %)
755 tailed tailless bat
GCA_004027475.1
n/a 19,920
(1.58 %)
28,017
(1.58 %)
n/a 41.76
(99.95 %)
4,640
(0.02 %)
341,895
(99.98 %)
3,139,817
(30.43 %)
381,536
(0.81 %)
12,069,229
(32.73 %)
54,528
(2.15 %)
756 tailess tenrec (hap1 2025)
GCA_050624435.1
n/a 21,323
(0.86 %)
25,222
(1.02 %)
n/a 44.80
(100.00 %)
175
(0.00 %)
2,180
(100.00 %)
5,682,996
(38.93 %)
1,001,072
(14.26 %)
17,866,411
(50.04 %)
53,320
(1.01 %)
757 tailess tenrec (hap1 2025)
GCF_050624435.1
45,770
(1.60 %)
21,323
(0.86 %)
25,223
(1.02 %)
n/a 44.80
(100.00 %)
175
(0.00 %)
2,180
(100.00 %)
5,633,466
(38.91 %)
1,001,072
(14.26 %)
17,866,411
(50.04 %)
53,320
(1.01 %)
758 tailess tenrec (hap2 2025)
GCA_050624465.1
n/a 20,180
(0.96 %)
23,467
(1.13 %)
n/a 44.21
(100.00 %)
160
(0.00 %)
1,233
(100.00 %)
5,074,733
(40.88 %)
791,473
(8.15 %)
16,742,233
(44.91 %)
47,409
(1.01 %)
759 takin (Tak-1 2022)
GCF_023091745.1
31,927
(1.65 %)
19,290
(1.42 %)
21,656
(1.27 %)
n/a 43.32
(100.00 %)
152
(0.00 %)
1,363
(100.00 %)
3,256,033
(21.01 %)
714,375
(8.32 %)
13,010,154
(44.58 %)
49,134
(7.43 %)
760 Talazac's shrew tenrec
GCA_004026705.1
n/a 22,605
(0.81 %)
50,725
(1.09 %)
n/a 43.03
(99.93 %)
6,619
(0.02 %)
795,514
(99.98 %)
3,493,378
(14.58 %)
705,274
(1.31 %)
20,975,335
(36.85 %)
70,793
(1.26 %)
761 tammar wallaby (alternate hap 2023)
GCA_028389975.1
n/a 11,133
(0.77 %)
13,869
(0.98 %)
n/a 38.63
(100.00 %)
2
(0.00 %)
14,285
(100.00 %)
3,114,522
(26.10 %)
661,874
(3.02 %)
11,667,649
(38.41 %)
12,393
(0.46 %)
762 tammar wallaby (Barry hap1 2025)
GCA_048593335.1
n/a 17,491
(0.79 %)
15,701
(0.88 %)
n/a 38.69
(100.00 %)
32
(0.00 %)
40
(100.00 %)
5,762,317
(26.52 %)
1,078,692
(1.83 %)
22,476,051
(38.99 %)
22,756
(0.48 %)
763 tammar wallaby (Barry hap2 2025)
GCA_048593345.1
n/a 17,037
(0.79 %)
15,066
(0.87 %)
n/a 38.62
(100.00 %)
16
(0.00 %)
24
(100.00 %)
5,608,153
(26.57 %)
1,050,173
(1.77 %)
21,856,273
(38.96 %)
21,811
(0.47 %)
764 tammar wallaby (v2 primary hap 2023 refseq)
GCF_028372415.1
73,219
(3.07 %)
17,615
(0.77 %)
15,415
(0.86 %)
n/a 38.73
(99.81 %)
515
(0.19 %)
272
(100.00 %)
5,866,314
(26.30 %)
1,193,604
(2.72 %)
22,677,480
(39.53 %)
23,590
(0.47 %)
765 Tasmanian devil (McLovin hap1 2025)
GCA_048593225.1
n/a 15,725
(0.77 %)
16,721
(0.92 %)
n/a 36.17
(99.49 %)
1,514
(0.51 %)
1,521
(99.49 %)
5,222,976
(23.42 %)
1,357,438
(3.95 %)
21,705,122
(42.26 %)
24,443
(0.70 %)
766 Tasmanian devil (McLovin hap2 2025)
GCA_048593325.1
n/a 15,165
(0.76 %)
15,663
(0.91 %)
n/a 36.00
(99.11 %)
2,578
(0.89 %)
2,584
(99.11 %)
5,039,957
(23.64 %)
1,257,168
(2.97 %)
20,893,744
(41.44 %)
22,574
(0.67 %)
767 Tasmanian devil (primary hap 2019)
GCF_902635505.1
52,070
(2.36 %)
15,918
(0.85 %)
16,111
(0.91 %)
n/a 36.16
(100.00 %)
354
(0.00 %)
106
(100.00 %)
6,789,158
(44.28 %)
1,246,027
(2.19 %)
21,434,803
(41.20 %)
23,609
(0.65 %)
768 Tasmanian wolf (PY-MV-C5757 2022)
GCA_007646695.3
n/a 15,896
(0.81 %)
37,523
(1.30 %)
n/a 36.26
(90.01 %)
295,304
(10.01 %)
149,109
(100.00 %)
9,159,284
(56.14 %)
1,604,085
(2.22 %)
21,839,162
(35.42 %)
46,604
(0.74 %)
769 thirteen-lined ground squirrel (2021 HiC)
GCF_016881025.1
69,352
(3.50 %)
18,934
(1.68 %)
16,775
(1.37 %)
n/a 39.91
(93.25 %)
146,412
(6.77 %)
7,132
(100.00 %)
4,262,890
(35.64 %)
640,624
(1.64 %)
14,118,452
(27.90 %)
28,317
(0.64 %)
770 thirteen-lined ground squirrel (hap1 2025)
GCA_052094955.1
n/a 19,425
(1.31 %)
21,287
(1.27 %)
n/a 40.31
(99.99 %)
1,444
(0.01 %)
5,280
(100.00 %)
6,062,160
(43.45 %)
940,716
(10.02 %)
16,322,133
(37.64 %)
34,544
(0.73 %)
771 thirteen-lined ground squirrel (hap2 2025)
GCA_052094965.1
n/a 17,228
(1.41 %)
17,999
(1.30 %)
n/a 39.81
(99.99 %)
1,000
(0.01 %)
1,438
(100.00 %)
5,253,166
(38.98 %)
750,953
(4.01 %)
14,542,518
(32.77 %)
27,458
(0.71 %)
772 thirteen-lined ground squirrel (mIctTri1hap1 2025)
GCF_052094955.1
91,025
(3.74 %)
19,425
(1.31 %)
20,977
(1.20 %)
n/a 40.31
(99.99 %)
1,444
(0.01 %)
5,279
(100.00 %)
6,062,154
(43.45 %)
940,716
(10.02 %)
16,322,064
(37.64 %)
34,544
(0.73 %)
773 Tibetan sand fox (lyu1992 2022)
GCA_024500485.1
n/a 19,552
(1.59 %)
19,307
(1.35 %)
n/a 41.25
(100.00 %)
145
(0.00 %)
234
(100.00 %)
4,500,832
(32.18 %)
999,068
(2.01 %)
13,646,015
(32.98 %)
49,402
(2.19 %)
774 tiger
GCF_018350195.1
71,226
(2.84 %)
18,513
(1.68 %)
19,919
(1.39 %)
n/a 41.64
(100.00 %)
65
(0.00 %)
131
(100.00 %)
4,878,003
(42.77 %)
912,595
(1.82 %)
13,804,650
(33.76 %)
64,312
(2.55 %)
775 Townsend's big-eared bat (COTO_CA2020_CCGPhap1 2025)
GCA_026230055.2
n/a 18,747
(1.81 %)
21,398
(1.62 %)
n/a 42.82
(100.00 %)
256
(0.00 %)
381
(100.00 %)
5,017,312
(48.85 %)
779,839
(3.26 %)
10,740,034
(37.51 %)
49,071
(2.44 %)
776 Townsend's big-eared bat (COTO_CA2020_CCGPhap2 2025)
GCA_026230045.2
n/a 17,913
(1.88 %)
19,986
(1.66 %)
n/a 42.93
(100.00 %)
239
(0.00 %)
165
(100.00 %)
4,617,916
(47.27 %)
707,796
(3.14 %)
9,951,985
(36.27 %)
46,302
(2.55 %)
777 Townsend's big-eared bat (haplotype 1 of 2 COTO_CA2020_CCGP 2022)
GCA_026230055.1
n/a 19,370
(1.77 %)
21,062
(1.61 %)
n/a 42.81
(100.00 %)
219
(0.00 %)
610
(100.00 %)
2,923,694
(25.49 %)
772,382
(3.25 %)
10,654,074
(37.41 %)
48,226
(2.42 %)
778 Townsend's big-eared bat (haplotype 2 of 2 COTO_CA2020_CCGP 2022)
GCA_026230045.1
n/a 18,627
(1.82 %)
20,108
(1.67 %)
n/a 42.95
(100.00 %)
217
(0.00 %)
182
(100.00 %)
2,733,927
(24.79 %)
715,258
(3.17 %)
10,099,456
(36.35 %)
47,139
(2.58 %)
779 Transcaucasian mole vole
GCA_001685075.1
n/a 20,173
(1.62 %)
18,627
(1.30 %)
n/a 41.51
(96.09 %)
440,846
(3.96 %)
499,269
(96.04 %)
3,827,136
(25.51 %)
810,597
(2.65 %)
13,634,524
(27.54 %)
9,596
(0.16 %)
780 Trefoil horseshoe bat (Malaysia alternate hap 2024)
GCA_043728055.1
n/a 17,828
(1.84 %)
20,454
(1.63 %)
n/a 40.66
(100.00 %)
n/a 2,403
(100.00 %)
3,519,024
(41.02 %)
627,372
(2.04 %)
11,034,851
(31.87 %)
33,992
(1.29 %)
781 trefoil horseshoe bat (Malaysia primary hap 2024)
GCA_043728145.1
n/a 18,871
(1.79 %)
20,351
(1.55 %)
n/a 40.66
(99.99 %)
397
(0.01 %)
136
(100.00 %)
3,580,957
(40.75 %)
683,947
(2.19 %)
11,464,418
(33.39 %)
37,175
(1.31 %)
782 True's beaked whale (hap1.1 2024)
GCA_964341445.1
n/a 19,530
(1.21 %)
24,576
(1.13 %)
n/a 42.48
(99.99 %)
1,240
(0.01 %)
2,757
(100.00 %)
4,847,855
(34.88 %)
949,927
(20.01 %)
10,981,914
(51.51 %)
91,880
(2.74 %)
783 True's beaked whale (hap2.1 2024)
GCA_964341485.1
n/a 19,313
(1.40 %)
22,642
(1.25 %)
n/a 42.03
(99.99 %)
1,073
(0.01 %)
2,457
(99.99 %)
4,540,507
(37.61 %)
826,104
(12.82 %)
11,296,445
(45.25 %)
80,840
(2.24 %)
784 Upper Galilee mountains blind mole rat (2095 2014 refseq)
GCF_000622305.1
54,680
(2.07 %)
19,704
(1.26 %)
21,262
(1.20 %)
n/a 41.26
(95.18 %)
201,121
(4.83 %)
356,097
(95.17 %)
6,165,645
(34.95 %)
1,197,750
(2.77 %)
16,282,383
(36.21 %)
22,905
(0.49 %)
785 Vancouver Island marmot (RANI-1049 2019)
GCA_005458795.1
n/a 19,867
(1.62 %)
15,893
(1.33 %)
n/a 39.77
(94.43 %)
296,819
(5.60 %)
315,631
(94.40 %)
4,452,628
(33.94 %)
751,210
(1.84 %)
13,917,879
(30.08 %)
26,541
(0.58 %)
786 vaquita (alternate hap mPhoSin1 2019)
GCA_008692045.1
n/a 9,367
(1.66 %)
11,297
(1.30 %)
n/a 41.50
(100.00 %)
1
(0.00 %)
9,470
(100.00 %)
1,708,360
(43.81 %)
267,584
(1.67 %)
5,373,410
(33.52 %)
29,783
(1.94 %)
787 vaquita (mPhoSin1 2019)
GCF_008692025.1
60,106
(3.00 %)
18,611
(1.76 %)
20,103
(1.39 %)
35,176
(2.22 %)
41.36
(99.66 %)
212
(0.34 %)
64
(100.00 %)
4,067,454
(44.25 %)
602,407
(1.34 %)
12,468,582
(35.55 %)
66,806
(1.79 %)
788 water buffalo (Mediterranean 2018)
GCF_003121395.1
69,771
(3.14 %)
19,465
(1.58 %)
21,849
(1.37 %)
46,051
(1.86 %)
41.81
(99.99 %)
410
(0.01 %)
509
(100.00 %)
5,407,697
(47.11 %)
473,976
(1.54 %)
13,015,899
(41.23 %)
43,120
(1.15 %)
789 water buffalo (Murrah 2021)
GCF_019923935.1
80,565
(3.26 %)
19,402
(1.59 %)
20,375
(1.31 %)
n/a 41.75
(100.00 %)
659
(0.00 %)
26
(100.00 %)
5,358,548
(47.11 %)
447,338
(1.14 %)
13,034,537
(41.28 %)
40,189
(1.07 %)
790 water vole (JQ59JK4JDI 2023)
GCA_019206885.2
n/a 18,401
(2.03 %)
18,085
(1.65 %)
n/a 42.19
(89.99 %)
161,581
(10.04 %)
2,585
(100.00 %)
4,771,963
(38.17 %)
705,400
(1.96 %)
11,410,837
(25.00 %)
16,195
(0.52 %)
791 Weddell seal (WS11-02 2013 refseq)
GCF_000349705.1
48,264
(2.73 %)
21,063
(1.73 %)
22,333
(1.43 %)
n/a 41.39
(70.44 %)
152,836
(29.58 %)
169,547
(70.42 %)
4,420,479
(41.72 %)
471,256
(0.66 %)
13,410,237
(22.09 %)
48,738
(1.01 %)
792 western European hedgehog (2012 refseq)
GCF_000296755.1
29,923
(1.67 %)
18,067
(1.33 %)
19,777
(1.35 %)
n/a 41.54
(85.94 %)
219,764
(14.09 %)
225,567
(85.91 %)
6,594,783
(45.66 %)
1,271,533
(2.29 %)
12,374,161
(42.02 %)
28,528
(0.71 %)
793 western European hedgehog (alternate hap 2023)
GCA_950295305.1
n/a 14,370
(1.06 %)
24,297
(1.27 %)
n/a 42.08
(100.00 %)
1
(0.00 %)
26,601
(100.00 %)
3,360,923
(19.59 %)
1,043,098
(3.92 %)
8,511,380
(53.68 %)
23,321
(0.97 %)
794 western European hedgehog (primary hap 2023 refseq)
GCF_950295315.1
61,103
(2.36 %)
18,125
(1.16 %)
20,689
(1.21 %)
n/a 42.00
(99.97 %)
3,760
(0.03 %)
1,174
(100.00 %)
4,891,329
(19.68 %)
1,507,929
(3.81 %)
12,571,105
(54.50 %)
32,667
(0.90 %)
795 western European house mouse (WSB_EiJ v3 2022)
GCA_921998345.2
n/a 21,722
(2.14 %)
19,586
(1.39 %)
108,856
(4.46 %)
41.81
(98.87 %)
1,233
(1.13 %)
233
(100.00 %)
4,634,551
(40.61 %)
1,541,826
(3.49 %)
13,030,566
(35.21 %)
22,985
(0.56 %)
796 western roe deer (2023)
GCA_951849835.1
n/a 20,291
(1.29 %)
23,555
(1.23 %)
n/a 42.31
(100.00 %)
n/a 212
(100.00 %)
4,204,612
(25.49 %)
848,463
(7.79 %)
12,687,776
(48.28 %)
57,315
(1.25 %)
797 western spotted skunk
GCA_004023965.1
n/a 21,665
(1.46 %)
34,370
(1.32 %)
n/a 41.61
(99.92 %)
11,822
(0.05 %)
433,831
(99.95 %)
4,889,781
(40.77 %)
901,906
(2.30 %)
13,931,764
(34.80 %)
54,394
(1.54 %)
798 western wild mouse (SPRET_EiJ v3 2022)
GCA_921997135.2
n/a 21,699
(2.10 %)
18,837
(1.32 %)
n/a 41.69
(99.51 %)
1,576
(0.49 %)
143
(100.00 %)
4,507,329
(41.24 %)
1,517,241
(3.77 %)
12,832,499
(36.17 %)
22,568
(0.53 %)
799 whiskered bat (hap1 2024)
GCA_964094495.2
n/a 19,504
(1.78 %)
22,272
(1.73 %)
n/a 42.99
(99.99 %)
1,566
(0.02 %)
533
(100.00 %)
3,046,246
(25.06 %)
753,151
(4.86 %)
10,596,418
(37.62 %)
66,785
(2.55 %)
800 whiskered bat (hap1.2 2025)
GCA_964094495.3
n/a 19,023
(1.85 %)
22,199
(1.73 %)
n/a 43.02
(100.00 %)
267
(0.00 %)
241
(100.00 %)
5,005,820
(47.73 %)
756,354
(4.85 %)
10,602,346
(37.72 %)
67,615
(2.61 %)
801 whiskered bat (hap2 2024)
GCA_964195625.1
n/a 18,681
(1.83 %)
21,523
(1.79 %)
n/a 43.13
(99.99 %)
1,414
(0.01 %)
1,741
(99.99 %)
2,849,223
(24.50 %)
688,594
(4.80 %)
9,968,980
(36.80 %)
64,365
(2.68 %)
802 white-beaked dolphin (alternate hap 2023)
GCA_949774935.1
n/a 17,639
(1.50 %)
25,684
(1.35 %)
n/a 42.08
(100.00 %)
n/a 25,619
(100.00 %)
3,039,324
(36.05 %)
637,912
(8.02 %)
9,746,398
(38.98 %)
56,325
(3.33 %)
803 white-beaked dolphin (primary hap 2023 refseq)
GCF_949774975.1
59,995
(2.43 %)
18,737
(1.57 %)
20,767
(1.34 %)
n/a 41.91
(99.99 %)
1,070
(0.01 %)
410
(100.00 %)
3,820,566
(36.21 %)
922,103
(8.43 %)
12,304,360
(39.74 %)
68,551
(3.58 %)
804 white-footed mouse (LL stock 2020)
GCF_004664715.2
54,479
(2.82 %)
19,971
(1.69 %)
20,132
(1.42 %)
n/a 42.23
(99.95 %)
2,299
(0.05 %)
1,857
(100.00 %)
5,060,487
(30.71 %)
1,258,073
(2.85 %)
14,007,098
(32.99 %)
23,456
(0.67 %)
805 white-tailed deer (Illinois 20LAN1187 2024)
GCF_023699985.2
68,660
(3.60 %)
19,951
(1.73 %)
21,804
(1.48 %)
n/a 41.56
(100.00 %)
294
(0.00 %)
718
(100.00 %)
4,512,173
(43.10 %)
402,481
(1.14 %)
12,813,223
(37.56 %)
45,863
(1.30 %)
806 white-tailed deer (Pink-7 2017 refseq)
GCF_002102435.1
57,787
(2.93 %)
20,661
(1.75 %)
23,085
(1.50 %)
40,987
(1.94 %)
41.55
(99.10 %)
107,058
(0.91 %)
48,653
(99.10 %)
4,800,704
(41.29 %)
413,129
(2.59 %)
13,296,779
(34.22 %)
44,165
(1.19 %)
807 white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 alternate hap 2022)
GCA_024140225.1
n/a 12,198
(1.10 %)
18,494
(1.29 %)
n/a 39.87
(100.00 %)
26
(0.00 %)
14,841
(100.00 %)
1,725,021
(17.81 %)
802,415
(4.26 %)
8,321,474
(45.72 %)
15,669
(0.79 %)
808 white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 primary hap 2022)
GCF_024139225.1
40,430
(1.81 %)
17,575
(1.21 %)
21,880
(1.35 %)
47,496
(1.55 %)
39.81
(99.57 %)
1,010
(0.43 %)
147
(100.00 %)
2,846,063
(18.57 %)
1,252,362
(3.89 %)
13,776,063
(46.50 %)
24,589
(0.78 %)
809 white-toothed pygmy shrew (primary hap 2022)
GCA_024139225.1
n/a 17,350
(1.25 %)
21,890
(1.35 %)
n/a 39.81
(99.57 %)
1,010
(0.43 %)
148
(100.00 %)
6,924,771
(50.26 %)
1,252,365
(3.89 %)
13,775,765
(46.50 %)
24,589
(0.78 %)
810 wild Bactrian camel (BCGSAC Cfer 1.0 YT-003-E 2020)
GCF_009834535.1
70,235
(4.11 %)
18,202
(1.93 %)
20,199
(1.66 %)
42,728
(2.35 %)
41.66
(99.99 %)
2,345
(0.01 %)
2,043
(100.00 %)
3,091,018
(33.31 %)
332,720
(5.33 %)
12,161,286
(28.79 %)
55,524
(1.75 %)
811 wild Bactrian camel (CB1 Naran 2013 refseq)
GCF_000311805.1
34,726
(2.40 %)
18,746
(1.96 %)
17,104
(1.61 %)
n/a 41.28
(98.83 %)
60,971
(1.18 %)
68,872
(98.82 %)
2,991,821
(33.93 %)
353,632
(1.23 %)
12,349,615
(25.12 %)
45,437
(1.02 %)
812 wild goat
GCA_000978405.1
n/a 19,104
(1.48 %)
16,198
(1.21 %)
n/a 41.91
(91.72 %)
279,195
(8.31 %)
368,693
(91.69 %)
5,563,294
(45.39 %)
452,402
(1.99 %)
13,802,376
(35.47 %)
41,935
(0.63 %)
813 wild yak (GX-2022 2023)
GCF_027580195.1
52,505
(2.90 %)
19,278
(1.60 %)
20,813
(1.31 %)
n/a 41.87
(100.00 %)
196
(0.00 %)
2,040
(100.00 %)
5,706,841
(46.71 %)
464,013
(1.82 %)
12,973,198
(41.46 %)
42,508
(1.32 %)
814 wild yak (yakQH1 2013)
GCF_000298355.1
29,789
(1.92 %)
19,936
(1.62 %)
19,914
(1.32 %)
n/a 41.71
(95.48 %)
192,006
(4.54 %)
233,198
(95.46 %)
5,348,663
(46.08 %)
449,880
(1.38 %)
13,572,902
(36.62 %)
41,147
(0.82 %)
815 winter white dwarf (Siberian hamster Psun_Stras_1 2023)
GCA_030556225.1
n/a 18,177
(1.88 %)
18,942
(1.54 %)
n/a 41.50
(100.00 %)
1
(0.00 %)
742
(100.00 %)
5,398,126
(39.36 %)
1,168,723
(3.56 %)
12,272,233
(30.38 %)
18,332
(0.60 %)
816 woodchuck (v1.1 L192 2022)
GCF_021218885.2
68,030
(3.47 %)
19,116
(1.55 %)
21,017
(1.38 %)
n/a 39.92
(100.00 %)
47
(0.00 %)
3,380
(100.00 %)
5,285,788
(43.20 %)
912,552
(2.73 %)
14,538,866
(35.15 %)
36,914
(1.02 %)
817 woodland dormouse
GCA_004027655.1
n/a 23,556
(1.09 %)
55,517
(1.33 %)
n/a 41.52
(99.86 %)
15,691
(0.06 %)
1,283,630
(99.94 %)
7,674,195
(34.99 %)
1,698,258
(3.76 %)
13,705,886
(42.23 %)
68,562
(1.41 %)
818 woodland thicket rat
GCF_004785775.1
43,129
(2.40 %)
22,710
(2.13 %)
21,042
(1.49 %)
n/a 41.17
(98.57 %)
76,623
(1.44 %)
23,656
(100.00 %)
4,732,544
(38.04 %)
1,424,025
(3.23 %)
13,549,399
(30.42 %)
18,232
(0.48 %)
819 woolly hare (The Qinghai-Tibet Plateau SH-2023 2024)
GCA_036325905.1
n/a 19,363
(1.28 %)
22,239
(1.28 %)
n/a 44.08
(100.00 %)
240
(0.00 %)
112
(100.00 %)
4,432,114
(42.23 %)
966,165
(7.11 %)
13,263,822
(43.77 %)
96,755
(2.28 %)
820 Yangtze finless porpoise (v2 wild 2018 refseq)
GCF_003031525.2
43,310
(2.49 %)
18,747
(1.81 %)
19,638
(1.46 %)
n/a 41.28
(99.29 %)
52,647
(0.72 %)
66,343
(99.28 %)
3,547,466
(35.83 %)
540,760
(1.65 %)
12,691,756
(32.88 %)
59,050
(1.48 %)
821 Yangtze River dolphin (v1.1 BGI 2013 refseq)
GCF_000442215.2
26,128
(1.61 %)
18,978
(1.74 %)
20,661
(1.39 %)
n/a 41.24
(98.69 %)
123,788
(1.33 %)
148,598
(98.67 %)
3,788,303
(37.04 %)
690,288
(1.96 %)
12,841,906
(35.04 %)
62,458
(1.54 %)
822 yellow-bellied marmot (hap1 2025 refseq)
GCF_047511675.1
55,299
(2.52 %)
19,502
(1.44 %)
20,297
(1.34 %)
n/a 39.90
(100.00 %)
330
(0.00 %)
813
(100.00 %)
4,038,893
(29.07 %)
978,915
(3.28 %)
14,404,633
(34.97 %)
36,674
(1.05 %)
823 yellow-bellied marmot (hap2 2025)
GCA_047512175.1
n/a 18,677
(1.51 %)
19,370
(1.40 %)
n/a 40.03
(100.00 %)
307
(0.00 %)
329
(100.00 %)
3,694,109
(28.05 %)
793,102
(2.43 %)
13,585,913
(33.39 %)
33,990
(1.02 %)
824 yellow-bellied marmot (SJ_83 v2.1 2019)
GCF_003676075.3
42,667
(2.16 %)
19,547
(1.52 %)
21,406
(1.40 %)
n/a 39.89
(97.96 %)
35,509
(2.04 %)
66,442
(97.96 %)
3,814,223
(27.39 %)
800,865
(1.96 %)
14,323,977
(32.63 %)
34,122
(0.91 %)
825 yellow-footed antechinus (v2 Samford, QLD, Australia AdamAnt 2021)
GCF_016432865.1
47,618
(2.51 %)
15,703
(0.78 %)
16,155
(0.90 %)
n/a 36.21
(99.99 %)
620
(0.01 %)
486
(100.00 %)
5,191,383
(23.81 %)
1,269,772
(2.59 %)
21,430,585
(42.69 %)
28,118
(0.66 %)
826 yellow-spotted hyrax
GCA_004026845.1
n/a 20,424
(0.86 %)
43,984
(1.27 %)
n/a 40.93
(99.94 %)
3,815
(0.01 %)
971,748
(99.99 %)
5,365,974
(31.41 %)
435,699
(1.22 %)
21,229,266
(45.17 %)
38,521
(0.68 %)
827 yellow-spotted hyrax (mHetBru1 2023)
GCA_028571685.1
n/a 17,610
(1.00 %)
20,322
(1.04 %)
n/a 40.80
(100.00 %)
276
(0.00 %)
62
(100.00 %)
3,295,935
(23.58 %)
389,907
(6.37 %)
19,525,382
(45.90 %)
31,831
(0.63 %)
828 yellow-spotted hyrax (mHetBru1 alternate hap 2023)
GCA_028571665.1
n/a 16,320
(1.03 %)
20,318
(1.13 %)
n/a 40.93
(100.00 %)
1
(0.00 %)
4,169
(100.00 %)
2,911,332
(23.50 %)
347,110
(4.57 %)
17,256,419
(44.04 %)
28,674
(0.68 %)
829 Yong Hoi Sen's woolly horseshoe bat (Malaysia 20210929_DDd alternate hap 2024)
GCA_043880365.1
n/a 18,844
(1.70 %)
23,805
(1.54 %)
n/a 41.26
(100.00 %)
n/a 8,862
(100.00 %)
3,638,702
(42.22 %)
847,774
(6.68 %)
11,654,541
(34.78 %)
34,055
(3.45 %)
830 Yong Hoi Sen's woolly horseshoe bat (Malaysia 20210929_DDd primary hap 2024)
GCA_043880425.1
n/a 18,352
(1.71 %)
20,233
(1.46 %)
n/a 41.73
(100.00 %)
196
(0.00 %)
1,530
(100.00 %)
3,466,695
(41.95 %)
934,524
(8.81 %)
11,690,112
(36.30 %)
35,257
(5.20 %)
831 Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP alternate hap 2023)
GCA_028536395.1
n/a 19,188
(1.79 %)
21,673
(1.72 %)
n/a 43.03
(100.00 %)
215
(0.00 %)
250
(100.00 %)
3,043,589
(24.76 %)
773,853
(4.49 %)
10,648,494
(37.26 %)
61,910
(2.52 %)
832 Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP primary hap 2023 refseq)
GCF_028538775.1
48,707
(3.25 %)
18,807
(1.93 %)
21,046
(1.76 %)
n/a 43.22
(100.00 %)
209
(0.00 %)
684
(100.00 %)
3,552,235
(38.46 %)
719,552
(4.26 %)
10,089,365
(36.35 %)
60,974
(2.61 %)
833 zebra duiker (hap1 2025)
GCA_054099735.1
n/a 19,411
(1.04 %)
23,174
(0.98 %)
n/a 46.14
(100.00 %)
185
(0.00 %)
598
(100.00 %)
6,742,800
(39.85 %)
699,303
(26.55 %)
12,357,908
(58.45 %)
605,557
(5.20 %)
834 zebra duiker (hap2 2025)
GCA_054099755.1
n/a 19,383
(1.06 %)
23,042
(0.98 %)
n/a 46.07
(100.00 %)
162
(0.00 %)
677
(100.00 %)
6,681,000
(40.47 %)
636,475
(26.14 %)
12,329,686
(57.66 %)
583,195
(5.17 %)
835 zebu cattle (Hainan HN024 2024)
GCA_039881165.1
n/a 19,162
(1.53 %)
20,991
(1.34 %)
n/a 41.77
(99.99 %)
350
(0.01 %)
292
(100.00 %)
3,296,209
(23.14 %)
440,574
(1.28 %)
12,824,144
(40.98 %)
39,400
(1.07 %)
836 zebu cattle (Nelore 2014 refseq)
GCF_000247795.1
39,830
(2.52 %)
18,603
(1.59 %)
18,779
(1.29 %)
n/a 41.75
(92.62 %)
6,941,272
(7.66 %)
253,770
(92.59 %)
5,119,428
(46.84 %)
358,908
(0.88 %)
13,431,672
(36.60 %)
35,241
(0.84 %)
837 zebu cattle (Sahiwal x Tharparkar maternal NIAB-ARS_2022 2023)
GCF_029378745.1
70,745
(4.27 %)
19,546
(1.58 %)
21,187
(1.33 %)
n/a 41.86
(100.00 %)
283
(0.00 %)
67
(100.00 %)
5,530,890
(46.61 %)
459,827
(1.43 %)
13,190,355
(41.36 %)
42,544
(1.21 %)
TOTALS:total assembly count 837

Additional hubs with collections of assemblies
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Primates 616 assemblies assembly stats track stats
Mammals 837 assemblies assembly stats track stats
Birds 543 assemblies assembly stats track stats
Fishes 637 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 406 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 1944 assemblies assembly stats track stats
Plants 444 assemblies assembly stats track stats
Fungi 4128 assemblies assembly stats track stats
Viruses 15061 assemblies assembly stats track stats
Archaea 2702 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 22351 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 689 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 1303 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 464 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 5519 assemblies assembly stats track stats