Legacy Genomes assembly hubs, track statistics

Assemblies from NCBI/Genbank/Refseq sources, subset of legacy only.

See also: hub accessassembly statistics


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Except for the gc5Base column which is: overall GC % average (percent coverage)
count common name
link to genome browser
ncbiRefSeq xenoRefGene augustus
genes
Ensembl
genes
gc5 base gaps assembly
sequences
Repeat
Masker
TRF
simpleRepeat
window
Masker
cpg
islands
1 aardvark (BS58 2019 Broad)
GCA_004365145.1
n/a 22,095
(0.63 %)
44,942
(0.68 %)
n/a 40.25
(99.86 %)
15,429
(0.03 %)
2,690,873
(99.97 %)
8,755,250
(34.47 %)
869,360
(1.26 %)
22,002,517
(59.65 %)
39,239
(0.49 %)
2 Acadian redfish (fSebFas1 primary hap 2024 genbank)
GCA_043250625.1
n/a 15,735
(2.44 %)
50,184
(6.16 %)
n/a 40.90
(99.99 %)
471
(0.01 %)
203
(100.00 %)
1,781,283
(37.65 %)
444,047
(7.93 %)
4,765,080
(37.01 %)
39,918
(2.01 %)
3 Aeolian wall lizard (La Canna islet primary hap 2022 genbank)
GCA_027172205.1
57,514
(54.61 %)
14,340
(1.37 %)
20,053
(2.31 %)
n/a 43.81
(100.00 %)
30
(0.00 %)
27
(100.00 %)
832,937
(4.17 %)
474,203
(4.04 %)
7,020,288
(38.29 %)
94,745
(2.70 %)
4 African clawed frog (2016)
GCF_001663975.1
61,159
(3.82 %)
23,424
(1.78 %)
27,990
(2.23 %)
n/a 38.98
(88.63 %)
216,028
(11.39 %)
324,061
(88.61 %)
1,726,079
(12.81 %)
680,428
(2.28 %)
13,887,586
(35.94 %)
85,680
(0.94 %)
5 African grass rat (v1 paternal X 2020 genbank)
GCA_011762505.1
45,963
(36.56 %)
20,933
(2.00 %)
19,613
(1.43 %)
37,929
(2.32 %)
41.39
(99.19 %)
1,624
(0.81 %)
1,596
(100.00 %)
4,940,083
(37.33 %)
1,674,970
(5.40 %)
13,613,540
(32.71 %)
17,767
(0.51 %)
6 African malaria mosquito (PEST 2006)
GCA_000005575.1
n/a 5,478
(2.34 %)
30,482
(13.88 %)
n/a 44.27
(95.26 %)
8,735
(4.75 %)
8,115
(99.79 %)
241,805
(14.48 %)
72,702
(2.39 %)
1,434,880
(21.28 %)
25,507
(8.25 %)
7 African savanna elephant (2009 genbank)
GCA_000001905.1
46,043
(34.84 %)
19,181
(1.25 %)
19,665
(1.10 %)
n/a 40.76
(97.57 %)
93,514
(2.45 %)
95,866
(97.55 %)
6,337,637
(57.82 %)
365,796
(0.88 %)
16,073,052
(44.89 %)
33,513
(0.68 %)
8 alkali bee (v1.2 Touchet_males 2018)
GCF_003710045.1
27,736
(10.71 %)
4,020
(1.34 %)
42,185
(10.12 %)
n/a 40.41
(94.37 %)
14,031
(5.59 %)
95,883
(100.00 %)
112,828
(2.21 %)
95,886
(3.63 %)
2,006,114
(27.47 %)
23,832
(3.81 %)
9 alpaca (2015 BGI)
GCA_000767525.1
n/a 18,513
(1.97 %)
19,112
(1.70 %)
31,905
(1.94 %)
41.46
(99.38 %)
23,458
(0.62 %)
75,733
(99.38 %)
3,095,742
(36.41 %)
314,508
(1.07 %)
12,365,152
(25.46 %)
53,956
(1.50 %)
10 alpaca (v3.1 Carlotta AHFN-0088 2019 Deakin U)
GCF_000164845.3
55,001
(3.56 %)
18,437
(1.94 %)
18,446
(1.63 %)
n/a 41.40
(95.85 %)
166,280
(4.17 %)
77,390
(100.00 %)
3,150,224
(36.21 %)
315,108
(1.36 %)
12,461,739
(24.88 %)
54,502
(1.38 %)
11 Alpine marmot (2015)
GCF_001458135.1
35,350
(2.23 %)
20,139
(1.58 %)
18,286
(1.41 %)
n/a 39.80
(96.07 %)
89,362
(3.94 %)
14,543
(100.00 %)
n/a 747,129
(1.83 %)
14,077,162
(30.27 %)
30,224
(0.63 %)
12 American alligator (2023 genbank)
GCA_030867065.1
n/a 14,487
(0.97 %)
20,444
(1.61 %)
n/a 45.04
(99.81 %)
136
(0.19 %)
806
(99.81 %)
3,380,365
(43.12 %)
560,127
(2.00 %)
12,524,244
(32.47 %)
50,852
(2.67 %)
13 American alligator (chrom assembly 2023 genbank)
GCA_030867095.1
60,799
(51.66 %)
14,382
(0.98 %)
18,601
(1.45 %)
n/a 45.01
(99.30 %)
161
(0.70 %)
194
(100.00 %)
3,322,619
(43.19 %)
478,206
(1.77 %)
12,316,391
(32.01 %)
49,792
(2.45 %)
14 American beaver (US014 2019 Broad)
GCA_004027675.1
n/a 22,515
(1.25 %)
34,527
(1.17 %)
n/a 39.58
(99.92 %)
5,769
(0.02 %)
837,916
(99.98 %)
5,101,904
(34.46 %)
552,100
(1.02 %)
15,150,706
(34.57 %)
24,558
(0.63 %)
15 American bison (2014 genbank)
GCA_000754665.1
38,686
(33.79 %)
20,215
(1.44 %)
20,845
(1.20 %)
n/a 41.99
(93.39 %)
341,984
(6.63 %)
792,165
(93.37 %)
6,006,931
(47.67 %)
495,106
(1.11 %)
13,902,115
(39.01 %)
90,767
(1.29 %)
16 American pika 3.0 (2012 Broad genbank)
GCA_000292845.1
26,240
(36.96 %)
17,569
(1.60 %)
20,092
(1.69 %)
n/a 43.35
(87.20 %)
122,542
(12.82 %)
132,961
(87.18 %)
2,829,934
(29.80 %)
414,895
(1.07 %)
10,968,663
(26.71 %)
44,651
(1.14 %)
17 amphioxus (hap2 2024 genbank)
GCA_035083965.1
n/a 5,217
(0.97 %)
41,736
(12.73 %)
n/a 41.61
(100.00 %)
103
(0.00 %)
34
(100.00 %)
128,505
(1.65 %)
182,123
(8.03 %)
2,157,899
(27.45 %)
44,261
(5.21 %)
18 amphipods H.azteca (HAZT.00-mixed v2.0 2016)
GCF_000764305.1
24,008
(8.48 %)
3,331
(0.47 %)
38,201
(8.97 %)
24,453
(8.50 %)
38.47
(99.52 %)
23,726
(0.48 %)
23,426
(99.52 %)
161,274
(1.72 %)
432,436
(8.89 %)
3,517,080
(28.92 %)
50,987
(4.44 %)
19 Amur tiger (TaeGuk 2013 genbank)
GCA_000464555.1
33,668
(37.51 %)
18,213
(1.58 %)
15,093
(1.29 %)
n/a 41.40
(97.59 %)
155,553
(2.44 %)
157,031
(97.56 %)
4,832,679
(42.49 %)
831,134
(1.67 %)
13,654,373
(31.78 %)
65,229
(1.60 %)
20 Anna's hummingbird (BGI_N300 2019 genbank)
GCA_003957555.2
n/a 12,258
(1.95 %)
20,580
(2.26 %)
n/a 41.49
(98.48 %)
429
(1.52 %)
160
(100.00 %)
535,315
(7.95 %)
262,056
(1.51 %)
6,092,351
(20.84 %)
17,130
(1.48 %)
21 ant C.costatus (v1 MS0001 2016)
GCF_001594065.1
16,082
(8.44 %)
4,038
(1.42 %)
32,856
(9.80 %)
n/a 34.73
(95.75 %)
10,626
(4.26 %)
26,005
(95.74 %)
203,498
(3.41 %)
100,483
(2.15 %)
2,221,362
(35.19 %)
18,108
(3.49 %)
22 ant N.fulva (TAMU-Nful-2015 v1.0 2019)
GCF_005281655.1
28,261
(10.34 %)
4,915
(1.27 %)
40,257
(10.17 %)
n/a 35.18
(99.51 %)
1,076
(0.49 %)
2,869
(100.00 %)
322,753
(4.92 %)
245,412
(6.65 %)
1,952,946
(43.11 %)
17,048
(6.08 %)
23 ant T.cornetzi (Tcor2-1 v1.0 2016 BGI)
GCF_001594075.1
22,023
(8.25 %)
4,211
(1.25 %)
37,113
(9.30 %)
n/a 35.01
(91.82 %)
40,822
(8.21 %)
60,583
(91.79 %)
218,162
(3.24 %)
139,385
(2.26 %)
2,347,922
(34.62 %)
23,814
(3.66 %)
24 apicomplexans C.sp. chipmunk genotype I (37763 2021 genbank)
GCA_004936735.2
n/a 426
(3.03 %)
203
(12.39 %)
n/a 32.03
(100.00 %)
10
(0.00 %)
50
(100.00 %)
3,358
(1.88 %)
1,257
(0.81 %)
67,711
(20.74 %)
4
(0.02 %)
25 apicomplexans E.tenella (Houghton 2013)
GCA_000499545.1
n/a 326
(0.37 %)
1,632
(4.94 %)
n/a 51.33
(98.72 %)
8,063
(1.32 %)
12,727
(98.68 %)
127,265
(17.42 %)
148,397
(16.77 %)
326,694
(37.33 %)
12,417
(22.22 %)
26 apple (Golden Delicious X9273 #13 2017 genbank)
GCA_002114115.1
n/a 22,542
(3.52 %)
67,060
(16.20 %)
n/a 38.04
(88.95 %)
7,175
(11.05 %)
806
(100.00 %)
692,611
(50.80 %)
322,540
(4.42 %)
3,033,193
(35.58 %)
25,871
(1.75 %)
27 Arabian camel (2014 genbank)
GCA_000767585.1
n/a 18,452
(1.96 %)
16,975
(1.61 %)
n/a 41.29
(98.88 %)
72,775
(1.13 %)
105,347
(98.87 %)
3,079,920
(34.79 %)
319,928
(0.96 %)
12,281,845
(25.28 %)
48,638
(1.17 %)
28 Arctic fox (US066 2019 Broad)
GCA_004023825.1
n/a 22,910
(1.42 %)
31,985
(1.20 %)
35,342
(1.47 %)
41.93
(99.87 %)
9,604
(0.04 %)
1,272,949
(99.96 %)
6,096,013
(44.89 %)
1,265,350
(2.67 %)
14,617,986
(39.29 %)
64,716
(1.93 %)
29 ascomycetes A.fischeri (v3 NRRL 181 2006)
GCF_000149645.2
10,388
(48.16 %)
1,538
(3.76 %)
6,155
(25.19 %)
n/a 49.56
(99.97 %)
90
(0.03 %)
466
(99.97 %)
5,026
(0.77 %)
2,256
(0.38 %)
68,790
(5.94 %)
2,846
(42.44 %)
30 ascomycetes A.nidulans (FGSC A4 2012 genbank)
GCA_000149205.2
n/a 1,524
(3.90 %)
5,275
(23.90 %)
n/a 50.30
(99.43 %)
158
(0.58 %)
249
(99.42 %)
5,218
(3.22 %)
2,452
(0.41 %)
51,693
(4.64 %)
1,128
(90.37 %)
31 ascomycetes A.niger CBS 513.88 (v3 2007)
GCF_000002855.3
10,609
(51.05 %)
1,481
(3.36 %)
5,692
(22.11 %)
n/a 50.35
(99.87 %)
662
(0.13 %)
469
(99.87 %)
9,986
(1.32 %)
2,619
(0.36 %)
106,480
(7.71 %)
5,568
(53.86 %)
32 ascomycetes A.rabiei (Mel4 2019)
GCF_004011695.1
11,257
(41.02 %)
1,596
(2.91 %)
8,283
(26.43 %)
n/a 49.20
(100.00 %)
n/a 34
(100.00 %)
14,775
(2.01 %)
16,031
(2.34 %)
103,256
(17.19 %)
805
(44.28 %)
33 ascomycetes B.dermatitidis (ER-3 2009 genbank)
GCA_000003525.2
n/a 1,516
(1.76 %)
5,714
(11.07 %)
n/a 37.07
(99.50 %)
566
(0.51 %)
593
(99.49 %)
38,696
(2.74 %)
27,571
(2.05 %)
270,617
(48.64 %)
8,002
(10.69 %)
34 ascomycetes B.gilchristii (SLH14081 2009 genbank)
GCA_000003855.2
n/a 1,518
(1.57 %)
5,702
(9.73 %)
n/a 35.75
(98.67 %)
1,691
(1.34 %)
1,794
(98.66 %)
42,930
(2.67 %)
27,826
(1.78 %)
328,698
(50.87 %)
7,943
(9.35 %)
35 ascomycetes C.auris (B8441 2017)
GCA_002759435.2
n/a 1,944
(12.45 %)
4,981
(62.59 %)
n/a 45.21
(100.00 %)
3
(0.00 %)
15
(100.00 %)
3,395
(1.46 %)
2,375
(0.85 %)
48,902
(8.34 %)
1,576
(6.87 %)
36 ascomycetes C.posadasii (C735 delta SOWgp 2009 genban)
GCA_000151335.1
n/a 1,479
(4.26 %)
5,283
(25.22 %)
n/a 46.59
(100.00 %)
33
(0.00 %)
88
(100.00 %)
10,463
(5.97 %)
5,206
(0.91 %)
74,027
(11.89 %)
4,784
(34.49 %)
37 ascomycetes F.oxysporum (NRRL 32931 2014 genbank)
GCA_000271745.2
n/a 1,503
(2.37 %)
11,741
(30.20 %)
n/a 47.63
(98.55 %)
377
(1.46 %)
545
(98.54 %)
8,453
(2.23 %)
3,560
(0.37 %)
129,150
(7.65 %)
14,398
(29.11 %)
38 ascomycetes P.destructans (20631-21 2010 genbank)
GCA_000184105.1
n/a 1,446
(3.95 %)
5,635
(25.84 %)
n/a 50.12
(92.42 %)
2,066
(7.59 %)
3,579
(92.41 %)
11,499
(5.71 %)
11,754
(2.10 %)
87,648
(13.51 %)
4,483
(54.70 %)
39 ascomycetes P.digitatum (Pd1 2012 genbank)
GCA_000315645.2
n/a 1,461
(4.51 %)
5,599
(29.85 %)
n/a 48.91
(95.53 %)
516
(4.48 %)
562
(95.52 %)
3,575
(0.59 %)
2,210
(0.38 %)
66,810
(6.03 %)
7,344
(38.10 %)
40 ascomycetes P.pennisetigena (Br36 2019 genbank)
GCA_004337985.1
n/a 1,482
(2.32 %)
7,302
(20.85 %)
n/a 47.48
(99.41 %)
1,281
(0.60 %)
108
(100.00 %)
24,268
(1.88 %)
11,049
(1.23 %)
163,225
(20.20 %)
764
(17.56 %)
41 ascomycetes P.rubens (Wisconsin 54-1255 2008 genbank)
GCA_000226395.1
n/a 1,550
(3.72 %)
7,756
(30.06 %)
n/a 48.96
(99.94 %)
775
(0.06 %)
49
(100.00 %)
5,678
(0.78 %)
4,560
(0.81 %)
73,645
(5.86 %)
7,807
(50.55 %)
42 ascomycetes R.enersibuu (CBS 393.64 2015 genbank)
GCA_000968595.1
n/a 1,499
(4.04 %)
3,608
(17.47 %)
n/a 50.55
(99.99 %)
76
(0.00 %)
938
(100.00 %)
12,877
(1.80 %)
4,459
(0.56 %)
116,737
(10.53 %)
2,561
(81.62 %)
43 ascomycetes S.macrospora (v2 k-hell 2012)
GCF_000182805.2
9,903
(39.44 %)
1,311
(2.58 %)
4,612
(17.66 %)
n/a 52.11
(99.64 %)
978
(0.36 %)
1,583
(100.00 %)
16,540
(1.85 %)
7,316
(0.76 %)
171,684
(11.10 %)
1,770
(49.40 %)
44 ascomycetes S.schenckii (1099-18 2015 genbank)
GCA_000961545.1
10,279
(51.22 %)
1,134
(2.55 %)
2,026
(10.60 %)
n/a 54.96
(100.00 %)
57
(0.00 %)
73
(100.00 %)
15,846
(2.28 %)
8,000
(0.94 %)
169,678
(13.75 %)
22
(99.61 %)
45 ascomycetes T.marneffei (ATCC 18224 2008 genbank)
GCA_000001985.1
n/a 1,532
(4.18 %)
7,679
(34.14 %)
n/a 46.67
(99.38 %)
137
(0.62 %)
589
(99.38 %)
6,404
(1.04 %)
2,594
(0.58 %)
61,594
(6.70 %)
5,746
(15.84 %)
46 ascomycetes Z.tritici (IPO323 2011 genbank)
GCA_000219625.1
10,941
(44.32 %)
1,451
(2.81 %)
6,906
(25.36 %)
n/a 52.14
(99.98 %)
3
(0.02 %)
24
(99.98 %)
8,941
(1.69 %)
8,367
(1.51 %)
99,818
(11.14 %)
27
(96.31 %)
47 Asian corn borer (v1 ACB-3 2019)
GCF_004193835.1
25,266
(7.93 %)
4,931
(1.05 %)
28,608
(7.16 %)
n/a 37.50
(100.00 %)
34,722
(0.01 %)
7,722
(100.00 %)
146,974
(1.35 %)
89,987
(2.68 %)
2,666,250
(38.74 %)
39,696
(5.22 %)
48 Asian corn borer (v2 ACB-3 2019)
GCF_004193835.2
25,169
(7.95 %)
4,867
(1.05 %)
28,255
(7.08 %)
n/a 37.49
(100.00 %)
34,702
(0.01 %)
6,269
(100.00 %)
150,783
(1.53 %)
89,885
(2.69 %)
2,627,296
(38.56 %)
39,511
(5.22 %)
49 Asian swallowtail (v1 2015)
GCF_000836235.1
22,417
(13.18 %)
5,290
(2.15 %)
13,925
(7.00 %)
n/a 33.81
(97.56 %)
5,205
(2.44 %)
10,777
(97.56 %)
122,491
(2.29 %)
27,169
(0.71 %)
2,130,840
(38.92 %)
11,899
(2.85 %)
50 Asian tiger mosquito (C6/36 2017 genbank)
GCA_001876365.2
n/a 10,893
(0.53 %)
128,502
(8.33 %)
n/a 40.42
(100.00 %)
n/a 2,434
(100.00 %)
605,350
(2.88 %)
921,761
(7.40 %)
11,169,474
(57.07 %)
220,674
(10.38 %)
51 Asian tiger mosquito (v1 FPA 2019 genbank
GCA_006496715.1
n/a 10,347
(0.43 %)
138,311
(7.69 %)
n/a 40.40
(99.93 %)
3,359
(0.07 %)
2,196
(100.00 %)
691,302
(2.69 %)
1,084,185
(7.47 %)
12,619,495
(57.66 %)
250,421
(10.15 %)
52 Asian tiger mosquito (v1 FPA 2019 refseq)
GCF_006496715.1
49,254
(2.57 %)
10,500
(0.44 %)
138,307
(7.69 %)
n/a 40.40
(99.93 %)
3,359
(0.07 %)
2,197
(100.00 %)
6,821,491
(69.74 %)
1,084,205
(7.47 %)
12,619,646
(57.66 %)
250,420
(10.13 %)
53 Asiatic tapir (BS100 BIUU 2019)
GCA_004024905.1
n/a 20,854
(1.73 %)
28,046
(1.39 %)
n/a 40.91
(99.96 %)
4,333
(0.02 %)
284,468
(99.98 %)
3,802,671
(39.88 %)
335,521
(0.73 %)
15,053,564
(30.25 %)
39,691
(1.17 %)
54 ass (Maral har 2015 genbank)
GCA_001305755.1
48,976
(40.12 %)
18,884
(1.76 %)
19,296
(1.44 %)
n/a 41.28
(98.63 %)
69,593
(1.38 %)
2,166
(100.00 %)
3,855,699
(41.69 %)
289,735
(0.96 %)
14,695,257
(28.58 %)
40,025
(1.06 %)
55 Atlantic halibut (primary hap 2019 genbank)
GCA_009819705.1
52,117
(66.34 %)
14,960
(3.20 %)
45,365
(7.48 %)
69,625
(10.94 %)
42.21
(99.43 %)
290
(0.57 %)
57
(100.00 %)
428,421
(4.16 %)
256,153
(3.73 %)
3,725,979
(24.13 %)
31,325
(2.25 %)
56 Atlantic herring (v1)
GCF_900700415.1
46,216
(9.88 %)
15,249
(2.65 %)
25,664
(6.68 %)
n/a 44.24
(99.88 %)
1,963
(0.12 %)
1,990
(99.88 %)
1,175,759
(12.03 %)
1,231,613
(13.39 %)
3,511,276
(32.20 %)
33,465
(1.97 %)
57 Atlantic ridley (rLepKem1 hap2 2025 genbank)
GCA_965140265.1
n/a 14,601
(1.02 %)
17,367
(1.50 %)
n/a 44.08
(100.00 %)
245
(0.00 %)
332
(100.00 %)
1,335,525
(12.58 %)
314,640
(2.13 %)
10,517,469
(34.27 %)
45,940
(1.37 %)
58 Atlantic salmon (genbank 2021)
GCA_905237065.2
n/a 28,077
(1.40 %)
120,383
(3.99 %)
183,727
(7.26 %)
43.42
(100.00 %)
211
(0.00 %)
4,222
(100.00 %)
4,501,521
(48.00 %)
2,247,891
(25.01 %)
10,731,814
(59.31 %)
77,089
(1.86 %)
59 Atlantic stingray (hap1 2023 genbank)
GCA_030144855.1
60,922
(45.62 %)
12,545
(0.38 %)
29,428
(1.34 %)
n/a 43.35
(99.99 %)
1,648
(0.01 %)
2,990
(100.00 %)
8,579,105
(49.81 %)
831,224
(15.75 %)
21,718,213
(51.79 %)
105,821
(2.42 %)
60 axolotl (Mex_15411 2024 genbank)
GCA_040938575.1
n/a 18,563
(0.07 %)
184,525
(1.17 %)
n/a 46.34
(100.00 %)
2,095
(0.00 %)
220
(100.00 %)
27,951,542
(67.11 %)
8,561,024
(9.70 %)
2,315
(100.00 %)
2,452,305
(5.31 %)
61 B.malayi (v3 2008 agent of lymphatic filariasis)
GCF_000002995.3
11,460
(14.87 %)
2,843
(2.29 %)
3,797
(4.95 %)
n/a 30.21
(92.98 %)
58,744
(7.04 %)
26,881
(93.03 %)
147,614
(11.55 %)
54,885
(7.91 %)
647,155
(33.62 %)
509
(0.15 %)
62 Bactrian camel (Alxa 2014 genbank)
GCA_000767855.1
52,178
(47.52 %)
18,330
(1.96 %)
17,094
(1.64 %)
n/a 41.32
(99.32 %)
31,980
(0.69 %)
67,434
(99.31 %)
3,072,373
(34.88 %)
306,996
(0.95 %)
12,209,895
(25.43 %)
49,789
(1.25 %)
63 band-tailed pigeon (v1 hap2 2024 genbank)
GCA_036971685.1
n/a 13,319
(1.60 %)
25,993
(2.05 %)
n/a 43.83
(99.41 %)
219
(0.59 %)
453
(100.00 %)
700,173
(13.18 %)
457,546
(13.85 %)
4,523,003
(31.73 %)
42,686
(7.00 %)
64 banded archerfish (primary hap 2021 genbank)
GCA_017976425.1
42,399
(57.52 %)
15,312
(3.18 %)
41,147
(7.01 %)
62,990
(9.37 %)
41.11
(99.82 %)
98
(0.18 %)
96
(100.00 %)
811,892
(18.19 %)
271,913
(9.55 %)
3,355,326
(28.08 %)
15,089
(0.96 %)
65 barn owl (2020)
GCF_902150015.1
37,361
(4.54 %)
12,958
(1.72 %)
22,922
(1.99 %)
26,976
(3.04 %)
41.55
(99.23 %)
177,340
(0.79 %)
21,504
(100.00 %)
585,627
(5.48 %)
367,764
(2.44 %)
7,399,161
(19.58 %)
47,061
(3.25 %)
66 barn owl BGI_N341 (2014)
GCF_000687205.1
15,006
(2.07 %)
11,133
(1.44 %)
21,138
(1.69 %)
n/a 40.21
(99.24 %)
109,223
(0.79 %)
171,345
(99.21 %)
413,761
(3.90 %)
181,353
(0.91 %)
6,776,326
(18.43 %)
10,575
(0.29 %)
67 barn swallow (bHirRus1 v2 primary hap genbank 2021)
GCA_015227805.2
n/a 12,385
(1.88 %)
23,302
(2.31 %)
n/a 42.54
(97.69 %)
1,102
(2.31 %)
617
(100.00 %)
579,928
(6.20 %)
364,636
(2.27 %)
6,198,840
(21.01 %)
36,546
(2.82 %)
68 barn swallow (v2 primary hap 2021 refseq)
GCF_015227805.1
43,374
(5.14 %)
12,385
(1.88 %)
23,302
(2.31 %)
n/a 42.54
(97.69 %)
1,102
(2.31 %)
617
(100.00 %)
579,928
(6.20 %)
364,636
(2.27 %)
6,198,840
(21.01 %)
36,546
(2.82 %)
69 barn swallow (v3 primary hap 2021 genbank)
GCA_015227805.3
n/a 12,395
(1.89 %)
23,302
(2.31 %)
n/a 42.54
(97.69 %)
1,102
(2.31 %)
617
(100.00 %)
664,757
(13.92 %)
364,636
(2.27 %)
6,198,840
(21.01 %)
36,548
(2.85 %)
70 barramundi perch (ASB-BC8 2016)
GCF_001640805.1
50,205
(13.10 %)
16,166
(3.05 %)
25,084
(6.20 %)
n/a 40.75
(100.00 %)
110
(0.00 %)
3,808
(100.00 %)
465,997
(3.11 %)
237,955
(4.36 %)
4,027,027
(23.91 %)
16,276
(1.04 %)
71 basidiomycetes A.bisporus (H97 2012)
GCF_000300575.1
10,448
(49.20 %)
1,066
(2.53 %)
5,238
(16.95 %)
n/a 46.48
(99.32 %)
225
(0.68 %)
254
(99.32 %)
4,921
(0.90 %)
2,352
(0.47 %)
62,603
(9.90 %)
5,244
(15.19 %)
72 basidiomycetes C.cinerea (okayama7#130 2010 genbank)
GCA_000182895.1
n/a 1,050
(2.04 %)
3,917
(10.89 %)
n/a 51.64
(100.00 %)
33
(0.00 %)
68
(100.00 %)
n/a 3,805
(0.81 %)
107,373
(7.81 %)
81
(99.54 %)
73 basidiomycetes C.depauperatus (CBS 7841 2024 genbank)
GCA_001720195.2
n/a 921
(4.16 %)
4,119
(24.79 %)
n/a 44.80
(100.00 %)
n/a 8
(100.00 %)
2,424
(0.66 %)
1,011
(0.30 %)
56,356
(7.99 %)
1,869
(7.30 %)
74 basidiomycetes C.neoformans (JEC21 2005 genbank)
GCA_000091045.1
n/a 957
(3.66 %)
3,784
(19.12 %)
n/a 48.54
(99.99 %)
85
(0.01 %)
99
(99.99 %)
4,944
(5.25 %)
1,808
(0.52 %)
68,717
(8.41 %)
5,128
(28.73 %)
75 basidiomycetes K.bestiolae (CBS 10118 2024 genbank)
GCA_000512585.3
n/a 918
(2.66 %)
4,907
(18.38 %)
n/a 47.29
(100.00 %)
n/a 8
(100.00 %)
7,245
(1.32 %)
2,141
(0.47 %)
97,927
(9.78 %)
4,995
(11.17 %)
76 basidiomycetes K.bestiolae (v1 CBS 10118 2016)
GCF_000512585.1
9,187
(54.88 %)
867
(2.56 %)
4,441
(17.03 %)
n/a 47.25
(99.94 %)
30
(0.06 %)
42
(99.94 %)
7,231
(1.31 %)
1,919
(0.32 %)
110,288
(10.48 %)
4,972
(10.95 %)
77 basidiomycetes K.dejecticola (CBS 10117 2024 genbank)
GCA_000512565.3
n/a 910
(2.69 %)
4,861
(19.78 %)
n/a 48.39
(100.00 %)
n/a 11
(100.00 %)
7,778
(1.42 %)
2,452
(0.43 %)
86,630
(7.97 %)
3,644
(14.24 %)
78 basidiomycetes K.dejecticola (v1 CBS 10117 2016)
GCF_000512565.1
8,645
(55.47 %)
908
(2.72 %)
4,862
(19.87 %)
n/a 48.38
(99.98 %)
56
(0.02 %)
69
(99.98 %)
7,816
(1.43 %)
2,425
(0.42 %)
85,868
(7.91 %)
3,698
(15.12 %)
79 basidiomycetes K.mangroviensis (v1 CBS 8507 2016 refseq)
GCF_000507465.1
8,471
(55.95 %)
884
(2.79 %)
5,418
(21.48 %)
n/a 44.88
(99.73 %)
43
(0.27 %)
105
(99.73 %)
6,509
(1.21 %)
1,529
(0.25 %)
101,733
(9.98 %)
2,326
(4.59 %)
80 basidiomycetes K.mangroviensis (v2 CBS 8507 2024 genbank)
GCA_000507465.4
n/a 886
(2.74 %)
5,392
(21.25 %)
n/a 44.92
(100.00 %)
n/a 4
(100.00 %)
6,585
(1.21 %)
1,546
(0.27 %)
104,495
(10.38 %)
2,335
(5.10 %)
81 basidiomycetes K.pini (v1 CBS 10737 2016)
GCF_000512605.1
7,854
(58.26 %)
816
(2.92 %)
5,392
(23.35 %)
n/a 40.23
(99.94 %)
24
(0.06 %)
42
(99.94 %)
6,502
(1.34 %)
1,847
(0.36 %)
99,393
(12.25 %)
1,191
(2.91 %)
82 basidiomycetes K.shandongensis (v1 CBS 12478 2019)
GCF_008629635.1
7,454
(55.86 %)
893
(2.94 %)
3,348
(15.13 %)
n/a 49.82
(99.99 %)
11
(0.01 %)
132
(100.00 %)
5,510
(1.13 %)
1,598
(0.33 %)
81,983
(9.00 %)
512
(39.06 %)
83 basidiomycetes M.globosa (v1 CBS 7966 2007)
GCF_000181695.1
4,286
(69.39 %)
1,060
(8.79 %)
2,585
(44.95 %)
n/a 52.06
(100.00 %)
22
(0.00 %)
89
(100.00 %)
1,777
(0.93 %)
720
(0.48 %)
22,182
(4.73 %)
124
(60.74 %)
84 basidiomycetes S.commune (v1 H4-8 2010)
GCF_000143185.1
13,192
(49.72 %)
894
(1.60 %)
973
(2.80 %)
n/a 57.50
(98.57 %)
316
(1.43 %)
352
(98.57 %)
7,478
(4.11 %)
7,640
(1.13 %)
176,404
(11.51 %)
38
(40.33 %)
85 bee C.calcarata (v1 Rehan_Ccalc_2016 2016)
GCF_001652005.1
25,020
(17.94 %)
4,205
(2.34 %)
27,352
(12.83 %)
n/a 41.09
(91.93 %)
19,248
(8.05 %)
50,565
(100.00 %)
57,833
(1.39 %)
27,440
(2.49 %)
1,173,760
(18.39 %)
10,942
(2.61 %)
86 bee E.mexicana (v1 0111107269 2016)
GCF_001483705.1
16,406
(4.01 %)
4,087
(0.75 %)
46,846
(6.53 %)
16,764
(4.04 %)
40.92
(95.72 %)
25,039
(4.23 %)
212,650
(95.77 %)
641,987
(7.51 %)
360,406
(11.43 %)
3,411,951
(46.01 %)
40,540
(3.99 %)
87 beet (2015)
GCF_000511025.2
37,803
(8.76 %)
12,044
(2.14 %)
63,283
(17.52 %)
n/a 36.14
(91.40 %)
30,962
(8.61 %)
71,208
(91.39 %)
288,084
(4.25 %)
299,650
(4.72 %)
3,021,571
(30.10 %)
32,547
(2.39 %)
88 Bellinger river turtle (v1 BRST_UC0152H_USYD 2024)
GCA_040894355.1
n/a 14,732
(1.14 %)
18,988
(1.77 %)
n/a 43.21
(100.00 %)
57
(0.00 %)
129
(100.00 %)
1,130,950
(11.22 %)
213,212
(1.80 %)
11,049,280
(26.48 %)
53,923
(2.09 %)
89 beluga whale (GAN/ISIS: 26980492/103006 v2 2017)
GCA_002288925.2
n/a 18,686
(1.78 %)
20,378
(1.43 %)
n/a 41.24
(98.66 %)
28,398
(1.35 %)
35,369
(98.65 %)
4,001,688
(43.72 %)
542,326
(1.10 %)
12,806,249
(34.24 %)
59,279
(1.53 %)
90 Betapolyomavirus macacae (2000)
GCA_000837645.1
n/a n/a n/a n/a 40.76
(99.94 %)
n/a 1
(100.00 %)
3
(0.00 %)
3
(4.54 %)
15
(4.33 %)
0
(0.00 %)
91 bighorn sheep (v1 Bighorn MfBH-ARS-UI-01 2024)
GCF_042477335.1
75,387
(2.66 %)
18,667
(1.37 %)
20,248
(1.35 %)
n/a 44.07
(100.00 %)
3
(0.00 %)
41
(100.00 %)
3,081,260
(20.10 %)
796,298
(12.14 %)
12,235,764
(46.75 %)
50,538
(11.18 %)
92 black cottonwood (v3 Nisqually-1 2018)
GCF_000002775.4
59,636
(15.47 %)
20,361
(4.67 %)
44,177
(15.83 %)
n/a 33.75
(97.43 %)
6,871
(2.58 %)
8,318
(97.42 %)
402,600
(27.63 %)
177,746
(4.65 %)
2,639,214
(36.04 %)
4,559
(0.56 %)
93 black perch (LCO1_2020_lvr primary hap 2022 genbank)
GCA_022577435.1
n/a 14,991
(3.02 %)
47,106
(6.98 %)
n/a 41.61
(100.00 %)
234
(0.00 %)
230
(100.00 %)
1,017,149
(18.99 %)
360,899
(8.75 %)
3,761,526
(28.91 %)
48,360
(4.43 %)
94 black rhinoceros (primary hap 2021 genbank)
GCA_020826845.1
56,255
(36.51 %)
18,774
(1.38 %)
22,346
(1.26 %)
n/a 41.59
(99.95 %)
215
(0.05 %)
1,075
(100.00 %)
4,200,385
(36.22 %)
548,030
(8.34 %)
14,347,639
(40.14 %)
43,525
(1.14 %)
95 black snub-nosed monkey (Rb0 v1 genbank 2016)
GCA_001698545.1
59,197
(39.21 %)
21,244
(1.88 %)
23,681
(1.25 %)
n/a 40.94
(94.13 %)
149,843
(5.88 %)
105,030
(100.00 %)
5,600,915
(50.57 %)
991,762
(2.45 %)
16,353,992
(34.26 %)
81,205
(1.19 %)
96 black snub-nosed monkey (Rb0 v1 refseq 2016)
GCF_001698545.1
59,210
(2.48 %)
21,256
(1.89 %)
23,679
(1.25 %)
n/a 40.94
(94.13 %)
149,843
(5.88 %)
105,031
(100.00 %)
5,602,009
(50.58 %)
991,745
(2.45 %)
16,354,078
(34.26 %)
81,205
(1.19 %)
97 black swan (v1 Queensland, Australia AKBS03 2020)
GCF_013377495.1
41,255
(4.77 %)
12,955
(1.98 %)
22,656
(2.28 %)
31,476
(5.07 %)
41.95
(100.00 %)
n/a 396
(100.00 %)
680,976
(7.66 %)
296,152
(1.44 %)
6,797,141
(21.40 %)
31,750
(3.32 %)
98 black tiger shrimp (v1 SGIC_2016 2020)
GCF_015228065.1
35,910
(2.41 %)
3,903
(0.15 %)
39,667
(2.27 %)
40,959
(2.59 %)
36.64
(83.75 %)
1,158,725
(16.44 %)
26,876
(100.00 %)
5,488,723
(29.98 %)
7,028,944
(21.91 %)
10,445,796
(49.62 %)
178,205
(3.43 %)
99 black-legged kittiwake (bRisTri1.patW 2023 genbank)
GCA_028500815.1
51,115
(48.16 %)
13,211
(1.67 %)
24,108
(1.99 %)
n/a 44.40
(99.94 %)
283
(0.06 %)
716
(100.00 %)
521,275
(5.36 %)
236,727
(8.62 %)
5,684,588
(26.70 %)
45,318
(4.71 %)
100 black-legged tick (U.Maryland v1 2021)
GCF_016920785.1
41,018
(2.61 %)
4,064
(0.14 %)
135,587
(7.67 %)
n/a 46.27
(100.00 %)
n/a 2,977
(100.00 %)
1,153,773
(4.93 %)
754,711
(7.52 %)
10,964,182
(43.13 %)
138,831
(8.38 %)
101 black-legged tick (Wikel colony 2008 genbank)
GCA_000208615.1
n/a 3,432
(0.19 %)
108,471
(5.13 %)
n/a 45.22
(78.65 %)
201,145
(21.35 %)
570,637
(78.65 %)
656,957
(3.38 %)
365,918
(1.61 %)
8,574,437
(27.02 %)
345,141
(14.15 %)
102 blackcap (primary hap 2019 genbank)
GCA_009819655.1
n/a 12,378
(1.92 %)
22,970
(2.37 %)
n/a 42.00
(98.88 %)
413
(1.12 %)
189
(100.00 %)
506,242
(6.14 %)
330,354
(2.12 %)
6,410,567
(19.76 %)
26,838
(2.34 %)
103 Blainville's beaked whale (primary hap 2022 genbank)
GCA_025265405.1
47,540
(38.02 %)
19,042
(1.52 %)
20,766
(1.27 %)
n/a 41.70
(99.97 %)
97
(0.03 %)
73
(100.00 %)
3,964,035
(35.29 %)
765,957
(8.74 %)
12,128,162
(41.78 %)
70,851
(1.80 %)
104 bloodfluke planorb (v1 BB02 2013 refseq)
GCF_000457365.1
42,216
(5.95 %)
3,558
(0.29 %)
24,115
(2.96 %)
n/a 35.99
(98.05 %)
76,921
(1.91 %)
408,322
(98.09 %)
629,362
(4.20 %)
749,383
(9.40 %)
6,932,184
(43.02 %)
16,970
(0.64 %)
105 bloodfluke planorb (v2 BB02 2013 genbank)
GCA_000457365.2
n/a 3,378
(0.29 %)
23,684
(2.94 %)
n/a 35.99
(98.05 %)
76,903
(1.91 %)
406,924
(98.09 %)
587,583
(3.57 %)
749,212
(9.41 %)
6,921,847
(43.04 %)
16,561
(0.63 %)
106 blue whale (JJ_BM4_2016_0621 v2 2020)
GCA_009873245.2
n/a 19,164
(1.81 %)
20,546
(1.41 %)
34,210
(1.86 %)
40.88
(98.91 %)
936
(1.09 %)
130
(100.00 %)
3,999,202
(44.22 %)
581,540
(1.22 %)
12,900,977
(34.62 %)
67,189
(1.73 %)
107 blunt-snouted clingfish (v1 2019 genbank)
GCA_900634775.1
47,312
(59.52 %)
14,496
(1.97 %)
28,873
(5.58 %)
60,981
(6.13 %)
38.27
(98.47 %)
1,160
(1.53 %)
441
(100.00 %)
731,730
(4.21 %)
471,620
(4.92 %)
5,974,002
(42.88 %)
29,050
(1.48 %)
108 blunt-snouted clingfish (v1 2019 refseq)
GCF_900634775.1
47,312
(7.12 %)
14,496
(1.97 %)
28,873
(5.58 %)
60,981
(6.13 %)
38.27
(98.47 %)
1,160
(1.53 %)
441
(100.00 %)
731,730
(4.21 %)
471,620
(4.92 %)
5,974,002
(42.88 %)
29,050
(1.48 %)
109 Bolivian squirrel monkey (100643 v2.0 BCM 2021)
GCF_016699345.1
53,030
(2.41 %)
20,599
(1.98 %)
21,182
(1.34 %)
46,441
(1.87 %)
40.95
(99.56 %)
1,074
(0.44 %)
2,790
(99.56 %)
5,098,799
(47.87 %)
946,231
(3.04 %)
14,608,771
(36.99 %)
37,273
(1.03 %)
110 Bolivian squirrel monkey (3227 Broad 2011)
GCF_000235385.1
39,820
(2.33 %)
20,222
(2.04 %)
18,404
(1.34 %)
49,071
(2.26 %)
40.77
(94.98 %)
148,728
(5.04 %)
151,414
(94.96 %)
4,710,420
(46.30 %)
767,602
(1.48 %)
14,489,703
(32.96 %)
32,474
(0.75 %)
111 Bornean orangutan (v1 AG05252 alternate hap 2023 genbank)
GCA_028885525.1
n/a 19,820
(1.76 %)
20,399
(1.15 %)
n/a 40.98
(99.88 %)
36
(0.12 %)
251
(99.88 %)
5,232,617
(54.01 %)
1,003,539
(10.19 %)
14,858,575
(42.10 %)
42,467
(1.24 %)
112 Bornean orangutan (v1 AG05252 primary hap 2023 refseq)
GCF_028885625.1
81,966
(2.93 %)
20,794
(1.72 %)
21,307
(1.13 %)
n/a 41.13
(99.86 %)
39
(0.14 %)
1,593
(99.86 %)
5,651,267
(54.21 %)
1,155,151
(9.33 %)
16,242,823
(42.82 %)
52,294
(2.02 %)
113 boutu (BS63 2019)
GCA_004363515.1
n/a 21,835
(1.38 %)
35,087
(1.18 %)
n/a 42.09
(99.89 %)
5,072
(0.02 %)
1,218,682
(99.98 %)
5,098,108
(45.85 %)
856,878
(2.32 %)
13,046,921
(40.74 %)
63,992
(1.47 %)
114 bowfin (hap1 2024 genbank)
GCA_036373705.1
n/a 13,851
(1.83 %)
27,058
(4.43 %)
n/a 40.75
(100.00 %)
97
(0.00 %)
390
(100.00 %)
953,497
(13.69 %)
387,700
(7.91 %)
4,552,410
(37.72 %)
46,301
(2.99 %)
115 Brazilian free-tailed bat (US034 2019)
GCA_004025005.1
n/a 23,562
(1.20 %)
51,200
(1.27 %)
n/a 42.40
(99.91 %)
4,243
(0.02 %)
1,071,858
(99.98 %)
4,884,584
(32.93 %)
777,032
(1.49 %)
14,195,446
(36.38 %)
89,940
(1.88 %)
116 brown anole (Geneva1000 2022 genbank)
GCA_025583915.1
38,099
(52.40 %)
14,028
(1.05 %)
19,927
(1.81 %)
n/a 41.14
(98.37 %)
114,440
(1.64 %)
3,738
(100.00 %)
1,376,455
(6.78 %)
1,094,843
(5.18 %)
9,127,396
(44.98 %)
46,291
(1.18 %)
117 brown argus (genbank 2021)
GCA_905147365.1
23,611
(63.03 %)
4,734
(1.03 %)
24,267
(6.80 %)
24,237
(6.16 %)
36.86
(100.00 %)
4
(0.00 %)
26
(100.00 %)
264,378
(2.90 %)
144,255
(3.35 %)
2,651,028
(48.44 %)
35,431
(4.56 %)
118 brown bear (GAN/ISIS:MIG12 v1 2018)
GCF_003584765.1
53,993
(3.19 %)
18,811
(1.78 %)
21,058
(1.52 %)
39,408
(1.98 %)
41.84
(99.31 %)
17,380
(0.70 %)
21,814
(99.30 %)
4,283,780
(41.29 %)
567,588
(1.23 %)
13,807,277
(30.86 %)
62,126
(1.80 %)
119 brown bear (v1.0 2022 WashU)
GCF_023065955.1
60,162
(4.01 %)
18,920
(1.66 %)
21,641
(1.49 %)
n/a 42.51
(100.00 %)
215
(0.00 %)
902
(100.00 %)
4,166,472
(34.00 %)
659,124
(5.14 %)
13,282,996
(33.88 %)
68,113
(2.27 %)
120 brown dog tick (v1 Rsan-2018 2020)
GCF_013339695.1
39,606
(2.36 %)
3,965
(0.13 %)
116,426
(5.96 %)
45,849
(2.46 %)
46.86
(99.96 %)
10,359
(0.04 %)
2,329
(100.00 %)
1,064,424
(3.53 %)
716,579
(3.47 %)
10,608,171
(42.78 %)
13,204
(0.97 %)
121 brown headed cowbird (v1.0 BHLD 08-10-18 2020)
GCF_012460135.1
31,379
(5.19 %)
12,572
(1.89 %)
24,442
(2.44 %)
26,137
(3.13 %)
42.40
(99.99 %)
278
(0.01 %)
691
(99.99 %)
504,872
(6.53 %)
420,620
(3.73 %)
6,496,619
(21.26 %)
28,576
(2.39 %)
122 brown planthopper (v1 BPH 2020 genbank)
GCA_014356525.1
36,936
(60.13 %)
4,416
(0.37 %)
22,354
(3.57 %)
37,534
(4.91 %)
34.69
(99.96 %)
4,529
(0.04 %)
7,093
(100.00 %)
597,351
(3.69 %)
564,076
(6.64 %)
6,601,703
(47.48 %)
39,697
(1.55 %)
123 brown planthopper (v1 BPH 2020 refseq)
GCF_014356525.1
36,949
(4.89 %)
4,427
(0.37 %)
22,417
(3.57 %)
37,573
(4.91 %)
34.69
(99.96 %)
4,529
(0.04 %)
7,094
(100.00 %)
597,178
(3.69 %)
564,092
(6.64 %)
6,601,918
(47.49 %)
39,697
(1.55 %)
124 budding yeast C.auris (6684 2015 genbank)
GCA_001189475.1
n/a 1,948
(12.61 %)
4,664
(59.90 %)
n/a 45.12
(98.69 %)
689
(1.33 %)
99
(100.00 %)
3,478
(1.23 %)
2,281
(0.83 %)
48,703
(8.19 %)
1,579
(6.36 %)
125 budding yeast C.auris (B11221 2017 genbank)
GCA_002775015.1
n/a 2,030
(12.92 %)
4,702
(58.30 %)
n/a 45.32
(100.00 %)
3
(0.00 %)
20
(100.00 %)
3,464
(2.27 %)
2,436
(0.80 %)
28,524
(6.96 %)
1,757
(7.37 %)
126 budding yeast C.lusitaniae (ATCC 42720 2009 genbank)
GCA_000003835.1
n/a 1,956
(12.86 %)
4,335
(54.85 %)
n/a 44.50
(99.71 %)
79
(0.29 %)
88
(99.71 %)
2,272
(1.18 %)
4,036
(1.77 %)
48,188
(8.66 %)
1,474
(15.82 %)
127 budding yeast C.oxycetoniae (v1 CBS 10844 2022)
GCF_023343755.1
4,917
(62.59 %)
1,845
(11.42 %)
4,476
(56.70 %)
n/a 37.84
(99.95 %)
167
(0.05 %)
148
(100.00 %)
14,118
(4.93 %)
19,713
(8.99 %)
82,014
(21.64 %)
201
(0.52 %)
128 budding yeast K.marxianus (DMKU3-1042 2014 genbank)
GCA_001417885.1
n/a 3,349
(28.79 %)
4,665
(66.28 %)
n/a 40.12
(100.00 %)
n/a 9
(100.00 %)
7,406
(3.43 %)
3,781
(1.46 %)
51,732
(11.80 %)
742
(4.91 %)
129 budding yeast L.elongisporus (NRRL YB-4239 2007 genbank)
GCA_000149685.1
n/a 1,905
(9.82 %)
5,004
(52.37 %)
n/a 36.94
(99.45 %)
117
(0.56 %)
145
(99.44 %)
30,880
(10.91 %)
18,155
(4.10 %)
100,210
(23.18 %)
22
(0.04 %)
130 budding yeast N.glabratus (CBS 138 2008 genbank)
GCA_000002545.2
n/a 3,553
(27.93 %)
4,799
(61.37 %)
n/a 38.65
(100.00 %)
3
(0.00 %)
16
(100.00 %)
3,047
(1.32 %)
2,546
(1.58 %)
59,567
(11.20 %)
635
(3.11 %)
131 budding yeast Y.lipolytica (CLIB122 2004 genbank)
GCA_000002525.1
n/a 1,755
(6.59 %)
4,802
(37.76 %)
n/a 49.05
(99.99 %)
28
(0.01 %)
34
(99.99 %)
7,553
(2.98 %)
9,578
(2.12 %)
81,595
(9.59 %)
6,216
(33.42 %)
132 budgerigar (maternal Z 2020 genbank)
GCA_012275295.1
32,026
(47.01 %)
13,250
(1.87 %)
23,063
(2.25 %)
26,324
(3.11 %)
41.80
(99.72 %)
284
(0.28 %)
865
(100.00 %)
539,059
(10.20 %)
279,511
(3.12 %)
5,874,608
(22.08 %)
21,155
(1.61 %)
133 butterfly L.sinapis (2021 genbank)
GCA_905404315.1
25,882
(55.17 %)
4,722
(0.65 %)
16,896
(3.62 %)
47,660
(8.03 %)
35.73
(100.00 %)
13
(0.00 %)
50
(100.00 %)
272,738
(1.92 %)
98,053
(6.01 %)
4,662,765
(51.79 %)
43,150
(4.96 %)
134 butterfly P.napi (v1.1 genbank 2021)
GCA_905475465.1
n/a 4,588
(1.37 %)
11,218
(5.90 %)
42,925
(13.84 %)
33.95
(100.00 %)
41
(0.00 %)
43
(100.00 %)
143,323
(2.19 %)
45,473
(3.23 %)
2,501,939
(42.55 %)
11,070
(2.07 %)
135 cabbage white (genbank 2021)
GCA_905147795.1
21,844
(65.09 %)
4,557
(1.68 %)
9,253
(6.32 %)
30,285
(15.57 %)
33.23
(100.00 %)
4
(0.00 %)
40
(100.00 %)
116,781
(2.12 %)
30,577
(1.24 %)
2,300,336
(39.04 %)
6,783
(2.24 %)
136 California condor (v1 813 2021 genbank)
GCA_018139145.1
n/a 12,650
(1.75 %)
21,946
(1.95 %)
n/a 42.16
(99.97 %)
632
(0.03 %)
542
(100.00 %)
518,393
(6.41 %)
177,329
(0.88 %)
7,168,675
(20.31 %)
34,926
(2.94 %)
137 California sea lion (BS06 2019 Broad)
GCA_004024565.1
n/a 23,668
(1.61 %)
29,709
(1.32 %)
n/a 41.56
(99.92 %)
10,276
(0.04 %)
582,272
(99.96 %)
4,952,087
(44.00 %)
651,744
(1.26 %)
13,644,805
(35.79 %)
62,245
(1.50 %)
138 California sea lion (v1 2019)
GCA_009762305.1
n/a 21,020
(1.79 %)
20,045
(1.39 %)
45,176
(2.15 %)
41.40
(99.28 %)
122
(0.72 %)
43
(100.00 %)
4,529,949
(43.67 %)
589,962
(1.24 %)
13,266,465
(33.77 %)
51,989
(1.50 %)
139 California two-spot octopus (v1 UCB-OBI-ISO-001 male 2015)
GCF_001194135.1
26,135
(1.83 %)
3,125
(0.12 %)
17,875
(1.29 %)
27,144
(1.85 %)
36.03
(84.95 %)
548,450
(15.13 %)
700,124
(84.87 %)
3,498,348
(13.19 %)
3,005,729
(6.50 %)
13,687,022
(41.09 %)
22,984
(0.34 %)
140 Canada lynx (LIC74 v1 2019)
GCF_007474595.1
50,094
(2.69 %)
18,283
(1.66 %)
19,326
(1.35 %)
38,985
(1.96 %)
41.70
(99.88 %)
848
(0.12 %)
66
(100.00 %)
5,016,399
(43.75 %)
904,986
(1.75 %)
13,476,288
(34.20 %)
66,822
(2.52 %)
141 Cape golden mole (BS56 2019 Broad)
GCA_004027935.1
n/a 25,543
(0.55 %)
52,506
(0.63 %)
n/a 40.04
(99.84 %)
4,876
(0.01 %)
3,432,954
(99.99 %)
7,363,240
(21.82 %)
876,677
(2.53 %)
25,446,677
(58.18 %)
25,319
(0.31 %)
142 capsicum (Zunla-1 2015 genbank)
GCA_000710875.1
n/a 16,133
(0.56 %)
62,445
(2.92 %)
n/a 34.93
(96.78 %)
107,172
(3.23 %)
108,797
(96.77 %)
1,171,727
(3.54 %)
948,641
(4.39 %)
21,533,236
(46.16 %)
16,621
(0.21 %)
143 Caribbean electric ray (hap1 2024 genbank)
GCA_036971445.1
n/a 11,967
(0.44 %)
20,851
(1.23 %)
n/a 43.35
(99.99 %)
1,443
(0.01 %)
596
(100.00 %)
4,902,656
(34.96 %)
1,040,893
(17.82 %)
16,403,253
(54.79 %)
113,936
(1.69 %)
144 carmine bee-eater (2014 BGI)
GCF_000691845.1
15,520
(2.12 %)
11,303
(1.45 %)
24,758
(1.84 %)
n/a 41.67
(99.59 %)
50,632
(0.42 %)
104,131
(99.58 %)
405,042
(5.66 %)
161,525
(1.05 %)
6,445,961
(19.27 %)
11,477
(0.36 %)
145 cassava (v6 AM560-2 2016 DOE)
GCF_001659605.1
48,199
(10.95 %)
18,537
(3.62 %)
45,536
(13.17 %)
n/a 35.94
(85.14 %)
37,896
(14.88 %)
39,916
(85.12 %)
295,656
(2.88 %)
266,527
(3.40 %)
2,434,269
(42.34 %)
30,963
(1.41 %)
146 cattle (Hereford 2015)
GCA_000003205.6
n/a 19,803
(1.54 %)
21,001
(1.30 %)
n/a 41.83
(99.57 %)
41,517
(0.44 %)
42,578
(99.56 %)
5,725,274
(49.24 %)
459,535
(1.33 %)
12,905,109
(41.11 %)
43,324
(1.28 %)
147 cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v1.2 2018 USDA)
GCF_002263795.1
76,369
(2.97 %)
19,669
(1.56 %)
21,999
(1.33 %)
n/a 41.93
(100.00 %)
386
(0.00 %)
2,211
(100.00 %)
5,643,592
(49.67 %)
545,256
(2.90 %)
13,085,601
(41.79 %)
44,357
(1.24 %)
148 cattle (Hereford L1 Dominette 01449 42190680 v1.3 2018 USDA)
GCF_002263795.2
76,306
(2.98 %)
19,325
(1.49 %)
21,665
(1.32 %)
n/a 41.94
(100.00 %)
386
(0.00 %)
1,957
(100.00 %)
3,550,686
(24.18 %)
544,595
(2.90 %)
13,050,221
(41.81 %)
44,208
(1.24 %)
149 Chacoan peccary (BS18 v1 2019 Broad)
GCA_004024745.1
n/a 21,372
(1.41 %)
34,453
(1.31 %)
n/a 42.35
(99.87 %)
10,534
(0.04 %)
1,240,696
(99.96 %)
5,244,572
(43.13 %)
2,503,015
(4.45 %)
12,961,004
(41.69 %)
173,264
(3.70 %)
150 channel bull blenny (2019 genbank)
GCA_900634415.1
40,788
(61.50 %)
14,472
(3.02 %)
24,012
(6.59 %)
60,720
(10.43 %)
40.96
(99.58 %)
445
(0.42 %)
322
(100.00 %)
420,697
(5.49 %)
320,518
(6.91 %)
3,394,846
(28.67 %)
20,453
(1.39 %)
151 channel catfish (USDA103 v1 2016)
GCF_001660625.1
53,920
(9.58 %)
15,712
(2.71 %)
25,639
(5.25 %)
n/a 39.70
(98.56 %)
25,203
(1.45 %)
34,544
(98.55 %)
871,222
(5.75 %)
585,250
(4.19 %)
5,150,651
(33.94 %)
31,438
(1.87 %)
152 channel catfish (USDA103 v1.2 2019)
GCF_001660625.2
57,087
(10.27 %)
16,253
(2.68 %)
44,936
(5.15 %)
n/a 39.70
(98.57 %)
25,285
(1.44 %)
34,545
(98.61 %)
900,327
(5.55 %)
614,695
(4.28 %)
5,348,266
(33.81 %)
32,840
(1.87 %)
153 cheetah (AJU 981 2015)
GCA_001443585.1
n/a 18,264
(1.57 %)
14,665
(1.26 %)
n/a 41.30
(98.26 %)
183,260
(1.77 %)
14,382
(100.00 %)
4,777,041
(42.51 %)
784,368
(1.53 %)
13,503,827
(31.65 %)
57,657
(1.31 %)
154 chevron butterflyfish (hap1 2024 genbank)
GCA_039877785.1
n/a 15,255
(2.94 %)
48,037
(7.05 %)
n/a 42.79
(100.00 %)
49
(0.00 %)
37
(100.00 %)
465,710
(3.82 %)
254,015
(3.62 %)
3,657,999
(23.28 %)
30,971
(2.02 %)
155 chimney swift (M959 v1.0 2014)
GCF_000747805.1
15,979
(2.53 %)
12,065
(1.82 %)
10,050
(2.07 %)
n/a 41.40
(95.99 %)
65,523
(4.03 %)
84,595
(95.97 %)
453,775
(7.30 %)
194,988
(2.21 %)
6,363,949
(19.70 %)
12,486
(0.42 %)
156 chimpanzee (Clint C0471 2018 genbank)
GCA_002880755.3
n/a 20,378
(1.83 %)
21,427
(1.19 %)
n/a 40.71
(98.98 %)
693
(1.02 %)
5,037
(98.98 %)
5,409,980
(53.76 %)
984,231
(7.31 %)
15,896,744
(39.56 %)
45,870
(0.97 %)
157 chimpanzee (v1 AG18354 alternate hap 2023 genbank)
GCA_028858805.1
n/a 20,001
(1.79 %)
21,230
(1.19 %)
n/a 40.62
(99.78 %)
22
(0.22 %)
141
(99.78 %)
5,092,768
(48.83 %)
946,933
(11.75 %)
14,844,947
(42.39 %)
47,662
(1.21 %)
158 chimpanzee (v1 AG18354 primary hap 2023 refseq)
GCF_028858775.1
111,282
(4.36 %)
20,990
(1.75 %)
21,705
(1.15 %)
n/a 40.94
(99.90 %)
29
(0.10 %)
1,500
(99.90 %)
5,581,205
(50.06 %)
1,158,792
(10.59 %)
15,972,274
(43.09 %)
61,901
(2.29 %)
159 China rose (Old Blush v1 2018)
GCF_002994745.1
60,293
(11.65 %)
15,433
(2.84 %)
67,310
(21.70 %)
n/a 38.83
(100.00 %)
33
(0.00 %)
45
(100.00 %)
273,992
(2.25 %)
228,466
(3.97 %)
2,261,888
(35.14 %)
37,317
(4.18 %)
160 Chinese hamster (17A/GY CHO 2018)
GCF_003668045.1
55,529
(3.00 %)
19,755
(1.76 %)
20,017
(1.50 %)
n/a 41.51
(99.88 %)
4,356
(0.12 %)
1,830
(100.00 %)
4,544,603
(29.89 %)
1,095,407
(2.92 %)
12,942,232
(32.27 %)
19,343
(0.58 %)
161 Chinook salmon (v2 Ot180627B 2021 male genbank)
GCA_018296145.1
92,370
(51.48 %)
27,141
(1.63 %)
113,328
(4.52 %)
157,545
(6.65 %)
43.55
(99.99 %)
2,333
(0.01 %)
9,977
(99.99 %)
4,892,399
(55.31 %)
2,306,695
(23.48 %)
10,038,870
(54.55 %)
62,726
(1.40 %)
162 chub mackerel (primary hap 2022 genbank)
GCA_027409825.1
34,390
(49.60 %)
15,350
(2.35 %)
46,858
(6.07 %)
n/a 40.01
(99.92 %)
1,572
(0.08 %)
361
(100.00 %)
1,669,327
(28.44 %)
638,340
(11.55 %)
4,613,422
(32.38 %)
16,290
(0.85 %)
163 chuck-will's-widow (BGI_N321 v1 2014)
GCF_000700745.1
17,196
(2.21 %)
12,140
(1.50 %)
25,641
(1.91 %)
n/a 40.76
(99.61 %)
56,667
(0.39 %)
126,789
(99.61 %)
560,317
(7.62 %)
203,204
(1.12 %)
6,593,712
(20.47 %)
8,105
(0.24 %)
164 chytrid fungus B.dendrobatidis (v1 JAM81 2011)
GCF_000203795.1
8,677
(50.60 %)
1,251
(4.00 %)
7,681
(34.45 %)
n/a 39.25
(99.25 %)
383
(0.76 %)
510
(99.24 %)
2,585
(1.13 %)
3,424
(1.20 %)
81,225
(12.02 %)
161
(0.21 %)
165 ciliates Oxytricha trifallax (v1 JRB310 2012)
GCA_000295675.1
n/a 1,065
(1.03 %)
1,781
(1.87 %)
n/a 31.32
(99.93 %)
1,347
(0.00 %)
23,709
(100.00 %)
29,228
(1.96 %)
22,291
(1.48 %)
550,667
(25.14 %)
20
(0.01 %)
166 climbing perch (v1.1 2018 refseq)
GCF_900324465.1
42,930
(13.31 %)
15,237
(3.47 %)
22,710
(7.34 %)
37,043
(11.25 %)
40.40
(98.65 %)
292
(1.35 %)
70
(100.00 %)
329,586
(2.67 %)
133,519
(1.94 %)
3,418,470
(21.84 %)
10,698
(0.86 %)
167 climbing perch (v1.2 2018 genbank)
GCA_900324465.2
42,746
(63.74 %)
15,239
(3.53 %)
39,067
(7.54 %)
63,908
(10.45 %)
40.40
(99.35 %)
266
(0.65 %)
50
(100.00 %)
324,479
(2.66 %)
130,248
(1.89 %)
3,324,960
(21.31 %)
10,500
(0.87 %)
168 climbing perch (v1.2 2018 refseq)
GCF_900324465.2
42,759
(13.53 %)
15,241
(3.53 %)
39,067
(7.54 %)
63,908
(10.45 %)
40.40
(99.35 %)
266
(0.65 %)
51
(100.00 %)
324,324
(2.66 %)
130,249
(1.89 %)
3,325,009
(21.31 %)
10,500
(0.87 %)
169 clouded leopard (mNeoNeb1 primary hap 2023 genbank)
GCA_028018385.1
81,219
(51.66 %)
18,516
(1.55 %)
20,363
(1.39 %)
n/a 41.79
(99.94 %)
181
(0.06 %)
34
(100.00 %)
4,798,634
(33.91 %)
992,669
(2.08 %)
13,618,933
(34.42 %)
67,831
(2.45 %)
170 clouded yellow (genbank 2021)
GCA_905220415.1
23,070
(64.23 %)
4,767
(1.38 %)
15,869
(7.12 %)
34,699
(13.48 %)
33.59
(100.00 %)
9
(0.00 %)
33
(100.00 %)
161,872
(2.42 %)
73,892
(2.86 %)
2,544,844
(42.14 %)
15,663
(2.98 %)
171 coho salmon (150728-3 2017)
GCF_002021735.1
64,032
(4.29 %)
24,727
(1.43 %)
46,926
(3.38 %)
n/a 43.33
(95.39 %)
265,291
(4.63 %)
22,810
(99.99 %)
1,185,308
(5.22 %)
2,455,045
(15.99 %)
11,710,855
(46.53 %)
72,061
(1.46 %)
172 common bottlenose dolphin (maternal Y genbank 2020)
GCA_011762595.1
67,207
(45.84 %)
18,772
(1.77 %)
20,527
(1.42 %)
35,815
(1.58 %)
41.44
(99.74 %)
674
(0.26 %)
362
(100.00 %)
4,067,521
(46.14 %)
628,982
(2.12 %)
12,490,896
(35.29 %)
65,551
(1.90 %)
173 common bottlenose dolphin (MMES2002162SC 2016 genbank)
GCA_001922835.1
45,962
(43.27 %)
17,254
(1.68 %)
17,112
(1.34 %)
n/a 40.85
(99.45 %)
114,003
(0.57 %)
2,647
(100.00 %)
3,845,214
(43.88 %)
514,631
(1.06 %)
12,317,013
(32.18 %)
48,030
(1.35 %)
174 common brushtail (genbank 2020)
GCA_011100635.1
37,661
(35.20 %)
18,681
(0.81 %)
15,375
(0.86 %)
n/a 39.48
(99.44 %)
1,796
(0.56 %)
212
(100.00 %)
7,598,697
(38.92 %)
1,259,434
(1.97 %)
22,071,301
(40.56 %)
17,762
(0.38 %)
175 common buzzard (bButBut1.hap1.1 2024 genbank)
GCA_964188355.1
n/a 13,512
(1.75 %)
24,417
(2.13 %)
n/a 43.17
(99.99 %)
471
(0.01 %)
546
(100.00 %)
439,018
(4.62 %)
244,865
(6.73 %)
6,778,625
(23.94 %)
43,400
(4.80 %)
176 common carp (2014)
GCF_000951615.1
75,414
(5.81 %)
27,632
(2.17 %)
59,950
(5.28 %)
n/a 37.00
(97.48 %)
57,940
(2.53 %)
9,378
(100.00 %)
1,460,282
(5.17 %)
987,356
(7.88 %)
9,900,821
(37.41 %)
48,702
(1.38 %)
177 common cuckoo (bCucCan1 primary hap 2021 genbank)
GCA_017976375.1
50,206
(57.28 %)
13,179
(1.84 %)
25,859
(2.41 %)
n/a 42.18
(99.58 %)
296
(0.42 %)
151
(100.00 %)
521,043
(9.61 %)
310,469
(2.36 %)
6,712,849
(21.76 %)
25,267
(1.71 %)
178 common cuckoo (BGI 2014)
GCF_000709325.1
16,827
(2.53 %)
12,599
(1.80 %)
12,623
(2.28 %)
n/a 41.52
(97.64 %)
56,977
(2.38 %)
71,907
(97.62 %)
418,870
(8.06 %)
192,437
(2.08 %)
6,576,259
(19.85 %)
18,002
(0.74 %)
179 common house spider (v2 Geottingen 2017)
GCF_000365465.2
30,064
(3.79 %)
3,347
(0.23 %)
7,571
(1.48 %)
n/a 29.46
(81.63 %)
247,378
(18.44 %)
263,908
(81.56 %)
587,943
(2.23 %)
464,643
(2.90 %)
10,795,253
(40.31 %)
10,480
(0.23 %)
180 common house spider (v3 Goettingen 2019 genbank)
GCA_000365465.3
37,121
(48.05 %)
3,276
(0.22 %)
9,098
(1.38 %)
38,273
(4.24 %)
29.40
(98.45 %)
124,228
(1.55 %)
84,235
(98.46 %)
637,694
(2.45 %)
527,781
(4.43 %)
11,553,196
(51.16 %)
11,998
(0.33 %)
181 common limpet (v1 primary hap 2022)
GCF_932274485.1
41,888
(9.21 %)
3,611
(0.43 %)
13,244
(4.58 %)
44,721
(6.30 %)
36.11
(100.00 %)
75
(0.00 %)
13
(100.00 %)
239,042
(1.40 %)
359,961
(7.89 %)
4,399,053
(45.69 %)
33,411
(1.94 %)
182 common sole (primary hap 2023 genbank)
GCA_958295425.1
55,359
(63.58 %)
14,846
(2.94 %)
42,832
(6.93 %)
n/a 40.87
(99.99 %)
373
(0.01 %)
243
(100.00 %)
1,149,249
(19.12 %)
342,239
(9.71 %)
3,906,839
(32.84 %)
27,772
(2.71 %)
183 common swift (bApuApu2 2021 genbank)
GCA_020740795.1
39,986
(53.94 %)
12,277
(1.88 %)
20,379
(2.16 %)
n/a 41.95
(99.84 %)
256
(0.16 %)
109
(100.00 %)
533,758
(8.66 %)
199,748
(1.12 %)
6,353,957
(21.19 %)
20,393
(1.74 %)
184 common vampire bat (v1 HL8 alternate hap 2022 genbank)
GCA_022682395.1
n/a 17,520
(1.75 %)
18,995
(1.67 %)
n/a 42.89
(99.99 %)
580
(0.01 %)
430
(100.00 %)
2,597,497
(28.17 %)
356,620
(2.88 %)
10,797,225
(31.23 %)
61,931
(2.30 %)
185 common vampire bat (v1 HL8 primary hap 2022 genbank)
GCA_022682495.1
58,054
(45.51 %)
18,280
(1.71 %)
19,514
(1.59 %)
n/a 42.98
(99.99 %)
611
(0.01 %)
572
(100.00 %)
2,761,820
(28.38 %)
427,940
(3.89 %)
11,250,492
(32.57 %)
70,700
(2.48 %)
186 common vampire bat (v1 HL8 primary hap 2022 refseq)
GCF_022682495.1
58,067
(3.40 %)
18,280
(1.71 %)
19,515
(1.59 %)
n/a 42.98
(99.99 %)
611
(0.01 %)
573
(100.00 %)
2,761,826
(28.38 %)
427,942
(3.89 %)
11,250,529
(32.57 %)
70,701
(2.48 %)
187 common vampire bat (v2 DRU21DN04 2018 genbank)
GCA_002940915.2
n/a 18,511
(1.87 %)
18,170
(1.68 %)
n/a 42.15
(97.78 %)
54,308
(2.23 %)
84,108
(97.77 %)
2,860,991
(29.93 %)
275,245
(1.03 %)
11,798,152
(28.19 %)
51,833
(1.38 %)
188 common vampire bat (v2 DRU21DN04 2018 refseq)
GCF_002940915.1
51,047
(3.24 %)
18,506
(1.88 %)
18,166
(1.68 %)
n/a 42.15
(97.78 %)
54,308
(2.23 %)
84,109
(97.77 %)
2,861,697
(29.93 %)
275,247
(1.03 %)
11,798,198
(28.19 %)
51,834
(1.38 %)
189 common vampire bat (v2 HL8 primary hap 2022 genbank)
GCA_022682495.2
n/a 18,311
(1.71 %)
19,456
(1.59 %)
n/a 42.99
(99.99 %)
615
(0.01 %)
573
(100.00 %)
2,767,071
(28.35 %)
431,575
(3.90 %)
11,286,853
(32.63 %)
71,506
(2.50 %)
190 Coquerel's sifaka 6110/Marcella (2015 genbank)
GCA_000956105.1
29,369
(33.72 %)
19,335
(2.10 %)
21,769
(1.63 %)
n/a 41.24
(74.51 %)
276,544
(25.53 %)
299,069
(74.47 %)
3,513,698
(39.82 %)
304,033
(0.59 %)
13,333,842
(21.06 %)
56,694
(1.59 %)
191 cork oak (v1 HL8 2018)
GCF_002906115.1
65,969
(8.84 %)
20,226
(1.95 %)
89,703
(16.66 %)
n/a 36.19
(97.99 %)
26,139
(2.01 %)
23,344
(100.00 %)
865,884
(3.63 %)
491,126
(5.95 %)
6,119,503
(36.10 %)
21,505
(3.50 %)
192 corroboree frog (hap2 2023 genbank)
GCA_028390025.1
n/a n/a 54,346
(1.07 %)
n/a 45.66
(99.76 %)
2,699
(0.24 %)
3,127
(100.00 %)
18,782,633
(75.22 %)
5,902,115
(18.63 %)
5,826
(99.76 %)
990,274
(4.84 %)
193 Cory's shearwater (hap1.1 2024)
GCA_964195595.1
n/a 13,703
(1.71 %)
26,310
(2.10 %)
n/a 43.29
(99.99 %)
525
(0.01 %)
414
(100.00 %)
479,045
(5.03 %)
336,466
(4.95 %)
5,910,298
(24.89 %)
48,046
(4.19 %)
194 Cory's shearwater (hap2.1 2024)
GCA_964196065.1
n/a 12,750
(1.85 %)
23,191
(2.16 %)
n/a 43.03
(99.99 %)
477
(0.01 %)
726
(99.99 %)
403,846
(4.59 %)
252,125
(3.30 %)
6,206,493
(22.07 %)
41,821
(4.50 %)
195 cotton bollworm (Harm_GR_Male_#8 2017 genbank)
GCA_002156985.1
21,972
(59.55 %)
4,839
(1.54 %)
21,045
(8.01 %)
n/a 36.13
(89.02 %)
26,910
(11.01 %)
24,551
(88.99 %)
115,046
(2.97 %)
31,900
(0.85 %)
2,230,382
(25.45 %)
15,851
(2.18 %)
196 cowpea (IT97K-499-35 v1 2019)
GCF_004118075.1
48,678
(10.56 %)
16,927
(3.30 %)
44,814
(13.06 %)
54,348
(11.30 %)
32.98
(99.48 %)
68
(0.52 %)
682
(100.00 %)
352,238
(4.22 %)
283,949
(8.14 %)
3,092,021
(41.64 %)
24,513
(2.40 %)
197 crab-eating macaque (v1 582-1 2024)
GCF_037993035.1
100,896
(3.93 %)
20,528
(1.79 %)
21,741
(1.19 %)
n/a 41.05
(100.00 %)
n/a 21
(100.00 %)
5,357,498
(52.90 %)
1,017,190
(8.58 %)
15,617,344
(40.74 %)
94,759
(1.56 %)
198 crab-eating macaque WashU 2013 genbank
GCA_000364345.1
76,183
(45.03 %)
20,283
(1.90 %)
20,544
(1.22 %)
n/a 40.90
(95.16 %)
80,474
(4.85 %)
87,763
(95.15 %)
5,351,207
(51.35 %)
941,514
(3.24 %)
15,778,449
(35.74 %)
76,963
(1.14 %)
199 crab-eating macaque WashU 2013 refseq
GCF_000364345.1
76,196
(3.30 %)
20,209
(1.91 %)
51,427
(6.84 %)
n/a 40.90
(95.16 %)
80,474
(4.85 %)
87,764
(95.15 %)
5,251,819
(50.85 %)
941,514
(3.24 %)
15,778,510
(35.74 %)
76,963
(1.14 %)
200 crucian carp (primary hap 2023 genbank)
GCA_963082965.1
90,094
(55.93 %)
29,389
(2.81 %)
88,291
(5.37 %)
n/a 38.31
(99.99 %)
832
(0.01 %)
278
(100.00 %)
3,481,389
(45.81 %)
802,775
(6.54 %)
8,190,816
(44.41 %)
83,696
(3.82 %)
201 crustacean D.carinata (v1 CSIRO-1 2022)
GCF_022539665.1
22,915
(28.69 %)
3,621
(2.94 %)
11,430
(17.96 %)
n/a 40.34
(99.47 %)
2
(0.53 %)
227
(100.00 %)
81,008
(2.67 %)
29,625
(4.98 %)
609,395
(25.66 %)
6,559
(5.05 %)
202 crustacean D.magna (SK Sungkyunkwan U. 2019 genbank)
GCA_003990815.1
n/a 3,519
(2.64 %)
12,174
(17.22 %)
n/a 40.54
(93.29 %)
13,228
(6.75 %)
4,192
(100.00 %)
63,254
(2.07 %)
22,325
(1.44 %)
728,942
(20.81 %)
8,375
(4.98 %)
203 crustacean P.pollicipes (v2 AB1234 2020)
GCF_011947565.2
30,025
(5.21 %)
3,968
(0.39 %)
56,084
(8.02 %)
32,834
(5.48 %)
52.34
(98.93 %)
10,786
(1.08 %)
1,254
(100.00 %)
361,409
(3.23 %)
533,046
(8.92 %)
3,456,307
(19.29 %)
6,722
(54.88 %)
204 dark-edged splitfin (DD_20200921_A 2022 genbank)
GCA_021462225.2
n/a 15,131
(1.68 %)
50,084
(4.18 %)
n/a 40.18
(99.46 %)
409
(0.54 %)
73
(100.00 %)
2,175,293
(47.80 %)
176,956
(1.87 %)
6,142,692
(38.35 %)
32,973
(1.28 %)
205 Daubenton's bat (primary hap 2023 genbank)
GCA_963259705.1
64,558
(45.64 %)
19,142
(1.72 %)
22,139
(1.66 %)
n/a 43.18
(99.99 %)
1,099
(0.01 %)
122
(100.00 %)
3,040,239
(24.03 %)
796,913
(6.38 %)
10,478,261
(38.84 %)
64,921
(2.50 %)
206 degu (3935 2012 genbank)
GCA_000260255.1
48,152
(35.39 %)
22,240
(1.40 %)
22,108
(1.46 %)
n/a 41.38
(84.36 %)
252,770
(15.68 %)
259,903
(84.32 %)
4,890,270
(27.82 %)
898,943
(1.50 %)
14,281,942
(29.30 %)
40,135
(0.82 %)
207 denticle herring (v1 2019)
GCF_900700375.1
59,645
(12.74 %)
16,556
(3.78 %)
37,861
(8.42 %)
72,719
(10.66 %)
43.69
(99.18 %)
464
(0.82 %)
460
(100.00 %)
403,512
(3.23 %)
224,282
(4.61 %)
2,948,671
(28.79 %)
64,661
(9.49 %)
208 diamondback terrapin (hap1 2023 genbank)
GCA_027887155.1
50,318
(52.07 %)
15,109
(1.08 %)
19,281
(1.62 %)
n/a 44.46
(99.92 %)
141
(0.08 %)
76
(100.00 %)
4,088,064
(46.33 %)
403,943
(1.72 %)
11,014,504
(33.74 %)
110,838
(2.71 %)
209 diplomonads (v1 WB C6 WB C6 2008)
GCF_000002435.1
6,502
(71.82 %)
251
(1.29 %)
2,079
(62.62 %)
n/a 49.25
(99.82 %)
242
(0.19 %)
306
(99.81 %)
697
(1.34 %)
335
(0.65 %)
20,634
(5.24 %)
2,275
(23.86 %)
210 dog (BS72 2019 Broad)
GCA_004027395.1
n/a 22,343
(1.53 %)
28,525
(1.27 %)
n/a 41.66
(99.91 %)
10,428
(0.04 %)
667,170
(99.96 %)
5,598,608
(45.38 %)
1,220,686
(2.58 %)
14,079,363
(36.37 %)
62,881
(2.13 %)
211 domestic ferret (Sable ID 1420 FGSC 2011)
GCF_000215625.1
55,980
(3.39 %)
18,440
(1.59 %)
19,474
(1.48 %)
n/a 41.47
(94.51 %)
109,700
(5.51 %)
117,442
(94.49 %)
n/a 606,818
(1.04 %)
13,503,550
(29.63 %)
53,376
(1.90 %)
212 domestic guinea pig (2N 2008 genbank)
GCA_000151735.1
44,762
(33.07 %)
18,297
(1.33 %)
20,107
(1.34 %)
n/a 39.95
(97.81 %)
58,460
(2.20 %)
61,603
(97.80 %)
4,257,412
(38.85 %)
658,532
(1.25 %)
14,547,631
(34.19 %)
37,092
(0.85 %)
213 domestic silkworm (genbank 2020)
GCA_014905235.2
n/a 5,227
(1.28 %)
18,795
(5.67 %)
n/a 38.55
(99.90 %)
30
(0.10 %)
696
(100.00 %)
615,428
(29.26 %)
86,179
(1.65 %)
2,607,325
(47.66 %)
44,022
(10.06 %)
214 domesticated barley (H.vulgare 2021 genbank)
GCA_904849725.1
63,294
(3.74 %)
18,050
(0.43 %)
260,902
(9.04 %)
n/a 44.46
(99.97 %)
162
(0.03 %)
290
(100.00 %)
1,274,894
(2.42 %)
1,726,303
(5.40 %)
14,010,542
(72.58 %)
732,828
(17.24 %)
215 dorado (hap2 2023 genbank)
GCA_030463535.1
n/a 16,799
(2.11 %)
50,411
(4.67 %)
n/a 41.29
(99.15 %)
726
(0.85 %)
104
(100.00 %)
2,693,928
(34.60 %)
805,807
(14.65 %)
5,615,731
(36.69 %)
30,083
(1.31 %)
216 downy mildews (GKB4 2021 genbank)
GCA_018691715.1
n/a 1,641
(1.07 %)
33,976
(44.50 %)
n/a 54.16
(99.69 %)
80
(0.31 %)
133
(100.00 %)
18,997
(0.80 %)
16,094
(2.84 %)
200,994
(27.68 %)
232
(99.71 %)
217 downy woodpecker (bDryPub1 primary hap 2020)
GCA_014839835.1
25,483
(48.39 %)
12,405
(1.70 %)
23,073
(2.18 %)
n/a 45.31
(99.66 %)
187
(0.34 %)
181
(100.00 %)
1,008,118
(21.51 %)
378,537
(3.38 %)
5,846,717
(32.04 %)
26,005
(1.75 %)
218 downy woodpecker (BGI 2014)
GCF_000699005.1
15,850
(2.33 %)
11,864
(1.67 %)
11,795
(1.99 %)
n/a 44.51
(96.31 %)
96,471
(3.72 %)
127,725
(96.28 %)
842,281
(18.63 %)
310,018
(2.09 %)
5,822,687
(27.83 %)
17,379
(0.69 %)
219 E. coli (K-12 BW25113 2014 genbank)
GCA_000750555.1
n/a n/a n/a n/a 50.78
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
n/a 90
(0.38 %)
19,508
(7.44 %)
1
(99.99 %)
220 East African water lily (v1 Beijing-Zhang1983 2019)
GCF_008831285.1
39,088
(10.61 %)
11,569
(2.49 %)
38,114
(15.67 %)
n/a 38.59
(99.98 %)
627
(0.02 %)
1,425
(99.98 %)
230,165
(2.88 %)
153,929
(4.02 %)
2,160,647
(26.81 %)
24,567
(4.41 %)
221 eastern European house mouse (PWK_PhJ v1 2016)
GCA_001624775.1
n/a 21,013
(2.21 %)
18,237
(1.40 %)
101,394
(4.09 %)
41.76
(90.89 %)
904,107
(9.24 %)
30,233
(98.34 %)
5,250,349
(40.55 %)
1,508,787
(2.97 %)
13,823,341
(28.09 %)
16,695
(0.43 %)
222 eastern happy (v2 2018)
GCF_900246225.1
57,628
(9.59 %)
15,348
(2.22 %)
28,518
(6.29 %)
42,170
(8.31 %)
41.07
(99.87 %)
490
(0.13 %)
364
(100.00 %)
527,486
(5.98 %)
217,915
(1.89 %)
4,547,443
(30.78 %)
33,005
(1.88 %)
223 Egyptian rousette (US006 2019 Broad)
GCA_004024865.1
n/a 20,133
(1.87 %)
36,361
(1.80 %)
n/a 40.23
(99.96 %)
4,332
(0.02 %)
226,086
(99.98 %)
2,985,622
(32.66 %)
475,311
(1.11 %)
12,612,081
(27.34 %)
81,930
(5.75 %)
224 Egyptian rousette (v1 2020 genbank)
GCA_014176215.1
65,163
(51.34 %)
17,637
(2.08 %)
22,318
(1.84 %)
n/a 40.05
(98.59 %)
242
(1.41 %)
30
(100.00 %)
2,821,248
(33.05 %)
434,415
(1.02 %)
12,031,652
(26.52 %)
53,604
(6.69 %)
225 electric eel (primary hap 2020 genbank)
GCA_013358815.1
n/a 15,954
(3.67 %)
48,976
(7.25 %)
n/a 42.49
(98.20 %)
227
(1.80 %)
90
(100.00 %)
567,621
(7.41 %)
564,288
(10.86 %)
2,935,361
(24.79 %)
44,501
(3.93 %)
226 elephant shark (2013)
GCF_000165045.1
30,695
(4.95 %)
11,306
(1.54 %)
18,189
(3.03 %)
n/a 42.34
(96.16 %)
46,232
(3.85 %)
67,421
(96.15 %)
1,405,480
(27.29 %)
330,698
(2.60 %)
5,549,534
(36.65 %)
35,561
(2.16 %)
227 emu (v1 ZJU1.0 2020)
GCA_016128335.1
n/a 13,181
(1.74 %)
24,708
(2.10 %)
33,433
(3.99 %)
42.41
(100.00 %)
512
(0.00 %)
802
(100.00 %)
504,527
(4.38 %)
259,276
(2.59 %)
7,105,965
(19.15 %)
41,784
(5.52 %)
228 epaulette shark (2021 genbank)
GCA_020745735.1
43,156
(39.58 %)
12,439
(0.39 %)
19,520
(1.06 %)
n/a 42.76
(98.05 %)
3,716
(1.95 %)
1,963
(100.00 %)
9,211,963
(69.93 %)
935,037
(6.51 %)
20,660,613
(43.88 %)
41,682
(1.08 %)
229 eudicots lettuce (Salinas v7 2020)
GCF_002870075.2
65,115
(2.96 %)
16,271
(0.65 %)
102,071
(6.37 %)
n/a 37.79
(92.44 %)
353,389
(7.60 %)
11,454
(99.71 %)
1,109,875
(4.83 %)
983,866
(3.64 %)
12,335,790
(52.95 %)
117,743
(2.02 %)
230 Euphrates poplar (v1 2014)
GCF_000495115.1
56,539
(12.93 %)
20,844
(4.28 %)
41,664
(12.47 %)
n/a 32.08
(95.31 %)
23,174
(4.71 %)
32,789
(95.29 %)
332,532
(5.23 %)
246,766
(4.06 %)
2,679,673
(43.30 %)
2,781
(0.47 %)
231 Eurasian badger (v3.1 2021)
GCF_922984935.1
57,151
(2.48 %)
19,265
(1.40 %)
22,121
(1.36 %)
n/a 42.48
(100.00 %)
101
(0.00 %)
538
(100.00 %)
4,487,951
(32.73 %)
821,664
(4.02 %)
13,814,723
(38.08 %)
66,524
(3.95 %)
232 Eurasian red squirrel (v1.1 2019)
GCA_902686455.1
n/a 21,298
(1.58 %)
21,024
(1.36 %)
36,645
(1.54 %)
40.08
(94.33 %)
1,177
(5.67 %)
638
(100.00 %)
4,680,964
(35.76 %)
704,218
(1.42 %)
14,991,981
(31.49 %)
48,159
(1.04 %)
233 Eurasian water vole (v1 2020)
GCF_903992535.1
45,658
(2.52 %)
19,724
(1.77 %)
19,069
(1.47 %)
34,561
(2.01 %)
42.15
(99.74 %)
872
(0.26 %)
216
(100.00 %)
4,098,151
(26.75 %)
1,088,237
(2.91 %)
12,853,776
(32.42 %)
19,000
(0.58 %)
234 European conger (primary hap 2023 genbank)
GCA_963514075.1
54,631
(54.17 %)
17,073
(1.89 %)
34,794
(5.07 %)
n/a 43.89
(99.98 %)
1,009
(0.02 %)
394
(100.00 %)
761,527
(5.99 %)
913,328
(13.25 %)
5,768,003
(35.48 %)
120,990
(6.12 %)
235 European eel (primary hap 2020 genbank)
GCA_013347855.1
n/a 17,048
(2.22 %)
34,271
(5.56 %)
n/a 43.64
(99.61 %)
640
(0.40 %)
53
(100.00 %)
831,037
(5.48 %)
786,520
(8.15 %)
5,700,818
(27.40 %)
130,345
(8.19 %)
236 European mink (primary hap 2023 genbank)
GCA_030435805.1
69,556
(45.15 %)
18,706
(1.46 %)
21,193
(1.37 %)
n/a 41.85
(100.00 %)
39
(0.00 %)
26
(100.00 %)
4,237,797
(30.90 %)
792,898
(2.69 %)
13,417,248
(36.59 %)
67,133
(2.54 %)
237 European peacock (2021 genbank)
GCA_905147045.1
22,557
(62.12 %)
4,716
(1.16 %)
12,599
(4.34 %)
26,251
(7.81 %)
33.70
(100.00 %)
10
(0.00 %)
42
(100.00 %)
212,528
(2.58 %)
60,682
(1.18 %)
3,127,157
(46.89 %)
24,620
(4.88 %)
238 European plaice (primary hap 2022 genbank)
GCA_947347685.1
46,467
(52.27 %)
14,820
(2.71 %)
51,453
(7.41 %)
n/a 42.51
(99.97 %)
1,072
(0.03 %)
356
(100.00 %)
476,317
(3.63 %)
520,730
(13.27 %)
3,283,400
(33.55 %)
47,051
(4.45 %)
239 European snow vole (primary hap 2023 genbank)
GCA_950005125.1
47,025
(39.90 %)
20,576
(1.75 %)
21,171
(1.56 %)
n/a 41.98
(100.00 %)
197
(0.00 %)
161
(100.00 %)
3,580,811
(22.71 %)
998,537
(5.14 %)
12,204,125
(34.97 %)
20,725
(0.63 %)
240 European turtle dove (v1.1 alternate hap 2019)
GCA_901699165.1
n/a 11,276
(1.79 %)
21,238
(2.15 %)
n/a 41.73
(100.00 %)
n/a 3,333
(100.00 %)
466,567
(7.08 %)
182,345
(0.97 %)
6,037,183
(20.24 %)
29,648
(2.35 %)
241 European turtle dove (v1.1 primary hap 2019)
GCA_901699155.1
n/a 12,415
(1.77 %)
23,484
(2.17 %)
n/a 41.84
(99.67 %)
894
(0.33 %)
357
(100.00 %)
539,737
(7.60 %)
227,500
(1.16 %)
6,768,805
(21.05 %)
34,729
(2.65 %)
242 European woodmouse (2022 genbank)
GCA_947179515.1
54,113
(34.13 %)
19,960
(1.65 %)
19,954
(1.25 %)
n/a 41.23
(99.99 %)
1,129
(0.01 %)
498
(100.00 %)
4,863,656
(37.41 %)
1,795,997
(8.95 %)
13,681,786
(40.58 %)
23,961
(0.53 %)
243 fall armyworm (Faw-zju 2020 genbank)
GCA_011064685.1
32,738
(63.63 %)
5,744
(1.12 %)
26,631
(7.08 %)
n/a 36.43
(99.99 %)
525
(0.01 %)
91
(100.00 %)
168,479
(1.60 %)
72,876
(1.70 %)
3,384,083
(37.35 %)
30,753
(4.27 %)
244 fall armyworm (Faw-zju v1.0 refseq 2020)
GCF_011064685.1
32,751
(9.65 %)
5,744
(1.12 %)
26,632
(7.08 %)
n/a 36.43
(99.99 %)
525
(0.01 %)
92
(100.00 %)
169,122
(1.61 %)
72,892
(1.70 %)
3,384,365
(37.36 %)
30,753
(4.27 %)
245 fire-bellied toad (primary hap 2023 genbank)
GCA_027579735.1
n/a 15,456
(0.21 %)
47,501
(0.88 %)
n/a 38.98
(98.02 %)
7,009
(1.99 %)
2,468
(100.00 %)
20,643,710
(70.75 %)
7,150,262
(12.27 %)
9,477
(98.01 %)
365,066
(1.20 %)
246 fission yeast (v1 972h- 2007 refseq)
GCF_000002945.1
12,393
(87.51 %)
5,085
(73.29 %)
3,403
(39.29 %)
n/a 36.05
(100.00 %)
6
(0.00 %)
4
(100.00 %)
3,336
(2.63 %)
1,034
(0.58 %)
80,458
(16.22 %)
105
(0.31 %)
247 fission yeast (v2 972h- 2019 genbank)
GCA_000002945.3
n/a 5,084
(73.46 %)
3,394
(39.28 %)
n/a 36.06
(100.00 %)
6
(0.00 %)
9
(100.00 %)
3,053
(1.03 %)
1,034
(0.58 %)
79,714
(16.06 %)
105
(0.31 %)
248 flatback sea turtle (hap1 2025 genbank)
GCA_965152275.1
n/a 15,046
(1.09 %)
18,089
(1.57 %)
n/a 44.23
(100.00 %)
171
(0.00 %)
43
(100.00 %)
4,516,775
(43.62 %)
319,645
(1.38 %)
10,785,223
(32.95 %)
52,168
(1.81 %)
249 flatworm S.haematobium (v2 2020)
GCF_000699445.2
8,934
(5.16 %)
1,548
(0.29 %)
4,070
(2.36 %)
8,934
(5.16 %)
34.53
(99.76 %)
15,128
(0.26 %)
666
(100.00 %)
124,259
(1.58 %)
35,312
(1.17 %)
2,638,150
(34.10 %)
3,957
(0.38 %)
250 flier cichlid (MPI-CPG 2019 genbank)
GCA_007364275.2
n/a 15,436
(2.15 %)
26,448
(5.90 %)
64,657
(6.60 %)
41.23
(98.19 %)
744
(1.81 %)
189
(100.00 %)
1,014,141
(16.95 %)
287,037
(2.21 %)
5,305,987
(30.67 %)
24,130
(1.26 %)
251 Florida manatee (Lorelei 2012 genbank)
GCA_000243295.1
39,651
(35.92 %)
18,302
(1.36 %)
20,592
(1.23 %)
32,831
(1.38 %)
40.73
(89.24 %)
160,167
(10.78 %)
166,489
(89.22 %)
5,109,822
(37.03 %)
389,314
(0.74 %)
14,633,007
(38.46 %)
27,461
(0.64 %)
252 fly D.albomicans (v1 15112-1751.03 2019)
GCF_009650485.1
24,196
(18.66 %)
10,065
(8.48 %)
14,473
(13.61 %)
n/a 38.15
(100.00 %)
7
(0.00 %)
11
(100.00 %)
298,709
(14.86 %)
80,048
(3.56 %)
1,317,733
(33.56 %)
18,849
(8.62 %)
253 fly D.santomea (v1.0 2021)
GCF_016746245.1
25,550
(21.64 %)
13,354
(17.52 %)
20,540
(17.87 %)
n/a 42.61
(100.00 %)
14
(0.00 %)
104
(100.00 %)
169,365
(23.08 %)
64,316
(3.47 %)
791,743
(23.14 %)
27,794
(16.15 %)
254 fly D.sechellia (sech25 v1 2019 UC Irvine)
GCF_004382195.1
26,658
(22.06 %)
13,461
(17.65 %)
21,781
(17.83 %)
n/a 42.26
(100.00 %)
38
(0.00 %)
402
(100.00 %)
145,818
(25.16 %)
34,869
(4.31 %)
719,811
(25.74 %)
30,130
(16.11 %)
255 fly D.serrata (v1.0 Fors4 2017)
GCF_002093755.1
21,759
(15.21 %)
12,488
(9.92 %)
21,269
(14.06 %)
n/a 39.11
(100.00 %)
n/a 1,356
(100.00 %)
314,594
(25.90 %)
82,446
(12.33 %)
1,113,448
(37.00 %)
27,493
(12.03 %)
256 fly D.simulans (w501 v3.0 2021)
GCF_016746395.1
28,582
(26.45 %)
13,448
(20.44 %)
18,989
(18.34 %)
n/a 42.47
(100.00 %)
2
(0.00 %)
96
(100.00 %)
126,424
(16.72 %)
32,595
(4.31 %)
759,296
(23.70 %)
27,530
(17.02 %)
257 fly D.yakuba (2018)
GCF_000005975.2
5,431
(4.09 %)
13,713
(15.95 %)
22,613
(16.71 %)
n/a 42.28
(98.12 %)
5,400
(1.88 %)
13,440
(98.12 %)
180,908
(22.48 %)
68,911
(3.75 %)
897,353
(23.94 %)
31,387
(14.91 %)
258 fly D.yakuba (v1 2021)
GCF_016746365.1
27,925
(24.59 %)
13,343
(17.86 %)
20,029
(17.64 %)
n/a 42.55
(100.00 %)
11
(0.00 %)
54
(100.00 %)
169,559
(23.47 %)
60,591
(3.64 %)
837,616
(23.40 %)
28,204
(16.22 %)
259 Gaboon caecilian (v1.1 2019 genbank)
GCA_902459505.1
54,713
(61.19 %)
14,267
(0.51 %)
29,026
(1.40 %)
n/a 43.24
(99.85 %)
433
(0.15 %)
163
(100.00 %)
1,311,113
(1.64 %)
1,364,596
(3.83 %)
19,589,738
(52.85 %)
270,923
(4.52 %)
260 Gaboon caecilian (v1.1 2019 refseq)
GCF_902459505.1
54,726
(1.72 %)
14,269
(0.51 %)
29,026
(1.40 %)
n/a 43.24
(99.85 %)
433
(0.15 %)
164
(100.00 %)
1,310,970
(1.64 %)
1,364,597
(3.83 %)
19,589,802
(52.85 %)
270,923
(4.52 %)
261 giant manta (hap1 2023 genbank)
GCA_030028105.1
n/a 12,432
(0.38 %)
24,821
(1.16 %)
n/a 43.26
(99.23 %)
1,810
(0.77 %)
4,715
(100.00 %)
7,913,208
(49.68 %)
969,352
(14.22 %)
20,235,210
(54.42 %)
110,678
(1.74 %)
262 giant panda (2009 BGI)
GCF_000004335.2
40,432
(2.55 %)
18,884
(1.76 %)
18,919
(1.46 %)
n/a 41.60
(97.66 %)
119,126
(2.36 %)
200,593
(97.64 %)
4,236,423
(40.48 %)
503,179
(1.10 %)
13,781,487
(28.85 %)
53,465
(1.34 %)
263 giant panda (Jingjing v1 2017)
GCA_002007445.1
n/a 20,110
(1.71 %)
22,288
(1.49 %)
n/a 41.69
(98.08 %)
186,846
(1.93 %)
244,258
(98.07 %)
4,464,041
(41.66 %)
614,896
(2.00 %)
14,294,774
(30.62 %)
59,340
(1.50 %)
264 giant panda (Jingjing v2 genbank 2020)
GCA_002007445.2
n/a 20,381
(1.71 %)
21,979
(1.44 %)
43,086
(2.00 %)
41.69
(98.09 %)
190,364
(1.92 %)
77,287
(100.00 %)
4,484,597
(41.53 %)
618,595
(2.00 %)
14,236,406
(30.39 %)
59,945
(1.50 %)
265 giant panda (Jingjing v2 refseq 2020)
GCF_002007445.1
67,162
(3.32 %)
20,374
(1.71 %)
21,965
(1.44 %)
43,086
(2.00 %)
41.69
(98.09 %)
190,364
(1.92 %)
77,288
(100.00 %)
4,476,689
(41.47 %)
618,596
(2.00 %)
14,236,463
(30.39 %)
59,946
(1.50 %)
266 gilthead seabream (v1 2019)
GCF_900880675.1
59,040
(10.97 %)
15,412
(2.36 %)
31,802
(6.47 %)
73,197
(7.97 %)
41.94
(99.96 %)
1,050
(0.04 %)
176
(100.00 %)
531,360
(3.04 %)
305,809
(3.03 %)
4,701,694
(25.69 %)
47,327
(2.41 %)
267 Glanville fritillary (genbank 2021)
GCA_905220565.1
17,520
(43.15 %)
4,738
(0.89 %)
16,197
(5.05 %)
35,235
(7.97 %)
34.09
(100.00 %)
80
(0.01 %)
32
(100.00 %)
343,193
(3.25 %)
144,286
(3.46 %)
3,683,956
(48.60 %)
30,200
(4.54 %)
268 globe artichoke (v1 2C 2018)
GCF_001531365.1
42,119
(6.72 %)
15,804
(2.23 %)
49,721
(11.10 %)
n/a 35.35
(90.31 %)
310,473
(9.77 %)
13,588
(99.93 %)
394,687
(2.79 %)
364,361
(3.37 %)
4,191,676
(39.48 %)
12,198
(0.64 %)
269 goat (v1 San Clemente 2016 USDA genbank)
GCA_001704415.1
0
(0.00 %)
19,842
(1.43 %)
22,426
(1.24 %)
52,608
(1.64 %)
43.16
(100.00 %)
790
(0.00 %)
29,906
(100.00 %)
5,669,868
(50.59 %)
760,836
(7.07 %)
13,024,386
(44.85 %)
125,682
(4.01 %)
270 goat (v1 San Clemente 2016 USDA refseq)
GCF_001704415.1
47,206
(2.31 %)
19,859
(1.44 %)
22,429
(1.24 %)
n/a 43.16
(100.00 %)
790
(0.00 %)
29,907
(100.00 %)
5,670,600
(50.59 %)
760,837
(7.07 %)
13,024,197
(44.85 %)
125,682
(4.01 %)
271 golden eagle (v1.2 2019)
GCF_900496995.1
55,164
(5.86 %)
13,226
(1.87 %)
23,033
(2.15 %)
25,921
(3.22 %)
42.11
(99.61 %)
191
(0.39 %)
142
(100.00 %)
519,341
(5.86 %)
180,990
(0.79 %)
7,005,531
(19.25 %)
37,343
(3.12 %)
272 golden eagle (v1.2 alternate hap 2019)
GCA_902153765.1
n/a 9,334
(1.82 %)
17,594
(2.12 %)
n/a 42.53
(99.93 %)
39
(0.07 %)
3,860
(100.00 %)
356,284
(6.03 %)
123,430
(0.80 %)
4,417,887
(19.25 %)
28,919
(3.52 %)
273 golden hamster (Baylor 2013 genbank)
GCA_000349665.1
0
(0.00 %)
18,965
(1.82 %)
19,339
(1.52 %)
n/a 42.01
(82.92 %)
216,216
(17.12 %)
237,699
(82.88 %)
3,724,142
(27.19 %)
790,256
(1.69 %)
12,003,866
(24.29 %)
18,591
(0.51 %)
274 golden snub-nosed monkey (2014 Novogene)
GCA_000769185.1
n/a 21,341
(1.86 %)
22,492
(1.24 %)
n/a 40.87
(98.50 %)
61,291
(1.50 %)
196,804
(98.50 %)
5,673,299
(51.36 %)
1,080,627
(3.06 %)
16,205,827
(36.77 %)
79,387
(1.14 %)
275 gopher snake (HBS135680 alternate hap 2023 genbank)
GCA_029215685.1
n/a 12,291
(1.06 %)
19,125
(2.02 %)
n/a 40.55
(100.00 %)
584
(0.00 %)
1,233
(100.00 %)
1,259,781
(7.92 %)
925,571
(7.56 %)
7,739,320
(45.92 %)
73,681
(2.81 %)
276 grape phylloxera (Bord-2020 2022 genbank)
GCA_025091365.1
n/a 2,982
(0.90 %)
5,710
(2.77 %)
n/a 27.24
(97.73 %)
41,970
(2.29 %)
8,544
(100.00 %)
195,538
(3.32 %)
65,664
(2.79 %)
2,529,566
(54.06 %)
4,357
(1.18 %)
277 gray mouse lemur genbank
GCA_000165445.3
n/a 20,031
(1.89 %)
22,619
(1.50 %)
n/a 40.98
(95.94 %)
43,363
(4.06 %)
50,982
(95.94 %)
4,082,873
(41.60 %)
582,430
(1.47 %)
14,808,558
(30.05 %)
74,772
(2.61 %)
278 gray short-tailed opossum (mMonDom1 primary hap 2023 genbank)
GCA_027887165.1
73,383
(42.66 %)
16,638
(0.72 %)
16,171
(0.86 %)
n/a 37.92
(99.11 %)
2,255
(0.89 %)
14
(100.00 %)
5,562,366
(25.40 %)
1,096,625
(2.60 %)
22,322,798
(43.37 %)
28,894
(0.57 %)
279 great fruit-eating bat (v1 hap1 2024)
GCA_038363095.1
n/a 18,022
(1.56 %)
20,018
(1.52 %)
n/a 42.28
(100.00 %)
81
(0.00 %)
419
(100.00 %)
2,827,417
(26.82 %)
371,479
(4.97 %)
11,603,093
(34.64 %)
71,574
(2.28 %)
280 great roundleaf bat (v1 ML-2016 2016 genbank)
GCA_001890085.1
50,937
(43.78 %)
19,011
(2.00 %)
19,882
(1.66 %)
41,741
(2.41 %)
41.11
(87.42 %)
172,751
(12.60 %)
7,570
(100.00 %)
3,078,210
(32.07 %)
495,290
(1.05 %)
11,588,202
(25.43 %)
33,101
(0.97 %)
281 great roundleaf bat (v1 ML-2016 2016 refseq)
GCF_001890085.1
50,950
(3.26 %)
18,992
(2.00 %)
19,880
(1.66 %)
41,778
(2.41 %)
41.11
(87.42 %)
172,751
(12.60 %)
7,571
(100.00 %)
3,285,971
(33.14 %)
495,292
(1.05 %)
11,588,248
(25.43 %)
33,101
(0.97 %)
282 greater horseshoe bat (mRhiFer1 2020)
GCA_014108255.1
n/a 18,531
(1.97 %)
20,309
(1.67 %)
n/a 40.52
(99.19 %)
292
(0.81 %)
50
(100.00 %)
3,284,473
(35.00 %)
559,653
(1.29 %)
12,043,562
(29.15 %)
32,047
(1.05 %)
283 greater horseshoe bat (v1 MPI-CBG 2019 genbank)
GCA_004115265.2
53,353
(46.77 %)
18,647
(1.97 %)
20,359
(1.68 %)
n/a 40.54
(99.64 %)
158
(0.36 %)
135
(100.00 %)
3,301,020
(34.99 %)
564,790
(1.35 %)
12,217,069
(29.39 %)
32,445
(1.06 %)
284 greater horseshoe bat (v1 MPI-CBG 2019 refseq)
GCF_004115265.1
53,352
(3.13 %)
18,647
(1.97 %)
20,359
(1.68 %)
n/a 40.54
(99.64 %)
158
(0.36 %)
134
(100.00 %)
3,300,836
(34.99 %)
564,789
(1.35 %)
12,217,020
(29.39 %)
32,445
(1.06 %)
285 greater mouse-eared bat (2019 Broad)
GCA_004026985.1
n/a 23,153
(1.31 %)
51,642
(1.43 %)
n/a 43.16
(99.88 %)
8,133
(0.04 %)
1,053,330
(99.96 %)
3,675,075
(25.48 %)
938,700
(2.73 %)
12,027,923
(39.01 %)
80,955
(2.31 %)
286 greater pipefish (v1.1 2019)
GCA_901709675.1
n/a 13,467
(5.26 %)
42,380
(12.01 %)
n/a 43.46
(100.00 %)
43
(0.00 %)
87
(100.00 %)
193,442
(3.05 %)
125,716
(4.25 %)
1,676,004
(25.93 %)
46,340
(13.40 %)
287 greater sac-winged bat (primary hap 2024 genbank)
GCA_036850765.1
n/a 18,322
(1.40 %)
21,049
(1.35 %)
n/a 41.71
(98.73 %)
468
(1.27 %)
359
(99.59 %)
4,247,148
(29.53 %)
1,031,385
(2.50 %)
12,465,194
(43.30 %)
101,620
(2.01 %)
288 greater wax moth (Carbio01_MB 2019 genbank)
GCA_003640425.2
20,814
(51.89 %)
4,346
(0.99 %)
12,930
(3.50 %)
21,226
(7.60 %)
33.06
(99.10 %)
27,314
(0.92 %)
13,303
(100.00 %)
270,925
(3.18 %)
86,050
(1.20 %)
3,416,162
(48.29 %)
11,043
(1.07 %)
289 green algae C.reinhardtii (v1 CC-503 cw92 v1 2007)
GCF_000002595.1
14,410
(22.17 %)
987
(0.55 %)
11,299
(59.37 %)
n/a 63.87
(87.58 %)
10,425
(12.45 %)
11,385
(87.55 %)
167,652
(16.23 %)
100,391
(4.60 %)
734,057
(30.38 %)
3,154
(63.45 %)
290 green algae C.reinhardtii (v2 CC-503 cw92 mt+ 2018 genbank)
GCA_000002595.3
n/a 988
(0.56 %)
9,689
(59.71 %)
n/a 64.08
(96.36 %)
1,459
(3.65 %)
1,512
(96.35 %)
171,684
(17.03 %)
110,553
(6.12 %)
748,240
(34.06 %)
106
(99.48 %)
291 green algae C.variabilis (NC64A 2010 genbank)
GCA_000147415.1
9,780
(62.01 %)
743
(1.01 %)
4,520
(67.55 %)
n/a 67.14
(91.48 %)
3,543
(8.55 %)
3,810
(91.45 %)
65,787
(8.35 %)
28,736
(2.86 %)
416,740
(37.15 %)
776
(95.90 %)
292 green monkey 1994-021 (2014 genbank)
GCA_000409795.2
76,037
(46.89 %)
20,079
(1.94 %)
20,246
(1.25 %)
n/a 40.81
(98.67 %)
178,925
(1.35 %)
163,017
(98.65 %)
5,382,039
(50.20 %)
980,479
(2.63 %)
16,076,172
(35.62 %)
50,033
(1.04 %)
293 green sea turtle (BGI 2013)
GCF_000344595.1
31,773
(2.57 %)
14,548
(1.02 %)
15,297
(1.46 %)
n/a 43.49
(95.57 %)
134,344
(4.44 %)
274,367
(95.56 %)
1,615,553
(13.87 %)
317,600
(2.08 %)
11,732,990
(28.32 %)
36,782
(0.70 %)
294 green sea turtle (v1 2020)
GCF_015237465.1
56,904
(3.63 %)
14,729
(1.06 %)
17,439
(1.56 %)
n/a 44.01
(99.44 %)
294
(0.56 %)
99
(100.00 %)
1,641,730
(15.08 %)
304,356
(1.25 %)
11,136,918
(31.96 %)
49,035
(1.44 %)
295 harbor porpoise (BS71 2019)
GCA_004363495.1
n/a 21,044
(1.46 %)
30,072
(1.23 %)
n/a 41.83
(99.88 %)
7,114
(0.03 %)
1,338,272
(99.97 %)
5,359,537
(46.83 %)
772,736
(1.54 %)
13,705,428
(42.29 %)
80,965
(1.65 %)
296 Harpy eagle (primary hap 2022 genbank)
GCA_026419915.1
51,641
(50.37 %)
13,412
(1.70 %)
24,002
(2.05 %)
n/a 43.39
(99.80 %)
342
(0.20 %)
322
(100.00 %)
456,476
(3.62 %)
260,495
(7.70 %)
5,658,773
(24.81 %)
60,606
(5.66 %)
297 Hawaiian crow (2021 genbank)
GCA_020740725.1
51,593
(54.67 %)
12,737
(1.83 %)
23,664
(2.30 %)
n/a 43.30
(99.84 %)
294
(0.16 %)
187
(100.00 %)
502,844
(6.10 %)
304,680
(5.73 %)
5,953,316
(23.59 %)
46,108
(3.49 %)
298 Hawaiian monk seal (2017 Johns Hopkins U genbank)
GCA_002201575.1
0
(0.00 %)
19,385
(1.74 %)
20,265
(1.41 %)
33,375
(1.66 %)
41.41
(97.77 %)
38,833
(2.24 %)
7,871
(100.00 %)
4,629,031
(43.70 %)
573,328
(1.09 %)
13,374,887
(33.10 %)
50,379
(1.45 %)
299 Hawaiian monk seal (2017 Johns Hopkins U refseq)
GCF_002201575.1
29,897
(1.95 %)
19,380
(1.75 %)
20,272
(1.41 %)
n/a 41.41
(97.77 %)
38,833
(2.24 %)
7,872
(100.00 %)
4,629,766
(43.70 %)
573,335
(1.09 %)
13,369,616
(33.10 %)
50,380
(1.45 %)
300 hemichordates Saccoglossus HW-2024a (v1 hap1 2024)
GCA_040954625.1
n/a 4,944
(1.30 %)
35,031
(15.53 %)
n/a 39.72
(99.96 %)
254
(0.04 %)
77
(100.00 %)
87,841
(1.67 %)
119,697
(13.20 %)
1,309,907
(29.40 %)
21,623
(4.17 %)
301 hemichordates Saccoglossus HW-2024a (v1 hap2 2024)
GCA_040954595.1
n/a 4,919
(1.33 %)
34,873
(16.02 %)
n/a 39.72
(99.96 %)
254
(0.04 %)
56
(100.00 %)
84,495
(1.58 %)
118,073
(13.23 %)
1,301,514
(28.77 %)
20,511
(4.03 %)
302 hippopotamus (v2 hap2 2023 genbank)
GCA_030028045.1
64,153
(41.00 %)
20,337
(1.62 %)
20,633
(1.37 %)
n/a 41.60
(100.00 %)
226
(0.00 %)
356
(100.00 %)
3,783,435
(35.17 %)
567,796
(3.38 %)
13,462,481
(35.48 %)
48,365
(1.91 %)
303 Honduran yellow-shouldered bat (v2.0 Veracruz 20B 2020)
GCF_014824575.1
49,894
(2.81 %)
18,317
(1.66 %)
19,991
(1.63 %)
n/a 42.33
(99.79 %)
38,823
(0.21 %)
27,486
(100.00 %)
2,844,834
(29.10 %)
367,443
(1.49 %)
11,805,151
(31.26 %)
59,262
(1.70 %)
304 honeybee mite (v1 2017)
GCF_002443255.1
35,641
(12.86 %)
2,741
(0.61 %)
28,868
(8.05 %)
n/a 40.92
(99.93 %)
3,073
(0.07 %)
1,426
(100.00 %)
117,879
(1.26 %)
43,685
(1.30 %)
1,858,762
(15.09 %)
31,400
(5.04 %)
305 hooded crow (v2 S_Up_H32 2017)
GCF_000738735.2
35,874
(6.47 %)
11,298
(1.84 %)
17,627
(2.12 %)
n/a 41.48
(97.07 %)
27,795
(2.94 %)
113
(100.00 %)
392,199
(5.95 %)
139,126
(0.76 %)
6,141,002
(18.21 %)
12,943
(0.48 %)
306 hooded crow (v5 S_Up_H32 2021)
GCF_000738735.5
42,799
(6.57 %)
11,845
(1.92 %)
20,738
(2.23 %)
n/a 42.10
(99.68 %)
425
(0.32 %)
47
(100.00 %)
421,463
(6.12 %)
164,830
(0.93 %)
6,148,741
(19.00 %)
25,266
(2.09 %)
307 horse (Twilight 2007 genbank)
GCA_000002305.1
n/a 18,575
(1.67 %)
17,121
(1.34 %)
n/a 41.50
(98.14 %)
45,680
(1.86 %)
55,316
(98.14 %)
3,941,878
(45.17 %)
381,229
(1.99 %)
14,674,265
(29.80 %)
45,521
(1.52 %)
308 hourglass treefrog (paternal 2023 genbank)
GCA_027789765.1
n/a 14,058
(0.89 %)
31,050
(2.69 %)
n/a 43.97
(99.70 %)
804
(0.30 %)
2,200
(100.00 %)
906,816
(2.43 %)
1,710,859
(17.48 %)
10,069,798
(51.41 %)
235,277
(5.56 %)
309 house finch (primary hap 2022 genbank)
GCA_027477595.1
43,228
(49.63 %)
12,700
(1.83 %)
24,567
(2.38 %)
n/a 42.91
(99.02 %)
295
(0.98 %)
183
(100.00 %)
440,379
(3.17 %)
463,164
(6.37 %)
6,300,100
(23.47 %)
30,897
(2.53 %)
310 house fly (aabys 2013 genbank)
GCA_000371365.1
n/a 7,825
(1.36 %)
12,819
(3.07 %)
n/a 35.11
(92.22 %)
102,610
(7.82 %)
104,053
(92.18 %)
415,874
(2.30 %)
376,409
(8.80 %)
4,931,104
(52.61 %)
7,139
(0.35 %)
311 house mouse (AKR_J v1 2016)
GCA_001624295.1
n/a 21,299
(2.19 %)
18,730
(1.41 %)
102,168
(4.09 %)
41.70
(86.82 %)
314,064
(13.22 %)
40,550
(96.00 %)
5,186,721
(40.97 %)
1,485,719
(3.05 %)
13,610,761
(27.42 %)
16,745
(0.41 %)
312 house mouse (A_J v1 2016)
GCA_001624215.1
n/a 21,171
(2.20 %)
18,776
(1.40 %)
102,254
(4.12 %)
41.70
(89.34 %)
365,877
(10.71 %)
33,692
(96.01 %)
5,186,523
(40.90 %)
1,483,826
(3.06 %)
13,614,266
(28.13 %)
16,590
(0.42 %)
313 house mouse (BALB_cJ v1 2016)
GCA_001632525.1
n/a 21,337
(2.21 %)
18,682
(1.41 %)
102,138
(4.14 %)
41.74
(88.91 %)
361,689
(11.14 %)
37,453
(95.84 %)
5,096,953
(40.72 %)
1,407,754
(2.90 %)
13,416,041
(27.66 %)
16,788
(0.42 %)
314 house mouse (C3H_HeJ v1 2016)
GCA_001632575.1
n/a 21,177
(2.22 %)
18,550
(1.42 %)
101,710
(4.15 %)
41.74
(85.90 %)
369,499
(14.15 %)
37,497
(95.91 %)
5,089,496
(40.41 %)
1,399,438
(2.72 %)
13,485,480
(26.52 %)
16,675
(0.41 %)
315 house mouse (CBA_J v1 2016)
GCA_001624475.1
n/a 21,259
(2.23 %)
18,593
(1.42 %)
101,632
(4.14 %)
41.78
(79.43 %)
410,639
(20.63 %)
42,242
(96.14 %)
5,081,543
(40.40 %)
1,393,763
(2.54 %)
13,472,532
(24.46 %)
16,809
(0.38 %)
316 house mouse (DBA_2J v1 2016)
GCA_001624505.1
n/a 21,156
(2.23 %)
18,610
(1.43 %)
101,908
(4.18 %)
41.80
(88.67 %)
409,306
(11.39 %)
42,324
(95.14 %)
5,028,217
(40.37 %)
1,364,702
(2.73 %)
13,540,805
(27.33 %)
16,544
(0.42 %)
317 house mouse (FVB_NJ v1 2016)
GCA_001624535.1
n/a 21,195
(2.22 %)
18,615
(1.42 %)
101,520
(4.15 %)
41.75
(89.39 %)
380,840
(10.66 %)
67,805
(93.73 %)
5,037,447
(40.28 %)
1,381,859
(2.89 %)
13,440,164
(27.32 %)
16,625
(0.42 %)
318 house mouse (GRCm38.p6 2017)
GCF_000001635.26
123,654
(4.49 %)
24,134
(2.09 %)
22,855
(1.67 %)
n/a 41.73
(97.18 %)
904
(2.82 %)
21,179
(97.18 %)
5,554,281
(45.50 %)
1,695,255
(3.40 %)
13,041,229
(35.91 %)
25,014
(0.54 %)
319 house mouse (LP_J v1 2016)
GCA_001632615.1
n/a 21,012
(2.23 %)
18,555
(1.43 %)
101,892
(4.18 %)
41.78
(84.14 %)
402,247
(15.91 %)
38,542
(95.89 %)
5,032,748
(40.03 %)
1,373,374
(2.60 %)
13,411,126
(25.61 %)
16,668
(0.40 %)
320 house mouse (NOD_ShiLtJ v1 2016)
GCA_001624675.1
n/a 21,291
(2.24 %)
19,697
(1.47 %)
101,562
(4.18 %)
42.00
(77.13 %)
595,433
(22.95 %)
66,154
(95.79 %)
5,059,815
(40.57 %)
1,370,443
(2.51 %)
13,251,532
(23.62 %)
18,188
(0.42 %)
321 house mouse (NZO_HlLtJ v1 2016)
GCA_001624745.1
n/a 21,233
(2.22 %)
18,805
(1.43 %)
103,134
(4.18 %)
41.74
(86.47 %)
337,909
(13.58 %)
57,439
(95.37 %)
5,112,301
(40.60 %)
1,418,629
(2.92 %)
13,588,055
(27.01 %)
16,857
(0.41 %)
322 human (HG00438.mat 2021)
GCA_018471515.1
n/a 20,788
(1.85 %)
22,424
(1.25 %)
233,427
(57.20 %)
40.83
(100.00 %)
n/a 258
(100.00 %)
5,426,471
(53.12 %)
1,085,458
(7.66 %)
16,023,596
(40.44 %)
52,702
(1.17 %)
323 human (HG00438.pat 2021)
GCA_018472595.1
n/a 20,627
(1.85 %)
22,176
(1.24 %)
233,698
(4.96 %)
40.82
(100.00 %)
1
(0.00 %)
276
(100.00 %)
5,419,334
(52.97 %)
1,071,302
(7.38 %)
15,894,505
(40.10 %)
52,377
(1.20 %)
324 human (HG00621.mat 2021)
GCA_018472605.1
n/a 20,611
(1.85 %)
22,275
(1.25 %)
233,258
(4.96 %)
40.86
(100.00 %)
n/a 253
(100.00 %)
5,392,161
(53.03 %)
1,048,372
(7.50 %)
15,960,374
(40.31 %)
52,502
(1.20 %)
325 human (HG00621.pat 2021)
GCA_018472575.1
n/a 19,907
(1.86 %)
21,558
(1.26 %)
227,172
(5.00 %)
40.88
(100.00 %)
n/a 287
(100.00 %)
5,174,496
(52.83 %)
1,030,071
(7.85 %)
15,147,153
(40.18 %)
50,988
(1.20 %)
326 human (HG00673.mat 2021)
GCA_018472565.1
n/a 20,805
(1.84 %)
22,193
(1.24 %)
233,975
(4.93 %)
40.84
(100.00 %)
n/a 348
(100.00 %)
5,408,639
(53.33 %)
1,056,398
(8.05 %)
16,117,475
(40.76 %)
52,411
(1.14 %)
327 human (HG00673.pat 2021)
GCA_018472585.1
n/a 19,963
(1.85 %)
21,514
(1.25 %)
227,480
(4.97 %)
40.84
(100.00 %)
2
(0.00 %)
420
(100.00 %)
5,185,516
(53.08 %)
1,065,657
(8.25 %)
15,183,778
(40.61 %)
50,883
(1.20 %)
328 human (HG00733 mat 2021)
GCA_018506975.1
n/a 20,626
(1.85 %)
22,511
(1.25 %)
233,295
(4.96 %)
40.87
(100.00 %)
1
(0.00 %)
609
(100.00 %)
5,412,701
(52.97 %)
1,052,600
(7.34 %)
15,895,725
(40.14 %)
53,216
(1.22 %)
329 human (HG00733 pat 2021)
GCA_018506955.1
n/a 20,749
(1.85 %)
22,251
(1.24 %)
233,792
(4.94 %)
40.83
(100.00 %)
1
(0.00 %)
695
(100.00 %)
5,420,299
(53.15 %)
1,076,604
(7.72 %)
15,964,663
(40.46 %)
53,315
(1.19 %)
330 human (HG00735.mat 2021)
GCA_018472765.1
n/a 20,674
(1.84 %)
22,283
(1.25 %)
233,363
(4.94 %)
40.80
(100.00 %)
1
(0.00 %)
244
(100.00 %)
5,406,821
(53.15 %)
1,060,553
(7.74 %)
16,051,646
(40.51 %)
52,343
(1.14 %)
331 human (HG00735.pat 2021)
GCA_018472715.1
n/a 20,688
(1.84 %)
22,080
(1.23 %)
233,237
(4.95 %)
40.80
(100.00 %)
1
(0.00 %)
299
(100.00 %)
5,391,900
(53.13 %)
1,050,251
(7.66 %)
16,052,188
(40.43 %)
52,436
(1.14 %)
332 human (HG00741.mat 2021)
GCA_018471095.1
n/a 20,654
(1.85 %)
22,309
(1.25 %)
233,294
(4.94 %)
40.83
(100.00 %)
n/a 297
(100.00 %)
5,410,814
(53.14 %)
1,059,472
(7.72 %)
16,043,406
(40.45 %)
52,535
(1.14 %)
333 human (HG00741.pat 2021)
GCA_018471105.1
n/a 20,657
(1.85 %)
22,458
(1.25 %)
233,356
(4.95 %)
40.86
(100.00 %)
1
(0.00 %)
289
(100.00 %)
5,397,570
(53.08 %)
1,046,743
(7.55 %)
16,021,887
(40.41 %)
52,164
(1.20 %)
334 human (HG01071.mat 2021)
GCA_018472685.1
n/a 20,742
(1.86 %)
22,169
(1.25 %)
233,386
(4.98 %)
40.86
(100.00 %)
n/a 236
(100.00 %)
5,380,815
(52.80 %)
1,031,609
(7.04 %)
16,008,178
(39.99 %)
52,233
(1.13 %)
335 human (HG01071.pat 2021)
GCA_018472725.1
n/a 20,694
(1.84 %)
22,451
(1.25 %)
232,969
(4.90 %)
40.75
(100.00 %)
1
(0.00 %)
330
(100.00 %)
5,420,540
(53.42 %)
1,100,044
(8.26 %)
15,926,032
(40.73 %)
52,706
(1.14 %)
336 human (HG01106.mat 2021)
GCA_018471345.1
n/a 20,635
(1.85 %)
22,311
(1.24 %)
233,162
(4.93 %)
40.84
(100.00 %)
1
(0.00 %)
272
(100.00 %)
5,394,949
(53.13 %)
1,045,161
(7.68 %)
15,896,292
(40.33 %)
52,604
(1.18 %)
337 human (HG01106.pat 2021)
GCA_018471075.1
n/a 19,939
(1.84 %)
21,482
(1.25 %)
227,418
(4.97 %)
40.82
(100.00 %)
n/a 284
(100.00 %)
5,199,262
(53.10 %)
1,073,766
(8.08 %)
15,085,301
(40.44 %)
51,050
(1.19 %)
338 human (HG01109.mat 2021)
GCA_018504365.1
n/a 20,638
(1.84 %)
22,373
(1.25 %)
233,201
(4.94 %)
40.83
(100.00 %)
1
(0.00 %)
399
(100.00 %)
5,405,239
(53.13 %)
1,058,194
(7.69 %)
15,910,496
(40.38 %)
53,236
(1.22 %)
339 human (HG01109.pat 2021)
GCA_018504645.1
n/a 19,870
(1.85 %)
21,659
(1.26 %)
227,481
(4.98 %)
40.81
(100.00 %)
1
(0.00 %)
473
(100.00 %)
5,197,395
(52.95 %)
1,071,566
(7.99 %)
15,109,996
(40.28 %)
51,315
(1.20 %)
340 human (HG01123.mat 2021)
GCA_018469665.1
n/a 20,643
(1.86 %)
22,373
(1.25 %)
233,154
(4.98 %)
40.85
(100.00 %)
1
(0.00 %)
340
(100.00 %)
5,382,379
(52.86 %)
1,029,500
(7.16 %)
15,979,100
(40.07 %)
52,346
(1.15 %)
341 human (HG01123.pat 2021)
GCA_018469695.1
n/a 20,631
(1.86 %)
22,210
(1.24 %)
233,273
(4.97 %)
40.86
(100.00 %)
1
(0.00 %)
436
(100.00 %)
5,391,322
(52.85 %)
1,041,900
(7.14 %)
15,985,878
(40.09 %)
52,630
(1.16 %)
342 human (HG01175.mat 2021)
GCA_018471085.1
n/a 20,587
(1.84 %)
22,094
(1.24 %)
232,602
(4.93 %)
40.81
(100.00 %)
3
(0.00 %)
315
(100.00 %)
5,397,845
(53.20 %)
1,069,444
(7.79 %)
15,978,901
(40.45 %)
51,968
(1.14 %)
343 human (HG01175.pat 2021)
GCA_018471065.1
n/a 20,651
(1.85 %)
22,302
(1.25 %)
233,105
(4.94 %)
40.83
(100.00 %)
n/a 365
(100.00 %)
5,401,789
(53.10 %)
1,061,956
(7.62 %)
16,016,635
(40.44 %)
52,440
(1.16 %)
344 human (HG01243.mat 2021)
GCA_018504375.1
n/a 20,701
(1.85 %)
22,327
(1.24 %)
232,970
(4.94 %)
40.84
(100.00 %)
n/a 345
(100.00 %)
5,384,218
(53.11 %)
1,029,835
(7.61 %)
15,997,541
(40.37 %)
52,287
(1.16 %)
345 human (HG01243.pat 2021)
GCA_018504045.1
n/a 19,886
(1.86 %)
21,597
(1.26 %)
227,249
(5.00 %)
40.90
(100.00 %)
1
(0.00 %)
436
(100.00 %)
5,188,879
(52.80 %)
1,041,178
(7.85 %)
15,168,227
(40.25 %)
51,387
(1.26 %)
346 human (HG01258.mat 2021)
GCA_018469405.1
n/a 20,652
(1.85 %)
22,270
(1.25 %)
233,297
(4.95 %)
40.86
(100.00 %)
1
(0.00 %)
346
(100.00 %)
5,421,505
(53.06 %)
1,070,796
(7.57 %)
15,904,078
(40.29 %)
52,952
(1.24 %)
347 human (HG01258.pat 2021)
GCA_018469675.1
n/a 19,899
(1.85 %)
21,663
(1.25 %)
227,048
(4.98 %)
40.83
(100.00 %)
1
(0.00 %)
324
(100.00 %)
5,179,894
(52.93 %)
1,053,273
(8.01 %)
15,211,574
(40.34 %)
50,868
(1.15 %)
348 human (HG01358.mat 2021)
GCA_018469865.1
n/a 20,620
(1.85 %)
22,173
(1.24 %)
232,988
(57.14 %)
40.83
(100.00 %)
1
(0.00 %)
334
(100.00 %)
5,408,314
(53.13 %)
1,082,369
(7.68 %)
15,986,592
(40.42 %)
52,497
(1.15 %)
349 human (HG01358.pat 2021)
GCA_018469965.1
n/a 19,983
(1.85 %)
21,787
(1.25 %)
227,373
(4.96 %)
40.85
(100.00 %)
1
(0.00 %)
441
(100.00 %)
5,212,793
(53.10 %)
1,073,348
(8.29 %)
15,098,284
(40.47 %)
51,706
(1.21 %)
350 human (HG01361.mat 2021)
GCA_018469685.1
n/a 20,709
(1.85 %)
22,220
(1.24 %)
233,019
(4.95 %)
40.82
(100.00 %)
n/a 295
(100.00 %)
5,400,880
(53.06 %)
1,072,673
(7.57 %)
15,970,600
(40.36 %)
52,279
(1.19 %)
351 human (HG01361.pat 2021)
GCA_018469705.1
n/a 20,643
(1.86 %)
22,265
(1.25 %)
233,156
(4.98 %)
40.88
(100.00 %)
1
(0.00 %)
288
(100.00 %)
5,389,985
(52.82 %)
1,039,540
(7.07 %)
15,972,086
(40.01 %)
52,246
(1.17 %)
352 human (HG01891.mat 2021)
GCA_018467155.1
n/a 20,644
(1.86 %)
22,204
(1.24 %)
233,342
(4.96 %)
40.82
(100.00 %)
1
(0.00 %)
331
(100.00 %)
5,394,888
(53.00 %)
1,057,773
(7.41 %)
16,010,248
(40.29 %)
52,761
(1.18 %)
353 human (HG01891.pat 2021)
GCA_018467165.1
n/a 20,737
(1.84 %)
22,422
(1.25 %)
233,650
(4.94 %)
40.86
(100.00 %)
1
(0.00 %)
427
(100.00 %)
5,403,741
(53.18 %)
1,044,828
(7.78 %)
15,926,586
(40.45 %)
52,966
(1.19 %)
354 human (HG01928.mat 2021)
GCA_018472695.1
n/a 20,608
(1.85 %)
22,133
(1.24 %)
232,837
(4.94 %)
40.81
(100.00 %)
n/a 244
(100.00 %)
5,393,247
(53.12 %)
1,066,426
(7.67 %)
15,949,983
(40.40 %)
51,940
(1.16 %)
355 human (HG01928.pat 2021)
GCA_018472705.1
n/a 19,872
(1.85 %)
21,396
(1.24 %)
226,741
(4.96 %)
40.86
(100.00 %)
1
(0.00 %)
317
(100.00 %)
5,191,849
(53.05 %)
1,052,422
(8.21 %)
15,216,610
(40.53 %)
50,940
(1.18 %)
356 human (HG01952.mat 2021)
GCA_018471545.1
n/a 20,679
(1.86 %)
22,204
(1.25 %)
233,578
(4.98 %)
40.85
(100.00 %)
n/a 307
(100.00 %)
5,393,904
(52.87 %)
1,041,237
(7.18 %)
15,894,360
(39.98 %)
52,866
(1.21 %)
357 human (HG01952.pat 2021)
GCA_018471555.1
n/a 19,863
(1.85 %)
21,383
(1.24 %)
226,809
(4.97 %)
40.86
(100.00 %)
n/a 378
(100.00 %)
5,181,545
(52.95 %)
1,053,224
(8.07 %)
15,149,369
(40.47 %)
51,292
(1.24 %)
358 human (HG01978.mat 2021)
GCA_018472865.1
n/a 20,711
(1.84 %)
22,195
(1.24 %)
233,223
(4.92 %)
40.84
(100.00 %)
n/a 247
(100.00 %)
5,415,439
(53.41 %)
1,076,389
(8.28 %)
16,001,461
(40.83 %)
52,688
(1.16 %)
359 human (HG01978.pat 2021)
GCA_018472845.1
n/a 20,727
(1.84 %)
22,443
(1.25 %)
233,592
(4.92 %)
40.83
(100.00 %)
1
(0.00 %)
286
(100.00 %)
5,424,250
(53.38 %)
1,090,520
(8.17 %)
15,938,736
(40.68 %)
52,674
(1.19 %)
360 human (HG02055 mat 2021)
GCA_018506125.1
n/a 20,668
(1.86 %)
22,497
(1.26 %)
233,148
(4.96 %)
40.83
(100.00 %)
1
(0.00 %)
306
(100.00 %)
5,394,664
(52.96 %)
1,054,907
(7.31 %)
16,015,246
(40.18 %)
52,182
(1.14 %)
361 human (HG02055 pat 2021)
GCA_018505855.1
n/a 19,927
(1.83 %)
21,549
(1.23 %)
227,271
(4.93 %)
40.82
(100.00 %)
n/a 367
(100.00 %)
5,216,705
(53.37 %)
1,083,360
(8.82 %)
15,156,062
(40.89 %)
51,291
(1.20 %)
362 human (HG02080.mat 2021)
GCA_018504085.1
n/a 20,633
(1.85 %)
22,288
(1.24 %)
233,237
(4.94 %)
40.84
(100.00 %)
1
(0.00 %)
422
(100.00 %)
5,403,587
(53.12 %)
1,056,798
(7.68 %)
15,880,598
(40.28 %)
52,572
(1.21 %)
363 human (HG02080.pat 2021)
GCA_018504055.1
n/a 20,645
(1.85 %)
22,426
(1.26 %)
233,357
(4.96 %)
40.84
(100.00 %)
n/a 485
(100.00 %)
5,400,305
(52.99 %)
1,056,100
(7.39 %)
15,866,266
(40.12 %)
52,798
(1.20 %)
364 human (HG02109 mat 2021)
GCA_018505825.1
n/a 20,672
(1.85 %)
22,359
(1.25 %)
233,217
(4.95 %)
40.86
(100.00 %)
n/a 445
(100.00 %)
5,404,232
(52.99 %)
1,059,138
(7.38 %)
15,909,866
(40.16 %)
52,821
(1.21 %)
365 human (HG02109 pat 2021)
GCA_018505865.1
n/a 20,726
(1.85 %)
22,416
(1.25 %)
233,280
(4.94 %)
40.84
(100.00 %)
2
(0.00 %)
481
(100.00 %)
5,415,046
(53.08 %)
1,053,373
(7.55 %)
15,926,813
(40.27 %)
52,917
(1.18 %)
366 human (HG02145 mat 2021)
GCA_018852585.1
n/a 20,626
(1.85 %)
22,340
(1.25 %)
233,065
(4.94 %)
40.85
(100.00 %)
1
(0.00 %)
437
(100.00 %)
5,406,959
(53.08 %)
1,055,638
(7.58 %)
15,881,847
(40.24 %)
52,888
(1.19 %)
367 human (HG02145 pat 2021)
GCA_018852595.1
n/a 19,971
(1.84 %)
23,489
(1.40 %)
227,332
(4.94 %)
40.91
(100.00 %)
1
(0.00 %)
817
(100.00 %)
5,210,152
(53.01 %)
1,080,455
(8.52 %)
14,936,162
(40.43 %)
52,745
(1.32 %)
368 human (HG02148.mat 2021)
GCA_018471535.1
n/a 20,622
(1.85 %)
22,230
(1.24 %)
233,267
(4.94 %)
40.81
(100.00 %)
n/a 423
(100.00 %)
5,415,368
(53.22 %)
1,083,752
(7.85 %)
16,009,690
(40.54 %)
52,324
(1.14 %)
369 human (HG02148.pat 2021)
GCA_018471525.1
n/a 20,675
(1.85 %)
22,449
(1.25 %)
233,621
(4.96 %)
40.87
(100.00 %)
n/a 487
(100.00 %)
5,408,728
(53.04 %)
1,060,811
(7.55 %)
15,818,402
(40.19 %)
52,717
(1.23 %)
370 human (HG02257.mat 2021)
GCA_018466845.1
n/a 20,636
(1.85 %)
22,298
(1.24 %)
233,236
(4.95 %)
40.84
(100.00 %)
1
(0.00 %)
292
(100.00 %)
5,409,203
(53.10 %)
1,060,311
(7.60 %)
16,026,213
(40.43 %)
52,647
(1.16 %)
371 human (HG02257.pat 2021)
GCA_018466835.1
n/a 20,659
(1.84 %)
22,252
(1.23 %)
233,332
(4.93 %)
40.78
(100.00 %)
n/a 306
(100.00 %)
5,414,841
(53.29 %)
1,077,125
(7.99 %)
15,891,119
(40.53 %)
52,638
(1.18 %)
372 human (HG02486.mat 2021)
GCA_018467015.1
n/a 20,626
(1.85 %)
22,072
(1.24 %)
232,923
(4.95 %)
40.80
(100.00 %)
1
(0.00 %)
283
(100.00 %)
5,409,820
(53.15 %)
1,075,146
(7.68 %)
15,995,649
(40.44 %)
52,593
(1.16 %)
373 human (HG02486.pat 2021)
GCA_018467005.1
n/a 20,047
(1.86 %)
21,511
(1.24 %)
227,472
(4.97 %)
40.80
(100.00 %)
1
(0.00 %)
342
(100.00 %)
5,191,769
(53.10 %)
1,044,947
(8.26 %)
15,239,696
(40.62 %)
51,172
(1.16 %)
374 human (HG02559.mat 2021)
GCA_018466985.1
n/a 20,748
(1.85 %)
22,425
(1.25 %)
233,661
(4.95 %)
40.84
(100.00 %)
n/a 329
(100.00 %)
5,409,998
(53.11 %)
1,067,279
(7.64 %)
15,944,107
(40.38 %)
53,297
(1.22 %)
375 human (HG02559.pat 2021)
GCA_018466855.1
n/a 20,684
(1.85 %)
22,457
(1.26 %)
233,500
(4.96 %)
40.86
(100.00 %)
1
(0.00 %)
260
(100.00 %)
5,394,499
(53.00 %)
1,048,556
(7.39 %)
16,015,449
(40.28 %)
52,834
(1.17 %)
376 human (HG02572.mat 2021)
GCA_018470445.1
n/a 20,823
(1.84 %)
22,634
(1.24 %)
232,547
(4.89 %)
40.83
(100.00 %)
1
(0.00 %)
632
(100.00 %)
5,435,641
(53.28 %)
1,076,981
(7.96 %)
15,851,923
(40.45 %)
53,410
(1.21 %)
377 human (HG02572.pat 2021)
GCA_018470435.1
n/a 20,054
(1.85 %)
21,827
(1.25 %)
225,951
(4.91 %)
40.85
(100.00 %)
1
(0.00 %)
641
(100.00 %)
5,213,929
(53.30 %)
1,082,137
(8.76 %)
15,068,577
(40.69 %)
51,312
(1.19 %)
378 human (HG02622.mat 2021)
GCA_018469875.1
n/a 20,669
(1.84 %)
22,455
(1.24 %)
233,354
(4.93 %)
40.86
(100.00 %)
n/a 292
(100.00 %)
5,446,540
(53.17 %)
1,085,576
(7.76 %)
15,975,207
(40.52 %)
53,535
(1.26 %)
379 human (HG02622.pat 2021)
GCA_018469925.1
n/a 20,698
(1.84 %)
22,536
(1.25 %)
233,733
(4.94 %)
40.84
(100.00 %)
1
(0.00 %)
270
(100.00 %)
5,421,378
(53.22 %)
1,062,842
(7.81 %)
15,934,809
(40.46 %)
52,975
(1.21 %)
380 human (HG02630.mat 2021)
GCA_018469955.1
n/a 20,674
(1.84 %)
22,467
(1.25 %)
233,172
(4.93 %)
40.87
(100.00 %)
1
(0.00 %)
497
(100.00 %)
5,432,857
(53.10 %)
1,072,648
(7.64 %)
15,990,876
(40.53 %)
54,101
(1.32 %)
381 human (HG02630.pat 2021)
GCA_018469945.1
n/a 20,722
(1.83 %)
22,445
(1.24 %)
233,268
(4.91 %)
40.85
(100.00 %)
1
(0.00 %)
534
(100.00 %)
5,449,816
(53.34 %)
1,108,461
(8.05 %)
15,985,498
(40.79 %)
53,746
(1.28 %)
382 human (HG02717.mat 2021)
GCA_018469935.1
n/a 20,621
(1.84 %)
22,396
(1.25 %)
233,096
(4.93 %)
40.81
(100.00 %)
1
(0.00 %)
323
(100.00 %)
5,411,829
(53.22 %)
1,079,483
(7.87 %)
15,854,981
(40.43 %)
53,155
(1.21 %)
383 human (HG02717.pat 2021)
GCA_018470425.1
n/a 19,952
(1.84 %)
21,767
(1.25 %)
227,273
(4.93 %)
40.83
(100.00 %)
1
(0.00 %)
399
(100.00 %)
5,216,997
(53.34 %)
1,089,537
(8.70 %)
15,132,132
(40.83 %)
51,815
(1.21 %)
384 human (HG02723.mat 2021)
GCA_018504065.1
n/a 20,697
(1.85 %)
22,322
(1.25 %)
233,152
(4.95 %)
40.83
(100.00 %)
2
(0.00 %)
429
(100.00 %)
5,403,282
(53.05 %)
1,062,881
(7.52 %)
15,861,495
(40.19 %)
52,733
(1.19 %)
385 human (HG02723.pat 2021)
GCA_018504075.1
n/a 20,606
(1.84 %)
22,627
(1.25 %)
233,499
(4.92 %)
40.82
(100.00 %)
2
(0.00 %)
529
(100.00 %)
5,419,888
(53.29 %)
1,079,052
(8.00 %)
15,778,626
(40.44 %)
53,133
(1.23 %)
386 human (HG02818.mat 2021)
GCA_018503585.1
n/a 20,695
(1.85 %)
22,489
(1.25 %)
233,161
(4.93 %)
40.80
(100.00 %)
1
(0.00 %)
620
(100.00 %)
5,406,404
(53.21 %)
1,061,348
(7.77 %)
15,879,759
(40.38 %)
52,992
(1.18 %)
387 human (HG02818.pat 2021)
GCA_018503575.1
n/a 20,696
(1.86 %)
22,490
(1.27 %)
233,253
(4.97 %)
40.87
(100.00 %)
1
(0.00 %)
566
(100.00 %)
5,397,389
(52.88 %)
1,044,887
(7.21 %)
16,011,018
(40.13 %)
52,793
(1.17 %)
388 human (HG02886.mat 2021)
GCA_018470455.1
n/a 20,740
(1.84 %)
22,693
(1.25 %)
233,895
(4.94 %)
40.87
(100.00 %)
n/a 461
(100.00 %)
5,448,421
(53.12 %)
1,077,973
(7.55 %)
15,956,661
(40.38 %)
53,701
(1.29 %)
389 human (HG02886.pat 2021)
GCA_018470465.1
n/a 20,705
(1.84 %)
22,599
(1.26 %)
233,328
(4.93 %)
40.85
(100.00 %)
n/a 503
(100.00 %)
5,438,367
(53.15 %)
1,090,141
(7.70 %)
16,016,158
(40.57 %)
53,652
(1.26 %)
390 human (HG03098 mat 2021)
GCA_018506165.1
n/a 20,700
(1.83 %)
22,200
(1.24 %)
233,714
(4.91 %)
40.79
(100.00 %)
n/a 331
(100.00 %)
5,414,502
(53.46 %)
1,066,527
(8.36 %)
15,926,377
(40.78 %)
52,417
(1.18 %)
391 human (HG03098 pat 2021)
GCA_018506155.1
n/a 19,900
(1.84 %)
21,567
(1.24 %)
226,998
(4.94 %)
40.84
(100.00 %)
1
(0.00 %)
445
(100.00 %)
5,201,143
(53.24 %)
1,083,861
(8.56 %)
15,069,721
(40.64 %)
51,389
(1.21 %)
392 human (HG03453.mat 2021)
GCA_018472855.1
n/a 20,710
(1.84 %)
22,595
(1.25 %)
233,614
(4.93 %)
40.83
(100.00 %)
1
(0.00 %)
439
(100.00 %)
5,436,784
(53.21 %)
1,094,451
(7.82 %)
15,990,282
(40.60 %)
53,318
(1.27 %)
393 human (HG03453.pat 2021)
GCA_018473305.1
n/a 20,661
(1.84 %)
22,407
(1.25 %)
233,945
(4.93 %)
40.80
(100.00 %)
n/a 480
(100.00 %)
5,418,964
(53.30 %)
1,060,724
(7.98 %)
15,795,098
(40.40 %)
53,149
(1.21 %)
394 human (HG03486 pat 2021)
GCA_018503245.1
n/a 20,698
(1.84 %)
22,539
(1.24 %)
233,646
(4.92 %)
40.84
(100.00 %)
2
(0.00 %)
519
(100.00 %)
5,426,413
(53.27 %)
1,068,800
(7.93 %)
15,812,092
(40.41 %)
53,143
(1.26 %)
395 human (HG03486.mat 2021)
GCA_018503525.1
n/a 20,760
(1.85 %)
22,730
(1.26 %)
233,655
(4.96 %)
40.87
(100.00 %)
2
(0.00 %)
480
(100.00 %)
5,422,116
(53.02 %)
1,069,864
(7.46 %)
15,951,020
(40.27 %)
53,338
(1.19 %)
396 human (HG03516.mat 2021)
GCA_018469425.1
n/a 20,766
(1.85 %)
22,424
(1.25 %)
233,619
(4.96 %)
40.85
(100.00 %)
n/a 320
(100.00 %)
5,437,541
(52.96 %)
1,084,729
(7.35 %)
16,097,675
(40.30 %)
52,953
(1.18 %)
397 human (HG03516.pat 2021)
GCA_018469415.1
n/a 20,820
(1.84 %)
22,672
(1.25 %)
234,068
(4.91 %)
40.85
(100.00 %)
1
(0.00 %)
369
(100.00 %)
5,451,270
(53.44 %)
1,086,645
(8.28 %)
15,991,774
(40.84 %)
53,435
(1.18 %)
398 human (HG03540.mat 2021)
GCA_018473295.1
n/a 20,665
(1.84 %)
22,566
(1.26 %)
233,386
(4.92 %)
40.85
(100.00 %)
1
(0.00 %)
435
(100.00 %)
5,436,802
(53.34 %)
1,105,174
(8.06 %)
15,931,296
(40.72 %)
53,436
(1.26 %)
399 human (HG03540.pat 2021)
GCA_018473315.1
n/a 20,724
(1.83 %)
22,627
(1.25 %)
233,360
(4.91 %)
40.83
(100.00 %)
1
(0.00 %)
512
(100.00 %)
5,449,110
(53.39 %)
1,087,677
(8.16 %)
15,936,844
(40.79 %)
53,859
(1.30 %)
400 human (HG03579.mat 2021)
GCA_018472825.1
n/a 20,702
(1.85 %)
22,327
(1.25 %)
233,403
(4.95 %)
40.84
(100.00 %)
1
(0.00 %)
456
(100.00 %)
5,423,189
(53.07 %)
1,075,620
(7.56 %)
15,928,710
(40.31 %)
53,423
(1.24 %)
401 human (HG03579.pat 2021)
GCA_018472835.1
n/a 19,942
(1.84 %)
21,710
(1.25 %)
227,313
(4.94 %)
40.82
(100.00 %)
n/a 499
(100.00 %)
5,226,752
(53.28 %)
1,092,235
(8.58 %)
15,143,136
(40.79 %)
51,622
(1.24 %)
402 human (NA18906.mat 2021)
GCA_018503255.1
n/a 20,739
(1.84 %)
22,340
(1.25 %)
233,812
(4.92 %)
40.86
(100.00 %)
n/a 271
(100.00 %)
5,464,910
(53.26 %)
1,101,031
(7.88 %)
15,871,098
(40.43 %)
53,290
(1.27 %)
403 human (NA18906.pat 2021)
GCA_018503285.1
n/a 20,765
(1.85 %)
22,414
(1.25 %)
234,102
(4.95 %)
40.84
(100.00 %)
n/a 304
(100.00 %)
5,443,478
(53.06 %)
1,085,707
(7.53 %)
15,888,465
(40.19 %)
53,328
(1.24 %)
404 human (NA19240.mat 2021)
GCA_018503275.1
n/a 20,678
(1.85 %)
22,534
(1.26 %)
233,508
(4.96 %)
40.82
(100.00 %)
1
(0.00 %)
387
(100.00 %)
5,404,648
(52.98 %)
1,047,126
(7.31 %)
15,970,133
(40.15 %)
52,529
(1.17 %)
405 human (NA19240.pat 2021)
GCA_018503265.1
n/a 20,772
(1.85 %)
22,461
(1.25 %)
233,684
(4.95 %)
40.86
(100.00 %)
4
(0.00 %)
453
(100.00 %)
5,424,224
(53.08 %)
1,063,925
(7.53 %)
15,954,132
(40.32 %)
53,106
(1.23 %)
406 human (NA20129 mat 2021)
GCA_018504635.1
n/a 20,664
(1.84 %)
22,511
(1.24 %)
233,033
(4.92 %)
40.85
(100.00 %)
1
(0.00 %)
448
(100.00 %)
5,420,332
(53.24 %)
1,067,867
(7.86 %)
15,932,491
(40.50 %)
53,011
(1.20 %)
407 human (NA20129 pat 2021)
GCA_018504625.1
n/a 20,706
(1.85 %)
22,365
(1.26 %)
233,543
(4.96 %)
40.84
(100.00 %)
n/a 481
(100.00 %)
5,401,495
(53.02 %)
1,051,311
(7.46 %)
16,041,778
(40.34 %)
52,911
(1.18 %)
408 human (NA21309 pat 2021)
GCA_018504665.1
n/a 20,685
(1.85 %)
22,478
(1.25 %)
233,394
(4.95 %)
40.81
(100.00 %)
4
(0.00 %)
608
(100.00 %)
5,399,150
(53.06 %)
1,053,638
(7.58 %)
15,999,929
(40.35 %)
52,798
(1.17 %)
409 human (NA21309.mat 2021)
GCA_018504655.1
n/a 20,635
(1.84 %)
22,458
(1.25 %)
233,555
(4.94 %)
40.84
(100.00 %)
1
(0.00 %)
508
(100.00 %)
5,389,804
(53.21 %)
1,045,498
(7.82 %)
15,862,735
(40.38 %)
52,479
(1.17 %)
410 human (NA24385 HG002 alt pat 2023)
GCA_018852605.2
n/a 19,964
(1.84 %)
20,479
(1.19 %)
n/a 40.79
(99.74 %)
4
(0.26 %)
27
(99.74 %)
5,394,200
(53.47 %)
1,082,908
(8.63 %)
15,221,566
(40.81 %)
50,569
(1.11 %)
411 human (NA24385 HG002 pri mat 2023)
GCA_018852615.2
n/a 20,637
(1.85 %)
21,256
(1.20 %)
n/a 40.82
(99.23 %)
5
(0.77 %)
24
(100.00 %)
5,394,439
(53.04 %)
1,041,946
(7.44 %)
16,039,487
(40.04 %)
52,111
(1.11 %)
412 human (NA24385.mat 2021)
GCA_018852615.1
n/a 20,744
(1.84 %)
21,968
(1.22 %)
233,779
(4.92 %)
40.85
(100.00 %)
6
(0.00 %)
445
(100.00 %)
5,435,410
(53.40 %)
1,086,871
(8.27 %)
15,970,867
(40.97 %)
53,581
(1.32 %)
413 human (NA24385.mat 2022)
GCA_021951015.1
n/a 20,809
(1.82 %)
21,369
(1.18 %)
234,089
(4.92 %)
40.85
(99.95 %)
109
(0.05 %)
355
(100.00 %)
5,489,855
(53.93 %)
1,085,681
(8.26 %)
15,968,830
(40.95 %)
53,511
(1.32 %)
414 human (NA24385.pat 2021)
GCA_018852605.1
n/a 19,919
(1.83 %)
21,582
(1.22 %)
227,333
(4.91 %)
40.87
(100.00 %)
5
(0.00 %)
610
(100.00 %)
5,215,774
(53.54 %)
1,094,036
(9.09 %)
15,125,069
(41.29 %)
52,653
(1.34 %)
415 human (NA24385.pat 2022)
GCA_021950905.1
n/a 20,014
(1.81 %)
20,716
(1.19 %)
227,278
(4.91 %)
40.87
(99.97 %)
117
(0.03 %)
514
(100.00 %)
5,293,356
(54.01 %)
1,100,786
(9.09 %)
15,122,569
(41.27 %)
52,546
(1.35 %)
416 human (NA24631 mat 2021)
GCA_018506965.1
n/a 20,683
(1.85 %)
22,446
(1.25 %)
233,691
(4.96 %)
40.88
(100.00 %)
4
(0.00 %)
503
(100.00 %)
5,423,411
(52.98 %)
1,075,094
(7.46 %)
15,897,770
(40.32 %)
53,731
(1.31 %)
417 human (NA24631 pat 2021)
GCA_018506945.1
n/a 19,910
(1.84 %)
21,610
(1.24 %)
227,521
(4.95 %)
40.90
(100.00 %)
2
(0.00 %)
682
(100.00 %)
5,224,127
(53.12 %)
1,078,588
(8.33 %)
15,264,128
(40.95 %)
53,164
(1.35 %)
418 human betaherpesvirus 6A (U1102 1995 genbank)
GCA_000845685.2
n/a n/a n/a n/a 42.44
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
33
(1.67 %)
36
(4.27 %)
603
(9.83 %)
3
(13.72 %)
419 Iberian mole (v1 TD23 2020)
GCF_014898055.1
46,872
(2.59 %)
18,566
(1.67 %)
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(1.59 %)
n/a 41.91
(99.98 %)
3,640
(0.02 %)
4,425
(100.00 %)
3,269,038
(31.47 %)
501,677
(1.32 %)
11,176,747
(32.61 %)
48,076
(2.80 %)
420 Iberian mole (v2 TD23 2020)
GCF_014898055.2
46,759
(2.60 %)
18,453
(1.69 %)
20,410
(1.59 %)
n/a 41.90
(99.98 %)
3,639
(0.02 %)
3,202
(100.00 %)
2,637,156
(23.36 %)
497,087
(1.30 %)
10,984,260
(32.64 %)
47,552
(2.89 %)
421 Indian glassy fish (v1 2019)
GCF_900634625.1
44,096
(12.32 %)
15,337
(3.60 %)
23,988
(7.92 %)
60,224
(10.41 %)
42.38
(98.08 %)
1,523
(1.92 %)
156
(100.00 %)
346,406
(3.02 %)
163,522
(3.00 %)
2,755,229
(25.07 %)
17,930
(1.47 %)
422 Indian medaka
GCF_002922805.1
47,300
(9.26 %)
14,561
(2.50 %)
31,867
(6.43 %)
n/a 39.04
(94.73 %)
51,440
(5.29 %)
8,603
(100.00 %)
319,637
(2.20 %)
208,749
(2.67 %)
5,412,794
(33.26 %)
40,721
(2.36 %)
423 Indianmeal moth (v1 USDA-ARS_2022_Savannah primary hap 2023)
GCF_027563975.1
28,390
(14.36 %)
4,799
(1.56 %)
15,737
(7.20 %)
n/a 35.38
(100.00 %)
26
(0.00 %)
46
(100.00 %)
136,242
(3.33 %)
48,275
(1.61 %)
2,518,372
(36.69 %)
14,106
(2.86 %)
424 Jamaican fruit-eating bat (US092 2019 Broad)
GCA_004027435.1
n/a 21,188
(1.26 %)
41,550
(1.34 %)
35,477
(1.51 %)
42.19
(99.92 %)
4,324
(0.02 %)
798,700
(99.98 %)
3,297,388
(28.66 %)
476,792
(1.23 %)
13,144,912
(34.13 %)
81,685
(1.86 %)
425 Japanese quail
GCF_001577835.1
46,995
(7.38 %)
12,864
(2.55 %)
36,126
(11.03 %)
n/a 41.28
(98.88 %)
11,601
(1.12 %)
9,642
(98.88 %)
466,141
(6.58 %)
321,128
(2.22 %)
5,497,911
(19.81 %)
17,977
(1.86 %)
426 Japanese sawshark (hap1 2024 genbank)
GCA_044704955.1
n/a 14,672
(0.28 %)
30,181
(0.79 %)
n/a 47.02
(99.98 %)
5,985
(0.02 %)
4,317
(100.00 %)
1,167,498
(3.08 %)
2,399,496
(18.16 %)
10,302
(99.98 %)
503,637
(6.56 %)
427 Jerdon's jumping ant (DR-91 v8.5 2018)
GCF_003227715.1
29,097
(10.82 %)
4,337
(1.33 %)
43,907
(11.32 %)
n/a 44.75
(99.72 %)
499
(0.28 %)
857
(100.00 %)
439,110
(17.67 %)
262,539
(5.69 %)
1,834,301
(29.28 %)
6,204
(9.08 %)
428 kakapo (Jane v1 2019)
GCF_004027225.1
49,444
(5.77 %)
13,114
(1.92 %)
17,732
(2.50 %)
29,004
(4.44 %)
41.97
(97.63 %)
362
(2.37 %)
99
(100.00 %)
548,758
(10.76 %)
208,171
(1.07 %)
6,258,082
(20.20 %)
22,279
(1.75 %)
429 kakapo (Jane v2 2020 genbank)
GCA_004027225.2
49,757
(54.33 %)
13,112
(1.92 %)
17,637
(2.48 %)
n/a 41.97
(99.08 %)
373
(0.92 %)
90
(100.00 %)
507,072
(7.85 %)
208,180
(1.08 %)
6,258,178
(20.50 %)
22,278
(1.77 %)
430 koala (Bilbo 61053 2017)
GCF_002099425.1
55,736
(2.16 %)
17,500
(0.86 %)
16,193
(0.94 %)
n/a 39.05
(100.00 %)
1
(0.00 %)
1,907
(100.00 %)
7,814,631
(41.58 %)
1,123,545
(2.03 %)
21,796,057
(39.25 %)
15,957
(0.35 %)
431 Korean giant-fin mudskipper (v1 primary hap 2020 genbank)
GCA_009829125.1
29,504
(53.56 %)
14,221
(2.37 %)
44,144
(5.80 %)
41,384
(6.20 %)
40.22
(99.05 %)
700
(0.95 %)
124
(100.00 %)
423,338
(4.48 %)
551,472
(7.22 %)
4,887,148
(38.97 %)
37,287
(2.58 %)
432 Korean giant-fin mudskipper (v1 primary hap 2020 refseq)
GCF_009829125.1
29,517
(6.48 %)
14,243
(2.37 %)
44,144
(5.80 %)
41,421
(6.20 %)
40.22
(99.05 %)
700
(0.95 %)
124
(100.00 %)
423,274
(4.48 %)
551,472
(7.22 %)
4,887,142
(38.97 %)
37,287
(2.58 %)
433 lanner falcon (bFalBia1 primary hap 2022 genbank)
GCA_023638135.1
48,561
(51.20 %)
12,862
(1.69 %)
21,562
(1.92 %)
n/a 43.03
(99.83 %)
158
(0.17 %)
397
(100.00 %)
439,975
(3.77 %)
203,640
(6.96 %)
6,921,438
(23.57 %)
32,398
(2.65 %)
434 large cabbage white (genbank 2021)
GCA_905147105.1
24,631
(60.59 %)
4,550
(1.47 %)
9,197
(5.18 %)
30,394
(12.69 %)
34.13
(100.00 %)
29
(0.00 %)
402
(100.00 %)
123,352
(2.30 %)
36,616
(6.05 %)
2,431,238
(41.04 %)
8,442
(2.49 %)
435 large tree shrew (BS70 2019 Broad)
GCA_004365275.1
n/a 26,266
(0.71 %)
59,868
(0.81 %)
n/a 42.00
(99.77 %)
6,466
(0.02 %)
3,890,086
(99.98 %)
7,163,973
(22.64 %)
1,629,329
(2.64 %)
18,970,992
(42.82 %)
138,732
(1.75 %)
436 leatherback sea turtle (v1 2019 genbank G10K)
GCA_009764565.1
n/a 14,572
(1.03 %)
16,165
(1.42 %)
n/a 43.36
(99.74 %)
558
(0.26 %)
55
(100.00 %)
1,631,923
(15.09 %)
303,440
(1.14 %)
11,122,938
(34.12 %)
35,505
(1.37 %)
437 leatherback sea turtle (v1 alternate hap 2019)
GCA_009762595.1
n/a 10,857
(1.01 %)
15,585
(1.46 %)
n/a 43.54
(100.00 %)
n/a 8,982
(100.00 %)
1,090,219
(15.03 %)
206,192
(1.19 %)
7,154,939
(33.03 %)
25,155
(1.42 %)
438 leatherback sea turtle (v3 2020 refseq G10K)
GCF_009764565.2
62,576
(3.50 %)
14,610
(1.03 %)
16,359
(1.45 %)
n/a 43.35
(99.74 %)
667
(0.26 %)
40
(100.00 %)
1,637,236
(15.13 %)
304,730
(1.14 %)
11,121,967
(34.21 %)
35,485
(1.36 %)
439 Leishmania infantum (JPCM5 2011 kinetoplastids genbank)
GCA_000002875.2
n/a 591
(1.09 %)
4,193
(46.51 %)
n/a 59.58
(99.94 %)
454
(0.06 %)
76
(100.00 %)
24,390
(4.61 %)
4,228
(1.93 %)
243,087
(20.97 %)
92
(99.40 %)
440 Leishmania major (Friedlin 2011 kinetoplastids genbank)
GCA_000002725.2
n/a 626
(1.15 %)
4,290
(46.53 %)
n/a 59.72
(100.00 %)
7
(0.00 %)
43
(100.00 %)
33,021
(5.20 %)
8,477
(2.43 %)
238,932
(20.91 %)
41
(99.80 %)
441 Leishmania martiniquensis (LSCM1 2021 genbank)
GCA_017916325.1
n/a 619
(1.14 %)
3,882
(44.58 %)
n/a 59.85
(100.00 %)
5
(0.00 %)
42
(100.00 %)
20,726
(2.91 %)
2,267
(2.64 %)
232,973
(20.45 %)
44
(99.29 %)
442 Leishmania orientalis (LSCM4 2021 genbank)
GCA_017916335.1
n/a 643
(1.12 %)
4,666
(45.26 %)
n/a 59.72
(99.99 %)
11
(0.00 %)
98
(100.00 %)
22,632
(2.47 %)
4,241
(2.74 %)
231,120
(20.18 %)
100
(99.82 %)
443 leopard (Maewha 2016 genbank)
GCA_001857705.1
73,266
(49.50 %)
18,874
(1.62 %)
21,014
(1.44 %)
n/a 41.71
(96.17 %)
214,953
(3.85 %)
265,329
(96.15 %)
5,246,283
(42.87 %)
1,059,443
(5.13 %)
14,265,514
(32.20 %)
77,000
(2.45 %)
444 lesser Egyptian jerboa (JJ0015 2012 genbank)
GCA_000280705.1
25,978
(33.60 %)
19,393
(1.38 %)
20,311
(1.35 %)
n/a 41.87
(87.17 %)
326,464
(12.87 %)
337,359
(87.13 %)
6,205,858
(38.76 %)
832,823
(1.53 %)
13,661,563
(33.98 %)
26,669
(0.59 %)
445 lesser kestrel (v1 2021)
GCF_017639655.1
47,420
(5.64 %)
13,097
(1.80 %)
22,203
(2.07 %)
n/a 42.30
(99.66 %)
298
(0.34 %)
291
(100.00 %)
516,498
(5.58 %)
210,236
(1.26 %)
7,133,927
(19.19 %)
27,558
(2.21 %)
446 lesser noctule (v1 hap1 2024)
GCA_964264875.1
n/a 18,260
(1.53 %)
23,046
(1.60 %)
n/a 43.05
(99.99 %)
1,662
(0.01 %)
1,281
(100.00 %)
3,246,021
(21.13 %)
1,298,965
(12.06 %)
9,752,193
(42.90 %)
66,137
(2.85 %)
447 lesser noctule (v1 hap2 2024)
GCA_964264895.1
n/a 17,557
(1.64 %)
22,484
(1.74 %)
n/a 43.06
(99.98 %)
1,563
(0.02 %)
2,898
(99.98 %)
2,999,553
(21.19 %)
1,122,371
(10.04 %)
9,331,392
(40.02 %)
61,834
(2.95 %)
448 lesser rhea (primary hap 2023 genbank)
GCA_028389875.1
39,024
(47.65 %)
13,358
(1.72 %)
23,870
(2.13 %)
n/a 42.45
(99.89 %)
128
(0.11 %)
179
(100.00 %)
674,141
(6.73 %)
329,122
(5.34 %)
6,820,211
(22.78 %)
45,073
(5.83 %)
449 lesser sac-winged bat (primary hap 2024 genbank)
GCA_036850995.1
n/a 18,322
(1.42 %)
21,350
(1.39 %)
n/a 41.84
(99.24 %)
573
(0.76 %)
345
(99.51 %)
4,224,340
(28.69 %)
1,030,574
(2.60 %)
12,591,928
(42.30 %)
98,189
(2.06 %)
450 lesser salmon catfish (primary hap 2023 genbank)
GCA_027579695.1
53,323
(53.05 %)
15,841
(0.90 %)
85,700
(3.30 %)
n/a 42.44
(99.43 %)
334
(0.57 %)
38
(100.00 %)
5,905,868
(49.76 %)
1,126,468
(6.51 %)
7,609,180
(62.74 %)
166,630
(4.38 %)
451 lettuce (Salinas v7 2018)
GCF_002870075.1
60,760
(2.83 %)
16,272
(0.65 %)
109,234
(6.86 %)
n/a 37.79
(92.71 %)
350,251
(7.33 %)
11,453
(100.00 %)
946,986
(1.96 %)
983,572
(3.65 %)
12,334,735
(53.11 %)
117,678
(2.02 %)
452 lettuce (Salinas v8 2020)
GCF_002870075.3
64,818
(2.94 %)
16,252
(0.65 %)
101,828
(6.36 %)
n/a 37.79
(92.44 %)
351,533
(7.59 %)
9,960
(99.71 %)
945,052
(1.95 %)
983,641
(3.64 %)
12,325,371
(53.00 %)
117,703
(2.02 %)
453 live sharksucker (v1 2019)
GCF_900963305.1
40,268
(11.91 %)
14,975
(3.53 %)
22,304
(7.09 %)
56,266
(9.51 %)
41.43
(99.89 %)
140
(0.11 %)
38
(100.00 %)
448,828
(3.61 %)
146,353
(1.65 %)
3,204,476
(21.79 %)
16,807
(1.33 %)
454 long-finned pilot whale (v1 primary hap 2023)
GCF_963455315.1
61,810
(2.84 %)
18,712
(1.51 %)
20,920
(1.39 %)
n/a 42.38
(99.99 %)
1,084
(0.01 %)
993
(100.00 %)
4,125,420
(35.62 %)
1,577,899
(12.03 %)
12,347,226
(42.01 %)
71,821
(5.51 %)
455 long-finned pilot whale (v2 primary hap 2024 genbank)
GCA_963455315.2
n/a 18,726
(1.51 %)
20,948
(1.39 %)
n/a 42.38
(99.99 %)
1,084
(0.01 %)
995
(100.00 %)
4,125,459
(35.62 %)
1,577,896
(12.03 %)
12,347,226
(42.01 %)
71,822
(5.51 %)
456 long-tailed hermit (v1 PSU5 primary hap 2022)
GCA_023637945.1
n/a 12,328
(2.02 %)
20,312
(2.34 %)
n/a 41.00
(99.63 %)
141
(0.37 %)
211
(99.63 %)
497,506
(5.06 %)
265,815
(1.51 %)
6,045,702
(20.10 %)
15,922
(1.43 %)
457 lumpfish (primary hap 2019 genbank)
GCA_009769545.1
41,612
(58.17 %)
14,748
(3.32 %)
49,223
(8.10 %)
52,721
(8.34 %)
42.83
(98.22 %)
347
(1.78 %)
49
(100.00 %)
478,416
(6.02 %)
421,634
(11.07 %)
2,928,668
(27.98 %)
53,323
(5.09 %)
458 Ma's night monkey genbank
GCA_000952055.2
55,061
(41.68 %)
21,084
(1.92 %)
22,287
(1.31 %)
n/a 40.74
(94.86 %)
83,929
(5.15 %)
112,850
(94.85 %)
5,109,404
(47.71 %)
734,754
(2.02 %)
15,854,134
(33.62 %)
36,070
(0.90 %)
459 malaria parasite P. falciparum (3D7 2016 genbank)
GCA_000002765.3
n/a n/a n/a n/a 19.34
(100.00 %)
n/a 16
(100.00 %)
79,857
(19.18 %)
78,154
(15.50 %)
186,960
(66.90 %)
22
(0.04 %)
460 Malayan pangolin (MP_PG03-UM 2016 genbank)
GCA_001685135.1
48,578
(30.31 %)
19,449
(1.56 %)
24,645
(1.37 %)
41,235
(1.95 %)
40.78
(92.27 %)
984,656
(7.81 %)
80,669
(100.00 %)
3,063,619
(35.20 %)
866,306
(3.08 %)
13,310,826
(28.76 %)
35,558
(0.84 %)
461 malo sina (v1 2012)
GCF_000231095.1
29,549
(16.44 %)
15,120
(6.45 %)
49,515
(30.69 %)
n/a 40.48
(93.32 %)
20,693
(6.71 %)
23,184
(93.29 %)
115,049
(2.29 %)
51,516
(1.90 %)
1,488,940
(24.12 %)
42,077
(12.05 %)
462 mangrove rivulus
GCF_001649575.1
45,293
(11.01 %)
14,510
(2.84 %)
29,750
(6.81 %)
n/a 40.03
(94.35 %)
29,388
(5.66 %)
3,073
(100.00 %)
345,930
(2.32 %)
146,268
(1.33 %)
4,717,260
(27.31 %)
39,557
(2.69 %)
463 meadow brown (genbank 2021)
GCA_905333055.1
29,488
(69.09 %)
4,863
(1.16 %)
19,812
(6.60 %)
27,763
(8.31 %)
36.96
(100.00 %)
21
(0.00 %)
32
(100.00 %)
227,482
(2.41 %)
107,773
(3.02 %)
2,456,144
(43.97 %)
24,873
(3.15 %)
464 meercat (VVHF042 2019 DNA Zoo genbank)
GCA_006229205.1
n/a 19,020
(1.63 %)
19,812
(1.43 %)
42,441
(2.08 %)
41.68
(99.72 %)
65,245
(0.28 %)
63,791
(100.00 %)
4,552,310
(40.02 %)
634,179
(1.21 %)
13,631,635
(32.17 %)
64,849
(2.13 %)
465 meerkat (BS45 2019 Broad)
GCA_004023905.1
n/a 21,726
(1.54 %)
31,908
(1.39 %)
n/a 41.89
(99.96 %)
4,153
(0.02 %)
354,021
(99.98 %)
4,835,157
(40.73 %)
693,037
(1.32 %)
13,779,279
(33.49 %)
76,740
(2.37 %)
466 melon fly (v1 USDA-PBARC White Pupae T1 2014)
GCF_000806345.1
26,008
(10.49 %)
7,743
(3.09 %)
12,206
(6.18 %)
n/a 35.15
(84.42 %)
37,430
(15.62 %)
43,002
(84.38 %)
237,943
(3.36 %)
74,977
(1.26 %)
2,410,203
(31.96 %)
15,259
(2.01 %)
467 Mexican gray wolf (hap1 2025 genbank)
GCA_048164855.1
n/a 19,584
(1.52 %)
20,783
(1.39 %)
n/a 41.56
(100.00 %)
167
(0.00 %)
250
(100.00 %)
4,643,072
(34.73 %)
1,102,137
(4.40 %)
13,591,414
(35.18 %)
53,471
(2.24 %)
468 Microcystis aeruginosa (PCC 7806 2024 genbank)
GCA_041506625.1
n/a n/a n/a n/a 42.08
(100.00 %)
n/a 1
(100.00 %)
n/a 1,266
(2.35 %)
23,848
(10.41 %)
410
(6.99 %)
469 microsporidians E.bieneusi (H348 2009 genbank)
GCA_000209485.1
n/a 238
(3.03 %)
394
(8.09 %)
n/a 33.70
(99.89 %)
437
(0.04 %)
1,743
(99.97 %)
1,511
(2.99 %)
268
(0.36 %)
31,900
(26.59 %)
373
(7.62 %)
470 microsporidians E.cuniculi (v1 GB-M1 2002)
GCF_000091225.1
1,996
(85.79 %)
1,569
(68.26 %)
596
(33.73 %)
n/a 47.31
(99.97 %)
4
(0.03 %)
15
(99.97 %)
257
(0.70 %)
199
(0.40 %)
10,819
(8.68 %)
126
(3.52 %)
471 microsporidians N.ceranae (BRL01 2009 genbank)
GCA_000182985.1
n/a 348
(2.68 %)
284
(3.31 %)
n/a 25.26
(99.86 %)
n/a 5,465
(100.00 %)
3,179
(1.99 %)
1,572
(1.39 %)
85,189
(41.34 %)
4
(0.02 %)
472 minke whale (2013 genbank)
GCA_000493695.1
42,553
(41.45 %)
19,298
(1.81 %)
18,661
(1.42 %)
n/a 40.94
(94.06 %)
173,296
(5.96 %)
184,071
(94.04 %)
4,041,828
(42.24 %)
573,950
(1.48 %)
13,504,295
(30.96 %)
65,448
(1.38 %)
473 minke whale (primary hap 2023 genbank)
GCA_949987535.1
61,711
(41.50 %)
19,544
(1.49 %)
21,502
(1.26 %)
n/a 41.55
(99.99 %)
1,177
(0.01 %)
1,375
(100.00 %)
4,006,932
(35.92 %)
1,058,106
(12.08 %)
12,708,154
(42.66 %)
72,756
(1.59 %)
474 mites & ticks V.jacobsoni (v1 VJ856 2017)
GCF_002532875.1
35,332
(12.83 %)
2,750
(0.61 %)
29,731
(8.07 %)
n/a 40.94
(99.89 %)
3,360
(0.11 %)
8,241
(99.89 %)
115,140
(1.18 %)
39,880
(0.71 %)
1,832,298
(14.55 %)
31,479
(5.12 %)
475 Mongolian gerbil (US013 2019 Broad)
GCA_004026785.1
n/a 21,302
(1.57 %)
27,162
(1.27 %)
40,982
(1.78 %)
41.88
(99.90 %)
11,139
(0.04 %)
796,326
(99.96 %)
5,253,752
(39.29 %)
1,211,658
(3.13 %)
13,894,596
(38.35 %)
24,829
(0.69 %)
476 monito del monte (mDroGli1 primary hap 2021 genbank)
GCA_019393635.1
47,034
(41.56 %)
18,428
(0.81 %)
15,519
(0.85 %)
n/a 39.11
(99.91 %)
260
(0.09 %)
18
(100.00 %)
7,426,369
(29.77 %)
1,249,638
(2.12 %)
21,135,395
(42.80 %)
16,598
(0.36 %)
477 moth C.splendana (v1 2021 genbank)
GCA_910591565.1
n/a 4,930
(0.75 %)
38,413
(8.53 %)
35,924
(4.55 %)
38.08
(99.99 %)
150
(0.01 %)
112
(100.00 %)
261,421
(1.99 %)
175,466
(5.62 %)
3,107,482
(46.30 %)
58,547
(5.75 %)
478 moth S.litura (Ishihara v1 2017)
GCF_002706865.1
25,114
(8.87 %)
5,088
(1.13 %)
22,625
(7.19 %)
n/a 36.56
(97.52 %)
10,662
(2.49 %)
13,637
(97.51 %)
154,017
(1.49 %)
50,642
(0.97 %)
2,919,487
(37.00 %)
34,396
(3.66 %)
479 mung bean (VC1973A 2015 genbank)
GCA_000741045.2
n/a 16,645
(3.88 %)
43,866
(14.64 %)
n/a 33.16
(92.79 %)
96,870
(7.25 %)
2,463
(100.00 %)
265,072
(3.32 %)
198,918
(3.34 %)
2,840,410
(34.89 %)
13,926
(1.48 %)
480 mute swan (bCygOlo1 v1 alternate hap 2019)
GCA_009769485.1
n/a 10,083
(1.97 %)
18,350
(2.23 %)
n/a 42.22
(100.00 %)
3
(0.00 %)
5,616
(100.00 %)
485,827
(7.06 %)
212,892
(1.28 %)
4,756,962
(19.95 %)
25,670
(3.87 %)
481 mute swan (v1 primary hap 2019)
GCA_009769625.1
n/a 12,973
(1.97 %)
22,300
(2.18 %)
n/a 41.92
(99.06 %)
446
(0.94 %)
181
(100.00 %)
688,720
(7.65 %)
301,358
(1.34 %)
6,775,217
(21.21 %)
31,271
(3.60 %)
482 naked mole-rat (NMR 29 2012 genbank)
GCA_000247695.1
74,574
(44.06 %)
21,317
(1.73 %)
20,856
(1.51 %)
n/a 40.21
(88.43 %)
110,424
(11.59 %)
114,652
(88.41 %)
4,162,977
(32.77 %)
484,933
(0.92 %)
13,672,503
(27.63 %)
31,950
(0.88 %)
483 narwhal (BS41 2019 Broad)
GCA_004026685.1
n/a 21,418
(1.52 %)
34,189
(1.28 %)
n/a 41.35
(99.92 %)
8,600
(0.03 %)
653,473
(99.97 %)
4,512,168
(44.82 %)
592,047
(1.17 %)
13,009,453
(37.18 %)
63,033
(1.47 %)
484 Natterer's bat (hap1.1 2024)
GCA_964212035.1
n/a 19,180
(1.72 %)
22,635
(1.71 %)
n/a 43.18
(99.99 %)
1,620
(0.02 %)
343
(100.00 %)
3,081,500
(24.27 %)
797,071
(5.37 %)
10,372,159
(38.30 %)
64,460
(2.57 %)
485 Natterer's bat (hap2.1 2024)
GCA_964212025.1
n/a 18,275
(1.81 %)
21,799
(1.80 %)
n/a 43.28
(99.99 %)
1,387
(0.01 %)
1,706
(99.99 %)
2,833,193
(23.73 %)
705,278
(5.10 %)
9,802,564
(36.67 %)
61,024
(2.68 %)
486 Nelson's sparrow (bAmmNel1 primary hap 2023 genbank)
GCA_027579445.1
31,033
(46.15 %)
12,385
(1.72 %)
24,339
(2.24 %)
n/a 43.01
(99.57 %)
215
(0.43 %)
77
(100.00 %)
479,994
(3.33 %)
443,098
(9.18 %)
6,350,593
(25.82 %)
31,693
(3.88 %)
487 nematode C.briggsae (AF16 v1 2008)
GCF_000004555.1
19,404
(22.65 %)
12,088
(12.63 %)
7,533
(12.85 %)
n/a 37.35
(97.22 %)
6,713
(2.80 %)
607
(99.95 %)
116,909
(19.60 %)
45,475
(4.23 %)
820,686
(35.42 %)
4,887
(1.65 %)
488 New South Wales waratah (AGSP 2013)
GCF_000471905.2
36,181
(5.65 %)
10,150
(1.34 %)
42,117
(8.90 %)
n/a 37.47
(94.63 %)
39,556
(5.39 %)
45,302
(94.61 %)
396,916
(3.25 %)
506,716
(6.41 %)
4,768,175
(36.07 %)
17,009
(0.90 %)
489 nine-banded armadillo (v1 hap1 2023)
GCA_030445055.1
n/a 19,429
(1.06 %)
22,396
(1.07 %)
n/a 40.96
(99.27 %)
845
(0.73 %)
594
(100.00 %)
4,369,568
(32.83 %)
673,707
(1.55 %)
18,586,102
(42.41 %)
131,852
(2.78 %)
490 nine-banded armadillo (v1 hap2 2023)
GCF_030445035.1
69,043
(2.70 %)
20,516
(1.05 %)
n/a n/a 41.00
(99.68 %)
771
(0.32 %)
539
(100.00 %)
4,656,325
(32.86 %)
726,574
(1.99 %)
19,585,522
(43.65 %)
140,990
(2.86 %)
491 nine-banded armadillo (v3.0 3-136 2012 Baylor genbank)
GCA_000208655.2
n/a 21,293
(1.15 %)
25,302
(1.09 %)
n/a 40.77
(90.89 %)
268,442
(9.13 %)
314,971
(90.87 %)
5,327,246
(49.09 %)
651,311
(1.26 %)
19,267,381
(38.27 %)
139,552
(2.47 %)
492 nine-banded armadillo (v3.0 3-136 2012 Baylor refseq)
GCF_000208655.1
46,131
(1.87 %)
21,316
(1.15 %)
25,308
(1.09 %)
n/a 40.77
(90.89 %)
268,442
(9.13 %)
314,972
(90.87 %)
5,328,146
(49.10 %)
651,316
(1.26 %)
19,267,438
(38.27 %)
139,552
(2.47 %)
493 North Atlantic right whale (hap2 2023 genbank)
GCA_028564815.1
n/a 19,541
(1.47 %)
21,516
(1.25 %)
n/a 41.69
(99.83 %)
363
(0.17 %)
779
(100.00 %)
1,361,117
(2.23 %)
836,632
(13.12 %)
12,597,969
(44.00 %)
93,862
(1.92 %)
494 northern elephant seal (v2 JK_09032017 2021)
GCF_021288785.1
49,934
(2.73 %)
20,106
(1.74 %)
20,957
(1.35 %)
n/a 41.51
(99.35 %)
39,936
(0.65 %)
142,455
(100.00 %)
4,434,732
(35.01 %)
588,877
(1.19 %)
13,745,426
(32.96 %)
52,064
(1.59 %)
495 northern goshawk (v1 primary hap 2022 refseq)
GCF_929443795.1
50,662
(4.74 %)
13,528
(1.65 %)
24,595
(1.99 %)
n/a 43.78
(100.00 %)
183
(0.00 %)
454
(100.00 %)
521,768
(3.86 %)
325,987
(9.82 %)
5,542,269
(27.30 %)
43,070
(4.44 %)
496 northern house mosquito (v1 TS 2021)
GCF_016801865.1
28,512
(7.14 %)
5,830
(1.09 %)
39,806
(8.27 %)
n/a 36.76
(100.00 %)
n/a 1,714
(100.00 %)
222,294
(5.58 %)
187,561
(9.87 %)
3,009,613
(56.49 %)
63,009
(9.78 %)
497 northern pike (primary hap 2020 genbank)
GCA_011004845.1
63,720
(60.35 %)
16,616
(2.41 %)
55,784
(5.64 %)
82,918
(8.82 %)
42.22
(99.89 %)
112
(0.11 %)
53
(100.00 %)
1,039,521
(30.93 %)
524,708
(7.32 %)
4,691,094
(32.91 %)
42,910
(2.52 %)
498 northern white-cheeked gibbon (2012 GGSC)
GCA_000146795.3
n/a 20,134
(1.89 %)
18,568
(1.14 %)
n/a 40.76
(93.09 %)
180,468
(6.94 %)
197,908
(93.06 %)
5,169,984
(51.90 %)
831,865
(4.16 %)
15,243,657
(35.77 %)
65,761
(1.00 %)
499 Norway rat BN7 genbank
GCA_015227675.2
97,432
(43.01 %)
21,523
(1.86 %)
19,627
(1.36 %)
54,530
(2.79 %)
41.99
(99.19 %)
581
(0.81 %)
757
(99.19 %)
4,895,563
(44.53 %)
1,514,974
(3.57 %)
13,450,428
(35.83 %)
19,244
(0.46 %)
500 olive baboon (2017 HGSC genbank)
GCA_000264685.2
n/a 20,319
(1.82 %)
21,542
(1.19 %)
n/a 40.99
(99.25 %)
58,981
(0.76 %)
118,810
(99.24 %)
5,524,514
(52.78 %)
1,068,912
(5.55 %)
16,068,031
(38.71 %)
95,595
(1.41 %)
501 olive baboon (2017 HGSC RefSeq)
GCF_000264685.3
84,433
(3.85 %)
20,317
(1.83 %)
21,239
(1.18 %)
n/a 40.99
(99.25 %)
58,981
(0.76 %)
118,811
(99.24 %)
5,525,293
(52.79 %)
1,068,912
(5.55 %)
16,068,088
(38.71 %)
95,595
(1.41 %)
502 oriental river prawn (v1 FS-2020 2020 genbank)
GCA_015104395.1
n/a 1,945
(0.08 %)
23,579
(1.88 %)
n/a 36.81
(99.60 %)
16,132
(0.41 %)
16,156
(99.59 %)
2,706,474
(10.11 %)
2,525,264
(12.75 %)
9,704,257
(48.31 %)
77,313
(3.01 %)
503 painted lady (genbank 2021)
GCA_905220365.1
20,948
(56.23 %)
4,705
(1.06 %)
15,277
(5.00 %)
29,018
(10.11 %)
33.42
(99.99 %)
91
(0.01 %)
37
(100.00 %)
209,233
(2.16 %)
56,676
(1.12 %)
3,372,591
(44.40 %)
13,547
(2.72 %)
504 pale spear-nosed bat (MPI-MPIP v1 2019)
GCF_004126475.1
35,529
(2.39 %)
18,185
(1.70 %)
20,184
(1.64 %)
41,094
(3.29 %)
42.38
(98.92 %)
831
(1.08 %)
141
(100.00 %)
3,072,951
(30.02 %)
385,608
(0.80 %)
12,060,365
(30.47 %)
64,081
(4.30 %)
505 pea aphid (AL4f v1 2019)
GCF_005508785.1
31,681
(7.81 %)
4,257
(0.79 %)
16,323
(3.39 %)
n/a 29.76
(92.38 %)
46,297
(7.65 %)
21,920
(100.00 %)
768,383
(18.87 %)
135,468
(2.11 %)
4,536,093
(48.39 %)
16,332
(2.13 %)
506 peregrine falcon (bFalPer1 primary hap 2022 genbank)
GCA_023634155.1
49,100
(50.44 %)
13,025
(1.67 %)
24,167
(2.02 %)
n/a 42.65
(99.69 %)
232
(0.31 %)
124
(100.00 %)
586,316
(11.83 %)
335,214
(8.05 %)
7,038,700
(24.65 %)
26,085
(2.25 %)
507 pig-tailed macaque (mMacNem1hap1 2024 genbank)
GCA_043159975.1
n/a 20,768
(1.76 %)
21,550
(1.18 %)
n/a 41.04
(100.00 %)
260
(0.00 %)
362
(100.00 %)
5,387,919
(53.48 %)
1,027,640
(9.31 %)
15,407,988
(41.73 %)
99,854
(1.52 %)
508 pigeon pea (v1 2016 BGI)
GCF_000340665.1
46,646
(9.41 %)
17,409
(3.12 %)
51,529
(12.74 %)
48,654
(8.33 %)
32.79
(94.21 %)
36,387
(5.81 %)
72,923
(94.19 %)
400,327
(3.60 %)
306,656
(4.69 %)
3,754,630
(39.24 %)
26,578
(2.89 %)
509 pike-perch
GCF_008315115.1
56,221
(8.23 %)
15,677
(2.23 %)
29,967
(5.65 %)
62,989
(6.22 %)
40.92
(100.00 %)
94
(0.00 %)
1,313
(100.00 %)
591,660
(5.05 %)
569,876
(7.39 %)
4,713,605
(36.32 %)
39,545
(1.93 %)
510 platypus (Pmale09 2018 BGI)
GCA_002966995.1
n/a 15,042
(1.17 %)
19,939
(1.55 %)
n/a 46.64
(100.00 %)
476
(0.00 %)
4,568
(100.00 %)
5,326,862
(52.88 %)
879,598
(5.00 %)
9,545,961
(50.95 %)
94,468
(9.28 %)
511 platypus (Pmale09 v1 2019)
GCF_004115215.1
56,695
(3.09 %)
14,805
(1.26 %)
18,918
(1.63 %)
42,516
(2.60 %)
46.13
(99.18 %)
522
(0.82 %)
305
(100.00 %)
5,099,803
(51.62 %)
577,434
(2.88 %)
9,110,403
(48.91 %)
87,829
(7.91 %)
512 platypus (Pmale09 v3 2020)
GCA_004115215.3
n/a 14,805
(1.26 %)
18,888
(1.63 %)
n/a 46.14
(99.18 %)
515
(0.82 %)
322
(100.00 %)
5,101,303
(51.62 %)
578,617
(2.89 %)
9,113,847
(48.93 %)
87,861
(7.92 %)
513 polar bear (Baiyulong BGI 2014 genbank)
GCA_000687225.1
35,751
(39.94 %)
18,495
(1.67 %)
15,243
(1.37 %)
n/a 41.65
(98.35 %)
110,343
(1.67 %)
134,161
(98.33 %)
4,221,025
(40.96 %)
553,193
(1.29 %)
13,765,526
(29.91 %)
54,906
(1.17 %)
514 Porcisia hertigi (C119 2021 genbank)
GCA_017918235.1
n/a 695
(1.21 %)
2,951
(42.86 %)
n/a 56.02
(100.00 %)
5
(0.00 %)
74
(100.00 %)
41,628
(4.32 %)
12,596
(4.67 %)
201,002
(23.43 %)
106
(99.30 %)
515 prehistoric monster fish (2019 genbank)
GCA_902500255.1
45,404
(55.83 %)
14,654
(0.76 %)
72,609
(2.41 %)
57,391
(2.04 %)
41.99
(99.49 %)
2,554
(0.51 %)
464
(100.00 %)
1,311,131
(2.79 %)
786,401
(3.65 %)
9,901,286
(59.90 %)
172,199
(5.45 %)
516 pronghorn (BS35 2019 Broad)
GCA_004027515.1
n/a 24,094
(1.34 %)
35,119
(1.27 %)
n/a 41.97
(99.87 %)
6,569
(0.02 %)
1,649,700
(99.98 %)
5,613,563
(41.47 %)
652,408
(1.55 %)
13,943,055
(43.64 %)
61,057
(1.17 %)
517 Przewalski's horse (Burgud 2014 genbank)
GCA_000696695.1
45,076
(35.88 %)
19,564
(1.68 %)
22,124
(1.36 %)
n/a 41.27
(99.13 %)
80,963
(0.88 %)
134,059
(99.12 %)
3,917,534
(41.44 %)
435,606
(1.73 %)
14,738,354
(28.36 %)
40,752
(0.94 %)
518 Puerto Rican coqui (hap1 2024 genbank)
GCA_035609145.1
n/a 13,881
(0.57 %)
32,313
(1.67 %)
n/a 44.91
(100.00 %)
659
(0.00 %)
963
(100.00 %)
1,044,181
(1.98 %)
1,442,189
(16.51 %)
14,710,175
(54.00 %)
501,931
(8.81 %)
519 puma (SC36_Marlon 2018 genbank)
GCA_003327715.1
25,575
(34.74 %)
17,665
(1.56 %)
16,565
(1.29 %)
n/a 41.36
(95.34 %)
178,992
(4.69 %)
2,174
(100.00 %)
4,884,619
(42.70 %)
833,136
(1.76 %)
13,705,706
(31.28 %)
58,912
(1.65 %)
520 pygmy chimpanzee (Ulindi genbank 2015)
GCA_000258655.2
59,332
(37.06 %)
19,951
(1.94 %)
19,039
(1.18 %)
n/a 40.74
(82.95 %)
156,797
(17.06 %)
121,337
(82.94 %)
5,136,492
(50.91 %)
775,493
(1.63 %)
15,570,612
(30.28 %)
43,049
(0.71 %)
521 pygmy chimpanzee (v1 primary hap 2023)
GCF_029289425.1
88,587
(3.87 %)
20,765
(1.73 %)
22,666
(1.18 %)
n/a 40.49
(99.96 %)
8
(0.04 %)
443
(100.00 %)
5,487,575
(50.65 %)
1,054,555
(12.79 %)
15,952,698
(43.80 %)
53,329
(1.37 %)
522 pygmy sperm whale (mKogBre1 haplotype 1 2022 genbank)
GCA_026419965.1
56,261
(41.31 %)
18,495
(1.55 %)
20,718
(1.32 %)
n/a 42.05
(99.81 %)
143
(0.19 %)
580
(100.00 %)
3,817,653
(34.51 %)
758,297
(7.42 %)
12,196,926
(39.96 %)
101,353
(2.90 %)
523 rabbit (New Zealand White DNA-2018 2021 genbank)
GCA_009806435.2
n/a 19,480
(1.31 %)
23,335
(1.31 %)
n/a 43.83
(97.68 %)
18,178
(2.32 %)
3,159
(100.00 %)
4,179,975
(0.00 %)
976,271
(2.33 %)
13,766,353
(39.76 %)
113,370
(2.46 %)
524 rabbit (primary hap 2024 genbank)
GCA_964237555.1
n/a 19,386
(1.31 %)
22,863
(1.35 %)
n/a 44.02
(99.98 %)
2,276
(0.02 %)
222
(100.00 %)
4,099,590
(21.20 %)
1,062,902
(3.78 %)
13,416,878
(41.72 %)
116,524
(2.66 %)
525 rabbit (Thorbecke 2009 Broad genbank)
GCA_000003625.1
n/a 18,676
(1.38 %)
20,095
(1.24 %)
n/a 43.75
(95.14 %)
80,789
(4.88 %)
84,024
(95.12 %)
4,884,561
(44.65 %)
883,943
(1.73 %)
13,254,559
(38.27 %)
110,338
(2.33 %)
526 radish (v1 WS10039 2015)
GCF_000801105.1
69,941
(20.66 %)
33,762
(10.20 %)
70,765
(28.80 %)
n/a 35.29
(87.22 %)
28,041
(12.80 %)
10,676
(100.00 %)
196,483
(2.53 %)
150,132
(3.32 %)
2,256,858
(26.65 %)
23,381
(2.80 %)
527 red admiral (genbank 2021)
GCA_905147765.2
n/a 4,641
(1.20 %)
13,258
(4.79 %)
32,725
(10.42 %)
32.84
(100.00 %)
18
(0.00 %)
142
(100.00 %)
184,094
(2.52 %)
41,639
(1.23 %)
3,193,736
(41.82 %)
10,747
(2.25 %)
528 red mason bee (LIB18336 2019)
GCF_004153925.1
26,926
(16.13 %)
4,185
(2.08 %)
24,859
(11.07 %)
n/a 39.77
(99.98 %)
2,089
(0.02 %)
10,222
(100.00 %)
88,278
(1.96 %)
74,016
(3.78 %)
1,305,254
(28.61 %)
10,712
(6.90 %)
529 red-crested turaco (2014 BGI)
GCF_000709365.1
16,151
(2.15 %)
12,046
(1.50 %)
25,077
(1.98 %)
n/a 41.63
(99.43 %)
75,085
(0.59 %)
134,672
(99.41 %)
401,465
(6.41 %)
153,694
(0.86 %)
6,705,299
(20.45 %)
30,183
(1.07 %)
530 red-legged seriema (BGI_N322 2014 BGI)
GCF_000690535.1
16,238
(2.21 %)
12,016
(1.53 %)
23,985
(1.93 %)
n/a 41.20
(99.63 %)
59,230
(0.38 %)
112,704
(99.62 %)
322,026
(4.02 %)
121,725
(0.68 %)
6,797,850
(18.25 %)
18,873
(0.62 %)
531 red-throated loon (hap2 2023 genbank)
GCA_030936135.1
25,173
(40.74 %)
13,218
(1.71 %)
28,120
(2.39 %)
n/a 43.11
(100.00 %)
249
(0.00 %)
1,195
(100.00 %)
544,427
(8.81 %)
223,674
(5.77 %)
6,669,469
(23.63 %)
38,306
(3.37 %)
532 reedfish (2019)
GCF_900747795.1
40,545
(1.73 %)
13,154
(0.46 %)
24,028
(1.29 %)
34,856
(1.34 %)
39.44
(93.75 %)
5,614
(6.25 %)
1,885
(100.00 %)
1,834,613
(2.79 %)
1,018,031
(2.36 %)
20,081,632
(44.56 %)
88,254
(1.06 %)
533 Rhesus monkey (2015 Baylor)
GCA_000772875.3
n/a 20,558
(1.71 %)
22,141
(1.12 %)
n/a 40.95
(97.08 %)
64,538
(2.91 %)
348,579
(97.09 %)
5,846,699
(54.61 %)
1,429,378
(9.24 %)
16,512,587
(40.26 %)
98,572
(1.29 %)
534 Rice's whale (hap2 2023 genbank)
GCA_028023285.1
59,888
(43.60 %)
19,291
(1.53 %)
21,195
(1.30 %)
n/a 41.44
(99.90 %)
334
(0.10 %)
774
(100.00 %)
3,917,923
(36.26 %)
828,521
(9.28 %)
12,518,796
(41.08 %)
73,126
(1.69 %)
535 rifleman (BGI 2014)
GCF_000695815.1
16,166
(2.37 %)
12,054
(1.65 %)
23,851
(2.04 %)
n/a 41.63
(99.55 %)
66,437
(0.46 %)
120,312
(99.54 %)
392,481
(7.69 %)
217,040
(2.27 %)
5,855,355
(18.33 %)
7,602
(0.24 %)
536 ring-tailed lemur BS26 Broad 2019
GCA_004024665.1
n/a 21,125
(1.90 %)
29,864
(1.51 %)
65,909
(1.91 %)
41.13
(99.93 %)
4,599
(0.02 %)
580,026
(99.98 %)
3,840,645
(39.25 %)
675,921
(1.83 %)
13,841,750
(31.45 %)
59,440
(1.72 %)
537 Rio pearlfish (Nwh7 v1 2020)
GCF_014905685.1
25,353
(3.88 %)
14,334
(1.56 %)
58,475
(4.46 %)
n/a 41.06
(92.01 %)
100,521
(8.02 %)
18,998
(100.00 %)
642,988
(3.38 %)
444,158
(3.06 %)
6,203,124
(42.81 %)
52,308
(2.11 %)
538 river trout (v1 2019)
GCF_901001165.1
102,785
(6.02 %)
27,413
(1.62 %)
51,424
(4.17 %)
121,979
(5.28 %)
43.36
(96.90 %)
3,941
(3.10 %)
1,441
(100.00 %)
1,438,988
(5.72 %)
1,789,507
(15.87 %)
9,819,761
(52.37 %)
70,821
(1.77 %)
539 rock pigeon (v1 racing homer maternal hap 2024)
GCA_036010775.1
n/a 12,450
(1.75 %)
25,274
(2.35 %)
n/a 42.27
(100.00 %)
192
(0.00 %)
673
(100.00 %)
586,422
(10.85 %)
392,341
(12.38 %)
5,521,172
(28.56 %)
33,479
(3.29 %)
540 rock pigeon (v1 racing homer paternal W 2024)
GCA_036013475.1
n/a 13,145
(1.66 %)
28,883
(2.53 %)
n/a 42.00
(100.00 %)
248
(0.00 %)
870
(100.00 %)
656,923
(11.76 %)
412,678
(12.92 %)
6,047,578
(29.90 %)
36,847
(3.12 %)
541 rock pigeon (v2 racing homer 2024 genbank)
GCA_036013475.2
n/a 13,146
(1.66 %)
25,463
(2.12 %)
n/a 42.00
(100.00 %)
249
(0.00 %)
870
(100.00 %)
656,969
(11.76 %)
412,670
(12.92 %)
6,047,584
(29.90 %)
36,847
(3.12 %)
542 rock ptarmigan (primary hap 2022 genbank)
GCA_023343835.1
51,619
(61.28 %)
12,831
(2.31 %)
n/a n/a 41.57
(99.99 %)
210
(0.01 %)
164
(100.00 %)
667,924
(11.59 %)
268,431
(2.63 %)
5,885,274
(21.73 %)
21,346
(2.37 %)
543 rose-grain aphid (CAU 2021 genbank)
GCA_019925205.1
n/a 4,332
(0.82 %)
15,532
(3.91 %)
n/a 30.24
(99.98 %)
240
(0.02 %)
67
(100.00 %)
481,097
(4.72 %)
135,266
(7.01 %)
4,093,473
(52.65 %)
12,709
(2.68 %)
544 rough bullseye (RE-2024b hap1 2024 genbank)
GCA_042242105.1
n/a 14,592
(2.84 %)
44,299
(6.93 %)
n/a 41.85
(100.00 %)
87
(0.00 %)
442
(100.00 %)
1,764,545
(30.13 %)
271,391
(5.93 %)
3,651,092
(24.53 %)
19,771
(1.39 %)
545 royal ground snake (hap1 2023 genbank)
GCA_031021105.1
n/a 13,327
(0.96 %)
20,347
(1.68 %)
n/a 41.25
(99.99 %)
1,391
(0.01 %)
400
(100.00 %)
1,983,903
(10.40 %)
1,698,731
(7.29 %)
9,084,707
(53.44 %)
130,852
(4.47 %)
546 Ryukyu mouse (v1 2017 EBI genbank)
GCA_900094665.2
53,779
(39.43 %)
21,304
(2.26 %)
18,211
(1.40 %)
n/a 41.70
(89.05 %)
306,650
(10.98 %)
30,919
(92.71 %)
4,878,260
(40.08 %)
1,351,707
(2.59 %)
12,965,226
(27.49 %)
16,050
(0.44 %)
547 Ryukyu mouse (v1 2017 EBI refseq)
GCF_900094665.1
53,855
(2.85 %)
21,291
(2.26 %)
19,256
(1.49 %)
96,713
(4.05 %)
41.70
(89.05 %)
306,650
(10.98 %)
30,920
(92.71 %)
4,749,528
(39.06 %)
1,351,707
(2.59 %)
12,965,297
(27.49 %)
16,050
(0.44 %)
548 saddleback dolphin (v1 primary hap 2023 genbank)
GCA_949987515.1
46,746
(40.70 %)
18,625
(1.49 %)
20,451
(1.28 %)
n/a 42.06
(99.99 %)
968
(0.01 %)
631
(100.00 %)
4,020,682
(35.99 %)
1,259,549
(13.09 %)
12,359,818
(42.64 %)
66,179
(3.91 %)
549 Saker falcon (bFalChe1 primary hap 2022 genbank)
GCA_023634085.1
50,290
(50.75 %)
12,971
(1.67 %)
23,351
(2.02 %)
n/a 43.15
(99.70 %)
258
(0.30 %)
282
(100.00 %)
548,087
(7.21 %)
201,482
(8.55 %)
7,030,761
(24.94 %)
31,791
(2.57 %)
550 salmon louse (v1.1 2020)
GCF_016086655.2
27,164
(5.26 %)
3,465
(0.45 %)
3,673
(1.75 %)
n/a 30.90
(99.99 %)
608
(0.01 %)
10,436
(99.99 %)
1,394,872
(53.53 %)
76,419
(1.13 %)
6,311,228
(43.85 %)
647
(0.04 %)
551 saltmarsh sparrow (bAmmCau1 primary hap 2023 genbank)
GCA_027887145.1
27,528
(42.80 %)
12,832
(1.69 %)
25,514
(2.23 %)
n/a 43.50
(99.76 %)
363
(0.24 %)
282
(100.00 %)
541,958
(3.43 %)
566,692
(13.38 %)
6,205,274
(28.98 %)
35,549
(5.05 %)
552 San Diegan tiger whiptail (v1.0 HBS 135688 primary hap 2022)
GCA_023333525.1
n/a 10,727
(1.18 %)
14,669
(1.99 %)
n/a 43.32
(100.00 %)
39
(0.00 %)
113
(100.00 %)
741,937
(6.29 %)
448,194
(5.60 %)
7,227,870
(36.97 %)
42,621
(2.15 %)
553 Sardinian treefrog (hap1 2023 genbank)
GCA_029499605.1
108,406
(45.40 %)
13,961
(0.46 %)
36,603
(1.55 %)
n/a 43.90
(99.99 %)
2,297
(0.01 %)
3,475
(100.00 %)
1,903,658
(2.85 %)
2,970,695
(16.56 %)
15,354,615
(64.31 %)
652,708
(8.36 %)
554 SARS-CoV-2 (Jan 2020 COVID-19)
GCF_009858895.2
n/a n/a n/a n/a 37.98
(99.99 %)
n/a 1
(100.00 %)
5
(0.24 %)
1
(0.11 %)
33
(1.38 %)
1
(0.73 %)
555 Schreibers' long-fingered bat (v1 hap1 2024)
GCA_964146895.1
n/a 17,882
(1.96 %)
21,291
(1.88 %)
n/a 42.53
(99.99 %)
1,322
(0.01 %)
265
(100.00 %)
2,639,522
(28.12 %)
453,024
(5.66 %)
10,206,715
(31.11 %)
59,363
(2.86 %)
556 Schreibers' long-fingered bat (v1 hap2 2024)
GCA_964145185.1
n/a 17,115
(2.05 %)
19,972
(1.93 %)
n/a 42.62
(99.99 %)
1,137
(0.01 %)
1,305
(99.99 %)
2,445,695
(27.61 %)
386,295
(4.40 %)
9,657,997
(29.32 %)
56,451
(2.93 %)
557 sea anemones (CC7 2015 genbank)
GCA_001417965.1
29,778
(59.32 %)
3,020
(1.06 %)
13,146
(12.99 %)
30,497
(24.04 %)
36.33
(82.34 %)
637,478
(17.95 %)
4,312
(100.00 %)
74,671
(1.98 %)
63,328
(2.24 %)
1,417,036
(20.33 %)
2,099
(0.38 %)
558 sea lamprey (kPetMar1 primary hap 2020)
GCA_010993605.1
n/a 8,130
(0.73 %)
36,343
(4.06 %)
n/a 48.31
(98.62 %)
930
(1.38 %)
1,433
(100.00 %)
3,309,659
(59.73 %)
1,194,161
(21.47 %)
5,320,564
(50.50 %)
178,590
(35.88 %)
559 sea otter (GAN:26980312 2017 genbank)
GCA_002288905.2
n/a 18,591
(1.64 %)
20,913
(1.44 %)
34,142
(1.77 %)
41.56
(98.79 %)
23,134
(1.21 %)
29,588
(98.79 %)
4,702,292
(41.42 %)
721,749
(1.39 %)
14,065,592
(32.89 %)
55,388
(1.87 %)
560 segmented worms (v1 2012)
GCF_000326865.1
23,426
(13.46 %)
2,741
(0.95 %)
3,156
(4.19 %)
n/a 32.82
(91.54 %)
11,185
(8.47 %)
12,292
(91.53 %)
572,062
(30.90 %)
474,390
(10.49 %)
1,741,644
(44.75 %)
3,489
(0.51 %)
561 siamang (v1 Jambi primary hap 2023)
GCF_028878055.1
79,118
(2.62 %)
20,139
(1.70 %)
21,232
(1.14 %)
n/a 40.62
(100.00 %)
1
(0.00 %)
606
(100.00 %)
5,278,880
(55.89 %)
946,219
(14.68 %)
14,395,605
(46.26 %)
95,573
(1.75 %)
562 siamang (v2 Jambi alternate hap 2024)
GCA_028878085.2
n/a 19,572
(1.70 %)
20,107
(1.11 %)
n/a 40.45
(99.93 %)
3
(0.07 %)
40
(100.00 %)
5,057,491
(55.54 %)
869,279
(15.07 %)
14,090,400
(46.04 %)
87,907
(1.41 %)
563 siamang (v2 Jambi primary hap 2024 genbank)
GCA_028878055.2
105,360
(44.53 %)
20,433
(1.69 %)
21,357
(1.12 %)
n/a 40.42
(99.97 %)
1
(0.03 %)
26
(100.00 %)
5,354,441
(55.80 %)
935,620
(14.70 %)
14,917,483
(46.01 %)
92,243
(1.42 %)
564 siamang (v2 Jambi primary hap 2024 refseq)
GCF_028878055.2
105,373
(3.05 %)
20,434
(1.69 %)
21,357
(1.12 %)
n/a 40.42
(99.97 %)
2
(0.03 %)
27
(100.00 %)
5,354,446
(55.80 %)
935,620
(14.70 %)
14,917,515
(46.01 %)
92,243
(1.42 %)
565 Siamese fighting fish (v2 primary hap 2019)
GCF_900634795.2
54,389
(16.95 %)
14,745
(4.21 %)
34,348
(10.09 %)
62,673
(13.02 %)
45.30
(99.99 %)
328
(0.01 %)
70
(100.00 %)
252,955
(3.51 %)
184,269
(4.62 %)
2,010,934
(23.88 %)
72,126
(13.08 %)
566 Siamese fighting fish (v3 primary hap 2020)
GCF_900634795.3
54,864
(17.78 %)
14,745
(4.20 %)
56,808
(10.87 %)
69,466
(16.34 %)
45.30
(99.99 %)
328
(0.01 %)
70
(100.00 %)
255,550
(3.51 %)
184,269
(4.62 %)
2,010,934
(23.88 %)
72,126
(13.08 %)
567 silvery gibbon (v1 HM0894 2020 UC Santa Cruz)
GCF_009828535.1
54,238
(2.74 %)
17,887
(2.00 %)
18,517
(1.25 %)
n/a 41.17
(98.20 %)
18,567
(1.80 %)
18,392
(100.00 %)
4,399,357
(50.55 %)
711,948
(2.37 %)
12,623,705
(36.55 %)
67,835
(1.30 %)
568 silvery gibbon (v2 HMO894 2020 UC Santa Cruz)
GCF_009828535.2
63,475
(2.65 %)
20,581
(1.94 %)
21,181
(1.20 %)
41,252
(1.46 %)
41.02
(97.81 %)
25,106
(2.19 %)
18,395
(100.00 %)
5,332,131
(51.09 %)
857,562
(2.26 %)
15,565,289
(36.84 %)
80,124
(1.26 %)
569 slow loris (BS32 2019)
GCA_004027815.1
n/a 26,771
(1.11 %)
44,247
(1.00 %)
n/a 40.68
(99.86 %)
9,648
(0.03 %)
1,946,791
(99.97 %)
6,230,312
(41.68 %)
688,924
(1.23 %)
16,892,392
(43.00 %)
39,326
(0.65 %)
570 slow loris (primary hap 2022 genbank)
GCA_027406575.1
67,213
(41.75 %)
22,195
(1.49 %)
21,341
(1.28 %)
n/a 40.82
(99.86 %)
218
(0.14 %)
85
(100.00 %)
4,625,875
(39.88 %)
579,984
(1.59 %)
14,405,402
(40.78 %)
38,257
(0.77 %)
571 small Madagascar hedgehog
GCA_000313985.1
n/a 19,066
(1.18 %)
19,334
(1.31 %)
n/a 43.01
(88.44 %)
269,444
(11.60 %)
277,845
(88.40 %)
3,789,866
(28.89 %)
429,318
(0.87 %)
16,950,647
(32.23 %)
39,994
(0.70 %)
572 smaller spotted catshark (v1.1 primary hap 2020 refseq)
GCF_902713615.1
55,749
(1.62 %)
12,597
(0.36 %)
23,987
(1.08 %)
n/a 47.65
(98.48 %)
7,146
(1.52 %)
646
(100.00 %)
1,185,832
(1.72 %)
1,448,620
(6.25 %)
20,884,767
(51.41 %)
456,658
(8.18 %)
573 smalleye Pacific opah (hap2 2023 genbank)
GCA_029633865.1
n/a 13,617
(1.10 %)
74,639
(4.12 %)
n/a 44.94
(99.96 %)
3,115
(0.04 %)
544
(100.00 %)
4,603,649
(53.23 %)
1,009,241
(18.00 %)
5,236,063
(51.65 %)
143,632
(7.43 %)
574 smalltooth sawfish (v2 primary hap 2019 genbank)
GCA_009764475.1
n/a 11,828
(0.66 %)
18,627
(1.55 %)
n/a 42.38
(99.09 %)
698
(0.91 %)
173
(100.00 %)
405,021
(1.14 %)
391,531
(1.52 %)
11,282,302
(38.19 %)
45,398
(1.34 %)
575 snowberry fruit fly (East Lansing v1.0 2016)
GCF_001687245.1
37,836
(4.45 %)
10,526
(1.07 %)
59,331
(6.34 %)
n/a 36.53
(93.84 %)
227,684
(6.18 %)
139,583
(93.83 %)
653,914
(2.87 %)
386,956
(5.71 %)
7,364,314
(43.00 %)
60,636
(4.05 %)
576 sockeye salmon (On170113-E2 v1 2019)
GCF_006149115.1
76,167
(6.12 %)
24,114
(1.71 %)
51,371
(4.08 %)
102,891
(5.24 %)
43.39
(96.16 %)
25,659
(3.84 %)
38,027
(99.99 %)
1,300,179
(8.96 %)
1,465,690
(10.81 %)
8,849,714
(48.44 %)
64,215
(1.55 %)
577 South Georgia icefish (v1 primary hap 2020)
GCF_902827115.1
41,307
(6.47 %)
14,776
(1.79 %)
68,734
(6.16 %)
61,643
(5.52 %)
42.07
(99.94 %)
2,461
(0.06 %)
1,563
(100.00 %)
498,451
(3.42 %)
474,032
(7.20 %)
3,613,731
(45.83 %)
88,984
(4.31 %)
578 southern bluefin tuna (primary hap 2021 genbank)
GCA_910596095.1
58,416
(66.24 %)
15,695
(2.61 %)
42,730
(5.74 %)
n/a 39.73
(100.00 %)
95
(0.00 %)
58
(100.00 %)
1,591,314
(33.50 %)
247,764
(2.94 %)
5,176,850
(26.85 %)
14,097
(0.88 %)
579 southern cattle tick (Rmic-2018 2020 genbank)
GCA_013339725.1
n/a 3,698
(0.12 %)
117,910
(5.00 %)
35,315
(1.88 %)
45.79
(99.99 %)
1,576
(0.01 %)
7,048
(100.00 %)
770,997
(2.03 %)
680,149
(3.55 %)
10,994,272
(39.37 %)
304,620
(17.03 %)
580 southern grasshopper mouse (US017 2019 Broad)
GCA_004026725.1
n/a 24,302
(1.12 %)
43,055
(0.98 %)
n/a 41.63
(99.82 %)
10,550
(0.03 %)
2,272,285
(99.97 %)
5,668,964
(24.75 %)
1,628,683
(5.38 %)
15,658,806
(41.85 %)
21,801
(0.44 %)
581 southern house mosquito (JHB 2007 genbank)
GCA_000209185.1
n/a 5,905
(1.14 %)
41,195
(8.84 %)
n/a 37.42
(93.28 %)
45,500
(6.75 %)
48,671
(93.25 %)
738,398
(35.22 %)
171,041
(5.71 %)
3,037,349
(50.41 %)
65,784
(9.49 %)
582 southern tamandua (Broad 2019)
GCA_004025105.1
n/a 25,638
(0.82 %)
49,782
(0.86 %)
n/a 39.53
(99.88 %)
5,819
(0.02 %)
2,150,023
(99.98 %)
6,033,640
(37.10 %)
708,890
(0.99 %)
22,371,532
(41.88 %)
80,897
(1.09 %)
583 southern two-toed sloth (US054 2019 Broad)
GCA_004027855.1
n/a 25,877
(0.78 %)
56,071
(0.82 %)
n/a 39.82
(99.84 %)
5,099
(0.02 %)
2,537,432
(99.98 %)
5,384,587
(37.86 %)
724,925
(2.20 %)
19,492,096
(41.12 %)
55,674
(0.90 %)
584 southern white rhinoceros (SDZICR_KB13650 2012 genbank)
GCA_000283155.1
37,037
(37.57 %)
18,551
(1.79 %)
19,747
(1.44 %)
n/a 40.90
(96.05 %)
54,737
(3.96 %)
57,823
(96.04 %)
3,824,807
(39.33 %)
421,693
(0.97 %)
14,765,476
(28.93 %)
36,281
(1.02 %)
585 soybean (US DOE JGI-PGF v2.0 2010)
GCF_000004515.4
82,440
(9.65 %)
27,682
(3.07 %)
77,218
(11.84 %)
n/a 34.77
(97.65 %)
15,955
(2.35 %)
17,146
(97.65 %)
834,646
(37.35 %)
436,219
(5.65 %)
5,341,660
(45.30 %)
35,897
(1.56 %)
586 soybean (US DOE JGI-PGF v2.1 2018)
GCF_000004515.5
85,123
(9.72 %)
27,647
(3.06 %)
77,190
(11.83 %)
n/a 34.77
(97.65 %)
15,995
(2.36 %)
17,187
(97.64 %)
834,651
(37.35 %)
436,225
(5.65 %)
5,341,721
(45.30 %)
35,897
(1.47 %)
587 speckled mousebird (hap1 2023 genbank)
GCA_028858725.1
n/a 11,956
(1.78 %)
25,177
(2.60 %)
n/a 42.38
(99.48 %)
143
(0.52 %)
189
(100.00 %)
523,056
(12.47 %)
243,547
(3.72 %)
5,408,003
(23.43 %)
25,552
(2.34 %)
588 speckled mousebird (v1 hap2 2023)
GCA_028858625.1
n/a 13,169
(1.74 %)
26,896
(2.47 %)
n/a 42.62
(99.56 %)
151
(0.44 %)
243
(100.00 %)
570,907
(11.75 %)
317,226
(6.96 %)
5,854,600
(25.51 %)
28,905
(2.31 %)
589 speckled wood butterfly (genbank 2021)
GCA_905163445.1
21,720
(55.73 %)
4,713
(0.87 %)
17,002
(4.33 %)
29,238
(7.81 %)
35.99
(100.00 %)
11
(0.00 %)
71
(100.00 %)
304,077
(2.97 %)
110,835
(4.09 %)
3,704,355
(44.42 %)
28,108
(2.75 %)
590 sperm whale (SW-GA 2019)
GCF_002837175.2
60,921
(2.59 %)
19,527
(1.73 %)
25,114
(1.51 %)
n/a 41.39
(95.90 %)
128,928
(4.12 %)
143,605
(95.88 %)
4,365,057
(42.78 %)
694,673
(2.40 %)
13,518,590
(32.76 %)
94,152
(2.52 %)
591 sponges A.queenslandica (v1.0 2010 JGI-PGF)
GCF_000090795.1
31,248
(25.26 %)
2,167
(1.08 %)
6,648
(9.22 %)
n/a 35.83
(86.92 %)
14,944
(13.10 %)
27,972
(86.90 %)
108,973
(4.04 %)
70,563
(4.66 %)
881,116
(24.58 %)
668
(0.62 %)
592 stable fly (8C7A2A5H3J4 2015 genbank)
GCA_001015335.1
n/a 7,737
(1.16 %)
11,972
(2.65 %)
n/a 38.85
(84.55 %)
129,113
(15.50 %)
125,702
(84.50 %)
310,342
(1.75 %)
391,619
(8.42 %)
5,616,633
(48.71 %)
38,246
(1.55 %)
593 sterlet (maternal hap 2022 genbank)
GCA_902713425.1
n/a 22,306
(1.80 %)
33,366
(4.09 %)
n/a 39.56
(99.99 %)
402
(0.01 %)
245
(100.00 %)
1,126,738
(3.36 %)
889,853
(6.73 %)
8,766,715
(39.22 %)
51,356
(1.84 %)
594 sterlet (maternal hap 2022 genbank)
GCA_902713425.2
n/a 25,364
(1.76 %)
40,452
(4.10 %)
n/a 40.11
(100.00 %)
433
(0.00 %)
1,731
(100.00 %)
4,055,215
(43.14 %)
1,124,096
(10.13 %)
9,426,172
(41.81 %)
64,522
(2.85 %)
595 sterlet (v1 Gen_M01 2020)
GCF_010645085.1
73,251
(5.76 %)
24,411
(1.72 %)
39,637
(3.96 %)
n/a 39.76
(99.93 %)
6,283
(0.07 %)
3,404
(100.00 %)
1,269,345
(3.50 %)
1,095,665
(6.81 %)
10,007,602
(39.30 %)
60,475
(1.95 %)
596 sterlet (v1 paternal hap 2020)
GCA_902713435.1
n/a 22,718
(1.81 %)
34,093
(4.15 %)
57,768
(4.88 %)
39.60
(100.00 %)
422
(0.01 %)
224
(100.00 %)
1,145,503
(3.39 %)
912,936
(6.84 %)
8,839,174
(39.17 %)
52,560
(1.82 %)
597 stony coral S.pistillata (v1 CSM Monaco 2017)
GCF_002571385.1
36,135
(16.45 %)
3,324
(0.70 %)
20,909
(10.93 %)
38,198
(17.00 %)
38.54
(89.50 %)
49,077
(10.54 %)
5,688
(100.00 %)
111,077
(1.70 %)
108,732
(2.95 %)
2,009,396
(21.40 %)
6,012
(0.58 %)
598 striped catfish (primary hap 2022 genbank)
GCA_027358585.1
53,859
(65.52 %)
16,035
(2.86 %)
41,619
(5.48 %)
n/a 38.99
(99.49 %)
236
(0.51 %)
59
(100.00 %)
1,870,238
(37.80 %)
605,571
(6.82 %)
5,059,499
(32.43 %)
17,919
(1.29 %)
599 sudden oak death agent (Pr-102 primary hap 2021 genbank)
GCA_020800215.1
n/a 1,461
(1.76 %)
22,413
(61.13 %)
n/a 54.37
(99.66 %)
50
(0.34 %)
28
(100.00 %)
8,935
(0.72 %)
9,528
(3.65 %)
117,380
(14.16 %)
34
(99.96 %)
600 Sumatran orangutan (Susie 2018 genbank)
GCA_002880775.3
n/a 20,174
(1.79 %)
20,994
(1.15 %)
47,806
(1.68 %)
40.80
(99.29 %)
553
(0.70 %)
5,813
(99.30 %)
5,497,148
(54.41 %)
1,048,361
(8.01 %)
15,948,575
(40.68 %)
39,481
(0.87 %)
601 Sumatran orangutan (v1 AG06213 primary hap 2023)
GCF_028885655.1
98,046
(3.46 %)
21,162
(1.68 %)
21,714
(1.13 %)
n/a 41.13
(99.79 %)
59
(0.21 %)
2,670
(99.79 %)
5,730,768
(55.05 %)
1,175,314
(11.19 %)
16,323,507
(44.05 %)
55,799
(2.08 %)
602 Swainson's thrush (bCatUst1 v1 alternate hap 2019)
GCA_009819505.1
n/a 13,403
(1.85 %)
27,456
(2.48 %)
n/a 42.86
(100.00 %)
13
(0.00 %)
3,601
(100.00 %)
497,374
(5.78 %)
649,859
(4.89 %)
6,740,713
(22.65 %)
49,076
(3.54 %)
603 Swainson's thrush (v1 primary hap 2019)
GCF_009819885.1
40,128
(5.45 %)
13,016
(1.88 %)
24,787
(2.41 %)
30,064
(2.94 %)
42.48
(98.86 %)
428
(1.14 %)
161
(100.00 %)
483,978
(5.85 %)
589,859
(4.32 %)
6,708,638
(22.44 %)
49,404
(3.53 %)
604 swamp sparrow (bMelGeo1 primary hap 2023 genbank)
GCA_028018845.1
29,544
(46.92 %)
12,375
(1.75 %)
24,577
(2.31 %)
n/a 43.08
(99.89 %)
236
(0.11 %)
40
(100.00 %)
419,473
(3.09 %)
439,909
(7.61 %)
6,077,743
(24.47 %)
32,064
(3.27 %)
605 tammar wallaby (v1 primary hap 2023 genbank)
GCA_028372415.1
n/a 17,652
(0.77 %)
15,774
(0.88 %)
n/a 38.73
(99.81 %)
515
(0.19 %)
315
(100.00 %)
5,836,160
(26.14 %)
1,193,709
(2.72 %)
22,682,658
(39.52 %)
23,629
(0.48 %)
606 tammar wallaby (v2 primary hap 2023 genbank)
GCA_028372415.2
n/a 17,617
(0.77 %)
15,414
(0.86 %)
n/a 38.73
(99.81 %)
515
(0.19 %)
273
(100.00 %)
5,866,321
(26.30 %)
1,193,604
(2.72 %)
22,677,517
(39.53 %)
23,590
(0.47 %)
607 Tasmanian devil
GCF_000189315.1
32,527
(1.79 %)
16,112
(0.84 %)
16,152
(0.94 %)
n/a 36.05
(92.36 %)
201,403
(7.66 %)
237,291
(92.34 %)
6,766,259
(42.85 %)
1,240,681
(2.07 %)
20,998,733
(36.61 %)
23,155
(0.38 %)
608 thale cress (tair10 Columbia 2011)
GCF_000001735.3
53,828
(40.09 %)
26,552
(34.12 %)
25,867
(35.78 %)
n/a 36.06
(99.85 %)
357
(0.16 %)
7
(100.00 %)
67,353
(16.32 %)
27,063
(2.77 %)
749,020
(22.64 %)
4,599
(1.63 %)
609 thirteen-lined ground squirrel (2011)
GCF_000236235.1
41,886
(2.61 %)
19,165
(1.70 %)
18,102
(1.44 %)
n/a 39.91
(93.27 %)
141,005
(6.75 %)
153,488
(93.25 %)
4,378,557
(36.61 %)
640,337
(1.64 %)
14,116,066
(27.91 %)
28,321
(0.64 %)
610 thorny skate (v1 CabotCenter1 v1 2020 refseq)
GCF_010909765.1
45,969
(2.40 %)
11,433
(0.60 %)
26,341
(1.72 %)
32,017
(1.87 %)
44.30
(92.54 %)
3,753
(7.46 %)
957
(100.00 %)
865,711
(2.57 %)
1,176,348
(3.79 %)
9,964,038
(52.25 %)
242,676
(4.73 %)
611 thorny skate (v1 primary hap CabotCenter1 2020 genbank)
GCA_010909765.1
45,969
(46.35 %)
11,434
(0.60 %)
26,342
(1.72 %)
32,017
(1.87 %)
44.30
(92.54 %)
3,753
(7.46 %)
958
(100.00 %)
866,598
(2.58 %)
1,176,350
(3.79 %)
9,964,083
(52.25 %)
242,676
(4.73 %)
612 tick D.silvarum (v1 2020)
GCF_013339745.1
36,084
(1.94 %)
4,032
(0.13 %)
128,567
(5.82 %)
43,960
(2.05 %)
46.91
(99.95 %)
13,519
(0.05 %)
1,665
(100.00 %)
1,116,542
(2.95 %)
642,860
(3.16 %)
10,429,455
(39.18 %)
37,849
(2.30 %)
613 tidepool copepod (San Diego 2019 genbank)
GCA_007210705.1
23,429
(54.20 %)
3,517
(1.61 %)
18,910
(15.71 %)
n/a 42.18
(97.94 %)
14,007
(2.09 %)
459
(100.00 %)
52,042
(1.17 %)
27,065
(1.23 %)
928,666
(18.11 %)
15,823
(5.51 %)
614 tidewater goby (DKJ021-1_F 2022 genbank)
GCA_026437365.1
n/a 14,276
(1.78 %)
66,576
(6.32 %)
n/a 42.96
(99.99 %)
794
(0.01 %)
820
(100.00 %)
2,127,818
(38.86 %)
708,255
(30.28 %)
3,809,452
(49.66 %)
101,682
(8.04 %)
615 tiger tail seahorse (QL1 v1 2016)
GCF_001891065.1
47,041
(13.29 %)
13,817
(3.76 %)
32,943
(8.81 %)
n/a 43.30
(93.04 %)
23,101
(6.97 %)
60,478
(93.03 %)
359,724
(3.91 %)
155,380
(3.35 %)
2,811,700
(24.51 %)
61,685
(7.72 %)
616 tiny Cayenne caecilian (v1 2019)
GCF_901765095.1
41,346
(1.27 %)
14,569
(0.43 %)
30,499
(1.16 %)
n/a 44.01
(98.99 %)
2,452
(1.01 %)
1,081
(100.00 %)
1,835,191
(1.59 %)
1,670,443
(3.30 %)
22,207,145
(52.43 %)
414,828
(3.91 %)
617 tomato (v3.0 Heinz 1706 2018)
GCF_000188115.4
46,014
(6.94 %)
15,396
(2.15 %)
38,462
(7.56 %)
n/a 34.12
(90.18 %)
19,634
(9.83 %)
3,150
(100.00 %)
417,162
(18.21 %)
229,803
(3.18 %)
5,370,478
(35.28 %)
25,279
(1.28 %)
618 tourmaline sunangel (hap1 2024 genbank)
GCA_036169615.1
n/a 12,509
(1.97 %)
21,020
(2.33 %)
n/a 41.63
(99.99 %)
437
(0.01 %)
131
(100.00 %)
532,267
(5.46 %)
332,284
(2.69 %)
6,084,978
(21.20 %)
19,080
(1.72 %)
619 trahira (v1 hap1 2023)
GCA_029633855.1
n/a 16,039
(2.06 %)
44,287
(4.38 %)
n/a 40.99
(92.91 %)
867
(7.09 %)
597
(100.00 %)
2,228,831
(30.95 %)
687,495
(13.85 %)
5,309,097
(36.70 %)
27,070
(2.09 %)
620 trahira (v1 hap2 2023)
GCA_029633875.1
n/a 16,216
(2.00 %)
45,209
(4.32 %)
n/a 41.03
(96.02 %)
907
(3.98 %)
452
(100.00 %)
2,280,303
(30.80 %)
708,327
(15.59 %)
5,394,248
(39.01 %)
28,386
(2.18 %)
621 tricolored blackbird (1412-34295 primary hap 2022 genbank)
GCA_023055355.1
n/a 12,867
(1.81 %)
26,393
(2.48 %)
n/a 42.85
(100.00 %)
97
(0.00 %)
311
(100.00 %)
429,011
(3.16 %)
564,849
(5.52 %)
6,336,716
(23.32 %)
33,378
(2.70 %)
622 Trypanosoma equiperdum (OVI 2016 genbank)
GCA_001457755.2
n/a 576
(1.36 %)
2,999
(35.93 %)
n/a 45.94
(99.65 %)
6,447
(0.44 %)
2,026
(100.00 %)
16,807
(2.60 %)
3,925
(0.79 %)
141,656
(16.64 %)
4,877
(34.82 %)
623 Trypanosoma melophagium (St. Kilda St. Kilda 2022 genbank)
GCA_022059095.1
n/a 742
(1.83 %)
848
(40.20 %)
n/a 41.23
(100.00 %)
n/a 64
(100.00 %)
39,141
(7.68 %)
14,366
(6.71 %)
131,898
(25.19 %)
4,119
(14.82 %)
624 tsetse fly (v1 IAEA_lab_2018 2020)
GCF_014805625.1
24,334
(8.13 %)
7,223
(2.32 %)
6,632
(3.62 %)
n/a 33.80
(97.46 %)
9,688
(2.55 %)
7,986
(100.00 %)
418,532
(4.76 %)
185,734
(2.26 %)
3,090,742
(35.34 %)
3,487
(0.58 %)
625 Tungara frog (aEngPut4 maternal hap 2024 genbank)
GCA_040894005.1
n/a 13,678
(0.88 %)
29,720
(2.41 %)
n/a 43.19
(100.00 %)
436
(0.00 %)
961
(100.00 %)
734,036
(2.54 %)
1,217,326
(21.42 %)
8,925,883
(52.53 %)
211,590
(5.08 %)
626 two-lined caecilian (v1.1 2019 refseq)
GCF_901001135.1
56,630
(1.50 %)
14,448
(0.38 %)
40,572
(1.31 %)
n/a 44.40
(99.36 %)
3,573
(0.64 %)
1,330
(100.00 %)
2,263,606
(1.94 %)
2,036,108
(4.34 %)
29,400,958
(44.09 %)
602,912
(6.66 %)
627 Ugandan red Colobus (RC106 v1 2017)
GCA_002776525.1
n/a 21,053
(1.88 %)
23,024
(1.24 %)
n/a 40.68
(96.59 %)
77,615
(3.42 %)
47,644
(100.00 %)
5,478,730
(51.13 %)
969,126
(2.63 %)
16,127,854
(36.40 %)
63,965
(1.04 %)
628 Ugandan red Colobus (RC106 v2 2018)
GCF_002776525.2
66,965
(2.69 %)
21,958
(1.85 %)
24,388
(1.22 %)
55,722
(1.95 %)
40.60
(97.10 %)
63,620
(2.91 %)
47,449
(100.00 %)
5,699,639
(51.61 %)
1,066,606
(2.87 %)
16,603,622
(37.49 %)
71,084
(1.08 %)
629 Ugandan red Colobus (RC106 v3 2019)
GCF_002776525.3
68,173
(2.68 %)
21,804
(1.85 %)
23,385
(1.18 %)
n/a 40.60
(97.10 %)
64,415
(2.91 %)
46,654
(100.00 %)
5,700,226
(51.61 %)
1,066,759
(2.88 %)
16,603,818
(37.49 %)
71,078
(1.08 %)
630 Ugandan red Colobus (RC106 v4 2019)
GCF_002776525.4
63,704
(2.55 %)
21,347
(1.86 %)
23,056
(1.19 %)
n/a 40.84
(97.07 %)
57,757
(2.93 %)
34,372
(100.00 %)
5,504,117
(51.70 %)
961,351
(2.75 %)
16,208,033
(37.10 %)
71,046
(1.10 %)
631 Upper Galilee mountains blind mole rat (#2095 2014 genbank)
GCA_000622305.1
54,667
(35.81 %)
19,685
(1.25 %)
21,268
(1.20 %)
n/a 41.26
(95.18 %)
201,121
(4.83 %)
356,096
(95.17 %)
6,165,270
(34.95 %)
1,197,778
(2.77 %)
16,282,333
(36.21 %)
22,905
(0.49 %)
632 valley oak (v3.0 2019)
GCF_001633185.1
63,555
(8.16 %)
16,886
(1.90 %)
72,876
(14.48 %)
n/a 35.38
(99.77 %)
1,674
(0.23 %)
2,010
(100.00 %)
800,389
(3.72 %)
460,244
(7.41 %)
5,439,256
(37.83 %)
19,635
(1.10 %)
633 vegetable marrow (v1 mu-cu-16 2017)
GCF_002806865.1
48,870
(21.91 %)
19,421
(7.41 %)
36,314
(20.76 %)
n/a 36.49
(94.25 %)
49,649
(5.76 %)
25,263
(100.00 %)
182,696
(3.35 %)
143,269
(7.40 %)
1,620,517
(29.12 %)
13,323
(2.49 %)
634 velvet spider S.dumicola (v1 Namibia, Etosha 2020)
GCF_010614865.1
34,675
(2.01 %)
3,329
(0.10 %)
24,015
(1.20 %)
n/a 33.26
(100.00 %)
7
(0.00 %)
16,531
(100.00 %)
1,258,301
(2.08 %)
828,332
(2.42 %)
17,994,342
(48.98 %)
63,015
(0.95 %)
635 wasp C.solmsi marchali (v1 2013)
GCF_000503995.1
13,201
(7.14 %)
3,474
(1.25 %)
15,142
(4.89 %)
n/a 30.36
(99.55 %)
7,471
(0.46 %)
9,928
(99.54 %)
340,841
(7.52 %)
251,386
(3.99 %)
2,448,273
(49.27 %)
16,346
(4.08 %)
636 water buffalo (Mediterranean 2013)
GCA_000471725.1
n/a 20,245
(1.49 %)
24,230
(1.29 %)
n/a 42.11
(97.39 %)
263,385
(2.62 %)
630,367
(97.38 %)
5,997,926
(47.35 %)
466,019
(1.02 %)
13,822,739
(40.29 %)
93,080
(1.71 %)
637 Weddell seal (WS11-02 2013 genbank)
GCA_000349705.1
48,251
(30.18 %)
21,044
(1.72 %)
22,320
(1.43 %)
n/a 41.39
(70.44 %)
152,836
(29.58 %)
169,546
(70.42 %)
4,420,479
(41.72 %)
471,250
(0.66 %)
13,410,191
(22.09 %)
48,738
(1.01 %)
638 western European hedgehog (2012 genbank)
GCA_000296755.1
29,923
(35.25 %)
18,034
(1.33 %)
19,779
(1.35 %)
n/a 41.54
(85.94 %)
219,764
(14.09 %)
225,566
(85.91 %)
6,527,125
(45.87 %)
1,271,531
(2.29 %)
12,374,069
(42.02 %)
28,528
(0.71 %)
639 western European hedgehog (primary hap 2023 genbank)
GCA_950295315.1
61,103
(44.10 %)
18,126
(1.16 %)
21,345
(1.28 %)
n/a 42.00
(99.97 %)
3,760
(0.03 %)
1,175
(100.00 %)
4,891,344
(19.68 %)
1,507,933
(3.81 %)
12,571,193
(54.50 %)
32,667
(0.90 %)
640 western European house mouse (WSB_EiJ v1 2016)
GCA_001624835.1
n/a 20,870
(2.26 %)
18,535
(1.45 %)
100,622
(4.22 %)
41.80
(84.36 %)
399,976
(15.70 %)
72,315
(94.81 %)
4,961,700
(39.53 %)
1,345,987
(2.51 %)
13,324,808
(25.23 %)
16,556
(0.40 %)
641 western flower thrips (v2 FOCC.00 2017)
GCF_000697945.2
24,277
(14.78 %)
4,066
(1.46 %)
26,743
(11.40 %)
n/a 51.10
(94.72 %)
60,375
(5.31 %)
34,226
(94.71 %)
275,482
(4.88 %)
167,812
(3.67 %)
1,832,537
(24.44 %)
26,406
(36.85 %)
642 western lowland gorilla (Susie 2016)
GCA_900006655.3
n/a 20,323
(1.77 %)
22,069
(1.15 %)
n/a 40.71
(99.64 %)
768
(0.36 %)
16,065
(99.64 %)
5,373,630
(50.30 %)
1,025,389
(10.17 %)
15,954,613
(41.78 %)
53,557
(1.01 %)
643 western lowland gorilla (v1.1 KB3781 2023)
GCF_029281585.1
101,242
(3.18 %)
20,994
(1.57 %)
41,945
(1.53 %)
n/a 40.59
(99.85 %)
38
(0.15 %)
637
(100.00 %)
5,526,927
(51.16 %)
1,080,693
(20.38 %)
15,929,020
(48.46 %)
76,432
(1.35 %)
644 western lowland gorilla (v2.0 KB3781 2024 genbank)
GCA_029281585.2
98,415
(41.67 %)
21,010
(1.59 %)
50,696
(1.83 %)
n/a 40.49
(99.94 %)
2
(0.06 %)
25
(100.00 %)
5,456,267
(50.77 %)
1,060,267
(19.55 %)
15,870,191
(47.77 %)
69,745
(1.19 %)
645 western lowland gorilla (v2.1 KB3781 2024 genbank)
GCA_029281585.3
n/a 21,010
(1.59 %)
50,695
(1.83 %)
n/a 40.49
(99.94 %)
2
(0.06 %)
26
(100.00 %)
5,456,271
(50.77 %)
1,060,267
(19.55 %)
15,870,225
(47.77 %)
69,745
(1.19 %)
646 western painted turtle (v303 2014)
GCF_000241765.3
51,681
(3.25 %)
15,203
(1.04 %)
22,272
(1.67 %)
46,230
(2.32 %)
44.19
(91.88 %)
183,744
(8.14 %)
262,326
(91.86 %)
2,767,141
(30.92 %)
316,971
(0.98 %)
11,856,824
(28.95 %)
104,231
(1.84 %)
647 western painted turtle (v304 RCT428 2020)
GCF_000241765.4
64,798
(3.75 %)
15,669
(1.09 %)
21,663
(1.64 %)
n/a 44.19
(87.54 %)
184,311
(12.48 %)
260,698
(87.52 %)
3,780,252
(41.81 %)
316,422
(0.93 %)
11,852,305
(27.59 %)
103,899
(1.75 %)
648 western predatory mite (v1.0 2012)
GCF_000255335.1
12,199
(13.86 %)
2,842
(1.49 %)
27,198
(19.18 %)
n/a 51.58
(99.74 %)
1,901
(0.26 %)
3,993
(99.74 %)
33,136
(1.10 %)
13,115
(0.57 %)
612,854
(9.73 %)
2,003
(54.71 %)
649 western wild mouse (SPRET_EiJ v1 2016)
GCA_001624865.1
n/a 21,211
(2.19 %)
17,797
(1.36 %)
100,839
(4.01 %)
41.65
(89.10 %)
334,091
(10.95 %)
29,259
(98.77 %)
5,087,807
(40.60 %)
1,402,357
(3.14 %)
13,522,663
(27.99 %)
16,888
(0.42 %)
650 wheat stem sawfly (v1 2014)
GCF_000341935.1
37,175
(25.01 %)
4,407
(2.81 %)
15,504
(11.96 %)
n/a 40.34
(98.12 %)
8,733
(1.89 %)
10,707
(98.11 %)
87,084
(2.38 %)
44,673
(2.55 %)
1,001,343
(22.18 %)
7,519
(2.78 %)
651 white leghorn X broiler chicken (v1 leghorn haplotype v1 2021)
GCF_016700215.1
55,865
(8.86 %)
12,310
(2.41 %)
22,056
(2.57 %)
n/a 42.20
(99.65 %)
254
(0.35 %)
509
(99.65 %)
604,452
(10.76 %)
232,416
(2.03 %)
5,541,059
(20.23 %)
22,185
(2.62 %)
652 white-beaked dolphin (primary hap 2023 genbank)
GCA_949774975.1
59,982
(41.87 %)
18,737
(1.57 %)
20,767
(1.34 %)
n/a 41.91
(99.99 %)
1,070
(0.01 %)
410
(100.00 %)
3,820,566
(36.21 %)
922,103
(8.43 %)
12,304,360
(39.74 %)
68,551
(3.58 %)
653 white-footed mouse
GCF_004664715.1
46,167
(2.56 %)
20,406
(1.72 %)
20,857
(1.46 %)
39,081
(1.88 %)
42.23
(100.00 %)
79
(0.00 %)
1,763
(100.00 %)
5,064,597
(30.73 %)
1,258,088
(2.85 %)
14,005,845
(33.01 %)
23,475
(0.69 %)
654 white-tailed deer (Pink-7 2017 genbank)
GCA_002102435.1
57,774
(39.81 %)
20,653
(1.75 %)
23,083
(1.50 %)
40,950
(1.94 %)
41.55
(99.10 %)
107,030
(0.91 %)
48,652
(99.10 %)
4,799,958
(41.28 %)
413,128
(2.59 %)
13,296,686
(34.22 %)
44,165
(1.19 %)
655 white-tailed eagle (primary hap 2022 genbank)
GCA_947461875.1
n/a 13,735
(1.76 %)
28,993
(2.53 %)
n/a 43.15
(99.99 %)
424
(0.01 %)
188
(100.00 %)
585,276
(12.89 %)
291,289
(6.10 %)
6,474,027
(23.66 %)
54,851
(4.05 %)
656 white-tufted-ear marmoset (2010 Wash U)
GCF_000004665.1
58,109
(2.92 %)
21,699
(1.91 %)
20,910
(1.24 %)
n/a 40.85
(94.45 %)
187,214
(5.57 %)
201,523
(94.43 %)
5,120,629
(48.95 %)
768,432
(2.30 %)
15,303,718
(34.75 %)
35,805
(0.79 %)
657 white-tufted-ear marmoset (CJ-08-46 2017)
GCA_002754865.1
n/a 21,754
(1.86 %)
21,668
(1.22 %)
n/a 40.77
(99.67 %)
48,495
(0.33 %)
88,439
(99.67 %)
5,195,965
(48.83 %)
825,714
(3.60 %)
15,372,168
(38.05 %)
34,994
(0.85 %)
658 white-tufted-ear marmoset (cj1700 genbank)
GCA_009663435.1
n/a 21,729
(1.89 %)
21,502
(1.30 %)
n/a 40.85
(98.70 %)
370
(1.30 %)
1,360
(98.70 %)
5,122,418
(49.40 %)
818,502
(3.68 %)
15,232,829
(38.20 %)
36,656
(0.90 %)
659 white-tufted-ear marmoset (v1 paternal hap 2020)
GCA_011100535.1
n/a 20,939
(1.94 %)
20,416
(1.31 %)
n/a 41.04
(99.58 %)
788
(0.42 %)
336
(100.00 %)
4,869,007
(49.39 %)
746,577
(2.68 %)
14,347,286
(37.59 %)
35,222
(0.94 %)
660 white-tufted-ear marmoset (v1.2 2021 genbank)
GCA_011100555.2
n/a 21,801
(1.88 %)
21,501
(1.28 %)
n/a 40.92
(99.52 %)
1,165
(0.48 %)
1,234
(100.00 %)
5,036,594
(47.71 %)
842,846
(3.25 %)
15,161,577
(38.08 %)
37,603
(0.93 %)
661 whooping crane (maternal hap 2023 genbank)
GCA_028858705.1
55,408
(53.40 %)
13,572
(1.81 %)
24,739
(2.19 %)
n/a 43.07
(99.63 %)
262
(0.37 %)
929
(100.00 %)
616,295
(10.57 %)
211,557
(2.90 %)
6,785,134
(22.11 %)
42,795
(4.66 %)
662 wild Bactrian camel (CB1 Naran 2013 genbank)
GCA_000311805.2
n/a 18,785
(1.94 %)
17,252
(1.62 %)
n/a 41.28
(98.83 %)
60,971
(1.18 %)
68,871
(98.82 %)
3,098,525
(34.75 %)
353,630
(1.23 %)
12,349,553
(25.12 %)
45,436
(1.02 %)
663 wild emmer wheat (Zavitan Atlit2015 v2.0 2019)
GCF_002162155.1
131,302
(1.34 %)
33,079
(0.33 %)
567,762
(8.14 %)
n/a 45.99
(96.70 %)
344,768
(3.31 %)
148,396
(100.00 %)
2,762,705
(2.81 %)
2,991,142
(3.37 %)
493,164
(96.69 %)
2,220,897
(25.33 %)
664 wild peanut A.duranensis (v1 V14167 2017)
GCF_000817695.2
69,091
(6.81 %)
16,823
(1.67 %)
75,740
(11.45 %)
n/a 35.81
(86.74 %)
133,967
(13.30 %)
3,189
(98.45 %)
588,761
(3.39 %)
493,855
(3.35 %)
5,206,772
(45.36 %)
48,008
(1.88 %)
665 wild strawberry (2011 genbank)
GCA_000184155.1
n/a 14,001
(6.64 %)
34,562
(26.90 %)
n/a 38.40
(94.26 %)
16,253
(5.76 %)
16,459
(94.24 %)
152,427
(20.00 %)
74,539
(2.79 %)
1,032,592
(21.43 %)
14,802
(3.20 %)
666 wire-tailed manakin (2018)
GCF_003945595.1
50,529
(5.75 %)
12,950
(1.89 %)
19,252
(2.57 %)
24,522
(2.44 %)
42.30
(100.00 %)
102
(0.00 %)
3,744
(100.00 %)
500,823
(7.17 %)
300,638
(2.31 %)
6,414,267
(20.54 %)
28,268
(2.21 %)
667 woodchuck (CNAG 2019)
GCA_901343595.1
n/a 20,813
(1.60 %)
23,199
(1.43 %)
45,153
(1.99 %)
40.00
(97.18 %)
57,045
(2.82 %)
105,556
(97.18 %)
4,756,333
(33.73 %)
836,503
(2.41 %)
14,755,960
(31.13 %)
34,151
(0.87 %)
668 woodchuck (v1.0 LI92 2021)
GCF_021218885.1
62,044
(2.80 %)
19,783
(1.48 %)
21,060
(1.38 %)
n/a 39.92
(100.00 %)
46
(0.00 %)
3,381
(100.00 %)
3,884,968
(28.12 %)
912,591
(2.73 %)
14,538,767
(35.15 %)
36,919
(1.02 %)
669 worm pipefish (v1 RoL_2023-P1 2023)
GCF_033978685.1
73,681
(3.43 %)
25,892
(1.02 %)
114,154
(3.30 %)
n/a 39.45
(100.00 %)
146
(0.00 %)
630
(100.00 %)
4,795,312
(24.37 %)
2,093,730
(16.74 %)
13,132,465
(67.32 %)
248,526
(4.59 %)
670 wrentit (frontalis MVZ Bird 193981 primary hap 2023 genbank)
GCA_029207755.1
n/a 13,052
(1.78 %)
24,950
(2.30 %)
n/a 43.93
(100.00 %)
353
(0.00 %)
1,695
(100.00 %)
444,866
(3.08 %)
473,471
(7.97 %)
5,336,498
(25.82 %)
37,210
(3.14 %)
671 Yangtze finless porpoise (v1 2018 refseq)
GCF_003031525.1
43,312
(2.49 %)
18,639
(1.72 %)
19,645
(1.46 %)
n/a 41.28
(99.29 %)
52,647
(0.72 %)
66,346
(99.28 %)
n/a 540,765
(1.65 %)
12,691,760
(32.87 %)
59,052
(1.48 %)
672 Yangtze finless porpoise (v1 wild 2018 genbank)
GCA_003031525.1
43,299
(41.33 %)
18,726
(1.80 %)
19,644
(1.46 %)
n/a 41.28
(99.29 %)
52,647
(0.72 %)
66,345
(99.28 %)
3,990,044
(42.54 %)
540,765
(1.65 %)
12,691,683
(32.88 %)
59,052
(1.48 %)
673 Yangtze River dolphin (v1 BGI 2013 genbank)
GCA_000442215.1
27,063
(35.76 %)
19,219
(1.73 %)
27,456
(1.66 %)
n/a 41.30
(98.69 %)
124,797
(1.33 %)
155,509
(98.67 %)
4,277,556
(44.10 %)
690,534
(1.95 %)
13,025,034
(35.19 %)
67,035
(1.82 %)
674 Yangtze River dolphin (v1 BGI 2013 refseq)
GCF_000442215.1
27,076
(1.65 %)
19,227
(1.75 %)
27,468
(1.66 %)
n/a 41.30
(98.69 %)
124,797
(1.33 %)
155,510
(98.67 %)
4,193,317
(43.38 %)
690,534
(1.95 %)
13,025,097
(35.19 %)
67,035
(1.82 %)
675 yellow fever mosquito (LVP_AGWG 2017 genbank)
GCA_002204515.1
n/a 8,814
(0.51 %)
152,909
(17.36 %)
n/a 38.16
(100.00 %)
229
(0.00 %)
6,534
(100.00 %)
2,912,289
(46.74 %)
533,475
(4.34 %)
10,210,670
(53.65 %)
132,732
(6.12 %)
676 yellow-bellied marmot (hap1 2025 genbank)
GCA_047511675.1
n/a 19,503
(1.44 %)
20,301
(1.35 %)
n/a 39.90
(100.00 %)
330
(0.00 %)
814
(100.00 %)
4,038,897
(29.07 %)
978,915
(3.28 %)
14,404,740
(34.97 %)
36,674
(1.05 %)
677 yellow-bellied marmot (SJ_83 v2.0 2019)
GCF_003676075.2
42,715
(2.16 %)
19,894
(1.62 %)
21,366
(1.40 %)
43,878
(1.99 %)
39.89
(97.96 %)
35,595
(2.04 %)
66,624
(97.96 %)
4,646,957
(34.05 %)
800,897
(1.96 %)
14,340,028
(32.63 %)
34,125
(0.91 %)
678 yellow-bellied marmot (v1 2018)
GCF_003676075.1
41,573
(2.14 %)
19,845
(1.63 %)
21,262
(1.39 %)
n/a 39.88
(97.82 %)
38,354
(2.18 %)
69,503
(97.82 %)
4,683,625
(34.38 %)
799,659
(1.95 %)
14,322,765
(32.58 %)
34,127
(0.91 %)
679 yellow-footed antechinus (v1 Samford, QLD, Australia AdamAnt 2021)
GCA_016432865.1
n/a 15,703
(0.78 %)
16,184
(0.90 %)
n/a 36.21
(99.99 %)
620
(0.01 %)
487
(100.00 %)
5,424,579
(25.40 %)
1,269,774
(2.59 %)
21,430,550
(42.69 %)
28,121
(0.66 %)
680 yellow-throated sandgrouse (BGI_N339 2014 BGI)
GCF_000699245.1
15,990
(2.25 %)
11,775
(1.55 %)
23,935
(1.90 %)
n/a 41.36
(99.67 %)
48,553
(0.34 %)
107,160
(99.66 %)
384,032
(4.45 %)
182,309
(1.03 %)
6,529,534
(19.24 %)
15,660
(0.55 %)
681 yellowtail amberjack (v1 SW California HSWRI2012SDOR001 2017)
GCF_002814215.1
41,181
(9.96 %)
15,861
(2.76 %)
30,671
(6.00 %)
n/a 40.75
(97.79 %)
33,664
(2.20 %)
99,598
(100.00 %)
614,513
(4.16 %)
522,349
(4.83 %)
4,650,538
(24.98 %)
18,054
(0.96 %)
682 Yuma myotis (MYYU_CA2020_CCGP primary hap 2023 genbank)
GCA_028538775.1
n/a 18,587
(1.82 %)
21,049
(1.76 %)
n/a 43.22
(100.00 %)
209
(0.00 %)
685
(100.00 %)
2,890,086
(24.28 %)
719,555
(4.26 %)
10,089,514
(36.35 %)
60,975
(2.61 %)
683 zebra finch (v1 Black17 2019 refseq)
GCF_003957565.1
51,472
(7.16 %)
13,211
(2.02 %)
17,812
(2.70 %)
38,655
(7.10 %)
42.04
(99.78 %)
312
(0.22 %)
135
(100.00 %)
535,521
(8.50 %)
550,118
(4.01 %)
6,519,872
(21.47 %)
30,053
(2.58 %)
684 zebra finch (v1 Black17 male 2019 genbank)
GCA_003957565.2
n/a 13,212
(2.02 %)
25,117
(2.57 %)
38,655
(7.10 %)
42.04
(99.78 %)
312
(0.22 %)
135
(100.00 %)
535,521
(8.50 %)
550,118
(4.01 %)
6,519,872
(21.47 %)
30,053
(2.58 %)
685 zebra finch (v1.4 Blue55 primary hap 2021 genbank)
GCA_003957565.4
n/a 12,755
(1.97 %)
24,009
(2.47 %)
n/a 41.86
(99.66 %)
352
(0.34 %)
199
(100.00 %)
389,146
(3.10 %)
458,903
(3.33 %)
6,338,599
(20.92 %)
29,203
(2.49 %)
686 zebra shark (hap1 2023 genbank)
GCA_030684315.1
n/a 12,291
(0.48 %)
16,769
(1.14 %)
n/a 43.41
(99.47 %)
1,159
(0.53 %)
835
(100.00 %)
8,087,543
(64.92 %)
798,373
(9.17 %)
14,838,773
(42.39 %)
45,284
(1.67 %)
687 zebu cattle (Nelore 2014 genbank)
GCA_000247795.2
n/a 18,599
(1.58 %)
18,779
(1.29 %)
n/a 41.75
(92.62 %)
6,941,272
(7.66 %)
253,769
(92.59 %)
5,118,783
(46.84 %)
358,908
(0.88 %)
13,431,620
(36.60 %)
35,241
(0.84 %)
688 zig-zag eel (v1.1 2018)
GCF_900324485.1
44,813
(12.05 %)
15,028
(3.35 %)
21,782
(6.89 %)
36,982
(11.22 %)
40.66
(97.63 %)
235
(2.37 %)
126
(100.00 %)
348,517
(2.87 %)
157,776
(2.00 %)
3,182,742
(23.42 %)
12,824
(1.08 %)
TOTALS:total assembly count 688

Additional hubs with collections of assemblies
Collection Hub index pages: Assembly statistics: Track statistics:
Primates 607 assemblies assembly stats track stats
Mammals 731 assemblies assembly stats track stats
Birds 541 assemblies assembly stats track stats
Fishes 551 assemblies assembly stats track stats
other vertebrates 353 assemblies assembly stats track stats
Invertebrates 1929 assemblies assembly stats track stats
Plants 440 assemblies assembly stats track stats
Fungi 4120 assemblies assembly stats track stats
Viruses 15059 assemblies assembly stats track stats
Archaea 2702 assemblies assembly stats track stats
Bacteria 22332 assemblies assembly stats track stats
legacy/superseded 688 assemblies assembly stats track stats
collections below are subsets of the assemblies above
VGP - Vertebrate Genome Project 1303 assemblies assembly stats track stats
CCGP - The California Conservation Genomics Project 126 assemblies assembly stats track stats
HPRC - Human Pangenome Reference Consortium 464 assemblies assembly stats track stats
BRC - BRC Analytics - Bioinformatics Research Center 5519 assemblies assembly stats track stats