Mammals Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of mammals only.

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count	common name link to genome browser	ncbiRefSeq	xenoRefGene	augustus genes	Ensembl genes	gc5 base	gaps	assembly sequences	Repeat Masker	TRF simpleRepeat	window Masker	cpg islands
1	aardvark (hap1 2026) GCA_054668785.1	n/a	18,288 (0.81 %)	20,681 (0.76 %)	n/a	40.40 (100.00 %)	121 (0.00 %)	354 (100.00 %)	10,530,628 (70.06 %)	890,633 (3.80 %)	19,549,882 (59.96 %)	36,422 (1.04 %)
2	aardvark (hap2 2026) GCA_054668755.1	n/a	17,455 (0.85 %)	18,974 (0.77 %)	n/a	40.25 (100.00 %)	89 (0.00 %)	269 (100.00 %)	9,589,258 (69.56 %)	812,088 (2.92 %)	18,264,020 (58.96 %)	31,668 (0.72 %)
3	aardvark (SDZICR_OR568_19922 2012 Broad) GCF_000298275.1	25,594 (1.08 %)	18,351 (1.06 %)	20,358 (0.98 %)	n/a	40.07 (76.89 %)	411,144 (23.15 %)	433,653 (76.85 %)	n/a	536,700 (0.74 %)	18,176,790 (39.08 %)	26,235 (0.40 %)
4	African grass rat (maternal 2020) GCA_011750645.1	n/a	20,916 (2.01 %)	19,513 (1.43 %)	n/a	41.37 (98.89 %)	1,526 (1.11 %)	1,610 (100.00 %)	4,928,847 (37.45 %)	1,652,295 (5.20 %)	13,507,965 (32.27 %)	17,712 (0.51 %)
5	African grass rat (paternal 2020) GCA_011762545.1	n/a	20,796 (2.00 %)	19,611 (1.43 %)	n/a	41.42 (97.70 %)	1,563 (2.30 %)	1,740 (100.00 %)	4,904,243 (37.25 %)	1,672,608 (5.37 %)	13,465,246 (32.19 %)	17,677 (0.50 %)
6	African grass rat (v1 paternal X 2020 refseq) GCF_011762505.1	45,963 (2.46 %)	20,878 (1.99 %)	19,613 (1.43 %)	37,929 (2.32 %)	41.39 (99.19 %)	1,624 (0.81 %)	1,595 (100.00 %)	4,939,557 (37.33 %)	1,674,970 (5.40 %)	13,613,429 (32.71 %)	17,767 (0.51 %)
7	African grass rat (v2 paternal X 2024 genbank) GCA_011762505.2	n/a	19,637 (1.95 %)	19,610 (1.43 %)	n/a	41.39 (99.19 %)	1,624 (0.81 %)	1,596 (100.00 %)	5,399,465 (42.90 %)	1,674,970 (5.40 %)	13,613,540 (32.71 %)	17,767 (0.51 %)
8	African grass rat (v2 paternal X 2025 refseq) GCF_011762505.2	70,837 (3.51 %)	19,640 (1.95 %)	19,607 (1.43 %)	n/a	41.39 (99.19 %)	1,624 (0.81 %)	1,595 (100.00 %)	5,625,390 (42.96 %)	1,674,970 (5.40 %)	13,612,806 (32.71 %)	17,767 (0.51 %)
9	African grass rat (v3 paternal hap 2024) GCA_011762505.3	n/a	20,986 (2.01 %)	19,611 (1.43 %)	n/a	41.39 (99.19 %)	1,624 (0.81 %)	1,596 (100.00 %)	4,532,782 (33.95 %)	1,674,970 (5.40 %)	13,612,916 (32.71 %)	17,767 (0.51 %)
10	African hunting dog GCA_001887905.1	n/a	18,956 (1.75 %)	17,562 (1.41 %)	n/a	40.98 (92.89 %)	1,415,298 (7.28 %)	803 (100.00 %)	4,458,183 (39.99 %)	658,637 (1.13 %)	13,671,493 (28.24 %)	47,644 (1.64 %)
11	African hunting dog (LycPic1hap1 2024) GCA_040955645.1	n/a	18,688 (1.61 %)	19,670 (1.44 %)	n/a	41.35 (100.00 %)	82 (0.00 %)	86 (100.00 %)	4,281,139 (31.62 %)	959,378 (2.78 %)	12,859,760 (32.95 %)	49,122 (2.32 %)
12	African hunting dog (LycPic1hap2 2024) GCA_040955705.1	n/a	19,463 (1.58 %)	20,378 (1.42 %)	n/a	41.30 (100.00 %)	91 (0.00 %)	77 (100.00 %)	4,513,580 (32.16 %)	1,008,611 (2.91 %)	13,570,452 (33.71 %)	50,954 (2.21 %)
13	African savanna elephant (2009 refseq) GCF_000001905.1	46,043 (2.30 %)	19,169 (1.26 %)	19,664 (1.10 %)	n/a	40.76 (97.57 %)	93,514 (2.45 %)	95,866 (97.55 %)	6,363,315 (57.54 %)	365,797 (0.88 %)	16,073,053 (44.89 %)	33,513 (0.68 %)
14	African savanna elephant (hap1 mLoxAfr1 2023) GCA_030020305.1	n/a	18,845 (1.07 %)	22,426 (1.10 %)	n/a	41.34 (99.85 %)	169 (0.15 %)	1,253 (99.85 %)	4,406,744 (29.55 %)	925,868 (4.71 %)	15,966,881 (50.49 %)	68,531 (1.61 %)
15	African savanna elephant (hap2 2023 genbank) GCA_030014295.1	n/a	18,981 (1.10 %)	22,759 (1.12 %)	n/a	41.25 (99.90 %)	231 (0.10 %)	880 (100.00 %)	4,426,756 (29.95 %)	832,908 (4.08 %)	16,118,910 (49.47 %)	62,315 (1.49 %)
16	African savanna elephant (hap2 2023 refseq) GCF_030014295.1	64,034 (3.35 %)	18,980 (1.10 %)	21,593 (1.06 %)	n/a	41.25 (99.90 %)	231 (0.10 %)	879 (100.00 %)	4,426,749 (29.95 %)	832,904 (4.08 %)	16,118,888 (49.47 %)	62,314 (1.49 %)
17	African soft-furred rat (Lowveld savanna grassland N552 2022) GCA_021653895.1	n/a	20,232 (2.08 %)	18,517 (1.32 %)	n/a	41.15 (100.00 %)	n/a	7,311 (100.00 %)	5,083,017 (39.13 %)	1,337,200 (3.02 %)	13,402,561 (30.35 %)	17,841 (0.51 %)
18	African soft-furred rat (MVZ Mamm 221054 2021) GCA_019843795.1	n/a	26,123 (1.59 %)	49,154 (1.23 %)	n/a	41.38 (99.06 %)	92,030 (0.93 %)	412,491 (99.07 %)	5,251,146 (37.28 %)	1,541,020 (3.13 %)	13,613,713 (32.35 %)	21,054 (0.58 %)
19	agile gracile mouse opossum GCF_016433145.1	30,697 (1.32 %)	17,361 (0.78 %)	17,596 (0.81 %)	n/a	37.86 (91.75 %)	85,142 (8.25 %)	60,714 (100.00 %)	7,917,577 (49.04 %)	1,054,566 (1.57 %)	22,701,659 (37.69 %)	27,301 (0.49 %)
20	Allen's wood mouse (MVZ Mamm 196246 2021) GCA_019843855.1	n/a	22,687 (1.16 %)	46,299 (0.94 %)	n/a	41.37 (99.72 %)	75,967 (0.24 %)	659,537 (99.76 %)	6,139,432 (45.57 %)	1,339,550 (3.13 %)	12,293,115 (32.34 %)	16,575 (0.44 %)
21	alpaca (1hap1 2026) GCA_056363735.1	n/a	18,349 (1.52 %)	22,790 (1.45 %)	n/a	n/a	141 (0.00 %)	722 (100.00 %)	3,502,205 (49.58 %)	405,801 (12.84 %)	11,754,979 (39.66 %)	73,373 (1.90 %)
22	alpaca (2025) GCF_048564905.1	80,233 (3.11 %)	18,667 (1.53 %)	23,043 (1.52 %)	n/a	41.92 (99.91 %)	681 (0.09 %)	519 (100.00 %)	3,387,094 (33.34 %)	395,581 (10.22 %)	11,510,740 (36.96 %)	72,497 (1.98 %)
23	alpaca (v3.2 Carlotta AHFN-0088 2019 Deakin U) GCF_000164845.4	54,987 (3.56 %)	18,439 (1.93 %)	18,426 (1.63 %)	n/a	41.40 (95.85 %)	166,272 (4.17 %)	77,389 (100.00 %)	3,004,413 (33.17 %)	315,092 (1.36 %)	12,458,272 (24.89 %)	54,502 (1.38 %)
24	Alpine marmot (2019) GCF_001458135.2	69,587 (3.43 %)	19,047 (1.54 %)	17,768 (1.39 %)	n/a	39.80 (96.13 %)	88,858 (3.88 %)	14,031 (100.00 %)	3,726,252 (26.48 %)	746,953 (1.83 %)	14,066,368 (30.30 %)	30,191 (0.63 %)
25	Alston's brown mouse (SKS-2025a 2025) GCA_049901635.1	n/a	19,201 (1.73 %)	20,397 (1.45 %)	n/a	41.54 (100.00 %)	n/a	7,689 (100.00 %)	6,399,518 (45.04 %)	1,172,526 (4.32 %)	13,154,869 (32.85 %)	17,916 (0.51 %)
26	Alvarez's mastiff bat (A012 2023) GCA_031001765.1	n/a	19,086 (1.55 %)	22,040 (1.52 %)	n/a	42.18 (99.99 %)	1,182 (0.01 %)	1,369 (99.99 %)	3,846,728 (31.78 %)	639,852 (2.90 %)	11,937,936 (38.98 %)	75,377 (2.21 %)
27	Alvarez's mastiff bat (hap1 2024) GCA_037157525.1	n/a	18,980 (1.50 %)	22,394 (1.50 %)	n/a	42.30 (100.00 %)	80 (0.00 %)	326 (100.00 %)	3,896,863 (31.56 %)	659,711 (4.74 %)	11,945,162 (40.81 %)	76,769 (2.57 %)
28	Alvarez's mastiff bat (hap2 2024) GCA_037176705.1	n/a	19,066 (1.48 %)	22,356 (1.48 %)	n/a	42.25 (100.00 %)	75 (0.00 %)	287 (100.00 %)	3,908,607 (31.48 %)	664,931 (5.23 %)	11,892,191 (41.08 %)	76,453 (2.43 %)
29	Amazon manatee (hap1 2025) GCA_046562985.1	n/a	17,917 (1.26 %)	20,499 (1.11 %)	n/a	40.77 (100.00 %)	377 (0.00 %)	550 (100.00 %)	5,812,915 (56.93 %)	431,488 (2.57 %)	14,336,638 (47.98 %)	33,775 (0.84 %)
30	Amazon manatee (hap2 2025) GCA_046562895.1	n/a	18,949 (1.23 %)	21,655 (1.08 %)	n/a	40.80 (100.00 %)	294 (0.00 %)	401 (100.00 %)	6,218,266 (57.31 %)	470,437 (3.04 %)	15,241,157 (48.91 %)	37,124 (0.86 %)
31	American beaver (hap1 2025) GCA_047511655.1	n/a	19,828 (1.45 %)	20,376 (1.31 %)	n/a	39.72 (100.00 %)	181 (0.00 %)	503 (100.00 %)	4,030,880 (35.35 %)	566,770 (2.63 %)	14,198,970 (35.24 %)	24,454 (0.96 %)
32	American beaver (hap1v2 2025) GCA_047511655.2	n/a	19,759 (1.46 %)	19,656 (1.23 %)	n/a	39.67 (100.00 %)	181 (0.00 %)	182 (100.00 %)	4,077,829 (35.51 %)	563,159 (2.55 %)	14,502,350 (35.45 %)	23,983 (0.89 %)
33	American beaver (hap2 2025) GCA_047511605.1	n/a	19,144 (1.44 %)	18,959 (1.23 %)	n/a	39.54 (100.00 %)	194 (0.00 %)	229 (100.00 %)	3,981,637 (35.85 %)	561,691 (2.26 %)	14,374,940 (35.03 %)	23,386 (0.80 %)
34	American beaver (hap2v2 2025) GCA_047511605.2	n/a	19,115 (1.44 %)	18,756 (1.21 %)	n/a	39.53 (100.00 %)	194 (0.00 %)	154 (100.00 %)	4,032,632 (35.91 %)	560,508 (2.24 %)	14,349,713 (35.01 %)	23,225 (0.77 %)
35	American beaver (mCasCan1.hap1v2 2025) GCF_047511655.1	79,343 (3.55 %)	19,759 (1.46 %)	19,920 (1.23 %)	n/a	39.67 (100.00 %)	181 (0.00 %)	181 (100.00 %)	4,023,733 (35.50 %)	563,158 (2.55 %)	14,502,226 (35.45 %)	23,983 (0.89 %)
36	American beaver (Ward 2017 refseq) GCF_001984765.1	40,013 (2.15 %)	20,867 (1.53 %)	24,201 (1.33 %)	n/a	39.72 (99.99 %)	3,321 (0.01 %)	21,157 (100.00 %)	4,526,430 (33.75 %)	486,353 (1.30 %)	14,347,145 (31.96 %)	23,046 (0.72 %)
37	American bison (2014 refseq) GCF_000754665.1	38,699 (2.34 %)	19,782 (1.47 %)	20,444 (1.25 %)	n/a	41.82 (93.12 %)	341,984 (6.92 %)	470,415 (93.08 %)	n/a	419,596 (0.95 %)	13,519,877 (37.66 %)	60,388 (1.03 %)
38	American black bear (L20-20 2025 refseq) GCF_024610735.1	62,897 (3.86 %)	18,085 (1.59 %)	21,360 (1.46 %)	n/a	n/a	41 (0.00 %)	297 (100.00 %)	4,678,918 (45.94 %)	642,273 (5.89 %)	13,210,460 (35.54 %)	68,975 (3.00 %)
39	American black bear (L20-20 alternate hap 2022) GCA_024610745.1	n/a	22,502 (1.17 %)	43,431 (1.28 %)	n/a	43.14 (99.99 %)	n/a	77,311 (100.00 %)	4,587,986 (32.30 %)	773,829 (6.39 %)	14,594,034 (35.67 %)	78,849 (3.32 %)
40	American black bear (UA15103 2021) GCF_020975775.1	53,916 (3.11 %)	18,840 (1.73 %)	20,969 (1.50 %)	n/a	42.09 (100.00 %)	n/a	2,213 (100.00 %)	3,936,528 (34.53 %)	594,864 (2.90 %)	13,725,005 (32.35 %)	62,580 (1.91 %)
41	American black bear (v1 L20-20 primary hap 2022 genbank) GCA_024610735.1	n/a	18,458 (1.52 %)	21,049 (1.43 %)	n/a	42.93 (100.00 %)	22 (0.00 %)	317 (100.00 %)	4,000,508 (32.69 %)	641,903 (5.91 %)	13,210,530 (35.54 %)	68,981 (3.00 %)
42	American black bear (v2 L20-20 2025 genbank) GCA_024610735.2	n/a	18,082 (1.59 %)	20,977 (1.43 %)	n/a	42.93 (100.00 %)	41 (0.00 %)	298 (100.00 %)	4,773,058 (45.96 %)	641,956 (5.91 %)	13,210,521 (35.54 %)	68,976 (3.00 %)
43	American mink (2018) GCA_900108605.1	n/a	18,686 (1.70 %)	20,016 (1.50 %)	36,997 (1.74 %)	41.60 (92.95 %)	154,172 (7.07 %)	161,347 (92.93 %)	4,350,343 (38.70 %)	606,128 (1.17 %)	13,605,797 (28.74 %)	54,199 (1.98 %)
44	American mink (hap1 2024) GCA_964106545.1	n/a	19,203 (1.43 %)	22,174 (1.33 %)	n/a	42.39 (99.98 %)	2,957 (0.02 %)	435 (100.00 %)	4,188,829 (30.04 %)	802,295 (5.81 %)	14,041,290 (37.98 %)	65,430 (2.64 %)
45	American mink (hap2 2024) GCA_964106205.1	n/a	18,890 (1.43 %)	21,684 (1.33 %)	n/a	42.35 (99.98 %)	2,849 (0.02 %)	3,200 (99.98 %)	4,158,563 (30.22 %)	786,430 (5.25 %)	13,845,377 (37.58 %)	64,307 (2.75 %)
46	American mink (M4711 2021 Dalhousie U) GCF_020171115.1	50,253 (2.26 %)	18,949 (1.49 %)	20,914 (1.29 %)	n/a	42.26 (100.00 %)	n/a	183 (100.00 %)	4,705,680 (39.15 %)	795,684 (5.50 %)	14,085,357 (37.99 %)	63,307 (2.38 %)
47	American mink (M4711 2021) GCA_020171115.1	n/a	18,487 (1.48 %)	20,915 (1.29 %)	n/a	42.26 (100.00 %)	n/a	182 (100.00 %)	5,389,046 (47.85 %)	795,680 (5.50 %)	14,085,303 (37.99 %)	63,306 (2.38 %)
48	American pika (hap1 2023 genbank) GCA_030435755.1	n/a	17,835 (1.28 %)	23,188 (1.49 %)	n/a	n/a	432 (0.00 %)	5,865 (100.00 %)	3,094,189 (27.70 %)	629,412 (15.71 %)	11,100,896 (42.69 %)	60,350 (1.67 %)
49	American pika (hap1 2023 refseq) GCF_030435755.1	45,008 (1.93 %)	17,997 (1.35 %)	23,185 (1.49 %)	n/a	44.16 (100.00 %)	432 (0.00 %)	5,864 (100.00 %)	4,126,248 (43.60 %)	628,344 (15.71 %)	11,100,962 (42.69 %)	60,350 (1.67 %)
50	American pika (hap2 2023) GCA_030435715.1	n/a	16,911 (1.23 %)	21,107 (1.43 %)	n/a	44.43 (100.00 %)	375 (0.00 %)	6,123 (100.00 %)	1,808,768 (10.42 %)	561,106 (21.05 %)	10,283,513 (45.97 %)	54,919 (1.33 %)
51	American pika 3.0 (2012 Broad refseq) GCF_000292845.1	26,240 (1.93 %)	17,576 (1.61 %)	20,076 (1.70 %)	n/a	43.35 (87.20 %)	122,542 (12.82 %)	132,962 (87.18 %)	2,761,257 (29.47 %)	414,896 (1.07 %)	10,968,698 (26.71 %)	44,652 (1.14 %)
52	American pika 4.0 (UAM:Mamm:113957 2020) GCF_014633375.1	31,887 (1.92 %)	17,532 (1.60 %)	19,609 (1.65 %)	n/a	43.35 (87.14 %)	124,941 (12.88 %)	9,351 (100.00 %)	2,827,662 (29.77 %)	414,980 (1.07 %)	10,969,165 (26.69 %)	44,743 (1.13 %)
53	American red squirrel (v2 hap1 2026) GCA_057930835.1	n/a	20,538 (0.79 %)	28,853 (0.92 %)	n/a	39.25 (100.00 %)	426 (0.00 %)	489 (100.00 %)	9,215,331 (50.80 %)	1,317,907 (3.34 %)	26,748,417 (47.09 %)	55,960 (0.71 %)
54	American red squirrel (v2 hap2 2026) GCA_057931055.1	n/a	19,151 (0.81 %)	26,172 (0.93 %)	n/a	39.26 (100.00 %)	468 (0.00 %)	426 (100.00 %)	8,342,035 (49.80 %)	1,194,845 (3.33 %)	24,234,438 (46.10 %)	49,136 (0.69 %)
55	American red squirrel (v3 hap1 2026) GCA_057657825.1	n/a	22,076 (0.75 %)	28,760 (0.85 %)	n/a	39.63 (100.00 %)	191 (0.00 %)	141 (100.00 %)	9,677,339 (48.50 %)	1,456,018 (3.67 %)	23,033,952 (52.86 %)	60,291 (0.74 %)
56	American red squirrel (v3 hap2 2026) GCA_057657875.1	n/a	20,617 (0.79 %)	28,522 (0.91 %)	n/a	39.48 (100.00 %)	194 (0.00 %)	96 (100.00 %)	9,339,714 (48.88 %)	1,335,432 (3.43 %)	25,390,192 (47.00 %)	59,575 (0.75 %)
57	American wolverine (FN33715 2022) GCA_024509225.1	n/a	18,360 (1.57 %)	20,615 (1.47 %)	n/a	41.70 (100.00 %)	53 (0.00 %)	758 (100.00 %)	4,038,995 (32.25 %)	664,825 (1.25 %)	13,625,080 (33.05 %)	56,595 (2.13 %)
58	Amur tiger (TaeGuk 2013 refseq) GCF_000464555.1	33,681 (2.23 %)	17,929 (1.49 %)	15,090 (1.29 %)	n/a	41.40 (97.59 %)	155,553 (2.44 %)	157,032 (97.56 %)	n/a	831,136 (1.67 %)	13,654,437 (31.78 %)	65,229 (1.60 %)
59	Angolan free-tailed bat GCA_043748645.2	n/a	18,321 (1.73 %)	23,033 (1.67 %)	n/a	42.90 (100.00 %)	100 (0.00 %)	34 (100.00 %)	4,324,378 (43.44 %)	558,565 (2.08 %)	11,330,414 (35.72 %)	103,798 (3.90 %)
60	Angolan free-tailed bat (Cote d'Ivoire 20210831_DDa 2024) GCA_043748645.1	n/a	18,528 (1.65 %)	22,359 (1.64 %)	n/a	42.89 (100.00 %)	88 (0.00 %)	44 (100.00 %)	3,531,044 (35.70 %)	555,304 (2.07 %)	11,439,853 (36.03 %)	102,112 (3.75 %)
61	Angolan free-tailed bat (Cote d'Ivoire 20210831_DDa alternate hap 2024) GCA_043748605.1	n/a	17,996 (1.77 %)	23,084 (1.76 %)	n/a	43.12 (100.00 %)	n/a	1,670 (100.00 %)	4,087,571 (42.52 %)	525,056 (2.00 %)	10,779,134 (34.81 %)	100,610 (3.93 %)
62	Angus cow (Angus x Brahman F1 Angus haplotype 2018) GCA_003369685.2	n/a	19,096 (1.59 %)	20,674 (1.34 %)	n/a	41.99 (99.75 %)	277 (0.25 %)	1,435 (100.00 %)	5,290,422 (47.51 %)	478,946 (1.94 %)	12,568,313 (41.15 %)	45,850 (1.37 %)
63	Antarctic minke whale GCA_000978805.1	n/a	23,312 (1.49 %)	45,535 (1.26 %)	n/a	40.73 (99.37 %)	299,456 (0.64 %)	720,900 (99.36 %)	4,011,313 (41.13 %)	504,837 (1.04 %)	13,553,641 (30.96 %)	56,223 (1.31 %)
64	Antillean ghost-faced bat GCA_004026545.1	n/a	20,088 (1.74 %)	31,558 (1.63 %)	n/a	41.74 (99.97 %)	1,835 (0.01 %)	207,094 (99.99 %)	3,025,044 (30.67 %)	332,606 (0.70 %)	12,504,556 (28.79 %)	65,503 (2.30 %)
65	aoudad GCA_002201775.1	n/a	19,905 (1.62 %)	27,488 (1.60 %)	n/a	42.01 (95.96 %)	186,672 (4.05 %)	263,992 (95.95 %)	5,418,013 (45.05 %)	471,426 (1.19 %)	13,396,252 (36.94 %)	48,844 (1.32 %)
66	Arabian camel (Drom800 2019 refseq) GCF_000803125.2	64,532 (3.85 %)	18,483 (1.89 %)	20,554 (1.62 %)	n/a	41.51 (99.22 %)	47,342 (0.79 %)	21,070 (100.00 %)	3,233,022 (34.07 %)	345,049 (1.55 %)	13,383,050 (26.19 %)	58,872 (1.79 %)
67	Arabian camel (hap2 2024) GCA_036321565.1	n/a	17,085 (1.73 %)	19,317 (1.59 %)	n/a	41.75 (100.00 %)	210 (0.00 %)	173 (100.00 %)	2,818,446 (29.44 %)	316,646 (8.90 %)	11,192,133 (31.47 %)	52,135 (1.67 %)
68	Arabian camel (paternal hap 2024 genbank) GCA_036321535.1	n/a	18,080 (1.66 %)	20,345 (1.52 %)	n/a	41.64 (100.00 %)	195 (0.00 %)	172 (100.00 %)	3,040,473 (29.22 %)	343,482 (10.93 %)	11,797,012 (33.50 %)	55,428 (1.61 %)
69	Arabian camel (paternal hap 2024 refseq) GCF_036321535.1	62,940 (3.46 %)	18,078 (1.66 %)	21,071 (1.56 %)	n/a	41.64 (100.00 %)	195 (0.00 %)	171 (100.00 %)	3,040,467 (29.22 %)	343,480 (10.93 %)	11,796,955 (33.50 %)	55,427 (1.61 %)
70	Arctic fox (Blue_001 2021 refseq) GCF_018345385.1	60,759 (3.11 %)	19,942 (1.72 %)	19,529 (1.38 %)	n/a	41.27 (100.00 %)	529 (0.00 %)	929 (100.00 %)	4,821,229 (41.22 %)	1,006,124 (2.31 %)	13,556,149 (32.92 %)	49,997 (2.23 %)
71	Arctic ground squirrel (AGS 11-09-20 2018) GCF_003426925.1	39,569 (2.25 %)	18,954 (1.74 %)	19,372 (1.45 %)	n/a	39.95 (89.51 %)	2,429,461 (10.59 %)	15,883 (100.00 %)	4,400,304 (32.67 %)	672,831 (1.50 %)	13,913,477 (26.41 %)	27,575 (0.72 %)
72	Arctic ground squirrel (hap1 2024) GCA_045843805.1	n/a	20,255 (1.35 %)	21,401 (1.44 %)	n/a	40.08 (100.00 %)	694 (0.00 %)	2,530 (100.00 %)	4,287,108 (25.85 %)	895,123 (5.96 %)	15,722,314 (36.45 %)	34,781 (0.82 %)
73	Arctic ground squirrel (hap2 2024) GCA_045843765.1	n/a	18,385 (1.31 %)	19,099 (1.34 %)	n/a	39.97 (100.00 %)	590 (0.00 %)	2,307 (100.00 %)	4,314,945 (35.63 %)	820,736 (6.65 %)	14,490,422 (35.95 %)	31,201 (0.78 %)
74	Arctic ground squirrel (mUroPar1hap1 2024) GCF_045843805.1	45,939 (2.00 %)	19,773 (1.41 %)	20,880 (1.28 %)	n/a	40.08 (100.00 %)	694 (0.00 %)	2,529 (100.00 %)	5,291,989 (39.61 %)	895,123 (5.96 %)	15,722,212 (36.45 %)	34,781 (0.82 %)
75	Argentine brown bat (hap1 2026) GCA_054644455.1	n/a	18,052 (1.73 %)	21,405 (1.63 %)	n/a	43.75 (100.00 %)	182 (0.00 %)	128 (100.00 %)	5,245,679 (48.66 %)	977,198 (7.30 %)	10,493,417 (40.05 %)	79,568 (3.84 %)
76	Argentine brown bat (hap2 2026) GCA_054644445.1	n/a	18,052 (1.75 %)	21,190 (1.62 %)	n/a	43.67 (100.00 %)	180 (0.00 %)	86 (100.00 %)	5,220,241 (48.57 %)	944,596 (6.38 %)	10,596,184 (39.27 %)	79,656 (3.86 %)
77	Arizona myotis (B2S1-25 2026) GCA_056320795.1	n/a	18,863 (1.89 %)	22,200 (1.77 %)	n/a	n/a	29 (0.00 %)	69 (100.00 %)	5,269,475 (46.93 %)	728,040 (3.97 %)	10,731,242 (36.48 %)	64,381 (2.58 %)
78	Asian palm civet GCA_004024585.1	n/a	22,124 (1.43 %)	43,710 (1.39 %)	n/a	42.52 (99.95 %)	4,533 (0.02 %)	442,658 (99.98 %)	4,877,367 (40.32 %)	754,440 (1.35 %)	14,557,779 (32.29 %)	148,246 (5.67 %)
79	Asiatic brush-tailed porcupine (POm2014 2021) GCA_016801275.1	n/a	18,688 (1.73 %)	22,642 (1.64 %)	n/a	41.26 (97.24 %)	152,126 (2.77 %)	303,244 (97.23 %)	3,431,580 (28.56 %)	667,375 (2.21 %)	13,572,972 (26.90 %)	42,853 (1.30 %)
80	Asiatic elephant (hap1 2025) GCA_051911825.1	n/a	18,110 (1.16 %)	21,254 (1.07 %)	n/a	41.12 (100.00 %)	83 (0.00 %)	106 (100.00 %)	8,688,198 (60.75 %)	617,944 (3.48 %)	16,342,943 (48.24 %)	54,726 (1.19 %)
81	Asiatic elephant (hap2 2025) GCA_051911805.1	n/a	17,315 (1.21 %)	20,345 (1.11 %)	n/a	41.03 (99.98 %)	51 (0.02 %)	88 (100.00 %)	8,066,849 (59.94 %)	495,013 (2.47 %)	15,276,267 (46.85 %)	44,484 (1.08 %)
82	Asiatic elephant (mEleMax1 alternate hap 2022) GCA_024166345.1	n/a	17,906 (1.18 %)	21,966 (1.14 %)	n/a	41.14 (100.00 %)	n/a	6,361 (100.00 %)	3,818,524 (29.72 %)	533,426 (3.22 %)	14,381,781 (47.30 %)	50,264 (1.15 %)
83	Asiatic elephant (mEleMax1 primary hap 2022) GCF_024166365.1	61,202 (2.60 %)	18,887 (1.13 %)	21,194 (1.06 %)	n/a	41.14 (99.90 %)	126 (0.10 %)	64 (100.00 %)	4,358,470 (31.27 %)	663,094 (4.56 %)	16,261,778 (48.66 %)	69,120 (1.32 %)
84	Asiatic mouflon (Amuf_v1 2020) GCA_014523465.1	n/a	19,569 (1.59 %)	21,293 (1.35 %)	n/a	41.97 (99.68 %)	257 (0.32 %)	128 (100.00 %)	5,390,761 (47.15 %)	451,837 (1.15 %)	13,157,608 (40.67 %)	44,158 (1.19 %)
85	Asiatic tapir (hap1 2023) GCA_031878655.1	n/a	18,969 (1.75 %)	20,207 (1.36 %)	n/a	41.25 (100.00 %)	79 (0.00 %)	262 (100.00 %)	3,650,963 (38.06 %)	355,322 (2.63 %)	14,837,952 (31.37 %)	37,174 (1.87 %)
86	Asiatic tapir (hap2 2023) GCA_031878705.1	n/a	18,931 (1.76 %)	19,988 (1.37 %)	n/a	41.16 (100.00 %)	92 (0.00 %)	193 (100.00 %)	3,632,286 (38.21 %)	350,074 (2.22 %)	14,785,531 (30.90 %)	36,699 (1.70 %)
87	ass (donkey Dezhou 2021) GCF_016077325.2	84,046 (4.01 %)	18,838 (1.75 %)	20,239 (1.42 %)	69,689 (3.29 %)	41.42 (99.86 %)	1,922 (0.15 %)	50 (100.00 %)	3,840,509 (41.57 %)	319,943 (0.81 %)	14,889,114 (29.46 %)	41,082 (1.37 %)
88	ass (donkey Dezhou DZ240498 2026) GCA_054375355.1	n/a	18,466 (1.53 %)	21,452 (1.35 %)	n/a	42.24 (100.00 %)	n/a	32 (100.00 %)	4,884,564 (46.47 %)	681,289 (5.26 %)	14,410,624 (36.71 %)	42,583 (2.97 %)
89	ass (donkey D_3611 2024) GCF_041296235.1	92,510 (3.84 %)	18,566 (1.54 %)	21,504 (1.32 %)	n/a	42.37 (99.94 %)	7 (0.06 %)	849 (100.00 %)	3,555,052 (38.38 %)	658,645 (5.79 %)	14,242,715 (36.79 %)	43,875 (3.45 %)
90	ass (donkey Maral har 2015 refseq) GCF_001305755.1	48,976 (3.12 %)	18,838 (1.78 %)	19,295 (1.44 %)	n/a	41.28 (98.63 %)	69,593 (1.38 %)	2,167 (100.00 %)	3,731,432 (40.84 %)	289,737 (0.96 %)	14,695,308 (28.58 %)	40,025 (1.06 %)
91	Atlantic white-sided dolphin (hap1.1 2024) GCF_964270905.1	34,820 (1.84 %)	18,692 (1.56 %)	21,070 (1.29 %)	n/a	42.18 (99.99 %)	1,034 (0.01 %)	1,932 (99.99 %)	4,918,851 (54.26 %)	1,054,000 (10.27 %)	12,280,671 (41.92 %)	79,762 (4.08 %)
92	Atlantic white-sided dolphin (mLagAcu1.hap1.1 2024) GCA_964270905.1	n/a	18,773 (1.50 %)	21,069 (1.29 %)	n/a	42.18 (99.99 %)	1,034 (0.01 %)	900 (100.00 %)	3,975,427 (35.64 %)	1,054,000 (10.27 %)	12,281,095 (41.92 %)	79,762 (4.08 %)
93	Atlantic white-sided dolphin (mLagAcu1.hap2.1 2024) GCA_964270935.1	n/a	17,961 (1.59 %)	20,087 (1.36 %)	n/a	42.05 (99.99 %)	917 (0.01 %)	1,796 (99.99 %)	3,626,392 (35.51 %)	824,778 (7.32 %)	11,499,904 (39.18 %)	74,348 (3.46 %)
94	Australian echidna (mTacAcu1 alternate hap 2020) GCA_015852515.1	n/a	13,505 (1.03 %)	18,978 (1.47 %)	n/a	45.32 (99.98 %)	26 (0.02 %)	3,482 (100.00 %)	6,880,857 (41.88 %)	1,099,932 (7.47 %)	8,156,735 (56.68 %)	70,515 (2.88 %)
95	Australian echidna (mTacAcu1 primary hap 2020) GCF_015852505.1	42,938 (2.28 %)	14,891 (1.01 %)	19,714 (1.45 %)	n/a	45.30 (98.61 %)	524 (1.39 %)	310 (100.00 %)	7,814,876 (42.89 %)	1,219,764 (6.93 %)	9,488,325 (55.68 %)	78,364 (2.73 %)
96	Australian echidna (primary hap 2020) GCA_015852505.1	n/a	14,558 (1.03 %)	19,716 (1.45 %)	n/a	45.30 (98.61 %)	524 (1.39 %)	311 (100.00 %)	11,576,251 (65.36 %)	1,219,765 (6.93 %)	9,488,197 (55.68 %)	78,365 (2.74 %)
97	Bactrian camel (Alxa 2014 refseq) GCF_000767855.1	52,191 (3.64 %)	18,303 (1.98 %)	17,097 (1.64 %)	n/a	41.32 (99.32 %)	31,980 (0.69 %)	67,435 (99.31 %)	2,966,704 (34.06 %)	306,997 (0.95 %)	12,209,949 (25.43 %)	49,790 (1.25 %)
98	Bactrian camel YW-2024 2025 GCF_048773025.1	76,927 (4.47 %)	18,239 (1.57 %)	22,111 (1.51 %)	n/a	41.95 (100.00 %)	127 (0.00 %)	158 (100.00 %)	3,258,307 (30.21 %)	377,352 (13.70 %)	11,533,205 (36.22 %)	65,887 (1.95 %)
99	banded mongoose GCA_004023785.1	n/a	21,568 (1.57 %)	30,427 (1.43 %)	n/a	42.00 (99.96 %)	4,510 (0.02 %)	316,874 (99.98 %)	4,768,524 (40.51 %)	684,187 (1.30 %)	13,713,756 (33.42 %)	78,648 (2.80 %)
100	bank vole GCF_902806735.1	56,423 (2.99 %)	18,977 (1.71 %)	18,408 (1.50 %)	n/a	41.86 (98.62 %)	53,506 (1.39 %)	54,142 (98.61 %)	3,222,366 (21.59 %)	933,697 (2.20 %)	12,831,232 (31.50 %)	18,784 (0.42 %)
101	bank vole (2345 2026) GCF_055000105.1	61,430 (3.61 %)	18,641 (1.83 %)	18,703 (1.51 %)	n/a	41.82 (99.31 %)	169,690 (0.72 %)	29 (100.00 %)	4,407,241 (38.94 %)	862,256 (2.01 %)	13,050,067 (29.53 %)	17,023 (0.50 %)
102	bank vole (alternate hap 2026) GCA_982192455.1	n/a	19,256 (1.62 %)	21,366 (1.49 %)	n/a	41.90 (99.96 %)	11,276 (0.04 %)	13,377 (99.96 %)	4,826,217 (40.86 %)	1,054,486 (5.70 %)	13,388,267 (35.53 %)	21,460 (0.81 %)
103	Bank vole (primary hap 2026 genbank) GCA_982192425.1	n/a	19,486 (1.64 %)	20,748 (1.44 %)	n/a	41.77 (100.00 %)	282 (0.00 %)	189 (100.00 %)	4,753,576 (39.91 %)	1,023,408 (7.51 %)	13,554,153 (36.18 %)	20,512 (0.55 %)
104	bank vole (primary hap 2026 refseq) GCF_982192425.1	65,946 (3.22 %)	19,403 (1.63 %)	20,825 (1.44 %)	n/a	n/a	282 (0.00 %)	470 (100.00 %)	5,296,968 (43.54 %)	1,023,918 (7.50 %)	13,554,104 (36.18 %)	20,512 (0.55 %)
105	banner-tailed kangaroo rat GCF_019054845.1	43,753 (1.82 %)	18,397 (1.18 %)	24,180 (1.39 %)	n/a	40.83 (100.00 %)	n/a	2,026 (100.00 %)	5,587,719 (30.97 %)	1,363,513 (3.95 %)	12,128,920 (48.74 %)	36,371 (1.27 %)
106	banteng 2023 GCF_032452875.1	71,974 (3.56 %)	19,305 (1.36 %)	21,174 (1.20 %)	n/a	42.79 (100.00 %)	84 (0.00 %)	1,518 (100.00 %)	3,344,481 (20.63 %)	1,039,571 (11.74 %)	13,031,356 (47.36 %)	73,031 (1.72 %)
107	bat A.intermedius (hap2 2024) GCA_038363225.1	n/a	17,124 (1.63 %)	18,342 (1.54 %)	n/a	42.25 (100.00 %)	56 (0.00 %)	187 (100.00 %)	2,597,378 (26.81 %)	332,733 (4.43 %)	10,957,327 (33.52 %)	63,688 (2.22 %)
108	bat C.sowelli (hap1 2025) GCA_051307085.1	n/a	18,014 (1.42 %)	20,809 (1.93 %)	n/a	42.09 (100.00 %)	68 (0.00 %)	509 (100.00 %)	3,004,656 (32.84 %)	845,572 (16.12 %)	11,658,155 (41.10 %)	66,315 (3.59 %)
109	bat C.sowelli (hap2 2025) GCA_051307135.1	n/a	17,963 (1.56 %)	20,587 (1.76 %)	n/a	42.16 (100.00 %)	58 (0.00 %)	272 (100.00 %)	2,925,013 (29.51 %)	669,006 (8.09 %)	11,656,071 (35.51 %)	66,056 (3.20 %)
110	bat G.keenani (hap1 2025) GCA_050655435.1	n/a	17,710 (1.68 %)	20,322 (1.57 %)	n/a	42.06 (100.00 %)	103 (0.00 %)	188 (100.00 %)	3,982,570 (44.25 %)	413,159 (3.00 %)	12,157,326 (33.66 %)	69,493 (3.54 %)
111	bat G.keenani (hap2 2025) GCA_050655445.1	n/a	17,129 (1.75 %)	19,351 (1.61 %)	n/a	42.25 (100.00 %)	57 (0.00 %)	83 (100.00 %)	3,507,996 (42.55 %)	382,739 (1.78 %)	11,541,032 (32.12 %)	67,214 (3.68 %)
112	bat H.larvatus (alternate hap 2023) GCA_031878685.1	n/a	19,431 (1.77 %)	23,767 (1.57 %)	n/a	41.38 (100.00 %)	4 (0.00 %)	7,531 (100.00 %)	4,390,631 (44.16 %)	678,913 (4.61 %)	11,883,673 (33.41 %)	41,004 (1.20 %)
113	bat H.larvatus (China 20210929_DDb primary hap 2024) GCA_043727955.1	n/a	19,354 (1.74 %)	21,367 (1.51 %)	n/a	41.48 (100.00 %)	190 (0.00 %)	265 (100.00 %)	3,860,506 (38.95 %)	722,335 (7.13 %)	11,994,816 (35.77 %)	44,562 (1.21 %)
114	bat M.microtis (hap1 2025) GCA_051107205.1	n/a	18,403 (1.68 %)	20,606 (1.62 %)	n/a	42.65 (100.00 %)	68 (0.00 %)	190 (100.00 %)	3,101,865 (28.94 %)	356,434 (1.13 %)	11,717,214 (32.98 %)	78,560 (2.78 %)
115	bat M.microtis (hap2 2025) GCA_051107335.1	n/a	17,634 (1.72 %)	19,795 (1.66 %)	n/a	42.77 (100.00 %)	64 (0.00 %)	158 (100.00 %)	2,904,392 (28.42 %)	330,754 (1.09 %)	11,070,209 (31.88 %)	74,480 (2.76 %)
116	beluga whale (Cook Inlet, Alaska, USA DL-CIB17-05 2020) GCA_009917745.1	n/a	19,239 (1.79 %)	22,513 (1.43 %)	35,878 (1.82 %)	41.25 (97.57 %)	27,070 (2.43 %)	52,780 (97.57 %)	4,021,599 (43.53 %)	544,323 (1.08 %)	12,738,162 (33.47 %)	59,710 (1.51 %)
117	beluga whale (GAN/ISIS: 26980492/103006 v3 2019) GCF_002288925.2	59,413 (3.09 %)	18,667 (1.79 %)	20,314 (1.43 %)	n/a	41.24 (98.49 %)	24,414 (1.52 %)	29,444 (98.48 %)	4,001,248 (43.73 %)	543,276 (1.11 %)	12,802,735 (34.18 %)	59,307 (1.53 %)
118	big brown bat (BU_THK_EF1 2012) GCF_000308155.1	59,162 (3.17 %)	18,334 (1.94 %)	20,121 (1.78 %)	n/a	42.93 (89.41 %)	160,269 (10.62 %)	167,057 (89.38 %)	2,842,065 (25.82 %)	614,712 (1.89 %)	10,407,733 (28.90 %)	66,720 (2.99 %)
119	big brown bat (TK198812 2023 genbank) GCA_027574615.1	n/a	18,420 (1.89 %)	21,275 (1.72 %)	n/a	43.51 (100.00 %)	75 (0.00 %)	49 (100.00 %)	4,895,568 (45.28 %)	904,082 (3.80 %)	10,530,742 (37.05 %)	77,606 (3.68 %)
120	big brown bat (TK198812 2023 refseq) GCF_027574615.1	46,266 (2.61 %)	18,620 (1.80 %)	21,271 (1.72 %)	n/a	43.51 (100.00 %)	75 (0.00 %)	48 (100.00 %)	3,041,145 (25.08 %)	904,075 (3.80 %)	10,530,666 (37.05 %)	77,605 (3.68 %)
121	bighorn sheep (Bighorn MfBH-ARS-UI-01 2024) GCA_042477335.2	n/a	19,021 (1.39 %)	21,154 (1.33 %)	n/a	43.91 (100.00 %)	3 (0.00 %)	41 (100.00 %)	5,490,141 (54.04 %)	826,352 (11.67 %)	12,918,667 (46.86 %)	52,254 (10.67 %)
122	bighorn sheep (BS48 2019) GCA_004026945.1	n/a	23,059 (1.34 %)	36,486 (1.19 %)	n/a	43.20 (99.90 %)	9,412 (0.03 %)	1,057,548 (99.97 %)	6,321,577 (50.75 %)	716,846 (1.66 %)	13,904,326 (44.98 %)	95,564 (1.72 %)
123	bighorn sheep (v2 Bighorn MfBH-ARS-UI-01 2024) GCF_042477335.2	78,636 (2.63 %)	19,459 (1.36 %)	21,150 (1.33 %)	n/a	43.91 (100.00 %)	3 (0.00 %)	42 (100.00 %)	3,963,383 (22.89 %)	826,353 (11.67 %)	12,918,743 (46.86 %)	52,254 (10.67 %)
124	bilby (mMagLag1 2024 genbank) GCA_037893015.1	n/a	18,686 (0.72 %)	17,238 (0.81 %)	n/a	37.35 (99.66 %)	4,431 (0.34 %)	609 (100.00 %)	6,263,094 (27.34 %)	2,223,995 (5.89 %)	23,994,844 (43.69 %)	51,039 (3.47 %)
125	bilby (mMagLag1 2024 refseq) GCF_037893015.1	60,460 (3.10 %)	18,687 (0.72 %)	17,229 (0.81 %)	n/a	37.35 (99.66 %)	4,431 (0.34 %)	608 (100.00 %)	6,299,949 (27.49 %)	2,223,987 (5.89 %)	23,992,536 (43.69 %)	51,039 (3.47 %)
126	black and rufous elephant shrew (mRhyPet1hap1 2024) GCA_043290085.1	n/a	20,713 (0.64 %)	21,469 (0.64 %)	n/a	41.74 (100.00 %)	770 (0.00 %)	470 (100.00 %)	3,860,121 (14.52 %)	1,230,113 (2.81 %)	21,600,460 (65.53 %)	49,878 (0.73 %)
127	black and rufous elephant shrew (mRhyPet1hap2 2024) GCA_043290065.1	n/a	19,814 (0.63 %)	20,140 (0.63 %)	n/a	41.82 (100.00 %)	723 (0.00 %)	315 (100.00 %)	3,657,357 (14.24 %)	1,158,716 (2.84 %)	22,924,986 (64.53 %)	46,774 (0.90 %)
128	black flying fox GCF_000325575.1	46,991 (3.15 %)	18,089 (2.00 %)	20,668 (1.75 %)	n/a	39.74 (97.93 %)	104,566 (2.08 %)	170,164 (97.92 %)	2,975,186 (34.05 %)	481,859 (1.45 %)	12,582,349 (26.52 %)	62,483 (3.88 %)
129	black rat GCF_011064425.1	39,601 (2.37 %)	20,793 (1.98 %)	17,944 (1.37 %)	n/a	42.14 (99.98 %)	6,158 (0.02 %)	2,173 (100.00 %)	4,715,157 (41.57 %)	1,432,294 (3.45 %)	13,275,550 (32.36 %)	18,055 (0.48 %)
130	black rhinoceros (alternate hap 2021) GCA_020826835.1	n/a	19,000 (1.37 %)	22,547 (1.26 %)	n/a	41.56 (99.97 %)	178 (0.03 %)	1,199 (100.00 %)	4,340,245 (37.22 %)	564,468 (8.07 %)	14,384,523 (40.40 %)	44,971 (1.16 %)
131	black rhinoceros (BS38 2019 Broad) GCA_004027315.1	n/a	21,713 (1.32 %)	32,731 (1.18 %)	n/a	41.22 (99.85 %)	7,256 (0.02 %)	2,029,914 (99.98 %)	4,618,655 (36.76 %)	618,834 (2.21 %)	16,248,532 (40.32 %)	44,113 (0.97 %)
132	black rhinoceros (primary hap 2021 refseq) GCF_020826845.1	56,268 (2.28 %)	18,774 (1.38 %)	22,348 (1.26 %)	n/a	41.59 (99.95 %)	215 (0.05 %)	1,076 (100.00 %)	4,200,390 (36.22 %)	548,030 (8.34 %)	14,347,693 (40.14 %)	43,525 (1.14 %)
133	black-footed cat GCA_004023925.1	n/a	22,895 (1.14 %)	51,789 (1.13 %)	n/a	41.92 (99.90 %)	13,476 (0.06 %)	603,600 (99.94 %)	5,261,265 (44.11 %)	943,514 (1.77 %)	13,681,435 (34.77 %)	86,892 (2.23 %)
134	black-footed ferret (SB6536 2022) GCF_022355385.1	56,415 (2.78 %)	18,681 (1.55 %)	20,685 (1.40 %)	n/a	41.55 (96.71 %)	33,042 (3.30 %)	20,575 (100.00 %)	4,087,717 (30.94 %)	695,805 (1.18 %)	13,880,116 (32.08 %)	54,060 (2.11 %)
135	Black-footed pygmy rice rat (hap1 2026) GCA_057876635.1	n/a	18,406 (1.50 %)	19,794 (1.40 %)	n/a	40.25 (100.00 %)	310 (0.00 %)	130 (100.00 %)	3,808,746 (29.86 %)	1,161,779 (5.60 %)	13,927,799 (34.51 %)	20,238 (0.63 %)
136	Black-footed pygmy rice rat (hap2 2026) GCA_057876665.1	n/a	18,294 (1.57 %)	19,184 (1.44 %)	n/a	40.44 (100.00 %)	279 (0.00 %)	95 (100.00 %)	3,674,443 (30.08 %)	1,059,812 (5.20 %)	14,027,360 (32.36 %)	18,895 (0.59 %)
137	black-lipped pika GCF_017591425.1	46,297 (2.64 %)	18,529 (1.63 %)	23,458 (1.83 %)	n/a	43.71 (100.00 %)	54 (0.00 %)	2,214 (100.00 %)	1,843,705 (12.62 %)	471,798 (2.76 %)	11,394,992 (31.27 %)	63,124 (1.85 %)
138	Blainville's beaked whale (alternate hap 2022) GCA_025094165.1	n/a	17,838 (1.54 %)	21,389 (1.35 %)	n/a	41.71 (100.00 %)	1 (0.00 %)	5,198 (100.00 %)	3,542,727 (35.35 %)	650,369 (8.86 %)	10,971,320 (41.15 %)	62,389 (1.68 %)
139	Blainville's beaked whale (primary hap 2022 refseq) GCF_025265405.1	47,553 (2.07 %)	19,041 (1.52 %)	20,766 (1.27 %)	n/a	41.70 (99.97 %)	97 (0.03 %)	74 (100.00 %)	3,964,038 (35.29 %)	765,957 (8.74 %)	12,128,229 (41.78 %)	70,851 (1.80 %)
140	Blasius's horseshoe bat (hap1 2026) GCA_057428245.1	n/a	18,361 (1.90 %)	20,645 (1.66 %)	n/a	40.57 (100.00 %)	106 (0.00 %)	197 (100.00 %)	3,589,565 (40.46 %)	551,655 (1.43 %)	12,136,235 (30.17 %)	34,854 (1.10 %)
141	Blasius's horseshoe bat (hap2 2026) GCA_057428315.1	n/a	17,508 (1.97 %)	19,717 (1.71 %)	n/a	n/a	82 (0.00 %)	150 (100.00 %)	3,296,778 (39.22 %)	511,295 (1.37 %)	11,469,148 (28.59 %)	30,364 (1.09 %)
142	blue whale (alternate hap JJ_BM4_2016_0621 2019) GCA_008658375.1	n/a	17,285 (1.80 %)	21,295 (1.43 %)	n/a	41.22 (100.00 %)	n/a	12,574 (100.00 %)	3,196,354 (43.47 %)	467,194 (1.26 %)	10,176,588 (33.66 %)	56,916 (1.85 %)
143	blue whale (JJ_BM4_2016_0621 primary hap 2020) GCA_009873245.3	n/a	19,151 (1.81 %)	20,574 (1.41 %)	n/a	40.88 (98.91 %)	886 (1.09 %)	106 (100.00 %)	3,986,871 (44.21 %)	579,629 (1.22 %)	12,858,081 (34.60 %)	67,032 (1.73 %)
144	Blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v2 alternate hap 2020) GCA_008658375.2	n/a	16,997 (1.82 %)	20,609 (1.44 %)	n/a	41.20 (100.00 %)	3 (0.00 %)	10,999 (100.00 %)	3,126,800 (43.49 %)	454,452 (1.23 %)	9,916,868 (33.63 %)	55,436 (1.85 %)
145	blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v3 primary hap 2020) GCF_009873245.2	58,737 (2.71 %)	19,162 (1.80 %)	20,576 (1.41 %)	36,291 (1.99 %)	40.88 (98.91 %)	886 (1.09 %)	106 (100.00 %)	3,986,870 (44.21 %)	579,629 (1.22 %)	12,858,384 (34.60 %)	67,032 (1.73 %)
146	bobcat (Redwood Valley CCGP_SWC_20201006 alternate hap 2022) GCA_022079275.1	n/a	24,877 (1.23 %)	48,382 (1.39 %)	n/a	42.05 (99.98 %)	4,716 (0.01 %)	72,827 (99.99 %)	6,403,412 (33.31 %)	1,269,531 (1.94 %)	17,771,689 (33.82 %)	100,915 (3.00 %)
147	bobcat (Redwood Valley CCGP_SWC_20201006 primary hap 2022) GCF_022079265.1	45,417 (2.39 %)	18,576 (1.65 %)	20,510 (1.41 %)	n/a	41.80 (100.00 %)	24 (0.00 %)	75 (100.00 %)	4,970,082 (43.28 %)	894,002 (1.80 %)	13,648,384 (34.21 %)	69,211 (2.68 %)
148	boreal woodland reindeer (boreal CA-31 2023) GCA_019903745.2	n/a	20,135 (1.60 %)	22,598 (1.47 %)	n/a	41.46 (96.98 %)	34,682 (3.03 %)	12,266 (100.00 %)	3,134,107 (24.41 %)	394,920 (0.92 %)	13,154,929 (36.43 %)	48,826 (1.07 %)
149	Botta's pocket gopher (bottae MVZ:Mamm:240275 alternate hap 2022) GCA_024803775.1	n/a	18,647 (0.96 %)	23,998 (1.13 %)	n/a	41.67 (100.00 %)	124 (0.00 %)	3,340 (100.00 %)	3,775,862 (22.40 %)	1,257,803 (21.71 %)	9,347,543 (61.85 %)	33,757 (1.35 %)
150	Botta's pocket gopher (bottae MVZ:Mamm:240275 primary hap 2022) GCA_024803745.1	n/a	17,791 (1.12 %)	22,667 (1.29 %)	n/a	41.66 (100.00 %)	106 (0.00 %)	2,898 (100.00 %)	6,293,452 (41.30 %)	1,076,688 (17.94 %)	8,553,272 (57.13 %)	31,102 (1.31 %)
151	Botta's pocket gopher (hap1 2023) GCA_031878675.1	n/a	18,247 (1.61 %)	22,673 (1.83 %)	n/a	41.12 (99.99 %)	775 (0.01 %)	835 (100.00 %)	2,918,285 (18.64 %)	868,090 (5.77 %)	9,427,604 (40.78 %)	27,049 (1.25 %)
152	Botta's pocket gopher (hap2 2023) GCA_031878665.1	n/a	17,612 (1.68 %)	22,099 (1.91 %)	n/a	41.23 (99.99 %)	541 (0.01 %)	365 (100.00 %)	2,748,918 (17.16 %)	827,542 (4.51 %)	8,832,809 (39.20 %)	26,416 (1.35 %)
153	boutu (hap1 2024) GCA_036417435.1	n/a	18,667 (1.46 %)	20,817 (1.26 %)	n/a	42.07 (100.00 %)	284 (0.00 %)	903 (100.00 %)	4,004,895 (35.23 %)	925,158 (12.15 %)	11,999,784 (42.65 %)	63,428 (1.55 %)
154	boutu (hap2 2024) GCA_036417475.1	n/a	17,954 (1.51 %)	19,994 (1.30 %)	n/a	42.02 (100.00 %)	240 (0.00 %)	800 (100.00 %)	3,723,164 (34.96 %)	809,880 (11.02 %)	11,359,211 (41.42 %)	60,067 (1.55 %)
155	Brahman cow (Angus x Brahman F1 Brahman haplotype 2018) GCF_003369695.1	63,234 (2.88 %)	19,601 (1.57 %)	21,699 (1.34 %)	n/a	41.83 (99.94 %)	302 (0.06 %)	1,250 (100.00 %)	5,524,454 (47.57 %)	459,928 (1.40 %)	13,208,799 (41.21 %)	41,359 (1.10 %)
156	Brandt's bat GCF_000412655.1	46,912 (2.84 %)	19,267 (1.75 %)	18,495 (1.62 %)	n/a	42.59 (94.06 %)	155,664 (5.95 %)	325,414 (94.05 %)	2,897,662 (25.08 %)	634,208 (3.20 %)	11,323,618 (31.06 %)	66,749 (1.59 %)
157	Brazilian free-tailed bat (alternate hap 2023) GCA_030848815.1	n/a	18,921 (1.72 %)	22,946 (1.65 %)	n/a	42.50 (100.00 %)	n/a	3,728 (100.00 %)	4,021,020 (40.28 %)	637,136 (3.60 %)	11,382,826 (36.28 %)	70,547 (2.64 %)
158	Brazilian free-tailed bat (primary hap 2023) GCA_030848825.1	n/a	19,039 (1.66 %)	21,660 (1.59 %)	n/a	42.29 (100.00 %)	20 (0.00 %)	148 (100.00 %)	3,805,818 (31.80 %)	640,446 (2.50 %)	11,793,353 (36.15 %)	68,896 (2.40 %)
159	Brazilian guinea pig GCA_000688575.1	n/a	16,531 (1.49 %)	11,177 (1.44 %)	n/a	39.81 (64.76 %)	2,565,595 (35.61 %)	3,131 (100.00 %)	2,529,479 (25.87 %)	342,907 (0.66 %)	10,719,517 (21.05 %)	19,508 (0.31 %)
160	Brazilian tapir GCA_004025025.1	n/a	21,581 (1.61 %)	30,818 (1.32 %)	n/a	41.12 (99.93 %)	2,273 (0.01 %)	805,779 (99.99 %)	3,877,938 (38.36 %)	344,032 (0.79 %)	15,601,710 (32.81 %)	43,382 (1.17 %)
161	brown bear (GAN/ISIS:MIG12 v2 2018) GCF_003584765.2	50,229 (2.92 %)	18,811 (1.77 %)	21,073 (1.52 %)	n/a	41.84 (99.31 %)	17,380 (0.70 %)	21,813 (99.30 %)	4,201,043 (40.86 %)	567,586 (1.23 %)	13,807,211 (30.86 %)	62,125 (1.80 %)
162	brown bear (v2.0 North America Adak 2023) GCF_023065955.2	66,371 (4.20 %)	18,615 (1.68 %)	21,434 (1.53 %)	n/a	42.29 (100.00 %)	250 (0.00 %)	362 (100.00 %)	4,030,019 (33.22 %)	630,008 (4.17 %)	13,240,060 (32.92 %)	64,814 (2.05 %)
163	brown big-eared bat (alternate hap 2023) GCA_963455325.1	n/a	18,932 (1.77 %)	23,324 (1.64 %)	n/a	43.04 (100.00 %)	n/a	5,570 (100.00 %)	4,970,484 (48.00 %)	928,854 (4.06 %)	10,332,383 (39.35 %)	59,133 (2.45 %)
164	brown big-eared bat (primary hap 2023 genbank) GCA_963455305.1	n/a	19,138 (1.72 %)	20,370 (1.54 %)	n/a	43.08 (99.99 %)	1,237 (0.01 %)	65 (100.00 %)	3,201,470 (26.24 %)	957,903 (4.27 %)	10,687,995 (39.65 %)	60,671 (2.39 %)
165	brown big-eared bat (primary hap 2023 refseq) GCF_963455305.1	51,465 (2.81 %)	18,957 (1.79 %)	20,368 (1.54 %)	n/a	43.08 (99.99 %)	1,237 (0.01 %)	64 (100.00 %)	5,119,261 (48.27 %)	957,900 (4.27 %)	10,687,449 (39.65 %)	60,670 (2.39 %)
166	brown-throated sloth GCA_004027775.1	n/a	17,043 (1.21 %)	37,090 (1.36 %)	n/a	42.76 (99.76 %)	462 (0.00 %)	1,772,267 (100.00 %)	2,487,215 (36.18 %)	316,812 (1.60 %)	7,948,666 (37.96 %)	62,325 (2.36 %)
167	bush duiker (CMD-5126 2019) GCA_006408735.1	n/a	21,234 (1.49 %)	24,405 (1.37 %)	n/a	42.55 (81.82 %)	787,889 (18.24 %)	810,213 (81.76 %)	5,743,783 (45.60 %)	588,471 (5.37 %)	13,114,146 (31.74 %)	52,826 (1.05 %)
168	cactus mouse (2023) GCF_949786415.1	47,537 (2.02 %)	18,894 (1.46 %)	20,159 (1.22 %)	n/a	42.40 (99.98 %)	2,603 (0.02 %)	4,297 (100.00 %)	7,181,232 (52.75 %)	1,247,378 (18.35 %)	13,329,318 (43.03 %)	19,540 (0.49 %)
169	California mouse (IS 2022) GCF_007827085.1	62,273 (3.80 %)	18,959 (1.75 %)	19,378 (1.41 %)	n/a	42.21 (100.00 %)	547 (0.00 %)	237 (100.00 %)	5,970,582 (45.08 %)	1,165,743 (3.67 %)	13,734,349 (33.67 %)	19,529 (0.58 %)
170	California Myotis (W8-MyCa 2026) GCA_056320955.1	n/a	18,697 (1.84 %)	22,300 (1.72 %)	n/a	n/a	12 (0.00 %)	87 (100.00 %)	5,364,514 (47.99 %)	764,945 (4.91 %)	10,577,355 (37.76 %)	64,311 (2.57 %)
171	California sea lion (alternate hap 2019) GCA_009762295.1	n/a	18,348 (1.81 %)	18,692 (1.47 %)	n/a	41.58 (100.00 %)	n/a	3,093 (100.00 %)	3,722,619 (42.89 %)	488,086 (1.26 %)	10,893,132 (33.14 %)	44,449 (1.57 %)
172	California sea lion (LMU 2018 refseq) GCF_900631625.1	69,240 (2.99 %)	20,741 (1.78 %)	20,298 (1.40 %)	n/a	41.38 (99.81 %)	47,716 (0.20 %)	10,423 (100.00 %)	4,530,259 (43.28 %)	573,086 (1.12 %)	13,442,336 (33.58 %)	50,583 (1.46 %)
173	California sea lion (mZalCal1 alternate hap 2020) GCA_009762295.2	n/a	18,319 (1.81 %)	18,772 (1.48 %)	n/a	41.58 (100.00 %)	n/a	3,096 (100.00 %)	3,724,021 (42.91 %)	488,356 (1.26 %)	10,891,276 (33.15 %)	44,467 (1.57 %)
174	California sea lion (primary hap 2020) GCA_009762305.2	n/a	20,939 (1.78 %)	20,184 (1.40 %)	n/a	41.40 (99.23 %)	185 (0.77 %)	47 (100.00 %)	4,530,531 (43.69 %)	590,246 (1.24 %)	13,263,573 (33.76 %)	51,899 (1.50 %)
175	California sea lion (v2 primary hap 2020) GCF_009762305.2	70,801 (3.05 %)	20,915 (1.77 %)	20,179 (1.40 %)	44,926 (2.10 %)	41.40 (99.23 %)	185 (0.77 %)	47 (100.00 %)	4,525,652 (43.65 %)	590,246 (1.24 %)	13,263,648 (33.76 %)	51,899 (1.50 %)
176	California vole (kernensis MVZ Mamm 240107 alternate hap 2023) GCA_028537755.1	n/a	19,409 (1.86 %)	20,578 (1.69 %)	n/a	42.43 (100.00 %)	43 (0.00 %)	310 (100.00 %)	3,161,054 (22.60 %)	891,453 (5.62 %)	11,087,206 (33.12 %)	19,104 (0.65 %)
177	California vole (kernensis MVZ Mamm 240107 primary hap 2023) GCA_028537955.1	n/a	19,681 (1.86 %)	21,257 (1.62 %)	n/a	42.24 (100.00 %)	51 (0.00 %)	350 (100.00 %)	4,957,057 (42.33 %)	943,226 (5.63 %)	11,695,871 (33.83 %)	20,062 (0.64 %)
178	Canada lynx (alternate hap LIC74 2019) GCA_007474575.1	n/a	12,029 (1.42 %)	15,171 (1.16 %)	n/a	41.46 (100.00 %)	3 (0.00 %)	15,036 (100.00 %)	2,937,491 (43.50 %)	544,410 (1.76 %)	7,641,565 (32.72 %)	39,082 (2.44 %)
179	Canada lynx (LIC74 primary hap 2020) GCA_007474595.2	n/a	18,286 (1.66 %)	19,266 (1.35 %)	n/a	41.70 (99.88 %)	842 (0.12 %)	55 (100.00 %)	5,014,416 (43.75 %)	904,528 (1.75 %)	13,467,329 (34.19 %)	66,805 (2.53 %)
180	Canada lynx (LIC74 v2 alternate hap 2020) GCA_007474575.2	n/a	12,041 (1.42 %)	15,226 (1.16 %)	n/a	41.46 (100.00 %)	5 (0.00 %)	15,046 (100.00 %)	2,939,291 (43.50 %)	544,849 (1.76 %)	7,650,345 (32.74 %)	39,099 (2.44 %)
181	Canada lynx (LIC74 v2 primary hap 2020) GCF_007474595.2	50,142 (2.69 %)	18,273 (1.65 %)	19,264 (1.35 %)	n/a	41.70 (99.88 %)	842 (0.12 %)	54 (100.00 %)	5,011,165 (43.72 %)	904,525 (1.75 %)	13,467,551 (34.19 %)	66,799 (2.48 %)
182	Cantor's roundleaf bat GCA_004027415.1	n/a	23,788 (1.42 %)	45,328 (1.68 %)	38,254 (1.57 %)	41.36 (99.91 %)	6,366 (0.03 %)	846,566 (99.97 %)	3,997,370 (31.48 %)	775,742 (1.42 %)	12,770,948 (33.45 %)	41,527 (1.41 %)
183	Cape elephant shrew GCF_000299155.1	25,406 (1.08 %)	23,258 (1.07 %)	24,266 (1.16 %)	n/a	40.30 (86.29 %)	279,394 (13.74 %)	288,162 (86.26 %)	3,765,232 (16.90 %)	604,351 (0.89 %)	20,072,078 (42.36 %)	25,977 (0.42 %)
184	Cape golden mole (2012 Broad) GCF_000296735.1	25,323 (1.07 %)	20,961 (1.07 %)	21,723 (1.04 %)	n/a	40.01 (79.93 %)	370,844 (20.11 %)	391,344 (79.89 %)	4,924,640 (21.03 %)	500,830 (1.95 %)	18,946,663 (41.18 %)	21,186 (0.33 %)
185	Cape hairy bat (hap1 2026) GCA_054824995.1	n/a	18,941 (1.79 %)	22,450 (1.66 %)	n/a	43.01 (100.00 %)	127 (0.00 %)	189 (100.00 %)	5,144,376 (47.81 %)	778,035 (6.45 %)	10,243,708 (39.07 %)	58,204 (2.36 %)
186	Cape hairy bat (hap2 2026) GCA_054825045.1	n/a	17,887 (1.90 %)	20,599 (1.71 %)	n/a	42.93 (100.00 %)	113 (0.00 %)	118 (100.00 %)	4,691,733 (46.04 %)	682,924 (4.53 %)	9,907,631 (36.70 %)	54,230 (2.37 %)
187	Cape rock hyrax (Dallas Zoo Isis #01D731 2014) GCA_000152225.2	n/a	18,455 (1.10 %)	22,103 (1.12 %)	n/a	41.00 (88.89 %)	259,879 (11.14 %)	325,568 (88.86 %)	6,210,235 (51.92 %)	381,915 (1.06 %)	20,080,212 (36.28 %)	29,690 (0.50 %)
188	Cape rock hyrax (US060 2019 Broad) GCA_004026925.1	n/a	21,401 (0.85 %)	45,353 (1.14 %)	n/a	41.08 (99.93 %)	4,203 (0.01 %)	1,048,940 (99.99 %)	7,222,494 (54.48 %)	430,286 (0.85 %)	21,775,991 (44.61 %)	37,158 (0.70 %)
189	capybara GCA_004027455.1	n/a	20,152 (1.22 %)	28,931 (1.29 %)	n/a	39.76 (99.93 %)	5,747 (0.02 %)	661,089 (99.98 %)	4,220,878 (29.16 %)	777,357 (2.04 %)	15,214,944 (35.16 %)	34,558 (0.85 %)
190	carabao (swamp buffalo K-KA32 2023) GCF_029407905.1	77,279 (2.89 %)	19,433 (1.40 %)	21,166 (1.23 %)	n/a	42.77 (100.00 %)	21 (0.00 %)	115 (100.00 %)	3,479,445 (21.92 %)	547,054 (6.39 %)	12,840,677 (45.22 %)	99,752 (3.73 %)
191	cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v2.0 2023 USDA) GCF_002263795.3	77,808 (4.11 %)	19,428 (1.48 %)	22,236 (1.33 %)	n/a	42.01 (100.00 %)	386 (0.00 %)	1,958 (100.00 %)	3,449,588 (22.63 %)	596,092 (3.13 %)	12,785,607 (42.11 %)	46,864 (1.37 %)
192	cattle (Hereford UMD_3.1.1 2014) GCF_000003055.6	57,977 (2.74 %)	19,583 (1.56 %)	20,581 (1.31 %)	n/a	41.82 (99.23 %)	74,464 (0.78 %)	75,598 (99.22 %)	5,607,556 (49.02 %)	440,521 (1.25 %)	13,167,657 (40.78 %)	42,869 (1.24 %)
193	Chacoan peccary (BS20 v2 2019 Broad) GCA_004024745.2	n/a	18,603 (1.52 %)	22,330 (1.36 %)	n/a	42.35 (98.12 %)	57,013 (1.80 %)	1,240,743 (98.20 %)	5,255,211 (43.27 %)	2,502,373 (4.37 %)	12,968,788 (40.96 %)	172,178 (3.66 %)
194	cheetah (Ajub_Pintada_27869175 2022) GCF_027475565.1	80,997 (4.53 %)	18,420 (1.70 %)	19,561 (1.40 %)	n/a	41.59 (100.00 %)	22 (0.00 %)	195 (100.00 %)	4,611,842 (35.10 %)	837,685 (1.68 %)	13,649,125 (33.06 %)	60,367 (2.22 %)
195	cheetah (Rico 2018) GCF_003709585.1	72,154 (3.33 %)	18,472 (1.70 %)	20,443 (1.42 %)	n/a	41.55 (99.55 %)	24,173 (0.45 %)	3,220 (100.00 %)	4,853,945 (42.85 %)	831,106 (1.53 %)	13,663,571 (32.84 %)	60,744 (2.17 %)
196	Chinese forest musk deer (Sichuan 2022) GCF_022376915.1	51,625 (2.80 %)	19,565 (1.43 %)	22,280 (1.29 %)	n/a	42.30 (99.97 %)	1,781 (0.03 %)	2,446 (100.00 %)	3,257,347 (21.65 %)	399,120 (3.81 %)	12,906,274 (43.79 %)	46,689 (1.12 %)
197	Chinese hamster (17A/GY CHO 2020) GCF_003668045.3	55,440 (2.79 %)	20,030 (1.84 %)	18,721 (1.41 %)	67,900 (3.41 %)	41.51 (99.90 %)	4,164 (0.10 %)	647 (100.00 %)	8,121,057 (33.74 %)	1,095,058 (2.91 %)	12,923,274 (32.25 %)	19,341 (0.58 %)
198	Chinese hamster (CHO v1 2011 BGI) GCF_000223135.1	46,006 (2.59 %)	20,602 (1.78 %)	17,467 (1.35 %)	n/a	41.37 (96.61 %)	156,635 (3.40 %)	265,787 (96.60 %)	4,541,936 (33.03 %)	1,072,129 (2.66 %)	13,150,189 (30.04 %)	12,522 (0.25 %)
199	Chinese hamster (CHO v2 2017 Eagle Genomics Ltd) GCA_900186095.1	n/a	19,874 (1.85 %)	19,298 (1.44 %)	n/a	41.45 (98.56 %)	63,334 (1.45 %)	71,598 (98.55 %)	4,521,726 (33.66 %)	1,060,619 (2.55 %)	12,867,288 (31.26 %)	17,960 (0.54 %)
200	Chinese hamster (CHO-K1 CHOZN v2.4 2022) GCA_026545065.1	n/a	20,293 (1.81 %)	18,881 (1.42 %)	n/a	41.62 (71.16 %)	924,541 (28.93 %)	1,236,122 (71.07 %)	4,330,728 (30.92 %)	987,319 (3.70 %)	13,374,062 (21.92 %)	18,838 (0.40 %)
201	Chinese pangolin (2020 Yunnan U) GCF_014570555.1	69,694 (3.21 %)	18,206 (1.70 %)	20,508 (1.48 %)	n/a	40.79 (95.54 %)	34,903 (4.47 %)	4,694 (100.00 %)	2,927,176 (35.60 %)	269,964 (0.67 %)	12,610,535 (29.10 %)	35,278 (1.05 %)
202	Chinese pangolin (hap1 2023 genbank) GCA_030020395.1	n/a	18,675 (1.41 %)	21,838 (1.29 %)	n/a	41.07 (99.77 %)	383 (0.23 %)	662 (100.00 %)	3,516,380 (43.45 %)	618,194 (3.68 %)	12,009,657 (39.02 %)	47,708 (1.22 %)
203	Chinese pangolin (hap1 2023 refseq) GCF_030020395.1	71,445 (2.98 %)	18,379 (1.34 %)	21,837 (1.29 %)	n/a	41.07 (99.77 %)	383 (0.23 %)	661 (100.00 %)	3,318,871 (34.65 %)	618,193 (3.68 %)	12,009,669 (39.02 %)	47,708 (1.22 %)
204	Chinese pangolin (hap2 2023) GCA_030020945.1	n/a	18,538 (1.34 %)	21,724 (1.27 %)	n/a	41.09 (99.48 %)	190 (0.52 %)	700 (100.00 %)	3,362,899 (34.48 %)	678,384 (4.11 %)	12,024,241 (39.52 %)	48,960 (1.19 %)
205	Chinese pangolin (MPE899 2014 WashU) GCA_000738955.1	n/a	18,749 (1.63 %)	22,506 (1.40 %)	n/a	40.93 (90.69 %)	257,424 (9.33 %)	230,927 (90.67 %)	2,691,116 (34.48 %)	316,518 (1.96 %)	11,538,086 (25.40 %)	30,693 (0.58 %)
206	Chinese rufous horseshoe bat GCA_001888835.1	n/a	26,871 (2.34 %)	25,467 (1.89 %)	n/a	40.52 (97.22 %)	212,601 (2.80 %)	63,439 (100.00 %)	3,219,611 (33.86 %)	495,126 (1.20 %)	12,476,551 (27.16 %)	32,993 (0.98 %)
207	Chinese rufous horseshoe bat (RSC01 2024 genbank) GCA_036562045.1	n/a	17,893 (1.95 %)	19,249 (1.60 %)	n/a	40.47 (100.00 %)	286 (0.00 %)	454 (100.00 %)	3,055,304 (33.11 %)	531,106 (1.34 %)	11,858,144 (29.52 %)	30,884 (1.08 %)
208	Chinese rufous horseshoe bat (RSC01 2024 refseq) GCF_036562045.2	67,162 (3.87 %)	17,890 (1.94 %)	19,248 (1.60 %)	n/a	40.47 (100.00 %)	286 (0.00 %)	454 (100.00 %)	3,325,750 (39.02 %)	531,106 (1.34 %)	11,858,028 (29.52 %)	30,884 (1.08 %)
209	Chinese tree shrew (2013 BGI) GCF_000334495.1	47,005 (2.07 %)	21,375 (1.39 %)	19,231 (1.28 %)	n/a	41.73 (95.10 %)	191,695 (4.92 %)	242,445 (95.08 %)	5,060,321 (23.05 %)	1,046,388 (4.15 %)	14,978,259 (38.04 %)	88,806 (1.44 %)
210	Chinese tree shrew (KIZ-2021 2023) GCA_033439345.1	n/a	22,218 (1.55 %)	22,364 (1.36 %)	n/a	41.78 (99.99 %)	1,697 (0.01 %)	1,645 (100.00 %)	6,126,341 (42.08 %)	1,035,957 (2.47 %)	14,328,193 (41.14 %)	90,914 (1.82 %)
211	Chiriquinan serotine (hap1 2025) GCA_054100705.1	n/a	17,992 (1.72 %)	21,541 (1.60 %)	n/a	43.57 (100.00 %)	319 (0.00 %)	133 (100.00 %)	5,339,985 (49.93 %)	956,399 (6.53 %)	10,659,420 (39.61 %)	80,046 (3.68 %)
212	Chiriquinan serotine (hap2 2025) GCA_054099605.1	n/a	17,252 (1.79 %)	20,347 (1.66 %)	n/a	43.70 (100.00 %)	267 (0.00 %)	112 (100.00 %)	4,920,908 (48.27 %)	859,047 (6.45 %)	9,871,329 (38.13 %)	75,180 (3.74 %)
213	chiru GCA_000400835.1	n/a	20,320 (1.60 %)	42,654 (2.51 %)	n/a	42.01 (93.04 %)	283,069 (7.00 %)	298,127 (93.00 %)	5,342,241 (43.54 %)	425,329 (1.25 %)	13,714,420 (34.66 %)	43,135 (1.89 %)
214	clouded leopard (mNeoNeb1 alternate hap 2023) GCA_028018655.1	n/a	16,430 (1.52 %)	21,057 (1.44 %)	n/a	41.79 (100.00 %)	n/a	10,377 (100.00 %)	3,845,437 (33.39 %)	794,587 (2.14 %)	10,765,695 (33.40 %)	56,375 (2.45 %)
215	clouded leopard (mNeoNeb1 primary hap 2023 refseq) GCF_028018385.1	81,219 (3.62 %)	18,300 (1.65 %)	20,361 (1.39 %)	n/a	41.79 (99.94 %)	181 (0.06 %)	33 (100.00 %)	4,224,269 (34.84 %)	992,668 (2.08 %)	13,618,866 (34.42 %)	67,830 (2.45 %)
216	common bottlenose dolphin (maternal 2020) GCA_011762535.1	n/a	18,837 (1.77 %)	20,857 (1.43 %)	n/a	41.43 (99.73 %)	649 (0.27 %)	985 (100.00 %)	4,073,893 (46.15 %)	630,039 (2.15 %)	12,628,219 (35.41 %)	65,379 (1.89 %)
217	common bottlenose dolphin (maternal hap 2024) GCA_011762595.2	n/a	18,777 (1.77 %)	20,526 (1.42 %)	n/a	41.44 (99.74 %)	674 (0.26 %)	362 (100.00 %)	4,064,487 (44.85 %)	628,982 (2.12 %)	12,490,633 (35.29 %)	65,551 (1.90 %)
218	common bottlenose dolphin (maternal Y refseq 2020) GCF_011762595.1	67,220 (3.31 %)	18,766 (1.77 %)	20,528 (1.42 %)	35,852 (1.58 %)	41.44 (99.74 %)	674 (0.26 %)	362 (100.00 %)	4,069,115 (46.17 %)	628,982 (2.12 %)	12,490,891 (35.29 %)	65,551 (1.90 %)
219	common bottlenose dolphin (MMES2002162SC 2016 refseq) GCF_001922835.1	45,975 (2.99 %)	17,255 (1.69 %)	17,058 (1.34 %)	n/a	40.85 (99.45 %)	114,003 (0.57 %)	2,648 (100.00 %)	3,845,938 (43.89 %)	514,631 (1.06 %)	12,317,098 (32.18 %)	48,030 (1.35 %)
220	common bottlenose dolphin (mTurTru1 2024) GCF_011762595.2	80,385 (4.33 %)	18,770 (1.77 %)	20,525 (1.42 %)	n/a	41.44 (99.74 %)	674 (0.26 %)	361 (100.00 %)	3,981,744 (44.78 %)	628,982 (2.12 %)	12,490,558 (35.29 %)	65,551 (1.90 %)
221	common bottlenose dolphin (paternal 2020) GCA_011762515.1	n/a	18,537 (1.77 %)	20,619 (1.44 %)	n/a	41.42 (98.08 %)	868 (1.92 %)	1,166 (100.00 %)	3,997,801 (45.93 %)	609,838 (1.85 %)	12,400,272 (34.53 %)	64,630 (1.84 %)
222	common brushtail (alternate hap 2020) GCA_011100645.1	n/a	14,863 (0.75 %)	15,426 (0.89 %)	n/a	39.41 (100.00 %)	313 (0.00 %)	12,446 (100.00 %)	5,846,769 (38.56 %)	987,917 (1.99 %)	16,764,356 (40.14 %)	13,303 (0.35 %)
223	common brushtail (refseq 2020) GCF_011100635.1	37,661 (1.80 %)	18,653 (0.80 %)	15,375 (0.86 %)	n/a	39.48 (99.44 %)	1,796 (0.56 %)	212 (100.00 %)	7,598,116 (38.90 %)	1,259,434 (1.97 %)	22,071,306 (40.56 %)	17,762 (0.38 %)
224	common dormouse GCF_963383645.1	31,384 (1.35 %)	18,619 (1.42 %)	22,414 (1.38 %)	n/a	41.73 (99.99 %)	1,805 (0.01 %)	2,017 (99.99 %)	6,589,540 (42.09 %)	1,593,656 (4.46 %)	12,228,695 (43.98 %)	71,058 (1.88 %)
225	common pipistrelle (2020) GCA_903992545.1	n/a	17,216 (1.82 %)	19,202 (1.79 %)	n/a	42.55 (99.97 %)	1,546 (0.03 %)	323 (100.00 %)	2,953,532 (23.94 %)	805,142 (2.83 %)	9,964,846 (34.69 %)	57,295 (2.83 %)
226	common pipistrelle (alternate hap 2020) GCA_903992515.1	n/a	15,974 (1.72 %)	20,563 (1.66 %)	n/a	42.41 (100.00 %)	12 (0.00 %)	10,459 (100.00 %)	2,634,333 (23.76 %)	703,674 (2.65 %)	8,909,525 (33.95 %)	50,430 (2.54 %)
227	common pipistrelle (Broad 2019) GCA_004026625.1	n/a	21,938 (1.35 %)	53,915 (1.60 %)	n/a	42.88 (99.88 %)	10,870 (0.05 %)	736,974 (99.95 %)	3,499,501 (22.91 %)	1,046,301 (2.96 %)	11,759,516 (37.96 %)	92,062 (3.23 %)
228	common pipistrelle (hap1.1 2025) GCA_965203405.1	n/a	18,233 (1.77 %)	21,445 (1.80 %)	n/a	42.93 (99.98 %)	1,650 (0.02 %)	575 (100.00 %)	3,324,262 (26.83 %)	869,167 (7.44 %)	10,218,519 (37.91 %)	76,006 (3.29 %)
229	common pipistrelle (hap1.2 2025) GCA_965203405.2	n/a	18,176 (1.76 %)	21,285 (1.78 %)	n/a	42.95 (100.00 %)	370 (0.00 %)	254 (100.00 %)	3,357,975 (26.71 %)	873,676 (8.26 %)	10,088,614 (38.25 %)	78,890 (3.25 %)
230	common pipistrelle (hap2.1 2025) GCA_965204225.1	n/a	18,115 (1.81 %)	21,233 (1.83 %)	n/a	42.89 (99.98 %)	1,602 (0.02 %)	1,971 (99.98 %)	3,303,323 (27.28 %)	852,756 (5.65 %)	10,047,424 (36.41 %)	69,105 (3.25 %)
231	common pipistrelle (hap2.2 2025) GCA_965204225.2	n/a	18,092 (1.83 %)	21,286 (1.85 %)	n/a	42.90 (100.00 %)	358 (0.00 %)	656 (100.00 %)	3,325,603 (27.55 %)	851,200 (4.82 %)	10,152,156 (36.08 %)	66,359 (3.22 %)
232	common thicket rat (MVZ Mamm 221001 2021) GCA_019843835.1	n/a	25,148 (1.36 %)	49,594 (1.08 %)	n/a	41.11 (99.52 %)	63,300 (0.44 %)	572,372 (99.56 %)	3,806,717 (32.04 %)	1,181,694 (2.86 %)	12,272,340 (28.58 %)	16,373 (0.48 %)
233	common vampire bat (v2 HL8 alternate hap 2022 genbank) GCA_022682395.2	n/a	17,485 (1.76 %)	18,907 (1.66 %)	n/a	42.87 (99.99 %)	576 (0.01 %)	429 (100.00 %)	2,592,246 (28.20 %)	352,985 (2.87 %)	10,737,944 (31.11 %)	61,125 (2.28 %)
234	common vampire bat (v2 HL8 primary hap 2022 refseq) GCF_022682495.2	58,786 (3.38 %)	18,507 (1.82 %)	19,451 (1.59 %)	n/a	42.99 (99.99 %)	615 (0.01 %)	574 (100.00 %)	2,960,602 (36.90 %)	431,577 (3.90 %)	11,286,753 (32.62 %)	71,507 (2.50 %)
235	common vampire bat (v3 DRU21DN04 2018) GCF_002940915.2	51,044 (3.24 %)	18,503 (1.88 %)	18,071 (1.68 %)	n/a	42.15 (97.78 %)	54,246 (2.23 %)	83,364 (97.77 %)	2,799,509 (29.62 %)	275,242 (1.03 %)	11,796,826 (28.19 %)	51,634 (1.37 %)
236	common warthog (WHEZ1 2021) GCF_016906955.1	55,156 (2.64 %)	18,264 (1.56 %)	19,251 (1.34 %)	54,816 (2.83 %)	41.95 (99.61 %)	523 (0.39 %)	194 (100.00 %)	3,898,243 (30.33 %)	588,742 (1.17 %)	12,955,929 (36.44 %)	75,592 (1.86 %)
237	common wombat GCF_900497805.2	46,365 (1.78 %)	19,437 (0.86 %)	18,947 (0.96 %)	n/a	38.86 (99.68 %)	67,461 (0.33 %)	14,183 (100.00 %)	8,645,969 (41.99 %)	1,203,246 (1.61 %)	23,878,215 (39.11 %)	18,752 (0.37 %)
238	Corsac fox (zsh2022 2023) GCA_030463245.1	n/a	19,527 (1.61 %)	18,923 (1.35 %)	n/a	41.24 (100.00 %)	107 (0.00 %)	202 (100.00 %)	4,435,406 (32.05 %)	981,019 (1.98 %)	13,673,245 (32.65 %)	49,252 (2.20 %)
239	cotton mouse (hap1 2026) GCA_057877385.1	n/a	19,246 (1.53 %)	21,031 (1.33 %)	n/a	42.08 (100.00 %)	109 (0.00 %)	464 (100.00 %)	7,290,342 (52.57 %)	1,324,779 (10.83 %)	13,875,877 (39.90 %)	24,010 (0.68 %)
240	cotton mouse (hap2 2026) GCA_057877455.1	n/a	18,393 (1.64 %)	19,527 (1.40 %)	n/a	42.37 (100.00 %)	78 (0.00 %)	197 (100.00 %)	6,785,800 (49.24 %)	1,222,530 (8.19 %)	13,058,217 (36.83 %)	22,704 (0.69 %)
241	coyote (coyote_06102 2023) GCA_034620425.1	n/a	19,251 (1.60 %)	19,585 (1.40 %)	n/a	41.18 (100.00 %)	93 (0.00 %)	120 (100.00 %)	4,493,000 (32.28 %)	982,814 (2.01 %)	13,803,318 (33.09 %)	50,777 (2.23 %)
242	creeping vole GCF_018167655.1	54,941 (2.31 %)	23,033 (1.55 %)	25,427 (1.53 %)	n/a	44.23 (100.00 %)	n/a	2,147 (100.00 %)	4,549,519 (25.66 %)	1,153,429 (13.60 %)	13,568,297 (40.65 %)	23,141 (0.54 %)
243	crested porcupine GCA_004026905.1	n/a	21,005 (1.32 %)	35,975 (1.39 %)	n/a	41.51 (99.89 %)	4,351 (0.02 %)	1,140,949 (99.98 %)	4,303,147 (30.69 %)	600,488 (1.19 %)	14,049,490 (33.80 %)	57,196 (1.33 %)
244	crested rat (2021) GCA_907164525.1	n/a	18,829 (1.57 %)	20,084 (1.23 %)	n/a	40.89 (92.16 %)	116,236 (7.85 %)	153,441 (92.15 %)	6,937,911 (48.56 %)	1,051,397 (2.16 %)	13,178,644 (37.15 %)	22,912 (0.47 %)
245	Crete spiny mouse (2024) GCA_964271855.1	n/a	19,467 (1.76 %)	18,734 (1.43 %)	n/a	42.87 (100.00 %)	184 (0.00 %)	113 (100.00 %)	4,718,848 (32.83 %)	1,327,449 (6.80 %)	12,893,458 (34.03 %)	21,236 (0.61 %)
246	Crete spiny mouse (2025 genbank) GCA_964271855.5	n/a	19,050 (1.82 %)	18,719 (1.43 %)	n/a	42.87 (100.00 %)	184 (0.00 %)	112 (100.00 %)	5,710,100 (41.99 %)	1,327,449 (6.80 %)	12,893,310 (34.03 %)	21,236 (0.61 %)
247	Crete spiny mouse (2025 refseq) GCF_964271855.1	66,570 (3.41 %)	19,050 (1.82 %)	18,721 (1.43 %)	n/a	42.87 (100.00 %)	184 (0.00 %)	112 (100.00 %)	5,710,100 (41.99 %)	1,327,449 (6.80 %)	12,893,309 (34.03 %)	21,236 (0.61 %)
248	Cucacao Myotis (hap1 2026) GCA_054855985.1	n/a	18,818 (1.71 %)	22,379 (1.61 %)	n/a	42.79 (100.00 %)	173 (0.00 %)	193 (100.00 %)	5,262,057 (49.88 %)	855,921 (7.52 %)	10,259,960 (40.77 %)	65,544 (2.34 %)
249	Cucacao Myotis (hap2 2026) GCA_054855975.1	n/a	17,661 (1.79 %)	20,358 (1.64 %)	n/a	42.80 (100.00 %)	174 (0.00 %)	150 (100.00 %)	4,786,224 (48.01 %)	751,852 (6.76 %)	9,699,043 (38.95 %)	57,353 (2.24 %)
250	Cuvier's beaked whale GCA_004364475.1	n/a	23,700 (0.90 %)	51,715 (0.86 %)	n/a	42.01 (99.76 %)	3,229 (0.01 %)	3,761,505 (99.99 %)	6,544,424 (43.61 %)	1,417,186 (3.11 %)	16,127,873 (42.25 %)	68,668 (1.15 %)
251	cyclops roundleaf bat (Cote d'Ivoire 20210929_DDa alternate hap 2024) GCA_043880225.1	n/a	18,335 (1.64 %)	20,207 (1.46 %)	n/a	41.56 (100.00 %)	n/a	1,440 (100.00 %)	4,675,929 (43.51 %)	742,038 (2.58 %)	11,746,853 (36.11 %)	47,949 (1.04 %)
252	cyclops roundleaf bat (Cote d'Ivoire 20210929_DDa primary hap 2024) GCA_043880285.1	n/a	18,610 (1.67 %)	19,098 (1.39 %)	n/a	41.56 (99.99 %)	334 (0.01 %)	73 (100.00 %)	4,077,286 (41.85 %)	754,689 (2.64 %)	11,873,386 (36.16 %)	48,137 (1.04 %)
253	Damara mole-rat DMR 1.0 (2014 BGI) GCF_000743615.1	52,373 (2.57 %)	17,983 (1.45 %)	17,063 (1.43 %)	n/a	40.34 (97.96 %)	87,815 (2.05 %)	162,545 (97.95 %)	4,053,433 (30.86 %)	545,281 (1.74 %)	13,406,483 (30.65 %)	37,008 (0.74 %)
254	Damara mole-rat DMR 1.0 HiC (2020 DNA Zoo) GCF_012274545.1	58,091 (2.74 %)	17,780 (1.44 %)	16,515 (1.42 %)	n/a	40.34 (97.94 %)	88,899 (2.07 %)	73,970 (100.00 %)	4,035,140 (30.95 %)	544,772 (1.73 %)	13,390,872 (30.61 %)	37,008 (0.74 %)
255	Darling's horseshoe bat (hap1 2026) GCA_057427945.1	n/a	18,798 (1.86 %)	20,919 (1.64 %)	n/a	40.67 (100.00 %)	59 (0.00 %)	223 (100.00 %)	3,581,848 (41.00 %)	560,680 (2.97 %)	12,112,526 (30.87 %)	34,026 (1.18 %)
256	Darling's horseshoe bat (hap2 2026) GCA_057428265.1	n/a	17,853 (1.82 %)	19,924 (1.60 %)	n/a	41.00 (100.00 %)	104 (0.00 %)	822 (100.00 %)	3,352,243 (43.10 %)	530,397 (7.87 %)	11,337,379 (33.03 %)	32,081 (1.08 %)
257	dassie-rat GCA_004026965.1	n/a	20,479 (1.16 %)	42,937 (1.41 %)	n/a	41.86 (99.89 %)	9,645 (0.04 %)	920,324 (99.96 %)	4,563,054 (28.83 %)	660,623 (1.92 %)	12,899,807 (34.48 %)	46,569 (1.25 %)
258	Daubenton's bat (alternate hap 2023) GCA_963242275.1	n/a	18,895 (1.78 %)	24,235 (1.81 %)	n/a	43.39 (100.00 %)	n/a	4,930 (100.00 %)	2,813,870 (23.75 %)	718,406 (5.18 %)	9,977,320 (37.24 %)	62,910 (2.66 %)
259	Daubenton's bat (hap1.2 2025) GCA_963259705.2	n/a	19,016 (1.77 %)	22,392 (1.66 %)	n/a	43.17 (100.00 %)	219 (0.00 %)	176 (100.00 %)	5,102,002 (45.10 %)	815,584 (6.94 %)	10,416,086 (39.34 %)	66,271 (2.56 %)
260	Daubenton's bat (hap2.2 2025) GCA_963242275.2	n/a	18,127 (1.87 %)	21,346 (1.75 %)	n/a	43.37 (100.00 %)	136 (0.00 %)	208 (100.00 %)	4,712,850 (43.86 %)	726,883 (5.33 %)	9,942,977 (37.29 %)	62,442 (2.66 %)
261	Daubenton's bat (primary hap 2023 refseq) GCF_963259705.1	64,558 (3.32 %)	19,141 (1.72 %)	22,133 (1.66 %)	n/a	43.18 (99.99 %)	1,099 (0.01 %)	121 (100.00 %)	3,040,232 (24.03 %)	796,911 (6.38 %)	10,478,180 (38.84 %)	64,920 (2.51 %)
262	Daurian ground squirrel GCA_002406435.1	n/a	20,990 (1.31 %)	17,575 (1.17 %)	n/a	39.77 (96.15 %)	141,850 (3.84 %)	502,654 (96.16 %)	5,783,538 (34.36 %)	924,038 (3.73 %)	17,533,301 (30.85 %)	27,955 (0.39 %)
263	David's myotis bat GCF_000327345.1	37,645 (2.70 %)	18,744 (1.78 %)	17,565 (1.62 %)	n/a	42.69 (91.23 %)	223,511 (8.80 %)	325,280 (91.20 %)	2,680,166 (23.79 %)	532,273 (1.90 %)	11,016,028 (29.55 %)	59,615 (1.59 %)
264	Davis's round-eared bat (hap1 2025) GCA_051307075.1	n/a	17,736 (1.53 %)	21,703 (1.45 %)	n/a	42.03 (100.00 %)	153 (0.00 %)	311 (100.00 %)	4,450,174 (45.25 %)	390,322 (7.86 %)	12,108,244 (37.90 %)	76,695 (4.57 %)
265	Davis's round-eared bat (hap2 2025) GCA_051307065.1	n/a	16,878 (1.65 %)	20,512 (1.56 %)	n/a	42.17 (100.00 %)	113 (0.00 %)	148 (100.00 %)	3,720,522 (43.45 %)	352,035 (4.96 %)	11,326,247 (34.44 %)	72,242 (4.65 %)
266	degu (3935 2012 refseq) GCF_000260255.1	48,165 (2.13 %)	22,242 (1.41 %)	22,101 (1.46 %)	n/a	41.38 (84.36 %)	252,772 (15.68 %)	259,904 (84.32 %)	4,901,673 (27.74 %)	898,945 (1.50 %)	14,282,003 (29.30 %)	40,135 (0.82 %)
267	desert hamster (2022) GCF_943737965.1	37,291 (2.11 %)	19,744 (1.74 %)	20,215 (1.50 %)	n/a	41.31 (100.00 %)	n/a	2,079 (100.00 %)	4,038,079 (31.01 %)	1,132,871 (2.71 %)	11,946,112 (32.62 %)	17,053 (0.51 %)
268	Desmarest's hutia GCA_004027915.1	n/a	23,535 (0.78 %)	50,796 (0.95 %)	n/a	42.03 (99.83 %)	3,492 (0.01 %)	2,355,850 (99.99 %)	5,790,506 (26.72 %)	1,062,134 (1.71 %)	16,977,224 (35.29 %)	54,479 (1.01 %)
269	dingo (2020 Alpine COOINDA U.NSW) GCF_012295265.1	102,060 (4.04 %)	19,777 (1.69 %)	20,341 (1.41 %)	n/a	41.29 (99.69 %)	325 (0.31 %)	477 (100.00 %)	4,950,808 (42.83 %)	1,033,921 (2.36 %)	13,745,703 (33.32 %)	51,835 (2.25 %)
270	dingo (Sandy 2020 James Cook U) GCF_003254725.2	104,332 (4.50 %)	19,710 (1.72 %)	19,857 (1.42 %)	n/a	41.24 (100.00 %)	69 (0.00 %)	159 (100.00 %)	4,547,906 (33.32 %)	993,474 (2.19 %)	13,701,060 (33.18 %)	51,216 (2.28 %)
271	dog (Basenji MU ID 185726 2019) GCA_004886185.2	n/a	19,889 (1.67 %)	20,501 (1.39 %)	n/a	41.36 (99.99 %)	1,388 (0.01 %)	3,630 (99.99 %)	4,950,227 (43.32 %)	1,059,639 (2.97 %)	13,694,849 (33.70 %)	51,443 (2.16 %)
272	dog (Basenji UNSW-BAS-2019 2021) GCA_013276365.2	n/a	19,310 (1.60 %)	19,947 (1.42 %)	n/a	41.21 (100.00 %)	149 (0.00 %)	631 (100.00 %)	4,452,916 (32.14 %)	960,590 (2.23 %)	13,685,353 (33.01 %)	50,715 (2.22 %)
273	dog (Bernese Mountain Dog BD 2023) GCA_031010765.1	n/a	19,211 (1.60 %)	20,327 (1.44 %)	n/a	41.20 (100.00 %)	641 (0.00 %)	175 (100.00 %)	4,471,016 (32.18 %)	984,776 (2.03 %)	13,719,474 (32.88 %)	51,050 (2.25 %)
274	dog (Bernese Mountain Dog OD 2023) GCA_031010635.1	n/a	19,279 (1.60 %)	20,348 (1.44 %)	n/a	41.21 (100.00 %)	1,015 (0.00 %)	159 (100.00 %)	4,491,081 (32.21 %)	996,142 (2.01 %)	13,761,195 (32.97 %)	51,490 (2.25 %)
275	dog (boxer Tasha 2011) GCF_000002285.3	82,536 (3.63 %)	19,772 (1.66 %)	19,565 (1.39 %)	n/a	41.31 (99.25 %)	23,876 (0.76 %)	27,106 (99.24 %)	4,918,098 (43.29 %)	991,835 (2.81 %)	13,644,959 (33.60 %)	53,269 (2.07 %)
276	dog (boxer Tasha 2020) GCF_000002285.5	93,761 (3.84 %)	19,392 (1.71 %)	19,572 (1.42 %)	52,141 (3.27 %)	41.26 (100.00 %)	1,028 (0.00 %)	147 (100.00 %)	23,927,903 (42.42 %)	972,851 (2.05 %)	13,611,845 (33.11 %)	50,679 (2.26 %)
277	dog (Cairn Terrier CA611 2023) GCA_031010295.1	n/a	19,255 (1.61 %)	20,479 (1.45 %)	n/a	41.19 (100.00 %)	262 (0.00 %)	141 (100.00 %)	4,490,019 (32.25 %)	989,383 (1.99 %)	13,710,808 (32.97 %)	50,883 (2.22 %)
278	dog (German shepard Mischka 2020) GCF_011100685.1	96,734 (3.71 %)	20,135 (1.64 %)	20,871 (1.38 %)	56,772 (3.19 %)	41.50 (100.00 %)	585 (0.00 %)	2,782 (100.00 %)	20,264,827 (43.87 %)	1,152,879 (3.22 %)	13,784,690 (34.30 %)	53,518 (2.23 %)
279	dog (German Shepherd Nala 2020) GCA_008641055.3	n/a	19,757 (1.69 %)	20,201 (1.41 %)	n/a	41.32 (99.74 %)	458 (0.26 %)	410 (100.00 %)	4,974,233 (43.03 %)	1,048,366 (2.46 %)	13,881,889 (33.61 %)	51,900 (2.21 %)
280	dog (Labrador retriever 2023) GCA_031165255.1	n/a	19,256 (1.61 %)	20,247 (1.44 %)	n/a	41.18 (100.00 %)	516 (0.00 %)	675 (100.00 %)	4,456,220 (32.19 %)	960,584 (1.96 %)	13,688,006 (32.82 %)	50,670 (2.21 %)
281	dog (labrador SID07034 2020) GCF_014441545.1	99,420 (3.87 %)	19,870 (1.70 %)	20,252 (1.41 %)	54,322 (3.23 %)	41.19 (99.47 %)	575 (0.53 %)	376 (100.00 %)	4,981,985 (42.28 %)	1,019,772 (1.97 %)	13,959,750 (32.77 %)	52,469 (2.25 %)
282	dog (poodle 2003) GCA_000181415.1	n/a	12,852 (0.53 %)	24,666 (0.57 %)	n/a	41.09 (99.86 %)	n/a	1,089,636 (100.00 %)	3,212,912 (39.08 %)	549,098 (1.63 %)	8,833,799 (29.80 %)	41,068 (1.31 %)
283	domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2017 WashU) GCF_000181335.3	72,076 (3.30 %)	18,662 (1.64 %)	20,897 (1.37 %)	n/a	41.73 (98.20 %)	436 (1.80 %)	5,079 (98.20 %)	5,086,462 (43.51 %)	964,126 (2.68 %)	13,947,871 (33.33 %)	69,701 (2.41 %)
284	domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2021 WashU) GCA_000181335.5	n/a	18,378 (1.53 %)	21,242 (1.40 %)	n/a	41.73 (98.21 %)	422 (1.79 %)	5,010 (98.31 %)	4,683,703 (33.33 %)	964,129 (2.68 %)	13,948,305 (33.33 %)	69,725 (2.42 %)
285	domestic cat (Abyssinian Cinnamon 2021) GCA_000181335.6	n/a	18,357 (1.55 %)	20,085 (1.38 %)	n/a	41.76 (98.18 %)	422 (1.82 %)	1,254 (98.28 %)	4,661,997 (33.78 %)	947,221 (2.58 %)	13,867,949 (33.67 %)	68,011 (2.41 %)
286	domestic cat (Fca126 2021 Texas A&M U) GCF_018350175.1	99,222 (4.40 %)	18,456 (1.66 %)	19,833 (1.39 %)	94,133 (5.63 %)	41.81 (100.00 %)	39 (0.00 %)	102 (100.00 %)	4,965,571 (43.65 %)	932,424 (1.95 %)	13,596,808 (33.85 %)	67,329 (2.48 %)
287	domestic cattle (Mongolian 80415 2024) GCA_043882115.1	n/a	19,213 (1.34 %)	21,950 (1.20 %)	n/a	43.41 (100.00 %)	8 (0.00 %)	46 (100.00 %)	6,723,585 (53.11 %)	1,123,913 (13.40 %)	12,798,664 (48.31 %)	85,793 (6.20 %)
288	domestic cattle (Tuli MAZUNGA 2024) GCA_040285425.1	n/a	19,454 (1.36 %)	22,081 (1.21 %)	n/a	44.04 (99.98 %)	31 (0.02 %)	878 (100.00 %)	6,506,177 (50.93 %)	1,038,848 (13.71 %)	11,547,434 (49.22 %)	84,199 (8.81 %)
289	domestic cattle (Wagyu 3DWFS0412 2024) GCA_040286185.1	n/a	19,252 (1.32 %)	22,269 (1.20 %)	n/a	43.83 (99.96 %)	17 (0.04 %)	407 (99.99 %)	6,783,665 (51.29 %)	1,072,289 (13.17 %)	12,697,022 (49.18 %)	89,666 (8.32 %)
290	domestic ferret (JIRA1106 JCVI 2020) GCF_011764305.1	68,868 (3.09 %)	19,019 (1.55 %)	21,812 (1.42 %)	n/a	41.90 (100.00 %)	n/a	1,224 (100.00 %)	4,650,028 (39.49 %)	745,115 (2.02 %)	13,758,447 (36.14 %)	58,684 (2.16 %)
291	domestic ferret (Sable 2011 Broad) GCA_000239315.1	n/a	18,778 (1.67 %)	19,571 (1.47 %)	n/a	41.48 (96.89 %)	72,670 (3.12 %)	76,914 (96.88 %)	4,491,876 (40.13 %)	618,556 (1.07 %)	13,721,938 (31.04 %)	54,600 (1.94 %)
292	domestic guinea pig (051 PalLab524CR 2023) GCF_034190915.1	79,333 (3.55 %)	17,999 (1.09 %)	21,509 (1.20 %)	n/a	40.64 (100.00 %)	84 (0.00 %)	672 (100.00 %)	5,037,431 (41.68 %)	886,785 (13.97 %)	14,620,284 (42.71 %)	39,682 (0.89 %)
293	domestic guinea pig (2N 2008 refseq) GCF_000151735.1	44,762 (2.31 %)	18,301 (1.33 %)	20,111 (1.34 %)	n/a	39.95 (97.81 %)	58,460 (2.20 %)	61,604 (97.80 %)	4,257,852 (38.85 %)	658,533 (1.25 %)	14,547,726 (34.19 %)	37,093 (0.85 %)
294	domestic yak (maiwa yakHY00 2019) GCA_005887515.3	n/a	18,672 (1.39 %)	19,408 (1.24 %)	n/a	41.97 (100.00 %)	646 (0.00 %)	343 (100.00 %)	3,570,978 (23.00 %)	583,762 (8.57 %)	14,055,227 (40.52 %)	43,883 (1.17 %)
295	domestic yak (Pamir PY7600 2026) GCF_055505025.1	139,812 (4.26 %)	19,009 (1.56 %)	21,215 (1.34 %)	n/a	41.90 (100.00 %)	2 (0.00 %)	31 (100.00 %)	6,364,775 (50.31 %)	452,332 (1.58 %)	12,984,103 (41.16 %)	41,459 (1.23 %)
296	dugong (hap1 mDugDug1 2023) GCA_030035585.1	n/a	18,354 (1.22 %)	20,434 (1.08 %)	n/a	40.65 (100.00 %)	96 (0.00 %)	198 (100.00 %)	4,458,084 (33.00 %)	444,499 (1.79 %)	15,031,940 (47.42 %)	29,863 (0.83 %)
297	dugong (hap2 mDugDug1 2023) GCA_030020955.1	n/a	18,538 (1.23 %)	20,775 (1.09 %)	n/a	40.64 (100.00 %)	89 (0.00 %)	167 (100.00 %)	4,455,227 (33.01 %)	444,021 (1.73 %)	14,946,847 (47.37 %)	29,828 (0.79 %)
298	dwarf bonneted bat (hap1 2026) GCA_058972175.1	n/a	19,701 (1.66 %)	22,894 (1.55 %)	n/a	42.94 (100.00 %)	91 (0.00 %)	159 (100.00 %)	4,868,188 (46.76 %)	814,580 (2.65 %)	11,250,323 (40.87 %)	94,798 (3.08 %)
299	dwarf bonneted bat (hap2 2026) GCA_058971805.1	n/a	19,646 (1.68 %)	22,856 (1.56 %)	n/a	42.89 (100.00 %)	112 (0.00 %)	114 (100.00 %)	4,830,940 (46.92 %)	798,083 (2.59 %)	11,230,678 (40.34 %)	94,036 (3.05 %)
300	dwarf fruit-eating bat (hap1 2025) GCA_051107565.1	n/a	17,834 (1.67 %)	19,738 (1.55 %)	n/a	42.25 (100.00 %)	77 (0.00 %)	106 (100.00 %)	3,731,962 (43.43 %)	377,985 (3.87 %)	11,915,741 (34.43 %)	72,159 (2.56 %)
301	dwarf fruit-eating bat (hap2 2025) GCA_051107595.1	n/a	16,790 (1.71 %)	18,246 (1.55 %)	n/a	42.24 (100.00 %)	43 (0.00 %)	102 (100.00 %)	3,412,455 (42.90 %)	339,875 (3.98 %)	10,947,746 (33.73 %)	65,083 (2.56 %)
302	dwarf mongoose GCA_004023845.1	n/a	21,478 (1.57 %)	32,174 (1.43 %)	n/a	41.83 (99.94 %)	10,815 (0.05 %)	200,185 (99.95 %)	4,574,991 (40.34 %)	595,520 (1.11 %)	13,720,585 (32.94 %)	70,689 (2.42 %)
303	eastern cottontail (primary hap 2023) GCA_949820135.1	n/a	18,522 (1.26 %)	22,314 (1.28 %)	n/a	43.69 (100.00 %)	316 (0.00 %)	99 (100.00 %)	3,699,683 (20.55 %)	935,350 (11.22 %)	13,112,318 (44.07 %)	99,224 (2.27 %)
304	eastern European house mouse (PWK_PhJ v2 2022) GCA_921998335.2	n/a	21,903 (2.13 %)	19,801 (1.40 %)	108,675 (4.42 %)	41.79 (99.89 %)	207 (0.11 %)	211 (100.00 %)	4,630,645 (40.56 %)	1,531,506 (3.70 %)	13,011,312 (35.48 %)	22,270 (0.54 %)
305	eastern mole GCA_004024925.1	n/a	19,631 (1.57 %)	32,414 (1.63 %)	n/a	42.02 (99.91 %)	7,239 (0.03 %)	647,535 (99.97 %)	3,145,725 (29.42 %)	554,620 (1.75 %)	10,663,504 (32.88 %)	55,063 (3.69 %)
306	eastern quoll GCA_020854095.1	n/a	15,715 (0.80 %)	16,750 (0.93 %)	n/a	36.19 (100.00 %)	431 (0.00 %)	76 (100.00 %)	5,256,999 (24.81 %)	1,280,160 (3.39 %)	21,362,866 (41.74 %)	24,508 (0.70 %)
307	eastern spiny mouse (2021) GCA_907164435.1	n/a	20,397 (1.93 %)	20,515 (1.44 %)	n/a	42.68 (98.12 %)	109,220 (1.90 %)	19,837 (99.90 %)	4,701,702 (33.98 %)	1,304,933 (2.91 %)	13,145,044 (31.05 %)	19,636 (0.56 %)
308	eastern woodrat (hap1 2025) GCA_050000055.1	n/a	19,460 (1.37 %)	22,249 (1.25 %)	n/a	40.82 (100.00 %)	154 (0.00 %)	1,382 (100.00 %)	7,741,791 (54.00 %)	2,194,305 (10.09 %)	13,803,906 (42.49 %)	22,114 (0.48 %)
309	eastern woodrat (hap2 2025) GCA_050000045.1	n/a	18,460 (1.50 %)	21,237 (1.36 %)	n/a	41.08 (100.00 %)	154 (0.00 %)	942 (100.00 %)	6,975,151 (51.59 %)	1,843,248 (8.41 %)	12,873,831 (39.03 %)	20,366 (0.52 %)
310	Egyptian mouse-tailed bat (hap1 2026) GCA_055761895.1	n/a	18,826 (1.25 %)	22,031 (1.11 %)	n/a	n/a	138 (0.00 %)	480 (100.00 %)	6,715,452 (42.48 %)	811,788 (12.04 %)	12,723,358 (51.17 %)	304,837 (3.40 %)
311	Egyptian rousette (1219 2016 Boston U) GCF_001466805.2	54,791 (4.93 %)	18,221 (2.05 %)	24,192 (1.88 %)	46,601 (2.22 %)	40.02 (99.97 %)	638 (0.03 %)	2,490 (100.00 %)	2,815,693 (32.23 %)	440,119 (1.01 %)	12,346,041 (26.86 %)	56,244 (6.54 %)
312	Egyptian rousette (primary hap 2025) GCA_014176215.2	n/a	17,319 (2.06 %)	22,433 (1.85 %)	n/a	40.05 (98.63 %)	250 (1.37 %)	27 (100.00 %)	3,010,528 (35.56 %)	434,429 (1.02 %)	12,031,135 (26.53 %)	53,517 (6.74 %)
313	Egyptian rousette (v1 2020 refseq) GCF_014176215.1	65,163 (4.76 %)	17,642 (2.07 %)	22,317 (1.84 %)	n/a	40.05 (98.59 %)	242 (1.41 %)	29 (100.00 %)	2,821,248 (33.05 %)	434,414 (1.02 %)	12,031,597 (26.52 %)	53,573 (4.84 %)
314	Egyptian spiny mouse (US019 2019) GCA_004027535.1	n/a	23,498 (1.69 %)	36,970 (1.40 %)	30,076 (1.58 %)	42.71 (99.88 %)	20,469 (0.09 %)	391,811 (99.91 %)	4,983,574 (35.17 %)	1,342,514 (3.45 %)	13,029,270 (32.79 %)	19,944 (0.55 %)
315	Eld's deer (hap1 2026) GCA_054824865.1	n/a	20,240 (1.16 %)	22,436 (1.05 %)	n/a	n/a	952 (0.01 %)	3,422 (100.00 %)	5,941,523 (62.49 %)	634,128 (29.99 %)	13,002,287 (56.20 %)	69,829 (2.06 %)
316	Eld's deer (hap2 2026) GCA_054824845.1	n/a	19,521 (1.50 %)	22,180 (1.33 %)	n/a	42.69 (100.00 %)	397 (0.00 %)	902 (100.00 %)	5,867,476 (52.38 %)	497,079 (9.42 %)	13,109,210 (43.24 %)	54,156 (1.66 %)
317	elk (wapiti) GCF_019320065.1	66,846 (3.00 %)	20,090 (1.67 %)	21,999 (1.44 %)	n/a	41.62 (99.93 %)	6,643 (0.08 %)	185 (100.00 %)	4,884,711 (43.14 %)	429,925 (1.65 %)	13,135,255 (37.85 %)	47,099 (1.31 %)
318	ermine (2020) GCF_009829155.1	74,345 (3.19 %)	18,855 (1.65 %)	20,667 (1.43 %)	44,584 (2.07 %)	41.56 (99.12 %)	199 (0.88 %)	94 (100.00 %)	4,647,934 (41.44 %)	714,174 (1.30 %)	13,845,904 (33.42 %)	56,065 (2.25 %)
319	ermine (alternate hap 2020) GCA_009829165.1	n/a	13,583 (1.65 %)	15,403 (1.46 %)	n/a	41.72 (100.00 %)	n/a	3,327 (100.00 %)	3,139,035 (40.57 %)	480,111 (1.29 %)	9,106,061 (31.93 %)	39,139 (2.25 %)
320	ermine (hap1.1 2025) GCA_965636865.1	n/a	18,538 (1.35 %)	23,646 (1.36 %)	n/a	42.25 (100.00 %)	212 (0.00 %)	1,036 (100.00 %)	6,455,322 (46.66 %)	881,285 (5.47 %)	13,096,768 (42.14 %)	93,973 (3.17 %)
321	ermine (hap2.1 2025) GCA_965636855.1	n/a	17,654 (1.42 %)	22,483 (1.40 %)	n/a	42.07 (100.00 %)	139 (0.00 %)	1,083 (100.00 %)	5,945,296 (44.94 %)	800,358 (4.39 %)	12,526,091 (40.11 %)	85,220 (2.90 %)
322	ermine (primary hap 2020) GCA_009829155.1	n/a	18,855 (1.65 %)	20,668 (1.43 %)	n/a	41.56 (99.12 %)	199 (0.88 %)	94 (100.00 %)	4,647,997 (41.44 %)	714,178 (1.30 %)	13,845,820 (33.42 %)	56,065 (2.25 %)
323	Eurasian badger (2021) GCA_922990625.1	n/a	19,332 (1.42 %)	22,424 (1.40 %)	n/a	42.47 (100.00 %)	27 (0.00 %)	726 (100.00 %)	4,362,536 (31.74 %)	801,232 (4.02 %)	13,893,672 (37.73 %)	65,806 (4.13 %)
324	Eurasian badger (v3.2 2022) GCA_922984935.2	n/a	19,268 (1.40 %)	22,121 (1.36 %)	41,043 (1.93 %)	42.48 (100.00 %)	101 (0.00 %)	538 (100.00 %)	4,417,203 (31.72 %)	821,664 (4.02 %)	13,814,720 (38.08 %)	66,524 (3.95 %)
325	Eurasian beaver (alternate hap 2025) GCA_977035955.1	n/a	14,184 (1.28 %)	14,518 (1.21 %)	n/a	40.16 (99.94 %)	12,413 (0.06 %)	17,640 (99.94 %)	2,894,516 (33.23 %)	469,512 (3.63 %)	8,909,825 (39.95 %)	18,772 (1.65 %)
326	Eurasian beaver (primary hap 2025) GCA_977036005.1	n/a	20,316 (1.47 %)	20,429 (1.25 %)	n/a	39.69 (100.00 %)	237 (0.00 %)	228 (100.00 %)	4,115,552 (36.09 %)	562,383 (2.69 %)	14,321,638 (36.02 %)	24,219 (0.75 %)
327	Eurasian field mouse (2024) GCA_964023405.1	n/a	20,487 (1.88 %)	19,707 (1.34 %)	n/a	42.15 (100.00 %)	182 (0.00 %)	61 (100.00 %)	5,115,510 (39.18 %)	1,868,284 (4.29 %)	13,503,826 (37.29 %)	26,414 (0.61 %)
328	Eurasian red squirrel (alternate hap 2019) GCA_902685485.1	n/a	12,437 (1.51 %)	12,702 (1.22 %)	n/a	40.06 (100.00 %)	2 (0.00 %)	10,657 (100.00 %)	2,303,176 (35.38 %)	353,996 (1.49 %)	7,218,556 (31.67 %)	24,268 (1.07 %)
329	Eurasian red squirrel (primary hap 2019) GCF_902686455.1	65,975 (3.30 %)	20,156 (1.54 %)	21,025 (1.36 %)	n/a	40.08 (94.33 %)	1,177 (5.67 %)	1,815 (94.33 %)	5,315,833 (42.85 %)	704,218 (1.42 %)	14,991,523 (31.49 %)	48,159 (1.04 %)
330	Eurasian red squirrel (v1.2 2020) GCA_902686455.2	n/a	21,309 (1.58 %)	21,026 (1.36 %)	33,465 (1.53 %)	40.08 (94.33 %)	1,177 (5.67 %)	639 (100.00 %)	4,677,412 (35.73 %)	704,218 (1.42 %)	14,992,063 (31.49 %)	48,159 (1.04 %)
331	Eurasian river otter (2020) GCF_902655055.1	67,269 (2.96 %)	18,842 (1.54 %)	20,178 (1.40 %)	n/a	41.59 (100.00 %)	185 (0.00 %)	44 (100.00 %)	4,259,294 (33.39 %)	713,721 (1.36 %)	13,626,048 (34.37 %)	57,073 (1.82 %)
332	Eurasian river otter (alternate hap 2019) GCA_902653095.1	n/a	9,910 (1.59 %)	11,315 (1.31 %)	n/a	41.85 (100.00 %)	n/a	8,506 (100.00 %)	2,052,338 (42.25 %)	316,084 (1.64 %)	6,222,460 (33.12 %)	27,057 (1.96 %)
333	Eurasian river otter (primary hap 2020) GCA_902655055.2	n/a	19,133 (1.66 %)	20,177 (1.40 %)	n/a	41.59 (100.00 %)	185 (0.00 %)	44 (100.00 %)	4,736,483 (42.28 %)	713,721 (1.36 %)	13,625,976 (34.37 %)	57,073 (1.82 %)
334	Eurasian water vole (alternate hap 2020) GCA_903992525.1	n/a	16,761 (1.66 %)	19,715 (1.37 %)	n/a	42.13 (100.00 %)	105 (0.00 %)	16,473 (100.00 %)	3,118,266 (26.44 %)	829,463 (2.82 %)	9,700,482 (31.37 %)	14,146 (0.57 %)
335	Eurasian water vole (primary hap 2021) GCA_903992535.2	n/a	19,126 (1.84 %)	19,054 (1.47 %)	n/a	42.15 (99.74 %)	873 (0.26 %)	215 (100.00 %)	5,439,454 (42.21 %)	1,088,163 (2.91 %)	12,853,486 (32.42 %)	19,000 (0.58 %)
336	Eurasian water vole (v2 2021) GCF_903992535.2	45,544 (2.51 %)	19,733 (1.78 %)	19,053 (1.47 %)	36,935 (2.27 %)	42.15 (99.74 %)	873 (0.26 %)	215 (100.00 %)	3,993,912 (25.74 %)	1,088,163 (2.91 %)	12,853,770 (32.42 %)	19,000 (0.58 %)
337	European badger GCF_922984935.2	57,137 (2.48 %)	18,649 (1.45 %)	22,117 (1.36 %)	n/a	42.48 (100.00 %)	101 (0.00 %)	537 (100.00 %)	6,255,467 (47.25 %)	821,660 (4.02 %)	13,814,631 (38.08 %)	66,524 (3.95 %)
338	European free-tailed bat (hap1.1 2025) GCA_976988885.1	n/a	19,367 (1.49 %)	21,955 (1.44 %)	n/a	42.35 (100.00 %)	174 (0.00 %)	641 (100.00 %)	4,439,364 (40.01 %)	680,470 (8.16 %)	11,487,613 (43.09 %)	73,991 (1.99 %)
339	European free-tailed bat (hap2.1 2025) GCA_976988855.1	n/a	19,630 (1.68 %)	21,945 (1.52 %)	n/a	42.25 (100.00 %)	121 (0.00 %)	370 (100.00 %)	4,242,872 (41.74 %)	637,498 (4.18 %)	11,360,772 (39.15 %)	69,324 (2.22 %)
340	European ground squirrel (alternate hap 2024) GCA_964194095.1	n/a	15,410 (1.11 %)	21,126 (1.11 %)	n/a	39.96 (100.00 %)	n/a	28,045 (100.00 %)	3,186,054 (30.28 %)	656,568 (16.12 %)	9,975,571 (43.35 %)	28,808 (1.24 %)
341	European ground squirrel (primary hap 2024) GCF_964194105.1	58,589 (2.31 %)	20,075 (1.28 %)	20,268 (1.19 %)	n/a	39.90 (99.99 %)	1,436 (0.01 %)	1,933 (99.99 %)	4,479,230 (31.86 %)	882,536 (12.27 %)	14,881,793 (41.66 %)	39,275 (0.88 %)
342	European hare (LE1 primary hap 2023) GCF_033115175.1	46,528 (2.09 %)	19,392 (1.25 %)	23,070 (1.29 %)	n/a	44.03 (100.00 %)	418 (0.00 %)	651 (100.00 %)	4,011,592 (19.81 %)	1,000,204 (8.44 %)	13,414,251 (44.25 %)	98,831 (2.33 %)
343	European harvest mouse GCF_963924665.1	35,455 (1.84 %)	20,235 (1.71 %)	19,365 (1.32 %)	n/a	40.05 (99.99 %)	2,020 (0.02 %)	893 (100.00 %)	5,424,328 (37.31 %)	1,223,387 (18.26 %)	11,906,806 (42.51 %)	17,423 (0.62 %)
344	European harvest mouse (alternate hap 2024) GCA_963924645.1	n/a	3,404 (1.16 %)	2,956 (0.83 %)	n/a	39.56 (100.00 %)	n/a	5,020 (100.00 %)	741,789 (44.38 %)	265,801 (43.28 %)	1,048,943 (61.65 %)	3,244 (3.57 %)
345	European harvest mouse (primary hap 2024) GCA_963924665.1	n/a	20,236 (1.71 %)	19,368 (1.32 %)	n/a	40.05 (99.99 %)	2,020 (0.02 %)	894 (100.00 %)	4,892,811 (36.49 %)	1,223,387 (18.26 %)	11,907,631 (42.51 %)	17,423 (0.62 %)
346	European mink (alternate hap 2023) GCA_030435785.1	n/a	15,419 (1.50 %)	21,175 (1.51 %)	n/a	42.09 (100.00 %)	n/a	12,043 (100.00 %)	2,952,218 (30.62 %)	538,508 (2.18 %)	9,303,303 (34.20 %)	47,810 (2.50 %)
347	European mink (primary hap 2023 refseq) GCF_030435805.1	69,556 (3.13 %)	18,706 (1.46 %)	21,193 (1.37 %)	n/a	41.85 (100.00 %)	39 (0.00 %)	25 (100.00 %)	4,237,791 (30.90 %)	792,897 (2.69 %)	13,417,195 (36.59 %)	67,132 (2.54 %)
348	European mole (hap1 2024) GCA_964194135.1	n/a	18,085 (1.69 %)	19,509 (1.58 %)	n/a	42.08 (99.99 %)	1,056 (0.01 %)	464 (100.00 %)	2,569,380 (23.32 %)	565,465 (2.18 %)	10,506,666 (33.68 %)	46,367 (3.09 %)
349	European mole (hap1.1 2024) GCF_964194135.1	32,332 (1.69 %)	17,635 (1.77 %)	19,511 (1.58 %)	n/a	42.08 (99.99 %)	1,056 (0.01 %)	1,519 (99.99 %)	4,036,401 (41.00 %)	565,464 (2.18 %)	10,506,260 (33.68 %)	46,366 (3.09 %)
350	European mole (hap2 2024) GCA_964194205.1	n/a	18,064 (1.69 %)	19,764 (1.59 %)	n/a	42.07 (99.99 %)	1,040 (0.01 %)	1,396 (99.99 %)	2,567,492 (23.34 %)	570,250 (2.16 %)	10,485,959 (33.56 %)	46,213 (3.27 %)
351	European pine marten (alternate hap 2023) GCA_963455355.1	n/a	11,162 (1.58 %)	15,150 (1.47 %)	n/a	n/a	n/a	10,046 (100.00 %)	2,781,622 (41.73 %)	366,014 (3.55 %)	7,394,702 (32.79 %)	35,991 (5.06 %)
352	European pine marten (primary hap 2023 genbank) GCA_963455335.1	n/a	18,336 (1.50 %)	20,807 (1.41 %)	n/a	42.38 (99.98 %)	2,250 (0.02 %)	477 (100.00 %)	4,096,160 (31.55 %)	707,337 (3.28 %)	13,715,382 (34.73 %)	61,481 (4.29 %)
353	European pine marten (primary hap 2023 refseq) GCF_963455335.1	39,266 (2.23 %)	17,953 (1.59 %)	20,814 (1.41 %)	n/a	42.38 (99.98 %)	2,250 (0.02 %)	476 (100.00 %)	5,504,277 (42.55 %)	707,333 (3.28 %)	13,714,536 (34.73 %)	61,480 (4.29 %)
354	European shrew (alternate hap 2023) GCA_027595995.1	n/a	17,506 (1.26 %)	25,527 (1.52 %)	n/a	43.20 (100.00 %)	n/a	5,699 (100.00 %)	2,400,784 (15.19 %)	1,062,793 (3.20 %)	13,284,496 (41.93 %)	77,009 (2.86 %)
355	European shrew (GB8-d 2012) GCF_000181275.1	23,525 (1.54 %)	17,290 (1.33 %)	22,005 (1.50 %)	n/a	42.90 (90.49 %)	188,953 (9.54 %)	201,798 (90.46 %)	4,400,127 (33.22 %)	946,629 (2.03 %)	13,377,581 (35.30 %)	77,851 (2.58 %)
356	European shrew (primary hap 2023 genbank) GCA_027595985.1	n/a	17,481 (1.26 %)	22,511 (1.43 %)	n/a	43.24 (99.46 %)	1,427 (0.54 %)	66 (100.00 %)	2,474,589 (15.18 %)	1,107,886 (3.28 %)	13,638,525 (41.72 %)	79,786 (2.86 %)
357	European shrew (primary hap 2023 refseq) GCF_027595985.1	44,643 (2.60 %)	17,479 (1.26 %)	21,293 (1.37 %)	n/a	43.24 (99.46 %)	1,427 (0.54 %)	65 (100.00 %)	2,474,584 (15.18 %)	1,107,884 (3.28 %)	13,638,467 (41.72 %)	79,785 (2.86 %)
358	European snow vole (alternate hap 2023) GCA_950005115.1	n/a	18,364 (1.79 %)	20,379 (1.63 %)	n/a	42.19 (100.00 %)	1 (0.00 %)	4,256 (100.00 %)	3,049,618 (22.22 %)	852,708 (4.50 %)	10,501,392 (33.34 %)	17,629 (0.60 %)
359	European snow vole (primary hap 2023 refseq) GCF_950005125.1	47,025 (2.69 %)	19,592 (1.78 %)	21,173 (1.56 %)	n/a	41.98 (100.00 %)	197 (0.00 %)	160 (100.00 %)	5,048,186 (44.12 %)	998,537 (5.14 %)	12,204,053 (34.97 %)	20,725 (0.63 %)
360	European suslik (primary hap 2024) GCA_964194105.1	n/a	20,075 (1.28 %)	20,274 (1.19 %)	n/a	39.90 (99.99 %)	1,436 (0.01 %)	502 (100.00 %)	4,357,247 (31.78 %)	882,536 (12.27 %)	14,882,486 (41.66 %)	39,275 (0.88 %)
361	European woodmouse (2022 refseq) GCF_947179515.1	54,113 (2.24 %)	19,959 (1.65 %)	19,953 (1.25 %)	n/a	41.23 (99.99 %)	1,129 (0.01 %)	497 (100.00 %)	4,863,650 (37.41 %)	1,795,997 (8.95 %)	13,681,732 (40.58 %)	23,961 (0.53 %)
362	European woodmouse (alternate hap 2022) GCA_947179525.1	n/a	18,692 (1.72 %)	22,021 (1.36 %)	n/a	41.56 (100.00 %)	2 (0.00 %)	10,863 (100.00 %)	4,055,957 (36.08 %)	1,513,576 (9.53 %)	11,306,811 (39.67 %)	20,865 (0.55 %)
363	fallow deer (Ldn47 2023) GCF_033118175.1	57,013 (2.35 %)	20,187 (1.33 %)	23,290 (1.33 %)	n/a	42.38 (100.00 %)	44 (0.00 %)	284 (100.00 %)	3,308,241 (20.72 %)	513,748 (18.20 %)	12,996,819 (48.19 %)	214,480 (2.98 %)
364	fallow deer (maternal hap SK-2024 2025) GCA_048126745.1	n/a	20,072 (1.51 %)	22,668 (1.37 %)	n/a	41.80 (100.00 %)	147 (0.00 %)	1,369 (100.00 %)	4,623,335 (34.75 %)	475,143 (7.51 %)	13,000,703 (41.56 %)	112,581 (2.00 %)
365	fallow deer (paternal hap SK-2024 2025) GCA_048127045.1	n/a	18,238 (1.57 %)	20,307 (1.42 %)	n/a	41.46 (100.00 %)	242 (0.00 %)	388 (100.00 %)	4,244,450 (35.89 %)	405,446 (2.83 %)	12,211,643 (38.55 %)	52,418 (1.36 %)
366	false killer whale (hap1 2024 genbank) GCA_039906515.1	n/a	18,718 (1.50 %)	20,929 (1.32 %)	n/a	42.08 (99.90 %)	123 (0.10 %)	439 (100.00 %)	3,958,932 (35.76 %)	1,002,329 (11.61 %)	12,193,131 (41.85 %)	79,158 (3.74 %)
367	false killer whale (hap1 2024 refseq) GCF_039906515.1	75,958 (3.31 %)	18,718 (1.50 %)	20,982 (1.32 %)	n/a	42.08 (99.90 %)	123 (0.10 %)	438 (100.00 %)	3,958,926 (35.76 %)	1,002,329 (11.61 %)	12,193,061 (41.85 %)	79,158 (3.74 %)
368	false killer whale (hap2 2024) GCA_039906525.1	n/a	17,866 (1.45 %)	21,079 (1.46 %)	n/a	42.37 (99.08 %)	133 (0.92 %)	416 (100.00 %)	3,852,502 (34.98 %)	1,112,185 (16.42 %)	11,435,533 (44.17 %)	75,215 (4.36 %)
369	fat dormouse (hap1.1 2026) GCA_986694645.1	n/a	19,297 (1.66 %)	22,170 (1.44 %)	n/a	n/a	142 (0.00 %)	81 (100.00 %)	8,399,708 (44.86 %)	1,574,754 (4.50 %)	12,366,897 (39.95 %)	69,837 (1.83 %)
370	fat dormouse (US078 2019) GCA_004027185.1	n/a	23,122 (1.24 %)	48,677 (1.27 %)	n/a	42.33 (99.92 %)	10,685 (0.04 %)	444,115 (99.96 %)	6,783,404 (37.03 %)	1,642,515 (3.72 %)	12,706,289 (39.97 %)	65,521 (1.47 %)
371	fat sand rat (mPsaObe1 2021) GCF_907164565.1	43,224 (2.50 %)	18,543 (1.78 %)	20,094 (1.42 %)	n/a	41.95 (99.11 %)	50,482 (0.90 %)	11,389 (100.00 %)	4,686,377 (43.10 %)	920,563 (1.85 %)	12,813,848 (35.08 %)	22,480 (0.71 %)
372	fat sand rat (Psa_ob012049795 2017) GCA_002215935.1	n/a	21,644 (1.71 %)	31,665 (1.41 %)	n/a	41.99 (99.99 %)	n/a	96,427 (100.00 %)	4,646,110 (38.87 %)	946,664 (2.24 %)	13,134,526 (33.94 %)	26,411 (0.73 %)
373	fat-tailed dunnart (SCR6 2025) GCF_048593235.1	60,212 (2.43 %)	15,763 (0.77 %)	16,031 (0.89 %)	n/a	36.12 (99.99 %)	1,908 (0.01 %)	8 (100.00 %)	5,302,378 (24.47 %)	1,450,227 (3.79 %)	20,870,714 (44.26 %)	24,586 (0.65 %)
374	fat-tailed dunnart (SCR6 hap1 2025) GCA_048593235.1	n/a	15,762 (0.77 %)	16,035 (0.89 %)	n/a	36.12 (99.99 %)	1,908 (0.01 %)	1,915 (99.99 %)	5,302,372 (24.47 %)	1,450,220 (3.79 %)	20,870,654 (44.26 %)	24,585 (0.65 %)
375	fat-tailed dunnart (SCR6 hap2 2025) GCA_048593295.1	n/a	16,012 (0.77 %)	16,430 (0.90 %)	n/a	36.18 (99.99 %)	1,730 (0.01 %)	1,737 (99.99 %)	5,361,847 (24.48 %)	1,474,744 (3.79 %)	21,021,671 (44.20 %)	25,669 (0.69 %)
376	fin whale (hap1.1 2025) GCA_965194825.1	n/a	19,491 (1.21 %)	22,538 (1.06 %)	n/a	42.19 (99.99 %)	1,516 (0.01 %)	2,612 (100.00 %)	4,598,236 (35.34 %)	1,716,315 (24.14 %)	12,260,919 (52.40 %)	82,683 (1.47 %)
377	fin whale (hap2.1 2025) GCA_965194765.1	n/a	18,684 (1.40 %)	21,322 (1.20 %)	n/a	41.87 (99.99 %)	1,258 (0.01 %)	3,706 (99.99 %)	4,103,716 (36.69 %)	1,030,821 (16.12 %)	11,633,934 (45.82 %)	74,782 (1.60 %)
378	finback whale GCF_965194825.1	88,327 (5.86 %)	19,923 (1.28 %)	22,534 (1.06 %)	n/a	42.19 (99.99 %)	1,516 (0.01 %)	2,611 (100.00 %)	4,839,138 (57.33 %)	1,716,315 (24.14 %)	12,260,862 (52.40 %)	82,683 (1.47 %)
379	fishing cat (Anna 2022 U Missouri) GCF_022837055.1	68,085 (2.86 %)	18,432 (1.63 %)	19,912 (1.37 %)	n/a	41.91 (100.00 %)	63 (0.00 %)	192 (100.00 %)	4,777,906 (34.85 %)	937,432 (2.30 %)	13,438,032 (34.55 %)	70,402 (2.61 %)
380	Florida manatee (CSIC 2023) GCA_030013775.1	n/a	19,432 (1.24 %)	24,035 (1.14 %)	n/a	40.66 (100.00 %)	33 (0.00 %)	15,641 (100.00 %)	4,400,331 (33.07 %)	439,615 (1.04 %)	14,884,753 (46.98 %)	32,563 (0.80 %)
381	Florida manatee (Lorelei 2012 refseq) GCF_000243295.1	39,664 (2.08 %)	18,308 (1.37 %)	20,588 (1.23 %)	32,868 (1.38 %)	40.73 (89.24 %)	160,167 (10.78 %)	166,490 (89.22 %)	n/a	389,315 (0.74 %)	14,633,038 (38.46 %)	27,462 (0.64 %)
382	fossa GCA_004023885.1	n/a	21,156 (1.56 %)	29,809 (1.38 %)	n/a	41.51 (99.94 %)	6,335 (0.03 %)	470,371 (99.97 %)	4,962,168 (42.36 %)	814,639 (1.52 %)	13,708,904 (34.14 %)	78,033 (2.52 %)
383	fringed myotis (MThy1 2026) GCA_056320715.1	n/a	18,918 (1.85 %)	22,081 (1.71 %)	n/a	n/a	19 (0.00 %)	75 (100.00 %)	5,370,118 (48.15 %)	773,642 (4.70 %)	10,609,158 (37.80 %)	69,154 (2.76 %)
384	Gambian giant pouched rat GCA_004027575.1	n/a	21,189 (1.59 %)	32,806 (1.43 %)	n/a	42.11 (99.88 %)	7,473 (0.03 %)	1,110,425 (99.97 %)	4,137,605 (24.57 %)	1,071,627 (2.76 %)	12,905,250 (32.78 %)	32,359 (0.80 %)
385	gaur (Gaur_Henry_Doorly_Zoo_5443 2020) GCA_014182915.2	n/a	19,130 (1.53 %)	21,239 (1.30 %)	n/a	41.83 (99.99 %)	2,194 (0.01 %)	635 (100.00 %)	6,520,228 (50.46 %)	466,916 (1.41 %)	13,425,286 (41.25 %)	41,833 (1.15 %)
386	gayal (CVASU_BF_001 2021) GCA_017311355.1	n/a	24,549 (1.09 %)	55,194 (1.15 %)	n/a	42.05 (99.91 %)	n/a	1,262,134 (100.00 %)	3,691,398 (22.78 %)	677,397 (2.00 %)	14,380,670 (42.36 %)	75,114 (1.33 %)
387	gayal (Nagaland 2019) GCA_007844835.1	n/a	22,715 (1.55 %)	23,635 (1.33 %)	n/a	41.67 (96.51 %)	301,761 (3.52 %)	306,776 (96.48 %)	6,243,468 (45.69 %)	518,664 (1.99 %)	15,147,647 (37.64 %)	45,586 (0.89 %)
388	Geoffroy's bat (hap1.1 2025) GCA_965115925.1	n/a	19,320 (1.74 %)	21,940 (1.65 %)	n/a	42.55 (99.99 %)	1,540 (0.01 %)	404 (100.00 %)	3,707,500 (37.60 %)	733,107 (7.78 %)	10,515,474 (39.35 %)	60,200 (2.41 %)
389	Geoffroy's bat (hap1.2 2025) GCA_965115925.2	n/a	18,831 (1.81 %)	22,032 (1.67 %)	n/a	42.55 (100.00 %)	226 (0.00 %)	306 (100.00 %)	4,958,159 (48.46 %)	733,004 (7.77 %)	10,528,813 (39.34 %)	59,971 (2.41 %)
390	Geoffroy's bat (hap2.1 2025) GCA_965115945.1	n/a	18,718 (1.71 %)	20,961 (1.62 %)	n/a	42.29 (99.98 %)	1,597 (0.02 %)	2,101 (99.98 %)	3,662,405 (37.72 %)	717,069 (7.80 %)	10,298,372 (39.22 %)	56,300 (2.26 %)
391	Geoffroy's bat (hap2.2 2025) GCA_965115945.2	n/a	18,471 (1.79 %)	21,274 (1.64 %)	n/a	42.31 (100.00 %)	264 (0.00 %)	418 (100.00 %)	4,911,358 (48.79 %)	719,004 (7.65 %)	10,340,272 (39.15 %)	56,616 (2.24 %)
392	Geoffroy's cat GCF_018350155.1	85,344 (3.53 %)	18,469 (1.66 %)	19,516 (1.36 %)	93,795 (4.83 %)	41.75 (100.00 %)	45 (0.00 %)	82 (100.00 %)	5,021,854 (43.23 %)	930,175 (1.84 %)	13,757,469 (34.29 %)	65,918 (2.36 %)
393	Geoffroy's horseshoe bat (hap1 2026) GCA_054645015.1	n/a	18,745 (1.80 %)	21,820 (1.62 %)	n/a	39.92 (100.00 %)	36 (0.00 %)	271 (100.00 %)	3,730,344 (39.95 %)	1,346,563 (3.86 %)	11,511,257 (32.29 %)	36,004 (1.17 %)
394	Geoffroy's horseshoe bat (hap2 2026) GCA_054645025.1	n/a	17,882 (1.88 %)	20,855 (1.70 %)	n/a	40.07 (100.00 %)	30 (0.00 %)	219 (100.00 %)	3,459,687 (38.78 %)	1,115,210 (3.49 %)	10,640,816 (29.99 %)	32,817 (1.14 %)
395	giant anteater GCA_004026745.1	n/a	24,383 (0.91 %)	44,315 (0.93 %)	n/a	39.53 (99.88 %)	8,283 (0.02 %)	1,629,691 (99.98 %)	5,333,757 (35.57 %)	575,140 (0.91 %)	21,181,213 (39.97 %)	57,558 (0.94 %)
396	giant otter GCA_004024605.1	n/a	21,199 (1.46 %)	30,565 (1.34 %)	n/a	41.71 (99.93 %)	7,431 (0.03 %)	652,159 (99.97 %)	5,113,769 (41.55 %)	788,677 (1.46 %)	14,385,279 (35.77 %)	82,376 (2.05 %)
397	giant panda (Jingjing v3 2020) GCF_002007445.2	65,481 (3.27 %)	19,077 (1.67 %)	20,176 (1.39 %)	n/a	41.68 (98.09 %)	189,277 (1.92 %)	73,514 (100.00 %)	4,012,144 (34.40 %)	617,803 (1.99 %)	14,216,587 (30.41 %)	59,449 (1.50 %)
398	goat (v2 San Clemente 2016 USDA) GCF_001704415.2	47,172 (2.31 %)	19,342 (1.38 %)	22,346 (1.24 %)	n/a	43.16 (100.00 %)	790 (0.00 %)	29,886 (100.00 %)	3,502,527 (22.45 %)	760,831 (7.07 %)	13,024,178 (44.85 %)	125,662 (4.00 %)
399	Gobi jerboa GCA_004027895.1	n/a	22,410 (0.91 %)	45,268 (1.02 %)	n/a	41.94 (99.88 %)	10,987 (0.04 %)	1,295,369 (99.96 %)	8,828,417 (40.19 %)	1,979,806 (6.43 %)	14,759,732 (47.73 %)	24,314 (0.52 %)
400	golden hamster (Baylor 2021) GCF_017639785.1	67,831 (3.37 %)	19,354 (1.71 %)	19,863 (1.47 %)	69,903 (4.39 %)	42.04 (96.99 %)	711 (3.01 %)	7,058 (96.99 %)	3,981,818 (27.65 %)	976,456 (3.46 %)	12,580,903 (32.87 %)	21,268 (0.61 %)
401	golden hamster (Broad 2013 refseq) GCF_000349665.1	42,636 (2.91 %)	18,976 (1.82 %)	19,149 (1.51 %)	29,936 (1.96 %)	42.01 (82.92 %)	216,216 (17.12 %)	237,700 (82.88 %)	3,599,795 (26.09 %)	790,256 (1.69 %)	12,003,956 (24.29 %)	18,591 (0.51 %)
402	golden jackal (CA01 2025) GCF_053574225.1	115,457 (4.37 %)	19,332 (1.58 %)	21,009 (1.39 %)	n/a	41.58 (100.00 %)	59 (0.00 %)	306 (100.00 %)	6,089,485 (46.31 %)	1,184,044 (5.44 %)	13,574,928 (35.96 %)	54,314 (2.19 %)
403	golden spiny mouse (2020 genbank) GCA_903995435.1	n/a	20,001 (1.90 %)	19,127 (1.50 %)	n/a	42.51 (99.65 %)	880 (0.35 %)	623 (100.00 %)	4,976,496 (36.34 %)	1,305,613 (3.34 %)	12,957,738 (32.33 %)	20,760 (0.59 %)
404	golden spiny mouse (2020 refseq) GCF_903995435.1	36,997 (1.96 %)	20,006 (1.91 %)	19,132 (1.50 %)	n/a	42.51 (99.65 %)	880 (0.35 %)	623 (100.00 %)	4,785,907 (32.61 %)	1,305,613 (3.34 %)	12,958,061 (32.33 %)	20,760 (0.59 %)
405	golden-mantled ground squirrel (hap1 2025 genbank) GCA_048772815.1	n/a	20,967 (0.89 %)	24,137 (0.94 %)	n/a	39.52 (99.99 %)	1,448 (0.01 %)	8,087 (100.00 %)	5,547,018 (29.30 %)	1,312,047 (10.07 %)	15,174,898 (52.73 %)	40,182 (0.59 %)
406	golden-mantled ground squirrel (hap1 2025 refseq) GCF_048772815.1	49,173 (1.30 %)	19,845 (0.90 %)	24,244 (0.94 %)	n/a	39.52 (99.99 %)	1,448 (0.01 %)	8,088 (100.00 %)	8,197,827 (62.01 %)	1,312,047 (10.07 %)	15,174,958 (52.73 %)	40,182 (0.59 %)
407	golden-mantled ground squirrel (hap2 2025 genbank) GCA_048772825.1	n/a	19,719 (1.16 %)	22,611 (1.21 %)	n/a	39.48 (100.00 %)	643 (0.00 %)	2,820 (100.00 %)	4,725,546 (31.70 %)	997,950 (3.53 %)	14,753,550 (39.53 %)	33,465 (0.69 %)
408	golden-mantled ground squirrel (hap2 2025 refseq) GCF_048772825.1	46,395 (1.71 %)	18,853 (1.19 %)	22,613 (1.21 %)	n/a	39.48 (100.00 %)	643 (0.00 %)	2,821 (100.00 %)	6,984,115 (50.68 %)	997,950 (3.53 %)	14,753,604 (39.53 %)	33,465 (0.69 %)
409	gracile shrew mole GCA_004024945.1	n/a	19,165 (1.25 %)	43,816 (1.48 %)	n/a	41.08 (99.89 %)	8,248 (0.04 %)	732,083 (99.96 %)	2,957,465 (23.76 %)	783,289 (2.60 %)	11,503,344 (31.38 %)	92,729 (3.60 %)
410	gray fox (Vermont ataVT051 2023) GCA_032313775.1	n/a	19,352 (1.42 %)	20,724 (1.33 %)	n/a	42.10 (100.00 %)	26 (0.00 %)	898 (100.00 %)	4,418,039 (36.90 %)	1,050,244 (11.63 %)	13,240,305 (39.50 %)	89,246 (2.69 %)
411	gray seal (241Hg 2020) GCF_012393455.1	79,009 (3.73 %)	19,882 (1.73 %)	22,416 (1.46 %)	n/a	41.44 (100.00 %)	117 (0.00 %)	6,880 (100.00 %)	4,448,588 (43.28 %)	557,710 (1.32 %)	13,340,576 (33.41 %)	55,637 (1.78 %)
412	gray seal (hap1.1 2025) GCA_964656455.1	n/a	19,291 (1.73 %)	20,301 (1.41 %)	n/a	41.56 (99.99 %)	1,130 (0.01 %)	171 (100.00 %)	4,245,582 (34.81 %)	600,624 (2.16 %)	13,240,803 (34.28 %)	56,932 (1.78 %)
413	gray seal (hap2.1 2025) GCA_964656465.1	n/a	19,222 (1.73 %)	20,205 (1.41 %)	n/a	41.54 (99.99 %)	1,110 (0.01 %)	1,233 (99.99 %)	4,236,942 (34.95 %)	601,409 (1.99 %)	13,226,667 (34.03 %)	57,067 (1.82 %)
414	gray seal (mHalGry1.hap1.1 2025) GCF_964656455.1	70,736 (3.27 %)	18,889 (1.71 %)	20,343 (1.40 %)	n/a	41.56 (99.99 %)	1,130 (0.01 %)	1,300 (99.99 %)	5,332,627 (44.68 %)	600,622 (2.16 %)	13,240,769 (34.28 %)	56,931 (1.78 %)
415	gray short-tailed opossum GCA_027887165.2	n/a	16,583 (0.75 %)	16,408 (0.86 %)	n/a	37.92 (99.11 %)	2,255 (0.89 %)	14 (100.00 %)	9,126,134 (61.38 %)	1,096,062 (2.60 %)	22,321,931 (43.37 %)	28,894 (0.57 %)
416	gray short-tailed opossum (mMonDom1 alternate hap 2023) GCA_027917375.1	n/a	12,662 (0.70 %)	15,124 (0.89 %)	n/a	37.74 (100.00 %)	24 (0.00 %)	8,086 (100.00 %)	4,098,004 (25.33 %)	806,470 (2.98 %)	16,244,072 (43.39 %)	24,879 (0.67 %)
417	gray short-tailed opossum (MonDom5 2007) GCF_000002295.2	68,388 (2.34 %)	16,663 (0.75 %)	16,162 (0.84 %)	n/a	37.82 (97.26 %)	67,660 (2.75 %)	72,674 (97.25 %)	7,753,175 (55.85 %)	1,051,473 (2.34 %)	22,274,001 (42.23 %)	30,883 (0.53 %)
418	gray short-tailed opossum (v1 mMonDom1 primary hap 2023 refseq) GCF_027887165.1	73,383 (3.04 %)	16,637 (0.72 %)	16,036 (0.85 %)	n/a	37.92 (99.11 %)	2,255 (0.89 %)	13 (100.00 %)	5,562,359 (25.40 %)	1,096,620 (2.60 %)	22,322,748 (43.37 %)	28,894 (0.57 %)
419	gray short-tailed opossum (v2 mMonDom1 primary hap 2026 refseq) GCF_027887165.2	73,367 (2.55 %)	16,583 (0.75 %)	16,407 (0.86 %)	n/a	37.92 (99.11 %)	2,255 (0.89 %)	13 (100.00 %)	9,126,125 (61.38 %)	1,096,057 (2.60 %)	22,321,881 (43.37 %)	28,894 (0.57 %)
420	gray squirrel (2020) GCF_902686445.1	59,073 (2.48 %)	20,752 (1.49 %)	21,107 (1.31 %)	32,732 (1.45 %)	40.06 (99.98 %)	1,824 (0.02 %)	752 (100.00 %)	4,605,578 (34.50 %)	728,192 (1.65 %)	15,467,412 (33.91 %)	51,878 (1.11 %)
421	gray squirrel (alternate hap 2019) GCA_902685475.1	n/a	17,156 (1.53 %)	18,190 (1.33 %)	n/a	40.25 (100.00 %)	2 (0.00 %)	9,510 (100.00 %)	3,455,580 (34.94 %)	530,053 (1.56 %)	10,927,458 (32.64 %)	38,976 (1.13 %)
422	gray squirrel (primary hap 2020) GCA_902686445.2	n/a	20,739 (1.50 %)	21,110 (1.31 %)	n/a	40.06 (99.98 %)	1,824 (0.02 %)	753 (100.00 %)	4,732,857 (35.28 %)	728,193 (1.65 %)	15,466,750 (33.91 %)	51,878 (1.11 %)
423	gray wolf (2021) GCA_905319855.2	n/a	19,474 (1.55 %)	20,394 (1.40 %)	72,806 (4.12 %)	41.49 (100.00 %)	166 (0.00 %)	82 (100.00 %)	4,550,524 (31.76 %)	1,063,944 (3.96 %)	13,588,117 (34.74 %)	51,996 (2.15 %)
424	gray wolf (alternate hap 2021) GCA_905319845.1	n/a	12,760 (1.57 %)	14,423 (1.42 %)	n/a	41.35 (100.00 %)	1 (0.00 %)	5,537 (100.00 %)	2,725,227 (31.66 %)	616,862 (3.40 %)	8,041,744 (32.68 %)	32,293 (2.35 %)
425	Great evening bat (hap1 2026) GCA_054824925.1	n/a	18,179 (1.63 %)	21,455 (1.50 %)	n/a	n/a	424 (0.00 %)	378 (100.00 %)	5,386,802 (53.26 %)	1,002,927 (10.50 %)	10,635,984 (42.59 %)	67,716 (2.32 %)
426	Great evening bat (hap2 2026) GCA_054824975.1	n/a	17,446 (1.71 %)	20,330 (1.57 %)	n/a	43.15 (100.00 %)	360 (0.00 %)	196 (100.00 %)	4,933,307 (51.60 %)	914,468 (10.92 %)	9,849,063 (41.54 %)	64,133 (2.42 %)
427	great fruit-eating bat (hap1 2025) GCA_038363095.4	n/a	18,198 (1.65 %)	19,926 (1.51 %)	n/a	42.45 (100.00 %)	44 (0.00 %)	487 (100.00 %)	3,105,608 (36.84 %)	379,427 (5.52 %)	11,651,533 (35.11 %)	72,337 (2.76 %)
428	great fruit-eating bat (v2 hap1 2024) GCA_038363095.2	n/a	18,051 (1.56 %)	19,955 (1.51 %)	n/a	42.45 (100.00 %)	45 (0.00 %)	487 (100.00 %)	2,841,143 (26.67 %)	379,430 (5.52 %)	11,651,542 (35.11 %)	72,337 (2.76 %)
429	great fruit-eating bat (v2 hap2 2024) GCA_038363175.2	n/a	16,978 (1.61 %)	18,544 (1.54 %)	n/a	42.42 (100.00 %)	54 (0.00 %)	312 (100.00 %)	2,601,985 (26.67 %)	331,187 (4.87 %)	10,884,729 (33.93 %)	63,610 (2.71 %)
430	great fruit-eating bat (v3 hap2 2025) GCA_038363175.3	n/a	17,189 (1.70 %)	18,544 (1.54 %)	n/a	n/a	54 (0.00 %)	312 (100.00 %)	2,838,138 (36.48 %)	339,722 (5.05 %)	10,884,721 (33.93 %)	63,610 (2.71 %)
431	great roundleaf bat (v2 ML-2016 2016) GCF_001890085.2	50,908 (3.26 %)	18,993 (2.01 %)	19,633 (1.65 %)	41,769 (2.41 %)	41.11 (87.42 %)	172,750 (12.60 %)	7,387 (100.00 %)	2,946,981 (30.72 %)	495,272 (1.05 %)	11,587,728 (25.43 %)	32,949 (0.96 %)
432	greater bulldog bat GCA_004026585.1	n/a	20,774 (1.62 %)	28,140 (1.63 %)	n/a	40.92 (99.94 %)	6,171 (0.03 %)	304,393 (99.97 %)	3,288,598 (29.60 %)	478,424 (1.16 %)	11,427,553 (35.29 %)	44,124 (1.99 %)
433	Greater cane rat GCA_004025085.1	n/a	20,383 (0.98 %)	47,456 (1.25 %)	n/a	42.85 (99.83 %)	8,825 (0.03 %)	1,898,466 (99.97 %)	5,569,185 (30.19 %)	946,696 (3.12 %)	13,144,109 (41.83 %)	97,686 (2.61 %)
434	greater horseshoe bat (MPI-CBG alternate hap 2019) GCA_004115295.1	n/a	14,896 (1.85 %)	18,939 (1.59 %)	n/a	40.69 (100.00 %)	2 (0.00 %)	13,426 (100.00 %)	2,426,330 (34.43 %)	418,341 (1.36 %)	8,763,234 (27.86 %)	24,370 (1.08 %)
435	greater horseshoe bat (MPI-CBG mRhiFer1 2019) GCA_004115265.3	n/a	18,510 (1.96 %)	20,357 (1.68 %)	n/a	40.54 (99.64 %)	158 (0.36 %)	135 (100.00 %)	3,547,476 (40.33 %)	564,790 (1.35 %)	12,217,002 (29.39 %)	32,445 (1.06 %)
436	greater horseshoe bat (v2 MPI-CBG 2019) GCF_004115265.2	53,353 (3.13 %)	18,641 (1.97 %)	20,359 (1.68 %)	n/a	40.54 (99.64 %)	158 (0.36 %)	134 (100.00 %)	3,218,744 (34.52 %)	564,789 (1.35 %)	12,217,020 (29.39 %)	32,445 (1.06 %)
437	greater Indian rhinoceros (Sample0755 2023) GCA_028646465.1	n/a	19,533 (1.67 %)	23,705 (1.37 %)	n/a	41.10 (101.83 %)	33,235 (0.47 %)	275,222 (99.99 %)	5,364,142 (46.33 %)	487,256 (1.17 %)	16,182,706 (30.52 %)	42,131 (1.13 %)
438	greater mouse-eared bat GCA_014108235.2	n/a	18,686 (1.94 %)	21,567 (1.74 %)	n/a	43.11 (98.56 %)	600 (1.44 %)	51 (100.00 %)	4,876,518 (44.95 %)	752,949 (2.84 %)	10,383,290 (35.84 %)	60,936 (2.45 %)
439	greater mouse-eared bat (2020 Bat1K) GCF_014108235.1	70,930 (3.43 %)	19,052 (1.84 %)	21,498 (1.73 %)	n/a	43.11 (98.55 %)	538 (1.45 %)	93 (100.00 %)	3,088,083 (26.27 %)	753,124 (2.84 %)	10,383,466 (35.84 %)	61,023 (2.69 %)
440	Greater mouse-tailed bat (20210906_DDa alternate hap 2024) GCA_043880455.1	n/a	16,611 (1.60 %)	22,294 (1.43 %)	n/a	42.59 (100.00 %)	n/a	8,359 (100.00 %)	4,914,747 (44.93 %)	593,619 (4.20 %)	10,708,461 (39.52 %)	222,795 (3.47 %)
441	greater mouse-tailed bat (20210906_DDa primary hap 2024) GCA_043880545.1	n/a	18,582 (1.55 %)	20,954 (1.35 %)	n/a	42.46 (100.00 %)	152 (0.00 %)	106 (100.00 %)	4,158,629 (40.30 %)	696,150 (4.67 %)	12,702,667 (41.11 %)	257,446 (3.38 %)
442	greater sac-winged bat (alternate hap 2024) GCA_036850925.1	n/a	17,838 (1.44 %)	21,425 (1.45 %)	n/a	41.86 (100.00 %)	n/a	2,167 (100.00 %)	6,139,040 (42.07 %)	974,353 (2.52 %)	11,694,399 (43.03 %)	96,465 (2.06 %)
443	greater sac-winged bat (primary hap 2024 refseq) GCF_036850765.1	55,259 (2.53 %)	18,321 (1.40 %)	21,048 (1.35 %)	n/a	41.71 (98.73 %)	468 (1.27 %)	256 (100.00 %)	4,247,145 (29.53 %)	1,031,385 (2.50 %)	12,465,157 (43.30 %)	101,620 (2.01 %)
444	greater sac-winged bat (primary hap 2024) GCA_036850765.2	n/a	18,321 (1.40 %)	21,048 (1.35 %)	n/a	n/a	468 (1.27 %)	256 (100.00 %)	7,065,814 (43.22 %)	1,031,282 (2.50 %)	12,465,008 (43.30 %)	101,620 (2.01 %)
445	greater spear-nosed bat (2021 Texas Tech U) GCF_019186645.2	50,563 (2.96 %)	18,224 (1.70 %)	20,689 (1.67 %)	n/a	42.27 (100.00 %)	55 (0.00 %)	534 (100.00 %)	2,961,591 (0.00 %)	387,908 (0.97 %)	12,179,612 (30.91 %)	62,189 (5.35 %)
446	Grevy's zebra (hap1 2026) GCA_057876975.1	n/a	18,036 (1.58 %)	20,487 (1.33 %)	n/a	42.30 (100.00 %)	123 (0.00 %)	767 (100.00 %)	4,643,638 (47.12 %)	545,325 (5.89 %)	14,404,726 (34.24 %)	42,105 (3.78 %)
447	Grevy's zebra (hap2 2026) GCA_057877195.1	n/a	17,709 (1.64 %)	19,935 (1.36 %)	n/a	41.70 (100.00 %)	145 (0.00 %)	274 (100.00 %)	4,483,471 (45.66 %)	430,395 (2.96 %)	14,426,365 (31.58 %)	39,398 (2.28 %)
448	grey whale GCA_004363415.1	n/a	21,827 (1.52 %)	32,191 (1.24 %)	n/a	41.22 (99.88 %)	10,622 (0.04 %)	1,046,770 (99.96 %)	4,841,166 (45.56 %)	780,015 (1.83 %)	13,559,563 (39.86 %)	72,343 (1.59 %)
449	grey whale (mEscRob2 alternate hap 2023) GCA_028021475.1	n/a	19,129 (1.37 %)	24,628 (1.24 %)	n/a	41.83 (100.00 %)	n/a	14,442 (100.00 %)	3,892,130 (35.74 %)	874,864 (15.70 %)	11,484,916 (45.69 %)	73,507 (1.72 %)
450	grey whale (primary hap 2023 genbank) GCA_028021215.1	n/a	19,288 (1.38 %)	21,791 (1.21 %)	n/a	41.74 (100.00 %)	279 (0.00 %)	704 (100.00 %)	4,116,900 (35.85 %)	966,065 (16.74 %)	12,154,173 (46.39 %)	77,011 (1.59 %)
451	grey whale (primary hap 2023 refseq) GCF_028021215.1	49,276 (1.90 %)	19,295 (1.38 %)	21,790 (1.21 %)	n/a	41.74 (100.00 %)	279 (0.00 %)	703 (100.00 %)	4,116,894 (35.85 %)	966,064 (16.74 %)	12,154,101 (46.39 %)	77,011 (1.59 %)
452	hairy big-eared bat (US037 2019 Broad) GCA_004026765.1	n/a	21,360 (1.44 %)	37,376 (1.52 %)	n/a	42.38 (99.94 %)	3,218 (0.01 %)	553,308 (99.99 %)	3,519,246 (30.77 %)	393,318 (0.85 %)	12,525,258 (34.42 %)	84,875 (2.37 %)
453	Hanaki's dwarf bat (v1 2024) GCA_964339955.1	n/a	17,856 (1.76 %)	20,604 (1.75 %)	n/a	42.55 (100.00 %)	306 (0.00 %)	141 (100.00 %)	3,697,250 (33.21 %)	842,827 (8.27 %)	10,094,062 (38.40 %)	61,715 (2.96 %)
454	Hanaki's dwarf bat (v5 2025 genbank) GCA_964339955.5	n/a	17,654 (1.85 %)	20,599 (1.75 %)	n/a	42.55 (100.00 %)	306 (0.00 %)	141 (100.00 %)	4,660,276 (45.88 %)	842,822 (8.27 %)	10,093,872 (38.40 %)	61,715 (2.96 %)
455	Hanaki's dwarf bat (v5 2025 refseq) GCF_964339955.1	51,103 (3.48 %)	17,654 (1.85 %)	20,598 (1.75 %)	n/a	42.55 (100.00 %)	306 (0.00 %)	141 (100.00 %)	4,660,276 (45.88 %)	842,822 (8.27 %)	10,093,872 (38.40 %)	61,715 (2.96 %)
456	harbor porpoise (alternate hap 2024) GCA_963924725.1	n/a	19,112 (1.54 %)	22,516 (1.29 %)	n/a	42.02 (100.00 %)	n/a	7,636 (100.00 %)	4,295,938 (43.35 %)	1,111,088 (11.90 %)	12,254,452 (42.18 %)	77,325 (3.31 %)
457	harbor porpoise (primary hap 2024 genbank) GCA_963924675.1	n/a	18,529 (1.58 %)	20,583 (1.34 %)	n/a	41.72 (99.99 %)	966 (0.01 %)	442 (100.00 %)	3,760,716 (36.18 %)	888,368 (7.18 %)	12,379,240 (39.04 %)	71,530 (2.69 %)
458	harbor porpoise (primary hap 2024 refseq) GCF_963924675.1	33,578 (1.54 %)	18,528 (1.58 %)	20,582 (1.34 %)	n/a	41.72 (99.99 %)	966 (0.01 %)	1,405 (99.99 %)	3,760,713 (36.18 %)	888,368 (7.18 %)	12,379,181 (39.04 %)	71,530 (2.69 %)
459	harbor seal GCF_004348235.1	50,657 (2.98 %)	19,484 (1.76 %)	20,771 (1.44 %)	33,296 (1.58 %)	41.38 (99.09 %)	16,480 (0.91 %)	21,161 (99.09 %)	4,526,182 (43.28 %)	576,921 (1.11 %)	13,421,780 (33.06 %)	54,592 (1.70 %)
460	harbor seal (hap1.1 2026) GCA_988265205.1	n/a	19,287 (1.70 %)	20,818 (1.41 %)	n/a	n/a	42 (0.00 %)	179 (100.00 %)	4,912,755 (45.06 %)	629,980 (2.65 %)	13,325,559 (35.05 %)	61,771 (2.11 %)
461	Hawaiian monk seal (2021 Johns Hopkins U) GCF_002201575.2	37,605 (1.99 %)	19,483 (1.73 %)	19,767 (1.35 %)	n/a	41.41 (98.23 %)	25,763 (1.77 %)	7,487 (100.00 %)	4,575,217 (43.59 %)	583,394 (1.11 %)	13,374,131 (33.69 %)	52,067 (1.50 %)
462	hazel dormouse GCA_004027005.1	n/a	21,556 (1.24 %)	40,971 (1.33 %)	n/a	41.60 (99.91 %)	15,076 (0.06 %)	481,881 (99.94 %)	6,679,641 (33.98 %)	1,653,419 (3.72 %)	12,685,676 (43.98 %)	71,478 (1.57 %)
463	hazel dormouse (alternate hap 2023) GCA_963383665.1	n/a	11,130 (1.23 %)	22,071 (1.36 %)	n/a	42.15 (99.99 %)	n/a	31,856 (100.00 %)	2,958,239 (41.25 %)	788,242 (4.52 %)	6,056,268 (41.88 %)	36,143 (1.96 %)
464	hazel dormouse (primary hap 2023) GCA_963383645.1	n/a	18,620 (1.42 %)	22,403 (1.38 %)	n/a	41.73 (99.99 %)	1,805 (0.01 %)	214 (100.00 %)	6,063,911 (41.66 %)	1,593,657 (4.46 %)	12,229,281 (43.98 %)	71,058 (1.88 %)
465	Heller's broad-nosed bat (hap1 2025) GCA_051107505.1	n/a	17,977 (1.62 %)	19,578 (1.49 %)	n/a	n/a	94 (0.00 %)	365 (100.00 %)	3,844,689 (40.85 %)	495,667 (5.71 %)	11,659,980 (35.39 %)	51,652 (2.95 %)
466	hippopotamus (BS01 2019 Broad) GCA_004027065.1	n/a	24,267 (1.55 %)	34,820 (1.30 %)	n/a	41.43 (99.91 %)	4,730 (0.02 %)	972,599 (99.98 %)	4,579,311 (41.26 %)	606,731 (1.02 %)	14,514,493 (36.58 %)	54,753 (1.59 %)
467	hippopotamus (HIP001 2018) GCA_002995585.1	n/a	22,343 (1.70 %)	31,687 (1.45 %)	n/a	40.96 (94.63 %)	153,125 (5.38 %)	281,897 (94.62 %)	3,952,905 (38.55 %)	476,243 (1.97 %)	14,216,817 (27.43 %)	48,380 (1.43 %)
468	hippopotamus (mHipAmp2 hap1 2023) GCA_030028035.1	n/a	20,391 (1.63 %)	20,668 (1.37 %)	n/a	41.62 (100.00 %)	83 (0.00 %)	545 (100.00 %)	3,778,764 (35.17 %)	563,345 (3.63 %)	13,524,869 (35.56 %)	48,164 (1.90 %)
469	hippopotamus (v2 hap2 2023 refseq) GCF_030028045.1	64,153 (2.73 %)	20,331 (1.62 %)	20,633 (1.37 %)	n/a	41.60 (100.00 %)	226 (0.00 %)	357 (100.00 %)	3,783,440 (35.17 %)	567,797 (3.38 %)	13,462,531 (35.48 %)	48,365 (1.91 %)
470	hirola (BS46 2019 Broad) GCA_004027495.1	n/a	22,264 (1.40 %)	36,984 (1.26 %)	n/a	42.31 (99.93 %)	9,287 (0.03 %)	545,176 (99.97 %)	5,809,405 (48.62 %)	465,001 (1.08 %)	13,326,245 (42.35 %)	48,312 (1.15 %)
471	Hispaniolan solenodon GCA_004363575.1	n/a	18,805 (1.55 %)	27,454 (1.64 %)	n/a	39.98 (99.96 %)	5,186 (0.02 %)	181,804 (99.98 %)	2,669,787 (26.78 %)	431,610 (1.04 %)	13,429,711 (27.35 %)	53,444 (2.30 %)
472	hispid cotton rat GCA_004025045.1	n/a	25,324 (1.49 %)	31,681 (1.31 %)	39,953 (1.43 %)	39.77 (99.89 %)	13,744 (0.05 %)	897,290 (99.95 %)	4,384,099 (28.17 %)	1,132,313 (3.34 %)	14,729,737 (38.08 %)	17,558 (0.40 %)
473	hoary bat (Cryan_1219 primary hap 2025) GCA_011751065.5	n/a	18,411 (1.72 %)	20,852 (1.49 %)	n/a	41.93 (97.36 %)	35,513 (2.65 %)	37,763 (97.35 %)	4,953,747 (48.32 %)	773,513 (2.08 %)	11,116,507 (38.56 %)	61,320 (2.76 %)
474	Hoffmann's two-fingered sloth GCA_000164785.2	n/a	24,546 (1.30 %)	30,273 (1.15 %)	n/a	39.80 (98.09 %)	101,085 (1.91 %)	370,035 (98.09 %)	5,145,551 (52.20 %)	614,819 (1.62 %)	17,932,269 (39.26 %)	55,943 (1.04 %)
475	Hog deer (hap1 2026) GCA_054883215.1	n/a	19,465 (1.51 %)	22,515 (1.39 %)	n/a	n/a	454 (0.00 %)	720 (100.00 %)	5,657,340 (50.01 %)	505,902 (6.03 %)	13,208,610 (41.33 %)	73,146 (2.25 %)
476	Hog deer (hap2 2026) GCA_054883225.1	n/a	18,236 (1.44 %)	21,068 (1.32 %)	n/a	43.42 (99.99 %)	1,362 (0.01 %)	1,968 (100.00 %)	5,210,730 (50.70 %)	450,467 (12.73 %)	12,050,600 (44.70 %)	98,724 (4.11 %)
477	hog-nosed bat GCA_004027555.1	n/a	20,591 (1.30 %)	39,589 (1.39 %)	n/a	40.99 (99.88 %)	6,224 (0.03 %)	1,230,480 (99.97 %)	4,081,924 (31.12 %)	1,008,077 (2.20 %)	12,068,828 (39.98 %)	55,567 (2.02 %)
478	Honduran yellow-shouldered bat (v2.1 Veracruz 20B 2020) GCF_014824575.3	49,071 (2.78 %)	17,588 (1.64 %)	19,357 (1.60 %)	n/a	42.32 (99.79 %)	38,648 (0.21 %)	25,848 (100.00 %)	2,708,400 (27.89 %)	366,870 (1.48 %)	11,795,308 (31.27 %)	59,066 (1.72 %)
479	Honduran yellow-shouldered bat (v3 Veracruz 20B 2022) GCF_014824575.4	49,074 (2.78 %)	17,270 (1.72 %)	19,383 (1.60 %)	n/a	42.32 (99.80 %)	38,653 (0.21 %)	64,534 (99.79 %)	3,759,212 (41.79 %)	366,883 (1.48 %)	11,795,401 (31.27 %)	59,077 (1.72 %)
480	horse (maternal 2024) GCA_036418255.1	n/a	16,789 (1.65 %)	18,017 (1.36 %)	n/a	42.07 (100.00 %)	210 (0.00 %)	821 (100.00 %)	3,146,381 (34.68 %)	430,664 (5.91 %)	13,246,059 (32.62 %)	37,293 (2.80 %)
481	horse (paternal hap 2024) GCA_036426135.1	n/a	19,073 (1.67 %)	20,636 (1.38 %)	n/a	42.08 (100.00 %)	114 (0.00 %)	602 (100.00 %)	3,521,953 (35.39 %)	461,571 (5.26 %)	14,833,688 (32.77 %)	43,527 (2.54 %)
482	horse (thoroughbred H_3958 2024) GCF_041296265.1	124,629 (3.91 %)	18,742 (1.47 %)	21,901 (1.39 %)	n/a	42.90 (99.96 %)	5 (0.04 %)	625 (100.00 %)	3,600,073 (33.96 %)	709,759 (8.89 %)	14,396,691 (35.72 %)	48,802 (5.67 %)
483	horse (Twilight 2018) GCF_002863925.1	76,388 (4.03 %)	18,997 (1.73 %)	20,914 (1.42 %)	113,346 (6.08 %)	41.50 (99.62 %)	6,294 (0.38 %)	4,701 (100.00 %)	4,080,319 (44.85 %)	395,037 (1.44 %)	15,169,517 (29.93 %)	44,825 (1.77 %)
484	Hottentot golden mole (hap1 2026) GCA_054824725.1	n/a	23,545 (0.65 %)	25,587 (0.69 %)	n/a	41.75 (100.00 %)	397 (0.00 %)	2,994 (100.00 %)	15,378,633 (76.69 %)	1,709,398 (27.18 %)	17,909,037 (71.38 %)	48,162 (0.41 %)
485	Hottentot golden mole (hap2 2026) GCA_054824785.1	n/a	22,773 (0.75 %)	23,199 (0.76 %)	n/a	40.81 (100.00 %)	334 (0.00 %)	1,448 (100.00 %)	10,749,854 (56.06 %)	1,271,895 (18.31 %)	19,407,780 (65.71 %)	40,984 (0.45 %)
486	house mouse (129S1_SvImJv1 2016) GCA_001624185.1	n/a	21,289 (2.22 %)	18,626 (1.42 %)	102,148 (4.16 %)	41.77 (85.00 %)	366,945 (15.05 %)	62,882 (95.15 %)	5,075,137 (40.38 %)	1,400,072 (2.80 %)	13,497,076 (26.20 %)	16,957 (0.40 %)
487	house mouse (129S1_SvImJ_v3 2022) GCA_921998555.2	n/a	21,780 (2.13 %)	19,436 (1.37 %)	110,376 (4.47 %)	41.79 (99.60 %)	1,557 (0.40 %)	188 (100.00 %)	4,653,663 (40.74 %)	1,550,342 (3.54 %)	12,930,784 (35.48 %)	23,211 (0.57 %)
488	house mouse (AKR_J v3 2022) GCA_922000895.2	n/a	21,721 (2.13 %)	19,324 (1.37 %)	110,654 (4.48 %)	41.80 (99.85 %)	2,714 (0.15 %)	201 (100.00 %)	4,645,513 (40.70 %)	1,547,237 (3.56 %)	13,016,932 (35.69 %)	23,309 (0.57 %)
489	house mouse (alternate hap 2023) GCA_949316305.1	n/a	661 (0.88 %)	720 (0.54 %)	n/a	38.59 (100.00 %)	n/a	1,806 (100.00 %)	97,279 (72.21 %)	40,071 (55.89 %)	208,928 (64.94 %)	506 (0.31 %)
490	house mouse (A_J v3 2022) GCA_921998355.2	n/a	21,869 (2.13 %)	19,400 (1.37 %)	110,389 (4.48 %)	41.80 (99.39 %)	608 (0.61 %)	163 (100.00 %)	4,668,553 (40.80 %)	1,556,835 (3.58 %)	12,995,938 (35.53 %)	23,203 (0.56 %)
491	house mouse (BALB_cJ v3 2022) GCA_921997145.2	n/a	21,891 (2.13 %)	19,499 (1.37 %)	110,461 (4.47 %)	41.79 (99.80 %)	274 (0.20 %)	217 (100.00 %)	4,673,990 (40.79 %)	1,560,327 (3.63 %)	13,018,071 (35.70 %)	23,196 (0.56 %)
492	house mouse (C3H_HeJ v3 2022) GCA_921997125.2	n/a	21,793 (2.13 %)	19,516 (1.38 %)	110,049 (4.46 %)	41.79 (99.05 %)	844 (0.95 %)	174 (100.00 %)	4,657,005 (40.76 %)	1,551,107 (3.53 %)	12,949,100 (35.32 %)	23,262 (0.56 %)
493	house mouse (C57BL/6J 2012) GCA_000185105.2	n/a	21,313 (2.28 %)	19,336 (1.53 %)	n/a	41.71 (91.01 %)	189,267 (9.02 %)	191,581 (90.98 %)	4,937,032 (40.05 %)	1,409,489 (2.64 %)	13,090,524 (27.69 %)	16,523 (0.40 %)
494	house mouse (C57BL_6J T2T 2024) GCA_964188535.1	n/a	21,496 (1.92 %)	19,278 (1.25 %)	n/a	41.31 (99.85 %)	108 (0.15 %)	345 (99.85 %)	4,519,975 (46.81 %)	1,564,206 (14.33 %)	12,267,542 (42.16 %)	23,119 (0.55 %)
495	house mouse (CBA_J v3 2022) GCA_921998905.2	n/a	21,829 (2.13 %)	19,841 (1.39 %)	110,858 (4.48 %)	41.79 (99.52 %)	658 (0.48 %)	145 (100.00 %)	4,658,032 (40.77 %)	1,552,298 (3.59 %)	12,948,038 (35.52 %)	23,232 (0.56 %)
496	house mouse (DBA_2J v3 2022) GCA_921998315.2	n/a	22,302 (2.08 %)	19,749 (1.35 %)	113,269 (4.42 %)	41.72 (100.00 %)	153 (0.00 %)	361 (100.00 %)	4,785,676 (41.69 %)	1,597,598 (4.56 %)	13,190,158 (36.58 %)	24,140 (0.59 %)
497	house mouse (FVB_NJ v3 2022) GCA_921998635.2	n/a	21,633 (2.15 %)	19,565 (1.40 %)	110,246 (4.50 %)	41.82 (98.35 %)	6,244 (1.65 %)	384 (100.00 %)	4,621,601 (40.42 %)	1,537,622 (3.48 %)	12,818,729 (34.77 %)	22,696 (0.55 %)
498	house mouse (LP_J v3 2022) GCA_947599735.1	n/a	22,452 (1.91 %)	19,841 (1.23 %)	110,073 (3.98 %)	41.29 (99.99 %)	386 (0.01 %)	515 (100.00 %)	4,839,574 (46.33 %)	1,645,163 (11.88 %)	12,936,515 (41.49 %)	24,374 (0.54 %)
499	house mouse (NOD_ShiLtJ v3 2022) GCA_921998325.2	n/a	21,797 (2.13 %)	19,521 (1.38 %)	109,890 (4.48 %)	41.80 (99.50 %)	1,462 (0.50 %)	170 (100.00 %)	4,650,016 (40.74 %)	1,547,220 (3.54 %)	12,918,125 (35.45 %)	23,253 (0.56 %)
500	house mouse (NZO_HlLtJ v3 2022) GCA_947593165.1	n/a	22,481 (1.93 %)	19,932 (1.26 %)	109,670 (4.03 %)	41.34 (100.00 %)	234 (0.00 %)	441 (100.00 %)	4,822,230 (45.92 %)	1,637,027 (11.19 %)	13,082,730 (41.04 %)	24,187 (0.54 %)
501	house mouse (primary hap 2023) GCA_949316315.1	n/a	22,351 (1.96 %)	19,629 (1.26 %)	n/a	41.38 (100.00 %)	101 (0.00 %)	179 (100.00 %)	4,774,018 (45.31 %)	1,620,102 (10.50 %)	13,181,250 (40.47 %)	23,955 (0.54 %)
502	house mouse C57BL/6J 2020 GRC GCF_000001635.27	136,224 (4.84 %)	22,409 (2.02 %)	19,480 (1.31 %)	140,725 (4.83 %)	41.67 (97.30 %)	334 (2.70 %)	22,273 (97.30 %)	5,361,085 (45.51 %)	1,641,063 (3.41 %)	12,722,791 (36.04 %)	23,794 (0.53 %)
503	house mouse C57BL_6NJ (2016) GCA_001632555.1	n/a	21,177 (2.23 %)	18,495 (1.42 %)	103,002 (4.20 %)	41.76 (82.53 %)	410,660 (17.53 %)	49,821 (96.37 %)	5,081,049 (40.22 %)	1,392,942 (2.58 %)	13,476,268 (25.21 %)	16,877 (0.39 %)
504	house mouse C57BL_6NJ (2022) GCA_921999865.2	n/a	21,817 (2.13 %)	19,349 (1.37 %)	n/a	41.79 (99.76 %)	1,127 (0.24 %)	214 (100.00 %)	4,661,104 (40.76 %)	1,552,079 (3.56 %)	12,953,662 (35.57 %)	23,204 (0.56 %)
505	humpback whale (KW2013002 2024) GCA_041834305.1	n/a	19,463 (1.32 %)	22,424 (1.19 %)	n/a	42.05 (100.00 %)	88 (0.00 %)	1,355 (100.00 %)	4,164,459 (34.02 %)	1,281,751 (18.33 %)	12,412,281 (48.28 %)	82,412 (1.67 %)
506	Iberian mole (v2.1 TD23 2020) GCF_014898055.3	56,986 (3.41 %)	18,431 (1.69 %)	20,317 (1.59 %)	n/a	41.89 (99.89 %)	3,575 (0.11 %)	3,202 (100.00 %)	2,635,974 (23.38 %)	496,514 (1.29 %)	10,969,546 (32.61 %)	47,466 (2.89 %)
507	Incan shrew opossum (hap1 2026) GCA_054644205.1	n/a	18,571 (0.65 %)	18,069 (0.75 %)	n/a	37.91 (100.00 %)	1,075 (0.00 %)	188 (100.00 %)	12,536,015 (55.82 %)	1,210,154 (3.86 %)	24,488,548 (48.61 %)	20,671 (0.41 %)
508	Incan shrew opossum (hap2 2026) GCA_054644215.1	n/a	18,021 (0.67 %)	17,310 (0.75 %)	n/a	37.79 (100.00 %)	994 (0.00 %)	98 (100.00 %)	12,176,230 (56.47 %)	1,165,452 (2.75 %)	23,829,102 (48.11 %)	19,139 (0.39 %)
509	Indian false vampire GCA_004026885.1	n/a	20,067 (1.37 %)	36,544 (1.53 %)	32,548 (1.37 %)	40.84 (99.83 %)	6,266 (0.02 %)	1,909,067 (99.98 %)	4,096,409 (31.50 %)	699,311 (1.81 %)	12,307,198 (39.96 %)	92,830 (3.12 %)
510	Indian flying fox GCF_902729225.1	64,763 (3.85 %)	18,222 (2.01 %)	23,187 (1.82 %)	45,389 (2.18 %)	39.83 (99.10 %)	17,500 (0.90 %)	16,113 (100.00 %)	2,972,300 (34.11 %)	487,157 (1.49 %)	12,486,528 (27.37 %)	57,869 (3.73 %)
511	Indian short-nosed fruit bat (CYSPWHU 2023) GCA_030015415.1	n/a	17,560 (2.04 %)	21,687 (1.83 %)	n/a	39.77 (100.00 %)	26 (0.00 %)	181 (100.00 %)	2,598,385 (30.48 %)	486,921 (1.41 %)	11,828,726 (27.28 %)	37,476 (5.58 %)
512	Indiana bat (hap1 2026) GCA_057945255.1	n/a	18,747 (1.84 %)	22,021 (1.70 %)	n/a	42.83 (100.00 %)	70 (0.00 %)	44 (100.00 %)	4,983,941 (48.10 %)	727,252 (6.15 %)	10,651,549 (38.18 %)	64,219 (2.52 %)
513	Indiana bat (hap2 2026) GCA_057945245.1	n/a	18,074 (1.89 %)	21,376 (1.78 %)	n/a	42.96 (100.00 %)	50 (0.00 %)	43 (100.00 %)	4,650,326 (46.91 %)	666,495 (5.97 %)	9,978,341 (37.20 %)	61,322 (2.61 %)
514	Indochinese shrew (US011 2019 Broad) GCA_004027635.1	n/a	18,870 (0.51 %)	55,636 (0.81 %)	n/a	39.81 (99.83 %)	5,267 (0.02 %)	2,420,679 (99.98 %)	4,130,068 (16.60 %)	1,663,335 (3.30 %)	18,728,711 (46.19 %)	31,453 (0.55 %)
515	Indus River dolphin GCA_004363435.1	n/a	24,321 (1.30 %)	47,065 (1.14 %)	n/a	41.72 (99.88 %)	11,702 (0.04 %)	1,110,492 (99.96 %)	5,093,308 (45.60 %)	845,860 (1.72 %)	13,162,111 (41.37 %)	68,257 (1.40 %)
516	Inner Mongolia cashmere goat (2024) GCA_041735815.1	n/a	19,123 (1.40 %)	21,508 (1.26 %)	n/a	43.19 (100.00 %)	n/a	31 (100.00 %)	3,982,368 (23.76 %)	650,129 (7.44 %)	12,858,872 (44.33 %)	99,144 (2.87 %)
517	intermediate fruit-eating bat (hap1 2024) GCA_038363145.1	n/a	18,022 (1.56 %)	19,824 (1.51 %)	n/a	42.28 (100.00 %)	81 (0.00 %)	419 (100.00 %)	2,827,417 (26.82 %)	371,479 (4.97 %)	11,603,093 (34.64 %)	71,574 (2.28 %)
518	intermediate horseshoe bat (China 20211001_DDa alternate hap 2024) GCA_043727925.1	n/a	17,564 (1.87 %)	20,064 (1.66 %)	n/a	41.05 (100.00 %)	n/a	2,194 (100.00 %)	3,406,902 (41.38 %)	537,189 (4.88 %)	11,454,141 (30.99 %)	32,338 (1.09 %)
519	intermediate horseshoe bat (China 20211001_DDa primary hap 2024) GCA_043728065.1	n/a	18,239 (1.76 %)	20,378 (1.53 %)	n/a	41.40 (100.00 %)	37 (0.00 %)	2,195 (100.00 %)	3,438,644 (42.82 %)	584,006 (9.54 %)	12,207,998 (35.49 %)	34,491 (1.02 %)
520	intermediate roundleaf bat (primary hap 2023) GCA_031876335.1	n/a	19,064 (1.67 %)	20,800 (1.49 %)	n/a	41.55 (100.00 %)	119 (0.00 %)	69 (100.00 %)	3,393,548 (30.92 %)	723,545 (6.58 %)	12,073,117 (35.40 %)	43,736 (1.20 %)
521	jaguar GCF_046562875.1	75,496 (3.58 %)	18,871 (1.64 %)	21,072 (1.41 %)	n/a	41.76 (100.00 %)	200 (0.00 %)	86 (100.00 %)	5,097,978 (41.83 %)	982,066 (2.10 %)	13,365,317 (34.16 %)	66,000 (2.75 %)
522	jaguar (BS21 2019) GCA_004023805.1	n/a	21,431 (1.51 %)	32,835 (1.35 %)	n/a	41.70 (99.89 %)	21,329 (0.09 %)	460,121 (99.91 %)	5,420,861 (43.75 %)	1,049,353 (1.93 %)	13,848,545 (34.90 %)	71,066 (2.37 %)
523	jaguar (hap1 2025 genbank) GCA_046562885.1	n/a	17,882 (1.68 %)	19,103 (1.41 %)	n/a	41.66 (100.00 %)	140 (0.00 %)	115 (100.00 %)	4,622,385 (41.25 %)	893,297 (1.89 %)	12,851,116 (33.53 %)	61,319 (2.55 %)
524	jaguar (hap1 2025 refseq) GCF_046562885.1	72,531 (3.71 %)	17,886 (1.68 %)	19,296 (1.42 %)	n/a	41.66 (100.00 %)	140 (0.00 %)	116 (100.00 %)	4,733,281 (41.33 %)	893,299 (1.89 %)	12,851,153 (33.54 %)	61,319 (2.55 %)
525	jaguar (hap1 2025) GCA_046562885.2	n/a	17,884 (1.68 %)	19,104 (1.41 %)	n/a	41.66 (100.00 %)	140 (0.00 %)	115 (100.00 %)	4,733,274 (41.33 %)	893,297 (1.89 %)	12,851,116 (33.53 %)	61,319 (2.55 %)
526	jaguar (Sample0147 2023) GCF_028533385.1	71,578 (4.12 %)	19,122 (1.67 %)	21,950 (1.36 %)	n/a	41.58 (99.31 %)	56,371 (0.70 %)	36,243 (100.00 %)	4,552,854 (33.37 %)	897,371 (1.63 %)	13,732,912 (32.89 %)	63,777 (2.41 %)
527	jaguar (v1 hap2 2025) GCA_046562875.1	n/a	18,867 (1.64 %)	20,784 (1.40 %)	n/a	41.76 (100.00 %)	200 (0.00 %)	85 (100.00 %)	4,977,843 (41.75 %)	982,064 (2.10 %)	13,365,332 (34.16 %)	66,000 (2.75 %)
528	jaguar (v2 hap2 2025) GCA_046562875.2	n/a	18,869 (1.64 %)	20,781 (1.40 %)	n/a	41.76 (100.00 %)	200 (0.00 %)	85 (100.00 %)	5,097,971 (41.83 %)	982,064 (2.10 %)	13,365,332 (34.16 %)	66,000 (2.75 %)
529	jaguarundi GCF_014898765.1	72,564 (3.15 %)	18,602 (1.64 %)	20,510 (1.39 %)	n/a	41.75 (97.85 %)	42,499 (2.16 %)	10,948 (100.00 %)	5,035,745 (43.29 %)	907,329 (1.61 %)	13,590,905 (33.57 %)	69,090 (2.29 %)
530	Jamaican fruit-eating bat (1a 2020 Wuhan U) GCF_014825515.1	48,692 (2.72 %)	19,921 (1.66 %)	23,614 (1.68 %)	39,384 (2.12 %)	41.95 (98.87 %)	110,840 (1.13 %)	56,740 (100.00 %)	2,972,388 (28.79 %)	405,474 (2.15 %)	12,458,880 (30.65 %)	61,973 (1.87 %)
531	Jamaican fruit-eating bat (2021) GCF_021234435.1	55,114 (3.18 %)	17,875 (1.68 %)	19,958 (1.66 %)	n/a	42.00 (100.00 %)	3 (0.00 %)	868 (100.00 %)	2,697,287 (28.17 %)	318,700 (0.84 %)	11,750,329 (31.61 %)	61,951 (1.93 %)
532	Japanese wild mouse (2022) GCA_921999095.2	n/a	23,292 (2.05 %)	20,114 (1.31 %)	n/a	41.71 (100.00 %)	397 (0.00 %)	1,449 (100.00 %)	4,952,306 (42.53 %)	1,635,456 (4.60 %)	12,838,321 (38.56 %)	24,168 (0.56 %)
533	Java mouse-deer (US108 2019 Broad) GCA_004024965.1	n/a	23,081 (1.38 %)	38,181 (1.41 %)	n/a	42.73 (99.91 %)	2,829 (0.01 %)	1,159,819 (99.99 %)	4,791,310 (34.97 %)	448,498 (1.92 %)	13,175,375 (39.89 %)	68,778 (2.92 %)
534	kiang (wild_1 2025) GCA_052150635.1	n/a	18,140 (1.70 %)	20,652 (1.44 %)	n/a	n/a	n/a	27 (100.00 %)	4,377,664 (45.26 %)	349,813 (2.17 %)	14,698,895 (30.82 %)	41,765 (2.48 %)
535	killer whale (2022) GCF_937001465.1	78,479 (3.76 %)	18,710 (1.51 %)	21,101 (1.30 %)	34,448 (1.49 %)	41.91 (100.00 %)	123 (0.00 %)	448 (100.00 %)	3,955,401 (36.81 %)	844,672 (9.94 %)	12,233,568 (41.63 %)	77,307 (3.08 %)
536	killer whale (alternate hap 2022) GCA_937001455.1	n/a	14,982 (1.50 %)	19,185 (1.30 %)	n/a	42.13 (100.00 %)	n/a	12,410 (100.00 %)	2,752,892 (35.61 %)	589,217 (10.15 %)	8,371,032 (41.11 %)	57,347 (3.41 %)
537	killer whale (Morgan 2013) GCF_000331955.2	70,972 (3.55 %)	18,736 (1.86 %)	20,365 (1.48 %)	n/a	41.35 (94.82 %)	78,441 (5.20 %)	80,100 (94.80 %)	3,978,339 (43.98 %)	555,737 (1.13 %)	12,773,973 (31.51 %)	61,145 (1.59 %)
538	killer whale (primary hap 2022) GCA_937001465.1	n/a	18,847 (1.59 %)	21,099 (1.30 %)	n/a	41.91 (100.00 %)	123 (0.00 %)	448 (100.00 %)	4,361,647 (43.69 %)	844,672 (9.94 %)	12,233,548 (41.63 %)	77,307 (3.08 %)
539	klipspringer (KSP-560 2019) GCA_006410675.1	n/a	22,317 (1.37 %)	27,606 (1.31 %)	n/a	42.04 (89.74 %)	371,212 (10.28 %)	396,104 (89.72 %)	6,379,883 (45.04 %)	726,514 (5.64 %)	15,472,957 (34.77 %)	50,579 (1.00 %)
540	koala (Bilbo 61053 2022 genbank) GCA_003287225.2	n/a	17,087 (0.81 %)	14,711 (0.86 %)	n/a	39.05 (100.00 %)	669 (0.00 %)	1,246 (100.00 %)	6,280,029 (29.77 %)	1,123,294 (2.02 %)	21,796,316 (39.24 %)	15,957 (0.35 %)
541	koala (Bilbo 61053 2022 refseq) GCF_003287225.1	50,393 (2.58 %)	17,125 (0.85 %)	14,711 (0.86 %)	n/a	39.05 (100.00 %)	669 (0.00 %)	1,246 (100.00 %)	10,370,789 (60.23 %)	1,123,294 (2.02 %)	21,796,035 (39.24 %)	15,957 (0.35 %)
542	koala (Bilbo 61053 2025) GCA_003287225.3	n/a	17,123 (0.85 %)	14,700 (0.86 %)	n/a	39.06 (100.00 %)	664 (0.00 %)	1,239 (100.00 %)	10,358,875 (60.22 %)	1,121,543 (2.02 %)	21,754,367 (39.21 %)	15,940 (0.35 %)
543	Kuhl's pipistrelle (2020) GCF_014108245.1	65,654 (3.37 %)	17,918 (1.89 %)	20,819 (1.86 %)	n/a	42.57 (99.31 %)	394 (0.69 %)	202 (100.00 %)	2,897,422 (23.58 %)	797,420 (2.76 %)	10,057,100 (34.56 %)	55,965 (2.99 %)
544	Kuhl's pipistrelle (primary hap 2025) GCA_014108245.2	n/a	17,770 (2.01 %)	20,646 (1.86 %)	n/a	42.57 (99.31 %)	522 (0.69 %)	82 (100.00 %)	4,542,064 (41.94 %)	797,434 (2.76 %)	10,057,037 (34.56 %)	55,766 (2.87 %)
545	large flying fox GCF_000151845.1	52,243 (3.10 %)	18,454 (1.91 %)	23,631 (1.73 %)	n/a	39.82 (91.80 %)	189,340 (8.24 %)	225,433 (91.76 %)	3,117,045 (36.49 %)	504,277 (3.03 %)	13,025,556 (25.00 %)	78,404 (3.24 %)
546	large Japanese field mouse (IB14-021 2017) GCA_002335545.1	n/a	22,630 (1.74 %)	33,810 (1.26 %)	n/a	42.04 (57.78 %)	4,289,924 (42.35 %)	4,626,044 (57.65 %)	3,638,537 (31.76 %)	1,048,253 (1.87 %)	12,039,926 (16.61 %)	19,817 (0.34 %)
547	large tree shrew (BS70 2022) GCA_026018925.1	n/a	21,678 (1.34 %)	22,317 (1.25 %)	n/a	42.17 (100.00 %)	1,188 (0.00 %)	1,198 (100.00 %)	5,530,547 (22.20 %)	1,357,640 (10.13 %)	14,334,312 (46.09 %)	123,453 (2.17 %)
548	large tree shrew (BS70 2025) GCA_026018925.2	n/a	21,760 (1.34 %)	22,479 (1.26 %)	n/a	42.17 (100.00 %)	1,263 (0.00 %)	1,209 (100.00 %)	6,876,878 (36.82 %)	1,357,671 (10.13 %)	14,333,971 (46.09 %)	123,449 (2.17 %)
549	least weasel (hap1 2026) GCA_057128415.1	n/a	18,939 (1.27 %)	22,764 (1.19 %)	n/a	42.71 (99.36 %)	600 (0.64 %)	4,178 (100.00 %)	6,149,771 (53.28 %)	869,596 (6.56 %)	13,236,177 (44.78 %)	66,312 (2.12 %)
550	least weasel (hap1.1 2025 genbank) GCA_964662115.1	n/a	19,085 (1.11 %)	23,074 (1.09 %)	n/a	43.54 (99.98 %)	2,938 (0.02 %)	3,189 (100.00 %)	4,687,333 (25.05 %)	908,610 (10.98 %)	12,922,050 (49.64 %)	68,749 (2.22 %)
551	least weasel (hap1.1 2025 refseq) GCF_964662115.1	87,413 (2.56 %)	19,035 (1.16 %)	23,079 (1.09 %)	n/a	43.54 (99.98 %)	2,938 (0.02 %)	6,117 (99.98 %)	6,208,263 (57.37 %)	908,609 (10.98 %)	12,922,009 (49.64 %)	68,748 (2.22 %)
552	least weasel (hap2 2026) GCA_057128425.1	n/a	18,078 (1.29 %)	21,580 (1.20 %)	n/a	42.81 (99.66 %)	460 (0.34 %)	4,263 (100.00 %)	5,771,273 (52.83 %)	811,406 (6.89 %)	12,416,602 (44.69 %)	62,699 (2.08 %)
553	least weasel (hap2.1 2025) GCA_964662095.1	n/a	18,255 (1.29 %)	22,201 (1.27 %)	n/a	42.68 (99.98 %)	2,709 (0.02 %)	4,948 (99.98 %)	4,268,233 (27.47 %)	787,850 (6.40 %)	12,592,088 (42.54 %)	62,416 (2.34 %)
554	leopard (Hobbes primary hap 2022) GCF_024362965.1	70,501 (3.29 %)	18,472 (1.56 %)	20,388 (1.41 %)	n/a	41.75 (99.99 %)	335 (0.01 %)	382 (100.00 %)	4,634,038 (33.80 %)	932,991 (2.25 %)	13,686,652 (34.03 %)	65,793 (2.64 %)
555	leopard (Maewha 2016 refseq) GCF_001857705.1	73,279 (3.20 %)	18,881 (1.63 %)	21,010 (1.44 %)	n/a	41.71 (96.17 %)	214,953 (3.85 %)	265,330 (96.15 %)	5,247,029 (42.87 %)	1,059,446 (5.13 %)	14,265,573 (32.20 %)	77,001 (2.45 %)
556	leopard cat GCF_016509475.1	59,965 (3.05 %)	18,472 (1.65 %)	19,934 (1.38 %)	n/a	41.80 (100.00 %)	56 (0.00 %)	123 (100.00 %)	4,978,115 (43.28 %)	901,754 (1.84 %)	13,596,535 (34.23 %)	67,390 (2.50 %)
557	Leschenault's rousette (2020) GCA_015472975.1	n/a	17,815 (2.05 %)	23,917 (1.90 %)	n/a	40.13 (99.14 %)	100,669 (0.88 %)	108,810 (99.12 %)	2,688,705 (31.20 %)	428,968 (1.19 %)	12,245,385 (26.51 %)	58,118 (6.81 %)
558	lesser Egyptian jerboa (2021) GCF_020740685.1	51,730 (1.99 %)	20,129 (1.24 %)	22,089 (1.24 %)	40,414 (1.76 %)	42.00 (99.52 %)	561 (0.48 %)	160 (100.00 %)	7,346,291 (41.25 %)	1,187,587 (2.92 %)	14,222,177 (44.13 %)	34,688 (0.86 %)
559	lesser Egyptian jerboa (alternate hap 2021) GCA_020740715.1	n/a	17,777 (1.27 %)	19,232 (1.28 %)	n/a	42.13 (92.75 %)	2,875 (7.25 %)	508 (100.00 %)	6,476,967 (33.93 %)	999,133 (2.78 %)	11,809,834 (40.52 %)	29,872 (0.82 %)
560	lesser Egyptian jerboa (JJ0015 2012 refseq) GCF_000280705.1	25,978 (1.44 %)	19,408 (1.38 %)	20,312 (1.35 %)	n/a	41.87 (87.17 %)	326,464 (12.87 %)	337,360 (87.13 %)	6,125,934 (38.31 %)	832,825 (1.53 %)	13,661,612 (33.98 %)	26,669 (0.59 %)
561	lesser Egyptian jerboa (primary hap 2021) GCA_020740685.1	n/a	20,129 (1.24 %)	22,086 (1.24 %)	n/a	42.00 (99.52 %)	561 (0.48 %)	159 (100.00 %)	6,288,871 (38.51 %)	1,187,585 (2.92 %)	14,221,962 (44.13 %)	34,688 (0.86 %)
562	lesser false vampire bat (Vietnam 20211001_DDb alternate hap 2024) GCA_043880535.1	n/a	1,572 (0.57 %)	3,175 (1.45 %)	n/a	41.82 (100.00 %)	n/a	2,678 (100.00 %)	286,260 (35.16 %)	107,917 (13.71 %)	1,232,326 (51.86 %)	5,144 (2.91 %)
563	lesser false vampire bat (Vietnam 20211001_DDb primary hap 2024) GCA_043880595.1	n/a	18,484 (1.87 %)	24,356 (1.84 %)	n/a	41.88 (97.91 %)	866 (2.09 %)	617 (99.68 %)	3,419,622 (36.65 %)	663,182 (2.53 %)	11,508,574 (30.58 %)	84,174 (4.85 %)
564	lesser horseshoe bat (hap1 2024) GCA_964194185.1	n/a	19,031 (1.88 %)	21,003 (1.63 %)	n/a	40.81 (99.99 %)	1,627 (0.01 %)	723 (100.00 %)	3,133,745 (33.46 %)	660,064 (3.79 %)	11,720,176 (32.32 %)	35,414 (1.75 %)
565	lesser horseshoe bat (hap2 2024) GCA_964194215.1	n/a	18,875 (1.72 %)	21,166 (1.58 %)	n/a	41.18 (99.99 %)	1,648 (0.01 %)	2,727 (99.99 %)	3,160,659 (34.00 %)	696,130 (6.23 %)	11,662,645 (34.26 %)	36,176 (1.80 %)
566	lesser horseshoe bat (hap2.2 2025) GCA_964194215.2	n/a	18,974 (1.81 %)	21,191 (1.58 %)	n/a	41.18 (100.00 %)	56 (0.00 %)	1,036 (100.00 %)	3,652,081 (41.23 %)	696,117 (6.18 %)	11,690,617 (34.28 %)	36,376 (1.84 %)
567	lesser horseshoe bat (mRhiHip2.hap1.1 2024) GCF_964194185.1	59,989 (3.28 %)	18,874 (1.86 %)	21,002 (1.63 %)	n/a	40.81 (99.99 %)	1,627 (0.01 %)	723 (100.00 %)	3,621,058 (40.92 %)	660,064 (3.79 %)	11,719,468 (32.32 %)	35,414 (1.75 %)
568	lesser noctule (v2 hap1 2025) GCA_964264875.2	n/a	18,342 (1.54 %)	22,974 (1.62 %)	n/a	43.04 (100.00 %)	302 (0.00 %)	588 (100.00 %)	4,258,096 (37.31 %)	1,289,911 (11.51 %)	9,694,758 (42.52 %)	65,974 (2.80 %)
569	lesser noctule (v2 hap2 2025) GCA_964264895.2	n/a	17,492 (1.62 %)	22,188 (1.72 %)	n/a	43.10 (100.00 %)	247 (0.00 %)	920 (100.00 %)	3,886,341 (36.52 %)	1,139,308 (10.89 %)	9,356,457 (40.65 %)	62,254 (3.00 %)
570	lesser panda (RP43 2017) GCA_002007465.1	n/a	19,120 (1.69 %)	20,591 (1.50 %)	n/a	41.60 (98.56 %)	137,333 (1.45 %)	148,922 (98.55 %)	4,513,888 (40.87 %)	692,778 (1.62 %)	13,691,859 (31.36 %)	64,369 (2.52 %)
571	lesser sac-winged bat (alternate hap 2024) GCA_036851165.1	n/a	18,593 (1.42 %)	23,334 (1.46 %)	n/a	41.84 (100.00 %)	n/a	4,715 (100.00 %)	6,471,175 (42.04 %)	1,030,472 (2.62 %)	12,509,696 (42.43 %)	96,414 (2.05 %)
572	lesser sac-winged bat (primary hap 2024 refseq) GCF_036850995.1	53,210 (2.49 %)	18,323 (1.42 %)	21,350 (1.39 %)	n/a	41.84 (99.24 %)	573 (0.76 %)	168 (100.00 %)	4,224,344 (28.69 %)	1,030,576 (2.60 %)	12,591,989 (42.30 %)	98,189 (2.06 %)
573	lion GCF_018350215.1	67,745 (2.86 %)	17,956 (1.69 %)	19,033 (1.40 %)	61,242 (3.04 %)	41.71 (100.00 %)	55 (0.00 %)	99 (100.00 %)	4,666,951 (42.23 %)	889,987 (1.87 %)	13,151,686 (33.40 %)	62,675 (2.56 %)
574	little brown bat GCF_000147115.1	50,660 (2.76 %)	19,314 (1.86 %)	22,683 (1.70 %)	n/a	42.50 (96.66 %)	61,131 (3.35 %)	72,785 (96.65 %)	3,682,263 (37.05 %)	634,854 (2.15 %)	10,841,759 (33.45 %)	57,630 (1.79 %)
575	little brown bat (MYLU1 2025) GCA_048340685.1	n/a	19,097 (1.88 %)	23,530 (1.86 %)	n/a	n/a	19 (0.00 %)	260 (100.00 %)	4,829,738 (45.55 %)	736,597 (4.59 %)	10,775,147 (36.89 %)	65,367 (2.64 %)
576	little pocket mouse (longimembris alternate hap 2022) GCA_024363435.1	n/a	19,150 (1.52 %)	23,435 (1.64 %)	n/a	42.08 (100.00 %)	229 (0.00 %)	718 (100.00 %)	n/a	1,051,300 (12.43 %)	9,858,628 (43.20 %)	48,101 (2.62 %)
577	little pocket mouse (longimembris primary hap 2022) GCA_024363575.1	n/a	19,760 (1.50 %)	24,317 (1.63 %)	n/a	42.09 (100.00 %)	215 (0.00 %)	1,135 (100.00 %)	3,913,744 (28.43 %)	1,095,577 (12.70 %)	10,273,833 (43.74 %)	49,636 (2.61 %)
578	little tube-nosed bat GCA_004026665.1	n/a	22,009 (1.26 %)	45,725 (1.35 %)	n/a	43.80 (99.90 %)	6,795 (0.03 %)	886,972 (99.97 %)	3,372,804 (23.57 %)	1,014,476 (3.00 %)	11,948,592 (41.18 %)	71,530 (2.05 %)
579	little yellow-shouldered Mesoamerican bat (hap1 2026) GCA_054855685.1	n/a	18,026 (1.60 %)	20,157 (1.49 %)	n/a	42.76 (100.00 %)	107 (0.00 %)	948 (100.00 %)	4,010,797 (44.26 %)	492,856 (4.68 %)	11,967,529 (35.61 %)	67,991 (1.87 %)
580	little yellow-shouldered Mesoamerican bat (hap2 2026) GCA_054855695.1	n/a	16,884 (1.64 %)	18,316 (1.50 %)	n/a	42.71 (100.00 %)	83 (0.00 %)	703 (100.00 %)	3,651,686 (43.73 %)	427,096 (4.49 %)	11,079,759 (34.79 %)	61,324 (1.78 %)
581	long-eared Myotis (MEvo1 2026) GCA_056320405.1	n/a	18,838 (1.86 %)	22,426 (1.74 %)	n/a	n/a	7 (0.00 %)	117 (100.00 %)	5,331,049 (47.95 %)	765,473 (4.53 %)	10,475,330 (37.51 %)	69,110 (2.76 %)
582	long-finned pilot whale (alternate hap 2024) GCA_963455345.2	n/a	17,552 (1.56 %)	25,954 (1.35 %)	n/a	42.12 (100.00 %)	n/a	28,097 (100.00 %)	3,815,058 (48.74 %)	789,873 (8.23 %)	9,845,230 (38.66 %)	58,137 (3.47 %)
583	long-finned pilot whale (v2 primary hap 2024 refseq) GCF_963455315.2	61,447 (2.80 %)	18,725 (1.51 %)	20,946 (1.39 %)	n/a	42.38 (99.99 %)	1,084 (0.01 %)	2,076 (99.99 %)	4,125,452 (35.62 %)	1,577,896 (12.03 %)	12,347,170 (42.01 %)	71,822 (5.51 %)
584	long-finned pilot whale (X-22926-18 2019) GCF_006547405.1	66,117 (3.28 %)	18,772 (1.80 %)	21,031 (1.46 %)	33,672 (1.78 %)	41.29 (99.58 %)	14,859 (0.42 %)	20,999 (99.58 %)	3,962,125 (45.58 %)	557,247 (1.11 %)	12,616,535 (34.70 %)	62,905 (1.69 %)
585	long-footed potoroo (2021) GCA_904812075.1	n/a	278 (19.06 %)	223 (16.20 %)	n/a	51.14 (99.50 %)	n/a	1,479 (100.00 %)	194 (1.83 %)	54 (0.32 %)	2,088 (5.90 %)	51 (2.47 %)
586	long-legged myotis (B2S1-22 2026) GCA_056320705.1	n/a	18,870 (1.84 %)	22,417 (1.72 %)	n/a	n/a	10 (0.00 %)	78 (100.00 %)	5,368,781 (48.20 %)	760,232 (4.69 %)	10,702,831 (37.62 %)	64,206 (2.40 %)
587	long-tailed chinchilla GCF_000276665.1	54,854 (2.98 %)	18,096 (1.59 %)	19,514 (1.52 %)	n/a	41.06 (95.56 %)	78,817 (4.46 %)	81,656 (95.54 %)	4,018,866 (30.94 %)	607,082 (1.15 %)	13,528,234 (28.15 %)	46,931 (1.25 %)
588	long-tongued fruit bat (US102 2019 Broad) GCA_004027375.1	n/a	19,208 (1.99 %)	31,180 (1.92 %)	n/a	39.56 (99.97 %)	2,056 (0.01 %)	174,041 (99.99 %)	2,893,453 (32.61 %)	597,516 (1.76 %)	12,093,608 (28.14 %)	63,015 (4.70 %)
589	Lowland paca GCA_004365215.1	n/a	21,953 (0.62 %)	56,356 (0.80 %)	n/a	40.83 (99.78 %)	3,060 (0.01 %)	3,771,510 (99.99 %)	5,892,507 (29.20 %)	802,811 (1.38 %)	18,630,883 (38.61 %)	61,715 (0.94 %)
590	Madagascan rousette (hap1 2026) GCA_059802055.1	n/a	17,416 (1.97 %)	23,244 (1.81 %)	n/a	40.37 (100.00 %)	50 (0.00 %)	78 (100.00 %)	3,077,702 (36.99 %)	514,081 (2.88 %)	12,173,492 (28.58 %)	63,249 (7.20 %)
591	Madagascan rousette (hap2 2026) GCA_059802175.1	n/a	16,694 (2.02 %)	21,640 (1.82 %)	n/a	40.41 (100.00 %)	39 (0.00 %)	65 (100.00 %)	2,881,737 (36.08 %)	472,529 (2.90 %)	11,388,923 (27.61 %)	58,575 (7.09 %)
592	Malagasy flying fox (hap1 2026) GCA_056363885.1	n/a	17,602 (1.89 %)	22,081 (1.69 %)	n/a	n/a	87 (0.00 %)	149 (100.00 %)	3,575,747 (41.30 %)	641,060 (5.08 %)	12,411,961 (30.96 %)	59,658 (4.27 %)
593	Malagasy straw-colored fruit bat (hap1 2026) GCA_059749095.1	n/a	17,913 (1.98 %)	21,869 (1.77 %)	n/a	39.73 (100.00 %)	103 (0.00 %)	81 (100.00 %)	2,947,096 (34.06 %)	499,471 (2.74 %)	12,180,358 (28.48 %)	53,093 (4.84 %)
594	Malagasy straw-colored fruit bat (hap2 2026) GCA_059749105.1	n/a	17,938 (1.99 %)	21,961 (1.77 %)	n/a	39.68 (100.00 %)	91 (0.00 %)	54 (100.00 %)	2,950,196 (34.03 %)	496,069 (2.49 %)	12,277,483 (28.35 %)	52,990 (4.61 %)
595	Malayan pangolin (MJ-LG 2024) GCF_040802235.1	87,404 (4.24 %)	18,382 (1.54 %)	19,802 (1.30 %)	n/a	41.03 (100.00 %)	90 (0.00 %)	63 (100.00 %)	3,146,889 (38.39 %)	384,539 (2.15 %)	12,642,995 (34.68 %)	48,454 (1.30 %)
596	Malayan pangolin (MP_PG03-UM 2016 refseq) GCF_001685135.1	48,591 (2.76 %)	19,458 (1.57 %)	24,783 (1.38 %)	41,272 (1.95 %)	40.78 (92.27 %)	984,658 (7.81 %)	80,670 (100.00 %)	3,064,599 (35.21 %)	866,309 (3.08 %)	13,310,859 (28.76 %)	35,558 (0.84 %)
597	Malayan pangolin YNU ManJav 2.0 GCF_014570535.1	68,043 (3.50 %)	18,167 (1.72 %)	20,453 (1.54 %)	n/a	40.83 (91.78 %)	57,746 (8.23 %)	17,969 (100.00 %)	2,864,567 (34.23 %)	277,996 (1.69 %)	12,659,207 (25.72 %)	33,486 (1.00 %)
598	marsupial mole (Waite Creek area ABTC07570 2025) GCA_048126345.1	n/a	25,281 (0.80 %)	18,740 (0.87 %)	n/a	37.80 (99.99 %)	196 (0.01 %)	889 (99.99 %)	6,538,990 (26.08 %)	1,450,668 (2.40 %)	21,374,371 (47.19 %)	17,923 (0.30 %)
599	Masai giraffe (alternate hap 2026) GCA_054371575.1	n/a	17,968 (1.65 %)	19,375 (1.35 %)	n/a	42.09 (100.00 %)	1 (0.00 %)	15 (100.00 %)	5,097,065 (47.28 %)	419,165 (2.46 %)	11,795,337 (39.58 %)	41,621 (1.98 %)
600	Masai giraffe (MA1 2016 Penn St) GCA_001651235.1	n/a	20,950 (1.52 %)	28,854 (1.33 %)	n/a	41.39 (96.50 %)	257,672 (3.48 %)	770,838 (96.52 %)	5,502,479 (43.94 %)	531,418 (2.64 %)	13,936,018 (36.18 %)	40,504 (1.02 %)
601	Masai giraffe (primary hap 2026 genbank) GCA_054371585.1	n/a	18,881 (1.61 %)	20,786 (1.36 %)	n/a	42.10 (100.00 %)	n/a	17 (100.00 %)	5,464,683 (47.98 %)	447,812 (2.90 %)	12,442,051 (40.00 %)	44,333 (2.00 %)
602	Masai giraffe (primary hap 2026 refseq) GCF_054371585.1	146,626 (4.30 %)	18,883 (1.61 %)	20,802 (1.36 %)	n/a	42.10 (100.00 %)	n/a	16 (100.00 %)	5,464,676 (47.98 %)	447,812 (2.90 %)	12,441,991 (40.00 %)	44,333 (2.00 %)
603	meadow jumping mouse GCA_004024765.1	n/a	22,236 (1.08 %)	44,719 (1.21 %)	n/a	42.31 (99.88 %)	7,610 (0.03 %)	1,165,710 (99.97 %)	6,135,446 (33.31 %)	1,525,146 (3.34 %)	13,854,475 (39.91 %)	26,633 (0.68 %)
604	meadow vole (hap1 2024 genbank) GCA_037038515.1	n/a	19,134 (1.78 %)	20,672 (1.55 %)	n/a	42.38 (100.00 %)	60 (0.00 %)	181 (100.00 %)	4,818,689 (41.90 %)	962,362 (4.16 %)	12,161,222 (34.42 %)	23,781 (0.74 %)
605	meadow vole (hap1 2024 refseq) GCF_037038515.1	56,969 (2.88 %)	19,974 (1.74 %)	20,672 (1.55 %)	n/a	42.38 (100.00 %)	60 (0.00 %)	180 (100.00 %)	4,116,239 (33.62 %)	962,362 (4.16 %)	12,161,153 (34.42 %)	23,781 (0.74 %)
606	meadow vole (hap2 2024) GCA_037039175.1	n/a	19,001 (1.82 %)	20,271 (1.68 %)	n/a	42.58 (100.00 %)	53 (0.00 %)	143 (100.00 %)	3,141,368 (21.37 %)	898,900 (4.24 %)	11,475,531 (32.14 %)	22,186 (0.75 %)
607	meerkat (VVHF042 2019 DNA Zoo refseq) GCF_006229205.1	58,806 (2.67 %)	19,009 (1.64 %)	19,088 (1.36 %)	n/a	41.68 (99.72 %)	65,245 (0.28 %)	63,791 (100.00 %)	4,564,931 (40.13 %)	634,179 (1.21 %)	13,631,635 (32.17 %)	64,858 (2.22 %)
608	melon-headed whale (hap1 2025) GCA_051427945.1	n/a	18,643 (1.64 %)	20,840 (1.43 %)	n/a	42.07 (100.00 %)	84 (0.00 %)	204 (100.00 %)	5,100,394 (52.00 %)	1,312,199 (7.54 %)	12,322,262 (38.99 %)	69,873 (4.58 %)
609	melon-headed whale (hap2 2025) GCA_051427955.1	n/a	17,790 (1.73 %)	19,805 (1.50 %)	n/a	41.92 (100.00 %)	65 (0.00 %)	167 (100.00 %)	4,595,309 (50.05 %)	975,539 (5.44 %)	11,730,402 (37.10 %)	65,883 (3.79 %)
610	Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 alternate hap 2022) GCA_024711525.1	n/a	18,555 (1.22 %)	24,508 (1.35 %)	n/a	42.04 (100.00 %)	181 (0.00 %)	3,482 (100.00 %)	6,419,007 (53.84 %)	1,384,128 (15.63 %)	11,486,822 (50.51 %)	38,521 (1.60 %)
611	Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 primary hap 2022 genbank) GCA_024711535.1	n/a	21,281 (1.16 %)	28,592 (1.34 %)	n/a	42.27 (100.00 %)	182 (0.00 %)	4,354 (100.00 %)	4,378,955 (29.66 %)	1,568,842 (17.75 %)	12,889,786 (51.96 %)	46,167 (1.71 %)
612	Merriam's kangaroo rat (MVZ:Mamm:240054 primary hap 2022 refseq) GCF_024711535.1	68,331 (2.37 %)	21,280 (1.16 %)	28,582 (1.34 %)	n/a	42.27 (100.00 %)	182 (0.00 %)	4,535 (100.00 %)	4,378,949 (29.66 %)	1,568,842 (17.75 %)	12,889,725 (51.96 %)	46,167 (1.71 %)
613	Merriam's long-tongued bat (hap1 2024) GCA_039655065.1	n/a	18,172 (1.67 %)	20,736 (1.60 %)	n/a	42.19 (100.00 %)	47 (0.00 %)	82 (100.00 %)	2,998,913 (29.48 %)	418,833 (1.07 %)	11,783,716 (32.96 %)	65,956 (4.38 %)
614	Merriam's long-tongued bat (hap2 2024) GCA_039656995.1	n/a	18,105 (1.68 %)	20,751 (1.60 %)	n/a	42.18 (100.00 %)	45 (0.00 %)	71 (100.00 %)	2,994,788 (29.48 %)	415,375 (1.07 %)	11,752,432 (32.88 %)	65,597 (4.38 %)
615	mesic four-striped grass rat (FMNH 192475 2021) GCA_019844195.1	n/a	18,926 (2.00 %)	20,713 (1.46 %)	n/a	41.06 (99.08 %)	121,340 (0.94 %)	152,293 (99.06 %)	6,081,188 (43.08 %)	1,497,646 (3.55 %)	13,086,584 (30.02 %)	15,700 (0.46 %)
616	Mesoamerican common mustached bat (primary hap 2026) GCA_056363955.1	n/a	18,206 (1.82 %)	21,154 (1.65 %)	n/a	41.47 (100.00 %)	60 (0.00 %)	27 (100.00 %)	2,457,342 (32.26 %)	349,146 (1.10 %)	12,607,430 (31.43 %)	54,759 (4.86 %)
617	Mexican gray wolf (hap1 2025 refseq) GCF_048164855.1	112,768 (4.40 %)	19,582 (1.52 %)	20,911 (1.39 %)	n/a	41.56 (100.00 %)	167 (0.00 %)	249 (100.00 %)	4,598,813 (31.70 %)	1,102,136 (4.40 %)	13,591,364 (35.18 %)	53,470 (2.24 %)
618	Mexican gray wolf (hap2 2025) GCA_048164845.1	n/a	18,738 (1.56 %)	19,759 (1.41 %)	n/a	41.58 (100.00 %)	124 (0.00 %)	155 (100.00 %)	4,265,479 (32.40 %)	1,030,876 (4.11 %)	12,818,772 (34.22 %)	50,269 (2.22 %)
619	minke whale (2013 refseq) GCF_000493695.1	42,553 (2.38 %)	19,159 (1.73 %)	18,656 (1.42 %)	n/a	40.94 (94.06 %)	173,296 (5.96 %)	184,072 (94.04 %)	n/a	573,951 (1.48 %)	13,504,347 (30.96 %)	65,448 (1.38 %)
620	minke whale (alternate hap 2023) GCA_950005055.1	n/a	20,412 (1.46 %)	27,421 (1.34 %)	n/a	41.50 (100.00 %)	1 (0.00 %)	21,272 (100.00 %)	3,811,435 (36.24 %)	959,712 (10.27 %)	12,159,896 (41.30 %)	69,852 (1.62 %)
621	minke whale (primary hap 2023 refseq) GCF_949987535.1	61,711 (2.51 %)	19,550 (1.49 %)	21,499 (1.26 %)	n/a	41.55 (99.99 %)	1,177 (0.01 %)	1,374 (100.00 %)	4,006,927 (35.92 %)	1,058,105 (12.08 %)	12,708,103 (42.66 %)	72,756 (1.59 %)
622	Mongolian gerbil (243 2017 Lucigen Corp.) GCF_002204375.1	40,359 (2.29 %)	21,215 (1.83 %)	24,305 (1.47 %)	n/a	42.09 (95.23 %)	91,601 (4.78 %)	68,793 (100.00 %)	4,821,343 (37.74 %)	940,776 (1.82 %)	13,848,274 (31.31 %)	24,154 (0.74 %)
623	Mongolian gerbil (EAM2014 2019 BGI) GCA_008131255.1	n/a	19,952 (1.59 %)	23,462 (1.36 %)	n/a	41.98 (99.01 %)	103,843 (0.97 %)	412,933 (99.03 %)	5,009,454 (0.00 %)	1,042,929 (2.52 %)	14,121,194 (34.63 %)	26,044 (0.71 %)
624	Mongolian gerbil (TT.TT164.6M 2023) GCF_030254825.1	65,502 (2.97 %)	19,045 (1.53 %)	20,203 (1.29 %)	n/a	41.87 (100.00 %)	53 (0.00 %)	193 (100.00 %)	4,477,607 (37.21 %)	1,124,432 (5.22 %)	13,244,320 (39.20 %)	25,300 (0.76 %)
625	monito del monte (mDroGli1 alternate hap 2021) GCA_019395325.1	n/a	16,419 (0.77 %)	17,219 (0.89 %)	n/a	39.03 (100.00 %)	33 (0.00 %)	9,959 (100.00 %)	6,332,360 (29.69 %)	1,065,454 (2.09 %)	17,908,986 (42.25 %)	13,856 (0.35 %)
626	monito del monte (primary hap 2021 refseq) GCF_019393635.1	47,034 (2.02 %)	18,399 (0.80 %)	15,519 (0.85 %)	n/a	39.11 (99.91 %)	260 (0.09 %)	17 (100.00 %)	9,107,968 (41.08 %)	1,249,635 (2.12 %)	21,135,324 (42.80 %)	16,598 (0.36 %)
627	Montane guinea pig GCA_004027695.1	n/a	20,064 (1.06 %)	31,321 (1.18 %)	39,905 (1.42 %)	40.09 (99.88 %)	11,321 (0.04 %)	1,379,500 (99.96 %)	4,730,634 (30.02 %)	1,583,664 (6.57 %)	15,806,339 (40.40 %)	37,371 (0.76 %)
628	moose/elk (2024) GCA_964270355.1	n/a	19,816 (1.60 %)	22,341 (1.44 %)	n/a	41.70 (100.00 %)	3 (0.00 %)	1,737 (100.00 %)	3,099,775 (24.20 %)	406,796 (2.52 %)	13,117,056 (38.34 %)	50,644 (1.33 %)
629	moose/elk (AALL_1980 2023) GCA_015832495.2	n/a	19,116 (1.66 %)	21,184 (1.45 %)	n/a	41.55 (95.50 %)	71,769 (4.51 %)	77,708 (95.49 %)	3,026,678 (23.77 %)	373,266 (0.91 %)	13,167,376 (34.08 %)	44,302 (1.21 %)
630	moose/elk (MIG12-28694850 2019) GCA_007570765.1	n/a	21,375 (1.65 %)	26,769 (1.42 %)	n/a	41.64 (92.66 %)	83,831 (7.35 %)	131,373 (92.65 %)	5,022,053 (43.27 %)	384,658 (1.22 %)	13,422,381 (34.52 %)	49,216 (1.18 %)
631	Mount Data shrew rat (FMNH 198792 2021) GCA_019843965.1	n/a	18,266 (2.07 %)	18,451 (1.45 %)	n/a	41.51 (99.45 %)	47,796 (0.55 %)	61,989 (99.45 %)	5,656,524 (42.94 %)	1,120,762 (2.44 %)	12,212,163 (29.98 %)	15,204 (0.46 %)
632	mountain beaver GCA_004027875.1	n/a	22,428 (1.10 %)	38,670 (1.12 %)	n/a	40.58 (99.89 %)	7,253 (0.02 %)	1,286,779 (99.98 %)	5,859,004 (32.29 %)	914,052 (2.37 %)	16,249,666 (38.21 %)	39,133 (0.76 %)
633	mountain bongo (Barney_WCC 2024) GCA_040438115.1	n/a	19,857 (1.47 %)	21,826 (1.20 %)	n/a	41.99 (96.15 %)	62,885 (3.86 %)	34,537 (100.00 %)	6,342,707 (52.09 %)	474,043 (1.33 %)	13,361,157 (42.94 %)	42,078 (0.91 %)
634	mouse-eared bat (LE001 2026) GCA_056320415.1	n/a	18,664 (1.84 %)	22,232 (1.72 %)	n/a	n/a	35 (0.00 %)	156 (100.00 %)	5,281,017 (47.77 %)	758,373 (5.26 %)	10,631,233 (37.39 %)	61,798 (2.53 %)
635	muskrat GCA_004026605.1	n/a	22,540 (1.52 %)	32,136 (1.35 %)	n/a	41.59 (99.93 %)	6,243 (0.02 %)	571,599 (99.98 %)	4,437,736 (28.49 %)	922,826 (2.38 %)	13,945,732 (35.23 %)	19,876 (0.50 %)
636	naked mole-rat (2022) GCA_944319725.1	n/a	20,755 (1.51 %)	20,024 (1.35 %)	n/a	39.98 (99.96 %)	2,332 (0.04 %)	264 (100.00 %)	3,593,261 (30.76 %)	529,045 (1.14 %)	13,294,831 (36.07 %)	32,235 (0.93 %)
637	naked mole-rat (maternal 2024) GCA_964261345.1	n/a	19,980 (1.56 %)	19,365 (1.33 %)	n/a	39.96 (99.93 %)	2,238 (0.07 %)	263 (100.00 %)	5,099,610 (44.65 %)	523,459 (1.13 %)	13,036,461 (35.91 %)	31,614 (0.92 %)
638	naked mole-rat (MEF-2018 2020) GCA_014060925.1	n/a	22,011 (1.30 %)	21,392 (1.22 %)	n/a	40.13 (95.11 %)	139,535 (4.91 %)	148,797 (95.09 %)	4,885,102 (35.91 %)	654,418 (1.90 %)	16,401,315 (34.21 %)	40,717 (0.98 %)
639	naked mole-rat (NMR 29 2012 refseq) GCF_000247695.1	74,587 (3.56 %)	21,332 (1.74 %)	20,861 (1.51 %)	n/a	40.21 (88.43 %)	110,424 (11.59 %)	114,653 (88.41 %)	4,179,991 (32.69 %)	484,933 (0.92 %)	13,672,561 (27.63 %)	31,950 (0.88 %)
640	naked mole-rat (pHap 2024) GCA_964261355.1	n/a	19,953 (1.57 %)	19,579 (1.35 %)	n/a	39.98 (99.91 %)	2,381 (0.09 %)	264 (100.00 %)	5,097,978 (44.61 %)	523,861 (1.13 %)	13,168,788 (36.09 %)	31,789 (0.93 %)
641	narwhal GCA_005190385.4	n/a	18,678 (1.79 %)	19,820 (1.40 %)	n/a	41.26 (100.00 %)	323 (0.00 %)	91 (100.00 %)	4,018,392 (43.94 %)	611,903 (1.52 %)	12,641,524 (35.02 %)	60,518 (1.78 %)
642	narwhal (Baffin Bay 2019) GCF_005190385.1	51,639 (2.71 %)	18,741 (1.78 %)	20,365 (1.40 %)	33,148 (1.79 %)	41.22 (99.52 %)	18,323 (0.49 %)	6,972 (100.00 %)	4,011,742 (43.97 %)	565,367 (1.22 %)	12,720,018 (34.85 %)	60,492 (1.58 %)
643	narwhal (Baffin Bay Population NGI 2022) GCA_005190385.3	n/a	18,681 (1.79 %)	19,816 (1.40 %)	n/a	41.26 (100.00 %)	313 (0.00 %)	101 (100.00 %)	3,618,235 (37.24 %)	612,229 (1.52 %)	12,641,632 (35.02 %)	60,518 (1.78 %)
644	Natal long-fingered bat (2016) GCF_001595765.1	32,050 (3.03 %)	18,015 (2.17 %)	18,293 (1.87 %)	n/a	42.07 (96.24 %)	204,616 (3.79 %)	1,269 (100.00 %)	2,565,457 (28.95 %)	376,532 (1.91 %)	10,427,823 (26.35 %)	63,261 (2.07 %)
645	Natal long-fingered bat (hap1 2026 genbank) GCA_054644295.1	n/a	17,698 (2.09 %)	21,893 (1.88 %)	n/a	42.54 (100.00 %)	113 (0.00 %)	136 (100.00 %)	3,272,492 (39.30 %)	405,440 (5.61 %)	10,243,363 (30.84 %)	59,199 (2.79 %)
646	Natal long-fingered bat (hap1 2026 refseq) GCF_054644295.1	36,349 (3.04 %)	17,696 (2.09 %)	21,235 (1.88 %)	n/a	n/a	113 (0.00 %)	135 (100.00 %)	3,232,325 (39.29 %)	405,970 (5.62 %)	10,243,311 (30.84 %)	59,198 (2.79 %)
647	Natal long-fingered bat (hap2 2026) GCA_054644305.1	n/a	17,715 (2.11 %)	22,079 (1.91 %)	n/a	42.49 (100.00 %)	121 (0.00 %)	99 (100.00 %)	3,263,689 (38.58 %)	393,153 (4.56 %)	10,248,496 (30.06 %)	59,330 (2.85 %)
648	Nathusius's pipistrelle (hap1.1 2025) GCA_964656225.1	n/a	18,001 (1.75 %)	21,219 (1.77 %)	n/a	42.26 (99.98 %)	1,836 (0.02 %)	1,062 (100.00 %)	3,664,854 (32.90 %)	906,692 (8.55 %)	10,164,440 (37.98 %)	56,705 (2.75 %)
649	Nathusius's pipistrelle (hap1.2 2025) GCA_964656225.2	n/a	17,671 (1.80 %)	21,057 (1.71 %)	n/a	42.19 (100.00 %)	307 (0.00 %)	410 (100.00 %)	4,579,266 (45.39 %)	943,644 (11.48 %)	9,925,875 (39.77 %)	56,485 (2.63 %)
650	Nathusius's pipistrelle (hap2.1 2025) GCA_964656075.1	n/a	17,899 (1.71 %)	20,808 (1.69 %)	n/a	42.15 (99.98 %)	1,832 (0.02 %)	2,485 (99.98 %)	3,637,576 (31.92 %)	930,013 (11.25 %)	9,967,930 (39.61 %)	56,237 (2.62 %)
651	Nathusius's pipistrelle (hap2.2 2025) GCA_964656075.2	n/a	17,650 (1.86 %)	21,005 (1.78 %)	n/a	42.30 (100.00 %)	306 (0.00 %)	759 (100.00 %)	4,580,609 (44.28 %)	888,097 (8.14 %)	10,070,978 (37.75 %)	56,514 (2.79 %)
652	Nathusius's pipistrelle (primary hap 2024) GCA_963693515.1	n/a	17,944 (1.86 %)	20,545 (1.83 %)	n/a	42.45 (100.00 %)	263 (0.00 %)	154 (100.00 %)	3,628,328 (34.57 %)	838,723 (4.04 %)	10,155,601 (35.22 %)	56,332 (2.92 %)
653	Natterer's bat GCF_964212035.1	36,662 (2.62 %)	18,650 (1.78 %)	22,423 (1.68 %)	n/a	43.15 (100.00 %)	225 (0.00 %)	212 (100.00 %)	5,075,897 (48.88 %)	801,041 (5.78 %)	10,278,311 (38.66 %)	64,639 (2.57 %)
654	Natterer's bat (hap1.2 2025) GCA_964212035.2	n/a	19,475 (1.82 %)	22,424 (1.68 %)	n/a	43.15 (100.00 %)	225 (0.00 %)	212 (100.00 %)	3,841,654 (38.99 %)	801,041 (5.78 %)	10,278,311 (38.66 %)	64,639 (2.57 %)
655	Natterer's bat (hap2.2 2025) GCA_964212025.2	n/a	18,368 (1.91 %)	21,701 (1.80 %)	n/a	43.27 (100.00 %)	136 (0.00 %)	309 (100.00 %)	3,509,151 (38.16 %)	704,537 (5.21 %)	9,806,703 (36.74 %)	61,004 (2.65 %)
656	neotropical fruit bat GCF_014824575.2	49,109 (2.78 %)	17,703 (1.63 %)	19,389 (1.60 %)	n/a	42.32 (99.79 %)	38,675 (0.21 %)	26,068 (100.00 %)	2,862,405 (29.31 %)	366,960 (1.48 %)	11,796,203 (31.27 %)	59,091 (1.70 %)
657	New Mexican meadow jumping mouse (hap1 2026) GCA_057945945.1	n/a	19,141 (1.41 %)	22,877 (1.82 %)	n/a	42.51 (100.00 %)	466 (0.00 %)	309 (100.00 %)	5,003,584 (35.98 %)	1,325,881 (5.09 %)	12,286,670 (39.67 %)	26,988 (1.58 %)
658	New Mexican meadow jumping mouse (hap2 2026) GCA_057945955.1	n/a	19,093 (1.41 %)	22,903 (1.71 %)	n/a	42.45 (100.00 %)	462 (0.00 %)	262 (100.00 %)	5,039,618 (35.97 %)	1,310,844 (5.10 %)	12,276,585 (39.57 %)	26,703 (1.33 %)
659	Nilgiri tahr GCA_004026825.1	n/a	22,735 (1.44 %)	34,961 (1.27 %)	n/a	42.37 (99.93 %)	10,387 (0.04 %)	479,550 (99.96 %)	5,793,761 (48.50 %)	535,297 (1.34 %)	13,378,352 (42.46 %)	57,653 (1.29 %)
660	nine-banded armadillo (hap2 2023) GCA_030445035.2	n/a	21,049 (1.11 %)	24,419 (1.07 %)	n/a	41.00 (99.67 %)	793 (0.33 %)	546 (100.00 %)	5,507,356 (53.38 %)	738,321 (2.02 %)	19,755,425 (43.69 %)	142,597 (2.85 %)
661	nine-banded armadillo (v2 hap1 2023) GCA_030445055.2	n/a	19,350 (1.07 %)	22,207 (1.07 %)	n/a	40.97 (99.27 %)	823 (0.73 %)	588 (100.00 %)	4,330,716 (32.85 %)	661,966 (1.52 %)	18,302,021 (42.22 %)	130,245 (2.79 %)
662	nine-banded armadillo (v2 hap2 2023) GCF_030445035.2	72,174 (2.47 %)	21,051 (1.11 %)	24,418 (1.07 %)	n/a	41.00 (99.67 %)	793 (0.33 %)	546 (100.00 %)	5,412,063 (53.31 %)	738,320 (2.02 %)	19,755,423 (43.69 %)	142,597 (2.85 %)
663	nine-banded armadillo (v3.2 3-136 2012 Baylor) GCF_000208655.3	46,110 (1.87 %)	20,820 (1.08 %)	25,226 (1.08 %)	n/a	40.77 (90.89 %)	268,437 (9.13 %)	314,788 (90.87 %)	4,552,770 (34.01 %)	651,225 (1.26 %)	19,266,969 (38.27 %)	139,490 (2.47 %)
664	North American deer mouse (MVZ:Mamm:240117 alternate hap 2022) GCA_026167925.1	n/a	19,342 (1.57 %)	20,947 (1.48 %)	n/a	42.40 (100.00 %)	229 (0.00 %)	1,006 (100.00 %)	4,161,568 (23.13 %)	1,278,205 (8.22 %)	13,148,019 (37.60 %)	23,523 (0.71 %)
665	North American deer mouse (v1 MVZ:Mamm:240117 primary hap 2022) GCA_026229955.1	n/a	19,700 (1.54 %)	22,354 (1.46 %)	n/a	42.19 (100.00 %)	244 (0.00 %)	2,082 (100.00 %)	6,089,884 (47.99 %)	1,358,786 (9.39 %)	13,799,349 (39.08 %)	24,733 (0.70 %)
666	North American deer mouse (v2 MVZ:Mamm:240117 primary hap 2026) GCA_026229955.2	n/a	19,460 (1.53 %)	21,066 (1.38 %)	n/a	42.19 (100.00 %)	477 (0.00 %)	1,632 (100.00 %)	7,214,715 (49.58 %)	1,352,727 (9.20 %)	13,819,592 (38.94 %)	24,484 (0.70 %)
667	North American porcupine (mEreDor1 alternate hap 2023) GCA_028500835.1	n/a	15,210 (1.55 %)	18,316 (1.43 %)	n/a	41.06 (100.00 %)	1 (0.00 %)	5,051 (100.00 %)	3,911,633 (40.55 %)	565,546 (1.54 %)	10,853,726 (32.61 %)	40,925 (1.35 %)
668	North American porcupine (mEreDor1 primary hap 2023) GCA_028451465.1	n/a	18,102 (1.58 %)	20,073 (1.40 %)	n/a	41.03 (100.00 %)	277 (0.00 %)	116 (100.00 %)	4,958,089 (41.64 %)	719,163 (1.59 %)	13,867,662 (33.89 %)	51,299 (1.36 %)
669	North Atlantic bottlenose whale GCF_949752795.1	33,287 (1.31 %)	19,106 (1.50 %)	20,818 (1.21 %)	n/a	41.81 (99.99 %)	1,098 (0.01 %)	756 (100.00 %)	5,163,512 (53.86 %)	769,275 (14.94 %)	12,133,394 (44.83 %)	67,258 (2.00 %)
670	North Atlantic right whale (hap2 + XY 2023 refseq) GCF_028564815.1	49,646 (1.86 %)	19,562 (1.46 %)	21,631 (1.25 %)	n/a	41.69 (99.83 %)	367 (0.17 %)	789 (100.00 %)	1,368,536 (2.24 %)	841,303 (13.08 %)	12,527,582 (43.92 %)	94,259 (1.92 %)
671	North Atlantic right whale (hap2._XY 2023) GCA_028564815.2	n/a	19,476 (1.53 %)	21,630 (1.25 %)	n/a	41.69 (99.83 %)	367 (0.17 %)	788 (100.00 %)	4,812,242 (53.57 %)	841,302 (13.08 %)	12,527,493 (43.92 %)	94,259 (1.92 %)
672	North Atlantic right whale (v1 hap1 2023) GCA_028571275.1	n/a	18,699 (1.61 %)	20,354 (1.28 %)	n/a	41.64 (99.84 %)	385 (0.16 %)	947 (100.00 %)	3,815,900 (43.46 %)	718,935 (11.38 %)	11,928,210 (42.25 %)	85,881 (1.90 %)
673	North Atlantic right whale (v2 hap1 2023) GCA_028571275.2	n/a	18,673 (1.52 %)	20,481 (1.29 %)	n/a	41.64 (99.84 %)	381 (0.16 %)	938 (100.00 %)	1,270,626 (2.25 %)	714,265 (11.41 %)	11,856,103 (42.12 %)	85,484 (1.90 %)
674	North Pacific right whale GCA_004363455.1	n/a	23,145 (1.43 %)	38,161 (1.21 %)	n/a	41.15 (99.88 %)	7,094 (0.03 %)	1,361,057 (99.97 %)	5,039,622 (45.69 %)	694,986 (1.31 %)	14,063,101 (40.51 %)	74,800 (1.52 %)
675	North Sulawesi babirusa (hap1 2026) GCA_057927545.1	n/a	17,837 (1.53 %)	19,846 (1.30 %)	n/a	42.38 (100.00 %)	531 (0.00 %)	2,202 (100.00 %)	6,623,055 (49.70 %)	672,980 (3.45 %)	13,111,305 (38.79 %)	61,896 (2.07 %)
676	North Sulawesi babirusa (hap2 2026) GCA_057877285.1	n/a	15,642 (1.54 %)	17,116 (1.32 %)	n/a	41.84 (100.00 %)	578 (0.00 %)	1,389 (100.00 %)	5,920,679 (48.33 %)	593,514 (2.37 %)	11,705,732 (36.85 %)	48,967 (1.68 %)
677	northern American river otter GCF_010015895.1	53,945 (2.18 %)	18,974 (1.68 %)	21,247 (1.45 %)	n/a	41.41 (99.58 %)	7,620 (0.42 %)	13,541 (99.58 %)	4,538,847 (41.18 %)	685,281 (1.20 %)	13,840,953 (32.61 %)	53,559 (1.88 %)
678	northern bat (alternate hap 2023) GCA_951640545.1	n/a	18,343 (1.80 %)	23,253 (1.77 %)	n/a	43.55 (100.00 %)	3 (0.00 %)	4,899 (100.00 %)	1,174,241 (2.96 %)	825,170 (5.11 %)	9,889,579 (36.12 %)	76,164 (3.52 %)
679	northern bat (hap1.2 2026) GCA_951640355.2	n/a	18,078 (1.80 %)	22,078 (1.69 %)	n/a	n/a	545 (0.01 %)	281 (100.00 %)	5,872,949 (49.20 %)	924,514 (6.28 %)	10,543,684 (38.17 %)	80,149 (3.37 %)
680	northern bat (primary hap 2023 genbank) GCA_951640355.1	n/a	18,636 (1.75 %)	21,446 (1.68 %)	n/a	43.32 (99.99 %)	1,423 (0.01 %)	207 (100.00 %)	1,259,729 (2.95 %)	905,676 (6.25 %)	10,554,535 (38.21 %)	77,656 (3.27 %)
681	northern bat (primary hap 2023 refseq) GCF_951640355.1	44,040 (3.33 %)	17,979 (1.82 %)	21,447 (1.68 %)	n/a	n/a	1,423 (0.01 %)	206 (100.00 %)	5,798,530 (48.90 %)	906,181 (6.23 %)	10,553,943 (38.21 %)	77,655 (3.27 %)
682	northern black mastiff bat (mMolNig1 2022) GCA_026936385.1	n/a	18,924 (1.53 %)	22,934 (1.58 %)	n/a	42.38 (100.00 %)	199 (0.00 %)	146 (100.00 %)	3,850,624 (31.21 %)	648,359 (3.76 %)	11,788,702 (39.25 %)	85,908 (2.60 %)
683	northern black mastiff bat (mMolNig1hap1 2024) GCA_039880945.1	n/a	18,933 (1.44 %)	23,629 (1.50 %)	n/a	42.60 (100.00 %)	113 (0.00 %)	366 (100.00 %)	4,027,155 (30.73 %)	712,278 (5.22 %)	12,003,034 (41.58 %)	96,116 (3.02 %)
684	northern black mastiff bat (mMolNig1hap2 2024) GCA_039880925.1	n/a	18,305 (1.49 %)	22,534 (1.56 %)	n/a	42.75 (100.00 %)	80 (0.00 %)	282 (100.00 %)	3,783,543 (30.10 %)	656,592 (4.68 %)	11,353,707 (40.26 %)	92,041 (3.01 %)
685	northern bottlenose whale (alternate hap 2023) GCA_949752845.1	n/a	19,537 (1.44 %)	27,826 (1.30 %)	n/a	41.67 (100.00 %)	n/a	23,401 (100.00 %)	3,634,923 (35.56 %)	672,860 (11.00 %)	11,175,398 (41.72 %)	62,007 (1.94 %)
686	northern bottlenose whale (primary hap 2023) GCA_949752795.1	n/a	19,073 (1.44 %)	20,821 (1.21 %)	n/a	41.81 (99.99 %)	1,098 (0.01 %)	757 (100.00 %)	3,997,911 (34.76 %)	769,275 (14.94 %)	12,133,820 (44.83 %)	67,258 (2.00 %)
687	northern elephant seal (BS05 2019 Broad) GCA_004023865.1	n/a	22,834 (1.54 %)	36,083 (1.32 %)	n/a	41.52 (99.94 %)	9,483 (0.04 %)	330,739 (99.96 %)	4,849,944 (43.83 %)	600,306 (1.16 %)	13,420,049 (34.43 %)	57,236 (1.62 %)
688	northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap1 2023 genbank) GCA_029215605.1	n/a	19,278 (1.60 %)	19,908 (1.39 %)	n/a	41.84 (100.00 %)	98 (0.00 %)	596 (100.00 %)	4,348,333 (34.40 %)	621,985 (2.21 %)	13,251,768 (35.32 %)	69,898 (2.38 %)
689	northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap1 2023 refseq) GCF_029215605.1	74,106 (3.88 %)	19,277 (1.60 %)	20,000 (1.36 %)	n/a	41.84 (100.00 %)	98 (0.00 %)	595 (100.00 %)	4,348,327 (34.40 %)	621,980 (2.21 %)	13,251,706 (35.32 %)	69,897 (2.38 %)
690	northern elephant seal (CCGP_5_RB_7025 hap2 2023) GCA_029215635.1	n/a	19,340 (1.59 %)	19,732 (1.37 %)	n/a	41.91 (100.00 %)	60 (0.00 %)	482 (100.00 %)	4,365,070 (34.26 %)	627,639 (2.43 %)	13,174,494 (35.47 %)	74,314 (2.49 %)
691	northern elephant seal (v3 JK_09032017 2022) GCF_021288785.2	53,819 (3.32 %)	20,099 (1.75 %)	20,957 (1.35 %)	n/a	41.51 (99.35 %)	39,936 (0.65 %)	142,455 (100.00 %)	4,368,400 (33.93 %)	588,877 (1.19 %)	13,745,426 (32.96 %)	52,064 (1.59 %)
692	northern fur seal GCF_003265705.1	54,953 (2.43 %)	23,408 (1.78 %)	23,666 (1.43 %)	52,089 (2.17 %)	41.48 (98.01 %)	38,666 (1.99 %)	52,469 (98.01 %)	5,047,032 (43.38 %)	638,130 (1.06 %)	14,922,442 (33.12 %)	57,281 (1.44 %)
693	northern fur seal (GAN/ISIS: 27379988/994484 2025) GCF_003265705.2	71,169 (3.14 %)	21,276 (1.78 %)	21,276 (1.42 %)	n/a	41.44 (98.05 %)	30,369 (1.95 %)	43,734 (98.05 %)	4,118,994 (34.95 %)	578,801 (1.07 %)	13,530,999 (33.27 %)	51,258 (1.43 %)
694	northern gundi (hap1 2025) GCA_048771875.1	n/a	16,996 (1.51 %)	21,787 (1.66 %)	n/a	42.28 (100.00 %)	117 (0.00 %)	535 (100.00 %)	3,293,772 (27.51 %)	602,403 (3.02 %)	11,827,700 (30.64 %)	44,220 (1.55 %)
695	northern gundi (hap2 2025) GCA_048771865.1	n/a	17,037 (1.43 %)	21,690 (1.55 %)	n/a	42.88 (100.00 %)	115 (0.00 %)	1,031 (100.00 %)	3,527,940 (26.81 %)	646,620 (6.32 %)	11,343,462 (34.09 %)	47,125 (1.51 %)
696	northern gundi (US049 2019) GCA_004027205.1	n/a	18,035 (1.39 %)	27,379 (1.57 %)	n/a	42.68 (99.91 %)	5,037 (0.02 %)	865,110 (99.98 %)	4,149,883 (27.83 %)	654,063 (1.64 %)	12,342,565 (33.72 %)	47,533 (1.43 %)
697	Northern hairy-legged myotis (hap1 2026) GCA_057888715.1	n/a	18,686 (1.84 %)	21,585 (1.68 %)	n/a	42.92 (100.00 %)	86 (0.00 %)	115 (100.00 %)	5,056,672 (47.84 %)	720,091 (4.09 %)	10,496,975 (37.76 %)	58,979 (2.35 %)
698	Northern hairy-legged myotis (hap2 2026) GCA_057888765.1	n/a	18,721 (1.84 %)	21,762 (1.69 %)	n/a	42.92 (100.00 %)	84 (0.00 %)	94 (100.00 %)	5,050,793 (47.87 %)	719,858 (4.19 %)	10,485,939 (37.74 %)	58,950 (2.33 %)
699	northern mole vole GCA_001685095.1	n/a	23,252 (1.39 %)	44,209 (1.25 %)	n/a	41.68 (99.04 %)	371,627 (0.98 %)	722,087 (99.02 %)	3,923,814 (25.79 %)	898,453 (2.47 %)	13,708,986 (29.04 %)	16,583 (0.36 %)
700	northern three-toed jerboa (halli NM19106 2024) GCA_036346955.1	n/a	19,574 (1.25 %)	21,306 (1.23 %)	n/a	42.16 (99.93 %)	954 (0.07 %)	487 (100.00 %)	6,447,286 (38.11 %)	1,321,523 (3.44 %)	13,986,035 (43.83 %)	30,337 (0.84 %)
701	northern white rhinoceros GCA_004027795.1	n/a	25,328 (1.34 %)	61,003 (1.95 %)	n/a	41.32 (99.90 %)	7,054 (0.03 %)	949,480 (99.97 %)	4,330,882 (38.89 %)	484,754 (1.12 %)	15,544,248 (33.11 %)	43,689 (2.08 %)
702	northern woolly horseshoe bat (20210929_DDc alternate hap 2024) GCA_043748905.1	n/a	17,474 (1.85 %)	19,891 (1.65 %)	n/a	40.73 (100.00 %)	n/a	1,329 (100.00 %)	3,473,169 (40.23 %)	618,364 (2.01 %)	11,013,083 (30.75 %)	32,427 (1.26 %)
703	northern woolly horseshoe bat (20210929_DDc primary hap 2024) GCA_043748575.1	n/a	18,475 (1.82 %)	19,990 (1.56 %)	n/a	40.72 (100.00 %)	63 (0.00 %)	68 (100.00 %)	3,507,612 (39.92 %)	711,081 (2.15 %)	11,788,205 (32.17 %)	35,670 (1.25 %)
704	Norway rat (BN/NHsdMcwi 2024 genbank) GCA_036323735.1	114,725 (42.69 %)	21,917 (1.75 %)	19,476 (1.26 %)	n/a	41.82 (99.86 %)	220 (0.14 %)	77 (100.00 %)	4,700,726 (39.99 %)	1,603,005 (5.45 %)	13,451,813 (38.68 %)	20,118 (0.44 %)
705	Norway rat (BN/NHsdMcwi 2024 refseq) GCF_036323735.1	114,725 (5.38 %)	21,870 (1.74 %)	19,989 (1.27 %)	n/a	41.82 (99.86 %)	220 (0.14 %)	76 (100.00 %)	5,294,185 (42.75 %)	1,603,005 (5.45 %)	13,451,760 (38.68 %)	20,118 (0.44 %)
706	Norway rat (F344/Stm 2024) GCA_041222355.1	n/a	21,764 (1.78 %)	20,141 (1.30 %)	n/a	41.87 (99.96 %)	234 (0.04 %)	120 (100.00 %)	4,636,987 (39.98 %)	1,579,595 (5.22 %)	13,544,768 (38.06 %)	20,127 (0.46 %)
707	Norway rat (LE/Stm RGD_629485 2026) GCA_058775275.1	n/a	22,033 (1.74 %)	20,312 (1.28 %)	n/a	41.84 (100.00 %)	255 (0.00 %)	1,330 (100.00 %)	4,747,037 (40.17 %)	1,613,740 (6.08 %)	13,369,040 (38.80 %)	20,630 (0.51 %)
708	Norway rat (v1 SHRSP/BppUtx 2022) GCA_021556685.1	n/a	22,366 (1.71 %)	20,531 (1.26 %)	57,580 (2.44 %)	41.86 (99.94 %)	1,610 (0.06 %)	2,734 (100.00 %)	5,238,574 (46.36 %)	1,638,412 (5.87 %)	13,769,141 (38.49 %)	21,006 (0.49 %)
709	Norway rat (v2 T2T SHRSP/BbbUtx 2026) GCA_021556685.2	n/a	21,935 (1.75 %)	20,183 (1.28 %)	n/a	41.87 (100.00 %)	7 (0.00 %)	192 (100.00 %)	4,752,792 (40.32 %)	1,617,613 (5.77 %)	13,383,610 (38.76 %)	20,532 (0.56 %)
710	Norway rat BN7 haplotype GCA_015244455.1	n/a	3,096 (1.64 %)	2,450 (1.02 %)	n/a	41.23 (100.00 %)	6 (0.00 %)	3,156 (100.00 %)	517,347 (50.76 %)	157,701 (3.90 %)	1,502,752 (34.14 %)	1,806 (0.40 %)
711	Norway rat BN7.2 GCF_015227675.2	97,432 (4.08 %)	21,526 (1.86 %)	19,266 (1.33 %)	54,530 (2.79 %)	41.99 (99.19 %)	581 (0.81 %)	757 (99.19 %)	5,029,005 (45.44 %)	1,514,974 (3.57 %)	13,450,428 (35.83 %)	19,244 (0.46 %)
712	Norway rat celera GCF_000002265.2	39,745 (2.91 %)	21,492 (1.95 %)	19,112 (1.38 %)	n/a	41.98 (95.28 %)	111,391 (4.74 %)	118,423 (95.26 %)	9,721,869 (43.57 %)	1,387,703 (3.05 %)	13,224,921 (32.45 %)	18,944 (0.42 %)
713	Norway rat Dahl SR JrHsd (RGD_1582184 2024) GCA_045688005.1	n/a	21,901 (1.75 %)	20,001 (1.28 %)	n/a	41.84 (99.81 %)	299 (0.19 %)	141 (100.00 %)	4,717,442 (40.25 %)	1,598,987 (5.75 %)	13,553,199 (38.60 %)	20,297 (0.46 %)
714	Norway rat Lyon Hypertensive(RGD_10755352 2024) GCA_045687965.1	n/a	21,971 (1.75 %)	20,095 (1.28 %)	n/a	41.85 (99.93 %)	269 (0.07 %)	133 (100.00 %)	4,719,614 (40.23 %)	1,601,400 (5.83 %)	13,552,374 (38.67 %)	20,429 (0.47 %)
715	Norway rat Lyon Normot (RGD_10755354 2024) GCA_045687995.1	n/a	21,928 (1.75 %)	20,321 (1.29 %)	n/a	41.85 (99.84 %)	302 (0.16 %)	154 (100.00 %)	4,723,406 (40.27 %)	1,602,417 (5.79 %)	13,563,546 (38.65 %)	20,456 (0.47 %)
716	Norway rat Rnor6.0 GCF_000001895.5	69,456 (3.34 %)	22,369 (1.83 %)	20,269 (1.32 %)	n/a	41.93 (95.13 %)	145,731 (4.89 %)	76,195 (95.16 %)	5,329,187 (44.14 %)	1,620,304 (3.72 %)	14,520,050 (33.09 %)	22,600 (0.47 %)
717	Norway rat SHR/Utx RGD_8142385 2022 GCA_023515785.1	n/a	21,116 (1.68 %)	20,103 (1.27 %)	57,027 (2.45 %)	41.85 (99.82 %)	1,256 (0.18 %)	2,151 (100.00 %)	4,704,388 (38.22 %)	1,611,144 (5.76 %)	13,524,575 (38.35 %)	20,720 (0.48 %)
718	Norway rat WKY/Bbb 2022 GCA_023515805.1	n/a	21,607 (1.68 %)	21,244 (1.28 %)	58,136 (2.47 %)	41.92 (99.80 %)	1,456 (0.20 %)	3,553 (100.00 %)	4,811,412 (38.21 %)	1,650,950 (5.41 %)	13,740,644 (38.24 %)	21,449 (0.51 %)
719	Nubian ibex (hap1 2026) GCA_054855995.1	n/a	18,692 (1.49 %)	21,269 (1.31 %)	n/a	42.65 (100.00 %)	83 (0.00 %)	227 (100.00 %)	6,520,577 (52.69 %)	553,105 (4.22 %)	12,816,690 (42.59 %)	65,657 (1.95 %)
720	Nubian ibex (hap2 2026) GCA_054856215.1	n/a	18,088 (1.44 %)	20,620 (1.27 %)	n/a	43.70 (100.00 %)	58 (0.00 %)	554 (100.00 %)	6,123,561 (54.71 %)	611,034 (8.85 %)	11,972,217 (45.26 %)	91,790 (2.58 %)
721	nutria GCA_004027025.1	n/a	24,707 (1.00 %)	47,533 (1.18 %)	n/a	41.70 (99.84 %)	15,249 (0.05 %)	1,684,916 (99.95 %)	6,961,690 (30.09 %)	1,698,977 (3.31 %)	15,207,563 (42.57 %)	59,854 (1.00 %)
722	okapi GCA_001660835.1	n/a	21,483 (1.43 %)	31,061 (1.26 %)	n/a	41.48 (95.11 %)	376,008 (4.86 %)	1,213,177 (95.14 %)	5,808,036 (42.90 %)	619,044 (4.22 %)	14,940,153 (35.17 %)	47,417 (1.12 %)
723	Okinawa island spiny rat (P-3 2024) GCA_047150545.1	n/a	20,516 (1.33 %)	20,222 (0.99 %)	n/a	40.89 (100.00 %)	19 (0.00 %)	53 (100.00 %)	9,452,355 (48.57 %)	2,252,101 (4.71 %)	12,808,891 (51.48 %)	20,770 (0.36 %)
724	Okinawa island spiny rat (P-3 primary hap 2023) GCA_036184385.1	n/a	18,829 (1.78 %)	19,061 (1.29 %)	n/a	41.18 (100.00 %)	250 (0.00 %)	1,778 (100.00 %)	6,918,941 (46.48 %)	1,550,409 (4.06 %)	12,787,294 (38.04 %)	19,458 (0.47 %)
725	Ord's kangaroo rat GCF_000151885.1	30,625 (2.21 %)	17,959 (1.54 %)	19,318 (1.54 %)	n/a	42.06 (92.36 %)	83,035 (7.65 %)	148,226 (92.35 %)	4,337,455 (33.76 %)	1,140,316 (7.60 %)	10,422,685 (36.59 %)	61,921 (3.56 %)
726	pacarana GCA_004027595.1	n/a	20,748 (1.20 %)	33,195 (1.31 %)	n/a	41.81 (99.90 %)	6,392 (0.02 %)	1,164,830 (99.98 %)	4,374,443 (30.16 %)	660,811 (1.38 %)	14,062,133 (35.99 %)	59,382 (1.23 %)
727	Pacific pocket mouse (BS65 2019 Broad) GCA_004363475.1	n/a	21,575 (1.07 %)	47,478 (1.31 %)	n/a	41.87 (99.76 %)	18,801 (0.07 %)	2,428,619 (99.93 %)	4,881,232 (20.80 %)	1,352,971 (4.11 %)	12,583,960 (48.42 %)	74,961 (2.33 %)
728	Pacific pocket mouse (PPM17 2022 San Diego Zoo) GCF_023159225.1	46,202 (2.48 %)	18,752 (1.50 %)	22,526 (1.60 %)	n/a	41.98 (99.96 %)	1,807 (0.04 %)	6,180 (100.00 %)	3,313,319 (16.79 %)	1,066,382 (10.88 %)	9,981,468 (42.63 %)	49,134 (2.83 %)
729	Pacific walrus GCF_000321225.1	27,163 (1.89 %)	20,293 (1.71 %)	20,982 (1.48 %)	n/a	41.36 (95.85 %)	66,766 (4.16 %)	70,656 (95.84 %)	4,372,578 (41.12 %)	511,500 (1.05 %)	13,507,582 (30.43 %)	45,142 (1.29 %)
730	Pacific white-sided dolphin GCF_003676395.1	65,970 (3.26 %)	18,743 (1.79 %)	20,862 (1.45 %)	31,917 (1.69 %)	41.28 (99.56 %)	16,699 (0.44 %)	21,350 (99.56 %)	3,971,820 (45.64 %)	574,056 (1.14 %)	12,602,965 (34.83 %)	62,275 (1.67 %)
731	pale spear-nosed bat (alternate hap MPI-MPIP 2019) GCA_004115245.1	n/a	18,118 (1.63 %)	23,536 (1.65 %)	n/a	42.48 (100.00 %)	38 (0.00 %)	10,873 (100.00 %)	3,001,130 (29.46 %)	375,042 (0.79 %)	11,813,971 (29.64 %)	67,712 (4.23 %)
732	pale spear-nosed bat (MPI-MPIP mPhyDis1 primary hap 2020) GCA_004126475.3	n/a	18,167 (1.70 %)	20,017 (1.62 %)	n/a	42.38 (99.28 %)	884 (0.72 %)	78 (100.00 %)	3,071,886 (30.03 %)	385,665 (0.81 %)	12,049,923 (30.57 %)	63,918 (4.33 %)
733	pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 alternate hap 2020) GCA_004115245.2	n/a	18,116 (1.63 %)	23,608 (1.65 %)	n/a	42.48 (100.00 %)	38 (0.00 %)	10,895 (100.00 %)	3,002,448 (29.46 %)	375,226 (0.79 %)	11,824,034 (29.65 %)	67,718 (4.23 %)
734	pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v3 mPhyDis1 primary hap 2020) GCF_004126475.2	54,932 (3.31 %)	18,171 (1.69 %)	20,025 (1.62 %)	42,786 (3.39 %)	42.38 (99.28 %)	884 (0.72 %)	77 (100.00 %)	3,069,141 (30.00 %)	385,664 (0.81 %)	12,050,232 (30.57 %)	63,905 (3.75 %)
735	Pallas's mastiff bat (2020 refseq) GCF_014108415.1	48,421 (2.20 %)	18,667 (1.61 %)	21,915 (1.59 %)	n/a	42.35 (97.95 %)	349 (2.05 %)	60 (100.00 %)	3,863,217 (32.76 %)	624,933 (1.88 %)	11,572,319 (37.09 %)	79,984 (2.45 %)
736	Pallas's mastiff bat (2026 genbank) GCA_014108415.2	n/a	18,473 (1.70 %)	21,847 (1.58 %)	n/a	42.35 (97.96 %)	373 (2.04 %)	45 (100.00 %)	4,907,773 (46.09 %)	624,938 (1.88 %)	11,572,201 (37.09 %)	79,987 (2.48 %)
737	pallid bat GCA_027563665.2	n/a	19,038 (1.74 %)	21,934 (1.63 %)	n/a	43.04 (99.72 %)	234 (0.28 %)	108 (99.99 %)	5,341,178 (49.43 %)	937,994 (3.72 %)	11,240,393 (39.42 %)	70,270 (2.89 %)
738	pallid bat (TK200870 alternate hap 2023) GCA_027595915.1	n/a	19,085 (1.74 %)	22,770 (1.68 %)	n/a	43.01 (100.00 %)	n/a	1,839 (100.00 %)	5,323,924 (49.33 %)	928,982 (3.65 %)	11,123,530 (39.36 %)	70,095 (2.89 %)
739	pallid bat (TK200870 primary hap 2023) GCA_027563665.1	n/a	19,688 (1.69 %)	21,998 (1.64 %)	n/a	43.04 (99.72 %)	234 (0.28 %)	112 (99.99 %)	2,794,986 (22.60 %)	938,016 (3.72 %)	11,241,518 (39.41 %)	70,272 (2.89 %)
740	Parnell's mustached bat (2013) GCA_000465405.1	n/a	21,436 (1.40 %)	57,232 (2.18 %)	n/a	40.82 (99.34 %)	265,720 (0.70 %)	443,121 (99.30 %)	2,780,805 (29.26 %)	290,520 (0.63 %)	12,354,814 (27.13 %)	69,806 (1.89 %)
741	Parnell's mustached bat (Mesoamerican 2021) GCF_021234165.1	37,033 (2.48 %)	18,339 (1.76 %)	21,630 (1.69 %)	n/a	41.32 (100.00 %)	12 (0.00 %)	333 (100.00 %)	2,828,339 (30.56 %)	333,670 (0.75 %)	12,444,271 (30.90 %)	53,180 (4.61 %)
742	particolored bat (hap1.2 2025) GCA_963924515.2	n/a	17,612 (1.78 %)	20,793 (1.69 %)	n/a	43.57 (100.00 %)	189 (0.00 %)	273 (100.00 %)	5,418,781 (46.24 %)	903,727 (5.36 %)	10,321,898 (38.41 %)	78,516 (4.52 %)
743	particolored bat (hap2.2 2025) GCA_963924695.2	n/a	16,887 (1.81 %)	20,042 (1.72 %)	n/a	43.67 (100.00 %)	128 (0.00 %)	395 (100.00 %)	5,048,325 (44.60 %)	836,727 (4.41 %)	9,638,999 (37.87 %)	76,656 (4.63 %)
744	particolored bat (primary hap 2024) GCA_963924515.1	n/a	17,913 (1.72 %)	20,720 (1.72 %)	n/a	43.54 (99.99 %)	980 (0.01 %)	185 (100.00 %)	2,932,869 (21.94 %)	874,665 (4.83 %)	10,263,103 (37.46 %)	77,397 (4.55 %)
745	Patagonian cavy GCA_004027295.1	n/a	21,143 (0.94 %)	40,887 (1.10 %)	n/a	39.86 (99.87 %)	6,223 (0.02 %)	1,911,987 (99.98 %)	5,194,890 (30.95 %)	892,551 (2.11 %)	17,052,577 (40.22 %)	45,730 (0.84 %)
746	Pere David's deer GCA_002443075.1	n/a	20,723 (1.65 %)	23,551 (1.43 %)	n/a	41.58 (97.49 %)	144,642 (2.51 %)	339,454 (97.49 %)	5,171,293 (43.30 %)	427,987 (1.20 %)	13,665,133 (35.97 %)	48,374 (1.14 %)
747	Philippine flying lemur (mCynVol1 alternate hap 2022) GCA_027409165.1	n/a	18,794 (1.72 %)	21,421 (1.40 %)	n/a	40.18 (100.00 %)	n/a	1,750 (100.00 %)	4,001,442 (39.37 %)	547,894 (2.75 %)	13,870,563 (34.33 %)	40,162 (1.31 %)
748	Philippine flying lemur (primary hap 2022 genbank) GCA_027409185.1	n/a	20,384 (1.64 %)	22,124 (1.29 %)	n/a	40.24 (100.00 %)	116 (0.00 %)	131 (100.00 %)	4,492,423 (39.31 %)	627,842 (4.79 %)	15,561,515 (36.57 %)	45,336 (1.27 %)
749	Philippine flying lemur (primary hap 2022 refseq) GCF_027409185.1	44,950 (1.91 %)	20,385 (1.64 %)	22,123 (1.29 %)	n/a	40.24 (100.00 %)	116 (0.00 %)	130 (100.00 %)	4,492,417 (39.31 %)	627,841 (4.79 %)	15,561,458 (36.57 %)	45,336 (1.27 %)
750	pig (Bamei 2023) GCA_030704935.1	n/a	18,472 (1.44 %)	19,911 (1.28 %)	n/a	42.63 (99.98 %)	878 (0.02 %)	379 (100.00 %)	3,996,827 (27.97 %)	2,094,728 (7.23 %)	12,677,118 (40.57 %)	81,791 (2.82 %)
751	pig (Bamei 2025) GCA_030704935.2	n/a	17,940 (1.49 %)	20,133 (1.29 %)	n/a	42.64 (100.00 %)	n/a	21 (100.00 %)	6,650,808 (50.63 %)	1,731,111 (5.80 %)	12,817,015 (40.05 %)	81,487 (2.80 %)
752	pig (Duroc 2017) GCF_000003025.6	77,695 (4.05 %)	18,980 (1.64 %)	19,453 (1.32 %)	59,876 (4.84 %)	41.87 (98.81 %)	544 (1.19 %)	1,313 (98.81 %)	5,021,184 (45.67 %)	710,994 (1.32 %)	13,243,289 (36.33 %)	79,132 (1.82 %)
753	pig (Norwegian landrace 2024) GCA_963921485.1	n/a	18,500 (1.46 %)	19,718 (1.29 %)	n/a	42.45 (100.00 %)	n/a	54 (100.00 %)	4,068,783 (28.54 %)	1,511,605 (5.52 %)	12,867,101 (39.59 %)	82,002 (2.44 %)
754	pig (SSC_HxYL_T2T_F1_AM1 2026) GCF_054392235.1	157,635 (4.99 %)	17,898 (1.49 %)	21,216 (1.31 %)	n/a	42.61 (100.00 %)	4 (0.00 %)	37 (100.00 %)	6,695,257 (50.66 %)	1,516,907 (5.52 %)	12,754,415 (39.86 %)	82,330 (3.08 %)
755	pig (USMARCv1 2017) GCA_002844635.1	n/a	19,458 (1.54 %)	21,487 (1.27 %)	58,655 (2.58 %)	42.49 (95.20 %)	661 (4.80 %)	14,157 (100.00 %)	5,159,244 (47.53 %)	902,079 (3.63 %)	13,145,120 (36.86 %)	82,442 (2.62 %)
756	pig (Wuzhishan WZS1 2025) GCA_048338725.1	n/a	18,525 (1.46 %)	19,792 (1.29 %)	n/a	42.55 (100.00 %)	n/a	20 (100.00 %)	4,084,482 (28.40 %)	1,424,314 (5.35 %)	12,927,595 (39.56 %)	81,967 (2.96 %)
757	plains viscacha rat (AO245 2017) GCA_002564285.1	n/a	23,367 (0.78 %)	50,706 (0.93 %)	n/a	41.26 (99.73 %)	124,165 (0.16 %)	1,682,965 (99.84 %)	5,295,703 (27.32 %)	1,024,529 (1.81 %)	16,181,193 (35.22 %)	46,628 (0.97 %)
758	plains zebra (Etosha38 2022 UCLA) GCF_021613505.1	55,794 (2.87 %)	19,529 (1.76 %)	21,214 (1.39 %)	n/a	41.38 (99.04 %)	14,595 (0.96 %)	11,098 (100.00 %)	3,683,862 (38.74 %)	314,723 (0.68 %)	15,217,328 (29.38 %)	41,391 (1.27 %)
759	platypus (alternate hap Pmale09 2020) GCA_004115175.2	n/a	13,244 (1.26 %)	19,241 (1.68 %)	n/a	46.27 (100.00 %)	25 (0.00 %)	5,868 (100.00 %)	4,420,884 (51.59 %)	513,006 (3.13 %)	7,749,797 (49.18 %)	81,538 (8.24 %)
760	platypus (Pmale09 primary hap 2020) GCA_004115215.4	n/a	14,555 (1.24 %)	18,891 (1.63 %)	n/a	46.14 (99.18 %)	515 (0.82 %)	322 (100.00 %)	7,731,079 (57.03 %)	578,617 (2.89 %)	9,113,668 (48.93 %)	87,861 (7.92 %)
761	platypus (Pmale09 v4 2020) GCF_004115215.2	51,379 (3.07 %)	14,778 (1.26 %)	18,888 (1.63 %)	n/a	46.14 (99.18 %)	515 (0.82 %)	322 (100.00 %)	5,071,089 (51.34 %)	578,614 (2.89 %)	9,113,848 (48.93 %)	87,796 (6.47 %)
762	polar bear (Baiyulong BGI 2014 refseq) GCF_000687225.1	35,751 (2.39 %)	18,466 (1.69 %)	15,384 (1.38 %)	n/a	41.65 (98.35 %)	110,343 (1.67 %)	134,162 (98.33 %)	4,123,540 (40.16 %)	553,196 (1.29 %)	13,765,581 (29.91 %)	54,907 (1.17 %)
763	polar bear (UCSC 2021) GCF_017311325.1	52,175 (2.92 %)	18,588 (1.75 %)	20,731 (1.54 %)	n/a	41.88 (99.60 %)	45,532 (0.41 %)	3,900 (100.00 %)	4,204,162 (40.75 %)	572,129 (1.75 %)	13,926,894 (30.79 %)	63,315 (1.93 %)
764	prairie deer mouse (Baylor 2013) GCF_000500345.1	50,187 (2.51 %)	20,427 (1.69 %)	20,874 (1.45 %)	n/a	42.34 (94.06 %)	182,263 (5.97 %)	212,962 (94.03 %)	n/a	1,229,123 (2.83 %)	14,447,916 (30.09 %)	23,246 (0.56 %)
765	prairie deer mouse (BWxNUB_F1_BW_parent 2025) GCF_049852395.1	84,704 (3.63 %)	19,312 (1.68 %)	20,354 (1.41 %)	n/a	42.31 (100.00 %)	106 (0.00 %)	25 (100.00 %)	6,577,724 (45.25 %)	1,288,198 (5.24 %)	13,978,540 (35.31 %)	23,724 (0.69 %)
766	prairie deer mouse (Harvard 2020) GCF_003704035.1	69,779 (3.28 %)	19,755 (1.73 %)	19,194 (1.43 %)	n/a	42.28 (95.07 %)	147,442 (4.96 %)	155,966 (95.04 %)	4,751,621 (29.04 %)	1,172,212 (2.66 %)	13,934,672 (29.87 %)	22,444 (0.57 %)
767	prairie vole (2012) GCF_000317375.1	40,484 (2.72 %)	19,648 (1.91 %)	19,489 (1.62 %)	n/a	42.25 (92.03 %)	180,677 (8.00 %)	187,012 (92.00 %)	3,779,126 (25.51 %)	879,192 (2.11 %)	12,360,347 (27.34 %)	18,233 (0.52 %)
768	prairie vole (hap1 2026) GCA_984569965.1	n/a	21,146 (1.74 %)	20,796 (1.49 %)	n/a	n/a	138 (0.07 %)	235 (99.93 %)	4,876,492 (38.85 %)	1,243,697 (5.13 %)	12,444,882 (37.53 %)	22,449 (0.71 %)
769	Preble's meadow jumping mouse (hap1 2026) GCA_057945845.1	n/a	19,379 (1.41 %)	23,135 (1.60 %)	n/a	42.41 (100.00 %)	243 (0.00 %)	263 (100.00 %)	5,161,690 (36.34 %)	1,280,534 (4.59 %)	12,486,697 (39.33 %)	27,286 (0.98 %)
770	Preble's meadow jumping mouse (hap2 2026) GCA_057945655.1	n/a	17,778 (1.50 %)	21,028 (1.59 %)	n/a	42.49 (100.00 %)	176 (0.00 %)	163 (100.00 %)	4,493,139 (34.60 %)	1,067,139 (3.68 %)	11,131,637 (37.03 %)	21,835 (0.87 %)
771	proboscis bat (hap1 2024) GCA_037038545.1	n/a	17,919 (1.46 %)	19,330 (1.31 %)	n/a	40.78 (100.00 %)	68 (0.00 %)	41 (100.00 %)	3,707,234 (28.28 %)	643,817 (2.22 %)	12,106,384 (41.48 %)	54,438 (1.38 %)
772	proboscis bat (hap2 2024) GCA_037038555.1	n/a	17,253 (1.51 %)	18,507 (1.35 %)	n/a	40.91 (100.00 %)	39 (0.00 %)	38 (100.00 %)	3,466,835 (27.96 %)	585,261 (1.91 %)	11,364,898 (40.65 %)	50,527 (1.37 %)
773	pronghorn (PH2016 2021) GCA_021018645.1	n/a	21,848 (1.58 %)	27,614 (1.56 %)	n/a	41.70 (96.83 %)	74,027 (3.17 %)	140,480 (96.83 %)	3,335,744 (24.40 %)	405,435 (4.11 %)	13,855,606 (34.67 %)	48,670 (1.19 %)
774	Przewalski's gazelle (PLG-pushi 2019) GCA_006410515.1	n/a	19,722 (1.52 %)	21,663 (1.29 %)	n/a	42.49 (95.93 %)	557,686 (4.13 %)	831,816 (95.87 %)	5,438,181 (47.21 %)	408,156 (1.63 %)	13,068,837 (39.30 %)	67,544 (1.31 %)
775	Przewalski's horse (Burgud 2014 refseq) GCF_000696695.1	45,089 (2.76 %)	19,546 (1.69 %)	22,107 (1.36 %)	n/a	41.27 (99.13 %)	80,963 (0.88 %)	134,060 (99.12 %)	3,787,533 (40.54 %)	435,607 (1.73 %)	14,738,418 (28.36 %)	40,752 (0.94 %)
776	Przewalski's horse (Varuska primary hap 2024) GCF_037783145.1	117,131 (4.09 %)	18,569 (1.70 %)	20,018 (1.38 %)	n/a	42.23 (100.00 %)	310 (0.00 %)	2,146 (100.00 %)	3,768,149 (39.86 %)	632,308 (5.35 %)	14,449,518 (32.71 %)	42,166 (4.46 %)
777	puma (L17-30 alternate hap 2023 genbank) GCA_028749965.1	n/a	18,380 (1.53 %)	20,701 (1.40 %)	n/a	41.91 (100.00 %)	96 (0.00 %)	304 (100.00 %)	4,881,674 (33.96 %)	978,817 (2.17 %)	13,422,986 (35.08 %)	69,437 (2.62 %)
778	puma (L17-30 alternate hap 2023 refseq) GCF_028749965.1	74,801 (3.83 %)	17,892 (1.65 %)	19,079 (1.37 %)	n/a	41.96 (100.00 %)	84 (0.00 %)	208 (100.00 %)	4,919,626 (40.47 %)	914,522 (2.10 %)	12,893,715 (34.74 %)	66,387 (2.67 %)
779	puma (L17-30 primary hap 2023) GCA_028749985.1	n/a	17,553 (1.53 %)	19,299 (1.39 %)	n/a	41.89 (100.00 %)	134 (0.00 %)	390 (100.00 %)	4,629,539 (33.53 %)	919,008 (2.02 %)	12,766,157 (34.70 %)	65,437 (2.53 %)
780	puma (L17-30hap1 2023) GCA_028749985.4	n/a	18,444 (1.61 %)	20,495 (1.40 %)	n/a	n/a	145 (0.00 %)	258 (100.00 %)	5,116,488 (41.04 %)	983,811 (2.10 %)	13,299,418 (35.06 %)	68,457 (2.50 %)
781	puma (SC36_Marlon 2018 refseq) GCF_003327715.1	25,588 (1.44 %)	17,664 (1.57 %)	16,565 (1.29 %)	n/a	41.36 (95.34 %)	178,992 (4.69 %)	2,175 (100.00 %)	4,885,335 (42.70 %)	833,138 (1.76 %)	13,705,778 (31.28 %)	58,912 (1.65 %)
782	punctate agouti GCA_004363535.1	n/a	22,612 (1.05 %)	45,433 (1.19 %)	n/a	40.79 (99.92 %)	6,459 (0.02 %)	993,123 (99.98 %)	5,671,738 (32.53 %)	945,722 (1.69 %)	17,003,309 (36.58 %)	85,696 (1.65 %)
783	Punta de Vaca leaf-eared mouse (GD2095 2023) GCA_033318265.1	n/a	18,332 (1.50 %)	18,296 (1.29 %)	n/a	40.01 (100.00 %)	133 (0.00 %)	437 (100.00 %)	3,825,722 (28.38 %)	915,865 (11.98 %)	13,456,122 (37.89 %)	18,577 (0.50 %)
784	pygmy sperm whale GCA_004363705.1	n/a	22,661 (1.30 %)	42,546 (1.15 %)	n/a	41.89 (99.89 %)	6,053 (0.02 %)	1,258,125 (99.98 %)	5,185,912 (43.65 %)	836,752 (1.88 %)	14,150,125 (39.88 %)	95,344 (2.15 %)
785	pygmy sperm whale (haplotype 1 2022 refseq) GCF_026419965.1	73,518 (2.67 %)	18,496 (1.55 %)	20,718 (1.32 %)	n/a	42.05 (99.81 %)	143 (0.19 %)	581 (100.00 %)	3,817,659 (34.51 %)	758,297 (7.42 %)	12,196,998 (39.96 %)	101,353 (2.90 %)
786	pygmy sperm whale (mKogBre1 haplotype 2 2022) GCA_026419985.1	n/a	18,550 (1.51 %)	20,491 (1.29 %)	n/a	42.18 (99.99 %)	138 (0.01 %)	391 (100.00 %)	3,860,112 (33.83 %)	820,375 (9.58 %)	12,159,196 (41.59 %)	106,168 (2.78 %)
787	Pyrenean desman (IBE-C5619 2021) GCA_019455555.1	n/a	17,527 (1.87 %)	20,474 (1.83 %)	n/a	41.67 (98.52 %)	63,679 (1.49 %)	75,985 (98.51 %)	2,147,379 (23.41 %)	327,740 (0.98 %)	10,539,226 (28.05 %)	44,487 (4.39 %)
788	rabbit (A946 2020) GCA_013371645.1	n/a	19,881 (1.40 %)	22,566 (1.32 %)	n/a	44.09 (99.92 %)	4,254 (0.08 %)	5,157 (99.93 %)	5,202,709 (44.78 %)	1,059,544 (2.39 %)	13,897,372 (40.69 %)	119,691 (2.74 %)
789	rabbit (alternate hap 2024) GCA_964237575.1	n/a	12,274 (1.39 %)	16,482 (1.38 %)	n/a	44.19 (100.00 %)	n/a	10,111 (100.00 %)	3,613,446 (49.48 %)	579,915 (3.18 %)	7,084,192 (39.81 %)	65,573 (2.79 %)
790	rabbit (New Zealand White DNA-2018 2021 refseq) GCF_009806435.1	83,033 (4.16 %)	19,486 (1.31 %)	23,267 (1.31 %)	n/a	43.83 (97.68 %)	18,178 (2.32 %)	3,160 (100.00 %)	4,072,524 (21.41 %)	976,273 (2.33 %)	13,766,413 (39.76 %)	113,371 (2.46 %)
791	rabbit (primary hap 2024 refseq) GCF_964237555.1	95,289 (4.22 %)	19,385 (1.31 %)	22,631 (1.31 %)	n/a	44.02 (99.98 %)	2,276 (0.02 %)	221 (100.00 %)	4,099,586 (21.20 %)	1,062,900 (3.78 %)	13,416,814 (41.72 %)	116,523 (2.66 %)
792	rabbit (Thorbecke 2009 Broad refseq) GCF_000003625.3	43,642 (2.34 %)	18,665 (1.39 %)	20,095 (1.24 %)	n/a	43.75 (95.14 %)	80,789 (4.88 %)	84,024 (95.12 %)	4,890,480 (44.71 %)	883,939 (1.73 %)	13,254,520 (38.27 %)	110,337 (2.33 %)
793	raccoon dog (2021) GCF_905146905.1	52,577 (2.89 %)	19,628 (1.60 %)	20,274 (1.43 %)	n/a	41.28 (99.98 %)	70 (0.02 %)	811 (100.00 %)	4,499,368 (31.98 %)	1,005,212 (2.04 %)	13,884,201 (32.95 %)	52,450 (2.27 %)
794	Rambouillet sheep (Baylor 2017) GCF_002742125.1	50,083 (2.48 %)	19,992 (1.47 %)	22,506 (1.31 %)	41,290 (1.46 %)	41.91 (99.99 %)	4,847 (0.01 %)	7,486 (99.99 %)	5,764,757 (47.38 %)	507,629 (1.55 %)	14,138,601 (41.27 %)	51,748 (1.29 %)
795	Rambouillet sheep (U.Idaho 2021) GCF_016772045.1	70,461 (3.21 %)	19,413 (1.59 %)	21,222 (1.35 %)	n/a	41.99 (100.00 %)	84 (0.00 %)	142 (100.00 %)	5,300,958 (46.83 %)	455,553 (1.24 %)	13,023,443 (40.62 %)	43,959 (1.30 %)
796	ratel GCA_004024625.1	n/a	22,196 (1.21 %)	35,937 (1.18 %)	n/a	42.00 (99.85 %)	6,511 (0.02 %)	2,074,823 (99.98 %)	6,171,383 (41.93 %)	877,669 (1.49 %)	15,269,908 (41.22 %)	95,094 (1.91 %)
797	red bat GCA_004026805.1	n/a	27,510 (1.22 %)	65,467 (1.48 %)	n/a	42.69 (99.94 %)	6,380 (0.02 %)	525,280 (99.98 %)	4,644,227 (28.24 %)	1,170,868 (2.68 %)	15,628,238 (39.97 %)	125,564 (3.55 %)
798	red deer (alternate hap 2021) GCA_910593805.1	n/a	18,817 (1.29 %)	21,916 (1.20 %)	n/a	44.23 (100.00 %)	22 (0.00 %)	4,021 (100.00 %)	3,279,005 (20.48 %)	472,706 (21.87 %)	11,466,609 (50.26 %)	128,858 (2.07 %)
799	red deer (hap1.2 2026) GCA_910594005.2	n/a	20,226 (1.25 %)	23,009 (1.19 %)	n/a	44.31 (100.00 %)	110 (0.00 %)	965 (100.00 %)	6,158,139 (37.49 %)	572,918 (22.39 %)	12,897,105 (51.16 %)	136,992 (2.02 %)
800	red deer (hap2.2 2026) GCA_910593805.2	n/a	20,412 (1.37 %)	22,827 (1.25 %)	n/a	43.54 (100.00 %)	102 (0.00 %)	500 (100.00 %)	5,927,428 (40.11 %)	501,561 (16.00 %)	12,984,298 (46.91 %)	108,724 (1.86 %)
801	red deer (primary hap 2021) GCF_910594005.1	68,992 (2.68 %)	20,470 (1.48 %)	22,563 (1.32 %)	n/a	42.98 (100.00 %)	40 (0.00 %)	144 (100.00 %)	5,501,063 (44.60 %)	503,301 (12.23 %)	13,102,622 (44.55 %)	88,756 (1.66 %)
802	red fox (BD-2025 2025) GCF_048418805.1	84,632 (3.45 %)	19,565 (1.57 %)	19,909 (1.38 %)	n/a	41.31 (100.00 %)	104 (0.00 %)	289 (100.00 %)	4,480,315 (31.76 %)	1,010,887 (2.70 %)	13,766,344 (33.12 %)	50,763 (2.22 %)
803	red fox (hap1 2024) GCA_964106825.2	n/a	19,622 (1.57 %)	20,371 (1.38 %)	n/a	41.34 (99.98 %)	1,845 (0.02 %)	461 (100.00 %)	4,519,485 (31.91 %)	1,018,114 (2.59 %)	13,810,284 (32.99 %)	52,053 (2.31 %)
804	red fox (hap2 2024) GCA_964106925.2	n/a	19,517 (1.57 %)	20,105 (1.37 %)	n/a	41.31 (99.99 %)	1,819 (0.02 %)	350 (100.00 %)	4,487,839 (31.79 %)	1,010,106 (2.64 %)	13,838,711 (33.07 %)	51,373 (2.26 %)
805	red fox (tameXaggressive cross 2018) GCF_003160815.1	43,508 (2.67 %)	19,826 (1.69 %)	18,893 (1.40 %)	n/a	41.08 (97.06 %)	246,167 (2.96 %)	82,424 (100.00 %)	4,919,102 (40.79 %)	954,461 (2.46 %)	14,190,625 (30.86 %)	53,204 (1.88 %)
806	reed vole (MF-2015 2020) GCF_014885135.2	55,722 (3.60 %)	19,808 (1.93 %)	20,787 (1.69 %)	n/a	42.36 (95.60 %)	67,118 (4.40 %)	10,460 (100.00 %)	3,130,955 (20.09 %)	831,969 (2.09 %)	11,985,657 (28.48 %)	18,764 (0.58 %)
807	Reeves' muntjac GCA_963930625.2	n/a	19,215 (1.54 %)	22,411 (1.38 %)	n/a	41.94 (100.00 %)	37 (0.00 %)	242 (100.00 %)	5,985,581 (48.42 %)	555,815 (2.95 %)	13,147,360 (40.36 %)	59,987 (1.80 %)
808	Reeves' muntjac (alternate hap 2024) GCA_963930665.1	n/a	18,947 (1.29 %)	24,114 (1.28 %)	n/a	42.75 (100.00 %)	n/a	8,892 (100.00 %)	3,375,476 (23.21 %)	654,539 (6.64 %)	11,132,469 (48.29 %)	79,357 (2.66 %)
809	Reeves' muntjac (alternate hap 2026) GCA_963930665.2	n/a	17,920 (1.33 %)	21,346 (1.19 %)	n/a	42.73 (99.99 %)	1,900 (0.01 %)	8,017 (99.99 %)	5,791,847 (51.71 %)	627,169 (6.70 %)	11,205,813 (47.89 %)	76,839 (2.77 %)
810	Reeves' muntjac (primary hap 2024) GCF_963930625.1	52,442 (2.57 %)	19,577 (1.52 %)	22,283 (1.38 %)	n/a	41.89 (99.99 %)	682 (0.01 %)	267 (100.00 %)	3,294,672 (23.89 %)	527,436 (2.98 %)	13,137,581 (39.89 %)	57,436 (1.81 %)
811	reindeer (2023) GCA_963422255.1	n/a	21,329 (1.58 %)	25,201 (1.59 %)	n/a	41.46 (98.35 %)	131,886 (1.65 %)	259,765 (98.35 %)	3,254,173 (23.49 %)	440,431 (2.00 %)	14,258,607 (36.17 %)	48,931 (1.20 %)
812	reindeer (US061 2019) GCA_004026565.1	n/a	24,150 (1.39 %)	39,911 (1.41 %)	n/a	42.08 (99.89 %)	4,769 (0.02 %)	1,365,508 (99.98 %)	6,083,178 (46.10 %)	546,470 (1.23 %)	14,434,855 (43.16 %)	55,319 (1.23 %)
813	Rice's whale (hap1 2023) GCA_028017805.1	n/a	19,396 (1.48 %)	21,693 (1.26 %)	n/a	41.62 (97.80 %)	131 (2.20 %)	1,039 (100.00 %)	3,973,936 (35.55 %)	987,571 (11.66 %)	12,473,459 (42.11 %)	74,971 (1.64 %)
814	Rice's whale (hap2 2023 refseq) GCF_028023285.1	59,888 (2.34 %)	19,291 (1.53 %)	21,195 (1.30 %)	n/a	41.44 (99.90 %)	334 (0.10 %)	774 (100.00 %)	3,917,923 (36.26 %)	828,521 (9.28 %)	12,518,796 (41.08 %)	73,126 (1.69 %)
815	Rickett's big-footed myotis (AB-2021 2024) GCA_036010255.1	n/a	18,982 (1.81 %)	22,002 (1.76 %)	n/a	43.12 (100.00 %)	n/a	105 (100.00 %)	2,909,847 (24.53 %)	757,964 (3.03 %)	10,561,925 (36.25 %)	57,318 (2.32 %)
816	Risso's dolphin GCF_964374135.1	37,640 (1.92 %)	18,598 (1.56 %)	20,984 (1.29 %)	n/a	42.25 (99.99 %)	1,138 (0.01 %)	2,283 (99.99 %)	5,101,286 (54.29 %)	1,342,544 (11.28 %)	12,274,011 (41.76 %)	76,936 (4.65 %)
817	Risso's dolphin (hap1.1 2024) GCA_964374135.1	n/a	18,825 (1.58 %)	20,986 (1.29 %)	n/a	42.25 (99.99 %)	1,138 (0.01 %)	1,150 (100.00 %)	4,405,513 (43.51 %)	1,342,544 (11.28 %)	12,274,096 (41.76 %)	76,936 (4.65 %)
818	Risso's dolphin (hap2.1 2024) GCA_964374185.1	n/a	18,061 (1.68 %)	20,080 (1.36 %)	n/a	41.97 (99.99 %)	1,073 (0.01 %)	2,135 (99.99 %)	3,948,427 (43.52 %)	848,222 (8.00 %)	11,527,950 (38.76 %)	70,117 (3.31 %)
819	rodents (hap1 2026) GCA_058744715.1	n/a	19,325 (1.61 %)	21,068 (1.34 %)	n/a	41.35 (100.00 %)	73 (0.00 %)	224 (100.00 %)	4,943,430 (39.29 %)	980,338 (9.21 %)	13,005,095 (37.12 %)	51,129 (1.40 %)
820	rodents (hap2 2026) GCA_058744725.1	n/a	19,322 (1.66 %)	21,110 (1.37 %)	n/a	41.23 (100.00 %)	91 (0.00 %)	223 (100.00 %)	4,873,730 (39.22 %)	928,422 (7.03 %)	13,088,495 (35.57 %)	47,812 (1.36 %)
821	root vole (2023) GCA_963919705.1	n/a	19,293 (1.92 %)	20,635 (1.67 %)	n/a	42.30 (100.00 %)	3 (0.00 %)	268 (100.00 %)	4,396,130 (38.90 %)	891,534 (2.66 %)	12,119,692 (31.39 %)	19,542 (0.63 %)
822	Ryukyu mouse (2026) GCF_978045245.1	58,951 (2.50 %)	22,322 (1.90 %)	19,296 (1.22 %)	n/a	41.31 (100.00 %)	1,393 (0.00 %)	1,195 (100.00 %)	5,665,093 (45.11 %)	1,943,248 (10.22 %)	12,791,355 (41.32 %)	20,072 (0.50 %)
823	Ryukyu mouse (v2 2017) GCF_900094665.2	53,792 (2.85 %)	21,351 (2.29 %)	18,073 (1.39 %)	n/a	41.70 (89.05 %)	306,599 (10.98 %)	30,835 (92.70 %)	4,479,912 (35.83 %)	1,351,677 (2.59 %)	12,964,608 (27.49 %)	15,963 (0.43 %)
824	Saanen dairy goat GCA_015443085.1	n/a	19,257 (1.54 %)	21,221 (1.32 %)	n/a	42.30 (100.00 %)	170 (0.00 %)	1,362 (100.00 %)	5,336,862 (47.58 %)	515,161 (2.87 %)	13,144,895 (41.67 %)	58,623 (2.22 %)
825	saddleback dolphin (alternate hap 2023) GCA_949987525.1	n/a	18,509 (1.54 %)	22,514 (1.36 %)	n/a	41.95 (100.00 %)	1 (0.00 %)	7,427 (100.00 %)	3,675,922 (35.75 %)	950,374 (10.49 %)	11,670,399 (40.31 %)	63,587 (3.15 %)
826	saddleback dolphin (alternate hap 2024) GCA_949987525.2	n/a	18,426 (1.62 %)	22,420 (1.35 %)	n/a	41.95 (100.00 %)	1 (0.00 %)	7,427 (100.00 %)	4,448,346 (50.40 %)	950,374 (10.49 %)	11,670,399 (40.31 %)	63,587 (3.15 %)
827	saddleback dolphin (primary hap 2024) GCA_949987515.2	n/a	18,542 (1.57 %)	20,620 (1.32 %)	n/a	42.06 (99.99 %)	968 (0.01 %)	631 (100.00 %)	4,890,277 (52.33 %)	1,258,165 (13.09 %)	12,359,469 (42.64 %)	66,188 (3.91 %)
828	saddleback dolphin (v1 primary hap 2023 refseq) GCF_949987515.1	46,746 (2.39 %)	18,624 (1.49 %)	20,662 (1.31 %)	n/a	42.06 (99.99 %)	968 (0.01 %)	630 (100.00 %)	4,020,676 (35.99 %)	1,259,549 (13.09 %)	12,359,748 (42.64 %)	66,179 (3.91 %)
829	saddleback dolphin (v2 primary hap 2024 refseq) GCF_949987515.2	46,014 (2.36 %)	18,616 (1.49 %)	20,618 (1.32 %)	n/a	42.06 (99.99 %)	968 (0.01 %)	1,598 (99.99 %)	4,020,525 (35.99 %)	1,258,165 (13.09 %)	12,359,758 (42.64 %)	66,188 (3.91 %)
830	saiga antelope GCA_004024985.1	n/a	23,736 (0.84 %)	55,133 (0.88 %)	n/a	42.52 (99.87 %)	2,867 (0.01 %)	1,775,066 (99.99 %)	6,485,113 (49.43 %)	447,097 (0.88 %)	13,972,753 (44.46 %)	46,883 (0.82 %)
831	Schreibers' long-fingered ba GCF_964146895.1	50,853 (3.35 %)	18,113 (2.10 %)	21,266 (1.89 %)	n/a	42.51 (100.00 %)	140 (0.00 %)	186 (100.00 %)	2,843,364 (34.45 %)	457,565 (5.58 %)	10,220,082 (31.02 %)	59,522 (2.81 %)
832	Schreibers' long-fingered bat (US075 2019) GCA_004026525.1	n/a	20,147 (2.06 %)	31,271 (1.82 %)	n/a	42.27 (99.94 %)	6,918 (0.04 %)	184,538 (99.96 %)	2,772,932 (29.66 %)	366,782 (1.13 %)	10,477,531 (28.60 %)	62,520 (2.73 %)
833	Schreibers' long-fingered bat (v2 hap1 2025) GCA_964146895.2	n/a	18,109 (2.10 %)	21,263 (1.89 %)	n/a	42.51 (100.00 %)	140 (0.00 %)	186 (100.00 %)	2,812,261 (34.39 %)	457,565 (5.58 %)	10,220,083 (31.02 %)	59,522 (2.81 %)
834	Schreibers' long-fingered bat (v2 hap2 2025) GCA_964145185.2	n/a	17,286 (2.19 %)	20,474 (1.95 %)	n/a	42.64 (100.00 %)	86 (0.00 %)	254 (100.00 %)	2,610,773 (33.65 %)	389,844 (4.42 %)	9,728,138 (29.49 %)	56,508 (2.97 %)
835	scimitar-horned oryx GCF_014754425.2	51,527 (2.72 %)	19,713 (1.57 %)	21,928 (1.32 %)	n/a	41.74 (99.30 %)	16,241 (0.70 %)	9,089 (100.00 %)	5,435,109 (46.76 %)	414,279 (0.98 %)	13,490,956 (40.45 %)	42,961 (1.10 %)
836	Screaming hairy armadillo GCA_004027955.1	n/a	24,532 (0.39 %)	56,725 (0.46 %)	n/a	39.68 (99.70 %)	2,747 (0.01 %)	7,680,080 (99.99 %)	8,978,735 (36.02 %)	1,516,551 (1.58 %)	32,918,217 (47.67 %)	234,762 (1.56 %)
837	sea otter (GAN:26980312 2017 refseq) GCF_002288905.1	38,140 (2.17 %)	18,578 (1.64 %)	20,913 (1.44 %)	34,179 (1.77 %)	41.56 (98.79 %)	23,134 (1.21 %)	29,589 (98.79 %)	4,703,044 (41.42 %)	721,750 (1.39 %)	14,065,653 (32.89 %)	55,388 (1.87 %)
838	Seba's short-tailed bat GCA_004027735.1	n/a	21,878 (0.94 %)	55,858 (1.10 %)	n/a	42.70 (99.84 %)	3,864 (0.01 %)	1,929,203 (99.99 %)	3,802,235 (28.35 %)	606,320 (1.03 %)	15,171,250 (31.99 %)	118,227 (2.28 %)
839	sei whale GCF_965194805.1	89,176 (6.49 %)	19,289 (1.32 %)	21,865 (1.14 %)	n/a	41.99 (99.99 %)	1,179 (0.01 %)	2,571 (100.00 %)	4,862,311 (59.97 %)	1,097,215 (21.14 %)	12,203,838 (50.47 %)	80,128 (1.58 %)
840	sei whale (hap1.1 2025) GCA_965194805.1	n/a	19,292 (1.27 %)	21,865 (1.14 %)	n/a	41.99 (99.99 %)	1,179 (0.01 %)	2,572 (100.00 %)	4,525,289 (42.25 %)	1,097,216 (21.14 %)	12,203,884 (50.47 %)	80,128 (1.58 %)
841	sei whale (hap2.1 2025) GCA_965194725.1	n/a	19,313 (1.37 %)	21,662 (1.17 %)	n/a	41.68 (99.99 %)	1,066 (0.01 %)	2,917 (99.99 %)	4,418,625 (42.98 %)	875,114 (15.81 %)	12,360,254 (46.52 %)	78,537 (1.66 %)
842	sheep (hu hu3095 2024) GCA_040805955.1	n/a	19,388 (1.42 %)	21,612 (1.28 %)	n/a	43.17 (100.00 %)	n/a	28 (100.00 %)	5,311,536 (44.06 %)	653,238 (7.29 %)	12,937,231 (44.10 %)	63,230 (6.03 %)
843	sheep (OAR_USU_Benz2616 2023) GCF_016772045.2	89,680 (5.44 %)	19,308 (1.52 %)	21,506 (1.35 %)	n/a	42.01 (100.00 %)	84 (0.00 %)	143 (100.00 %)	3,275,767 (22.85 %)	464,346 (1.26 %)	12,987,607 (40.61 %)	44,477 (1.28 %)
844	sheep (Texel 2015) GCA_000298735.2	n/a	19,179 (1.56 %)	19,001 (1.26 %)	48,105 (1.85 %)	41.90 (98.94 %)	44,566 (1.07 %)	48,481 (98.93 %)	5,429,824 (46.13 %)	540,267 (1.64 %)	13,509,668 (38.83 %)	43,911 (1.13 %)
845	short-tailed field vole (hap1.1 2026) GCA_987114375.1	n/a	20,597 (1.43 %)	22,792 (1.32 %)	n/a	n/a	349 (0.00 %)	1,296 (100.00 %)	7,143,482 (56.52 %)	1,606,680 (8.13 %)	12,067,439 (46.41 %)	22,002 (0.55 %)
846	short-tailed shrew (CBP01580 primary hap 2026) GCA_051295465.2	n/a	16,479 (1.36 %)	21,313 (1.48 %)	n/a	42.66 (99.98 %)	2,066 (0.02 %)	2,486 (99.98 %)	6,370,533 (45.64 %)	1,336,462 (5.34 %)	11,780,354 (42.31 %)	51,740 (1.94 %)
847	shrew mouse GCF_900095145.1	46,279 (2.64 %)	20,549 (2.23 %)	18,979 (1.49 %)	94,079 (3.98 %)	41.89 (90.53 %)	269,643 (9.50 %)	17,879 (93.73 %)	4,788,498 (38.32 %)	1,499,714 (3.03 %)	13,021,757 (27.83 %)	16,787 (0.47 %)
848	Siberian hamster (SSSS 2022) GCA_023856395.1	n/a	18,375 (1.83 %)	17,066 (1.44 %)	n/a	41.27 (99.64 %)	88,601 (0.37 %)	7,756 (100.00 %)	3,152,242 (21.63 %)	1,087,009 (2.64 %)	12,055,167 (29.20 %)	15,455 (0.48 %)
849	Siberian musk deer (BS20 2019 Broad) GCA_004024705.1	n/a	23,440 (1.32 %)	37,497 (1.19 %)	n/a	42.32 (99.86 %)	19,764 (0.07 %)	1,195,467 (99.93 %)	6,726,950 (49.79 %)	437,480 (1.57 %)	14,155,240 (46.22 %)	49,177 (1.05 %)
850	sika deer (Changchun, China MLH-2022 2023) GCA_034195675.1	n/a	20,087 (1.59 %)	23,556 (1.46 %)	n/a	41.66 (99.97 %)	1,724 (0.03 %)	1,889 (100.00 %)	3,925,148 (27.17 %)	419,490 (1.24 %)	13,364,988 (37.79 %)	47,630 (1.31 %)
851	small Madagascar hedgehog GCF_000313985.2	37,090 (1.93 %)	18,969 (1.19 %)	19,298 (1.31 %)	n/a	43.01 (88.43 %)	270,406 (11.60 %)	7,490 (100.00 %)	3,789,337 (28.89 %)	429,226 (0.87 %)	16,951,112 (32.23 %)	39,993 (0.70 %)
852	smoky shrew (2023) GCF_029834395.1	37,165 (1.66 %)	17,572 (1.06 %)	24,146 (1.29 %)	n/a	43.43 (100.00 %)	n/a	497 (100.00 %)	2,593,080 (14.11 %)	1,194,567 (7.25 %)	14,051,522 (48.20 %)	107,473 (2.80 %)
853	snow leopard (11264 2022) GCF_023721935.1	53,569 (3.37 %)	18,780 (1.67 %)	21,038 (1.40 %)	n/a	41.60 (99.30 %)	23,786 (0.70 %)	2,636 (100.00 %)	4,714,429 (34.93 %)	919,518 (1.59 %)	13,711,504 (33.24 %)	64,690 (2.41 %)
854	snowshoe hare GCA_004026855.1	n/a	23,263 (0.88 %)	55,811 (1.01 %)	n/a	44.12 (99.87 %)	10,153 (0.03 %)	1,602,982 (99.97 %)	4,767,120 (21.29 %)	1,040,992 (2.22 %)	15,680,144 (43.23 %)	126,152 (2.28 %)
855	social tuco-tuco GCA_004027165.1	n/a	25,166 (1.12 %)	41,316 (1.26 %)	n/a	40.71 (99.89 %)	16,191 (0.06 %)	823,762 (99.94 %)	5,390,906 (28.28 %)	1,027,922 (2.15 %)	15,241,308 (38.39 %)	31,883 (0.72 %)
856	Soft-furred tree mouse (WYS1704033 2022) GCA_023101885.1	n/a	20,505 (1.36 %)	25,606 (1.53 %)	n/a	42.21 (99.64 %)	3,794 (0.36 %)	1,243 (100.00 %)	5,973,279 (45.08 %)	1,551,851 (4.63 %)	13,570,249 (38.60 %)	73,762 (1.53 %)
857	soprano pipistrelle (alternate hap 2023) GCA_949987765.1	n/a	17,590 (1.81 %)	21,597 (1.85 %)	n/a	42.88 (100.00 %)	1 (0.00 %)	2,717 (100.00 %)	2,734,555 (21.46 %)	795,752 (6.56 %)	9,601,735 (36.35 %)	62,524 (3.25 %)
858	soprano pipistrelle (hap1.2 2025) GCA_949987585.2	n/a	17,999 (1.88 %)	21,396 (1.80 %)	n/a	42.74 (100.00 %)	122 (0.00 %)	330 (100.00 %)	4,426,108 (44.40 %)	866,819 (7.44 %)	10,132,985 (37.65 %)	64,680 (3.15 %)
859	soprano pipistrelle (hap2.2 2025) GCA_949987765.2	n/a	17,269 (1.90 %)	20,534 (1.83 %)	n/a	42.89 (100.00 %)	87 (0.00 %)	369 (100.00 %)	4,151,522 (43.86 %)	809,312 (8.01 %)	9,615,104 (37.56 %)	63,890 (3.24 %)
860	soprano pipistrelle (primary hap 2023) GCA_949987585.1	n/a	18,056 (1.78 %)	21,158 (1.79 %)	n/a	42.67 (100.00 %)	161 (0.00 %)	249 (100.00 %)	2,899,535 (21.64 %)	853,717 (7.80 %)	10,162,216 (37.72 %)	63,256 (3.06 %)
861	South African ground squirrel GCA_004024805.1	n/a	22,802 (1.44 %)	33,892 (1.27 %)	n/a	39.97 (99.92 %)	9,745 (0.04 %)	587,115 (99.96 %)	5,256,998 (34.93 %)	594,122 (1.27 %)	14,462,947 (33.96 %)	34,141 (0.80 %)
862	Southeastern Asian house mouse (2016) GCA_001624445.1	n/a	21,103 (2.24 %)	18,682 (1.45 %)	102,099 (4.16 %)	41.83 (86.23 %)	424,005 (13.83 %)	52,352 (97.85 %)	4,990,851 (39.88 %)	1,356,202 (2.67 %)	13,469,640 (26.15 %)	16,724 (0.41 %)
863	Southeastern Asian house mouse (2022) GCA_921999005.2	n/a	21,799 (2.13 %)	19,729 (1.40 %)	110,356 (4.43 %)	41.78 (99.19 %)	278 (0.81 %)	151 (100.00 %)	4,663,228 (40.41 %)	1,549,985 (3.70 %)	13,012,600 (34.99 %)	21,349 (0.52 %)
864	Southeastern Asian house mouse (T2T 2024) GCA_964188545.1	n/a	22,529 (1.85 %)	20,409 (1.22 %)	n/a	41.10 (99.90 %)	78 (0.10 %)	416 (99.90 %)	4,880,101 (47.77 %)	1,689,287 (15.13 %)	12,822,147 (42.92 %)	22,642 (0.54 %)
865	Southern African pygmy mouse (2020) GCA_902729485.2	n/a	21,253 (2.02 %)	24,053 (1.41 %)	n/a	41.62 (85.36 %)	63,317 (14.65 %)	92,356 (85.35 %)	5,677,434 (41.24 %)	1,683,338 (3.20 %)	13,320,768 (28.29 %)	21,132 (0.44 %)
866	southern elephant seal GCF_011800145.1	53,210 (2.86 %)	19,520 (1.73 %)	20,727 (1.41 %)	39,634 (1.86 %)	41.45 (99.36 %)	22,850 (0.64 %)	1,115 (100.00 %)	4,728,105 (43.75 %)	585,443 (1.13 %)	13,463,979 (33.65 %)	53,182 (1.62 %)
867	southern flying squirrel (Volans SFS_CC1 2021) GCA_020662805.1	n/a	19,813 (1.54 %)	25,643 (1.37 %)	n/a	40.48 (98.33 %)	53,082 (1.67 %)	114,190 (98.33 %)	5,649,834 (41.22 %)	689,166 (1.55 %)	14,561,421 (30.61 %)	37,158 (0.90 %)
868	southern grasshopper mouse (2020 genbank) GCA_903995425.1	n/a	19,395 (1.68 %)	18,821 (1.36 %)	n/a	41.81 (98.94 %)	2,143 (1.06 %)	2,949 (100.00 %)	4,850,480 (28.64 %)	1,195,836 (2.72 %)	13,539,823 (32.73 %)	18,046 (0.54 %)
869	southern grasshopper mouse (2020 refseq) GCF_903995425.1	47,152 (2.39 %)	19,356 (1.68 %)	18,821 (1.36 %)	n/a	41.81 (98.94 %)	2,143 (1.06 %)	2,949 (100.00 %)	4,850,460 (28.64 %)	1,195,836 (2.72 %)	13,540,762 (32.73 %)	18,046 (0.54 %)
870	Southern marsupial mole (Waite Creek area ABTC07570 2026) GCA_048126345.2	n/a	24,714 (0.82 %)	18,971 (0.87 %)	n/a	37.80 (99.99 %)	211 (0.01 %)	688 (100.00 %)	13,545,658 (58.39 %)	1,450,475 (2.40 %)	21,374,274 (47.19 %)	17,923 (0.30 %)
871	southern multimammate mouse GCF_008632895.1	69,058 (3.04 %)	20,313 (2.11 %)	17,745 (1.38 %)	n/a	41.39 (91.90 %)	146,713 (8.12 %)	28 (100.00 %)	4,875,400 (38.43 %)	1,454,350 (2.93 %)	13,104,717 (28.82 %)	16,715 (0.45 %)
872	southern tamandua (mTamTet1 alternate hap 2022) GCA_023853755.1	n/a	20,179 (1.21 %)	24,249 (1.19 %)	n/a	39.54 (100.00 %)	4 (0.00 %)	7,866 (100.00 %)	3,953,031 (35.88 %)	531,111 (1.14 %)	16,354,874 (39.96 %)	59,907 (1.35 %)
873	southern tamandua (mTamTet1 primary hap 2022 genbank) GCA_023851605.1	n/a	20,058 (1.26 %)	22,196 (1.13 %)	n/a	39.48 (99.44 %)	961 (0.56 %)	201 (100.00 %)	4,037,291 (46.02 %)	593,019 (1.17 %)	18,033,833 (40.56 %)	65,039 (1.33 %)
874	southern tamandua (mTamTet1 primary hap 2022 refseq) GCF_023851605.1	84,279 (3.04 %)	20,960 (1.28 %)	22,188 (1.13 %)	n/a	39.48 (99.44 %)	961 (0.56 %)	200 (100.00 %)	4,793,649 (47.24 %)	593,018 (1.17 %)	18,033,318 (40.56 %)	65,039 (1.33 %)
875	southern three-banded armadillo GCA_004025125.1	n/a	29,138 (0.73 %)	56,522 (0.75 %)	n/a	39.20 (99.82 %)	15,801 (0.04 %)	2,941,308 (99.96 %)	6,990,740 (38.88 %)	839,452 (1.23 %)	24,805,397 (43.95 %)	71,951 (0.98 %)
876	southern two-toed sloth (mChoDid1 alternate hap 2020) GCA_015220265.1	n/a	22,897 (1.23 %)	27,007 (1.18 %)	n/a	39.87 (100.00 %)	70 (0.00 %)	12,050 (100.00 %)	4,502,020 (38.27 %)	576,759 (1.02 %)	17,143,050 (40.65 %)	51,339 (1.15 %)
877	southern two-toed sloth (mChoDid1 primary hap 2020) GCF_015220235.1	63,054 (2.39 %)	21,998 (1.29 %)	23,177 (1.18 %)	45,345 (1.69 %)	39.89 (97.48 %)	1,243 (2.52 %)	146 (100.00 %)	4,559,690 (39.66 %)	577,607 (1.02 %)	16,594,630 (40.50 %)	51,430 (1.14 %)
878	southern two-toed sloth (primary hap 2020) GCA_015220235.1	n/a	22,250 (1.38 %)	23,180 (1.18 %)	n/a	39.89 (97.48 %)	1,240 (2.52 %)	146 (100.00 %)	4,830,544 (50.68 %)	577,607 (1.02 %)	16,594,148 (40.49 %)	51,430 (1.14 %)
879	southern white rhinoceros (SDZICR_KB13650 2012 refseq) GCF_000283155.1	37,037 (2.11 %)	18,398 (1.71 %)	19,753 (1.44 %)	n/a	40.90 (96.05 %)	54,737 (3.96 %)	57,824 (96.04 %)	3,685,898 (38.31 %)	421,694 (0.97 %)	14,765,529 (28.93 %)	36,281 (1.02 %)
880	Southern yellow bat (hap1 2026) GCA_058971415.1	n/a	18,554 (1.45 %)	20,850 (1.37 %)	n/a	42.36 (100.00 %)	387 (0.00 %)	835 (100.00 %)	4,105,444 (42.92 %)	958,849 (9.83 %)	11,113,701 (45.96 %)	72,495 (5.06 %)
881	Southern yellow bat (hap2 2026) GCA_058972195.1	n/a	17,721 (1.51 %)	19,825 (1.41 %)	n/a	42.46 (100.00 %)	319 (0.00 %)	591 (100.00 %)	3,812,032 (41.99 %)	848,611 (8.64 %)	10,398,244 (44.23 %)	68,141 (4.77 %)
882	Southwestern Myotis (B2S1-17 2026) GCA_056320785.1	n/a	18,875 (1.85 %)	22,011 (1.71 %)	n/a	n/a	29 (0.00 %)	136 (100.00 %)	5,312,069 (47.61 %)	749,174 (5.12 %)	10,598,311 (37.85 %)	66,243 (2.71 %)
883	Sowerby's beaked whale GCF_964165515.1	50,568 (2.18 %)	19,470 (1.39 %)	22,885 (1.24 %)	n/a	42.04 (99.99 %)	1,095 (0.01 %)	2,696 (99.99 %)	4,774,485 (38.32 %)	825,474 (10.97 %)	11,375,525 (45.31 %)	76,527 (3.10 %)
884	Sowerby's beaked whale (hap1 2024) GCA_964165515.1	n/a	19,471 (1.39 %)	22,951 (1.24 %)	n/a	42.04 (99.99 %)	1,095 (0.01 %)	1,604 (100.00 %)	4,307,839 (34.31 %)	825,475 (10.97 %)	11,375,945 (45.31 %)	76,527 (3.10 %)
885	Sowerby's beaked whale (hap2 2024) GCA_964148845.1	n/a	18,591 (1.46 %)	21,588 (1.27 %)	n/a	42.00 (99.99 %)	974 (0.01 %)	2,126 (99.99 %)	3,961,403 (34.20 %)	742,897 (9.73 %)	10,832,739 (43.68 %)	70,803 (2.85 %)
886	Sowerby's beaked whale (US080 2019) GCA_004027085.1	n/a	22,800 (1.32 %)	38,247 (1.17 %)	n/a	41.68 (99.84 %)	8,597 (0.03 %)	1,810,317 (99.97 %)	5,520,986 (45.05 %)	1,081,962 (2.69 %)	13,480,261 (43.01 %)	69,001 (1.39 %)
887	sperm whale (hap1.1 2026) GCA_978012005.1	n/a	19,211 (1.53 %)	21,574 (1.27 %)	n/a	42.19 (100.00 %)	357 (0.00 %)	783 (100.00 %)	4,849,649 (50.53 %)	873,547 (8.11 %)	11,855,809 (42.39 %)	103,167 (3.00 %)
888	sperm whale (SW-GA 2023) GCF_002837175.3	62,616 (2.83 %)	19,485 (1.75 %)	22,707 (1.41 %)	n/a	41.33 (95.82 %)	121,387 (4.20 %)	133,555 (95.80 %)	3,906,439 (36.43 %)	691,647 (2.39 %)	13,489,368 (32.95 %)	86,751 (2.23 %)
889	spotted hyena (KB4526 2019) GCF_008692635.1	44,813 (2.42 %)	17,929 (1.62 %)	18,444 (1.40 %)	n/a	41.48 (99.10 %)	259,266 (0.92 %)	283,944 (99.08 %)	5,744,848 (42.15 %)	646,532 (1.63 %)	13,599,442 (32.09 %)	61,299 (2.04 %)
890	spotted-tailed quoll (Chaos hap1 2025) GCA_048593285.1	n/a	15,188 (0.80 %)	15,406 (0.90 %)	n/a	36.07 (99.97 %)	151 (0.03 %)	157 (99.97 %)	4,933,924 (23.65 %)	1,239,006 (2.76 %)	20,612,787 (41.98 %)	21,700 (0.64 %)
891	spotted-tailed quoll (Chaos hap2 2025) GCA_048593245.1	n/a	15,441 (0.80 %)	15,791 (0.92 %)	n/a	36.12 (99.99 %)	118 (0.01 %)	124 (99.99 %)	4,962,547 (23.62 %)	1,257,253 (2.87 %)	20,652,321 (42.01 %)	22,718 (0.69 %)
892	star-nosed mole GCF_000260355.1	30,444 (2.86 %)	16,116 (1.82 %)	17,403 (1.78 %)	n/a	41.55 (95.10 %)	82,557 (4.92 %)	84,595 (95.08 %)	1,855,039 (18.90 %)	308,473 (0.86 %)	9,571,561 (26.02 %)	48,079 (2.76 %)
893	Steller sea lion GCF_004028035.1	46,044 (2.38 %)	21,171 (1.78 %)	21,626 (1.43 %)	36,701 (1.75 %)	41.38 (99.41 %)	18,994 (0.59 %)	24,485 (99.41 %)	4,556,415 (43.53 %)	577,797 (1.09 %)	13,545,012 (33.71 %)	51,355 (1.45 %)
894	Stephens's kangaroo rat GCA_004024685.1	n/a	20,638 (1.19 %)	43,541 (1.37 %)	n/a	41.90 (99.85 %)	8,882 (0.04 %)	1,278,525 (99.96 %)	4,886,095 (30.36 %)	1,229,832 (5.30 %)	11,334,494 (44.33 %)	38,450 (1.17 %)
895	steppe mouse (ZRU 2018) GCA_003336285.1	n/a	22,032 (2.17 %)	20,891 (1.41 %)	n/a	41.70 (95.78 %)	123,681 (4.24 %)	161,217 (95.76 %)	4,964,415 (42.35 %)	1,414,584 (2.75 %)	12,989,925 (31.80 %)	17,544 (0.44 %)
896	Stoliczka's trident bat (China 2021113_DDA alternate hap 2024) GCA_043727795.1	n/a	18,498 (1.82 %)	20,345 (1.58 %)	n/a	41.33 (100.00 %)	2 (0.00 %)	2,228 (100.00 %)	4,403,018 (41.05 %)	809,880 (2.56 %)	11,206,839 (32.61 %)	38,354 (1.36 %)
897	Stoliczka's trident bat (China 2021113_DDA primary hap 2024) GCA_043727835.1	n/a	19,605 (1.80 %)	20,075 (1.48 %)	n/a	41.32 (100.00 %)	87 (0.00 %)	80 (100.00 %)	4,110,913 (40.46 %)	838,212 (2.48 %)	11,938,168 (33.52 %)	40,424 (1.32 %)
898	straw-colored fruit bat GCA_000465285.1	n/a	20,161 (1.66 %)	40,283 (1.50 %)	n/a	39.24 (99.62 %)	154,908 (0.40 %)	288,446 (99.60 %)	2,814,732 (32.92 %)	372,539 (1.01 %)	12,351,823 (25.93 %)	67,245 (2.34 %)
899	stripe-headed round-eared bat GCA_004024845.1	n/a	20,248 (1.62 %)	29,173 (1.61 %)	n/a	42.04 (99.96 %)	2,860 (0.01 %)	252,670 (99.99 %)	3,018,746 (29.48 %)	333,243 (0.74 %)	12,128,116 (30.51 %)	59,513 (1.87 %)
900	striped dolphin (alternate hap 2023) GCA_951394445.1	n/a	18,204 (1.54 %)	21,036 (1.34 %)	n/a	42.07 (100.00 %)	n/a	3,464 (100.00 %)	3,767,720 (35.65 %)	1,102,723 (10.92 %)	11,794,617 (40.96 %)	67,537 (3.57 %)
901	striped dolphin (primary hap 2023 genbank) GCA_951394435.1	n/a	18,595 (1.48 %)	20,637 (1.29 %)	n/a	42.18 (99.99 %)	993 (0.01 %)	639 (100.00 %)	4,097,623 (35.88 %)	1,442,973 (13.60 %)	12,327,244 (43.08 %)	68,498 (4.29 %)
902	striped dolphin (primary hap 2023 refseq) GCF_951394435.1	55,298 (2.72 %)	18,760 (1.55 %)	20,645 (1.29 %)	n/a	42.18 (99.99 %)	993 (0.01 %)	1,630 (99.99 %)	5,991,283 (52.35 %)	1,442,973 (13.60 %)	12,326,846 (43.08 %)	68,498 (4.29 %)
903	striped hyena (BS54 2019 Broad) GCA_004023945.1	n/a	22,373 (1.45 %)	39,382 (1.45 %)	n/a	41.66 (99.93 %)	11,849 (0.05 %)	362,072 (99.95 %)	5,048,667 (42.42 %)	712,073 (1.24 %)	13,879,012 (34.58 %)	69,835 (2.20 %)
904	striped hyena (Hyena2069 2018 Potsdam U) GCF_003009895.1	48,870 (2.41 %)	18,793 (1.67 %)	20,950 (1.44 %)	n/a	41.56 (99.29 %)	23,058 (0.71 %)	5,761 (100.00 %)	4,782,500 (41.88 %)	701,157 (1.32 %)	13,436,624 (33.05 %)	58,977 (2.20 %)
905	sugar glider (PSGF00001 2023 genbank) GCA_028583685.1	n/a	19,326 (0.81 %)	17,560 (0.95 %)	n/a	38.95 (98.12 %)	85,933 (1.89 %)	1,895 (100.00 %)	6,382,198 (27.07 %)	1,058,207 (1.74 %)	22,508,040 (39.84 %)	16,224 (0.33 %)
906	sugar glider (PSGF00001 2023 refseq) GCF_028583685.1	55,990 (2.41 %)	19,328 (0.81 %)	17,559 (0.95 %)	n/a	38.95 (98.12 %)	85,933 (1.89 %)	1,896 (100.00 %)	6,382,203 (27.07 %)	1,058,208 (1.74 %)	22,508,106 (39.84 %)	16,224 (0.33 %)
907	Sumatran rhinoceros (hap1 2026) GCA_060039915.1	n/a	18,591 (1.58 %)	22,216 (1.40 %)	n/a	41.01 (100.00 %)	246 (0.00 %)	404 (100.00 %)	5,002,790 (48.58 %)	498,846 (1.86 %)	15,182,511 (34.12 %)	43,768 (1.30 %)
908	Sumatran rhinoceros (hap2 2026) GCA_060039925.1	n/a	17,652 (1.59 %)	20,770 (1.39 %)	n/a	41.19 (100.00 %)	221 (0.00 %)	888 (100.00 %)	4,702,969 (48.73 %)	501,843 (3.62 %)	13,805,271 (34.22 %)	41,269 (1.27 %)
909	Sumatran rhinoceros (Ipuh 2017) GCA_002844835.1	n/a	20,368 (1.53 %)	24,204 (1.23 %)	n/a	41.05 (95.54 %)	50,876 (4.40 %)	1,112,463 (95.60 %)	4,516,240 (39.90 %)	561,540 (1.56 %)	15,821,451 (34.68 %)	45,201 (1.03 %)
910	Sumatran serow (serow.1 2024) GCF_032405125.1	36,400 (1.65 %)	19,192 (1.42 %)	22,014 (1.41 %)	n/a	43.08 (100.00 %)	6 (0.00 %)	159 (100.00 %)	3,242,768 (21.18 %)	612,565 (8.05 %)	12,812,990 (44.37 %)	75,177 (5.86 %)
911	Sunda flying lemur (2014 WashU) GCF_000696425.1	34,734 (1.83 %)	21,356 (1.55 %)	25,832 (1.21 %)	n/a	40.21 (87.96 %)	412,608 (12.07 %)	511,878 (87.93 %)	4,961,153 (38.35 %)	854,441 (3.33 %)	17,562,576 (28.82 %)	82,988 (1.05 %)
912	Sunda flying lemur (US047 2019 Broad) GCA_004027255.1	n/a	24,882 (1.29 %)	43,546 (1.12 %)	n/a	40.46 (99.88 %)	5,895 (0.02 %)	1,655,642 (99.98 %)	5,807,241 (38.62 %)	953,765 (2.48 %)	18,836,777 (37.68 %)	114,955 (1.43 %)
913	Svalbard reindeer (2023) GCA_949782905.1	n/a	20,041 (1.43 %)	24,148 (1.33 %)	n/a	n/a	267 (0.00 %)	1,397 (100.00 %)	6,222,102 (52.46 %)	620,954 (9.09 %)	12,654,829 (44.33 %)	52,994 (1.36 %)
914	tailed tailless bat GCA_004027475.1	n/a	19,920 (1.58 %)	28,017 (1.58 %)	n/a	41.76 (99.95 %)	4,640 (0.02 %)	341,895 (99.98 %)	3,139,817 (30.43 %)	381,536 (0.81 %)	12,069,229 (32.73 %)	54,528 (2.15 %)
915	tailess tenrec (hap1 2025 genbank) GCA_050624435.1	n/a	21,323 (0.86 %)	25,222 (1.02 %)	n/a	44.80 (100.00 %)	175 (0.00 %)	2,180 (100.00 %)	5,682,996 (38.93 %)	1,001,072 (14.26 %)	17,866,411 (50.04 %)	53,320 (1.01 %)
916	tailess tenrec (hap1 2025 refseq) GCF_050624435.1	45,770 (1.60 %)	21,323 (0.86 %)	25,223 (1.02 %)	n/a	44.80 (100.00 %)	175 (0.00 %)	2,180 (100.00 %)	5,633,466 (38.91 %)	1,001,072 (14.26 %)	17,866,411 (50.04 %)	53,320 (1.01 %)
917	tailess tenrec (hap2 2025) GCA_050624465.1	n/a	20,180 (0.96 %)	23,467 (1.13 %)	n/a	44.21 (100.00 %)	160 (0.00 %)	1,233 (100.00 %)	5,074,733 (40.88 %)	791,473 (8.15 %)	16,742,233 (44.91 %)	47,409 (1.01 %)
918	takin (Tak-1 2022) GCF_023091745.1	31,927 (1.65 %)	19,290 (1.42 %)	21,656 (1.27 %)	n/a	43.32 (100.00 %)	152 (0.00 %)	1,363 (100.00 %)	3,256,033 (21.01 %)	714,375 (8.32 %)	13,010,154 (44.58 %)	49,134 (7.43 %)
919	Talazac's shrew tenrec GCA_004026705.1	n/a	22,605 (0.81 %)	50,725 (1.09 %)	n/a	43.03 (99.93 %)	6,619 (0.02 %)	795,514 (99.98 %)	3,493,378 (14.58 %)	705,274 (1.31 %)	20,975,335 (36.85 %)	70,793 (1.26 %)
920	tammar wallaby (alternate hap 2023) GCA_028389975.1	n/a	11,133 (0.77 %)	13,869 (0.98 %)	n/a	38.63 (100.00 %)	2 (0.00 %)	14,285 (100.00 %)	3,114,522 (26.10 %)	661,874 (3.02 %)	11,667,649 (38.41 %)	12,393 (0.46 %)
921	tammar wallaby (Barry hap1 2025) GCA_048593335.1	n/a	17,491 (0.79 %)	15,701 (0.88 %)	n/a	38.69 (100.00 %)	32 (0.00 %)	40 (100.00 %)	5,762,317 (26.52 %)	1,078,692 (1.83 %)	22,476,051 (38.99 %)	22,756 (0.48 %)
922	tammar wallaby (Barry hap2 2025) GCA_048593345.1	n/a	17,037 (0.79 %)	15,066 (0.87 %)	n/a	38.62 (100.00 %)	16 (0.00 %)	24 (100.00 %)	5,608,153 (26.57 %)	1,050,173 (1.77 %)	21,856,273 (38.96 %)	21,811 (0.47 %)
923	tammar wallaby (v2 primary hap 2023 refseq) GCF_028372415.1	73,219 (3.07 %)	17,615 (0.77 %)	15,415 (0.86 %)	n/a	38.73 (99.81 %)	515 (0.19 %)	272 (100.00 %)	5,866,314 (26.30 %)	1,193,604 (2.72 %)	22,677,480 (39.53 %)	23,590 (0.47 %)
924	Tasmanian devil (McLovin hap1 2025) GCA_048593225.1	n/a	15,725 (0.77 %)	16,721 (0.92 %)	n/a	36.17 (99.49 %)	1,514 (0.51 %)	1,521 (99.49 %)	5,222,976 (23.42 %)	1,357,438 (3.95 %)	21,705,122 (42.26 %)	24,443 (0.70 %)
925	Tasmanian devil (McLovin hap2 2025) GCA_048593325.1	n/a	15,165 (0.76 %)	15,663 (0.91 %)	n/a	36.00 (99.11 %)	2,578 (0.89 %)	2,584 (99.11 %)	5,039,957 (23.64 %)	1,257,168 (2.97 %)	20,893,744 (41.44 %)	22,574 (0.67 %)
926	Tasmanian devil (primary hap 2019) GCF_902635505.1	52,070 (2.36 %)	15,918 (0.85 %)	16,111 (0.91 %)	n/a	36.16 (100.00 %)	354 (0.00 %)	106 (100.00 %)	6,789,158 (44.28 %)	1,246,027 (2.19 %)	21,434,803 (41.20 %)	23,609 (0.65 %)
927	Tasmanian wolf (PY-MV-C5757 2022) GCA_007646695.3	n/a	15,896 (0.81 %)	37,523 (1.30 %)	n/a	36.26 (90.01 %)	295,304 (10.01 %)	149,109 (100.00 %)	9,159,284 (56.14 %)	1,604,085 (2.22 %)	21,839,162 (35.42 %)	46,604 (0.74 %)
928	thirteen-lined ground squirrel (2021 HiC) GCF_016881025.1	69,352 (3.50 %)	18,934 (1.68 %)	16,775 (1.37 %)	n/a	39.91 (93.25 %)	146,412 (6.77 %)	7,132 (100.00 %)	4,262,890 (35.64 %)	640,624 (1.64 %)	14,118,452 (27.90 %)	28,317 (0.64 %)
929	thirteen-lined ground squirrel (hap1 2025) GCA_052094955.1	n/a	19,425 (1.31 %)	21,287 (1.27 %)	n/a	40.31 (99.99 %)	1,444 (0.01 %)	5,280 (100.00 %)	6,062,160 (43.45 %)	940,716 (10.02 %)	16,322,133 (37.64 %)	34,544 (0.73 %)
930	thirteen-lined ground squirrel (hap2 2025) GCA_052094965.1	n/a	17,228 (1.41 %)	17,999 (1.30 %)	n/a	39.81 (99.99 %)	1,000 (0.01 %)	1,438 (100.00 %)	5,253,166 (38.98 %)	750,953 (4.01 %)	14,542,518 (32.77 %)	27,458 (0.71 %)
931	thirteen-lined ground squirrel (mIctTri1hap1 2025) GCF_052094955.1	91,025 (3.74 %)	19,425 (1.31 %)	20,977 (1.20 %)	n/a	40.31 (99.99 %)	1,444 (0.01 %)	5,279 (100.00 %)	6,062,154 (43.45 %)	940,716 (10.02 %)	16,322,064 (37.64 %)	34,544 (0.73 %)
932	Tibetan sand fox (lyu1992 2022) GCA_024500485.1	n/a	19,552 (1.59 %)	19,307 (1.35 %)	n/a	41.25 (100.00 %)	145 (0.00 %)	234 (100.00 %)	4,500,832 (32.18 %)	999,068 (2.01 %)	13,646,015 (32.98 %)	49,402 (2.19 %)
933	tiger GCF_018350195.1	71,226 (2.84 %)	18,513 (1.68 %)	19,919 (1.39 %)	n/a	41.64 (100.00 %)	65 (0.00 %)	131 (100.00 %)	4,878,003 (42.77 %)	912,595 (1.82 %)	13,804,650 (33.76 %)	64,312 (2.55 %)
934	Townsend's big-eared bat (COTO_CA2020_CCGPhap1 2025) GCA_026230055.2	n/a	18,747 (1.81 %)	21,398 (1.62 %)	n/a	42.82 (100.00 %)	256 (0.00 %)	381 (100.00 %)	5,017,312 (48.85 %)	779,839 (3.26 %)	10,740,034 (37.51 %)	49,071 (2.44 %)
935	Townsend's big-eared bat (COTO_CA2020_CCGPhap2 2025) GCA_026230045.2	n/a	17,913 (1.88 %)	19,986 (1.66 %)	n/a	42.93 (100.00 %)	239 (0.00 %)	165 (100.00 %)	4,617,916 (47.27 %)	707,796 (3.14 %)	9,951,985 (36.27 %)	46,302 (2.55 %)
936	Townsend's big-eared bat (haplotype 1 of 2 COTO_CA2020_CCGP 2022) GCA_026230055.1	n/a	19,370 (1.77 %)	21,062 (1.61 %)	n/a	42.81 (100.00 %)	219 (0.00 %)	610 (100.00 %)	2,923,694 (25.49 %)	772,382 (3.25 %)	10,654,074 (37.41 %)	48,226 (2.42 %)
937	Townsend's big-eared bat (haplotype 2 of 2 COTO_CA2020_CCGP 2022) GCA_026230045.1	n/a	18,627 (1.82 %)	20,108 (1.67 %)	n/a	42.95 (100.00 %)	217 (0.00 %)	182 (100.00 %)	2,733,927 (24.79 %)	715,258 (3.17 %)	10,099,456 (36.35 %)	47,139 (2.58 %)
938	Transcaucasian mole vole GCA_001685075.1	n/a	20,173 (1.62 %)	18,627 (1.30 %)	n/a	41.51 (96.09 %)	440,846 (3.96 %)	499,269 (96.04 %)	3,827,136 (25.51 %)	810,597 (2.65 %)	13,634,524 (27.54 %)	9,596 (0.16 %)
939	Trefoil horseshoe bat (Malaysia alternate hap 2024) GCA_043728055.1	n/a	17,828 (1.84 %)	20,454 (1.63 %)	n/a	40.66 (100.00 %)	n/a	2,403 (100.00 %)	3,519,024 (41.02 %)	627,372 (2.04 %)	11,034,851 (31.87 %)	33,992 (1.29 %)
940	trefoil horseshoe bat (Malaysia primary hap 2024) GCA_043728145.1	n/a	18,871 (1.79 %)	20,351 (1.55 %)	n/a	40.66 (99.99 %)	397 (0.01 %)	136 (100.00 %)	3,580,957 (40.75 %)	683,947 (2.19 %)	11,464,418 (33.39 %)	37,175 (1.31 %)
941	True's beaked whale (hap1.1 2024 genbank) GCA_964341445.1	n/a	19,530 (1.21 %)	24,576 (1.13 %)	n/a	42.48 (99.99 %)	1,240 (0.01 %)	2,757 (100.00 %)	4,847,855 (34.88 %)	949,927 (20.01 %)	10,981,914 (51.51 %)	91,880 (2.74 %)
942	True's beaked whale (hap1.1 2024 refseq) GCF_964341445.1	51,240 (1.91 %)	19,491 (1.24 %)	24,573 (1.13 %)	n/a	42.48 (99.99 %)	1,240 (0.01 %)	2,756 (100.00 %)	5,445,244 (60.47 %)	949,926 (20.01 %)	10,981,870 (51.51 %)	91,880 (2.74 %)
943	True's beaked whale (hap1.2 2026 genbank) GCA_964341445.2	n/a	19,446 (1.25 %)	23,872 (1.13 %)	n/a	42.50 (99.99 %)	1,215 (0.01 %)	2,365 (100.00 %)	5,438,551 (60.72 %)	947,935 (20.05 %)	10,903,184 (51.60 %)	91,540 (2.75 %)
944	True's beaked whale (hap1.2 2026 refseq) GCF_964341445.2	50,798 (1.91 %)	19,445 (1.25 %)	23,861 (1.13 %)	n/a	n/a	1,215 (0.01 %)	2,364 (100.00 %)	5,295,930 (60.70 %)	951,907 (19.84 %)	10,903,138 (51.60 %)	91,540 (2.75 %)
945	True's beaked whale (hap2.1 2024) GCA_964341485.1	n/a	19,313 (1.40 %)	22,642 (1.25 %)	n/a	42.03 (99.99 %)	1,073 (0.01 %)	2,457 (99.99 %)	4,540,507 (37.61 %)	826,104 (12.82 %)	11,296,445 (45.25 %)	80,840 (2.24 %)
946	True's beaked whale (hap2.2 2026) GCA_964341485.2	n/a	19,335 (1.44 %)	23,239 (1.28 %)	n/a	42.03 (99.99 %)	1,073 (0.01 %)	2,453 (99.99 %)	5,186,124 (55.45 %)	826,101 (12.82 %)	11,296,189 (45.25 %)	80,840 (2.24 %)
947	Upper Galilee mountains blind mole rat (2095 2014 refseq) GCF_000622305.1	54,680 (2.07 %)	19,704 (1.26 %)	21,262 (1.20 %)	n/a	41.26 (95.18 %)	201,121 (4.83 %)	356,097 (95.17 %)	6,165,645 (34.95 %)	1,197,750 (2.77 %)	16,282,383 (36.21 %)	22,905 (0.49 %)
948	Vancouver Island marmot (RANI-1049 2019) GCA_005458795.1	n/a	19,867 (1.62 %)	15,893 (1.33 %)	n/a	39.77 (94.43 %)	296,819 (5.60 %)	315,631 (94.40 %)	4,452,628 (33.94 %)	751,210 (1.84 %)	13,917,879 (30.08 %)	26,541 (0.58 %)
949	vaquita (alternate hap mPhoSin1 2019) GCA_008692045.1	n/a	9,367 (1.66 %)	11,297 (1.30 %)	n/a	41.50 (100.00 %)	1 (0.00 %)	9,470 (100.00 %)	1,708,360 (43.81 %)	267,584 (1.67 %)	5,373,410 (33.52 %)	29,783 (1.94 %)
950	vaquita (mPhoSin1 2019) GCF_008692025.1	60,106 (3.00 %)	18,611 (1.76 %)	20,103 (1.39 %)	35,176 (2.22 %)	41.36 (99.66 %)	212 (0.34 %)	64 (100.00 %)	4,067,454 (44.25 %)	602,407 (1.34 %)	12,468,582 (35.55 %)	66,806 (1.79 %)
951	vaquita (primary hap 2019) GCA_008692025.1	n/a	18,599 (1.75 %)	20,104 (1.39 %)	35,398 (2.22 %)	41.36 (99.66 %)	212 (0.34 %)	65 (100.00 %)	4,067,518 (44.25 %)	602,407 (1.34 %)	12,468,653 (35.55 %)	66,806 (1.79 %)
952	water buffalo (Mediterranean 2018) GCF_003121395.1	69,771 (3.14 %)	19,465 (1.58 %)	21,849 (1.37 %)	46,051 (1.86 %)	41.81 (99.99 %)	410 (0.01 %)	509 (100.00 %)	5,407,697 (47.11 %)	473,976 (1.54 %)	13,015,899 (41.23 %)	43,120 (1.15 %)
953	water buffalo (Murrah 2021) GCF_019923935.1	80,565 (3.26 %)	19,402 (1.59 %)	20,375 (1.31 %)	n/a	41.75 (100.00 %)	659 (0.00 %)	26 (100.00 %)	5,358,548 (47.11 %)	447,338 (1.14 %)	13,034,537 (41.28 %)	40,189 (1.07 %)
954	water vole (JQ59JK4JDI 2023) GCA_019206885.2	n/a	18,401 (2.03 %)	18,085 (1.65 %)	n/a	42.19 (89.99 %)	161,581 (10.04 %)	2,585 (100.00 %)	4,771,963 (38.17 %)	705,400 (1.96 %)	11,410,837 (25.00 %)	16,195 (0.52 %)
955	Weddell seal (Sample4059 2025) GCF_054177405.1	64,922 (3.92 %)	20,961 (1.71 %)	22,100 (1.30 %)	n/a	41.56 (101.48 %)	51,965 (0.82 %)	396,181 (100.00 %)	4,778,614 (41.37 %)	576,425 (1.10 %)	14,014,212 (32.58 %)	53,779 (1.51 %)
956	Weddell seal (WS11-02 2013 refseq) GCF_000349705.1	48,264 (2.73 %)	21,063 (1.73 %)	22,333 (1.43 %)	n/a	41.39 (70.44 %)	152,836 (29.58 %)	169,547 (70.42 %)	4,420,479 (41.72 %)	471,256 (0.66 %)	13,410,237 (22.09 %)	48,738 (1.01 %)
957	western European hedgehog (2012 refseq) GCF_000296755.1	29,923 (1.67 %)	18,067 (1.33 %)	19,777 (1.35 %)	n/a	41.54 (85.94 %)	219,764 (14.09 %)	225,567 (85.91 %)	6,594,783 (45.66 %)	1,271,533 (2.29 %)	12,374,161 (42.02 %)	28,528 (0.71 %)
958	western European hedgehog (alternate hap 2023) GCA_950295305.1	n/a	14,370 (1.06 %)	24,297 (1.27 %)	n/a	42.08 (100.00 %)	1 (0.00 %)	26,601 (100.00 %)	3,360,923 (19.59 %)	1,043,098 (3.92 %)	8,511,380 (53.68 %)	23,321 (0.97 %)
959	western European hedgehog (primary hap 2023 refseq) GCF_950295315.1	61,103 (2.36 %)	18,125 (1.16 %)	20,689 (1.21 %)	n/a	42.00 (99.97 %)	3,760 (0.03 %)	1,174 (100.00 %)	4,891,329 (19.68 %)	1,507,929 (3.81 %)	12,571,105 (54.50 %)	32,667 (0.90 %)
960	western European house mouse (C57BL/6 2026) GCA_056825265.1	n/a	22,725 (1.91 %)	20,127 (1.25 %)	n/a	41.32 (100.00 %)	n/a	22 (100.00 %)	5,054,625 (45.46 %)	1,712,800 (10.08 %)	12,627,747 (41.14 %)	24,439 (0.56 %)
961	western European house mouse (WSB_EiJ v3 2022) GCA_921998345.2	n/a	21,722 (2.14 %)	19,586 (1.39 %)	108,856 (4.46 %)	41.81 (98.87 %)	1,233 (1.13 %)	233 (100.00 %)	4,634,551 (40.61 %)	1,541,826 (3.49 %)	13,030,566 (35.21 %)	22,985 (0.56 %)
962	western roe deer (2023) GCA_951849835.1	n/a	20,291 (1.29 %)	23,555 (1.23 %)	n/a	42.31 (100.00 %)	n/a	212 (100.00 %)	4,204,612 (25.49 %)	848,463 (7.79 %)	12,687,776 (48.28 %)	57,315 (1.25 %)
963	western spotted skunk GCA_004023965.1	n/a	21,665 (1.46 %)	34,370 (1.32 %)	n/a	41.61 (99.92 %)	11,822 (0.05 %)	433,831 (99.95 %)	4,889,781 (40.77 %)	901,906 (2.30 %)	13,931,764 (34.80 %)	54,394 (1.54 %)
964	western wild mouse (SPRET_EiJ v3 2022) GCA_921997135.2	n/a	21,699 (2.10 %)	18,837 (1.32 %)	n/a	41.69 (99.51 %)	1,576 (0.49 %)	143 (100.00 %)	4,507,329 (41.24 %)	1,517,241 (3.77 %)	12,832,499 (36.17 %)	22,568 (0.53 %)
965	whiskered bat (hap1 2024) GCA_964094495.2	n/a	19,504 (1.78 %)	22,272 (1.73 %)	n/a	42.99 (99.99 %)	1,566 (0.02 %)	533 (100.00 %)	3,046,246 (25.06 %)	753,151 (4.86 %)	10,596,418 (37.62 %)	66,785 (2.55 %)
966	whiskered bat (hap1.2 2025) GCA_964094495.3	n/a	19,023 (1.85 %)	22,199 (1.73 %)	n/a	43.02 (100.00 %)	267 (0.00 %)	241 (100.00 %)	5,005,820 (47.73 %)	756,354 (4.85 %)	10,602,346 (37.72 %)	67,615 (2.61 %)
967	whiskered bat (hap1.3 2026) GCA_964094495.4	n/a	18,883 (1.85 %)	22,196 (1.73 %)	n/a	n/a	267 (0.00 %)	241 (100.00 %)	5,290,968 (47.99 %)	756,384 (4.85 %)	10,602,346 (37.72 %)	67,615 (2.61 %)
968	whiskered bat (hap2 2024) GCA_964195625.1	n/a	18,681 (1.83 %)	21,523 (1.79 %)	n/a	43.13 (99.99 %)	1,414 (0.01 %)	1,741 (99.99 %)	2,849,223 (24.50 %)	688,594 (4.80 %)	9,968,980 (36.80 %)	64,365 (2.68 %)
969	white-beaked dolphin (alternate hap 2023) GCA_949774935.1	n/a	17,639 (1.50 %)	25,684 (1.35 %)	n/a	42.08 (100.00 %)	n/a	25,619 (100.00 %)	3,039,324 (36.05 %)	637,912 (8.02 %)	9,746,398 (38.98 %)	56,325 (3.33 %)
970	white-beaked dolphin (primary hap 2023 refseq) GCF_949774975.1	59,995 (2.43 %)	18,737 (1.57 %)	20,767 (1.34 %)	n/a	41.91 (99.99 %)	1,070 (0.01 %)	410 (100.00 %)	3,820,566 (36.21 %)	922,103 (8.43 %)	12,304,360 (39.74 %)	68,551 (3.58 %)
971	white-footed mouse (LL stock 2020) GCF_004664715.2	54,479 (2.82 %)	19,971 (1.69 %)	20,132 (1.42 %)	n/a	42.23 (99.95 %)	2,299 (0.05 %)	1,857 (100.00 %)	5,060,487 (30.71 %)	1,258,073 (2.85 %)	14,007,098 (32.99 %)	23,456 (0.67 %)
972	white-tailed deer (Illinois 20LAN1187 2024) GCF_023699985.2	68,660 (3.60 %)	19,951 (1.73 %)	21,804 (1.48 %)	n/a	41.56 (100.00 %)	294 (0.00 %)	718 (100.00 %)	4,512,173 (43.10 %)	402,481 (1.14 %)	12,813,223 (37.56 %)	45,863 (1.30 %)
973	white-tailed deer (Pink-7 2017 refseq) GCF_002102435.1	57,787 (2.93 %)	20,661 (1.75 %)	23,085 (1.50 %)	40,987 (1.94 %)	41.55 (99.10 %)	107,058 (0.91 %)	48,653 (99.10 %)	4,800,704 (41.29 %)	413,129 (2.59 %)	13,296,779 (34.22 %)	44,165 (1.19 %)
974	white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 alternate hap 2022) GCA_024140225.1	n/a	12,198 (1.10 %)	18,494 (1.29 %)	n/a	39.87 (100.00 %)	26 (0.00 %)	14,841 (100.00 %)	1,725,021 (17.81 %)	802,415 (4.26 %)	8,321,474 (45.72 %)	15,669 (0.79 %)
975	white-toothed pygmy shrew (mSunEtr1 primary hap 2022) GCF_024139225.1	40,430 (1.81 %)	17,575 (1.21 %)	21,880 (1.35 %)	47,496 (1.55 %)	39.81 (99.57 %)	1,010 (0.43 %)	147 (100.00 %)	2,846,063 (18.57 %)	1,252,362 (3.89 %)	13,776,063 (46.50 %)	24,589 (0.78 %)
976	white-toothed pygmy shrew (primary hap 2022) GCA_024139225.1	n/a	17,350 (1.25 %)	21,890 (1.35 %)	n/a	39.81 (99.57 %)	1,010 (0.43 %)	148 (100.00 %)	6,924,771 (50.26 %)	1,252,365 (3.89 %)	13,775,765 (46.50 %)	24,589 (0.78 %)
977	wild Bactrian camel (BCGSAC Cfer 1.0 YT-003-E 2020) GCF_009834535.1	70,235 (4.11 %)	18,202 (1.93 %)	20,199 (1.66 %)	42,728 (2.35 %)	41.66 (99.99 %)	2,345 (0.01 %)	2,043 (100.00 %)	3,091,018 (33.31 %)	332,720 (5.33 %)	12,161,286 (28.79 %)	55,524 (1.75 %)
978	wild Bactrian camel (CB1 Naran 2013 refseq) GCF_000311805.1	34,726 (2.40 %)	18,746 (1.96 %)	17,104 (1.61 %)	n/a	41.28 (98.83 %)	60,971 (1.18 %)	68,872 (98.82 %)	2,991,821 (33.93 %)	353,632 (1.23 %)	12,349,615 (25.12 %)	45,437 (1.02 %)
979	wild goat GCA_000978405.1	n/a	19,104 (1.48 %)	16,198 (1.21 %)	n/a	41.91 (91.72 %)	279,195 (8.31 %)	368,693 (91.69 %)	5,563,294 (45.39 %)	452,402 (1.99 %)	13,802,376 (35.47 %)	41,935 (0.63 %)
980	wild yak (GX-2022 2023) GCF_027580195.1	52,505 (2.90 %)	19,278 (1.60 %)	20,813 (1.31 %)	n/a	41.87 (100.00 %)	196 (0.00 %)	2,040 (100.00 %)	5,706,841 (46.71 %)	464,013 (1.82 %)	12,973,198 (41.46 %)	42,508 (1.32 %)
981	wild yak (yakQH1 2013) GCF_000298355.1	29,789 (1.92 %)	19,936 (1.62 %)	19,914 (1.32 %)	n/a	41.71 (95.48 %)	192,006 (4.54 %)	233,198 (95.46 %)	5,348,663 (46.08 %)	449,880 (1.38 %)	13,572,902 (36.62 %)	41,147 (0.82 %)
982	winter white dwarf (Siberian hamster Psun_Stras_1 2023) GCA_030556225.1	n/a	18,177 (1.88 %)	18,942 (1.54 %)	n/a	41.50 (100.00 %)	1 (0.00 %)	742 (100.00 %)	5,398,126 (39.36 %)	1,168,723 (3.56 %)	12,272,233 (30.38 %)	18,332 (0.60 %)
983	woodchuck (v1.1 L192 2022) GCF_021218885.2	68,030 (3.47 %)	19,116 (1.55 %)	21,017 (1.38 %)	n/a	39.92 (100.00 %)	47 (0.00 %)	3,380 (100.00 %)	5,285,788 (43.20 %)	912,552 (2.73 %)	14,538,866 (35.15 %)	36,914 (1.02 %)
984	woodland dormouse GCA_004027655.1	n/a	23,556 (1.09 %)	55,517 (1.33 %)	n/a	41.52 (99.86 %)	15,691 (0.06 %)	1,283,630 (99.94 %)	7,674,195 (34.99 %)	1,698,258 (3.76 %)	13,705,886 (42.23 %)	68,562 (1.41 %)
985	woodland thicket rat GCF_004785775.1	43,129 (2.40 %)	22,710 (2.13 %)	21,042 (1.49 %)	n/a	41.17 (98.57 %)	76,623 (1.44 %)	23,656 (100.00 %)	4,732,544 (38.04 %)	1,424,025 (3.23 %)	13,549,399 (30.42 %)	18,232 (0.48 %)
986	woolly hare (The Qinghai-Tibet Plateau SH-2023 2024) GCA_036325905.1	n/a	19,363 (1.28 %)	22,239 (1.28 %)	n/a	44.08 (100.00 %)	240 (0.00 %)	112 (100.00 %)	4,432,114 (42.23 %)	966,165 (7.11 %)	13,263,822 (43.77 %)	96,755 (2.28 %)
987	wrinkle-faced bat (hap1 2026) GCA_058972505.1	n/a	17,620 (1.53 %)	20,718 (1.49 %)	n/a	42.82 (100.00 %)	85 (0.00 %)	812 (100.00 %)	3,933,017 (42.96 %)	461,927 (10.60 %)	10,236,179 (38.95 %)	68,442 (2.55 %)
988	wrinkle-faced bat (hap2 2026) GCA_058972435.1	n/a	17,530 (1.57 %)	20,692 (1.50 %)	n/a	42.70 (100.00 %)	80 (0.00 %)	654 (100.00 %)	3,876,611 (42.49 %)	425,909 (9.29 %)	10,283,412 (37.60 %)	68,200 (2.41 %)
989	Yangtze finless porpoise (v2 wild 2018 refseq) GCF_003031525.2	43,310 (2.49 %)	18,747 (1.81 %)	19,638 (1.46 %)	n/a	41.28 (99.29 %)	52,647 (0.72 %)	66,343 (99.28 %)	3,547,466 (35.83 %)	540,760 (1.65 %)	12,691,756 (32.88 %)	59,050 (1.48 %)
990	Yangtze River dolphin (v1.1 BGI 2013 refseq) GCF_000442215.2	26,128 (1.61 %)	18,978 (1.74 %)	20,661 (1.39 %)	n/a	41.24 (98.69 %)	123,788 (1.33 %)	148,598 (98.67 %)	3,788,303 (37.04 %)	690,288 (1.96 %)	12,841,906 (35.04 %)	62,458 (1.54 %)
991	yellow-bellied marmot (hap1 2025 refseq) GCF_047511675.1	55,299 (2.52 %)	19,502 (1.44 %)	20,297 (1.34 %)	n/a	39.90 (100.00 %)	330 (0.00 %)	813 (100.00 %)	4,038,893 (29.07 %)	978,915 (3.28 %)	14,404,633 (34.97 %)	36,674 (1.05 %)
992	yellow-bellied marmot (hap2 2025) GCA_047512175.1	n/a	18,677 (1.51 %)	19,370 (1.40 %)	n/a	40.03 (100.00 %)	307 (0.00 %)	329 (100.00 %)	3,694,109 (28.05 %)	793,102 (2.43 %)	13,585,913 (33.39 %)	33,990 (1.02 %)
993	yellow-bellied marmot (SJ_83 v2.1 2019) GCF_003676075.3	42,667 (2.16 %)	19,547 (1.52 %)	21,406 (1.40 %)	n/a	39.89 (97.96 %)	35,509 (2.04 %)	66,442 (97.96 %)	3,814,223 (27.39 %)	800,865 (1.96 %)	14,323,977 (32.63 %)	34,122 (0.91 %)
994	yellow-footed antechinus (v2 Samford, QLD, Australia AdamAnt 2021) GCF_016432865.1	47,618 (2.51 %)	15,703 (0.78 %)	16,155 (0.90 %)	n/a	36.21 (99.99 %)	620 (0.01 %)	486 (100.00 %)	5,191,383 (23.81 %)	1,269,772 (2.59 %)	21,430,585 (42.69 %)	28,118 (0.66 %)
995	yellow-spotted hyrax GCA_004026845.1	n/a	20,424 (0.86 %)	43,984 (1.27 %)	n/a	40.93 (99.94 %)	3,815 (0.01 %)	971,748 (99.99 %)	5,365,974 (31.41 %)	435,699 (1.22 %)	21,229,266 (45.17 %)	38,521 (0.68 %)
996	yellow-spotted hyrax (mHetBru1 2023) GCA_028571685.1	n/a	17,610 (1.00 %)	20,322 (1.04 %)	n/a	40.80 (100.00 %)	276 (0.00 %)	62 (100.00 %)	3,295,935 (23.58 %)	389,907 (6.37 %)	19,525,382 (45.90 %)	31,831 (0.63 %)
997	yellow-spotted hyrax (mHetBru1 alternate hap 2023) GCA_028571665.1	n/a	16,320 (1.03 %)	20,318 (1.13 %)	n/a	40.93 (100.00 %)	1 (0.00 %)	4,169 (100.00 %)	2,911,332 (23.50 %)	347,110 (4.57 %)	17,256,419 (44.04 %)	28,674 (0.68 %)
998	Yong Hoi Sen's woolly horseshoe bat (Malaysia 20210929_DDd alternate hap 2024) GCA_043880365.1	n/a	18,844 (1.70 %)	23,805 (1.54 %)	n/a	41.26 (100.00 %)	n/a	8,862 (100.00 %)	3,638,702 (42.22 %)	847,774 (6.68 %)	11,654,541 (34.78 %)	34,055 (3.45 %)
999	Yong Hoi Sen's woolly horseshoe bat (Malaysia 20210929_DDd primary hap 2024) GCA_043880425.1	n/a	18,352 (1.71 %)	20,233 (1.46 %)	n/a	41.73 (100.00 %)	196 (0.00 %)	1,530 (100.00 %)	3,466,695 (41.95 %)	934,524 (8.81 %)	11,690,112 (36.30 %)	35,257 (5.20 %)
1000	Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP alternate hap 2023) GCA_028536395.1	n/a	19,188 (1.79 %)	21,673 (1.72 %)	n/a	43.03 (100.00 %)	215 (0.00 %)	250 (100.00 %)	3,043,589 (24.76 %)	773,853 (4.49 %)	10,648,494 (37.26 %)	61,910 (2.52 %)
1001	Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP primary hap 2023 refseq) GCF_028538775.1	48,707 (3.25 %)	18,807 (1.93 %)	21,046 (1.76 %)	n/a	43.22 (100.00 %)	209 (0.00 %)	684 (100.00 %)	3,552,235 (38.46 %)	719,552 (4.26 %)	10,089,365 (36.35 %)	60,974 (2.61 %)
1002	zebra duiker (hap1 2025) GCA_054099735.1	n/a	19,411 (1.04 %)	23,174 (0.98 %)	n/a	46.14 (100.00 %)	185 (0.00 %)	598 (100.00 %)	6,742,800 (39.85 %)	699,303 (26.55 %)	12,357,908 (58.45 %)	605,557 (5.20 %)
1003	zebra duiker (hap2 2025) GCA_054099755.1	n/a	19,383 (1.06 %)	23,042 (0.98 %)	n/a	46.07 (100.00 %)	162 (0.00 %)	677 (100.00 %)	6,681,000 (40.47 %)	636,475 (26.14 %)	12,329,686 (57.66 %)	583,195 (5.17 %)
1004	zebu cattle (Hainan HN024 2024) GCA_039881165.1	n/a	19,162 (1.53 %)	20,991 (1.34 %)	n/a	41.77 (99.99 %)	350 (0.01 %)	292 (100.00 %)	3,296,209 (23.14 %)	440,574 (1.28 %)	12,824,144 (40.98 %)	39,400 (1.07 %)
1005	zebu cattle (Nelore 2014 refseq) GCF_000247795.1	39,830 (2.52 %)	18,603 (1.59 %)	18,779 (1.29 %)	n/a	41.75 (92.62 %)	6,941,272 (7.66 %)	253,770 (92.59 %)	5,119,428 (46.84 %)	358,908 (0.88 %)	13,431,672 (36.60 %)	35,241 (0.84 %)
1006	zebu cattle (Sahiwal x Tharparkar maternal NIAB-ARS_2022 2023) GCF_029378745.1	70,745 (4.27 %)	19,546 (1.58 %)	21,187 (1.33 %)	n/a	41.86 (100.00 %)	283 (0.00 %)	67 (100.00 %)	5,530,890 (46.61 %)	459,827 (1.43 %)	13,190,355 (41.36 %)	42,544 (1.21 %)
TOTALS:	total assembly count 1006

Additional hubs with collections of assemblies
Collection	Hub index pages:	Assembly statistics:	Track statistics:
Primates	628 assemblies	assembly stats	track stats
Mammals	1006 assemblies	assembly stats	track stats
Birds	685 assemblies	assembly stats	track stats
Fishes	918 assemblies	assembly stats	track stats
other vertebrates	537 assemblies	assembly stats	track stats
Invertebrates	2000 assemblies	assembly stats	track stats
Plants	466 assemblies	assembly stats	track stats
Fungi	4136 assemblies	assembly stats	track stats
Viruses	15117 assemblies	assembly stats	track stats
Archaea	2977 assemblies	assembly stats	track stats
Bacteria	23961 assemblies	assembly stats	track stats
legacy/superseded	691 assemblies	assembly stats	track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project	1303 assemblies	assembly stats	track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project	126 assemblies	assembly stats	track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium	464 assemblies	assembly stats	track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center	5522 assemblies	assembly stats	track stats

Mammals Genomes assembly hubs, track statistics

See also: hub access, assembly statistics

Data resource links